电镜照片的裁剪和拼接

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电镜摄影技术和图像处理-七年制

电镜摄影技术和图像处理-七年制

机头可伸缩式保护
CCD的闪烁器、光纤及感应器等集成的机头 为可伸缩式设计。 在不使用 CCD时,机头缩入到真空保护腔室 中,避免闪烁器等被电镜中的脏东西污染及损 坏,有效地延长CCD的准确 ②厚度要均匀 ③无刀痕、无颤痕 ④无皱褶 ⑤反差适当 ⑥无电子染色污染 ⑦无漂移现象 理想的SEM样品:
①表面要清洗干净 ②镀膜要均匀
*2、TEM照相程序
· 选择视野、确定放大倍数(先低后高)。 · 调整物镜光阑。 要根据样品的反差强弱来调整。 · 聚焦:使用调焦荧光屏,调小电子束 光斑。目的是使图像结构清晰。
CCD相机的耦合方式
包括光学透镜耦合和光纤耦合,它是CCD的 一个重要技术指标。 1、光学透镜耦合: 是透过两组磁棱镜进行光子信号的传播,其 传输效率只有原有信号的 1%-10% ,传输效 率非常低,其反应灵敏度差,信息容易丢失。 使用光学透镜耦合的 CCD 相机获得清晰的生 物医学样品图像时,需要加大电子束流,这样 很容易损坏生物医学样品的原始形貌,破坏样 品内部信息,所获得的图像反差较差,不能反 映样品的真实情况。
(如使用 CCD 相机,调焦、曝光后,以不同图片 格式将其储存于建立好的文件夹内,刻好光盘后 备用)
· 做好观察记录
3、电镜摄影的注意事项



严格遵守操作程序。 摄影中要避免外界光线的干扰。 调焦时光斑亮度要由暗渐亮。 选择图像视野。 一是按先低倍、后高倍的原则选择视野。 二是按学术性和艺术性相结合的原则, 布局合理、重点突出。 照相时,要做到“抓拍”。要注意防震。 照相时, 要做好每个组别和每张照片的记录。
CCD的特点
HCRTM技术
光子在传播过程中,由于点扩散函数 (PSF)的影响,光子信号会发生扩散,所以 要保证像素的分辨率,必须保证光子信号的扩 散面积和像素尺寸相匹配,才能达到真实的分 辨率。假如像素尺寸小于扩散面积就会产生空 像素,从而分辨率大大减少。 HCRTM技术在保证1:1单像素分辨率的同时, 将闪烁器、光纤及CCD感应器一体化(熔接), 从而最大程度上减小了点扩散函数过度效应的 产生,减小扩散面积(读取噪音低) ,提高图 像分辨率。

电子显微镜图像处理方法探讨

电子显微镜图像处理方法探讨

电子显微镜图像处理方法探讨【引言】电子显微镜(Electron Microscope,简称EM)是一种利用电子束来放大和观察微观物体的仪器。

相较于传统光学显微镜,电子显微镜具有更高的分辨率和更大的放大倍数,在无法用光学显微镜观察的微小结构上具有重要的应用价值。

然而,电子显微镜所产生的图像往往有噪点、伪影等不完美之处,因此图像处理方法在电子显微镜技术中起到至关重要的作用。

【图像增强】图像增强是电子显微镜图像处理的核心任务之一,其目的是改善图像的质量和清晰度,使得细节更加明确可见。

常用的图像增强方法包括灰度拉伸、中值滤波、直方图均衡化等。

- 灰度拉伸是通过线性变换来扩展图像的灰度范围,使得图像上的细节更加丰富。

它通过将图像的最低灰度值映射到最小的可显示灰度值,将最高灰度值映射到最大的可显示灰度值,从而增强图像的对比度和细节。

- 中值滤波是一种常用的平滑滤波方法,通过计算像素周围邻域的中值来替代原像素值。

它能够有效地去除图像中的噪声和伪影,并保持图像边缘的清晰度。

- 直方图均衡化是一种通过变换图像的像素灰度分布来增强图像对比度的方法。

它能够显著改善图像的整体亮度分布,使得图像细节更加鲜明。

【图像分割】图像分割是将图像划分为具有相似属性的区域的过程,常用于目标检测、图像分析和量化等领域。

电子显微镜图像分割的目标在于将微观结构从背景中准确提取出来,并进行精确的定量分析。

常用的图像分割方法包括阈值分割、区域生长和边缘检测等。

- 阈值分割是最简单常用的图像分割方法之一,它将图像中的像素根据其灰度值与给定阈值的大小关系划分到不同的区域。

通过选择合适的阈值,可以有效地将前景目标与背景分开。

- 区域生长是一种基于像素相似度的图像分割方法,它从具有相似属性的种子像素开始,逐渐将相邻的像素合并到同一区域,直到满足预设的停止条件。

区域生长方法适用于具有连续性的目标分割。

- 边缘检测是通过识别图像中明显的灰度变化或其他特征来确定物体的边界。

电镜图像处理 IPP

电镜图像处理 IPP

电镜图像由于成像方式特殊性,很难采用一般方法来进行有效分割。

IPP软件强大图像逻辑运算、滤镜工具、分割以及据处理功能,可以测量各种金属和非金属电镜图像,帮助您成为电镜图像处理专家。

晶粒度分析
自定义伪彩色-电镜图像增强形态学分割工具晶粒度测量-金刚石样品
更多实例
刀痕、刀
颤去除磁性材料晶粒度电镜图像以及网格图结果
统计结果以及数据直方图
平板玻璃晶粒度测量
IMC分析
测量IMC面积比
测量IMC面积比,粒径分级统计
图像拼接
Media Cybernetics, Inc. China Representative Office / Tel:+86.21.33773539 / Email: support_PMQ@。

图像分幅裁剪和拼接处理

图像分幅裁剪和拼接处理

图像分幅裁剪和拼接处理一、实验目的在实际工作中,经常需要对图像划分工作范围,因此需要对图像进行分幅裁剪。

在图像分幅处理完之后,要对具有地理参考的若干相邻图像合并成一幅图像或一组图像,所以产生了图像拼接处理。

通过本次试验,学会图像分幅和图像拼接处理,并能灵活运用处理图像。

二、实验内容1、规则分幅裁剪2、不规则分幅裁剪(1)A IO多边形裁剪(2)A rcinfo多边形裁剪3、卫星图像拼接(1)启动图像拼接工具(2)加载Mosaic图像(3)图像重置叠合(4)图像匹配设置(5)运行Mosaic工具(6)退出Mosaic工具4、航空影像拼接(1)拼接准备工作(2)启动图像拼接工具(3)设置图像拼接范围(4)加载Mosaic图像(5)确定相交的区域(6)绘制裁切的区域(7)定义输出的图像(8)运行拼接功能(9)退出Mosaic三、实验步骤1、规则分幅裁剪在ERDAS图标面板菜单条单击main/data preparation/subset image命令,打开subset对话框。

在subset对话框中需要设置下列参数:(1)输入文件名称(input file)为lanier.img(2)输出文件名称(output file)为lanier sub.img(3)坐标类型(coordinate type)为file(4)确定裁剪范围(subset definition),在ulx、uly、lrx、lry微调框中分别输入需要的数值(5)输出数据类型(output data type)为unsigned 8 bit(6)输出文件类型(output layer type)为continuous(7)输出统计忽略零值,选中ignore zero in output stats复选框(8)输出像元波段(select layers)为2:5(表示选择2、3、4、5这四个波段)(9)单机OK按钮(关闭subset image对话框,执行图像裁剪)2、不规则分幅裁剪A.AOI多边形裁剪(1)在窗口中打开需要裁减的图像,并应用AOI工具绘制多边形AOI,可以将AOI保存在文件中(*.aoi),也可以暂时不退出窗口,将图像与AOI多边形保存在窗口中。

电镜的图像处理技术

电镜的图像处理技术

电镜的图像处理技术电子显微镜(简称电镜)是一种高科技装置,可以高精度地观察物质微观结构,它的出现推动了纳米科学、纳米技术的不断发展。

在电镜取得的图像中,图像处理技术可以为我们提供更多的细节信息,让人类更好地认识和利用物质世界,将在此阐述一些常用的图像处理技术。

1、对比度调整调整对比度可以使图像更加清晰,让目标物体的特征更加明显。

电镜的图像通常比较暗淡,如果不进行对比度调整,会很难看清物体的表面结构和内部形态。

为此,我们需要使用图像处理软件,在里面打开电镜图像,通过调节对比度和亮度等参数,使得图像更加明亮、细节更加清晰。

2、去噪电镜图像通常包含噪声,在处理图像前,我们需要把噪声移除,这可以通过各种滤波算法来实现。

常用的去噪算法有中值滤波、高斯滤波、维纳滤波等。

中值滤波将每个像素的值都改为周围像素的中值,具有去除噪声的效果;高斯滤波是一种基于像素点附近值的加权平均值的算法,可以消除高频噪声;维纳滤波可以对加性噪声进行去噪。

3、边缘检测边缘检测是图像处理中的一种常见操作,它可以帮助我们寻找图像中各个物体的边缘。

在电镜图像处理中,边缘检测可以帮助我们更加清晰地观察物体的表面形态和内部结构。

常用的边缘检测算法有Canny算法、Sobel算法、Laplacian算法等。

这些算法都可以在图像中寻找边缘,并将其以线条的形式标记出来,方便我们分析和研究。

4、三维可视化在电镜实验中,我们经常需要观察物体的三维形态,这可以通过三维可视化技术来实现。

在图像处理软件中,我们可以将电镜图像进行三维建模,然后通过旋转、拉伸等操作,让物体的三维形态更加清晰地呈现出来。

此外,还可以使用虚拟现实技术来进行三维可视化,让用户身临其境地观察物体的微观结构。

5、人工智能技术辅助分析随着人工智能技术的不断发展,电镜图像处理也不再局限于传统的方法,人工智能技术在其中扮演越来越重要的角色。

比如,我们可以使用卷积神经网络等深度学习技术来自动识别物体的形态、结构等信息,帮助我们更快速地进行图像分析和处理。

sem标准操作流程

sem标准操作流程

SEM标准操作流程包括样品准备、对SEM设备的操作以及照片获取和分析等步骤。

首先,对于样品的准备,主要包括样品切割定形、镶嵌、磨抛等步骤。

一般情况下会使用低速锯手动切割样品,当样品数量较大、切割精度要求高时,则会使用线切割。

在拿到SEM设备室之前,需要对样品表面进行喷金处理,喷金的离子会让其附着在样品表面,增加导电性,从而在用SEM电子束观察的时候能够更清晰。

然后是对SEM设备的操作。

操作者需要熟悉设备的主要结构,包括电子枪,电子束聚焦系统,真空系统,样品室等。

同时,要能熟练地调节对焦和消像散以获得清晰的电镜照片。

在操作过程中,需要戴上手套以免污染样品。

最后是获取照片并进行相应的分析。

通过调整设备参数以及对拍摄的照片进行分析,可以得到关于样品的表面形态和结构的信息。

需要注意的是,SEM操作涉及高度专业化的设备和技术,因此应由经过专业培训的人员进行。

电镜超薄切片课件PPT

电镜超薄切片课件PPT

与常规切片技术的比较
切片厚度
电镜超薄切片技术使用的切片厚度通常在50-100纳米之间, 远小于常规切片技术的切片厚度,能够更好地保留细胞和组 织的细微结构。
观察效果
由于超薄切片的厚度极薄,电镜下观察时能够获得更高的分 辨率和更清晰的图像,更准确地反映细胞和组织的形态。
与其他电镜技术的比较
透射电镜与扫描电镜
发展高效的数据处理和分析方法,应 对海量数据带来的挑战,挖掘更多有 价值的信息。
THANKS FOR WATCHING
感谢您的观看
应用领域
01
02
03
04
生物学
研究细胞、组织、器官的超微 结构和功能,如细胞器、细胞
膜、染色体等。
医学
诊断疾病、研究病变组织、药 物作用机制等。
材料科学
研究材料的微观结构和性能, 如金属、陶瓷、高分子业、食品科学等 。
02 电镜超薄切片制备流程
样品选择与处理
样品选择
选择合适的电镜型号
根据实验需求,选择具有高分 辨率和高成像质量的电镜型号
,如透射电镜或扫描电镜。
操作电镜前的准备
确保电镜处于良好的工作状态 ,检查真空度、电源和控制系 统是否正常。
样品制备
将超薄切片置于电镜载网上, 调整位置,确保切片平整且不 与载网接触。
观察与成像参数设置
根据样品特性,调整加速电压 、工作距离、物镜光圈等参数
,以获得最佳成像效果。
图像的获取与处理
1 2
图像获取
通过电镜的摄像系统或数字成像系统获取切片图 像。
图像处理
对获取的图像进行对比度、亮度调整,以及伪彩 色标记等处理,以增强图像的可视化效果。
3
图像保存与输出

实验2 图像的拼接和裁剪

实验2 图像的拼接和裁剪

实验二图像的拼接和裁剪一、实验目的掌握对图像按照不同mode进行拼接熟练掌握对拼接好但是边界不整齐的图像进行裁剪二、实验数据与软件硬件:计算机软件:ERDAS软件开发环境:windows xp 系统三、实验步骤第一步:在erdas主界面中点击dataprep选项弹出:选择mosaic images 选mosaic tool在此窗口加载1、2、3img图像直接进入set input mode选择此mode 对edit中set overlap进行设置如下:并对color corrections 中设置为(use.histogram matching)至此对拼接的设置完成,Process preview mosaic 后直接保存为拼接1:在view#中打开拼接1:由于拼接的图像边界不是规则的,故进行第二步的裁剪第二步:打开第一步中拼接好的图像(拼接1),并在AOI下拉框中选择tools自动弹出工具,选择矩形裁剪框,任意调整想要裁剪的区域如下:接下来,把此视图保存为.aoi文件步骤为:file save 保存为c.aoi 回到erdas 主界面选择Dataprep 选subset然后引进拼接好的图,新建裁剪3点击AOI导入c.aoi文件进行最后的裁剪图像生成:单击OK后等候片刻,就会在存储路径下生成裁剪3.img,,并在view#中打开图像显示如下:四、实验结果与分析1、对比裁剪预览可知室所裁剪的结果2、拼接三幅图像可以采样不同的六种mode ,然后得到的拼接图像也不相同,比较后选择本实验的这种mode最佳3、可能室软件源或者安装等的问题出现有些功能和属性设置在本实验中问能按要求设置,如:在拼接未能找(edit下的overlap areas),但是设置了color corrections中use.histogram matching也能实现拼接。

电镜照片处理

电镜照片处理

尺寸: 1024 1024 格式: JPEG图像 颜色: 灰度
1பைடு நூலகம்
电镜照片的规范化处理
规范化处理要求
图像分辨率: 图像尺寸: 标尺形式: 标尺文字: 图像颜色: 输出文件: 300 dpi 7 cm宽 5.5 cm高 12磅纯白或纯黑直线 14磅 Arial ( (Symbol) y ) 灰度 JPEG图像文件, 品质10
电镜照片的规范化处理
6
IV类 (HRTEM) 照片处理
① 拷贝粘贴原始比例尺到照片中部 ② 分辨率改为360 dpi (尽量多保留信息) 此时图像尺寸为 7.227.22 cm ③ 垂直翻转图像, 使右下角为非特征区 ④ 更改画布大小为宽 7.0 7 0 cm (左右被裁剪) ⑤ 图像上部裁剪约1 cm, 使特征区位于中部 ⑥ 更改画布大小为高 5.5 cm (上下被裁剪) ⑦ 画标尺、尺寸文字, 并移到右下角 ⑧ 调整图像对比度 ⑨ 文件输出 360 dpi PSD: 用于以后再次编辑 300 dpi JPG: 用于Word文档打印 120 dpi JPD: 用于ppt 文档显示
电镜照片的规范化处理
7
扫描电镜原始照片特征
类型-I 类型-II
尺寸: 1280 960 格式: TIFF图像 颜色: 索引
尺寸: 712 484 格式: TIFF图像 颜色: 灰度
0
电镜照片的规范化处理
透射扫描电镜原始照片特征
类型-III 类型-IV
尺寸: 1053 758 格式: JPEG图像 颜色: 灰度
电镜照片的规范化处理
2
I类 (SEM) 照片处理
① 图像模式改为 “灰度” ② 选择包含比例尺的区域, 拷贝并粘贴到照片中部 ③ 裁剪去掉图像下部说明 (剩余部分图像尺寸为: 1280 869) ④ 更改 “图像大小”将高度 定为 5.5 cm (须选定 “约束比例”) ⑤ 更改 “画布大小” 将宽度 定为 7.0 cm

如何手动给显微镜照片加标尺?

如何手动给显微镜照片加标尺?

如何手动给显微镜照片加标尺?在科研过程中,我们会用到各种各样的显微镜(如荧光显微镜,电镜等),我们在用显微镜拍照的时候,一般都会用显微镜自带的拍照软件加上标尺(Scale bar)。

但在我们结果展示的时候,往往需要将照片进行裁剪和排版,照片右下角的标尺往往被裁剪掉。

那么,在照片排版的时候如何给照片再加上标尺呢?目标是这样的:(PNAS,2014)或者这样的:(PP,2018)之前的《科研照片的处理与组合》一文,已介绍了如何用PPT 排版和处理科研照片,下面就用上面的3张图做演示,看看如何用Adobe Photoshop(Ps)为照片加标尺。

首先,通过文件/脚本/将文件载入堆栈,在弹出的文件选择窗口,点浏览文件按钮,将所有图片分别堆叠到同一个画布上的不同图层。

单击矩形工具,将填充色设置为白色,将描边颜色设为无。

将鼠标指针移到图片右下角的标尺处,按住alt键,向前滚动鼠标中间滚轮,放大该区域(也可用缩放工具或ctrl + “+”/”-”对图片区域进行放大),为了使绘制的标尺非常精确,这里将视野放大到1200%,甚至可以看到单个的正方形像素,如下图。

然后绘制矩形,使矩形的宽与照片上的标尺一样。

这样,一张图片的标尺就绘制好了,当然你也可以用文本工具(快捷键:T)在矩形上方添加数字和字母,这里就不演示了。

将视野是缩小(快捷键同上)后,将新绘制的“标尺”用移动工具(快捷键:V)移到图像不会被裁剪掉的区域。

使用裁剪工具(快捷键:C)将照片裁为正方形(比例设为1:1即可),如下图。

然后通过图像/画布大小,将背景画布的宽度调为图片的3倍多一些,高度适当加大一些。

用移动工具将三张照片进行排列,如下图。

接下来右键矩形图层,点复制图层,再复制出2个“标尺”。

tips:如果你的照片是在不同放大倍数的显微镜下拍摄的,就需要对每张照片的标尺重新绘制,方法同上。

本文的照片在相同的放大倍数下拍摄的,只需将矩形图层复制三个就好了。

电镜图片上色!看完就会

电镜图片上色!看完就会

好不容易拿到电镜,难道不给它上个色?(个人●上色效果图)(个人●上色效果图)这些效果都是PhotoShop做出来的。

别担心!整个上色过程仅使用简简单单的3种工具:磁性套索、图层、色彩填充。

看完这篇你也能做出炫酷的电镜彩图。

接下来,以下图为例,做电镜上色动作分解。

图文教程1. 首先你的电脑上需要安装PhotoShop做,网上有很多绿色版,随意下载一个版本的就行。

(我个人用的是14.0 x64版本)2. 直接用PhotoShop打开电镜图片(无需建立画布)3. 按“Ctrl+J”,新建图层。

4. 点击左侧的缩放工具,放大局部至合适大小(个人感觉越大越方便)。

5. 选择“磁性套索”,然后贴着这个细胞表面勾勒出形状。

尽可能地仔细勾勒,形成闭合状。

6. 再次按“Ctrl+J”,新建图层。

此步是将刚刚勾勒的细胞从全图中分离出来。

7. 选中新图层,然后点击“编辑”,选择“填充”。

8. 弹窗中选择“颜色”,选择“柔光”,选择“保留透明区域”,颜色自选(个人喜爱红色)。

9. 可以看到初步的上色效果。

有内味儿了!10. 接下来重复上一步的操作方法将凹陷里面的另一个细胞也上色。

11. 选择图层1,也就是最开始建立的图层。

然后点击“编辑”,选择“填充”,弹窗中选择“颜色”,选择“柔光”,选择“保留透明区域”,颜色自选(个人喜爱淡黄色)。

12. 最后存储为JPEG格式图像,注意取消“ICC配置文件”,最佳品质输出。

13. 完美上色!14. 当然了,如果耐心足够,还可以设计更多细节和颜色。

比如我手痒了,就顺势添加了一些小细节。

Ending~~~·。

透射电镜的使用方法和观察技巧

透射电镜的使用方法和观察技巧

透射电镜的使用方法和观察技巧透射电镜(Transmission Electron Microscope,简称TEM)是一种非常强大的工具,它能够以高分辨率来观察物质的微观结构和成分。

通过TEM,科学家们可以更好地理解原子和分子层面的结构和性质。

本文将介绍透射电镜的使用方法和一些观察技巧,帮助读者更好地利用这一仪器。

在使用透射电镜之前,首先需要进行一些准备工作。

最重要的一步是样品的制备与处理。

样品的制备对于获得高质量的图像至关重要。

样品通常需要被切割成非常薄的切片,常用的工具是离心切片机或者离心磨削机。

切片的厚度通常在几纳米至几十纳米之间,过厚或过薄都会影响图像的质量。

此外,在切割后,我们需要使用一些药剂进行清洗和净化,以去除切割时可能附着的污染物。

准备工作完成后,我们可以将样品放入透射电镜当中进行观察。

为了获得清晰的图像,我们需要将电镜调整至最佳状态。

首先,调整透射电镜的对准,确保电子束能够正确地通过样品。

然后,我们需要调整透射电镜的对焦以及亮度和对比度,以获得清晰和明亮的图像。

这一步骤需要耐心和细心,因为微小的调整可能会产生巨大的影响。

一旦电镜准备就绪,我们可以开始观察样品了。

对于初学者来说,最好选择一些相对简单和易观察的样品,以便更好地理解透射电镜的操作和图像解读。

例如,金属纳米颗粒或者碳纳米管等样品都是非常受欢迎的选择。

观察样品时,需要将电镜设定为合适的放大倍数以及曝光时间。

使用过高的放大倍数可能会造成图像模糊,而曝光时间过长可能会导致图像过曝或过暗。

合理地选择这些参数对于获得清晰的图像至关重要。

另外,在观察过程中,我们还需要注意一些技巧和细节。

首先,由于透射电镜中使用的是电子束,而电子束对样品的伤害是不可忽视的,因此我们需要尽量保持较低的电子束强度和较短的照射时间,以避免对样品的损伤。

同时,我们还需要保持透射电镜的真空状态,因为任何微小的气体分子都可能对电子束的传输和样品的观察造成干扰。

透射电镜组织处理

透射电镜组织处理

透射电镜组织处理
透射电子显微镜(Transmission Electron Microscope,TEM)是一种强大的显微镜技术,可以对材料的内部结构和组织进行高分辨率的观察。

为了进行透射电镜观察,材料通常需要经过一系列处理步骤以准备样品。

下面是一般的透射电镜组织处理步骤:
1.采样和切片:从原始材料中采集要观察的样品,并使用显
微切割机或离心切片机将样品切片成适当的厚度(通常是
几十到几百纳米)。

2.修剪和固定:根据需要,选择感兴趣的样品区域,修剪并
将其固定在载玻片或网状膜上,以便在电镜中进行观察。

3.固定剂处理:为了保持样品的原始结构和形态,通常使用
特定的固定剂处理样品。

例如,常用的固定剂有冷冻醇、
蛋白质交联剂(如缩醛或戊二醛)等。

4.重金属染色:为增加样品的对比度,某些样品可能需要进
行染色处理。

重金属染色剂(如铀酸或铋酸)通常用于染
色,以增强电子束与样品的相互作用。

5.脱水和浸透:为了进一步固化样品并保持其结构,通常使
用乙醇或丙酮等有机溶剂进行脱水处理,并使用一些合适
的浸透剂(如酮树脂或环氧树脂)浸透样品。

6.切片和显影:将浸透好的样品切成适当的薄片(通常是50
至100纳米),并使用硝酸铋等显影剂处理样品,以增强
对比度。

7.观察:将处理好的样品放入透射电镜中,利用电子束穿过
样品观察样品的内部结构和组织。

需要注意的是,透射电镜组织处理的具体步骤和条件可能会根据不同的样品类型和目的而有所不同。

电镜标本处理ppt课件

电镜标本处理ppt课件

每级10 min。
11 在切片表面注入少量Epon/丙酮液(Epon:丙酮 = 2:1),用
注满Epon液的塑料胶囊扣入切片上。
12 置聚合箱中,37℃聚合24h,60℃聚合48h。
13 在酒精灯外燃上加热5~7秒,将标本从载片上分离,剥除塑
料胶囊。镜下选择超薄切片部位或细胞。
14 修块,用超薄切片机切片,片厚60~80 nm。将切片裱于铜
酶组织化学染色方法
生物素-抗生素免疫细胞化学技术
细胞凋亡检测技术
葡萄球菌蛋白A
第二章 免疫细胞化学技术9..0万 每节15万字左右
凝集素
第一节 免疫细胞化学的免疫学及组织细胞学概述(三军医 第五节 免疫金银及铁标记技术(三军医大学 蔡文琴)
大学张吉强)
免疫进技术发展史
抗原
溶胶的基本概念
抗体
免疫胶体金银细胞化学染色的固定剂选择
免疫 树脂包
埋聚合 超薄切片 电子染色 电
镜观察照相
Photo shop处理照片
论文照片版面做成
5
免疫染色后的标本处理
电镜
光镜
6
光镜 电镜
7
振动切片机
8
40 um
脑(for example) vibrating-blade microtome切片
免疫染色 树脂包埋
锇酸固定
ultramicrotome 超薄切片60-80 nm、电子染色(醋酸铀/枸橼酸铅)
网。
15 醋酸铀、枸橼酸铅染色,双蒸水洗净,电镜观察。
10
锇酸固定
锇酸的配制与管理:用0.1M PB配制,浓度为2%。用棕 色磨口瓶密封,4度冰箱内保存。 固定时间:1.5~2h 注意事项:在通风橱中进行。

电子显微镜中的采集与图像处理技术

电子显微镜中的采集与图像处理技术

电子显微镜中的采集与图像处理技术电子显微镜是一种利用电子束照射样品表面,通过电子束与样品的相互作用产生的信号,利用电子光学透镜和探测器对信号进行转换、放大和成像的高分辨率显微镜。

电子显微镜具有较高的分辨率和强大的成像能力,为材料学、生物学、物理学等学科提供了强有力的工具。

而在实际应用中,如何有效地采集和处理电子显微镜图像数据,成为了电子显微镜技术中一个十分重要的环节。

一、电子显微镜中的采集技术对于电子显微镜,采集技术指的是将电子束与样品相互作用产生的信号,通过探测器将其捕捉并转换为电信号,以便进行信号放大和成像。

针对电子显微镜中常见的信号类型,其采集技术主要有以下几种。

1. SE信号采集SE信号是电子束与样品表面相互作用后,由样品自身产生的电子通过离开样品表面的方式产生的二次电子声波信号。

SE信号在电子显微镜成像中占有重要地位,因此其采集技术也十分关键。

在实际采集中,SE信号的采集技术通常采用二次电子探测器,二次电子探测器利用高电子亲和能的金属材料(如氖)吸附分离二次电子,并通过微弱电流引出信号。

2. BSE信号采集BSE信号是由电子束与样品相互作用后,通过散射、逸出或折射等方式形成的反向(与电子束方向相反)电子束,其信号强度与样品成分及表面形貌等因素有关。

为采集BSE信号,常用的探测器有气体焊接的半导体探测器和固体结构的晶体探测器。

气体焊接的半导体探测器具有较高的信噪比和响应速度,而晶体探测器则具有较高的能量分辨率。

3. EDX信号采集EDX信号是由电子束与样品相互作用后,样品中的原子通过电子碰撞排除外层电子,产生一系列特定能量的特征X射线,并被探测器捕捉。

EDX信号采集是电子显微镜中元素分析的关键环节。

在实际采集中,常用的EDX探测器有Si(Li)探测器、SDD探测器和Peltier冷却探测器等。

二、电子显微镜中的图像处理技术电子显微镜采集到的原始数据往往存在着噪声、信号不均匀等问题,需要通过图像处理技术对数据进行进一步处理,才能获得更加清晰、准确的图像。

扫描电子显微镜的图像处理技术研究

扫描电子显微镜的图像处理技术研究

扫描电子显微镜的图像处理技术研究概述扫描电子显微镜(SEM)是一种常用于材料科学、生命科学、纳米科学等领域的高分辨率显微技术。

其优点在于可以获得高分辨率的图像,同时还可以进行化学成分分析、形貌分析等。

然而,SEM采集到的图像通常存在一定的噪声和伪影,这就需要对其进行图像处理,以得到更为准确的信息。

本文将重点介绍SEM图像处理技术。

图像预处理SEM采集的图像往往存在一些问题,如伪影、噪声、图像失真等。

为了获得更好的图像质量,需要进行图像预处理。

图像预处理包括噪声去除、伪影消除、图像增强等。

噪声去除SEM图像中噪声主要来源于电子束的不稳定性和材料本身的表面微观结构。

常用的噪声去除方法有中值滤波、高斯滤波、小波变换等。

其中,小波变换可以同时进行滤波和小波包分解,能够更好地删除噪声。

伪影消除SEM图像中的伪影可由不正确的工作距离、扫描电子束强度等因素引起。

常用的伪影消除方法是多种方法的组合,如空洞填充、线性函数矫正、灰度梯度校正等。

图像增强图像增强可以使图像中的细节更加明显、清晰,提高图像质量。

常见的图像增强方法包括灰度转换、直方图均衡化、小波变换等。

形貌分析形貌分析是SEM图像处理中的一个主要应用,其应用广泛,如场发射显示器技术、纳米材料等。

形貌分析主要通过二维和三维形貌几何参数的计算和分析来描述图像中物体的形状和大小。

常用的形貌参数包括表面粗糙度、孔洞面积、孔洞大小和颗粒直径等。

其他应用除了形貌分析,SEM图像处理还具有其他应用,如材料成分分析、断层分析、晶体结构分析等。

这些应用涉及到SEM图像中存在的其他信息,如X射线能谱、断层等。

结论SEM图像处理技术是SEM应用中不可或缺的一部分,它可以提高图像的质量,使得图像中的信息更加精确。

随着SEM技术的发展和需求的增加,SEM图像处理技术也不断发展和完善。

未来,SEM图像处理技术将越来越广泛应用于各个领域。

电镜照片的裁剪和拼接

电镜照片的裁剪和拼接

电镜照片的裁剪和拼接对于拍摄效果理想的电镜照片,只需要通过简单的裁剪和拼接,就可以完成。

但是在实际操作过程中,往往存在这样的问题,电镜照片下方有一个标注栏,在标注栏中可以记录标尺、工作距离、加速电压等电镜拍摄条件,在制作插图过程中,往往需要将电镜图片缩小,将几张具有对比效果的图片拼接在一张插图中,此时数据栏中的字体会变得很小,标尺也会看不清楚。

因此,在制作用于发表的插图过程中往往需要将电镜照片下方的数据栏剪切掉,再重新制作一条标尺,并进行标记。

对于单张照片的裁剪、修改电镜图片的大小及重新调整照片明暗对比度的工作需要用Photoshop软件(简称PS)来完成,而将图片拼接在一起,重新画标尺和标注文字的工作需要Illustrator软件(简称AI)来完成。

一、收集合格整理素材将一张插图中计划用到的所有电镜照片全部复制下来,建立一个新的文件夹,最好给每一张照片一个文件名,以后文件名最好不要更改,因为AI软件和PS软件中的图片是链接关系,防止在拼接图片过程中出现的链接图片无法识别。

二、用Photoshop裁剪出大小完全一致的图片1、按照图片标尺长度绘制一个矩形框当扫描电镜图片被缩小后,标尺经常会看不清楚。

因此可以先根据标尺长度绘制一个等长的矩形框,以便图像拼接后根据该矩形框重新画一条标尺。

具体操作步骤如下:①用Photoshop CS5软件打开需要操作的图片。

②将索引格式的电镜图片转变成RGB颜色格式的文件(执行“图像——模式——RGB颜色”命令)。

③按照原标尺大小画一个相同长度的矩形框,并填色。

具体方法如下,新建一个图层,用缩放工具拖拽图片,将标尺区域放大,在新建图层中用矩形选择工具按照标尺长度画一个等长的矩形框,用吸管工具在色板上任意吸取一个颜色,按下Alt+Delelte键,将矩形框填充上颜色。

按下Ctrl+D键取消选框。

将矩形框移动到图片中任意区域,裁剪时不会受到影响即可。

双击抓手工具,将图片放到合适屏幕大小。

电镜技术及超薄切片技术 PPT

电镜技术及超薄切片技术 PPT
电镜技术及超薄切片技术
电镜室现有设备
1、H-7500型透射电镜,购于2004年,最大点分辨率 为0、24nm,有效放大倍数达60万倍。 2、S-3000N型扫描电镜,购于2004年,有效放大倍数 达30万倍。 3、辅助设备:Tome-Power XL超薄切片机,零界点干 燥仪,离子溅射仪等。
1924年,法国Broglie提出了“电磁波与光一样,具有波 动性“的假说,并计算出电磁波长为0、005nm、
标本取材方向及大小示意图
双刀切割法
• 常见脏器的取材简介
睾丸组织取材方法
1、灌注固定
2、注射固定
3、浸泡固定
4、位置选择:要观察生精细胞或支持细胞,取材 于睾丸的睾丸网部位,大鼠与小鼠的睾丸网比较 表浅,就在白膜下附近。假如要观察成熟精子,最 好取材于附睾的尾部,此处精子已基本成熟,而且 精子密度最高。
透射电子显微镜
光源 聚光镜 样品 物镜 投影镜 最终象
光学显微镜
透射电子显微镜的原理和结构
• 光的衍射现象: 由于光具有波动 性,当光线通过小孔或 小孔光源经光学系统 成象会产生衍射。其 图案是:中央部分一个 亮斑,在其周围有明暗 交替的圆环。
2D
显微镜的分辨本领
显微镜分辩本领是由其产生的衍射图中央亮 斑半径 D(分辨能力)大小来决定的即
骨组织取材方法
• 取小块骨片(1~2mm大小),先用2、5%戊二醛固定2小时, 磷酸缓冲液漂洗2次,再将骨片浸入脱钙液进行脱钙处理, 视脱钙效果而定脱钙时间,如用EDTA脱钙液,大约3天时间, 主要视组织块是否变得柔软,通常用细针刺脱钙骨片是否 容易刺穿来判断脱钙效果。
• 软骨组织一般直截了当固定,不需要脱钙处理。
(1000KV)的点分辨率可高达0、001nm。

图像分幅裁剪和拼接

图像分幅裁剪和拼接

图像分幅裁剪(Subset Image)在实际工作中,经常需要根据研究工作范围对图像进行分幅裁剪,按照ERDAS实现图像分幅裁剪的过程,可以将图像分幅裁剪分为两种类型:规则分幅和不规则分幅。

1.规则分幅裁剪(Rectangle Subset Image)规则分幅是指裁剪图像的边界范围是一个矩形,通过左上角和右下角两点的坐标,就可以确定图像的裁剪位置,整个裁剪过程比较简单。

ERDAS 图标面板菜单条:Main→ Data Preparation →Data Preparation菜单(图4.1)→选择Subset Image→开Subset Image对话框(图4.8)ERDAS 图标面板工具条:点击Data Prep图标→打开Data Preparation菜单(图4.1)→选择Subset Image→打开Subset Image对话框(图4.8)图4.8 Subset Image对话框在Subset Image对话框中需要设置下列参数:→输入文件名称(Input File):Lanier.img→输出文件名称(Output File):Lanier_sub.img→坐标类型(Coordinate Type):File→裁剪范围(Subset Definition):输入ULX、UL Y、LRX、LRY→输出数据类型(Output Data Type):Unsigned 8 bit→输出统计忽略零值:Ignore Zero in Output Stats→输出像元波段(Select Layers):1:7(表示选择从第一波段到第七波段)4,3,2(表示选择4,3,2四个波段)→OK(关闭Subset Image对话框,执行图像裁剪)说明:①在上述图像裁剪过程中,裁剪范围是通过直接输入左上角坐标和右下角坐标定义的。

此外,还可以通过两种方式定义裁剪范围:其一是应用查询框(Inquire Box),然后在Subset Image对话框中选择From Inquire Box功能;其二是应用AOI,然后在Subset Image 对话框中选择AOI功能,打开AOI对话框,并确定AOI区域来自图像视窗即可。

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电镜照片的裁剪和拼接
对于拍摄效果理想的电镜照片,只需要通过简单的裁剪和拼接,就可以完成。

但是在实际操作过程中,往往存在这样的问题,电镜照片下方有一个标注栏,在标注栏中可以记录标尺、工作距离、加速电压等电镜拍摄条件,在制作插图过程中,往往需要将电镜图片缩小,将几张具有对比效果的图片拼接在一张插图中,此时数据栏中的字体会变得很小,标尺也会看不清楚。

因此,在制作用于发表的插图过程中往往需要将电镜照片下方的数据栏剪切掉,再重新制作一条标尺,并进行标记。

对于单张照片的裁剪、修改电镜图片的大小及重新调整照片明暗对比度的工作需要用Photoshop软件(简称PS)来完成,而将图片拼接在一起,重新画标尺和标注文字的工作需要Illustrator软件(简称AI)来完成。

一、收集合格整理素材
将一张插图中计划用到的所有电镜照片全部复制下来,建立一个新的文件夹,最好给每一张照片一个文件名,以后文件名最好不要更改,因为AI软件和PS软件中的图片是链接关系,防止在拼接图片过程中出现的链接图片无法识别。

二、用Photoshop裁剪出大小完全一致的图片
1、按照图片标尺长度绘制一个矩形框
当扫描电镜图片被缩小后,标尺经常会看不清楚。

因此可以先根据标尺长度绘制一个等长的矩形框,以便图像拼接后根据该矩形框重新画一条标尺。

具体操作步骤如下:
①用Photoshop CS5软件打开需要操作的图片。

②将索引格式的电镜图片转变成RGB颜色格式的文件(执行“图像——模式——RGB颜色”命令)。

③按照原标尺大小画一个相同长度的矩形框,并填色。

具体方法如下,新建一个图层,用缩放工具拖拽图片,将标尺区域放大,在新建图层中用矩形选择工具按照标尺长度画一个等长的矩形框,用吸管工具在色板上任意吸取一个颜色,按下Alt+Delelte键,将矩形框填充上颜色。

按下Ctrl+D键取消选框。

将矩形框移动到图片中任意区域,裁剪时不会受到影响即可。

双击抓手工具,将图片放到合适屏幕大小。

2、裁剪图片
为了得到一幅较为美观的插图,插图中每一张照片的大小应当保持一致,且倍数不变,可以通过固定比例裁剪或固定大小裁剪来实现。

(1)固定比例裁剪。

单击矩形选择工具,在样式下拉列表中选择“固定比例”,输入宽度和高度比例,如将图片比例固定为4:3,。

用鼠标左键在图片上拖动,选择区域,之后单击菜单栏中“图像——裁剪”命令,之后按下Ctrl+D键取消选框。

(2)固定大小裁剪。

如果是具有对比效果的图片,那么裁剪区域的大小也必须完全一样,此时,需要将裁剪区域大小固定。

①单击矩形选择工具,选取第一幅图片的被裁剪区域,此时样式可以用“正常”也可以“固定比例”。

②选择好被裁剪区域后,执行“图像——裁剪”命令。

③执行“图像——图像大小”命令,在“图像大小”对话框中查看被裁剪区域的
大小,如。

④用Photoshop软件打开第二幅图片,单击矩形选择工具,在“样式”下拉列表中选择“固定大小”,输入图像大小值,如
,选择被裁减区域,执行“图像——裁剪”命令即可。

3、固定图片大小
裁剪出图片后,执行“图像——图像大小”命令,在“图像大小”对话框中,定义文档大小,如下图。

注意:此时“重定图像像素”的选框一定不能被选中,否则图像像素会发生变化。

Photoshop CS5图像大小面板
4、存储图片
图片存为PSD格式即可,方便后续操作。

三、用Illustrator CS5软件拼接图片
用Photoshop CS5裁剪出几张完全相同大小的图片后,运用Illustrator CS5
软件将图片拼接在一张画板上。

1、打开Illustrator CS5软件。

2、执行“文件——新建”命令,新建一个画板。

3、执行“文件——置入”命令,选择要置入的图片,将裁剪好的图片依次置入Illustrator CS5中。

注意:置入对话框中“链接”的选项要被选中,这样可以将置入的原文件与AI中用于拼接文件链接起来,方便后续操作。

4、用选择工具移动图片,执行“窗口——对齐”命令,打开“对齐”对话框,
,用选择工具选中图片,执行对齐命令。

操作完
成后将该图层锁定。

图未对齐之前的图片
顶部对齐之后的效果
*对齐面板介绍:“对齐”面板中“对齐对象”选项组中包含6个对齐命令按钮:”“水平左对齐”、“水平居中对齐”、“水平右对齐”、“垂直顶对齐”、“垂直居中对齐”、“垂直底对齐”。

选取要对齐的对象,单击“对齐”面板中“对齐对象”选项组的对齐命令按钮,所有选取的对象互相对齐。

注意:运用移动工具拖动图片过程中,两张图片边界恰好重合时,会显示一条绿色线,这样方便知道图片的重叠情况。

5、用直线工具在图片之间画一条直线,作为图片之间的分界线
(1)新建一个图层,在新建图层中单击直线工具,按住shift键,用直线工具在两幅图片中间画一条直线。

注意:使用直线工具时,按住shift键,可以得到一条水平、垂直或45°的直线。

(2)更改线条宽度和颜色:
用选择工具选中画好的线条,在属性栏中选择“描边”的下拉列表中选择2pt 或0.5mm(更改描边单位为mm的方法:单击编辑——首选项——单位——描
边——mm)。

左下方工具栏中选择“描边工具”,用“吸管工具”在右侧色板上吸取白色。

这样画好的直线就在图片间形成一条白色分割线。

将此图层命名为边界线,并将此图层锁定。

注意:“填色和描边”工具下方有三个选项,分别为颜色、渐变和无。

在对线段填色过程中“填色”要选择无,而将描边填充颜色。

6、在图片中输入ABCD等字符
(1)新建一个图层,点击文字工具,输入A,退回到选择工具,将字母“A”选中,在选项栏中“字符”选项中调整字符格式,如。

(2)完成一个字符后,按住Alt键,用选择工具拖动字符就可以进行复制,然后用文字工具将字母“A”改成“B、C、D”等字符即可,字符格式不变。

(3)用选择工具将写好的字符拖放到合适的位置,并对齐即可。

(4)将此图层命名为字符,并将其锁定。

注意:文章中所有的图标尽量用相同字体。

*Illustrator CS5中的格式刷功能:
如果标记的ABCD等字符格式等完全不同,需要调成相同的,需要先选中所有要更改的字符,单击吸管工具,在正确格式的字符上吸取即可。

7、重画标尺
新建一个图层,用放大工具将标尺部位放大,单击直线工具,按下shift 键,按照标尺长度画一条完全等长的水平直线,在标尺上方输入标尺长度,并将其移动到合适的位置。

用Photoshop CS5软件打开被链接的图片,在图片中将标尺删除,并且保存此文件。

此时Illustrator CS5中就会跳出一个对话框,
单击“是”即可,此时原本在Photoshop中画的矩形框就会消失,只留下Illustrator 中新画的标尺。

这也是在操作过程中将Photoshop中修改的文件与Illustrator链接的最大益处。

将该图层命名为“标尺”,并锁定。

8、更改画板大小
单击画板工具,图像上会出现一个画板的定界框,
用定界框外的控制点调整画板大小,
此时,如果有画在画板以外的直线,不用处理,只需在保存的时候保存画板即可。

9、保存文件
(1)保存AI格式的文件
执行“文件——存储为”命令,在“存储为”对话框选择AI格式文件,单击“保存”即可。

(2)导出Tiff格式的文件
执行“文件——导出”命令,此时弹出“导出”对话框,
在保存类型下拉列表框中选择Tiff格式,(此时勾中下方使用画板)——保存,此时弹出“Tiff选项”对话框。

在颜色模式(处理和保存的时候保存RGB格式。

如果需要时可以改成CMYK
等)——选择分辨率,一般电镜照片用400dpi即可。

LZW选中,嵌入ICC配置文件不选。

确定即可。

提示:LZW是一种无损压缩技术,它能被TIFF、PDF、GIF、PostScript语言文件格式所支持,在压缩包含大面积单色图像时最为有用。

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