用RAPD技术检测野生鲫鱼的四个金鱼代表品种的基因组DNA多态性 Detection of the Genomic DNA Poly

合集下载
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

道利用 R P A D技术对一些动植物的遗传多样性进行研究,在动物方面如对原生动物C 、鼠〔 滇金丝 8 ) 9 ) 猴〔) 1 、蛇〔) 0 ‘ 均有报道,但用R P ’ A D方法对鱼类进行研究报道较少c 1 。本文在前人研究的基础上,利用 2 )
R P 技术 ,并 辅 以适 当的统 计分析 ,对 卿鱼 和金鱼 主要代 表 品种 的基 因组 D A D NA 进行多态 性分析 ,在 DN A 分子水平上 为金鱼 的起源提供 新的佐 证, 同时进 一步深 人探讨 了金鱼主要 品种 的系统演化关 系。
U i R P T cn u s g D hi e n A e q
WA NG i me S NG eqn I l C N u a g X a i o O W n i L Xia u n HE R i n y
(eatet ioyN naU i rt T nn 07) D pr noBo g, ki v sy i j 3 01 m f l a n e i, i 0 a A s at e o c bt c G n miD r NA l rhs i t wl cui f m o f e t a ad fu r r p y p i n i rc n t df rn aes i o r e o mo ms h e d a r w ie o r n n e - p
合酶( 北京高登沃德生物制品有限公司) 。反应混合物用石蜡油覆盖。D NA扩增采用Poee R循环仪( rgn P C 英国
T cn 公 Fra Baidu bibliotek) 每 个反应 为 4 个循 环, 前 8个循环 9 ℃变 性 1 , ℃退火 1 , ℃延 伸 2 n eh e 。 0 4 mn 3 i 6 mn 7 i 2 mi ;后 3 个 2

gli ad l fh o fh oagl i . d s n v ods
K y rs l cui , lfh R P Ss ma c lt n e w d Wi rc n Godi , D, t t eoui o d a s A ye i v o 金鱼是世界 著名 的观 赏鱼类之 一,它 以其绚丽 的色彩、优美 的体 态以及典雅 的游 姿深受人们 的喜爱。体态奇
拍照。

1 . 5数据分析 任意两个品种间的遗传距离() P根据两个品 共享度() 种的 F来计算〔, ’: 。
P=1 F F 2 Q ( + h - ; N 6 N N ) = /

5 期

王晓梅等: R P 技术检测野生螂鱼和 四个金鱼代 表品种 的基 因组 D 用 AD NA多态性



风 和 戈 分别为ab品种拥有的R D标记数,戈。 , , AP 为ab两个品种共同拥有的R P A D标记数。根据遗传
化而来,聚类结果表明, 草金鱼形成后,首先演化为文种鱼,然后由文种再形成龙种和蛋种两个品系。 关键词 螂鱼,金鱼,R D,系统演化 AP
分 类号 Q 4 , 3 39 Q 5 9

D t t n h G nmc A lm rh m ite l e co o te o iD P y opi s h Wi e i f e N o s n d C ui ad uR peette r ts o fh rc n F r r nai V ii oG l i a n o e s v a ee f d s

距离P值,再用类平均法〔〕 1 求出类间 4 距离后再聚类。

2结



2 RP . A D扩增结果 1
我们采 用了 5 0个随机 引物进 行扩增,选取其 中 2 个引物扩增产物电泳带型清晰的用于数据统计,实验 中这 6 2 6个引物 在各品种实验鱼 中平均获得约 14 带( 3 条 标记) 个引物平均提供约 5 个标记 ,单 个的引物扩增出的 ,每 . 2 R P 标记在 1 1 AD - 6个之间( 2。图 1 表 ) 列举 了几个引物扩增产物 的电泳带数。 表 2 随机 引物序 列及 扩增结果
的 酚、 氯仿 ( :1 提 数次 , 取上 清 液加 人 两倍 体 积 的无水 乙醇 沉淀 DN 1 ) 抽 A,干 燥后 用 适量 的 T E缓 冲液 ( 1 0

m o/ r- C, . 1 o/ D A溶解,再经R a 及蛋白 m l TiH I H 0 m l E T ) L s p 8 , m L Ns e 酶K处理后置冰箱 备用。 1 P R扩增 . C 3

1材









11材料 .
1. . 1实验 鱼 1 野 生螂鱼 分别 采 自天津 市蓟县 于桥水库 和天津市 西青 区南河镇境 内的独流碱河 ,金鱼来 自天津

市北辰区多助养殖场,按新的五类分类法〔〕金鱼选取草金种、文种、龙 ’, 3 种和蛋种4 大类的代表品 种。实验鱼
经鉴定后取 出肝脏, 置于一 0 2 ℃备 用( 见表 1 ) . 1. .2随机引物 由美国哥 伦比亚大学合成 ,香港大学动物系孙梅博 士惠赠。 1 表 1 野生螂鱼和 4 个金 鱼代 表品种
①天津农学院水产系教师,在职研究生。 ②通讯联系人。





传 HE E T S ei ) 8 R DIA ( i g 19 Bj n 9

2卷 0

白电泳的 基本谱带相似〔 。这些实验结果均科学地证实了金鱼起源于卿鱼,二者属于同一物 7 ) 种。但前人对金 鱼
品种 内的系统演化 关系至今 尚未取得 一致意见. 自 Wii s We h 90 lm 和 l a l ( )创 立 R D 技术 以来 ,已广 泛用于基 因组研 究的各个方 面,RA D技 术尤对 s 19 AP P 未知基 因序列的物种 的品种 鉴定及物种 的亲缘 关系和进 化方面的研究有着 独到之处。近年 来,国 内外已有许多报

snai vrts o fh r dt t b ui rno a le pl opiDNA A D) - ette ii o gl i w e e e y n adm i d y rhc ( P t h v a ee f d s e e c d s g mpf o m i R e c nqeT e o c o ec vrt o fh s li wt 2 pi r On rg, u 14 i . gnmiDNA ah iy i w a ie i 6 me . ae eaot u h e f ae f a mpfd h r s s va b 3
R P A D扩增的基本条件是:P R反应体系为 2p,其中含有 1 m o/ r- C, . 5 m o/ C 5l 0 l Ti H Ip 8 , m l m L s H 3 0 L

K I . m l C, o/ 0, 3 u L引物,20m l L T, m o/ Cr 2- 0 组D A 1U q A聚 0, o/ N P 2 m l L l 0- n 基因 N , T D u d . 0 Mg , 4 g . a N 5
R D akr w r o sre b ec vr t. m res and a g pie vr d m t AP m res e evd ah i y T e kro ti b s l r r i f 1 e b y ae h a b e y i e m a e r n o o 1. s tta a a s o t epr e t rsl id ae ta rn o a li p l op iD 6 T e ii l l i f xei na eu s i t ht d m ie o m rh NA h t sc n y s h a e m l t n c d a mpf d y c o t g lfh d l cui hv a h p ro o rno a li p l op iDN f g e t f od s a w d c n e i po ot n a d m ie oy rh h e i n i r a a hg r i f mp fd m c A m n r a sa d T ifr e vr i ta g lfh eovd m i cui . c s r l isget ta hr . s t r ie h t di i v l f wl rc n T e t a a s ugs d t e h u h e fd o s s e r o d a h l e n y s u e h at e eg g gas l i ie o e t w n lfh te truh n lfh l d dao ee f r ri , s g d s s l d e g di , n o g w g di eov t rgny e m n r o fh v v o o s h h e o s v e o

1 . 2基因组 DN A的提取
将实验鱼肝脏 0 -0 m . - g在液氮中研成粉末转至 5 E pnof 2 . 5 m] edr管中,加 2 l p mD NA提取缓冲液( ( 1 0

m o/ r- C, .7 m o/ al . S S5 o/ D A,于6℃ m l L sH I H 0 5 l L C, D , l L T ) Ti p 8 , m N 0 % 5 m m E 5 保温 1分钟、加等体积・ 0

鱼 ( aas s au V r 代表品种的基因组DNA的多态性。用 2 C rsu arts . i u a) 6个随机引物对各品种实验鱼的基
因组 D NA进 行扩增 ,平均 每个 品种 观察 到约 14个标记 ,单 个引物获得 的标记 在 1 1 个之 间。实验 3 一 6

结果经统计学分析表明,金鱼和螂鱼的随机扩增多态D A共享度高,进一步证实了 N 金鱼由野生螂鱼演

循环 9℃变性 3s 3℃退火 I , ℃延伸 2 n 4 0, 6 mi 7 n 2 mi;首次循环前 9℃变性 5 ,最后循环后 7℃再延伸 7 mi n 2
8 n 每次反应均设 不含模板 D mi 。 NA 的空 白对 照。 1 . 4电泳

R P A D产物用 1 %琼脂糖凝胶电泳分离(.x E 3 c . 8 (5 B , m恒压) 0 T V/ ,澳化乙咙染色后,紫外透射仪上观察和
遗传 HE E T S eig 2()7 1 9 R DIA ( in) 5 一1 1 8 Bj 0 : 9

用R P A D技术检测野生螂鱼和四个金鱼 代表品种的基因组 D A多态性 N
王晓梅① 宋文芹 李秀兰 陈瑞阳②
( 南开 大学生 物系, 天津 30 7) 0 01





利用 随机扩增多态 DN 技术检 测了两个不 同地 区的野生细鱼 ( aas s au L) 4 A C rsu a rts 和 个金 i u .
品 种 野生螂鱼

一于 水 桥库
1 0 1 72 2.

独流碱河
1 0 757 . 1 0 2. 34 1 0 94 . 1 0 1. 65 1 0 1. 44

红草金鱼

红 文鱼

红龙睛鱼

红泡眼鱼

个体数 平均体重 ( g ) 年 龄

1 +

1 +

1 +

1 十

l +

l +

注: 为叙 述方便, 螂鱼也称 为一个品种 ; 品种 的金鱼 英文名称 来 自罗莉 中(92、傅仪远(97和梁前 进( 9) 将 各 18) 18) 1 4. 9

异的金鱼与江河湖泊中的野生鱼类有着极大的不同,在自然水域找不到它的踪影,它是人工饲养的产物。但据史
料记载,金鱼起源于 中国的野生卿鱼 ,根据这一历史记 载,前人 已从 多方面进行研究 ,发现螂鱼可和任何 品种 的

金鱼进行杂交〔 ;金鱼和卿鱼的各期胚胎发育不仅形态相似,且同温下胚胎发育速度相同( ;染色体数目 ’ 〕 2 ) 相 同、 形态相似( ;金鱼和螂鱼同组织中的酷酶及乳酸脱氢酶同工酶谱带基本相同〔 6;金鱼和卿鱼的肌肉 3 ) 4) - 蛋
相关文档
最新文档