广义线性模型课件
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分布 正态分布
联系函数 = 普通线性模型
二项分布 或多项分布
(Poisson分布)
=log
=log{P/(1-P)}
对数线性模型
(Poisson回归) Logistic回归模型
=log{h(t)/h0(t)} COX回归模型
Logistic回归分析
何平平 北大医学部流行病与卫生统计学系 Tel:82801619
(二)经典Logistic回归分析的基本原理
1.变量特点
因变量:二分类变量,若令因变量为y,则常用y=1表
示“发病”,y=0表示“不发病”(在病例对照研究中,
分别表示病例组和对照组)。 自变量:可以为分类变量,也可以为连续变量。
2.Logistic模型
g ( x) 0 1x1 2 x2 .... i xi .... m xm
后退法筛选变量
每步的模型检验、
拟合分类表
后退法筛选变量
不在模型中的变量
前进法筛选变量
前进法筛选变量
不在模型中的变量
应用Logistic回归分析时的注意事项
Logistic回归是乘法模型,这一点,在结果解释时需要 慎重。
对于自变量(X1,X2),OR12=exp(1+2)=OR1×OR2
根据模型,病情严重程度与治疗方法对患者的治愈情况有影响;其 中病情严重组相对于不严重组,OR=0.203,95%置信区间为
(0.038,1.092)(此区间包括1,缺乏实际意义);旧疗法组相对于
新疗法组, OR=0.103,95%置信区间为(0.019,0.553)
另法:将X1、X3指定为分类变量。
例:某研究调查胃癌发病的危险因素,得到“有不良饮食习 惯”相对于“无不良饮食习惯”的OR=2.6, “喜吃卤食和 盐渍食物”相对于“不吃卤食和盐渍食物”的OR=2.4。那么 根据Logistic回归,“有不良饮食习惯且喜吃卤食和盐渍食 物”相对于“无不良饮食习惯且不吃卤食和盐渍食物”的 OR=2.6×2.4=6.24,得出此结论时需要考虑从专业知识上是 否合理。
以下实例摘自Hosme and Lemeshow(2000).
Applied Logistic Regression: Second Edition. John Wiley & Sons Inc. 研究目的是考察与婴儿低出生体重有关的可能危险因素 (当体重低于2500g时,认为是低出生体重婴儿)。研 究收集了189例妇女的数据,其中59例分娩低出生体重 婴儿,130例分娩正常体重婴儿。
如何评价新旧疗法的疗效(见数据文件logistic.sav)?
(注:作为举例,本例样本量仅为40例,由于样本量太 小,Logistic回归的结论仅作为参考)
变量说明:Y:治愈情况,1=治愈;0=未治愈;X1:
病情严重程度,0=不严重,1=严重;X2:年龄。X3:
治疗方法,0=新疗法,1=旧疗法。
二值
(2)令病例的生存时间比对照短 (3)在设置生存状态变量(status)时,令病例组为完全 数据,对照组为删失数据
以下实例摘自Hosme and Lemeshow(2000). Applied Logistic Regression: Second Edition.
John Wiley & Sons Inc.
推荐书籍:
Hosmer, David W . (2000). Applied logistic regression . John Wiley, New York.
(一)Logistic回归分析的任务
影响因素分析 logistic回归常用于疾病的危险因素分析,logistic回归 分析可以提供一个重要的指标:OR。
Logistic回归
因变量
协变量(自变量)
注:此处将X1、X3看作为连续变量。
OR的95%置信区间
对模型的检验
模型拟合良好
经统计学检验,模型2=13.951,P=0.003,Logistic回 归模型有显著性。
拟合分类表
符合率为 70.0%
回归系数 标准误 Wald值
P值
OR
OR置信区间
研究目的是考察与婴儿低出生体重有关的可能危险因素 (当体重低于2500g时,认为是低出生体重婴儿)。此 研究为1:1病例对照研究,包括112例(56例病例,56 例对照)。对于每一例分娩低出生体重婴儿母亲,按照 母亲的年龄进行匹配,选择一例分娩正常体重婴儿作为 对照。
当检验的P值大于0.1时,则说明模型对样本的拟合是可以接 受的。
6.OR与RR Logistic回归模型中,OR=exp()。 lnOR= 当某种疾病的发病率或死亡率很低时,ORRR OR的置信区间为:
ˆ z ˆ ) exp se ( 1 / 2
例:比较新疗法与旧疗法治疗某种疾病的疗效。现对40 例患者随机分组,分别接受新疗法和旧疗法治疗。根据 专业知识,患者的病情严重程度、年龄对疗效也有影响。
采用似然比检验(the likelihood ratio test),当P0.05
时,拒绝H0,认为模型有统计学意义。 自变量检验: H0:i=0 H1:i0
采用Wald检验,当P0.05时,拒绝H0,认为i不为0。
4.自变量的筛选 与多元线性回归分析类似,有Forward法(前进逐步法 )、
Generalized Linear Models 广义线性模型
何平平
北大医学部流行病与卫生统计学系 Tel:82801619
广义线性模型的定义
该模型假定: 1. Y1,…Yn是n个服从指数分布族的独立样本
i=E(Yi | X1,X2,…,Xk),i=1,…,n;
2. i是k个解释变量的线性组合
哪个变量应该被剔除的最好方法。
wk.baidu.com
5.模型拟合的优良性指标 (1)拟合分类表(Classification Table) 根据Logistic回归模型,对样本重新判别分类,总符合率越 接近100%,则模型拟合越好。Logistic回归用于判别分类很 粗劣,尤其在很多情况下对于小样本的分类效果差 。
(2)Hosmer-Lemeshow 拟合优度统计量
模型估计方法: 条件最大似然法(the Conditional Maximum
Likelihood)。可以估计出回归系数i , 与k无关(在实际
应用中,我们并不关心k)。
3.应用 最常见的情况是流行病学中的匹配病例对照研究。 SPSS中实现Logistic回归___借助COX回归模型:
(1)增加一个虚拟的生存时间变量
(三)条件Logistic回归分析的基本原理
1.概述 条件Logistic回归是经典Logistic回归的重要拓展方法 之一,它主要用于分层数据(strata data)的影响因素 分析,通过分层来控制可能的混杂因素对结局变量的影 响。分层变量可以包括一个变量或者几个变量 。
2.条件 Logistic模型 令yk为第k层的因变量,yk=1或0;xk1,xk2…xki… xkm为 第k层的m个自变量。第k层的模型为:
g ( xk ) k 1xk1 2 xk 2 .... i xki .... m xkm
k 为第k层的截距,反映了层的效应。1,2…. m为回
归系数,是未知参数。 logit变换:
Pk g ( xk ) ln 1 P k
假定:对于k层,自变量xki的回归系数相同,这表明对 于所有的层,自变量对因变量的影响大小是相同的。
Backward (后退逐步法 )法。SPSS中默认的选入标准为
0.05,剔除标准为0.10。 注:不同自变量的筛选方法,当结果差别较大时,应该结合 专业知识,用尽可能少的变量拟合一个最佳模型。有研究 者认为,依据Wald统计量(Wald ) 、似然比统计量(LR)
或者条件统计量(Conditional )剔除变量时, LR是决定
模型估计方法: 最大似然法(Maximum Likelihood Method):构造似然 函数( Likelihood function )L= P(y=1|x) P(y=0|x),通 过迭代法估计一组参数(0, 1 , 2 ….. m)使L达到最
大。
3.模型及自变量的统计检验 模型检验: H0:1=2=…=i=…=m =0 H1:至少有一个i0
i=0+1Xi1+…+ kXik
3.存在一个连接函数(Link function)g,使得i 与i有 下面的关系
i =g(i)
常见分布及其联系函数
指数分布族常见的重要分布如正态分布、二项分布、Poisson
分布、指数分布等。对非正态广义线性模型,经典的最小二乘
法已不能用于这种模型的拟合,而是采用最大似然估计方法。
另法:将X1、X3指定为分类变量。
与前述结果相比,X1与X3的回归系数符号发生了变化,结果解释 有所不同:病情不严重组相对于严重组,OR=4.928, 95%置信区 间为(0.916,26.506) ;新疗法组相对于旧疗法组, OR=9.707, 95%置信区间为(1.809,52.103) 。
注:对于二分类变量,可以当作连续变量处理,也可以指定为 分类变量,但要注意结果解释。
g(x)是对P的变换,称为logit变换:
P g ( x) ln 1 P
可以得到:
P exp[ g ( x)] 1 exp[ g ( x)]
P=P(y=1|x),为发病概率;1-P=P(y=0|x),为不发病概率。
0为常数项, 1 , 2 ….. m分别为m个自变量的回归系数。