《蛋白质合成后加工》PPT课件

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5.水解断链
一般真核细胞中一个基因对应一个mRNA,一个mRNA 对应一条多肽链,但也有少数的情况,即一种三思而行 翻译后的多肽链经水解后产生几种不同的蛋白质或多肽。 例如哺乳动物的鸦片样促黑皮激素原初翻译产物为265 个氨基酸,它在脑下垂体前叶细胞中,POMC初切割成为 N-端片断和C端片段的β-促脂解激素。然后N端片段又 被切割成较小的N端片断和工9肽的促肾上腺皮质激素。 而在脑下垂体中叶细胞中,β-促脂解激素再次被切割 产生β-内啡肽;ACTH也被切割产生13肽的促黑激素 (α-melanotropin)。
切除 连接
图2-1 蛋白质自我剪接
1994年,Perler等将蛋白质自我剪接中被切除的肽段命名 为蛋白内含肽(intein),也称蛋白内含子或内蛋白子,将位 于蛋白内含肽两侧、切除部位再连接形成的产生蛋白称为蛋白 外显肽(e含肽的基因不是单独的开放阅读框,它插入在蛋白 外显肽的基因中,和内含子的区别在于它可以和蛋白外显肽的 基因一起表达,而不是在mRNA阶段被切除。
从核糖体上释放出来的多肽链,按照一级结构中氨基酸 侧链的性质,自行卷曲,形成一定空间结构,过去一直认为, 蛋白质空间结构的形成是靠其一级结构决定,不需要另外的 信息。近些年来发现许多细胞内蛋白质正确装配都需要一类 称做“分了伴侣”的蛋白质帮助才能完成,这一概念的提出 并未否定“氨基酸顺序决定蛋白空间结构”这一原则。
第二节 新合成蛋白的定位及折叠
细胞内合成的蛋白质,有些被简单地传送到细胞质,有 些被转运到各种细胞器,有些被分泌到细胞外,有些是要插 入到细胞膜或其它生物膜。
那么,在核糖体上新合成的蛋白质是如何识别并达到它特 定的部位呢?
一、新合成蛋白的定位
1.分泌蛋白质 核糖体上合成的分泌蛋白位于真核细胞的粗面内质网膜上
磷酸化多发生在多肽链丝氨酸、苏氨酸的羟基上,偶尔也 发生在酪氨酸残基上(磷酸化分子式如下图),这种磷酸化的 过程受细胞内一种蛋白激酶催化,磷酸化后的蛋白质可以增加 或降低它们的活性,例如:促进糖原分解的磷酸化酶,无活性 的磷酸化酶b经磷酸化以后,变居有活性的磷酸化酶a。而有活 性的糖原合成酶I经磷酸化以后变成无活性的糖原合成酶D,共 同调节糖元的合成与分介。
这样,肽链就在内质网内不断地延长,并且信号肽将被 肽酶水解除去。然后,多肽链被传递至高尔基体,生成分泌 泡,再分泌出细胞外。
还有一种分泌蛋白,合成后先到溶酶体,然后再分泌出 去发挥作用,这类蛋白也需要信号肽。
2.膜蛋白 膜蛋白也是由附着在粗面内质网上的核糖体合成的。
膜蛋白的信号肽起着引导作用,其羧基端的疏水顺序使它 能附着于膜质结构的双脂层。 3.细胞器蛋白
4.亚基的聚合
有许多蛋白质是由二个以上亚基构成的,这就需这些 多肽链通过非共价键聚合成多聚体才能表现生物活性。例 如成人血红蛋白由两条α链,两条β链及四分子血红素所 组成,大致过程如下:α链在多聚核糖体合成后自行释下, 并与尚未从多聚核糖体上释下的β链相连,然后一并从多 聚核糖体上脱下来,变成αβ二聚体。此二聚体再与线粒 体内生成的两个血红素结合,最后形成一个由四条肽链和 四个血红素构成的有功能的血红蛋白分子。
在胞浆中合成的线粒体蛋白,要运输到线粒体的各个 部位,如外膜、膜间隙、内膜及基质。
这类蛋白质需要氨基端的延伸肽(extension peptide),延伸肽是疏水性的,线粒体上存在着识别它的 受体,可帮助线粒体蛋白的正确定位。
二、蛋白质的折叠
1.新生肽段折叠研究中的新观点 长期以来关于蛋白质折叠,形成了自组装的主导学说,因
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不论是原核还是真核生物,在细胞浆内合成的蛋白质需 定位于细胞特定的区域,有些蛋白质合成后要分泌到细胞外, 这些蛋白质叫做分泌蛋白。
在细菌细胞内起作用的蛋白质一般因靠扩散作用而分布 到它们的目的地。如内膜含有参与能量代谢和营养物质转运 的蛋白质;外膜含有促进离子和营养物质进入细胞的蛋白质; 在内膜与外膜之间的间隙称为周质,其中含有各种水解酶以 及营养物质结合蛋白。
6.蛋白质自我剪接 1990年,Hirata等首次报道一种新的蛋白质加工方式-蛋
白质自我剪接。他们发现,酿酒酵母基因TFP1表达成两种蛋白, 较大的(69×103)是液泡H+-ATPase的催化亚基,它来自 TFP1基因5`编码区和3`编码区,较小的(50×103)是由该基 因中央区编码。
他们证明,这两种蛋白是同一条多肽链经过自我剪接产生 的,较小的蛋白是被切割下来的部分,较大的蛋白由切除较小 蛋白后再连接而成(见图2-1)。
(2)糖基化 糖蛋白的糖链是蛋白质合成之后,在通过高尔基体时,经
过糖化而形成的。质膜蛋白质和许多分泌性蛋白质都具有糖链, 这些寡糖链结合在丝氨酸或苏氨酸的羟基上,例如红细胞膜上 的ABO血型决定簇。也可以与天门冬酰胺连接。这些寡糖链是在 内质网或高尔基氏体中加入的(见下图)。
(3)羟基化 胶原蛋白前α链上的脯氨酸和赖氨酸残基在内质网中受羟
某些蛋白氨基端有一段15~30个氨基酸残基的顺序,这段顺 序称信号肽,与蛋白质传送到特定的细胞器、膜,或分泌出细胞 外有关。信号肽在运送过程中通常由专一的酶催化而水解除去。
2.氨基酸残基的修饰 (1)甲基化修饰
某些蛋白质中的赖氨酸残基需要甲基化,某些谷氨酸残基 的羧基也要甲基化,以除去负电荷。 (2)羧化修饰
80年代中期在胞浆中发现一种由小分子RNA和蛋白质共同组 成的复合物,它能特异地与信号肽识别而命名为信号肽识别颗粒。 它的作用是识别信号肽与核糖体结合并暂时阻断多肽链合成。内 质网外膜上有SRP受体,当SRP与受体结合后,信号肽就可插入内 质网内腔,被内质网内膜上的信号肽酶水解除去SRP与受体结合 后,信号肽就可插入内质网进入内腔,被内质网内腔上的信号肽 酶水解除去,而信号肽后序肽段也进入内质网内腔,并开始继续 合成多肽链,SRP对翻译阶段作用的重要生理意义在于:分泌蛋 白及早进入细胞的膜性细胞,能正确折叠、进行必要的后加工与 修饰并顺利分泌出细胞(见下图)。
化酶、分子氧和维生素C作用产生羟脯氨酸和羟赖氨酸,如果 此过程受障碍胶原纤维不能进行交联,极大地降低了它的张 力强度。 (4)二硫键的形成
真核细胞合成的某些蛋白质,往往能自发地折叠形成其 天然构像,分子内的半胱氨酸的巯基之间形成共价键-二硫 键。
二硫键在稳定蛋白质空间构型中起着重要作用。例如胰 岛素分子的成熟是借核糖体上释放的前胰岛素原经自发折叠、 形成二硫键,然后再切除C肽而形成的。
而是对这一理论的补充,分子伴侣这一类蛋白质能介导 其它蛋白质正确装配成有功能活性的空间结构,而它本身并 不参与最终装配产物的组成。目前认为“分子伴侣”蛋白有 两类,第一类是一些酶,例如蛋白质二硫键异构酶可以识别 和水解非正确配对的二硫键,使它们在正确的半胱氨酸残基 位置上重新形成二硫键,第二类是一些蛋白质分子,它们可 以和部分折叠或没有折叠的蛋白质分子结合,稳定它们的构 象,免遭其它酶的水解或都促进蛋白质折叠成正确的空间结 构。
真核生物细胞结构更为复杂,而且有多种不同的细胞器, 它们又具有各不相同的膜结构,因此合成好的蛋白质还要面 临跨越不同的膜而到达细胞器,有些蛋白质在翻译完成后还 要经过多种共价修饰,这个过程叫做翻译后处理。
第一节 蛋白质的分泌和加工修饰
一、蛋白质的分泌
1.细菌中蛋白质的越膜 细胞的内膜蛋白,外膜蛋白和周质蛋白是怎样越过内膜而到
或在原核细胞的细胞内膜上。 真核细胞合成的分泌蛋白最终将被转移至分泌小泡中。这
些分泌过程的化学基础是分泌蛋白的前体大都有“信号肽”。 信号肽位于成熟蛋白的氨基端,约15~30个氨基酸残基,
多数具有疏水侧链。
内质网表面的核糖体受体能识别80S核糖体,使80S核糖 体结合于内质网上。内质网表面的信号肽受体识别信号肽, 因而正在生长着的肽链就凭借信号肽的疏水性穿透膜,进入 内质网。
现以哺乳动物的胰岛素为例说明这种分泌过程。胰岛素由 51个氨基酸残基组成,但胰岛素mRNA的翻译产和在兔网织红细 胞无细胞翻译体系中为86个氨基酸残基,称为胰岛素原,在麦 胚无细胞翻译系统中为110个氨基酸残基组成的前胰岛素原, 后来证明,在前胰岛素原的N末端有一段富含疏水氨基酸的肽 段做为信号肽,使前胰岛素原能穿越内质网膜进入内质网内腔, 在内腔壁上信号肽被水解。所以在哺乳动物细胞内,当多肽链 合成完成时,前胰岛素原已成为胰岛素原。然后胰岛素原被运 到高尔基复合体,切去C肽成为成熟的胰岛素,最终排出胞外。 像真核细胞的前清蛋白,免疫球白轻链,催乳素等都有相似的 分必方式 。
其目的地的呢?绝大多数越膜蛋白的N端都具有大约15-30个以疏 水氨基酸为主的N端信号序列或称信号肽。信号肽的疏水段能形 成一段α螺旋结构。在信号序列之后的一段氨基酸残基也能形成 一段α螺旋,两段α螺旋以反平行方式组成一个发夹结构,很容 易进入内膜的脂双层结构,一旦分泌蛋白质的N端锚在膜内,后 续合成的其它肽段部分将顺利通过膜。疏水性信号肽对于新生肽 链跨膜及把它固定的膜上起一个拐棍作用。之后位于内膜外表面 的信号肽酶将信号肽序列切除。当蛋白质全部翻译出来后,羧端 穿过内膜,在周质中折叠成蛋白质的最终构象(见下图)。
二、蛋白质合成后的加工修饰
前体蛋白是没有活性的,常常要进行一系列翻译后加工,才 能成为有功能的成熟蛋白。而“分子伴侣”蛋白质合成后折叠成 正确空间结构中起重要作用,对于大多数蛋白质来说多肽链翻译 后还要进行下列不同方式的加工修饰才具有生理功能。 1.氨基端和羧基端的修饰及信号肽去除
在原核生物中几乎所有蛋白都是从N-甲酰蛋氨酸开始,真核 生物从蛋氨酸开始。甲酰基经酶水解而除去,蛋氨酸或者氨基端 的一些氨基酸残基常由氨肽酶催化而水解除去。因此,成熟的蛋 白质分子的N-端没有甲酰基,或没有蛋氨酸。同时,某些蛋白质 分子氨基端要进行乙酰化,在羧基端也要进行修饰。
2.真核生物蛋白质分泌
真核生物不但有细胞核、细胞质和细胞膜,而且还有许多膜 性结构的细胞器,在细胞须内合成的蛋白质怎样的到达细胞的不 同部位呢?了解比较清楚的是分泌性蛋白质的转运。
像原核细胞一要,真核细胞合成的蛋白质N端也有信号肽也 能形成两个α-螺旋的发夹结构,这个结构可插入到内质网的膜 中,将正在合成中的多肽链带进内质网内腔。
蛋白质自我剪接在原核生物和单细胞真核生物中均已发 现。迄今已在20多种生物的近30种蛋白质分子中发现蛋白内 含肽,这些蛋白质大约一半参与核酸代谢。
蛋白内含肽常具有一定的生物活性,如核酸内切酶的活 性。此外,许多蛋白内含肽插入至蛋白质高度保守区(如活 性中心附近),其作用是一方面迫使蛋白质前体必须经过剪 接才能成熟,另一方面也有利于蛋白内含肽自我保护。
此,在研究新生肽段折叠时,就很自然的把在体外蛋白质折叠 研究中得到的规律推广到体内,用变性蛋白的复性作为新生肽 段折叠的模型,并认为细胞中新合成的多肽链,不需要别的分 子帮助,不需要额外能量的补充,就应该能自发的折叠而形成 它的功能状态。
1988年,邹承鲁指出新生肽段折叠在合成早期已开始,而
不是合成完后才开始,随着肽段的延伸同时折叠,又不断进行 构象调整,先形成的结构会作用于后合成肽段的折叠,而后合 成的结构又会影响前面已形成的结构调整。因此,在肽段延伸 过程中形成的结构往往不一定是最终功能蛋白中的结构。这样, 三维结构的形成是一个同时进行着的,协调的动态过程。九十 年代一类具有新生物功能的蛋白,分子伴侣的发现,以及更广 泛意义上说帮助蛋白质折叠的辅助蛋白的提出,说明细胞内新 生肽段折叠一般说需要帮助,而不是自发进行。
某些蛋白质,如凝血酶等凝血因子,含有多个r-羧基Glu, 这一羧基是由需Vit K的酶催化下进行的。 (3)加辅基
蛋白质与辅基的结合也是在翻译之后进行的,如乙酰CoA 羟化酶的辅基,生物素和细胞色素C的血红素。
3.共价修饰
许多的蛋白质可以进行不同的类型化学基团的共价修饰, 修饰后可以表现为激活状态,也可以表现为失活状态。 (1)磷酸化
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