动物组织总RNA提取实验操作

合集下载

动物组织中总RNA的提取

动物组织中总RNA的提取

动物组织中总RNA的提取
1、取20--40mg的组织,转移至预冷的研钵中,加液氮研磨至粉末;
2、向研钵中加入400μl Buffer-R-I,用装有21-25号针头的注射器反复抽吸8-10次,并转入1.5ml离心管(试剂盒内提供);
3、加入150μl Buffer-R-II,漩涡振荡15-30s,12000×g离心5min;
4、取上述上清液至另一1.5ml 离心管,加入250μl异丙醇,混合均匀;
5、将制备管置于2ml离心管(试剂盒内提供),转移步骤4中的混合液到制备管中,6000×g离心1min
6、弃掉滤液,将制备管重新置于2ml离心管中,加入500μl Buffer -W1A,12000×g离心1min
7、弃掉滤液,将制备管重新置于2ml离心管中,加入700μl Buffer -W2,12000×g离心1min
8、重复操作7
9、弃掉滤液,将制备管重新置于2ml离心管中,12000×g离心1min
10、将制备管放入干净的 1.5ml的离心管中,在制备管膜中央加70-100μl Buffer-TE(DNase and RNase-free)或RNase-free水
11、室温静置1min,12000×g离心1min,洗脱得到RNA。

总RNA的提取及相关实验方法

总RNA的提取及相关实验方法

总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。

若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。

在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。

1.提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放置5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放置2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;4.取上层水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放置10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下自然干燥;7.用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。

PCR实验室常用DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。

TaKaRa Taq TM是一般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。

TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有一定的保真性,而且其扩增得到的PCR产物3’端附有一个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。

Pyrobest TM DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,其特点是保真性极高,扩增得到的PCR产物为平滑末端。

磁珠法动物组织总rna提取试剂

磁珠法动物组织总rna提取试剂

磁珠法动物组织总rna提取试剂磁珠法动物组织总RNA提取试剂是一种常用于从动物组织中提取总RNA的试剂。

总RNA是指包括mRNA、tRNA、rRNA等各种类型的RNA,它们在细胞中起到重要的生物学功能。

动物组织总RNA的提取对于研究基因表达、生物学功能以及疾病研究等领域具有重要意义。

下面将详细介绍磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理、操作流程以及优缺点。

一、原理:磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理是利用磁珠在磁场中的作用来实现RNA的分离和纯化。

磁性珠子(磁珠)是一种微米级别的颗粒,表面含有特异性结合分子(如寡聚核苷酸、抗体等),可以与RNA特异性结合。

通过结合物的磁场作用,可以将RNA与其他杂质分离开,并进行纯化。

二、操作流程:磁珠法动物组织总RNA提取试剂的操作流程通常可以分为样品处理、细胞破碎、RNA结合、磁珠分离、洗涤和洗脱等步骤。

(一)样品处理:首先要将收集到的动物组织样品进行样品处理,如清洗、离心等,以去除表面的杂质并提取细胞。

(二)细胞破碎:将经过样品处理的细胞进行破碎,以释放细胞内的RNA。

目前常用的破碎方法包括机械破碎、酶解和超声破碎等。

选择不同的破碎方法需要根据所研究的组织类型、细胞数量以及目标RNA 的适应性来确定。

(三)RNA结合:将破碎后的细胞溶液与磁珠结合试剂加入,并进行混匀。

通过磁性珠子表面的特异性结合分子与RNA结合,使得RNA能够与磁珠结合。

(四)磁珠分离:通过磁力,将含有磁性珠子的RNA溶液与其他不具有磁性的杂质分离。

可以利用磁力器将磁性珠子收集到一侧,将无磁性的溶液倒掉,从而分离纯化RNA。

(五)洗涤:为了去除残留的污染物,可以进行洗涤步骤。

将洗涤缓冲液加入含有磁珠的管中,再次使用磁力使磁性珠子沉淀,倒掉上清液,然后重复该步骤多次以保证洗涤的彻底性。

(六)洗脱:最后,用洗脱缓冲液将RNA从磁珠上洗脱下来。

将洗脱缓冲液加入磁性珠子所在的管中,轻轻摇晃管子,使RNA溶解在洗脱缓冲液中,从而得到纯化的RNA溶液。

动物组织中总RNA的提取

动物组织中总RNA的提取
探索疾病机制
通过对动物疾病模型的总RNA进行分析,有助于 揭示疾病发生、发展的分子机制,为药物研发和 疾病治疗提供依据。
物种进化研究
通过对不同物种的总RNA进行比较分析,可以研 究物种之间的进化关系,深入了解生物多样性。
02
总RNA提取的基本原理
RNA的基本结构与性质
总结词
了解RNA的基本结构和性质对于提取总RNA至关重要,因为 它们决定了提取过程中的许多因素,如使用的试剂、方法以 及RNA的稳定性。
疾病研究
RNA在各种动物疾病的发生和发 展过程中发挥重要作用,对其进 行分析有助于深入了解疾病的机 制和寻找治疗策略。
生物进化
通过对不同物种的RNA进行比较 分析,可以揭示物种之间的进化 关系和生物多样性。
总RNA提取的目的和意义
1 2 3
开展基因表达研究
提取高质量的总RNA是进行基因表达分析的前提, 如实时定量PCR、微阵列技术和RNA-seq等。
02
03
新鲜组织
确保组织新鲜,避免长时 间暴露在空气中,以免 RNA降解。
组织匀浆
将组织剪碎后放入匀浆器 中,加入适量的缓冲液, 充分匀浆。
组织清洗
匀浆后,用离心机将组织 碎片和杂质去除,得到澄 清的匀浆液。
细胞分离与破碎
细胞分离
将匀浆液通过离心机进行离心, 使细胞下沉,上清液为胞质成分 。
细胞破碎
药物疗效评估
在药物治疗过程中,监测动物组织中RNA的表达变化可以评估药物的疗效,为药物研发和优化提供参 考。
ห้องสมุดไป่ตู้
在药物研发中的应用
药物靶点筛选
利用总RNA提取技术,可以研究药物作 用机制,发现潜在的药物靶点,为新药 研发提供方向。

Trizol提取总RNA-碧云天改进

Trizol提取总RNA-碧云天改进

Trizol 法提取RNA实验步骤1.细胞裂解或组织匀浆。

a. 贴壁细胞吸尽培养液,每10平方厘米细胞加入1ml Trizol。

一般六孔板每孔加1ml Trizol,12孔板每孔加0.5ml Trizol。

晃动3-5下,再用枪吹打2-3下,确保全部裂解,然后吸至离心管中。

b. 悬浮细胞离心收集细胞,吸尽液体,每五百万至一千万动植物或酵母细胞,或一千万细菌,加入1ml Trizol。

用枪吹打或适当vortex,确保全部裂解。

某些酵母和细菌如裂解不充分,可用匀浆器匀浆,确保全部裂解。

c. 组织先将组织剪切成小块,放入普通玻璃匀浆器内。

每50mg-80mg组织加入1ml Trizol,匀浆。

对于RNA完整性要求比较高的情况,推荐先液氮冷冻组织块,然后在低温下用研钵研碎组织,随后再加入Trizol进行总RNA抽提。

2. 对于某些蛋白,多糖或脂含量很高的细胞或组织,Trizol裂解后可能会有不溶物或油脂状漂浮物。

需12,000g 4℃离心10分钟,然后吸取澄清的Trizol裂解产物至一新的离心管中。

3. 室温放置5分钟,使样品充分裂解。

4. 每毫升Trizol加入0.2ml氯仿,vortex混匀或猛烈晃动15秒,室温放置2-3分钟。

5. 12,000g 4℃离心15分钟,然后吸取含总RNA的上层无色水相至一新的离心管中,每毫升Trizol约可吸取0.5-0.55ml。

6. 按每毫升最初的Trizol加入0.5ml异丙醇,颠倒数次混匀,室温沉淀10分钟。

如果希望提取microRNA等小RNA,推荐-70℃沉淀过夜。

7. 12,000g 4℃离心10分钟,在管底可见RNA沉淀,弃上清。

8. 每毫升最初的Trizol加入1ml 75%乙醇(DEPC水配制),vortex或颠倒混匀,9. 7,500g 4℃离心5分钟,弃上清。

再用快速离心机甩一下,小心吸尽液体。

10. 待5-10分钟RNA略干后,加入20μlDEPC水溶解,-70℃冻存。

TRIzol法提取真核细胞和动物组织总RNA

TRIzol法提取真核细胞和动物组织总RNA

TRIzol法提取真核细胞和动物组织总RNA简介TRIzol是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相的快速抽提总RNA试剂,可以从动物组织,真核细胞等中提取总RNA。

它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,裂解细胞并释放出RNA。

加入氯仿离心后,溶液会形成上清层,中间层和有机层,RNA 分布在上清层中,收集上清层经异丙醇沉淀后便可以回收得到总RNA。

材料(1)试剂:RIzol、氯仿、异丙醇、75%乙醇、DEPC水、PBS 缓冲液等。

(2)器材:RNase Free EP管、冷冻离心机、组织匀浆器等。

实验步骤1、样品处理(1)细胞:收集细胞沉淀,加入1ml TRIzol吹打混匀。

(2)组织样品:取一小块样品于1.5ml离心管中,剪碎,加入TRIzol后匀浆器匀浆。

2、抽提RNA(1)室温孵育5min,加入200ul氯仿/1ml TRIzol,震荡混匀,室温静置3min。

(2)(提前预冷离心机)4°C ,12000×g离心15 min,离心后液体分为三层,小心吸取上层水相至新的EP管。

RNA在上层水相,中间层为DNA,下层为蛋白质。

吸上清时,不可吸到中间层,宁可少吸也不能多吸。

(3)加入500ul异丙醇/1ml TRIzol,上下颠倒混匀,冰上孵育10min。

(4)4°C ,12000×g离心10 min,弃上清。

(5)加入1ml 75%乙醇轻柔洗涤沉淀,短暂涡旋使沉淀漂起。

(6)4°C ,7500×g离心5 min,吸弃上清,静置干燥沉淀。

沉淀不能过干或过湿,待沉淀会变为半透明色即可。

(7)视沉淀量加入适量DEPC水溶解,轻轻吹打,-80°C长期保存。

3、总RNA 纯度、浓度和完整性检测(1)One Drop检测RNA纯度和浓度:纯净RNA的A260/A280的比值为2.0,小于1.9说明存在有机物污染,大于2.1则说明RNA发生了降解。

磁珠法动物组织总rna提取试剂

磁珠法动物组织总rna提取试剂

磁珠法动物组织总rna提取试剂动物组织总RNA提取是一项重要的实验步骤,其中磁珠法被广泛应用。

本文将介绍磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理、操作步骤和优势,以及其在科研工作中的应用。

一、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理磁珠法动物组织总RNA提取试剂是一种基于磁性珠子的提取方法。

其原理是利用磁性珠子表面的羧基与RNA中的氨基结合,形成稳定的结合,从而实现RNA的高效提取。

该试剂具有高选择性和高纯度的特点,可有效去除DNA、蛋白质和其他杂质。

二、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的操作步骤1. 准备工作:将动物组织样品切割成小块,并加入适量的细胞裂解缓冲液。

2. 组织裂解:利用机械或化学方法将组织完全裂解,使细胞内的RNA充分释放。

3. 加入磁性珠子:将磁性珠子加入细胞裂解液中,并充分混匀,使珠子均匀分散。

4. 结合RNA:在一定的温度和时间下,RNA与磁性珠子表面的羧基发生结合,形成RNA-磁性珠子复合物。

5. 分离复合物:利用磁性装置将RNA-磁性珠子复合物迅速沉降,然后去除上清液,以实现复合物的分离。

6. 洗涤:用洗涤缓冲液洗涤复合物,去除杂质和残余试剂。

7. 释放RNA:将洗涤后的复合物加入洗脱缓冲液,使RNA从磁性珠子上释放出来。

8. 收集RNA:将释放的RNA收集下来,即可用于后续的实验操作。

三、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的优势1. 高效性:磁珠法能够在较短的时间内提取高纯度的RNA,适用于大规模样品的处理。

2. 纯度高:该方法能够有效去除DNA、蛋白质和其他杂质,获得高纯度的RNA。

3. 灵敏度高:磁珠法能够提取低浓度的RNA,适用于少量样品和低表达基因的研究。

4. 操作简便:该方法操作简单,不需要复杂的仪器设备,适用于实验室内各种规模的科研工作。

5. 可靠性强:磁珠法提取的RNA具有较好的稳定性和可靠性,适合多种分子生物学实验的需求。

四、磁珠法动物组织总RNA提取试剂在科研工作中的应用磁珠法动物组织总RNA提取试剂在生物医学研究中广泛应用。

rna提取实验步骤

rna提取实验步骤

RNA提取实验步骤如下:
●匀浆处理:
●组织:将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆
仪进行匀浆处理。

●单层培养细胞:直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即
3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。

●细胞悬液:离心收集细胞,每5-10×106动物、植物、酵母细胞或1×107
细菌细胞加入1ml TRIzol,反复吸打。

加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。

一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。

将匀浆样品在室温(15-30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。

可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2-8℃10000×g离心10分钟,取上清。

每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。

2-8℃10000×g离心15分钟。

收集上清液。

使用酒精洗涤RNA,以去除离心管内残留的试剂和盐。

最后利用2-甲基硫氰酸盐(MECT)溶液进行脱水,使RNA干燥而不影响RNA的完整性。

此外,如果是从动物组织中提取RNA,还需要使用DNase I处理RNA,以去除残留的DNA。

如果是从细菌中提取RNA,需要先进行细菌的裂解和细胞壁的破碎。

同时需要注意,整个提取过程需要严格控制RNA酶的污染。

动植物总RNA提取-Trizol法

动植物总RNA提取-Trizol法

动植物总RNA提取-Trizol法Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。

用Trizol 法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。

RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交,Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。

1、将组织在液N中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1ml Trizol液研磨,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。

2、研磨液室温放置5分钟,然后以每1mlTrizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒。

3、取上层水相于一新的离心管,按每mlTrizol液加0.5ml异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置10分钟,12000g离心10分钟。

4、弃去上清液,按每ml Trizol液加入至少1ml的比例加入75%乙醇,涡旋混匀,4℃下7500g离心5分钟。

5、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。

然后将RNA溶于水中,必要时可55℃-60℃水溶10分钟。

RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。

[注意] 1、整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。

2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。

Trizol 是一种新型总RNA 抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。

TRIzol的主要成分是酚。

主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。

酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。

x0.1%的8-羟基喹啉的,与氯仿联合使用可增强对RNase的抑制x异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。

小鼠心肌组织rna提取

小鼠心肌组织rna提取

小鼠心肌组织rna提取
提取小鼠心肌组织的RNA可以采用多种方法,以下是一种常用的方法:
1.准备所需试剂和器材:TRIzol试剂、离心管、枪头、镊子、剪刀
等。

2.剪取小鼠心肌组织:将小鼠处死后,用镊子轻轻取出心肌组织,
并称重。

3.加入TRIzol试剂:将适量的TRIzol试剂加入离心管中,然后加
入剪碎的心肌组织,用剪刀搅拌均匀。

4.彻底破碎细胞:将混匀的TRIzol和心肌组织转移到研钵中,用
研磨棒研磨至匀浆。

5.离心:将匀浆液转移到离心管中,进行离心,以分离细胞碎片
和组织残渣。

6.移除沉淀物:将上清液转移到新的离心管中,并加入等体积的
氯仿,剧烈震荡后静置15分钟。

7.再次离心:将上清液再次转移到新的离心管中,进行离心,以
进一步分离RNA和其他杂质。

8.洗涤RNA:将上清液转移到干净的离心管中,用等体积的异丙
醇洗涤RNA沉淀。

9.晾干RNA:将离心后的RNA晾干,然后溶解在适量的DEPC水
中。

10.测定RNA浓度和质量:使用紫外分光光度计测定RNA浓度和
质量。

提取RNA的过程需要注意无菌操作,避免污染。

另外,为了保证提取的RNA质量和数量符合后续实验的要求,需要控制好提取过程中的一些关键因素,如剪碎组织的程度、加入TRIzol试剂的比例、研磨力度和时间等。

Trizol法提取动植物细胞组织总RNA

Trizol法提取动植物细胞组织总RNA

Trizol 法提取细胞/组织样本总RNA1. 所需试剂:名称来源储存条件有效期RNA Isolater Total RNA Extraction Reagent(R401)仓库4℃1年DEPC水配制间室温1周75%乙醇(DEPC水配)自备室温7天氯仿外购室温1年异丙醇外购室温1年2%琼脂糖凝胶自制室温1天Marker DL5000 仓库室温1年PBS缓冲液自备室温1年2. 所需耗材及仪器:序号名称序号名称1 冷冻离心机 4 制冰机、冰盒和冰2 通风橱 5 电泳仪及电泳槽3 RNase free枪头和EP管 6 OneDrop3. 操作步骤:3.1 细胞样本预处理1)小心倒掉细胞培养液,用移液器吸取5ml 1×PBS缓冲液小心加至培养皿中,轻轻晃动,将残留的培养液洗掉,用枪吸净PBS缓冲液,向每个培养皿中加入2 ml Trizol用枪吹打,使细胞完全悬浮和裂解。

(一般一次提取的1 mg RNA需要10盘HeLa Cell。

)2)将裂解的细胞转移至50 ml RNase Free离心管中,在超净台中分装至1.5 ml RNase Free EP管,每管分装1 ml。

3.2 动物组织样本预处理1)取动物组织样本50-100 mg于1.5 ml EP管中,向其中加入1 ml Trizol,用匀浆机高速匀浆,直至无明显颗粒状物质;或将动物组织剪成碎块,迅速转移至已用液氮预冷的灭菌研钵内,将组织碎块研磨成粉末,再称取50-100 mg于1.5 ml EP管中,并加入1 ml Trizol 中,用移液器吹打至无明显颗粒状物质。

3.3 植物组织样本预处理1)取新鲜植物组织样本15-30 mg于1.5 ml EP管中,向其中加入1 ml Trizol,用匀浆机高速匀浆,直至无明显颗粒状物质;或将动物组织剪成碎块,迅速转移至已用液氮预冷的灭菌研钵内,将组织碎块研磨成粉末,再称取15-30 mg于1.5 ml EP管中,并加入1 ml Trizol中,用移液器吹打至无明显颗粒状物质。

RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南

RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南

RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南RNA提取实验操作步骤、注意事项及问题指南准备试剂:氯仿,异丙醇,75℅⼄醇,⽆RNase的⽔或0.5℅SDS(溶液均需⽤DEPC处理过的⽔配制)。

操作步骤:1. 匀浆处理a. 植物组织:以叶⽚RNA提取为例.取新鲜叶⽚在液氮中充分研磨或将叶⽚剪碎后直接在Trizol中研磨,研磨要迅速,最好不要超过1min.,⼤约100mg 叶⽚使⽤1 ml Trizol.b. 动物组织:以⿏肝脏RNA提取为例.取新鲜或-70℃冻存组织,每50-100mg组织加1ml Trizol,⽤匀浆仪进⾏匀浆处理.样品体积⼀般不要超过Trizol体积的10%.c. 单层培养细胞.直接在培养板中加⼊Trizol裂解细胞,每10cm2⾯积加1ml Trizol.⽤取样器吹打⼏次.注意:Trizol加量根据培养板⾯积决定,不是由细胞数决定.如果Trizol加量不⾜,可能导致提取的RNA中有DNA污染.d.细胞悬液:离⼼取细胞,每5-10×106动物、植物和酵母细胞或每107细菌细胞加1ml Trizol。

加Trizol 前不要洗涤细胞,以免降解mRNA。

⼀些酵母和细菌细胞可能需要匀浆仪处理。

e.⾎液处理:直接取新鲜的⾎液,加⼊3倍体积红细胞裂解液,混匀后室温放置10min,10 000rpm 离⼼1min。

弃上清,收集⽩细胞沉淀。

每1ml⾎液收集的⽩细胞沉淀中加⼊1ml Trizol。

2. 将匀浆样品在15-30℃放置5mim,使得核酸蛋⽩复合物完全分离。

3. 可选步骤:4 ℃10 000rpm离⼼10min,取上清。

如果样品中含有较多蛋⽩、脂肪、多糖或肌⾁、植物结节部分等,可离⼼去除。

离⼼得到的沉淀中包括细胞外膜、多糖、⾼分⼦量DNA,上清中含有RNA。

处理脂肪组织样品时,上层是⼤量油脂,应除去。

取澄清的匀浆溶液进⾏下⼀步操作。

4. 每使⽤1ml Trizol加0.2ml氯仿,盖好管盖,剧烈震荡15s,室温放置3min。

rna提取 步骤

rna提取 步骤

rna提取步骤RNA提取是分子生物学实验中常用的一项技术,它可以从细胞或组织中提取RNA分子,为后续的RNA分析和研究提供基础。

RNA 提取的步骤包括样品收集、细胞破碎、RNA溶解、纯化和质量检测等。

下面将详细介绍RNA提取的步骤。

1. 样品收集在进行RNA提取之前,首先需要收集合适的样品。

样品可以是细胞培养物、动物组织或植物组织等。

在收集样品时,要注意避免RNA的降解。

可以将样品存储在RNA保护液中,或者迅速冷冻保存。

2. 细胞破碎将样品中的细胞破碎是RNA提取的关键步骤之一。

常用的方法有机械破碎、化学破碎和酶解等。

机械破碎可以通过离心或超声波处理来实现,化学破碎则是通过加入蛋白酶K等蛋白酶来破坏细胞膜,而酶解则是利用特定的酶来降解细胞壁和细胞膜。

3. RNA溶解破碎后的细胞中存在着大量的RNA酶,这些酶会降解RNA分子。

因此,在提取RNA之前,需要添加RNase抑制剂来阻止RNA的降解。

同时,还需要加入蛋白酶来破坏蛋白质,使RNA与蛋白质分离。

4. 纯化为了从混合物中分离出RNA分子,需要进行纯化步骤。

常用的纯化方法有酚/氯仿法、硅胶柱法和磁珠法等。

酚/氯仿法主要是通过酚和氯仿的密度差异来分离RNA和其他杂质。

硅胶柱法则是利用硅胶膜上的亲水性来吸附RNA分子。

磁珠法则是通过磁珠上的特定配体与RNA的结合来实现分离。

5. 质量检测提取到的RNA需要进行质量检测,以确保其完整性和纯度。

常用的检测方法有琼脂糖凝胶电泳、比色法和荧光测定等。

琼脂糖凝胶电泳可以根据RNA的大小和形态进行分析。

比色法和荧光测定则可以用来测定RNA的浓度和纯度。

RNA提取是一项复杂的实验技术,需要经过样品收集、细胞破碎、RNA溶解、纯化和质量检测等步骤。

每一步都需要仔细操作,以确保提取到高质量的RNA样品。

RNA提取的成功与否直接影响到后续的RNA分析和研究结果,因此在实验中应尽可能遵循标准操作规程,以获得准确可靠的实验结果。

总RNA的提取和检测 实验报告

总RNA的提取和检测 实验报告

实验二总RNA的提取和检测实验目的1.掌握从动物组织细胞中提取总RNA的方法;2.熟悉紫外吸收法检测RNA浓度与纯度的原理及测定方法;3.掌握RNA琼脂糖凝胶电泳方法并分析总RNA的电泳图谱;实验原理(一)概述1. 10-5 µg RNA/细胞含有rRNA 80-85%:28S 18S 5StRNA, snRNA 10-15%mRNA 1-5%2. mRNA 3’端存在20-250个多聚腺苷酸(polyA) 结构,可用oligo(dT)亲和层析柱分离mRNA。

3.RNA分离的方法:异硫氰酸胍氯化铯超速离心法,盐酸胍-有机溶剂法,氯化锂-尿素法,蛋白酶K-细胞质RNA提取法、异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法等。

4.目前常用的是Trizol法。

(二)Trizol的主要成分1.Trizol 是一种新型总RNA 抽提试剂,主要成分是异硫氰酸胍和苯酚。

异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,其主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白/核酸物质解聚得到释放。

2.酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。

3.溶解组织细胞的混合物在氯仿作用下溶液分为水相和有机相,RNA在上层水相中。

4.取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA。

(三)总RNA的纯度检测原理:不同波长的单色光通过溶液时其光的能量就会被不同程度的吸收,光能量被吸收的程度和物质的浓度有一定的比例关系。

RNA在260nm紫外光波长处有最大的吸收峰。

因此,可以用260nm波长分光测定RNA浓度,OD值为1相当于大约40μg/mL 的单链RNA。

用PH=7.6 的TE(tris HCl缓冲液)稀释RNA样品n倍并以TE为空白对照,根据此时读出的OD 260 值即可计算出样品稀释前的浓度:RNA (mg/mL) = 40×OD 260 读数×稀释倍数(n)/1000实验步骤(一)样品处理与Trizol用量1.提取组织RNA时,每50~100mg组织(即0.5×0.5×0.5cm,约合0.1cm3)用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;2.悬浮细胞先离心沉淀,每5-10×106个细胞加1mL Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞。

动物组织细胞总RNA的抽提及检测(TRIzol法)

动物组织细胞总RNA的抽提及检测(TRIzol法)

动物组织/细胞总RNA的抽提及检测(TRIzol法)背景知识:细胞质总RNA中,有rRNA、tRNA、mRNA等。

绝大多数mRNA分子(除血红蛋白、干扰素和有些组蛋白mRNA外)的3’端存在20~250个多聚腺苷酸PolyA。

利用此特性,可很方便得从总RNA中,用寡聚(dT)亲和层析柱分离出mRNA。

RNA分离的关键因素是尽量减少RNA酶的污染。

RNA酶是一类生物活性非常稳定的酶,除细胞内RNase以外,环境中的灰尘、各种实验器皿和试剂、人体的汗液以及唾液中均存在RNase。

这类酶耐热、耐酸、耐碱,蛋白质变性可使之暂时失活,但在变性剂去除后,又可恢复活性。

所以在实验的操作过程中,应尽量减少RNAse污染的机会。

在整个操作过程中,在一个洁净的环境中,戴手套和口罩,所用的器皿、水和试剂需用焦炭酸二乙酯(DEPC 很强的RNAse抑制剂)处理过。

玻璃器皿的处理。

在常规洗净后,应用0.1% DEPC浸泡2h以上,再用双蒸水漂洗几次,高压消毒去除DEPC,然后250℃烘烤4h以上。

塑料器材应用一次性的、新的,在使用前高压消毒,严格一些可以用0.1%DEPC浸泡过夜,高压灭菌。

所用试剂应加DEPC至0.05%~0.1%,室温过夜,然后高压处理。

但是,Tris与DEPC反应,所以在配制Tris时,应用DEPC处理过的水配制,最好再高压消毒。

方法一:1.取新鲜动物组织0.1~0.2g置于研钵中,用剪刀剪碎组织,研钵中加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再加少量液氮,再研磨成粉末状,每100mg组织加入1ml TRIzol,在水浴中迅速匀浆15~30秒,以充分研碎组织。

然后,将细胞悬浮液吸入另一1.5ml微量离心管中,室温下静置5min。

2.若为贴壁细胞,培养预定时间后,弃掉沉淀培养液。

将TRIzol试剂直接加到贴壁细胞上,室温放置10min;若为悬浮细胞,则直接离心收集细胞后用TRIzol重悬、裂解,每1ml TRIzol可裂解5*106个动物、植物或酵母细胞,或1*107个细菌菌体。

动物组织细胞总RNA的提取实验原理及步骤

动物组织细胞总RNA的提取实验原理及步骤

实验十一动物组织细胞总RNA的提取一、实验原理RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。

对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。

获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。

由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。

再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。

在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase 活性,保护RNA分子不被降解。

因此提取必须在无RNase的环境中进行。

可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。

提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。

并有助于除去非核酸成分。

本实验介绍异硫氰酸胍法和TRIzol法提取动物组织总RNA并通过电泳进行鉴定。

二、仪器和试剂1.仪器:超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管、玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。

2.试剂:(1)细胞裂解液:异硫氰酸胍 4mol/L柠檬酸钠(pH7.0) 25mmol/L十二烷基肌氨酸钠 0.5%β-巯基乙醇 0.1mol/L称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。

然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍 25g,混合,完全溶解后4℃保存备用。

(2)10×凝胶缓冲液:吗啉代丙璜酸(MOPS)(pH7.0) 200mmol/LNaAc 100mmol/LEDTA(pH 8.0) 10mmol/L过滤除菌后避光保存。

sds法提取组织rna步骤

sds法提取组织rna步骤

sds法提取组织rna步骤SDS法是一种用于提取组织中RNA的常用方法,它可以有效地去除蛋白质和其他杂质,并保持RNA的完整性。

下面是使用SDS法提取组织RNA的一般步骤:1.组织采样:首先,从您感兴趣的组织中采集样品。

可以选择常规的研究动物组织,如小鼠或大鼠的脑、肝脏等,也可以选择与您的研究相关的特定组织。

2. 样品处理:将采集的组织样品立即放入含有RNA保护剂(如RNAlater)的离心管中,并迅速冷冻保存在液氮中,以避免RNA的降解。

您还可以直接将组织样品置于离心管中,然后立即冷冻。

3.组织破碎:将冷冻的组织样品快速研磨成细粉末,并在冰上迅速加入SDS试剂,即一种非离子表面活性剂。

SDS有助于去除蛋白质,并释放RNA。

4.RNA溶解:将组织破碎后的样品在高温条件下(通常在60-70°C)孵育一段时间,以使SDS充分溶解,蛋白质释放并RNA保持完整。

5.脱脂:加入等体积的酚/氯仿/异丙醇混合物,并轻轻混合,以去除脂质、蛋白质和其他杂质。

混合物将产生两个相,上层为水相(含RNA),下层为有机相(含脂质和蛋白质)。

用玻璃针或移液管将上层水相转移至新离心管中。

6.沉淀RNA:向新的离心管中加入等体积的异丙醇,再次混合。

异丙醇可将RNA沉淀出来。

离心管以最高速度离心(通常在4°C下)10-15分钟。

7.去除异丙醇:将离心管倾斜,轻轻倾倒异丙醇。

使用70%乙醇重悬RNA沉淀,通过洗涤去除残留的异丙醇。

8. 干燥RNA:通过将离心管在室温下挥发乙醇的方法进行干燥。

干燥后的RNA易溶于RNase‐free水中。

9. RNA质量评估:使用紫外吸收光谱(如NanoDrop)或凝胶电泳等方法来评估提取的RNA的浓度和完整性。

确保提取的RNA是高质量和完整的,以便后续分析。

使用SDS法提取组织RNA时,需要注意以下几点:-在样品处理和样品破碎过程中,要尽量避免RNA的降解。

保持样品的低温和快速操作对于RNA的完整性至关重要。

提取RNA步骤

提取RNA步骤

实验目的:提取动物组织RNA,备后续实验使用。

实验试剂:研钵、镊子、刮勺、冰盒、试管架、微量移液器、RNA无酶管、低温离心机、酒精、液氮、Takara RNA提取试剂盒、去除DNA试剂盒冰袋实验步骤:1、实验准备:研钵中加入少量酒精,点燃,灭菌后,超净台灭菌30min(包括研钵、镊子、刮勺、试管架、微量移液器、RNA无酶管)。

2、取液氮、冰袋备、冰盒备用3、将研钵预冷,其中大研钵的可以放在冰袋上,然后再倒入液氮,小研钵直接倒入少量液氮预冷。

4、将超低温冻结的RNA 提取样品,剪取绿豆到黄豆大小组织(不能太大,不要大于黄豆大小),迅速转移至用液氮预冷的研钵中,用研杵研磨组织,其间不断加入液氮,直至研磨成粉末状(无明显的可见颗粒,如果没有研磨彻底会影响RNA 的收率和质量)。

可用刮勺将其刮到一团。

5、可以向4的研钵中加入适量的含有裂解液的Buffer RL,(大约700ul),确保研磨成粉末状的样品完全覆盖,然后室温静置(研钵倾斜放置),直至样品完全融化后用枪头吹打混匀,只至液体中无明显沉淀。

这期间可以研磨下一组织.6、将步骤5中的匀浆液转移至1。

5mlRNA无酶管中,12,000 rpm,4℃离心5 分钟。

期间配置70%乙醇(7份无水乙醇+3份水(为试剂盒中的RNA无酶水))7、小心吸取6步骤上清液(吸取400ul即可),移入1。

5ml的RNase Free collection(切勿吸取沉淀,否则会阻塞后面的膜)。

然后向其中加入等体积的70%乙醇,此时可见沉淀,立即摇匀。

8、将7中的混合液,取600ul(要小于600ul)到RNA spin column (含2ml collection Tube)中,12,000 rpm,4℃离心 1 分钟,弃滤液。

将RNA spin column 放到2ml collection Tube 管中。

9、将500ul buffer RWA加入至RNA spin column 12,000 rpm,4℃离心30s,弃滤液。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

常规动物组织总RNA提取
(Trizol法)
实验操作流程
1摘要
本标准操作规程适用于一般动物组织的总RNA提取,一般情况下能得到高质量的总RNA。

2提取步骤
a)用液氮预冷研钵,组织样品放入加有液氮的研钵中,在液氮下把组织样品充分研磨成
粉末。

b)把样品粉末转入到装有TRIzol裂解液的2.0mL EP管中,(每mL裂解液可加50mg组
织样品)剧烈震荡,充分混匀,平放室温静置5-10min。

c)10000rpm,4℃离心5min。

d)吸取上清液至新的2.0mL EP管中,每毫升裂解液加入200μL氯仿/异戊醇,剧烈颠倒
混匀。

e)10000rpm,4℃离心10min。

f)吸取上清液至新的1.5mL离心管,注意不要吸到中间蛋白层,加入等上清液体积的异
丙醇,轻轻颠倒混匀。

g)放入-20℃冰箱沉淀1h。

h)13600rpm,4℃离心20min。

i) 吸弃上清,加入1mL 75%乙醇,用移液器吹洗沉淀。

j) 10000rpm,4℃离心3min,吸弃上清,短暂离心,吸去残留液体,晾干3-5min。

k)用30-100μL DEPC水或者RNase-free水溶解沉淀。

3设备与试剂
3.1设备
3.2试剂。

相关文档
最新文档