新年利是——荧光定量PCR试剂系列之五：TaqManAssay搜索流程

新年利是——荧光定量PCR试剂系列之五：TaqManAssay
搜索流程
经过前一讲的介绍，相信大家对TaqMan Assay都有了一定的了解。

但是新的问题产生了，TaqMan Assay种类繁多，数量巨大，我们如何快速地从多达上千万的assay中找到需要的那一个呢？在这一讲中，我们将为大家介绍TaqMan Assay的搜索流程。

一、首先，您需要打开赛默飞官网主页（）（图1）。

将鼠标放在“Popular”标题上方，在弹出的下拉框中选择“TaqMan Real-Time PCR Assays”的选项（图1）。

图1. 赛默飞官网首页
二、点开后会弹出如下的“测定方法检索工具”的界面（图2）。

图2. TaqMan Gene Expression Assay搜索结果
1. 选择“Gene Expression”；
2. 选择“All Gene Expression Assays”，也可以根据具体需求选择非编码RNA（Noncoding RNA only），融合基因检测assay （Fusion）等；
3. 选择物种。

如果为人/小鼠/大鼠以外的物种，点击“More”进行选择；
4. 在“Enter target information”下的对话框中输入基因名称或缩写，或在“Enter Single Sequence”下的对话框中输入序列；
5. 如果要查询多个基因的assay，也可以点击“Enter/Upload Multiple Targets”进行批量搜索；
6. 点击“Search”，得到搜索结果。

三、搜索结果的详细页面如下图3。

1. 一个基因可能会有不止一个assay，每个assay都有一个特殊的“身份证号”—Assay ID。

而货号则代表了这类产品的包装规格，通过Assay ID + 货号的组合可以找到唯一对应的TaqMan Gene Expression Assay。

2. 点开“详细信息”（View Details）可以进一步查看RefSeq、检测区段、扩增子长度等信息。

如果没有特殊要求，可以选择标注有“Best Coverage”的assay。

3. 点击“相关试剂”（Related Reagents），可以查看其他相关试剂；
4. 点击“常用内参”（Controls），可以查看常用的内参。

图3. TaqMan Gene Expression Assay搜索结果
除了基因表达assay之外，我们常用的TaqMan Assay还涵盖了SNP、CNV、mutation和microRNA检测等方面的应用，可以通过类似的方法进行搜索。

TaqMan SNP Assay的搜索（图4）：
1. 选择“SNP Genotyping”；
2. 选择“All SNP Genotyping”。

如果只需要搜索药物代谢酶相关基因上的SNP位点，可以选择“Drug Metabolism Assays”；
3. 选择物种（目前提供人及小鼠相关的assay）；
4. 在“Enter target information”下的对话框中输入rs号或基因名称等关键词；
5. 如果要查询多个SNP位点的assay，也可以点击“Enter/Upload Multiple Targets”进行批量搜索。

6. 也可以根据染色体位置，在“What chromosome location are you trying to find？”下面的对话框中，按染色体编号及起止位置进行搜索；
7. 点击“Search”，得到搜索结果。

图4. TaqMan SNP Assay搜索界面
TaqMan Copy Number Assay的搜索（图5）：
1. 选择“Copy Number”；
2. 选择“All Copy Number Assays”；
3. 选择物种（目前提供人及小鼠相关的assay）；
4. 在“Enter target information”下的对话框中输入基因名称等关键词；
5. 如果需要查询多个Copy Number Assay，也可以点击“Enter/Upload Multiple Targets”进行批量搜索；
6. 也可以根据染色体位置，在“What chromosome location are you trying to find？”下方的对话框中，按染色体编号及起止位
置进行搜索；
7. 点击“Search”，得到搜索结果。

图5. TaqMan Copy Number Assay搜索界面
TaqMan Mutation Detection Assay的搜索方法（图6）：
1. 选择“Mutation Detection”；
2. 根据实验所选用的平台选择“Digital PCR”或者“Real-Time PCR”；
3. 在“Enter target information”下的对话框中输入基因名称、COSMIC ID等关键词；
4. 如果要查询多个Mutation Assay，也可以点击“Enter/Upload Multiple Targets”进行批量搜索；
5. 点击“Search”，得到搜索结果。

图6. TaqMan Mutation Detection Assay搜索界面
TaqMan MicroRNA Assay的搜索（图7）：
1. 选择“MicroRNA”；
2. 选择“TaqMan MicroRNA Assays”。

也可以根据实际需求，选择“TaqMan Advanced miRNA Assays”，“Ta qMan Pri-MicroRNA Assays”（前前体）等选项。

3. 选择物种；如果为人/小鼠/大鼠以外的物种，点击“More”进行选择；
4. 在“Enter target information”下的对话框中输入miRBase ID，miRBase Accession Number等关键词（如果有miRNA的成熟体序列，建议优先采用成熟体序列进行搜索）；
5. 如果要查询多个miRNA的assay，可以点击“Enter/Upload Multiple Targets”进行批量搜索；
6. 也可以在“Enter Single Sequence”下方的对话框中输入miRNA的成熟体序列进行搜索；
7. 点击“Search”，得到搜索结果。

图7. TaqMan MicroRNA Assay搜索界面
好了，关于TaqMan Assay的搜索，我们就先介绍到这里。

最后再送给大家一个小贴士，如果在搜索框中不输入任何关键词，则可以查找到该类别下面的所有assay。

小伙伴们，还不快试试这个新技能？
如果经过了一番搜索之后，很遗憾，没有找到需要的assay。

大家也别沮丧，我们还准备了独门秘籍，那就是通过定制的流程得到专属于自己的TaqMan Assay。

关于这部分的内容，敬请期待我们后续的内容哦。

祝各位老师，2018年身体健康，阖家幸福。