第8章 原核基因的表达与调控
分子生物学课程教学大纲
分子生物学课程教学大纲课程名称:分子生物学(Molecular Biology)课程编号:1313072215课程类别:专业课总学时数:68 课内实验时数:18学分:3.5开课单位:生命科学学院生物技术教研室适用专业:生物技术适用对象:本科(四年)一、课程的性质、类型、目的和任务分子生物学为高等学校生物技术专业学生必修的一门专业基础课,是从分子水平研究生命本质为目的的一门新兴边缘学科,主要研究核酸、蛋白质等生物大分子的功能、形态结构特征及其重要性和规律性的科学,是人类从分子水平上真正揭开生物世界的奥秘,由被动地适应自然界转向主动地改造和重组自然界的基础学科。
通过分子生物学的教学,应使学生了解分子生物学的发展历史以及最新研究成果;熟练掌握DNA的结构与功能、RNA在蛋白质合成中的功能、蛋白质的结构与功能、遗传密码及基因表达调控的本质;了解现代分子生物学基本研究方法,并能运用分子生物学的理论知识分析、研究和解决问题,为进一步学习有关专业课程及从事基因工程领域的研究工作奠定基础。
二、本课程与其它课程的联系与分工从学科角度来讲,分子生物学涵盖面非常广,与生物学、生物化学和细胞生物学、遗传学等生命科学课程有交叉,《生物化学》是先修课程。
三、教学内容及教学基本要求[1]表示“了解”;[2]表示“理解”或“熟悉”;[3]表示“掌握”;△表示自学内容;○表示略讲内容;第一章绪论第一节引言创世说与进化论[1];细胞学说[2];经典的生物化学和遗传学[3];DNA的发现[2]第二节分子生物学简史[1]第三节分子生物学研究的主要内容分子生物学的含义[3];DNA重组技术、基因工程技术概念[3];分子生物学研究的主要内容[3]第四节展望分子生物学的一些分支学科[1];分子生物学发展的趋势[1]重点:分子生物学的含义和研究内容难点:分子生物学的研究内容教学手段:多媒体教学教学方法:讲授法作业:1.简述阵德尔、摩尔根和沃森等人对分子生物学发展的主要贡献。
原核生物的转录与调控.ppt
例如:lac基因簇(乳糖操纵子中的三个结构基因)
原核生物操纵子中的全部结构基因从同一个启动子开 始-转半录乳成糖一苷个分多解顺酶反子的mRNA分子。
-半乳糖苷透性酶
Plac
硫代半乳糖苷乙酰转移酶
二、转录水平的调控-操纵子
3. 操纵基因:是原核生物的操纵子中调节蛋白的结合 位点,为控制结构基因转录的DNA序列。
和终止的调控。
机体可以在基因表达过程的任何阶段进行调控,一般以 转录水平上的调控为主。
二、转录水平的调控-操纵子
1. 操纵子
操纵子是原核生物基因结构、表达和调控的基本形式。 一个操纵子包括一个上游的调控区和一个以上的结构基 因组成。 调控区包含启动子和操纵基因两部分。该区控制连锁在 一起的多个基因的转录。
4. 调节基因:仅指参与其他基因表达调控的RNA和蛋 白质的编码基因。
调节基因编码的调节蛋白通过与DNA上的操纵基因结 合而控制结构基因的转录,是基因表达调控的关键。
二、转录水平的调控-操纵子
5. 反式作用因子与顺式作用元件
基因表达的产物(蛋白质或RNA)从合成的场所扩散到目 标场所而发挥作用的过程称为反式作用(trans-acting), 此基因表达产物被称为反式作用因子(trans-acting factor) 。
反式作用因子通常为蛋白质或RNA,其特征为可以从合成 地扩散到目标场所发挥作用。
顺式作用元件(cis-acting factor)是指对结构基因表达 有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在 一个DNA分子上的基因。顺式作用元件通常不编码蛋白 质,多位于基因旁侧或内含子中。
顺式作用(cis-acting)的概念用于任一不转变为任何其 他形式的DNA序列,它只在原位发挥DNA序列的作用, 仅影响与其物理上相连的DNA序列的活性。
第八章-原核生物基因的表达调控-2
调控结构:启动子、操纵子、前导序列、弱化子; 调控结构:启动子、操纵子、前导序列、弱化子; 阻遏物trpR基因:与trp操纵子相距较远; 基因: 操纵子相距较远; 阻遏物 基因 操纵子相距较远
• 2.色氨酸操纵子的负调控: 色氨酸操纵子的负调控: 色氨酸操纵子的负调控
阻遏调控: ⑴. 阻遏调控: trpR基因编码无辅基阻遏物 基因编码无辅基阻遏物 与色氨酸 结合 形成有活性的色氨酸阻遏物 与操作 阻止转录; 子结合 阻止转录; 色氨酸不足: 色氨酸不足:阻遏物三维空间结构发生变 不能与操作子结合,操纵元开始转录; 化 ,不能与操作子结合,操纵元开始转录; 色氨酸浓度升高:色氨酸与阻遏物结合, 色氨酸浓度升高:色氨酸与阻遏物结合, 空间结构发生变化,可与操作子结合, 空间结构发生变化,可与操作子结合,阻止转 录。
另一方面,若外源色氨酸浓度实在太低, 另一方面,若外源色氨酸浓度实在太低,细 菌本身又没有其他的内源性色氨酸合成体系, 菌本身又没有其他的内源性色氨酸合成体系, 以致细菌难以支持自身的生长时, 以致细菌难以支持自身的生长时,就需要有衰 减体系加以调节——通过不终止 通过不终止mRNA的合成 减体系加以调节 通过不终止 的合成 来增加Trp酶的合成从而提高内源色氨酸的浓 酶的合成从而提高内源色氨酸的浓 来增加 度。
就像在色氨酸操纵子中, 就像在色氨酸操纵子中,阻遏作用与衰减机制 一起协同控制其基因表达, 一起协同控制其基因表达,显然比单一的阻遏 负调控系统更为有效。 负调控系统更为有效。 一方面, 一方面,当有活性的阻遏物向无活性阻遏 物的转变速度极低时.衰减系统能更迅速地作 物的转变速度极低时. 出反应, 出反应,使色氨酸从较高浓度快速下降到中 等浓度;色氨酸密码子时 由于 如缺乏色氨酸, 如缺乏色氨酸 没有色氨酰tRNA的供应 停留在该密码子位置, 没有色氨酰 的供应 停留在该密码子位置,位 于区段1 使区段2与区段 与区段3配对 区段4无对应序 于区段 使区段 与区段 配对 区段 无对应序 聚合酶通过弱化子, 列配对呈单链状态 RNA聚合酶通过弱化子,继续向 聚合酶通过弱化子 前移动,转录出完整的多顺反子序列。 前移动,转录出完整的多顺反子序列。
原核生物的基因表达与调控
非编码RN的作用
参与基因表达调 控:非编码RN 可以调控基因的 表达影响蛋白质 的合成
参与转录后调控: 非编码RN可以 参与转录后的调 控影响mRN的 稳定性和翻译效 率
参与翻译调控: 非编码RN可以 参与翻译调控影 响蛋白质的合成 和翻译后修饰
参与表观遗传调 控:非编码RN 可以参与表观遗 传调控影响基因 的表达和功能
别
翻译起始调控: 包括正调控和 负调控影响翻
译效率
正调控:包括 启动子、增强 子等促进翻译
起始
负调控:包括 沉默子、终止 子等抑制翻译
起始
翻译延伸的调控
核糖体:蛋白质合成的场 所
起始密码子:蛋白质合成 的起始点
终止密码子:蛋白质合成 的终止点
延伸因子:参与蛋白质合 成的延伸过程
释放因子:参与蛋白质合 成的释放过程
时序调控机制的研究进展
发现基因表达调控的时序性
研究基因表达调控的调控网络
研究基因表达调控的机制 发现基因表达调控的调控因子
研究基因表达调控的调控机制在原核生物 中的作用
研究基因表达调控的调控机制在原核生物 中的调控机制
07
原核生物基因表达调控的应用前景
基因工程与合成生物学中的应用
基因工程:通过基因重组 技术将外源基因导入原核 生物实现基因表达调控
合成生物学:通过设计、 构建和优化基因回路实现 原核生物的基因表达调控
生物制药:利用原核生物 基因表达调控技术生产药 物、疫苗等
生物能源:利用原核生物 基因表达调控技术生产生 物燃料如乙醇、生物柴油 等
环境保护:利用原核生物 基因表达调控技术降解污 染物实现环境修复
农业:利用原核生物基因 表达调控技术改良作物品 种提高作物抗病、抗虫、 抗逆能力
原核生物基因表达调控概述
原核生物基因表达调控概述基因表达调控是生物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋白质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭而不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核生物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。
这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达即经济又有效,保证其生命活动的需要。
调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋白质因子及其他小分子配基的相互作用。
细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋白质在不同时期的表达水平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋白质的小分子物质消耗,这是生物长期进化过程中自然选择的结果,这种控制称为转录水平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括一些与翻译有关的酶及其复合体分子缔合的装配速度等过程。
这种蛋白质合成及其基因表达的控制称为翻译水平的调控。
二.原核生物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够广泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、水分、溶液浓度、温度,pH等。
而这些条件须通过细胞内的各种生化反应途径,为细胞生长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的小分子化合物。
(2)顺式作用元件和反式作用元件基因活性的调节主要通过反式作用因子与顺式作用元件的相互作用而实现。
反式作用因子的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同一个DNA分子上。
RNA聚合酶是典型的反式作用因子。
基因的表达与调控
No RNA
R-
1 No RNA R-
No RNA
RNA
RNA
RNA
RNA
No RNA
No RNA
1
21
2
2
32
3
3、基因的微细结构
20世纪50年代的生化技术还无法进行DNA的序列 测定,本泽尔利用经典的噬菌体突变和重组技术, 对T4噬菌体rⅡ区基因的微细结构进行了详细分析。
野生型T4噬菌体 可侵染B株和K12株 噬菌斑小而模糊
功能上被互补(顺反)测验所规定的核苷酸 序列。
假定有两个独立起源的隐性突变,如a1与a2,它 们具有类似的表型。
如何判断它们是属于同 一个基因的突变,还是分 别属于两个基因的突变? 即如何测知它们是否是等 位基因?
二、基因的微细结构
1、互补作用与互补测验(顺反测验)
需要建立一个双突变杂合二倍体,测定这两个突 变间有无互补皱粒表现型是由于缺少了淀粉档分享dnagtacatcatgtacttgaaacttgacctggagaacttgaacttaaatttmrna密码子guacaucuuacuccugaagaaaaa氨基酸dnagtacatmrna密码子gua氨基酸dnaaaatttmmrna密码根据红色面包霉的研究提出了一个基因一个酶的假说后来又被修改为一个基因种多肽链
Enzymes
B
CAP
G
R
ZY A
a
b
P
X
在有葡萄糖存在时,不能形成cAmp,也就不能 形成正调控因子cAmp-CAP,因此,基因不表达。
目前,通过遗传分析证明了lac操纵元的存在; 已经分离出阻遏蛋白,并成功地测定了阻遏蛋白 的结晶结构,以及阻遏蛋白与诱导物及操纵子序 列结合的结构。
原核生物基因表达的机理及其调控
原核生物基因表达的机理及其调控原核生物是一类单细胞生物,其基因组包括细胞质内的DNA和可能存在于外部的质粒DNA。
基因是生命的基本单位,通过基因表达来实现细胞内各种生物活动的调节、协调和控制。
这里将重点介绍原核生物基因表达的机理及其调控。
基因表达的三个步骤基因表达分为三个主要步骤:转录、翻译和调节。
转录是指将DNA序列转换成RNA序列的过程;翻译是指RNA序列被翻译成氨基酸序列的过程,进而合成蛋白质;调节是指生物体在不同状态下对基因表达的调整和控制。
转录的机理和调控转录是从DNA合成RNA的过程。
在细胞内,RNA聚合酶是起主导作用的酶,可以将位于DNA模板链上的核苷酸与其形成互补配对的核苷酸连接起来,从而合成RNA,这个过程是由DNA模板指导的。
在原核生物中,转录过程相对简单。
细菌细胞中,只有一个RNA聚合酶可以完成所有RNA的合成,并且细菌细胞中的大多数基因都是成串排列的,构成的连续片段被称为“操纵子”。
细菌的一个操纵子通常包含3个区域,启动子、结构基因和终止子。
其中,启动子包含一段特别的DNA序列,被RNA聚合酶认识为转录起点,使得RNA聚合酶可以将核苷酸序列转录为RNA。
结构基因由串联的核苷酸序列组成,决定了合成的RNA分子序列构建。
终止子是一些DNA序列,确定RNA聚合酶在终止转录时的位置。
转录过程中的调控非常重要。
原核生物常常通过启动子区域的开放或关闭调控基因的转录。
这可以通过转录因子的作用来实现。
例如,细菌的“cap结构”和“UTR”可以帮助细胞发现起始位置。
激活蛋白可以缠绕到基因区域,启动转录酶的工作进程。
还有其他的转录因子,他们的作用是为转录酶提供指导信号。
翻译的机理和调控翻译是在RNA模板的指导下,由核糖体将合成的氨基酸序列合成成蛋白质的过程。
在原核生物中,翻译是通过紧密联系的核糖体和RNA复合物实现的。
核糖体由大大小小两个亚基组成,并特异地识别不同氨基酸。
它通过扫描RNA序列来寻找指定的起始区域(起始密码子),并始终按照特定的氨基酸序列连接合成蛋白质。
原核生物基因表达调控
-
23
3)乳糖操纵子可诱导的负调节机制 • 无乳糖: lac操纵子处于阻遏状态(repression) • 有乳糖: lac操纵子即可被诱导
诱导剂(inducer): 别乳糖、半乳糖、IPTG (异丙基硫代半乳糖苷)
-
24
当阻遏物与操纵基因结合时,la- c mRNA的转录起始受到抑制25 。
-
3)基因调控的模式可分成两大类,正调控和负调
控,原核生物以负调控为主。
-
3
3.原核基因表达调控的几个概念
1)顺式作用元件和反式作用因子
➢基因表达的产物(蛋白质或RNA)从合成的场所扩散到 目标场所而发挥作用的过程称为反式作用(transacting),此基因表达产物被称为反式作用因子( trans-acting factor) 。反式作用因子通常为的蛋白 质或RNA。
在转录起始阶段,σ因子识别特异启动序列;不同的
σ因子决定特异编码基因的转录激活,也决定不同
RNA(mRNA、rRNA和tRNA)基因的转录。σ亚
基在转录延长时脱落。
-
12
• 在E.coli,不同类型的启动子需要不同类型的σ
因子
σ32 调控热休克基因 (heat shock genes) σ54/60 调控氮代谢基因 σF 调控鞭毛基因 σ43 调控噬菌体基因枯草杆菌 (B.subtilis)
一. 原核生物基因表达调控概述
随着生物个体的发育,DNA分子能有序地将 其所承载的遗传信息,通过密码子-反密码子系 统转变成蛋白质,执行各种生理生化功能。科 学家把从DNA到蛋白质的过程称为基因表达( gene expression),对这个过程的调节就称 为基因表达调控(gene regulation或gene control)。
分子生物学原核生物基因表达调控ppt课件
一、原核基因表达调控环节
1、转录水平上的调控
(transcriptional regulation)
2、转录后水平上的调控
(post-transcriptional regulation)
① mRNA加工成熟水平上的调控 ② 翻译水平上的调控
15
二、操纵子学说
1、操纵子模型的提出 1961年,Monod和Jacob提出 获1965年诺贝尔生理学和医学奖
54
55
③ 操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26bp), 是阻遏物的结合位点。
56
RNA聚合酶结合部位
阻遏物结合部位
57
操纵位点的回文序列
58
④当阻遏物与操纵基因结合时,lac mRNA的转 录起始受到抑制。
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未诱导:结构基因被阻遏
阻遏物 四聚体
LacI P O
lacZ
lacY
lacA
32
酶合成的诱导操纵子模型
调节基因
操纵基因
结构基因
阻遏蛋白
调节基因
操纵基因
结构基因
诱导物
如果某种物质能够促使
阻遏蛋白
mRNA
细菌产生酶来分解它,
这种物质就是诱导物。
诱导物
酶蛋白
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• 可阻遏调节:基因平时是开启的,处在产生蛋白质 或酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物 的积累而将其关闭,阻遏了基因的表达。 例:色氨酸操纵子 合成代谢蛋白的基因
1、根据操纵子对调节蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白) 的应答,可分为: 正转录调控 负转录调控
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调节基因
操纵基因
结构基因
激活蛋白 阻遏蛋白
正转录调控 负转录调控
第八章真核生物基因表达调控
hMLH1
缺损DNA错配修复,基因点突变
结肠癌[32]、胃癌[27]、子宫内膜瘤[33]、 卵巢癌[34]
MGMT
p53-相关基因,与DNA 修复及耐药性有关 肺癌[24]、脑瘤[35]
P15
细胞的过度激活与增殖
非白血性白血病[36]、淋巴瘤[37, 38]、鳞 状细胞癌、肺癌
RASSF1A
失去了对G1/S负调控抑制作用
③ The CTD may coordinate processing of RNA with transcription.
4. Many Transcriptional Activators
i.e. CAAT GC-box
Factors involved in gene expression include RNA polymerase and the basal apparatus, activators that bind directly to, co-activators that bind to both activators and the basal apparatus, and regulators that act on chromatin structure (chromatin remodeling complex).
1.马蛔虫受精卵的早期分裂 马蛔虫2n=2,但染色体上有多个着丝粒。第一 次卵裂是横裂,产生上下2个子细胞。第二次卵 裂时,一个子细胞仍进行横裂,保持完整的基 因组,而另一个子细胞却进行纵向分裂,丢失 部分染色体。
体细胞 生殖细胞
2.四膜虫: 大核: 营养核 可转录 小核: 生殖核 无转录活性 大核由小核发育而来,发育过程中有多处 染色质断裂,并删除约10%的基因组DNA, 被删除序列的存在可能抑制了基因的正常 表达。
基因表达与调控
❖基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。
基因表达产物通常是蛋白质,但是非蛋白质编码基因如转移RNA(tRNA)或小核RNA(snRNA)基因的表达产物是功能性RNA。
基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,RNA剪接,翻译和翻译后修饰,进行调控来实现对基因表达的调控。
基因调控赋予细胞对结构和功能的控制,基因调控是细胞分化、形态发生以及任何生物的多功能性和适应性的基础。
基因调控也可以作为进化改变的底物,因为控制基因表达的时间、位置和量可以对基因在细胞或多细胞生物中的功能(作用)产生深远的影响。
➢转录原核生物的转录是通过单一类型的RNA聚合酶进行的,需要一个称为Pribnow盒的DNA序列以及sigma因子(σ因子)以开始转录。
原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA)真核生物的转录由三种类型的RNA聚合酶进行,每种RNA聚合酶需要一种称为启动子的特殊DNA序列和一组DNA结合蛋白(转录因子)来启动该过程。
RNA聚合酶I负责核糖体RNA(rRNA)基因的转录。
RNA聚合酶II(Pol II)转录所有蛋白质编码基因以及一些非编码RNA加工:RNA(例如snRNA,snoRNA 或长非编码RNA)。
RNA聚合酶III转录5S rRNA,转移RNA(tRNA)基因和一些小的非编码RNA(例如7SK)。
当聚合酶遇到称为终止子的序列时,转录结束。
真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。
RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。
RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。
➢RNA的成熟多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。
核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。
原核生物的基因表达和调控机制
原核生物的基因表达和调控机制原核生物是指不含细胞核和其他复杂的细胞器官的生物,包括细菌和蓝藻等。
这些生物虽然简单,但仍具有复杂的基因表达和调控机制,通过调控基因的转录和翻译来响应环境变化和完成生物学功能。
本文将探讨原核生物的基因表达和调控机制。
基因表达和调控的基本概念基因是指DNA分子上编码一个蛋白质的序列,是生物体内传递遗传信息的基本单位。
基因表达指的是将基因的信息转化为蛋白质的过程,包括转录和翻译两个步骤。
其中,转录是指将DNA序列转化为mRNA(信使RNA)的过程,而翻译是指将mRNA上的三联体密码子翻译为相应的氨基酸序列的过程。
基因表达的过程涉及到基因启动子、转录因子、RNA聚合酶等多个分子的相互作用,需要经过复杂的调控机制来保证在特定的时空条件下进行。
原核生物中基因的表达和调控原核生物虽然没有细胞核和其他复杂的细胞器官,但其基因的表达和调控机制同样有其特殊性。
以下将从基因的结构、转录、RNA的修饰和翻译等方面探讨原核生物中基因的表达和调控。
基因结构原核生物中,基因通常呈现为一条连续的DNA链,其中编码区域与非编码区域相互交错,没有剪切和剪接等后加工处理。
编码区通常以ATG作为起始密码子,以TAG、TAA或TGA作为终止密码子。
在非编码区,存在启动子、转录因子结合位点、RNA剪切位点和终止符等辅助元素,有助于调控基因的表达。
相比于真核生物中复杂的基因结构,原核生物中基因的紧凑结构为调控提供了更多的可能性。
转录的调控在原核生物中,转录的调控可以通过多种方式实现,包括转录起始的选择、负向调控和正向调控等。
转录起始的选择:在原核生物中,转录的起始位点可以在基因内或外,不同的起始位点可以产生不同长度的转录产物,从而产生不同的蛋白质或非编码RNA。
此外,在一些条件下,同一基因的多个启动子甚至可以同时被使用,进一步增加了基因表达的多样性。
负向调控和正向调控:在原核生物中,负向调控指的是一些转录抑制因子的作用,可以通过抑制转录因子的结合来阻止基因的转录。
原核生物的基因调控机制
原核生物的基因调控机制原核生物是指没有核膜分隔细胞质和核的生物,包括细菌和蓝藻等单细胞有核生物。
相对于真核生物而言,原核生物在基因调控机制上显得比较简单,但是其基因调控机制的研究对于我们理解生命的本质和人工合成生命具有重要意义。
1. 基本特征原核生物的基因组通常比真核生物小得多,只有数千到数百万个碱基对,但是它们在适应各种环境和生存的压力方面却表现出很高的灵活性和多样性。
而基因表达的调控就对这种适应力至关重要。
基因调控有两方面的意义:在不同的环境中合理表达适当的基因,以达到适应环境的目的,而另一方面,也保证了细胞内部各个代谢通路之间的协同作用。
2. 基质和细胞质中的基因调控首先,我们需要明确一点,原核生物没有真正意义上的细胞器(除了细菌的核壳和蓝藻的一些细胞膜片)。
所有的物质在细胞质中自由扩散,包括DNA,这给基因调控带来了额外的因素。
通过对E. coli基因调控的大量实验研究,人们发现,在基质和细胞质中对细胞材料的获取和代谢是通过基因调控进行控制的。
这些代谢通路可以直接影响特定基因的表达,从而刺激或阻止细胞完成特定任务。
3. 负反馈回路的基因调控许多细菌通过一种被称为“负反馈回路”的机制来根据需要调节基因表达。
这个机制基于蛋白质-DNA相互作用,并通过控制特定基因的转录和翻译进行管理。
在负反馈回路中,启动子与特定的蛋白质结合,阻止转录机器进行工作,从而阻止与之对应的基因的表达。
然而,随着时间的推移,该蛋白质被人体分解或降解,基因被再次激活,产生更多的蛋白质。
该蛋白质的过剩则会在细胞中累积,随着时间的推移,其甚至可能会影响到自己的合成。
4. 其他机制除负反馈回路外,其他基因调控机制也在原核生物中起着非常重要的作用,如阳性反馈、形态诱导、环境感应等。
通过这些机制,原核生物可以对环境的变化做出更快速、更灵敏的响应,以适应不同的压力。
5. 总结尽管相对于其他生物而言,原核生物的基因调控机制表现出一定的简单性,但其对环境变化的快速感应和适应能力远不逊于其他生物。
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第9章基因的表达与调控(上)——原核基因表达调控模式1.本章教学要求一、基因表达调控基本概念与原理1.掌握基因表达及基因组的概念,主要特点及主要表达方式。
2.了解基因表达调控的生物学意义。
3.熟悉基因表达调控的基本要素(原理)。
二、原核基因转录调节1.熟悉原核基因转录调节特点。
2.掌握乳糖操纵子结构,熟悉调节机制(包括阻遏蛋白负性调节、CAP正性调节及协调调节三个概念)。
3.了解其他转录调节机制。
三、真核基因转录调节1.熟悉真核基因组的结构特点及真核基因表达调控特点。
2.掌握以下概念:顺式作用元件、反式作用因子、启动子、增强子,熟悉沉默子、基本转录因子、特异转录因子概念。
3.了解转录因子的结构特点。
Chapter 9 Controlling of the Gene Expression(Part One)9.1基因表达调控的基本概念9.2原核基因调控机制9.3乳糖操纵子9.4色氨酸操纵子9.5其他操纵子9.1 基因表达调控的基本概念一、基因表达的概念•gene expression:是指储存遗传信息的基因经过转录、翻译合成特定蛋白质,进而发挥其生物功能的整个过程。
也即基因转录及翻译的过程。
•对这个过程的调节就称为gene regulation。
•rRNA、tRNA编码基因转录合成RNA的过程也属于基因表达。
二、基因表达的方式(一)组成性表达(constitutive expression)(二)适应性表达(adaptive expression)(一)组成性表达1、概念:又称组成性基因表达(constitutive gene expression)是指在个体发育的任一阶段都能在大多数细胞中持续进行的基因表达。
其基因表达产物通常是对生命过程必需的或必不可少的,且较少受环境因素的影响。
这类基因通常被称为管家基因(housekeeping gene)。
2.特点①不易受环境变化影响,表达产物是整个生命过程中都持续需要的,是细胞存活所必须的。
②表达水平较恒定。
3. 意义维持生命(二)适应性表达1.概念指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。
包括:①诱导—随环境条件变化基因表达水平增高的现象称为诱导(induction),这类基因被称为可诱导的基因(inducible gene);②阻遏--相反,随环境条件变化而基因表达水平降低的现象称为阻遏(repression),相应的基因被称为可阻遏的基因(repressible gene)。
2.特点易受环境变化影响3.意义适应环境三、基因表达的时间性和空间性1、时间特异性(temporal specificity)•按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间特异性。
•多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性(stage specificity)。
2、空间特异性(spatial specificity)•是指多细胞生物个体在某一特定生长发育阶段,同一基因的表达在不同的细胞或组织器官不同,从而导致特异性的蛋白质分布于不同的细胞或组织器官。
故又称为细胞特异性或组织特异性(cell or tissue specificity)。
四、基因表达调控的生物学意义•适应环境、维持生长和增殖(原核、真核)•维持个体发育与分化(真核)五、基因表达调控的基本原理(一)基因表达的多级调控•基因表达调控可见于从基因激活到蛋白质生物合成的各个阶段,因此基因表达的调控可分为–转录水平(基因激活及转录起始)–转录后水平(加工及转运)–翻译水平–翻译后水平•但以转录水平的基因表达调控最重要。
(二)基因转录激活调节基本要素1.顺式作用元件(cis-acting element):又称分子内作用元件,指存在于DNA分子上的一些与基因转录调控有关的特殊顺序。
•在原核生物中,大多数基因表达通过操纵子模型进行调控,其顺式作用元件主要由启动基因、操纵基因和调节基因组成。
•在真核生物中,与基因表达调控有关的顺式作用元件主要有启动子(promoter)、增强子(enhancer)和沉默子(silencer)2.反式作用因子(trans-acting factor)•又称为分子间作用因子,指一些与基因表达调控有关的蛋白质因子。
反式作用因子与顺式作用元件之间的共同作用,才能够达到对特定基因进行调控的目的。
•原核生物中的反式作用因子主要分为特异因子、激活蛋白和阻遏蛋白;•而真核生物中的反式作用因子通常称为转录因子。
3.顺式作用元件与反式作用因子之间的相互作用•大多数调节蛋白在与DNA结合之前,需先通过蛋白质-蛋白质相互作用,形成二聚体或多聚体,然后再通过识别特定的顺式作用元件,而与DNA分子结合。
这种结合通常是非共价键结合。
9.2 原核基因调控机制内容提要:•原核基因表达调控环节•操纵子学说•原核基因调控机制的类型与特点•转录水平上调控的其他形式一、原核基因表达调控环节1、转录水平上的调控(transcriptional regulation)2、转录后水平上的调控(post-transcriptional regulation)① mRNA加工成熟水平上的调控②翻译水平上的调控二、操纵子学说1、操纵子模型的提出1961年,Monod和Jacob提出,获1965年诺贝尔生理学和医学奖2、操纵子的定义操纵子是基因表达的协调单位,由启动子、操纵基因及其所控制的一组功能上相关的结构基因所组成。
操纵基因受调节基因产物的控制。
三、原核基因调控机制的类型与特点1、根据操纵子对调节蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白)的应答,可分为:正转录调控:在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入这种调节蛋白质后基因活性就被开启,这样的调控成为正转录调控。
负转录调控:在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的调控称为负转录调控。
2、根据操纵子对某些能调节它们的小分子的应答,可分为可诱导调节和可阻遏调节两大类:•可诱导调节(P238):指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的诱导下使基因活化。
例:大肠杆菌的乳糖操纵子诱导物:如果某种物质能够促使细菌产生酶来分解它,这种物质就是诱导物。
•可阻遏调节(P238):基因平时是开启的,处在产生蛋白质或酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物的积累而将其关闭,阻遏了基因的表达。
即在某些物质的阻遏下使基因关闭。
•例:色氨酸操纵子•合成代谢蛋白的基因酶合成的阻遏操纵子模型3、在负转录调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白(repressor),起着阻止结构基因转录的作用。
根据其作用特征又可分为负控诱导和负控阻遏:•在负控诱导系统中,阻遏蛋白与效应物(诱导物)结合时,结构基因转录;•在负控阻遏系统中,阻遏蛋白与效应物(辅阻遏物)结合时,结构基因不转录。
负控诱导•在负控诱导系统中,阻遏蛋白与效应物(诱导物)结合时,结构基因转录;负控诱导负控阻遏•在负控阻遏系统中,阻遏蛋白与效应物(辅阻遏物)结合时,结构基因不转录。
负控阻遏4、在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋白(activator)。
根据激活蛋白的作用性质分为正控诱导和正控阻遏•在正控诱导系统中,效应物分子(诱导物)的存在使激活蛋白处于活性状态;•在正控阻遏系统中,效应物分子(辅阻遏物)的存在使激活蛋白处于非活性状态。
正控诱导•在正控诱导系统中,效应物分子(诱导物)的存在使激活蛋白处于活性状态;正控诱导正控阻遏•在正控阻遏系统中,效应物分子(辅阻遏物)的存在使激活蛋白处于非活性状态。
正控阻遏四、转录水平上调控的其他形式1、σ因子的更换在E.coli中,当细胞从基本的转录机制转入各种特定基因表达时,需要不同的 因子指导RNA聚合酶与各种启动子结合。
大肠杆菌中的各种σ因子比较•温度较高,诱导产生各种热休克蛋白由σ32参与构成的RNA聚合酶与热休克应答基因启动子结合,诱导产生大量的热休克蛋白,适应环境需要•枯草芽孢杆菌芽孢形成有序的σ因子的替换,RNA聚合酶识别不同基因的启动子,使芽孢形成有关的基因有序地表达2、降解物对基因活性的调节3、弱化子对基因活性的影响9.3 乳糖操纵子(lac operon)内容提要:乳糖操纵子的结构酶的诱导¡ª¡ªlac体系受调控的证据乳糖操纵子调控模型影响因子Lac操纵子中的其他问题一、乳糖操纵子的结构乳糖操纵子的结构乳糖操纵子的结构1) 结构基因:分解乳糖的三种酶,使乳糖分解,产生能量。
2) 操纵基因3) 启动子4) CAP5) i基因:上游,产生阻遏物。
结构基因•Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖•Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
•A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。
二、酶的诱导¡ªl a c体系受调控的证据义务诱导物(gratuitous inducer):如果某种物质能够促使细菌产生酶而本身又不被分解,这种物质被称为义务诱导物,如IPTG(异丙基- β–D-硫代半乳糖苷)。
三、乳糖操纵子调控模型主要内容:① Z、Y、A基因的产物由同一条多顺反子的mRNA分子所编码②这个mRNA分子的启动子紧接着O(operater,操纵基因)区,而位于I与O之间的启动子区(P),不能单独起动合成β-半乳糖苷酶和透过酶的生理过程。
③操纵基因(operater)是DNA上的一小段序列(仅为26bp),是阻遏物的结合位点。
④当阻遏物与操纵基因结合时,lac mRNA的转录起始受到抑制。
⑤诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵基因结合,从而激发lac mRNA的合成。
当有诱导物存在时,操纵基因区没有被阻遏物占据,所以启动子能够顺利起始mRNA的合成。
(一)阻遏蛋白的负性调节:(分解代谢)——可诱导调控1) 无乳糖存在时,阻遏物可以结合在操纵基因上—→阻止转录过程—→基因关闭2) 有乳糖存在时,乳糖与阻遏物结合—→阻遏物变构—→阻遏物不能结合操纵基因—→转录进行—→基因开放•可诱导调控的操纵子,其基因表达产物都是利用某种营养物的酶体系(分解代谢)有营养物——相应基因开放无营养物——细胞就没必要产生相应的酶(二)CAP的正性调节1.调控机理:代谢物激活蛋白(CAP)/ 环腺甘酸受体蛋白(CRP)•细菌中有一种能与cAMP特异结合的环腺甘酸受体蛋白(cAMP receptor protein,CRP)–当CRP未与cAMP结合时它是没有活性的;–当cAMP浓度升高时,CRP与cAMP结合并发生空间构象的变化而活化,称为代谢物激活蛋白(Catabolite Activator Protein, CAP),能以二聚体的方式与特定的DNA序列结合。