5.核酸杂交PPT课件

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2. cDNA探针:是互补与mRNA的DNA分子,理想的 探针,但一般不易获得。
3. RNA探针:注意PolyA,本身易降解。多用于 基因转录研究。
4. 寡核苷酸探针:人工合成 5. 注意:长度;(G+C)%;发卡结构;碱基重
复;特异性
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探针的标记
标记物的要求: 高灵敏度 不影响杂交 检测方法灵敏,特异,无污染,价格廉 易操作,稳定性好
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Southren blotting意义
主要用于基因组中 特定基因的定性和定量检测 克隆基因的酶切图谱、基因突变分析 基因重排,丢失等分析
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Northren blotting
RNA(mRNA)提取 限制性内切酶消化 变性凝胶电泳分离RNA片段 转膜 预杂交 杂交 放射自显影
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探针的放射性同位素标记
1.缺口平移法(nick translation)
2.随机引物法(random priming)
3.DNA的5‘末端标记法
5’----GTGCTGATGACCGTA -----3’
碱性磷酸酶切除
5’----TGCTGATGACCGTA -----3’
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常用分子杂交技术
液相分子杂交
固相分子杂交
支持物(载体)
硝酸纤维素膜
尼龙膜
化学激活膜
乳胶颗粒
磁珠
微空板
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Southern blotting原理
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Southren blotting 步骤
DNA提取 限制性内切酶消化 琼脂糖电泳分离DNA片段 变性 转膜 预杂交 杂交 放射自显影
核酸杂交
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核酸杂交基本原理
1 核酸变性(Denaturation)
双链DNA间氢键断裂,变为两条单链的过 程。
增色效应:变性时溶液对紫外光吸收值 逐渐变大。(260nm)
Tm值:变性温度或解链温度指增色效应 达到一半时,即一半DNA双链解链时的温 度。
Tm值与G+C含量呈正比
互补单链重新缔合成双链的过程。
减色效应
复性速度影响因素:
DNA大小;离子强度;DNA浓度;
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分子杂交概念
两条单链之间存在完全或部分碱基序列 互补,相互结合形成双链(molecular hybridization)
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核酸杂交类型
DNA-DNA;DNA-RNA;RNA-RNA; OLIGO-DNA;OLIGO-RNA
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核酸探针
探针概念(PROBE):广义 核酸探针:指能与特定核苷酸序列发生
特异性互补杂交,杂交后又能被特殊方 法检测的已知被标记的核苷酸序列。 标记物(示踪物)分类 1. 同位素标记 2. 非同位素标记
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探针的种类
1. 基因组探针(某一基因的全部或部分序列); 应主义内含子和非编码区。
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Northren blotting应用
RNA的研究 mRNA表达高低 癌基因,抑癌基因活化
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斑点杂交(dot blotting)
概念 是一种快速、简便检测微量DNA或RNA
的方法,是将样品点到一张硝酸纤维素 膜上,并将膜划分区域,点多个样品, 烘烤固定,然后杂交现色。 优点: 快速,高通量,半定量 缺点:灵敏度不理想
Bio-7-dATP Bio-11-dCTP Bio-11-dUTP 等
DNA半抗原标记:地高辛Dig-16-dUTP
pg级
酶标:AP;HRP
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非放射标记探针的检测
AP 显色体系: P140 HRP显色体系: P140 ABC显色体系: P141
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原位杂交
核酸保持在细胞或组织切片中,经适当 方法处理细胞或组织,将标记的核酸探 针与细胞或组织切片中核酸,进行杂交 称为原位杂交。
特点:不需要提取核酸
可定性定量
可定位。
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共同的心声
一起帮助孩子更好学习, 一起帮助孩子健康成长。
起核酸变性的因素
酸、碱、热、变性剂(尿素、胍) 有机溶剂(乙醇、丙酮) Tm(85-95度之间) Tm=69.3+0.41(G+C) Tm的影响因素: GC含量;离子强度; PH值;变性剂
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核酸的几个基本概念
2. 核酸的复性(Renaturation)
T4酶 + (32P)ATP
5’---- (32P)ATGCTGATGACCGTA -----3’
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探针的非放射标记
光敏生物素标记:光生物素;补骨脂素 生物素;当归素生物素等。(pg级)
酶促生物素标记:Bio-16-dUTP ,
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