我国近年来生物化学研究热点

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我国近年来生物化学研究热点:基于共词分析视角

班级:管信1002班

学号:201003083

姓名:王秀玉

目录

目录 (1)

1 实验内容 (2)

(1)文献资源检索 (2)

(2)文献挖掘 (2)

(3)分析当前国内生物化学领域研究热点、推测研究趋势 (2)

2 文献获取 (2)

3 关键词确定 (3)

4 其他基本信息 (5)

(1)发表单位信息 (5)

(2)作者信息 (5)

(3)热门文章 (6)

5建立供词相关矩阵、相似矩阵、相异矩阵 (7)

(1)共词矩阵 (7)

(2)相似矩阵 (8)

(3)相异矩阵 (8)

6 聚类分析 (9)

7 因子分析 (10)

8 结果分析 (14)

(1)牛血清蛋白研究 (14)

(2)热休克蛋白研究 (14)

(3)对多糖的研究 (14)

(4)PCR (15)

(5)生物信息学 (15)

(6)蛋白质组 (15)

(7)代谢组学 (15)

(8) 基本特性 (16)

9 总结 (16)

10 个人体会 (16)

1 实验内容

本实验是研究国内生物化学领域的研究状况和特点,通过现阶段的热点的分析,进而推测该领域在将来一段时间内的研究趋势。研究过程主要分为以下三个步骤。

(1)文献资源检索

最初对各种数据库以及搜索引擎进行初步尝试和了解,选择资料翔实全面、检索查询较为方便和精细的数据库进行文献资源的检索。最终选择了中国学术期刊网(中国知网)。其数据资料全面、查询方法多样且得到的结果比较精确,符合本次实验的要求,能够得到所需要的数据和文献全文。

(2)文献挖掘

首先对各种文献挖掘方法进行学习和掌握,特别是书中介绍的共词分析和共引分析,了解每种方法的特点与用途。之后确定自己所要研究的领域以及研究的方向和想要得到结果。接下来比较需要的结果和已掌握的方法,最终决定所需要使用的方法。确定的研究领域为生物化学,需要研究出近十年该领域的研究热点并进行适当的研究方向的预测。最终选择了共词分析的方法作为该实验文献挖掘的方法。

(3)分析当前国内生物化学领域研究热点、推测研究趋势

2 文献获取

为了探索国内生物化学领域的研究状况和特点,本实验选择中国学术期刊网(CNKI)全文数据库获取文献。文献收集过程具体如下:首先,为了保证数据的准确性和全面性,选取的文献数据来自中国知网文献分类-基础科学-生物化学子分类下的文献资料;其次,设定检索时间范围为2002年~2012年,且在前7年的文献中选取引用次数较高的文章,而在后四年选择了下载次数较多的文章,以进一步提高研究的精准度;同时,为了排除不相关文献的干扰,确保文献的查准率,还作了如下处理:一是对符合检索条件的论文进行分析,若论文只与教学相关,则主动予以放弃;二是只选择学术论文,剔除会讯、消息、信息等非学术论文;三是只挑选有关键词的文献,以便作进一步的分析处理。最后经过去重处理后, 得到相关文献1148篇。经过一系列格式处理后,最后在EXCEL中建立如下结构的二维表。(表1)

表1 文献数据结构表

Title Author Organ CEPeriodical Year Keyword Summary

篇名作者发表单位发表期刊发表时间关键词摘要

图1 文献数据结构图

3 关键词确定

通过excel统计功能进行词频统计处理,得到原始关键词共3043个。利用数据-分类汇总功能,得到词频不小于7的关键词74个。其中关键词“生物化学”出现15次,但鉴于该关键词与本研究内容完全重合,在共词分析中难以发挥作用,故舍弃。关键词“应用”出现频率最高,为52次,关键词“研究进展”30次、“评述”12次、“综述”10次、“应用前景”9次、“进展”九次。最终得到词频不小于7的有效关键次数为68个。

图2 国内生物化学研究领域关键词表

最终确定共有35个高频关键词作为共词分析的基础。这35个关键词及其词频见表2。

表2 国内生物化学研究领域高频关键词表

序号关键词词频序号关键词词频序号关键词词频序号关键词词频

1 蛋白质51 10 生物学功

19 19 生理功能14 28 多糖11

2 抗菌肽40 11 相互作用19 20 生物活性14 29 分子伴侣11

3 蛋白质组

36 12 质谱19 21 双向电泳14 30 基因表达11

4 牛血清白

蛋白

30 13 蛋白质组18 22 荧光光谱14 31 荧光探针11

5 DNA 25 14 蛋白质相

互作用

17 23

高效液相

色谱

13 32 基因10

6 结构24 15 超氧化物

歧化酶

16 24 基因工程12 33 胶原蛋白10

7 功能22 16 纤维素酶16 25 金属硫蛋

12 34

热休克蛋

10

8 分离纯化20 17 代谢组学15 26 溶菌酶12 35 PCR 10

9 生物信息

20 18 纯化14 27 制备12

4 其他基本信息

(1)发表单位信息

利用excel分列和分类汇总功能得到发表单位的发表文章频次,共有3017个发表单位,选取发表频次不小于10的单位及其发表频次列出:

表3国内生物化学研究领域高频发表单位表

序号发表单位频次

1 南开大学化学系28

2 山东大学微生物技术国家重点实验室26

3 华东师范大学生命科学学院24

4 吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室20

5 军事医学科学院放射医学研究所19

6 军事医学科学院生物工程研究所18

7 中国海洋大学海洋生命学院17

8 东北大学化学系17

9 福建师范大学生物工程学院16

10 江南大学食品学院15

11 厦门大学生命科学学院14

12 西南科技大学材料科学与工程学院化学系14

13 山西农业大学动物科技学院14

14 南京工业大学制药与生命科学学院14

15 中国科学院大连化学物理研究所13

16 浙江大学生命科学学院13

17 中国科学院微生物研究所12

18 武汉大学生命科学学院12

19 河北大学生命科学学院12

20 江南大学工业生物技术教育部重点实验室11

21 中国药科大学生命科学与技术学院10

22 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所10

23 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室10

(2)作者信息

利用excel分列和分类汇总功能得到发表文章的作者3231人,用同样的方法选择出发表文章频次不小于4的作者及其出现频次。

表4国内生物化学研究领域高频发表作者表

编号作者频次

1 张玉奎9

2 何锡文 6

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