基因辅助选择
两套玉米抗病近等基因系的分子标记辅助选择的开题报告
两套玉米抗病近等基因系的分子标记辅助选择的开题报告
1. 研究背景
玉米是世界上最重要的经济作物之一,但长期以来玉米遭受许多病害的威胁,其中最为严重的是玉米花叶病和玉米赤霉病。
为了解决这些问题,近年来,研究人员通
过基因组学、遗传学和生物技术等方法破解了玉米病害的抗性基因,并利用这些基因
培育出了抗病玉米品种。
目前,选择适合自己地区环境的抗病玉米品种已经成为农民
种植玉米的重要工作之一。
2. 研究目的
本研究的目的是利用分子标记辅助选择的方法,筛选出两套玉米抗病近等基因系,为今后玉米的抗病育种奠定基础。
3. 研究内容
(1)收集玉米遗传资源,从中筛选出具有抗病性状的种质材料。
(2)通过PCR扩增和测序等方法,从目标种质材料中筛选出与抗病基因相关的分子标记。
(3)利用分子标记技术分析不同玉米个体的分子遗传差异,筛选出具有两套抗
病近等基因系的玉米个体。
(4)基于所选出的抗病近等基因系,进行后代试验,确定抗病性状的表现规律
和遗传规律。
(5)对通过后代试验筛选出的玉米进行实地试验,探究与环境因素的关系,并
评价其抗病性状的稳定性和抗病强度。
4. 研究意义
本研究将为玉米抗病育种提供新的思路和方法,并为选择适合不同地区的抗病玉米品种提供理论和实践基础。
同时,也可为其他作物的抗病育种提供借鉴和参考。
选择育种的基本方法
选择育种的基本方法介绍育种是现代农业中重要的一环,它通过选择和配对适合的作物品种,来获得更好的产量、品质和抗性。
在育种过程中,选择合适的方法是至关重要的。
本文将探讨选择育种的基本方法。
基本方法分类传统育种方法1.分离育种:将不同基因型的植株进行交配,并通过观察和筛选后代来选择理想的品种。
2.选择育种:根据对不同品种的性状评估,选择具有所需特性的个体进行繁殖。
3.杂交育种:通过将两个不同的亲本交配,利用杂种优势来获得更优良的后代。
分子育种方法1.DNA标记辅助选择(MAS):利用分子标记来辅助选择具有目标基因的个体,提高选择的准确性和效率。
2.基因编辑:利用基因编辑技术,如CRISPR-Cas9,在目标基因上进行精确的修改,以改善作物性状。
3.基因组选择:通过测定和分析植株基因组中的多样性,预测其表型,并选择具有期望性状的个体进行繁殖。
选择育种方法的优缺点传统育种方法1.优点:–成本低:传统育种方法不需要先进的设备和技术,成本较低。
–适用广泛:传统育种方法适用于各种作物,能够满足不同的育种需求。
2.缺点:–时间长:传统育种方法需要多年甚至几十年的时间来完成选择和筛选。
–选择效率低:传统育种方法受到环境因素和多基因性状的限制,选择效率相对较低。
分子育种方法1.优点:–高效:分子育种方法通过DNA标记和基因编辑技术,大大提高了选择效率和准确性。
–可控性强:分子育种方法可以精确地编辑和调整作物基因组,快速改良性状。
2.缺点:–成本高:分子育种方法需要昂贵的设备和技术支持,成本较高。
–需要专业知识:分子育种方法需要专业的遗传学和生物技术知识,对操作人员要求较高。
不同方法的结合应用为了克服单一育种方法的局限性,现在通常采用不同方法的结合应用来进行育种工作。
1. 筛选与分子标记辅助选择相结合:首先通过传统筛选方法选择具有期望性状的个体,然后利用分子标记的技术验证其是否带有目标基因。
2. 杂交与基因组选择相结合:根据植株基因组的分析结果,选择具有较高遗传多样性的亲本进行杂交,以增加后代的遗传潜力。
黄瓜ZYMV抗性鉴定与抗性基因的分子标记辅助选择
黄瓜ZYMV抗性鉴定与抗性基因的分子标记辅助选择杨义;蔡润;何欢乐;李俊;郭春立;杜慧;吕铎;Masashi Amano;王艳菊;潘俊松【摘要】Zucchini yellow mosaic virus has been causing increasingly serious damage to cucumber (Cucumis sativus L.) in recent years.ZYMV can influence the growth of cucumber and reduce the yield as well as the quality of cucumber.ZYMV resistant cucumber lines need to be bred because there are no effective chemical substances to control ZYMV.ZYMV Z5-1 was used as virus source and candidate gene was sequenced in order to identify ZYMV resistance of different cucumber lines.The results show that cucumber lines SA02,SA06,S94,S1003,WI7230 and TMG--1 is resistant to ZYMV and their mutation sites are identical in candidate geneCsa6G152960.1.Based on the identification of ZYMV resistance,ZYMV resistant gene in cucumber inbred line TMG-1 was introduced into a ZYMV susceptible cucumber inbred line SA0422 through backcross breeding.During the backcross breeding,foreground and background selections were conducted in backcross population.After three generations of backcross,ZYMV resistant gene was introduced into SA0422,laying a solid foundation for breeding new ZYMV-resistant cucumber lines.%近年来,小西葫芦黄化花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)在黄瓜(Cucumis sativus L.)上危害愈发严重,影响黄瓜植株的生长发育,降低黄瓜的产量与品质.由于ZYMV缺乏有效的防治药剂,因此需要培育ZYMV抗性黄瓜品种.以ZYMV Z5-1为病毒源,对不同黄瓜材料的ZYMV抗性进行鉴定,并对抗性位点候选基因进行了测序分析.结果显示,黄瓜品种SA02、SA06、S94、S1003、WI7230与TMG-1具有ZYMV抗性,其抗性候选基因Csa6G152960.1的突变位点一致.在ZYMV抗性鉴定的基础上,通过回交转育,将黄瓜自交系TMG--1中的ZYMV抗性基因转入感病自交系SA0422中,回交期间利用分子标记对回交群体进行前景选择和背景选择,经过3代回交,将ZYMV抗性基因转入SA0422,为培育抗ZYMV黄瓜新品种奠定了基础.【期刊名称】《上海交通大学学报(农业科学版)》【年(卷),期】2017(035)004【总页数】10页(P48-57)【关键词】黄瓜;小西葫芦黄化花叶病毒;抗性鉴定;标记辅助选择;回交育种【作者】杨义;蔡润;何欢乐;李俊;郭春立;杜慧;吕铎;Masashi Amano;王艳菊;潘俊松【作者单位】上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;上海交通大学农业与生物学院,上海200240;Saitama Gensyu Ikuseikai Co.Ltd.,Kuki, Saitama 346-0105,Japan;闵行区动植物检测检验中心,上海201109;上海交通大学农业与生物学院,上海200240【正文语种】中文【中图分类】S642.2小西葫芦黄化花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)为马铃薯Y病毒属,主要通过蚜虫以非持久性方式传播,可侵染葫芦科、苋科、藜科、豆科等多种植物[1]。
基因工程在育种中的应用
基因工程在育种中的应用
基因工程是一种现代生物技术,它通过改变生物体的基因组来创造新的特性或改善现有的特性。
在育种中,基因工程技术可以被用来改良农作物、家畜和其他生物的品质和产量。
以下是基因工程在育种中的应用。
1. 基因编辑
基因编辑是一种新兴的基因工程技术,它可以直接修改生物体的基因组。
通过使用CRISPR-Cas9系统,科学家可以选择性地剪切和粘贴基因组中的特定基因,以实现所需的特性。
这项技术可以用于改良农作物的抗病性、耐旱性和耐盐性等方面。
2. 基因转移
基因转移是一种将外源基因导入生物体的技术。
通过将具有所需特性的基因从一个物种转移到另一个物种,可以创造新的品种。
例如,将一些抗虫基因从一种作物转移到另一种作物,可以增加该作物的抗虫性。
3. 基因静默
基因静默是一种通过RNA干扰技术来抑制特定基因表达的技术。
这项技术可以
用于改善作物的品质,例如,通过抑制某些基因的表达来改善水果的口感和质量。
4. 基因标记辅助选择
基因标记辅助选择是一种利用基因标记来筛选具有所需特性的个体的技术。
通过在基因组中标记与所需特性相关的基因,可以更容易地选择具有所需特性的个体,从而加速育种进程。
5. 基因组学
基因组学是一种通过分析生物体的基因组来了解其遗传特性的技术。
通过对作物和家畜基因组的分析,可以确定哪些基因与所需特性相关,并加速育种进程。
总的来说,基因工程技术在育种中具有广泛的应用前景。
通过利用这些技术,可以创造出更具有抗病性、耐旱性、耐盐性和高产性的农作物和家畜,从而提高粮食和肉类的产量和质量,为人类提供更好的食品安全保障。
分子标记辅助选择优越性和应具备的条件
分子标记辅助选择优越性和应具备的条件利用传统的挑选办法,胜利地哺育了大量的品种。
但是,在传统育种过程中,主要凭借育种阅历依据表型对后代举行挑选,无法对目标基因的基因型举行挺直挑选。
因此,挑选效率和精确性较低。
而利用分子标志可从DNA水平上挺直鉴定个体的基因型,避开了表型推想基因型不精确等缺点。
无论是对质量性状还是延续变异的数量性状,利用分子标志辅助挑选可显著提高挑选效率和精确性,加快育种进程。
详细而言,分子标志辅助挑选有以下优越性。
(1)克服性状表型鉴定的困难。
有些性状,如地下部(根系)、抗病虫、耐逆等性状的表型鉴定技术难度大、程序繁琐、鉴定费用高,难以大规模举行。
同时,低世代因育种材料较少,不允许做重复鉴定。
另外,在回交转育的前期,一些受隐性等位基因控制的有利表型无法举行鉴定,只能通过后代分别出的隐性纯合个体,才干确定表型。
而利用标志挺直挑选目标基因型,则可以有效地克服性状表型鉴定的困难。
(2)可在生长发育早期挑选。
有些性状不仅需要特定的生长环境,还要在个体发育到一定阶段才干表现,如抽穗开花耐热性、耐冷性、抗病性、经济产量、品质等性状只能在个体发育后期才干举行鉴定评价,用传统的挑选办法很难精确挑选,且效率低。
利用分子标志举行基因型鉴定,可以在早期对幼苗(甚至对种子)举行检测和挑选。
特殊是对多年生的作物或生长周期较长的果树或经济林木的选育,假如在早期利用分子标志鉴定基因型,可以将更多的群体纳入讨论挑选的对象之中,从而可以对其施加更大强度的挑选压力。
因此,利用分子标志挑选技术可以削减田间种植群体的大小,节省人力、物力和财力,大大削减工作量,加快育种进程。
(3)控制同一性状的多个(等位)基因的利用。
在植物中,存在同一性状(如抗病、抗虫、株高、粒重等)受多个基因控制的现象。
此外,在同一位点上也存在不同(复)等位基因,按照性状表型很难区别不同等位基因。
例如,水稻中已知抗白叶枯病的基因就有20多个。
第17章 MAS-4-辅助选择
三、数量性状的标记辅助选择
质量性状和数量性状的MAS的原理是一样的。原则 上,质量性状的MAS方法也适合数量性状。 作物的大多数性状是数量性状,如产量、生育期等。 因此,对数量性状的MAS极其重要。数量性状的主要遗传 特点就是表现型与基因型之间缺乏明显的对应关系,而传 统方法主要依据个体表现型进行选择的,这是造成传统育 种效率不高的原因。
M1
Gene
M2
抗性供体
M R
受体
m
×
S
目的基因与标记连锁(交换值为r) 亲本中的标记带型
共显 DNA 记的 助选 原理
性 标 辅 择
M R
m S
F1中的标记带型 × F2群体中3种标记带型
RR (1-r)2 0.9025
RS 2r ( 1-r ) 0.09
SS r2 0.0025
当 r=0.05 时 , 根 据 标 记 基 因 型 mm选择目的基因型RR,选错的 概率约为0.10
一 分子标记辅助选择的基本原理
1、概念:目标基因与分子标记紧密连 锁为利用分子标记间接选择提供了方便。 通过基因定位, 找到与目标基因紧密连锁的 分子标记后, 就可以通过该分子标记,间接地 对目标性状进行选择。此法简称分子标记 辅助选择(Molecular Assistant Selection, MAS )。MAS 是育种中的一个诱人领域, 将 给传统的育种研究带来革命性的变化。 MAS 主要应用在有利基因的转移和基因的 累加等方面。 可靠性?? r1 r2
受体亲本 × 供体亲本 (含抗性基因B) (无抗性基因) F1 (含抗性基因B)
标记辅助基 因聚合与品种改 良相结合的技术 路线,受体亲本 应为符合育种目 标的优良品种
复交杂种 (分离群体) 标记辅助选择 中选杂种个体 (含抗性基因A和B)
植物基因组学技术在作物育种中的应用
植物基因组学技术在作物育种中的应用随着生物技术的迅猛发展,植物基因组学技术已经成为现代作物育种中不可或缺的一部分。
通过对植物基因组的分析和研究,可以了解作物的遗传特性、基因结构和功能等,从而实现作物选育、品种改良和繁育的目的。
本文将从植物基因组学技术的原理、方法和应用等方面来详细探讨植物基因组学技术在作物育种中的应用。
一、植物基因组学技术的原理和方法1.原理:植物基因组是指植物所有的遗传信息,包括DNA序列、基因表达调控、蛋白质结构和功能等。
植物基因组学研究的核心在于对植物基因组信息的分析和解析,通过对植物基因组学分析可以了解植物基因信息的全貌和内在机制。
2.方法:植物基因组学技术包括DNA测序技术、基因芯片技术、基因功能鉴定技术等,其中DNA测序技术是目前最直接、最常用的技术之一。
随着高通量测序技术的发展及其日益普及,基因组学研究可以大规模、快速、准确地进行。
二、1.基因发掘与功能鉴定:通过基因组学技术的应用,可以快速地发掘作物中存在的基因类型和数量,并对基因进行功能鉴定,从而寻找对作物育种有用的基因。
例如可以通过基因表达谱分析,筛选具有逆境耐受性的基因,并进行进一步研究和利用。
2.基因组标记辅助选择:植物基因组学技术可以构建高密度的基因组物理图谱,对基因进行定位和标记,从而实现对植物杂交育种过程中的杂交亲本进行筛选和选择。
同时可以利用基因组学技术鉴定植物中的分子标记如SNP、SSR等,用于杂交育种的基因组标记辅助选择。
3.基因编辑技术:CRISPR-cas9技术在作物基因组编辑中的应用尤为重要,可以创造新的子类和新的具有优异性状的优质作物品种。
该技术以其高效、准确和大规模的优点,有望取代传统育种方法,提高育种效率和质量。
三、不足与展望1.在植物基因编辑技术方面,目前编辑的目标基因点多偏向逆境作物的转录因子或关键酶基因,而其他重要功能基因的编辑仍面临挑战,这对于一些特殊作物而言可能表现得更为明显。
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种【摘要】蔬菜作物是人们日常生活中不可或缺的食材,如何提高蔬菜作物的产量和品质一直是育种学家们的重要目标。
本文着重介绍了主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种的相关内容。
通过基因定位技术,育种者可以准确定位到目标基因,进而利用分子辅助选择育种方法迅速培育出优质品种。
蔬菜作物中常用的基因定位方法包括QTL定位和关联分析等。
文章还列举了一些利用分子标记辅助选择蔬菜作物的成功案例,展示了分子辅助选择育种的潜力。
基因组编辑技术的应用也在蔬菜作物改良中发挥越来越重要的作用。
文章探讨了蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种的未来发展方向,希望能进一步提升蔬菜作物的品质和产量,满足人们对健康食品的需求。
【关键词】蔬菜作物、基因定位、分子辅助选择育种、基因组编辑、品质、产量、未来发展方向。
1. 引言1.1 主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种蔬菜是人类饮食中不可或缺的重要食材,而主要蔬菜作物的育种是农业生产中至关重要的一环。
随着现代生物技术的发展,基因定位与分子辅助选择育种已经成为蔬菜作物育种中的重要手段。
通过精准地定位和利用蔬菜作物中的关键基因,可以加速优良品种的选育过程,提高蔬菜的产量和品质,同时也能够增强蔬菜对病虫害的抗性。
基因定位技术在蔬菜作物育种中的应用是通过遗传图谱构建和分子标记标定,确定目标基因在染色体上的位置,并进而实现对目标基因的精准选择和改良。
而分子辅助选择育种则是利用分子标记与目标性状的遗传关联,在无需实际观察目标性状的情况下,加速蔬菜作物的育种进程。
主要蔬菜作物如番茄、黄瓜、甘蓝等,常见的基因定位方法包括QTL定位、关联分析和全基因组关联研究等。
这些方法不仅可以帮助育种者找到目标基因,还能为后续的分子标记辅助选择提供重要依据。
将基因定位与分子辅助选择相结合,不仅可以提高蔬菜作物育种的效率和准确性,还可以带来更多的创新可能。
未来,随着基因组编辑技术的发展,蔬菜作物的改良将更加精准和快速。
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种近年来,随着基因组学和生物技术的快速发展,蔬菜作物基因定位和分子辅助选择育种成为了育种领域的热点研究方向。
这项技术的应用有助于提高蔬菜作物的产量、品质、抗逆性等重要农艺性状,为人们提供更加健康、优质的蔬菜产品。
蔬菜作物的基因定位是指通过遗传与分子标记、基因组学等技术手段,将某个感兴趣的性状与某个特定的基因位点联系起来。
通过对不同品种的基因组进行高通量测序和分析,可以获取大量的分子标记,如单核苷酸多态性(SNP)、简单序列重复(SSR)等。
通过这些分子标记,可以通过相关性分析和关联分析等方法,找到与目标性状相关的位点,并进一步确认与该性状相关的特定基因。
这样做可以加速蔬菜作物优良性状的揭示和利用,为育种工作提供重要基础。
分子辅助选择育种是指利用分子标记和相关技术手段,辅助传统的选择育种方法,提高育种效率和选育精度。
通过分析目标基因的分子标记与性状的关联程度,可以帮助育种者在规模更小的群体中筛选、选择具有目标性状的个体,从而加速目标性状的遗传改良。
分子辅助选择育种还可以避免传统选择育种中的难以观察到的性状,如抗性、逆境耐受性等。
蔬菜作物中的许多重要性状受到多基因的控制,而且受到基因与环境的互作影响。
蔬菜作物基因定位和分子辅助选择育种技术有效地解决了这一问题。
通过高通量测序和分子标记的分析,可以揭示与复杂性状相关的重要位点和基因,从而加速对这些复杂性状的遗传改良。
基于分子标记的辅助选择技术可以提高选育效果,加速优质和抗逆性等重要性状的选育。
而且,蔬菜作物基因定位和分子辅助选择育种技术也为转基因育种提供了重要支持。
通过揭示与目标性状相关的基因和位点,可以为转基因效应基因的引进和定位提供重要的背景信息。
蔬菜作物基因定位和分子辅助选择育种是将基因组学和生物技术应用于蔬菜育种的重要手段,有助于加速蔬菜作物的性状改良和选育进程。
随着技术的不断进步和发展,将有更多的新技术和方法应用于蔬菜作物的基因定位和分子辅助选择育种中,为蔬菜作物的可持续发展和优质蔬菜的生产提供更好的支持。
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种
主要蔬菜作物基因定位与分子辅助选择育种随着人口的增长和生活水平的提高,蔬菜作为人们日常饮食中不可或缺的一部分,其生产和质量需求也越来越高。
传统的蔬菜育种方法存在效率低、耗时长、成本高等问题,因此迫切需要新的育种方法来加快育种进程,提高蔬菜品质和产量。
基因定位与分子辅助选择育种技术正是应运而生的育种新方法,它通过分子标记来辅助选择目标基因,提高育种效率和准确性,已成为当前蔬菜育种领域的研究热点。
基因定位是指利用遗传地图或物理地图来确定某一基因在染色体上的位置,通过对该位置上的基因进行标记和分析,从而实现对目标性状的分子辅助选择。
基因定位技术主要包括分子标记技术和基因组信息分析技术。
分子标记技术是指利用DNA或RNA序列的单碱基多态性或特定序列对目标基因进行标记,常用的分子标记包括随机扩增多态性DNA标记(RAPD)、简单重复序列标记(SSR)和单核苷酸多态性标记(SNP)。
通过对不同品种进行分子标记分析,可以快速、准确地鉴定目标基因的位置和功能,为蔬菜作物的分子辅助选择育种提供了重要的技术手段。
基因组信息分析技术则是利用计算机辅助技术对大规模基因组数据进行处理和分析,通过基因组学、转录组学等手段来识别和研究蔬菜作物的功能基因及其调控网络,为蔬菜作物的育种研究提供了丰富的信息资源和科学依据。
除了基因定位技术,分子辅助选择育种也是蔬菜作物育种领域中的重要技术。
分子辅助选择是指利用分子标记进行选择的育种方法,通过对目标基因的分子标记分析,可以将目标特性与分子标记相联系,从而通过分子标记辅助选择的方式来进行新品种的筛选和育种。
与传统的育种方法相比,分子辅助选择育种具有效率高、准确性强、节约成本等优势,可以大大加快新品种的培育速度,提高育种效果,对于蔬菜作物的改良和优化具有重要的意义。
在蔬菜作物中,基因定位与分子辅助选择育种技术的应用已经取得了一些进展。
以番茄为例,利用SSR分子标记对抗旱基因进行了定位研究,结果表明该基因位于番茄第六染色体上,为番茄抗旱性状的分子辅助选择育种提供了重要信息。
cytoscape hub基因选取标准 -回复
cytoscape hub基因选取标准-回复题目:cytoscape hub基因选取标准摘要:在生物信息学中,基因选取是一项关键任务,它能够帮助研究人员在大规模基因表达数据中识别出与特定生物过程相关的基因。
Cytoscape Hub 是一个功能强大的网络分析工具,旨在辅助用户对基因进行筛选、分析与可视化。
本文将一步一步回答如何使用Cytoscape Hub进行基因选取,并介绍基因选取的主要标准。
第一步:安装Cytoscape Hub首先,要使用Cytoscape Hub进行基因选取,我们需要在计算机上安装Cytoscape软件。
可以在Cytoscape官方网站上下载相应的安装程序,并按照安装向导进行安装。
第二步:导入基因表达数据在Cytoscape软件中,我们需要导入基因表达数据集,以便进行进一步的分析和选取。
通常,这些数据集以Excel或CSV格式存储,并包含多个样本和基因的表达值。
在Cytoscape的菜单栏中,选择“导入数据”选项,并根据指示将基因表达数据导入到软件中。
第三步:进行数据预处理在进行基因选取之前,我们需要对导入的基因表达数据进行一些预处理步骤。
这包括数据的标准化、缺失值的处理和离群值的去除。
Cytoscape Hub 提供了一系列的插件和工具来帮助用户进行数据预处理,如“DataImporter”、“Missing Value Imputation”和“OutliersHandling”。
第四步:进行差异表达基因分析差异表达基因分析是基因选取的一个重要步骤,它能够帮助我们识别在不同条件下表达显著变化的基因。
Cytoscape Hub提供了多个插件来进行差异表达基因分析,其中最常用的是“edgeR”和“DESeq2”。
这些插件基于统计方法,能够对基因进行差异表达分析,并生成差异表达基因列表。
第五步:基于生物学意义进行基因筛选确定差异表达基因后,我们可以利用生物学意义进行进一步的基因筛选。
养殖技术中的育种策略与基因改良
养殖技术中的育种策略与基因改良育种作为一项重要的养殖技术,旨在通过选择和培育优良品种,提高农作物和畜禽的产量、品质和抗病能力,以满足人类不断增长的食品需求。
育种技术的发展已经取得了显著的成就,其中育种策略和基因改良是重要的手段之一。
育种策略是指通过人为选择和培育,逐步改变物种的遗传特性和表现形式。
传统育种策略主要包括选择育种、杂交育种和自交育种。
选择育种是利用遗传变异的现象,通过连续选择和繁殖出合适的个体,以达到改良品种的目的。
例如,在作物种植中,通过选择具有高产量、抗病虫害和适应性强的个体,不断培育出高产优质品种。
选择育种的优点在于操作简单、成本低廉,但缺点在于进展较慢,不能充分利用遗传多样性。
杂交育种是将两个亲本个体的优良性状进行组合,通过杂交后代的优势表现来获得更好的品种。
这种育种策略在农作物和畜禽养殖中得到广泛应用。
杂交育种可以获得明显的增产效果,同时增加品种的抗病性和适应性。
然而,杂交育种也存在一些问题,比如杂交代际后代表现不稳定,需要不断进行后代选择和筛选。
自交育种是指通过连续的自交和选择,使种群中各个性状的基因固定,从而形成纯系品种。
这种育种策略在一些农作物中应用广泛,可以获得纯系品种,具有良好的品质和稳定性。
但是,长期的自交容易导致遗传单一,缺乏遗传变异,对环境适应能力差。
随着科技的不断进步,基因改良逐渐引入养殖技术领域。
基因改良是指通过直接改变目标物种的遗传信息,从而改变其性状和表现形式。
基因改良主要包括传统育种和转基因技术。
传统育种中的基因改良是通过辅助选择和高通量筛选技术,快速准确地鉴定和筛选携带目标基因的个体。
这种方法可以大大缩短育种周期,提高选育效率。
例如,在植物育种中,利用分子标记辅助选择技术,可以准确鉴定携带抗病基因的个体,从而加速抗病品种的培育。
在转基因技术中,通过将外源基因导入目标物种中,改变其遗传特性和性状。
转基因技术可以使植物获得抗虫、抗病、耐盐碱等特性,从而提高作物的产量和品质。
分子标记与辅助选择
4
选择扩增:应用含有接头序列和三个选择核甘酸序 列的引物进行选择扩增。通过这一轮扩增,进一步 降低扩增片段数量,同时一个引物被同位素或荧光 染料标记(也可用银染),电泳后压片检测。
AFLP技术
遗传连锁图谱的构建 亲缘关系和遗传多样性的研究
AFLP标记 技术的应用
种质资源鉴定
分子标记辅助选择育种
基因表达和基因克隆
3应用
随着分子生物学技术的发展,现在DNA分子标记技术已有数十 种,广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘 关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。
分子标记类型
A、基于分子杂交的分子标记 RFLP(限制性片段长度多态性) B、基于PCR技术的分子标记 (1)随机引物: RAPD(随机扩增多态DNA) DAF VNTR
缺点:
SSR标记的建立首先要对为微卫星侧翼序 列进行克隆、测序 、人工合成设计引物以 及标记的定位、 作图等基础性究,因而其 开发有一定的困难,费用也很高。
SSR微卫星标记技术的应用
构建连锁遗 传图谱加快 遗传多样性 的研究
种质资源 鉴定
分子标记 辅助育种
4、AFLP标记
AFLP (amplified fragment length polymorphism) 即扩增性片段长度多态性
寻找与基 因或QTL 紧密连锁 的标记或 侯选基因
寻找与性 状变异有 关的特定 基因(型) 或功能位 点
检 测 选 择
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影响分子标记辅助选择的因素:
• 数量性状主基因或QTL效应的大小。 • 分子标记与主基因或QTL连锁的紧密程度。 • 主基因或QTL参数(即效应)估计的准确性。 • 数量性状的遗传率。
• 数量性状的遗传机制尚不十分清楚。
基因型选择和基因辅助BLUP对不同遗传力性状的选择效果
基因型选择和基因辅助BLUP对不同遗传力性状的选择效果王孝义;李明丽;刘刚;鲁绍雄【摘要】为揭示性状遗传力对基因型选择(GTS)和基因辅助BLUP (GBLUP)选择效果的影响,探讨基因辅助选择相对于常规动物模型BLUP选择方法的效率,在假定目标性状同时受1个QTL和多基因共同控制的前提下,采用随机模拟方法,研究了在一个闭锁群体内分别采用常规动物模型BLUP、GTS和GBLUP方法对不同遗传力性状实施连续选择时的效果.结果表明:在一定世代内,性状遗传力越高,3种选择方法所获得的遗传进展越大;GBLUP方法可以对QTL和多基因效应实施有效选择,可望获得优于常规BLUP方法的选择效果;GTS只考虑了QTL基因型而无法兼顾多基因效应,其选择进展反而不如常规BLUP选择.基因辅助选择的优势在于可对QTL进行更为准确的选择.当遗传力较低、选择世代数较短时,其对QTL选择的效率较高.在长期选择下,不断检测并确认“新”的QTL,是保持其持续选择优势的关键.【期刊名称】《云南农业大学学报》【年(卷),期】2013(028)006【总页数】8页(P796-803)【关键词】动物模型BLUP;基因型选择;基因辅助BLUP;遗传力;遗传进展;随机模拟【作者】王孝义;李明丽;刘刚;鲁绍雄【作者单位】云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;全国畜牧总站畜禽遗传资源保存利用中心,北京100193;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201【正文语种】中文【中图分类】Q348畜禽数量性状基因座位(quantitative trait loci,QTL)定位研究的迅猛发展[1-3]为人们更为有效地开展畜禽遗传改良奠定了重要的基础,部分QTL定位的研究成果已逐渐被应用到畜禽的实际育种中[4]。
在利用 DNA标记(或 QTL)信息进行畜禽遗传改良时,如果能准确测定QTL的基因型,直接选择那些具有理想基因型的个体做种,即实施所谓的基因辅助选择(gene-assisted selection,GAS),那么不仅操作简单,而且对QTL选择的准确性高,因而被认为是实施标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)最理想的情形。
遗传育种--名词解释
一、名词解释(20题,1分/题,共20分)1、基因家族(gene family):真核生物基因组中有许多来源相同、结构相似、功能相关的基因,这样的一组基因称为一个基因家族。
遗传222、随体(satellite):指位于染色体末端的球形染色体节段,通过次缢痕区与染色体主体部分相连接。
遗传263、位置效应(position effect):一个基因随着染色体畸变而改变它和相邻基因的位置关系,所引起表型改变的现象。
遗传804、外显率(penetrance):是指在一特定环境中,同一基因所显示出的预期表型效应的百分数。
遗传1175、连锁遗传(linkage inheritance):是指来自同一亲本的两个性状,在后代中有较多的机会连锁在一起遗传。
遗传1256、保护繁殖:(conservation breeding):是指圈养繁殖的种群只有保持了野外种群的原本性。
遗传1667、MHC:主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex),是指主要组织相容系统MHS中,编码MHS的基因群,称为主要组织相容性复合体。
遗传2128、辅助选择(marker-assisted selection):在动物育种过程中主要利用与其紧密连锁的DNA标记来进行,即DNA标记辅助选择。
遗传P2319、基因组印迹(genomic imprinting):是指基因组在传递遗传信息的过程中对基因或DNA片段打下标识、烙印的过程。
遗传27010、PCR(polymerase chain reaction):是一种在体外快速扩增特定基因或DNA 序列的方法,又称为基因的体外扩增法。
遗传30011、基因频率(gene frequency):在一个群体中某一等位基因的数量与占据同一基因座的全部等位基因总数的比例。
育种2312、同源一致性(identity by descent,IBD):是指亲属个体带有的基因是由某一个共同祖先同一基因复制来的。
分子标记辅助选择的原理标准版文档
r
F1杂种中DNA标记的带型
RR Rr rr (1-P)2 2P(1-P) P2
在F2分离群体中分子标记类型 即MM,Mm,mm
MM类型的分子标记所代表的目标基因型及 其频率
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最 少 应 选 株 数
重组率 标记与目标基因间的重组率与F2群体 中标记辅助选择最少应选株数的关系
重组值为P,当基因纯合时,则 跟踪目标基因的标记度。
RR 概率为 : ( 1-P ) 三、分子标记辅助选择的条件
2
理想的分子标记应该是建立在 PCR 技术基础上,重复性高,在广泛基因背景下都能表达,在不同研究者中能相互交换使用,并能有效
Rr 概率为 跟踪目标基因的标记,如SSR标记。
2.具有在大群体中利用分子标记进行筛选的有效手段, 主要是应用PCR技术。
3.筛选技术在不同实验室间重复性好,且具有经济、 易操作的特点。
4.具有实用化程度高并能协助育种家作出抉择的计算 机数据处理软件。
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标记基因型 P :M 具有在大群体中利用分子标记进行筛选的有效手段,主要是应用PCR技术。
理想的分子标记应该是建立在 PCR 技术基础上,重复性高1,在广泛基因背景下都能表达,在不同研究者中能相互交换使用,并能有效
跟踪目标基因的标记,如SSR标记。 种子生产与经营专业教学资源库
P2:m
F :Mm 种子生产与经营专业教学资源库
Rr 概率为 :2P(1-P)
:2P(1-P)
rr 概率为仅为 :P2
选择的正确率随重组率的增加而迅速下降。重组值越
小,其错选率越低。
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分子标记辅助选择的原理全套PPT
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二、分子标记辅助选择的原理
以RFLP标记辅助选择抗病基因(R)为例: 标记基因型 P1:M P2:m F1:Mm F2:MM Mm mm
在MM群体中大多数个体由于连锁携带抗基因R,若重组 值为P,当基因纯合时,则
RR 概率为 : ( 1-P )2 Rr 概率为 :2P(1-P) rr 概率为仅为 :P2
处理软件。
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选择的正确率随重组率的增加而迅速下降。重组值越小, 其错选率越低。
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供体
M
R
受体
m
r
目标基因与DNA标记间的遗传距离位p 亲本中DNA标记的带型
M
m
M—抗性标记 R—抗性基因 m—感病标记 r—感病基因
R
r
F1杂种中DNA标记的带型
RR Rr rr (1-P)2 2P(1-P) P2
m—感病标记 r—感病基因
重组率
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
标记与目标基因间的重组率与F2群体中标记辅助 选择最少应选株数的关系
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三、分子标记辅助选择的条件
理想的分子标记应该是建立在 PCR 技术基础上,重复性高, 在广泛基因背景下都能表达,在不同研究者中能相互交换使用,
并能有效跟踪目标基因的标记,如SSR标记。
种子生产与经营专业
教学资源库
《作物育种技术》
分子标记辅助选择的原理
教学目标
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分子标记辅助选择(Marker-assisted selection,MAS)就是 利用与基因紧密连锁的分子标记,对目的基因进行辅助选择, 从而实现对基因的有效利用。
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猪MAS中的主效基因
-FUT1
FUT1是编码产肠毒素大肠杆菌F18受体的基因,决定抗性 的主效变异位点为M307G-A。
GG:易感型 AG:易感型
AA:抵抗型
PIC公司购买了FUT1基因检测专利,于2003年起在法国 和西班牙首先推出了能特异抵抗F18ab仔猪腹泻的新品系
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猪MAS中的主效基因
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主效基因的鉴别
QTL-QTG-QTN的鉴别法
基因组扫描 主效QTLs的初步定位
(20 cM) 主效QTL的精细定位(1-5cM) 寻找位置候选基因和多态标记
功能验证分析
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主效基因的鉴别
QTL-QTG-QTN的鉴别法 -设计科学缜密
- 标记选择效果明确 - 难度大 - 研发时间长 - 已发现的QTG/QTN有限
已建立简捷准确的RYR1基因检测技术 PIC公司应用该技术剔除易感个体,使 种群内因PSS致死的个体数从4-16头 /1000下降为零
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猪MAS中的主效基因
-RYR1
国内针对RYR1基因的种群选育改良工作仍有必要
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猪MAS中的主效基因
-PRKAG3
汉普夏猪的酸肉效应:
pH24显著低于其他猪种,致使火腿加工产量下降
体形外貌 生长速度
性状
恶性高温综合症 酸肉效应
断奶后仔猪腹泻易感性 精子短尾症 高血脂症
显性白毛和黑毛
椎骨数
背膘厚和产肉量
生长速度和背膘厚
基因
RYR1 PRKAG3
FUT1 KPL2 LDLR KIT/MC1R
NR6A1
IGF2
MC4R
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猪MAS中的LD标记
类别
繁殖性状
肉质性状
性状
产仔数 产仔数 产仔数 产仔数 肌内脂肪含量 肌内脂肪含量 嫩度和多汁性
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猪MAS中的主效基因
-PRKAG3
汉普夏猪酸肉基因研究的国际大合作
瑞典, 法国, 英国
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猪MAS中的主效基因
-PRKAG3
PRKAG3:农业动物中第一个采用位置候选克隆鉴别到的重要 经济性状主基因(Science, 288:1248-1281 )
1985年: 发现汉普夏猪的酸肉效应 1986年: 提出单基因控制酸肉效应假说 1990年: 验证了单个主效基因的存在 1995年: 酸肉基因(RN)定位于SSC15 1996年: RN基因的精细定位 1999年: 鉴别主效基因位点(R200Q) 2000年: 论文发表于Science
87
是
40
是
60
否
91
是
18
是
103
否
75
否
160
否
72
否
83
否
R-Q Q-Q R-R R-Q Q–Q R-R R-R R-R R-R R-R
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猪MAS中的主效基因
-FUT1
产肠毒素大肠杆菌F18侵染肠道,与其表面受体结合, 是造成断奶后仔猪腹泻和水肿的主要致病原之一
无受体猪:抵抗型 有受体猪:易感型
基因
ESR PRLR RBP4 FSHB A-FABP H-FABP CAST
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猪MAS中的主效基因
-RYR1
RYR1:第一个被鉴别的猪重要经济性状主基因 猪的兰定尼受体基因(RYR1)使敏感个体易在应激条 件下猝死,且易产生PSE肉(肉色苍白、渗水)
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猪MAS中的主效基因
-RYR1
正常个体
异常个体
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猪MAS中的主效基因
-KPL2
KLP2:内含子30中1个约9kb的逆转座子插入事件造成
外显子30的异常表达,形成无功能性蛋白,最 终导致精子短尾不育症(PNAS, 2006, 5006-11)
正常
内含子29
内含子30
异常
已用于芬系长白的选育改良
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MAS中的分子标记
直接标记(direct marker) -基因辅助选择(GAS)
鉴别的难度 育种价值
连锁不平衡标记(LD marker) -LD标记辅助选择(LD-MAS)
连锁平衡标记(LE marker) -LE标记辅助选择(LE-MAS)
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猪MAS中的主效基因
类别
遗传缺陷
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猪MAS中的主效基因
-PRKAG3
PRKAG3: 不利等位基因只存在于汉普夏及含其血缘的合成系
中,已应用PRKAG3育种技术淘汰不利个体
品种
数量 酸肉 PRKAG3
汉普夏1(瑞典) 汉普夏2(瑞典) 汉普夏3(瑞典) 汉普夏相关合成系1 汉普夏相关合成系2 汉普夏相关合成系3 皮特兰 杜洛克 长白 大白
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品种改良的关键
遗传基础 品种选育 种质扩繁
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品种改良的关键
基因型 环境
表型
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品种改良的措施
基因
h2
表型
估计育种值 EBV
环境
亲属的表型
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品种改良的措施
严格数量 遗传选择
猪的选种
MAS/GS
数量遗传
> 50年
性能测定是关键
生物技术
常规生 产性能
抗病性
个体鉴 定
> 20年
OObbsseerrvvaattiioonnss oonn ppHH ooff ppiigg mmeeaatt
77
"Hampshire effect"
=
Acid meat
pH
66
55
0
2
4
6
01 2 34
Standard Piétrain Hampshire
8
10
24
Slaughter
Time (hours)
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主效基因的鉴别
侯选基因法
-根据已知的生理生化功能进行选择 -分析基因内的遗传变异与表型的关联性
优点
-简单易行
不足
-侯选的鉴别
众多改变连锁不平衡(LD)的因素决定了许多候选基因标记 影响效应具有种群特异性
-重组 -选择 -迁移 -遗传漂变 -进化时间
产仔数 肉质
标记作用的大小 和数量是关键
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分子育种
育种值估计的模型假设:经济性状由微效多基因控制
QTL分析结果表明:存在主效基因
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分子育种
分子育种技术与数量遗传学技术相结合是当前种猪选育 改良的新手段
-提高育种值估计精度 -加大选择反应 如何建立分子育种技术 -有多少个主效基因? -影响的效应有多大? -选择改良的效果如何?
-KIT
KIT的重复突变和剪接突变决定西方猪群显性白毛表型
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猪MAS中的主效基因
-MC1R
MCIR的多重错义突变位点影响黑毛斑点的形成
KIT
+
MC1R
毛色选育
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猪MAS中的主效基因
-KPL2
精子短尾不育症:1987年首见于芬兰长白猪
至20世纪末芬系长白核心群种公猪中有82个患病个体