紫外可见光分光光度计酶活性测定的实验流程和方法
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5
µl MgCl2
5 µl NADP
5 µl 葡萄糖
12.5 µl ATP
121.5 µl Tris 缓冲液
0.5 µl 葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶
∑= 149.5 µl
使用移液器快速将溶液转移到比色皿槽的超微量比色皿中。 为适应反应温度,测定参数包括预孵育时间,时间至少为 6 分钟。 开始测定时,记录在 340nm 时的吸光度值变化。当检测不到 吸光度的进一步变化时,加入 0.5 µl 的己糖激酶溶液开始酶 促反应(约 1 分钟后)。
行跟踪。由于反应速度在酶测定时可能会快速变化,所以
每 10 秒(图 4)收集一次数据。活性测定的参数(图 5A)
和底物测定的参数( 图 5B 和 5C)是根据初步实验的结果
设定。如图 5 所示,为测定活性和底物浓度,Hale Waihona Puke Baidu择了不同
的方法。使用线性回归方法确定己糖激酶的活性。线性回归
分析中,每 5 秒测定一次。该反应是在预热 6 分钟后(参数“延
为了进行测定,使用源自面包酵母的己糖激酶和葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶进行偶联反应。由于 Eppendorf BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学款)带有温控比色皿槽,也可演示这一反应对温度的依赖性。在 37 °C 时,检测到最高活性。
引言
己糖激酶反应的代谢意义
吸光度
NAD(P)/NAD(P)H2 光谱
3.000
2.500 2.000 1.500
NAD(P) NAD(P)H2
1.000
0.500
0.000 240 260 280 300 320 340 360 380 400 波长 [nm]
图 1:NADP/NADPH2 的吸收光谱
NADPH2 在 340 nm 波 长 下 的 吸 收 峰 可 以 区 分 两 种 物 质。这 样, NADP/NADPH2 依赖性酶的活性就可以通过在 340 nm 处的吸光度 值变化来确定。
3C
迟”(Delay))加入己糖激酶开始的,总共检测时间为 6 分钟。
实验参数是根据初步实验使用 “单波长λ- 连续”(Singleλ-
continuous)(见上)设定的。以下公式分别用于计算酶活
性和底物浓度:
图 3:活性测定选项 A) 单波长λ- 连续 B) 简单动力学 C) 高级动力学 (Singleλ- continuous) (Simple kinteics) (Advanced kinetics)
再加入葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶和己糖激酶,充分混匀溶液, 分别在 22 °C、30 °C 和 37 °C 进行测定。
通过己糖激酶测试测定底物 为测定底物,使用与己糖激酶活性检测相同的成分。为测定 样品中未知浓度的 ATP,使用 1 mM 和 0.1 mM 的 ATP 作 为标准品。
BioSpectrometer kinetic 的设置 BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学款) 提供三种方法测定酶的活性(图 3):
为了能直接从吸光度测定结果分别计算 U/L 或 µmol/min×L 的酶活性,(1 L 的相对酶活),系数需要从 mol/L 改成单位 µmol/L,即需要乘以 1 × 106。因此,系数应是 161。在图 5A 中, 给出 1 ml(U/ml) 酶活性的换算系数,所以系数是 0.161。 然后,直接从计算的斜率推导出酶活性,并在测定后显示。
图 2 中描述的检测反应是本用户指南中的一个样例反应。 其目的是为了演示使用 Eppendorf BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学款)进行酶动力学测定的 两种应用:
1) ATP 浓度的酶测定 底物的浓度通过 37 ° C 下定量 ATP 的两点校准法来确定。 这一过程中,在底物转化的线性范围内进行两次测定。该转 化的线性范围需在初步测定中确定。 2) 酶活性的测定 如图 2 所示,己糖激酶反应对温度的依赖性。在 Eppendorf BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学 款)具备可加热比色皿槽,可以对样品进行温度控制:可选 温度范围在 20 °C 到 42 °C 之间。由于酶活性与孵育温度相关, 所以温度调节对于酶活性的精确测定至关重要。因此,分别 在 22 ° C、30 ° C 以及 37 ° C 下测定己糖激酶的酶活性。根 据曲线的线性回归确定准确的酶活性。
Tris 缓冲液 pH 7.0 MgCl2 葡萄糖 NADP+ ATP 己糖激酶 葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶
以上溶液均使用分子生物学用水进行制备,并在 Eppendorf IsoPack 冰盒中以 4 °C 保存。Tris 缓冲液在室温下保存。酶 在使用后立即放回冰箱。
以下是用于一次测定反应所需溶液的量:
材料
BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学 款),IsoPack 冰盒 +IsoRack 支架(Eppendorf),Ultra-Mikro 比色皿 105.202-QS(Hellma, 105-202-85-40) ATP(Roche Applied Science, 10127523001) 酿酒酵母己糖激酶(Roche Applied Science, 11426362001) 酿酒酵母葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶(Roche Applied Science, 10127671001) NADP(Sigma-Aldrich, 93205-50MG) α-D- 葡萄糖(Sigma-Aldrich, 158968-25G) MgCl2(Sigma-Aldrich, 63069-100ML) Tris 缓冲液 pH 7.0(AppliChem, A5247, 0500) 分子生物学用水(AppliChem, A7398,1000)
糖酵解 几乎所有生物新陈代谢的一个中间环节就是葡萄糖分别在细 胞的细胞液或细胞质内进行的酶促降解。这一过程叫做糖酵 解。葡萄糖通过分步反应转化为 2 分子的丙酮酸。1 分子的 葡萄糖生成 2 分子的 ATP 和 2 分子以 NADPH2 形式存在的 氧化还原产物。然后,丙酮酸进入初步代谢途径,即丙酮酸 循环,进一步生成呼吸链的还原产物,最终转化为氧。最终 的降解产物是 H2O 和 CO2。
在 BioSpectrometer kinetic 上进行线性回归分析以测定酶活 只在在曲线线性范围内的酶活性进行分析,因为只有在线性 范围内才可以排除诸如底物浓度降低或来自最终产物的抑制 作 用 等 类 似 抑 制 因 素。Eppendorf BioSpectrometer kinetic 紫外 / 可见光分光光度计(动力学款)反向将回归曲线变为 线性曲线,并提供在活性检测时使用线性回归加以分析。在 测定过程结束后,激活 “处理结果”(Process results)区 里的 “线性回归”(Linear regression)功能。这样,就可以 重新设定回归曲线的起点和终点(图 6)。
1
文献参考
酶活性测定不但可以确定酶的性质,还可以用来分别检测某 些底物或底物的浓度。如可以使用以上提到的己糖激酶反应 测定葡萄糖或 ATP 的浓度。通过与葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶 在偶联反应中生成 NADPH2 可间接检测葡萄糖或 ATP。生 成 ATP 的量与葡萄糖或 ATP 的量成正比(图 2)。
方法
己糖激酶活性测定
所有测定均是在 Eppendorf BioSpectrometer 紫外 / 可见光
分光光度计上进行的。为进行酶测试,准备以下溶液:
• 10 ml 0.1 M • 1 ml 0.1 M • 1 ml 5 mM • 0.5 ml 10 mM • 1 ml 1 mM • 1 ml • 2 ml
代谢酶的酶促降解检测 由于这些相关代谢途径和酶的意义重大,所以它们在生化研 究和教育领域中倍受关注。其中一个重要的方面是酶活性的 测定,因为酶活性是酶的独有特征。测定各个酶活性的基本 方法是使用分光光度计进行光度测定法。
由于 NADP(NAD)和 NADPH2(NADH2 )分别参与中间代 谢中几乎所有酶促反应,酶活性的确定主要是通过 NADPH2 的增加或减少来确定。NADP 和 NADPH2 均在 260 nm 波 长下显示出最大吸收峰。然而,NADPH2 在 340 nm 波长下 还会显示一个波峰(图 1),这就可以在光度测定上区分 NADPH2 和 NADP。
a) “单波长λ- 连续”(Singleλ- cont) :限定波长、限定 时间间隔以及限定一段时间内简单测定吸光度值的变化。温 度控制功能可选。该方法特别适用于初步实验,即某反应的 动力学检测(速度、线性范围)。 b) “简单动力学”(Simple kinteics) :和 a) 一样;另外可 以定义直接换算吸光度值的单位和换算系数。可以进行终点 测定、两点测定以及线性回归分析。“延迟”(Delay)功能 可对延迟检测过程进行编程,以确保反应混合液充分适应实 际测定温度等。 c) “高级动力学”(Advanced kinetics) :和 b) 一样;另外 提供 “试剂空白对照”(Reagent blank)编程以及标准品编程。 “试剂空白对照”(Reagent blank)可以验证在反应开始前 没有显著的吸光度值变化。
2
文献参考
3A
4
图 4:“单波长λ- 连续”(Singleλ- cont) 方法中己糖激酶测定初步 实验的参数设置
3B
为 测 试 己 糖 激 酶 反 应 的 进 程,先 使 用 “单 波 长λ- 连 续”
(Singleλ- cont)方法进行初步反应。选择的参数可以对反
应混合液的吸光度在一定持续时间内(10 分钟)的变化进
直接计算酶活性 图 5A 中的系数是根据 NADPH 的摩尔吸光系数(6.32×103 L / (mol * cm))计算所得。
朗伯 - 比尔定律基本原理: A= ε× c × l 或 c=A/ε× l 其中 c 为浓度,A 为吸光度,ε为摩尔吸光系数,l 为光路(比 色皿光路长度)。 对于光路长度为 1 cm 的比色皿,适用以下公式:分别是 c=A/ε或 c=A × 1/ε或 c=A × F。 这样,系数 F 就是摩尔消光系数的倒数,它的单位分别是 mol/L 或 µmol/µl(相对于 NADPH2 1.61 × 10-4)。
葡萄糖 + ATP
己糖激酶 / Mg 2+
葡萄糖-6-磷酸 + ATP
葡萄糖-6-磷酸脱氢酶
葡萄糖-6-磷酸 + NADP
6-磷酸葡萄糖 + NADPH2
图 2:葡萄糖或 ATP 的间接酶检测 两种物质可以通过己糖激酶和葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶催化的偶联反 应得以确定(偶联测试系统 [1])。通过生成的 NADPH2 的量来计算 两种物质的量。
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文献参考
5A
6A
5B 6B
5C 6C
图 5:酶活性和底物浓度测定参数 A) “ 简单动力学”(Simple kinteics) 方法中通过线性回归测定己糖 激酶的参数。 B) + C)“ 高级动力学”(Advanced kinetics) 方法中通过两点校准测 定底物浓度的参数。
底物浓度测定 在测定底物浓度的过程中,预孵育 7 分钟后进行一次测定,然 后加入己糖激酶,将反应混合物温育 2 分钟。根据两点测定法, 分别在孵育起始时和结束时各进行一次测定。为计算样品的浓 度,在限定底物浓度的情况下进行两次初步标准品测定。未知 样品的浓度根据标准品来计算。
文献参考
使用酿酒酵母己糖激酶和葡萄糖 -6- 磷酸脱氢酶 在 Eppendorf BioSpectrometer® kinetic 紫外 / 可见光
分光光度计上进行酶动力学测定
简介
该用户指南将演示使用 Eppendorf BioSpectrometer 紫外 / 可见光分光光度计进行的酶活性测定。为优化测定流程,先使用 “单 波长λ- 连续”(Singleλ- continuous)测定法进行初步测定。然后,根据这些结果进行实际活性测定。通过线性回归确定酶活性。
己糖激酶反应活化葡萄糖 葡萄糖的降解维持着所有生物的呼吸作用。在降解葡萄糖之 前,需使葡萄糖易于降解,即激活。这一过程包括己糖激酶 催化的葡萄糖磷酸化和消耗 ATP,生成葡萄糖 -6- 磷酸。后 者实际上是糖酵解的初始底物(图 1)。
另外,葡萄糖 -6- 磷酸也是进一步重要代谢途径 ,即戊糖 磷酸途径的初始底物。戊糖磷酸途径可提供重要的氧化还原 产物,如 NADPH2,以及被认为进一步参与分解代谢和生物 合成途径的各种碳水化合物。