生物过程—新型假单胞菌对羟基苯乙腈水解酶及其性质研究
对羟基苯乙腈的新合成方法研究
d r a t i o n r e a c t i o n u s i n g B u 2 S n O a s t h e c a t a l y s t . Th e i n f l u e n c e s o f t h e q u a n t i t y o f Bu 2 S n O, t h e r e a c t i o n
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嘉 兴 学 院学 报 J o u r n a l o f J i a x i n g U n i v e r s i t y
Байду номын сангаас
第2 V 5 卷第3 期2 0 1 3 年5 月 o1 .2 5 No.3 2 01 3. 5
1 0 . 3 9 6 9 / i . i s s n . 1 0 0 8 —6 7 8 1 . 2 0 1 3 . 0 3 . 0 1 5
Ab s t r a c t :4一 hy dr ox yb e nz yl c y a ni de wa s s y nt he s i z e d f r o m 4一 hy d r o xyb e n z e ne a c et am i de i n t o l u e ne b y de h y
ma s s . Un d e r t h e o p t i mu m c o n d i t i o n s ,t h e y i e l d o f e 4一 h y d r o x y b e n z y l c y a n i d e wa s 9 5 . 3 .I n a d d i t i o n ,t h e p r o d u c t wa s c h a r a c t e r i z e d b y me l t i n g p o i n t , I R a n d H NM R s p e c t r o me t r y . Ke y wo r d s :4 一h y d r o x y b e n z e n e a c e t a mi d e ;Bu z S n O;4 一h y d r o x y b e n z y 1 c y a n i d e ;d e h y d r a t i o n
耐逆的腈水解酶等化工酶在芽孢表面固定化并优化其连接肽提高固定化效果
摘要腈水解酶作为一种重要的工业酶能够直接将有毒腈化物转化为相应的无毒酸和氨,应用广泛。
腈水解酶介导的生物催化制备某些羧酸化合物已经代替了传统的化学合成法,其反应条件温和,环境友好,选择性高等优点,引起研究者密切关注,因此筛选获得更多具有优良性质的腈水解酶具有很大的意义。
近年,枯草杆菌孢子展示技术作为一种新型的蛋白固定化方式引起广泛关注,由于枯草杆菌芽孢具有高稳定性和抗逆性,使得芽孢便成为了一个优秀的固定化载体在其表面展示外源蛋白。
目前有关利用芽孢展示技术进行耐逆化工酶酶的固定化报道较少,本文首次克隆表达鉴定了来自Thermotoga maritima MSB8的腈水解酶并展示在芽孢表面,然后对连接孢子表面衣壳蛋白与腈水解酶的连接肽进行了初步优化。
本研究中,首次从Thermotoga maritima MSB8基因组扩增到腈水解酶基因,并连接到原核表达载体PET-28a上,构建表达质粒PET-28a-nit,然后转化入大肠杆菌BL21,IPTG诱导表达后经SDS-PAGE鉴定,分子量在30kDa 左右,与预测一致。
对Thermotoga maritima MSB8腈水解酶的酶学性质进行了研究,发现以3-氰基吡啶作为反应底物时,该腈水解酶的最适反应温度和pH分别为45℃和7.5。
热耐受性试验显示在75℃环境下处理0.5h能够保留将近50% 的酶活,酸碱耐受性试验显示该腈水解酶对碱性反应条件的比较敏感。
Mn2+,Zn2+和Cu2+能显著抑制酶活,Mg2+和Fe2+.能够稍微促进酶活,其它的一些金属离子和金属离子螯合剂EDTA对酶活没有显著影响。
还原剂二硫苏糖醇DTT能够一定程度促进酶活,其它一些还原剂、表面活性剂、蛋白酶抑制剂和有机溶剂都对该腈水解酶活性产生了不同程度的抑制作用。
该腈水解酶的动力学常数Vm和Km值分别为3.12 μmol/min/mg和7.63mM,催化常数为kcat/Km为0.44 /mM/s,底物谱研究表明该腈水解酶对脂肪族双腈具有明显的特异性。
腈水解酶催化腈水解的研究进展_刘颖
腈水解酶催化腈水解的研究进展刘颖,苏昕*1(沈阳药科大学 生命科学与生物制药学院,沈阳 110016)摘要:腈水解酶催化具有毒性、致畸性、致癌性的腈水解合成羧酸因其反应条件温和、成本低、环境污染少及高选择性(立体、化学、区域)而备受学者和企业家的青睐,产物羧酸广泛用于精细化工、医药中间体、维生素前体等,具有高增值价值,因此腈水解酶具有良好的工业应用前景和巨大的经济价值。
目前对腈水解酶的来源、作用机制、筛选途径、酶结构、催化特性以及腈水解酶基因克隆、纯化、固定化、修饰等研究均有报道。
参考20余篇文献,本文综述腈水解酶催化腈类化合物水解的研究进展。
关键词:腈水解酶,腈化合物,生物催化Advances in nitrilase hydrolyzing nitrilesLIU Ying, SU Xin*(School of Life Science and Biopharmaceutics, Shenyang Pharmaceutical University, Shenyang 110016, China) Abstract: The nitrilases attract substantial attention from scholars and entrepreneurs because of their mild reaction conditions, low-cost, small environmental pollution and high selectivity (stereo-, chemical-, regional-) when hydrolyzing toxic, mutagenic and carcinogenic nitriles. The production of carboxylic acid with high added value is widely used in fine chemicals, pharmaceutical intermediates and vitamin premises. Therefore, the nitrilase has good application prospect and the great economic value. Articles about the sources of enzyme, mechanism, screening approach, structure, catalytic properties, nitrilase gene cloning, purification of nitrilase, immobilization, modification etc have been reported. Based on more than 20 domestic and foreign literatures, recent progress on nitrilases hydrolyzing nitriles was reviewed.Keywords: Nitrilase, Nitriles, Biocatalysis腈是一类含−CN基团的有机物,是合成酰胺、羧酸、酯等的起始原料。
腈水解酶基因bxn的结构与功能研究
生物技术通报・研究报告・ B IOTEC HNOLOGY BULL ETI N 2005年第2期腈水解酶基因bxn的结构与功能研究张锐1 王清路1 倪万潮2 郭三堆31(1中国农业科学院生物技术研究所,北京 100081;2江苏省农业科学院遗传生理研究所,南京 210014)摘 要: 前期研究发现腈水解酶基因bx n2RD127表达产物无功能,测序证明该基因结构中存在4处突变。
本文对4处突变逐点进行结构与功能回复突变研究,发现其中2处突变能使基因表达产物丧失功能,1处使基因表达产物活性降低,1处对基因表达产物活性基本无影响。
进一步将完全回复突变的bx n基因转化烟草,获得的转基因烟草具有抗溴苯腈除草剂特性,结果证明结构中的3处突变与活性中心功能有关。
关键词: 溴苯腈除草剂 腈水解酶基因 转基因烟草Study on the Construction and Function R elationof Nitrilase G ene bxnZhang Rui1 Wang Qinglu1 Ni Wanchao2 Guo Sandui13(1I nstit ute of B iotechnology,Chinese A cadem y of A gricult ural Sciences,Bei j i ng 100081;2I nstit ute of A grobiological Genetics and Physiolog y,J iangsu A cadem y of A g ricult ural S ciences,N anj ing 210014)Abstract: Prophase research of bx n2R D127gene indicated its expressing product had no nitrilase activity.Se2 quencing data showed there were4sites of mutants in it.In this paper,we studied the four mutants site by site,two of them made the nitrilase unf unctionally,one made the nitrilase activity decreased,the other had no influence on the activity.Then,the completely recruited mutation bxn gene was expressed ulteriorly in transgenic tobacco plants which could resistant to the brom bx n nil herbicide.Those results attested three mutants of the construction have re2 lation to the enzyme activity domains.K ey words: Brom bx n nil herbicide Nitrilase gene Transgenic tobacco杂草和农作物竞争水分、养料及光照,影响农作物的产量和品质。
对羟基苯甲酸法合成对羟基苯甲腈及产物分析
广西科学院学报2010263:228229JournalofGuangxiAcademyofSciencesVol.26No.3August2010收稿日期:2010-06-28作者简介:郭一锋1985-男硕士研究生主要从事生态环境材料及其外加剂的合成研究。
对羟基苯甲酸法合成对羟基苯甲腈及产物分析SynthesisandIRAnalysisof4-Hydroxybenzonitrile郭一锋1陈平12GUOYi-feng1CHENPing121.桂林理工大学材料学院广西桂林5410042.有色金属及材料加工教育部重点实验室广西桂林5410041.FacultyofMaterialScienceEngineeringGuilinUniversityofTechnologyGuilinGua ngxi541004China2.KeyLaboratoryofNewProcessingTechnologyforNonferrousMetalsand MaterialsConstitutedbyMinistryofEducationGuilinUniversityofTechnologyGuilinGuangx i541004China摘要:以对羟基苯甲酸和尿素为基本原料在脱水剂和催化剂共同作用下直接酰胺化一锅法合成对羟基苯甲腈并采用熔点测定和红外分析方法判定产物结构。
关键词:对羟基苯甲腈酰胺反应一锅法中图法分类号:O625.31文献标识码:A文章编号:1002-7378201003-0228-02Abstract:4-Hydroxybenzonitrilewhichisoneimportantfinec hemicalintermediateswassynthesizedby4-hydroxybenzonicacidandureathroughacylatingre actionanddehydratingreaction.Thestructureof4-hydroxybenzonitrilewascharacterizedbyFT-IRandmelt-pointanalysis.Keywords:4-Hydroxybenzonitrileacylatingreactionone-PotSy nthesis对羟基苯甲腈p-HBN又名4-氰基苯酚或对氰基苯酚是合成高效杀虫剂和除草剂的重要中间体在液晶材料、缓蚀剂及香料中也有广泛应用1。
腈水合酶研究进展
腈水合酶研究进展摘要从腈水合酶的结构、分布、酶学性质及其基因克隆和生产中的利用形式等方面简要阐述了腈水合酶的研究进展。
关键词腈水合酶;酶学性质;基因克隆腈水合酶(Nitrile hydratase,EC4.2.1.84)是一类可以催化腈类物质转化成相应酰胺类物质的酶[1],其最初是由日本学者Asano发现并命名的。
微生物的腈水合酶作为生物催化剂应用在有机物合成的工艺上具有巨大的潜力,它的反应条件温和、产率高、副产物少、产物的自聚损失少,具有区域选择性、立体选择性和光激活性,可广泛应用于氨基酸、酰胺、羧酸及其衍生物的合成。
更重要的是,它环境污染小、成本低、符合绿色化工发展理念,有着化学方法无法替代的优越性,从而促进了精细化工产品、可降解塑料和手性药物以及维生素等方面的研制和开发。
因此,20多年来一直受国内外研究者的广泛关注。
1腈水合酶的产生菌及其结构无论是腈类物质还是酰胺类物质对人体来说都是极其有毒的[2],然而有些微生物却能利用它们作为自身生长的碳源和氮源。
原因就在于这些微生物能够自身合成降解腈类物质的酶—腈水合酶(NHase),腈水合酶是某些微生物在进行肟或尿代谢过程中所产生的一种蛋白[3]。
目前已知可产腈水合酶的菌株有红球菌、诺卡氏菌、假诺卡氏菌、棒状杆菌、假单胞菌、产碱杆菌、短杆菌等。
可见产腈水合酶的菌的分布相当广泛[4]。
不同菌株的腈水合酶在结构上存在着一定的差异,但是也存在来自不同菌株的腈水合酶在结构上的相同。
尽管不同菌株的腈水合酶在氨基酸序列上存在差异,但是它们仍然存在着一个共同点,那就是在酶的活性部位都含有螯合的金属离子作为辅助因子。
根据所含辅助因子的不同,腈水合酶可分为2类,一类为高分子量腈水合酶(H-NHase),其所含金属离子为钴;另一类为低分子量腈水合酶(L-NHase),其所含金属离子为铁。
尽管铁型和钴型腈水合酶在氨基酸序列上具有极大的同源性,但这2种酶在生物转化活性和底物特异性上还是有着很大的差异。
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究【摘要】本研究旨在探究一株具有较强降解能力的对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长和降解特性。
首先分离鉴定出目标菌株,通过实验验证其生长特性,结果显示其在特定条件下具有较好的生长能力。
进一步研究表明,该菌株对对羟基苯甲酸甲酯具有较高的降解效率,同时揭示了降解代谢途径和影响因素。
最终结论显示,该菌株具有潜在的应用前景,可望在环境治理中发挥重要作用,提出了未来研究的意义和建议。
本研究为对羟基苯甲酸甲酯降解菌的研究提供了重要参考。
【关键词】对羟基苯甲酸甲酯降解菌、生长特性、降解特性、降解代谢途径、影响因素分析、降解能力、应用前景、研究意义、建议。
1. 引言1.1 研究背景一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究引言对羟基苯甲酸甲酯是一种广泛应用于化工、医药和农药生产中的有机化合物,但其在生产和使用过程中容易对环境造成污染。
目前,关于对羟基苯甲酸甲酯的降解研究主要集中在物理化学方法,如光解、化学氧化等,但这些方法存在着效率低、成本高以及产生二次污染等问题。
寻找一种能够高效降解对羟基苯甲酸甲酯的生物技术显得尤为重要。
微生物降解对羟基苯甲酸甲酯具有很大的潜力,因为微生物在自然界中广泛存在且具有较强的降解能力。
通过研究一株特定的对羟基苯甲酸甲酯降解菌,可以深入了解其生长及降解特性,为开发高效降解技术提供重要参考。
本研究旨在分离并鉴定对羟基苯甲酸甲酯降解菌,探究其生长特性、降解特性以及降解代谢途径,为环境治理和资源利用提供新思路和方法。
1.2 研究目的本研究旨在探究一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性,具体目的如下:1. 确定菌株的分离和鉴定结果,明确其系统学位置及生物学特征,为后续研究奠定基础。
2. 分析菌株的生长特性,包括生长速率、最适生长条件等,探究其在不同环境下的适应能力。
3. 研究对羟基苯甲酸甲酯的降解特性,了解菌株对有机污染物的降解能力及机理。
4. 探讨降解代谢途径,揭示菌株在降解过程中的代谢途径及关键酶系统。
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
对羟基苯甲酸甲酯(MMP)是一种广泛使用的有机污染物。
许多微生物能够通过菌株之间的互补作用来利用MMP,然而,在MMP为唯一碳源的条件下,如何选择快速生长并具有相应降解能力的菌株是十分重要的。
本文旨在通过研究一株对MMP具有高生长和降解能力的细菌来深入了解MMP降解生物学特性。
实验采集了从市区河流中采集的不同细菌菌株样品。
通过在含有MMP的胆汁琼脂和液体培养基中比较不同细菌的生长速度和MMP去除效率。
结果表明,菌株B1能够在15小时内以优异的速度生长,并降解掉90%的MMP。
转化产物经过质谱分析后表明,MMP在B1细胞中的降解途径是法洛三环氧化酶的介导下,先将MMP转化为对羟基苯乙酸甲酯(MHPM),然后转化为苯酚并且最终被降解为原始物质。
通过对B1的基因组进行测序和比对,发现B1为一株属于铜绿假单胞菌属(Pseudomonas aeruginosa)的细菌,特征为具有高效合成酶和氧化酶。
实验进一步探究了不同pH和温度对B1的生长和MMP降解效率的影响。
在较低的温度下(4℃和15℃),B1的生长显著减缓,但在较高温度下(30℃和37℃),B1的生长和MMP降解能力均得到了显著提高。
在不同pH值下,B1是在pH 7.5的条件下表现出最优的生长速度和MMP降解效率。
综上所述,本研究成功地分离的B1是一株对MMP具有较强降解能力的细菌,能够在相对宽广的温度和pH范围内高效生长及降解MMP。
这些结果对于未来合理选择最合适的细菌降解MMP有重大的指导意义。
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
Studyonthegrowthanddegradationcharacteristics
ofastrainofmethylparabendegradingbacteria
LiYue1 LiHaipБайду номын сангаас2 YangZhaoguang2
1.CollegeofChemistryandChemicalEngineering,CentralSouthUniversity HuNanChangsha 410083;
科技风 2020年 4月
机械化工 DOI:10.19392/j.cnki.16717341.202010158
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
李 跃1 李海普2 杨兆光2
1.中南大学化学化工学院 湖南长沙 410083;2.环境与水资源研究中心 湖南长沙 410083
摘 要:以具有内分泌干扰性的对羟基苯甲酸甲酯(MeP)为目标污染物,研究细菌 1a51的生长曲线以及对水中 MeP的降解。 结果表明,菌株在 R2A液体培养基中培养 16小时后进入对数生长期,60小时后进入稳定期,随后进入凋亡期;菌株的最适降解 pH 为 7,最适降解温度为 35℃,随着目标污染物 MeP浓度的提高,一定时间内的降解率逐渐降低后达到稳定,不同的金属离子对降解 影响不同,Cd2+对菌株降解 MeP的抑制效果最明显,Zn2+对降解几乎没影响,本研究结果可为防腐剂的微生物降解提供一定的 依据。
2.CenterforEnvironmentandWaterResources,CentralSouthUniversity HuNanChangsha 410083
Abstract:Thegrowthcurveofbacteria1a51andthedegradationofmethylparaben(MeP)whichpossessedendocrinedisruptioninwater werestudied.TheresultsshowedthatthestrainenteredthelogarithmicgrowthstageandstablestageafterbeingculturedinR2Aliquidme dium for16hand60h,thenenteredthephaseofapoptosis.TheoptimalpH andtemperatureofMePbeingdegradedbystrain1a51were7 and35℃,respectively.WiththeconcentrationofMePincreasing,thedegradationrateofMePdecreasedandthenachievedstable.Theinflu enceofdifferentmetalionsonthedegradationofMePwasdifferent.Cd2+hadasignificantinhibitioneffectwhileZn2+hadlittleeffect.There searchresultscouldprovidebasisforthemicrobialdegradationofpreservatives.
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究对羟基苯甲酸甲酯(MEHP)是一种常见的环境污染物,具有较强的毒性和生物累积性。
研究MEHP的降解菌株及其生长和降解特性对于环境保护和生态修复具有重要意义。
本研究从环境样品中筛选获得一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌株,并鉴定为假单胞菌属(Pseudomonas)的一株菌株。
通过形态学观察、生理生化试验和16S rDNA序列分析等方法,确认该菌株的物种为假单胞菌树脂降解菌(Pseudomonas resinovorans)。
随后,以MEHP为唯一碳源,研究了该菌株的生长特性。
结果显示,该菌株能够在微量的MEHP存在下生长,最适生长温度为30℃,最适生长pH为7.0。
菌株在MEHP浓度为50-200mg/L时能够保持较好的生长,但当浓度超过200mg/L时,生长受到抑制。
菌株的生长速率(μ)为0.22h-1,最大生长速率(μmax)为0.34h-1,潜伏期(λ)为4.77 h。
进一步,研究了该菌株对MEHP的降解特性。
结果显示,该菌株能够完全降解100mg/L 的MEHP,降解率达到100%。
菌株对MEHP的降解过程符合一级动力学模型,降解半衰期为18.9 h。
这说明该菌株具有较强的降解能力。
酶促反应实验结果显示,该菌株通过产生酶类来降解MEHP,其中甲酰乙酸酯酶活性最高。
综合上述结果,可以得出结论:一株假单胞菌属的树脂降解菌株具有较好的生长和降解特性,能够在一定条件下高效降解对羟基苯甲酸甲酯。
这对于开发高效的生物降解剂,减少和修复MEHP污染具有重要的实际意义。
进一步的研究还需要对该菌株的代谢途径、代谢产物和降解机制进行深入的探究。
对羟基联苯腈的合成改进研究
作者: 严永新 吴国志 刘天宝 任斐然 汪新 何兆帅
作者机构: 池州学院化学材料与工程实验中心,安徽池州247000
出版物刊名: 池州学院学报
页码: 64-65页
年卷期: 2013年 第6期
主题词: 对羟基联苯腈 液晶 2,6-二叔丁基苯酚 二步合成
摘要:以对氯苯腈和2,6-二叔丁基苯酚为原料,通过两步法合成液晶材料中间体对羟基联苯腈(P)。
中间体M及目标产物P的结构用FTIR、^1H NMR进行了表征。
此合成方法步骤少,操作简便,总收率较高,可达到64.1%。
实验结果表明。
中间体M制备的最佳温度为150℃.用环丁砜作溶剂优于DMSO。
腈水解酶在羧酸合成中的研究进展
早在20世纪30年代,就有人提出用某些植物 组织能将腈化物转化成酸的假说来解释一些化学
收稿日期:2008-05-26 基金项目:国家自然科学基金资助项目(20506037,20672037);华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室开放课题资助项目(2008004) 作者简介:何玉财(1979一),男,辽宁开原人,博士,研究方向:生物催化与生物加工;许建和(联系人),教授,博士生导师,E-mail:jianhexu@∞-
Aci,地£06口c把,AK 226
alkyInitriles,arylnitriles. dinitriles,hetemcyclic mononitriles
Agrobacterium sP.DSM 6336 Alcaligenes sp.ECU0401
heterocyelic nitriles
Comamonas testosteroni
Cryptococcus∥倒淞UFMG—Y61
alkylnitriles isobutyronitrile
Exophiala oligosperma R1 Fusarium solani 01 Gordona terrae FERM BP-4535
phenylacetonitrile 3-Cyanopyrid合成中的重要中间体,它可以通过 氰基的化学水解来获得,通常需要强酸、强碱和高 温回流等苛刻条件,而且常伴随有大量盐类形成, 给产品的分离纯化带来困难,也造成一定程度的环 境污染¨]。用腈水解酶实现氰基的水解,其优势不 仅在于反应条件温和、污染少和处理容易的环境友
好过程,而且更重要的是可以实现一般化学转化所 不具有的优良的化学、区域和立体选择性。
第7卷第1期 2009年1月
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
一株对羟基苯甲酸甲酯降解菌的生长及降解特性研究
羟基苯甲酸甲酯是一种常见的有机污染物,对环境和人体健康造成威胁。
研究对羟基苯甲酸甲酯具有高效分解能力的菌株的生长和降解特性,对于治理相关废水和土壤具有重要意义。
本研究选择了一株对羟基苯甲酸甲酯具有强降解能力的菌株,命名为HX-1。
通过常规培养基平板筛选的方法,从一个污泥样品中成功分离出HX-1。
HX-1菌落呈洋红色,菌体为短杆状,无菌条。
形态学特征与常见的革兰氏阴性菌相似。
为了研究HX-1对羟基苯甲酸甲酯的降解能力,我们采用了摇瓶培养法。
将HX-1菌种接入LB培养基中,在37℃下恒温摇床培养24小时。
接种时使用的菌液浓度为OD600=0.1。
之后将生长良好的菌液移植到含有羟基苯甲酸甲酯的最小盐基培养基中,初始浓度为50 mg/L。
培养条件为37℃、150 rpm,培养了20天。
通过逐日测定培养液中对羟基苯甲酸甲酯的浓度变化,我们发现,在前6天,羟基苯甲酸甲酯浓度迅速下降,且呈线性降低。
达到降解峰值后,降解速度略有减缓,但仍保持一定的降解能力。
无论是生长曲线还是降解曲线,均呈现典型的S形曲线。
我们对HX-1菌株进行了降解产物的分析。
通过高效液相色谱法和质谱法检测,发现HX-1菌株在降解羟基苯甲酸甲酯时,产生了对羟基苯甲酸的过渡产物。
这个过渡产物可能是通过苯甲酸酯酶将羟基苯甲酸甲酯水解生成的,随后被苯甲酸羧化酶催化生成对羟基苯甲酸。
本研究对HX-1菌株的生长和降解特性进行了详细研究,为进一步应用于废水和土壤治理提供了理论基础和实验依据。
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Bioprocess 生物过程, 2012, 2, 70-74doi:10.4236/bp.2012.22012 Published OnlineJune 2012 (/journal/bp)A New 4-Hydroxyphenylcyanide Nitrilases from PseudomonasSp. and Its Catalytic Properties*Mingle Cao1, Xinglin Jiang2, Haibo Zhang2#, Mo Xian2, Xin Xu2, Wei Liu21State Key Laboratory of Microbial Technology, Shandong University, Ji’nan2Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology, Chinese Academy of Sciences, QingdaoEmail: #zhanghb@Received: May 13th, 2012; revised: May 27th, 2012; accepted: Jun. 4th, 2012Abstract: Nitrilases can hydrolyze nitrile efficiently under mild conditions. The enzymatic methods have the advan-tages of less pollution, low cost compared with the chemical methods. Nitrilases are potentially applied in agriculture, industry, environment, and biomedicine. In this study, Berthelot method and high performance liquid chromatography were used to screen new stains for nitrilases. A nitrilase with high substrate specificity for 4-hydroxyphenylcyanide was found from Pseudomonas sp. 6-1. The stain produced 28.47 U/ml nitrilase after optimization of the culture conditions. The enzyme remained 80% activities at pH 6.6 to pH 7.6, temperature 35˚C to 45˚C, and it was stable after 18 h incuba-tion. The stain can be potentially used in biosynthesis 4-Hydroxyphenylacetic acid using 4-hydroxyphenylcyanide as substrate.Keywords: 4-Hydroxyphenylcyanide; 4-Hydroxyphenylacetic Acid; Nitrilase; Biocatalysis新型假单胞菌对羟基苯乙腈水解酶及其性质研究*曹明乐1,姜兴林2,张海波2#,咸漠2,徐鑫2,刘炜21山东大学微生物技术国家重点实验室,济南2中国科学院青岛生物能源与过程研究所,青岛Email: #zhanghb@收稿日期:2012年5月13日;修回日期:2012年5月27日;录用日期:2012年6月4日摘要:腈水解酶催化的腈水解具有反应高效、条件温和、环境污染小和成本低等优点,在有机合成、材料合成、医药、食品、农业、畜牧业及环境等污染方面有着重要的应用前景。
本研究利用初步活化和分步胁迫富集,通过Berthelot法高通量筛选与高压液相精细筛选获得一株底物对4-羟基苯乙腈具有较好的催化活性的菌株;经过培养基初步优化,产酶量达到28.47 U/ml;铜离子对该酶具有较强的抑制作用,酶学性质研究表明该菌株能够在pH 6.2~pH 7.3之间酶活性能够保持在最高酶活性的80%以上,在35℃~45℃范围内催化活性大于最大酶活性的80%,反应18 h后离心菌体二次催化几乎不丧失活性;该菌株在开发对羟基苯乙腈合成对羟基苯乙酸具有较高的开发价值。
关键词:对羟基苯乙腈;对羟基苯乙酸;腈水解酶;生物催化1. 引言腈水解酶包括腈水解酶(Nitrilase)和腈水合酶(Nitrile hydratase),前者可以催化腈直接水解生成羧酸及氨;而后者可以催化腈水解生成酰胺,酰胺在酰胺酶(Amidase)作用下进一步转化成羧酸及氨。
传统化学方法利用腈类合成相应羧酸类需要在强酸性、高温环境中进行,而且合成过程中会有大量的副产物产生,*基金项目:Y2008B43,Y112131105。
#通讯作者。
合成效率低下,分离产物困难。
利用腈水解酶(包括菌体及纯化后蛋白质)催化腈化物的水解具有高选择性、高效性、条件温和、环境污染小、成本低、产物光学纯度高等优点,与传统的化学方法相比,有着无可比拟的优越性[1-3]。
利用腈水解酶降解腈类化合物,产物用于合成手性的羧酸和酰胺等医药中间体,此外腈水解酶及其产生菌还可用于电镀厂等腈污染废水的生物治理。
对羟基苯乙酸是一种重要的药物、材料中间体,可应用于医药、农药以及液晶材料等方面。
目前,对羟基苯乙酸的合成均采用化学方法。
腈水解酶的研究比较多,来源于Pseudomonas chlororaphis B23及Rhodococcus rhodochrous J1的腈水解酶已经应用于工业生产,使得年产丙烯酰胺达30,000吨以上[4-7],此外在几个真菌菌属中,也发现腈类降解活性的报道[8-11]。
当前,采用腈水解酶催化对羟基苯乙腈合成对羟基苯乙酸已有报道,主要催化菌株有Rhodococcus butanica及Alcaligenes faecalis等[12-14]。
在本研究中,利用β-羟基丙腈作为筛选压力和筛选氮源,通过对样品进行两步富集,利用Berthelot 法初步测定菌株的腈水解能力,结合高压液相进行精确测定确定其腈水解酶活性,筛选获得了一株对羟基苯乙腈转化效果较好的菌株并对该菌株进行了产酶优化和酶学性质测定。
2. 材料与方法2.1. 样品采集样品主要采集于青岛周围的污水处理厂(麦岛、李村、团岛),石老人海水浴场,中国科学院青岛生物能源与过程研究所周围土壤及水体,中国海洋大学崂山校区水体。
2.2. 菌株筛选选择性筛选培养基(用于筛选分离菌株):葡萄糖10 g/L,K2HPO4 1.5 g/L,KH2PO4 2 g/L,MgSO4·7H2O 0.2 g/L,NaCl 1 g/L,FeSO4·7H2O 0.002 g/L,CaCl2 0.001 g/L,三羟基丙腈1 g/L,pH 7.0~7.2。
基础产酶培养基:葡萄糖10 g/L,蛋白胨10 g/L,KH2PO4 2 g/L,NaCl 1 g/L,MgSO4 0.2 g/L,pH 7.0~7.2。
样品富集方法:取土样按照1 g样品加10 mL蒸馏水溶解,将水样置于室温24小时活化后向样品中添加1 mL的选择性筛选培养基;继续富集培养48小时后,取1 mL经富集的样品接种到装有50 mL选择性筛选液体培养基;富集培养12小时后用于分离。
取经过两次富集培养的样品100 μL富集培养液涂布于选择性筛选培养基固体平板,在37℃培养48小时获得单菌落,测定其腈水解酶活性。
获得菌株经Berthelot法高通量初筛,根据转化产生的3NH 的量初步测定菌株的转化活性,进而通过高压液相(HPLC)分析获得具有高对羟基苯乙醇转化活性的菌株[15,16]。
2.3. 16s rDNA鉴定根据当前国际上通用的重要菌株鉴定方法16s rDNA序列分析初步鉴定。
菌体DNA提取采用OMEGA细菌基因组DNA提取试剂盒,具体操作按照试剂盒说明书。
PCR采用细菌通用引物进行扩增测定PCR扩增反应条件为:94℃,5 min;94℃,1 min;55℃,1 min;72℃,5 min;30个循环;72℃,10 min。
产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测,切胶回收目的片段进行DNA测序。
测序结果经NCBI数据库Blast比对,对菌株进行初步鉴定。
2.4. 产酶条件优化本研究采用1.2中提到的基础产酶培养基作为出发培养基,对常用碳源:葡萄糖、淀粉、木糖、乳糖、糊精、麦芽糖、蔗糖、壳聚糖,以及常用氮源:硫酸铵、硝酸铵、牛肉粉、尿素、蛋白胨、酵母浸粉对该菌株产酶的影响进行评估。
酶活性测定采用Berthelot 法进行测定腈水解酶转化对羟基苯乙腈的转化率,酶活反应体系含有1 mM的对羟基苯乙腈底物和10 mM 的磷酸二氢钠–磷酸氢二钠(pH 7.0)缓冲体系。
2.5. 腈水解酶催化的影响因素反应体系:反应体系的底物浓度为10 mM的对羟基苯乙腈,缓冲体系为10 mM的磷酸氢二钠–磷酸二氢钠缓冲体系。
经活化接种于基础产酶培养基的菌体经过夜培养后12,000转/分钟离心10 min,用上述磷酸钠缓冲液洗涤2次后用于催化转化。
酶活单位定义为:常温下,1 min内转化1 μM底物所需要的酶量。
金属离子对腈水解酶活性的影响:在上述反应体系中添加1 mM的Mg2+、Zn2+、Fe3+、Cu2+、Mn2+、Co2+、Ga2+,分别测定添加后与对照的酶活性对比,比较其变化。
pH对腈水解酶催化水解的影响:利用10 mM不同pH值的磷酸氢二钠–磷酸二氢钠缓冲体系分别测定腈水解酶在pH值为5.8,6.2,6.6,7.0和7.4时腈水解酶的催化能力,取最大酶活性点做为对照。
温度对腈水解酶催化活性的影响:取上述反应体系,测定其在15℃~45℃之间的腈水解酶活性,间隔温度5℃。
3. 结果与讨论3.1. 菌株筛选与鉴定经过初步活化和两步富集,两步筛选获得菌株6-1对4-羟基苯乙腈具有较好的催化活性。
在筛选过程中添加活化步骤,并通过低浓度到高浓度的筛选剂的胁迫,能够有效的提高样品中高产腈水解酶的菌株的优势,使得最后涂布平板菌落较单一,提高了筛选腈水解酶的效率。
菌株6-1的16S rDNA经华大基因测序,序列共1500bp,比对结果与GQ246949.1(假单胞菌)、AM411070.1(假单胞菌)、AM410621.1(假单胞菌)等具有99%~100%的相似性,结合形态学观察,该菌属于假单胞菌属,与恶臭假单胞菌相近,定名为Pseudomonas sp.6-1。