pcr-ngs原理
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pcr-ngs原理
PCR-NGS (Polymerase Chain Reaction - Next Generation Sequencing) 是一种结合了PCR技术和高通量测序技术的方法,用于对DNA或RNA样本进行大规模测序。
PCR-NGS的主要步骤如下:
1. DNA扩增:首先,使用PCR技术对DNA样本进行扩增。
PCR使用DNA聚合酶,引物和dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)来选择性地扩增目标DNA序列。
PCR的扩增过程包括反复进
行变性(DNA双链解开),引物结合和扩增(DNA合成)。
2. DNA片段准备:扩增得到的DNA片段会被切割成短片段,通常长度为200-600碱基对。
这些片段之后会被连接到DNA
片段适配器上。
3. DNA库构建:将连接上适配器的DNA片段进行纯化和富集,以去除未连接的适配器和剩余的引物。
4. 测序:准备好的DNA库会被加载到测序平台上,如
Illumina或Ion Torrent等。
在测序过程中,DNA片段会通过序列化反应产生荧光信号,这些信号会被靶向测序仪器检测和记录。
5. 数据分析:测序仪器获得的原始序列数据将通过生物信息学分析进行处理,包括序列拼接、去除低质量碱基、去除适配器序列以及比对到参考基因组等步骤。
最后,通过与参考序列比
对,识别和注释样本中的基因变异。
PCR-NGS技术组合了PCR的高特异性和高敏感性以及NGS 的高通量测序能力,可以广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学等领域的研究和疾病诊断中。