酚氯仿法提取DNA的原理
提取dna的方法及原理
提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA提取是生物学和遗传学研究中的一项基础操作,它是获取DNA样本的过程。
DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。
1. 高盐法高盐法是一种简单且常用的DNA提取方法。
其原理是利用高盐溶液中DNA与其他细胞组分(如蛋白质)之间的亲和性差异。
在高盐环境下,DNA更容易溶解而不与蛋白质结合,从而实现DNA的提取。
具体步骤包括细胞破碎、加入高盐溶液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的DNA提取方法。
其原理是利用酚和氯仿两种溶剂的密度差异,将DNA从细胞中分离出来。
具体步骤包括细胞破碎、加入酚/氯仿混合液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法。
其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性差异。
DNA样本在经过一系列处理后,通过硅胶柱,DNA能够与硅胶颗粒结合,而杂质则被洗脱。
最后,通过洗脱DNA,即可获得高纯度的DNA。
硅胶柱法的优点是提取纯度高、操作简单,适用于分子生物学研究和临床诊断。
4. 磁珠法磁珠法是一种高效、快速的DNA提取方法。
其原理是利用带有亲和基团的磁珠与DNA之间的亲和性,实现DNA的选择性吸附和洗脱。
具体步骤包括磁珠悬浮液制备、样本加入、磁珠与DNA结合、磁珠分离、洗脱DNA等。
除了上述常用的DNA提取方法外,还有其他一些特殊的DNA提取方法,如酶解法、离心法、凝胶切割法等。
这些方法在不同的实验和应用中具有各自的特点和优势。
总结起来,DNA提取的方法多种多样,选择适合的方法取决于实验目的、样本类型和实验条件等。
无论采用哪种方法,都需要严格控制实验操作,以确保提取到高质量的DNA样本。
DNA提取的成功与否直接影响到后续的实验结果,因此在进行DNA提取时,需要注意样本的保存、细胞破碎的方式、溶解液的选择等因素,以获得可靠且高纯度的DNA。
DNA和RNA提取方法及原理
DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法及原理:1.酚/氯仿法:酚/氯仿法是最常用的DNA提取方法之一、其原理是通过酚类物质将细胞质膜破坏,使DNA从细胞内溶解出来,然后利用氯仿的重度稠化剂作用,将DNA上层的蛋白质、脂类等杂质与下层的DNA分离。
2.盐溶液法:盐溶液法是一种温和的DNA提取方法,适用于多种植物和动物样品。
其原理是将样品细胞裂解后,加入高浓度盐溶液中,通过离心分离出DNA上层液相。
3.硅胶柱法:硅胶柱法是一种高效纯化DNA的方法,可去除杂质并提高DNA的纯度。
该方法利用硅胶柱对DNA进行吸附,去除杂质,然后通过洗脱得到纯净的DNA。
这种方法常用于分离较小的DNA片段。
4.酶解法:酶解法是一种特异性较高的DNA提取方法,通过特定的酶切酶对细胞膜进行消化,将DNA释放出来。
常用的酶解酶有蛋白酶K和蛋白酶E等。
RNA提取方法及原理:1.酚酸法:酚酸法是最常用的RNA提取方法之一、它基于RNA和DNA的相对稳定性差异,利用酚酸破坏细胞膜、沉淀RNA,然后利用酚酸与蛋白质和DNA 形成复合物,分离RNA。
2.硅胶柱法:硅胶柱法也适用于RNA提取。
与DNA的硅胶柱法不同的是,RNA在硅胶柱上结合后会进行一系列的洗脱步骤,除去污染物。
该方法能有效去除DNA、蛋白质、盐和其他杂质。
3.离心收集法:离心收集法是一种简便、快速的RNA提取方法。
根据RNA在水相中的溶解性,通过离心将细胞裂解液中的RNA分离出来,然后加入酒精沉淀纯化。
4.硅酸盐法:硅酸盐法是一种特异性较高的RNA提取方法,通过利用试剂中的硅酸盐吸附RNA,并在洗涤步骤中去除杂质,从而得到纯净的RNA。
酚氯仿法提取DNA原理及方法
酚氯仿法提取DNA原理及方法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其原理是利用酚氯仿溶液对细胞和细胞碎片进行破碎,然后通过离心分离DNA。
以下是详细的步骤:1.细胞裂解:将待提取DNA的样本(细胞、组织等)加入含有酚氯仿的裂解缓冲液中,将溶液均匀混合。
酚氯仿是一种有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出DNA。
2.蛋白质沉淀:加入混合溶液中的蛋白质会和酚氯仿相互分离,形成一个物理屏障。
离心沉淀后,由于DNA密度比蛋白质低,DNA会上浮到上层,而蛋白质则沉淀在下层。
3.DNA沉淀:将上层液体转移到新的离心管中,加入同等体积的冷乙醇或异丙醇,然后轻轻振荡以促使DNA沉淀。
酒精能够与DNA相互作用,使DNA分子变得更加疏水,从而沉淀下来。
4.清洗:离心沉淀后,将上清液倒掉,加入70%乙醇洗涤沉淀。
乙醇通过去除残留的酚氯仿和其他杂质,使沉淀的DNA纯化。
5. 溶解:将洗涤后的DNA沉淀干燥或用适量的缓冲液溶解,最常用的是TE缓冲液(含有10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA),以便后续的DNA浓度测定和实验操作。
总结来说,酚氯仿法利用酚氯仿溶液破坏细胞膜和核膜,将DNA从细胞中释放出来。
离心分离蛋白质和DNA,然后通过酒精沉淀和乙醇洗涤纯化提取的DNA。
这种方法简单快速,并且能够获得较纯的DNA样品。
不过,酚氯仿法在提取DNA时会同时提取到RNA和蛋白质,因此在一些需要高纯度DNA的实验中可能不适用。
在使用酚氯仿法提取DNA时,还需要注意避免DNA的降解,避免污染和交叉污染,以及正确保存提取的DNA样品。
DNA苯酚氯仿提取法和试剂盒纯化有什么区别
DNA苯酚氯仿提取法和试剂盒纯化有什么区别
酚氯仿⽅法是提取核酸的⽅法,主要原理是利⽤核酸、蛋⽩等杂质在⽔相和有机相中溶解度不同⽽重新分配。
试剂盒原理是在特定溶液环境下(⾼盐、低pH)使核酸吸附在固相介质(⼀般是硅胶膜)上,洗涤去除杂质后,再改变溶液环境使DNA溶解到纯⽔或TE中。
酚氯仿⽅法:便宜,⽤的都是实验室常⽤试剂,提纯效率和纯度都很⾼,但缺点是费时费⼒,苯酚和氯仿还有⼀定毒性,我见过的实验室很少有⽤这种⽅法的。
试剂盒严格来说也分好多种,常⽤的是离⼼柱的,就是把硅胶膜固定在离⼼管中,类似于超滤膜,⽤离⼼⼒或者负压让液体通过硅胶膜,核酸就留在膜上。
在经过洗涤、洗脱的步骤得到核酸。
这种⽅法的优点是操作简单、时间短,现在也能达到很⾼的质量,价格也不贵。
缺点是不易放⼤,需要多次离⼼。
试剂盒基本步骤是先使样本裂解,在特定溶液中通过离⼼流过硅胶膜,再经过⼏次洗涤,最后加上洗脱液,离⼼后核酸就溶解到洗脱液中。
酚氯仿法提取DNA的原理
酚氯仿法提取DNA的原理用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而D NA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase 的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或NaAc,Na+中和DN A分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在0.14mol/L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在0.14mol/L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。
加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。
加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。
最后用95%乙醇沉淀DNA。
溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。
加4毫升10%SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60 ℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。
其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。
具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。
2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。
酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。
3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。
脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。
4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。
5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。
6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。
洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。
7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。
通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。
酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DN A裂解液(300μl),研磨后再加入300μl DNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tri s饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10mi n。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了D Nase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与D NA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
提取dna的方法及原理
提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA是生物体中的遗传物质,它携带着生物体的遗传信息。
提取DNA是研究基因组学、遗传学等领域的重要基础工作。
本文将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。
1. CTAB法CTAB法是一种经典的DNA提取方法。
其原理是利用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)与DNA结合形成离子对,然后通过盐溶液的浓度差异,使DNA从溶液中沉淀出来。
该方法适用于提取植物细胞中的DNA。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种常用的DNA提取方法。
其原理是利用DNA在酚相中溶解,而其他细胞组分则在氯仿相中溶解,通过酚/氯仿两相的分离,从而将DNA分离出来。
该方法适用于提取动物细胞和细菌等样品中的DNA。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高效、纯化度较高的DNA提取方法。
其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性,将DNA吸附在硅胶颗粒上,然后通过洗涤、离心等步骤,将DNA从硅胶颗粒上洗脱下来。
该方法适用于提取各种样品中的DNA。
4. 磁珠法磁珠法是一种基于磁性颗粒的DNA提取方法。
其原理是将带有亲和基团的磁性颗粒与DNA结合,然后通过磁力的作用,将颗粒和DNA一起沉淀下来,最后通过洗涤等步骤,将DNA从颗粒上洗脱下来。
该方法具有快速、高效的特点,适用于高通量的DNA提取。
以上是几种常用的DNA提取方法及其原理。
不同的方法适用于不同类型的样品和实验需求。
在实际操作中,可以根据具体情况选择合适的方法进行DNA提取。
同时,为了保证提取到的DNA质量和纯度,还需要注意提取过程中的一些关键步骤,如细胞破碎、蛋白质酶处理、DNA沉淀等。
DNA的提取是基因研究和遗传学研究的重要步骤,通过合适的提取方法可以获取到高质量的DNA样品,为后续的实验和分析提供可靠的基础。
随着技术的不断进步,提取方法也在不断改进和优化,为科学研究提供更多的可能性。
dna分离纯化方法及原理
dna分离纯化方法及原理
1. 酚-氯仿抽提法:这是一种传统的 DNA 提取方法。
原理是利用酚和氯仿的混合物来溶解细胞膜和蛋白质,使 DNA 与其他细胞成分分离开来。
然后通过离心和有机溶剂的萃取,将 DNA 从混合物中提取出来。
2. 硅胶柱层析法:该方法基于 DNA 与硅胶柱子之间的吸附和解吸作用。
将待提取的样本加载到硅胶柱上,通过柱子的吸附作用,使 DNA 与其他杂质分离开来。
然后用适当的洗脱缓冲液将 DNA 从柱子上洗脱下来。
3. 磁珠法:这是一种利用磁性颗粒结合 DNA 的方法。
将磁珠与样本混合,使 DNA 与磁珠结合。
通过外部磁场的作用,可以将磁珠与结合的 DNA 分离开来,从而实现 DNA 的纯化。
4. 质粒抽提法:这种方法适用于提取质粒 DNA。
通过碱处理破坏细菌细胞壁和细胞膜,使质粒 DNA 从细菌细胞中释放出来。
然后通过离心和沉淀等步骤,将质粒 DNA 与其他杂质分离开来。
5. 超声波法:利用超声波的能量,将细胞破碎,使 DNA 释放到溶液中。
然后通过离心和沉淀等步骤,将 DNA 与其他杂质分离开来。
这些方法的原理基于不同的物理、化学或生物学原理,旨在从复杂的生物样本中选择性地分离和纯化 DNA。
选择合适的方法取决于样本类型、纯度要求和实验目的等因素。
在 DNA 分离纯化过程中,还需要注意操作规范、防止污染,并进行质量控制和检测,以确保获得高质量的 DNA 用于后续的分析和实验。
酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase 的活性。
DNA和RNA提取方法及原理
DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法:1.酚/氯仿方法:这是最早应用的DNA提取方法之一,适用于绝大多数生物样本。
原理是利用酚酸抽提DNA,酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,而DNA在酚相沉淀。
然后用氯仿提取,分离DNA与酚相中的蛋白质和RNA。
最后通过乙醇沉淀纯化DNA。
这种方法可以得到高质量的DNA,但操作过程相对繁琐。
2.硅胶基质法:硅胶基质可吸附DNA,该方法使用硅胶膜或硅胶粉末来固定DNA,通过洗涤去除杂质,最后用洗脱液从硅胶上洗脱DNA。
这种方法具有简便和高纯度的优点,适用于大规模提取DNA。
3.盐酸法:盐酸法以酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物的原理,通过加入盐酸将DNA沉淀下来,然后经过洗涤和乙醇沉淀纯化。
这种方法适用于提取纯度要求不高的DNA。
RNA提取方法:1.酚酸提取法:这是最常用的RNA提取方法之一、原理类似于DNA的酚/氯仿法,通过酚酸将核酸与蛋白质和其他杂质分离。
然后通过氯仿脱脂,去除酚相中的蛋白质,并且获得RNA水相。
最后通过乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于大多数样品,得到的RNA纯度较高。
2.硅胶基质法:与DNA提取类似,它也适用于RNA的提取。
通过硅胶膜或硅胶粉末结合RNA并洗脱,用洗脱液分离RNA与杂质。
这种方法适用于大规模提取RNA。
3.氯仿法:这是一种较为简便的RNA提取方法,它通过氯仿脱脂去除脂质和其他杂质,并且能够同时去除DNA。
最后用乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于需要较快速提取RNA的情况。
DNA和RNA提取的基本原理都是通过分离和纯化DNA或RNA与其他杂质的物质。
酚酸提取法和硅胶基质法同属于酚酸法,都是通过酚酸和氯仿来分离DNA或RNA与蛋白质和其他杂质。
其中酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,并且DNA或RNA在酚相中沉淀,而蛋白质和RNA在氯仿相中溶解。
然后通过洗脱和纯化步骤,从酚酸相中提取DNA或RNA。
盐酸法与酚酸法不同,它是通过酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物来分离DNA与其他杂质。
DNA提取方法原理简介
DNA提取方法原理简介DNA是脱氧核糖核酸,是绝大多数生物的最主要的遗传物质。
随着生命科学技术的发展,从生物样本中提取DNA的方法也日益多样、成熟。
下面就几种常见的DNA提取方法的原理作个简介。
1 酚氯仿法酚氯仿法为DNA提取的经典方法,价格较低。
加入Tris饱和酚能使蛋白质变性,令DNA与组织蛋白质分开,同时抑制DNase的作用,保护DNA免于降解。
随后加入的氯仿/异戊醇经过混匀和离心后,能使溶液分为上层水相和下层有机相。
由于DNA存在于水相,蛋白质等杂质存在于有机相,这样就能使DNA与其他杂质分开。
吸取上层水相后,加入无水乙醇能使DNA从溶液中沉淀下来,经过离心去除上清液就能得到DNA沉淀了。
可以再使用75%乙醇洗涤一次,去除残留的一些有机物,使DNA更纯。
最后等乙醇挥发干燥后,加入TE缓冲液就能得到理想的DNA样本。
2 Chelex-100法Chelex-100是一种由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成的化学树脂,可以螯合多价离子。
Chelex-100法提取DNA是一种快速方便的方法,但DNA模板的纯度比较低,不适合长期保存。
Chelex-100溶液与血液样品等混匀后,通过煮沸、离心等步骤,可以使样品中大部分蛋白质变性,金属离子被Chelex-100螯合,从而使样品上清液的DNA模板能用于后续反应。
3 膜吸附法常用硅胶膜作为吸附DNA的载体。
部分的商品化DNA提取试剂盒会采用这种方法。
提取的DNA纯度高,效果好,但试剂盒成本较高。
其原理是在高盐缓冲液条件下,硅胶膜会吸附DNA,经过数次缓冲液洗涤离心后,吸附在膜上的DNA已经很纯,这时再用适当体积的低盐TE缓冲液进行洗脱。
4 磁珠法经过特殊表面处理的磁珠,在缓冲液条件下对DNA有很强的吸附力。
部分的商品化DNA提取试剂盒会采用这种方法。
提取的DNA纯度高,效果好,但试剂盒成本较高。
其原理是在缓冲液条件下,磁珠能吸附DNA,通过使用磁力棒能使磁珠聚集,去除含杂质的上清液。
氯仿法提取DNA
试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。
蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。
当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。
离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。
酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。
抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
试验步骤:1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。
重复一次。
用0.7mlDNA 提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。
2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠。
50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。
保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。
3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。
5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复酚抽提一次。
加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复一次。
4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿抽提DNA原理是一种常用的DNA提取方法,通过该
方法可以从复杂的生物样品中高效地提取纯度较高的DNA样本。
其原理主要包括以下几个步骤:
1. 细胞破碎:首先将待提取的生物样品经过离心等操作,去除无关细胞和组织,然后使用细胞裂解缓冲液将目标细胞破碎,使细胞内部的DNA释放出来。
2. 蛋白酶处理:在细胞裂解的过程中,蛋白酶会释放出来,为了去除其对DNA的影响,可以加入蛋白酶抑制剂来保护DNA。
此步骤的目的是降解蛋白质,同时保持DNA的完整性。
3. 混合酚氯仿:将细胞裂解液与等体积的氯仿混合,产生两相体系。
氯仿主要用来分离DNA和其他细胞成分,如脂质、蛋
白质等。
在混合过程中,DNA溶于水相,而其他成分溶于有
机相。
这样,通过离心使两相分离。
DNA会聚集在水相中。
4. DNA沉淀:将水相转移到新的离心管中,加入冷酒精或异
丙醇,使DNA沉淀出来。
酒精或异丙醇中的离子会中和
DNA上的电荷,从而使DNA不溶于水,形成可见的白色沉淀。
5. 洗涤与溶解:将DNA沉淀用无菌蒸馏水洗涤去除酒精或异
丙醇的残余,并用TE缓冲液溶解DNA,使其得以储存和进
一步应用。
通过酚氯仿抽提DNA,可以将DNA从细胞中高效地提取出
来,纯度较高,适用于许多分子生物学实验和技术的应用,如PCR、酶切、测序等。
酚氯仿法提取DNA的原理
酚氯仿法提取DNA的原理酚氯仿法是一种用于提取DNA的常见方法,它基于DNA与酚氯仿在两相溶液中由于密度差异而发生分离的原理。
下面将详细介绍酚氯仿法提取DNA的原理及步骤。
DNA是一个带有负电荷的双链分子,其溶解度与其环境的离子力有关。
酚氯仿可以形成无水酚、蛋白质和DNA、RNA在其中既不溶于水又不溶于酚氯仿的界面。
当DNA溶液与酚氯仿混合时,DNA会从水相转移到有机相(酚氯仿相)中,实现分离。
1.细胞裂解:将待提取DNA的细胞加入缓冲液中,并通过机械、热力或化学方法使细胞裂解,释放DNA。
2.去除蛋白质:加入蛋白酶K等蛋白酶使蛋白质降解,形成胶冻样物质。
3.DNA溶解:加入盐酸溶解胶冻样物质,使DNA溶于溶液中。
4.全球胆碱设备实验室的志愿者在2024年完成了其中一个针对雌激素和其他抗生素的研究试验。
5.沉淀DNA:加入冰冷的异丙醇或乙醇,在DNA溶液中形成DNA沉淀。
6.制备DNA:将DNA沉淀转移到新的管中,并用乙醇洗涤去除杂质。
7.定量和存储:使用分光光度计测量DNA的浓度,然后将其保存在适当的条件下,以便后续实验中使用。
1.方法成本较低,步骤简单易行。
2.可以提取高纯度的DNA。
3.可以在较短时间内提取大量DNA。
1.操作要注意安全,避免酚氯仿的接触和吸入。
2.使用无菌技术和无菌材料,以避免外源性DNA的污染。
3.避免DNA溶液的过热和过长的暴露于空气中,以避免降解DNA。
总结:酚氯仿法提取DNA是一种常用的DNA提取方法,其原理是通过DNA与酚氯仿在两相溶液中的密度差异实现DNA的分离。
该方法简单易行,可以提取高纯度的DNA,适用于很多生物学实验和研究领域。
在进行实验时,需注意操作安全和避免DNA污染,以保证提取到高质量的DNA。
[方案]酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理
[方案]酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56?,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4?。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。
9.离心:12000R,7min,4?。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4?。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20?冷冻的100%的酒精。
-20?过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4?离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20?冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用,使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
酚氯仿抽提原理
酚氯仿抽提原理
酚氯仿抽提原理是一种常见的有机物提取方法,该方法通过酚氯仿与样品中的目标化合物发生化学反应,将目标化合物从样品中分离出来。
下面将详细介绍酚氯仿抽提原理:
1.溶剂选择:酚氯仿是一种有机溶剂,对许多有机物具有良好
的溶解能力,因此在酚氯仿抽提过程中常常选择酚氯仿作为抽提溶剂。
2.抽提原理:酚氯仿可以与目标化合物发生亲油性反应,形成
可溶于酚氯仿的复合物,并从样品中抽提出来。
这是因为酚氯仿的化学性质使其能够与许多有机物形成相互作用,例如氢键、氧化还原反应等。
3.抽提条件:酚氯仿抽提的条件包括温度、pH值、搅拌速度等。
适当的条件可以促进酚氯仿与目标化合物的反应,并提高抽提效果。
4.抽提步骤:酚氯仿抽提的步骤通常包括样品制备、酚氯仿溶
液制备、抽提过程和目标化合物的分离。
其中,在样品制备过程中需要将样品研磨或者加入适当的溶剂溶解,以便更好地与酚氯仿反应。
5.分离纯化:一般情况下,酚氯仿抽提得到的溶液中还包含有
一些杂质。
为了得到纯净的目标化合物,需要进行进一步的分离纯化步骤,例如溶剂挥发、晶体生长等。
总之,酚氯仿抽提原理通过酚氯仿与目标化合物的化学反应来分离目标化合物。
通过优化溶剂的选择、抽提条件的控制以及后续的分离纯化步骤,可以得到纯净的目标化合物。
tris-saturated phenol method dna
tris-saturated phenol method dnaDNA分离是分子生物学实验的常见操作,其中一种常用的方法是Tris-饱和酚法。
该方法通过沉淀DNA蛋白质复合物,将DNA从蛋白质和其他杂质中分离出来。
以下是关于Tris-饱和酚法的相关参考内容:1. 方法原理:Tris-饱和酚法利用酚和氯仿两性溶剂的不相容性来沉淀DNA。
酚能够与DNA形成络合物,而氯仿则与酚不相溶。
这样当样品中加入饱和盐溶液和酚后,DNA将从其他细胞组分中分离出来形成沉淀。
通过离心,可以将DNA沉淀物从上清液中分离出来。
2. 实验步骤:- 将样品细胞裂解,并加入含有盐和洗涤缓冲液的混合物。
- 加入等体积的饱和酚,轻轻混合,使酚和样品溶液充分接触。
- 离心,分离上清液和DNA沉淀。
- 将上清液中的蛋白质和其他杂质移除。
- 加入冷酒精,使DNA沉淀。
- 用冷酒精洗涤和干燥DNA沉淀物。
- 重溶DNA沉淀物,用于后续的实验。
3. 实验应用:Tris-饱和酚法是许多分子生物学实验的关键步骤,包括:- DNA提取:该方法可以从细胞或组织样品中提取DNA,用于进一步的分析,如PCR、限制性酶切等。
- 基因库构建:通过分离和提纯DNA,可以构建基因库,用于克隆、表达和研究特定的基因。
- DNA纯化:该方法可以将DNA从复杂的样品中纯化出来,以进行下游实验,如测序、Southern blot等。
4. 实验优缺点:- 优点:该方法操作简单、成本低,适用于大规模的DNA提取和纯化。
同时,该方法适用于各种样品类型,包括细胞、组织和血液等。
- 缺点:该方法对样品中其他细胞组分的污染比较敏感,特别是蛋白质。
此外,该方法不能分离RNA和DNA。
5. 注意事项:- 实验过程中应注意生物安全,避免接触有害的细胞或样品。
- 严格按照实验步骤进行操作,以避免DNA沉淀的损失或污染。
- 使用酚和氯仿时应注意防护,避免吸入和皮肤接触。
以上是关于Tris-饱和酚法的相关参考内容,介绍了该方法的原理、实验步骤、应用、优缺点以及注意事项。
酚氯仿法提取DNA实验报告
酚氯仿法和试剂盒法提取DNA实验报告一、实验目的实验原理:酚氯仿法:先从全血中分离白细胞,再通过蛋白酶K 消化,通过酚、氯仿的抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯化DNA。
蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA乙二胺四乙酸二钠存在下保持很高的活性。
在匀浆后提取DNA的反应体系中晶SDS可破坏细胞膜、核膜晶并使组织蛋白与DNA分离晶EDTA则抑制细胞中Dnase的活性 而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸晶使DNA分子完整地分离出来。
氯仿-异戊醇溶液可以使核蛋白变性沉淀晶将核酸物质萃取出来 再向萃取液中加入适量乙醇晶可使DNA析出。
氯仿异戊醇抽提和乙醇沉淀方法在DNA纯化研究中非常常用晶氯仿-异戊醇抽提的原理是晶氯仿可使蛋白质变性并加速有机相与液相分层 异戊醇有助于消除抽提过程中产生的气泡。
而DNA不溶于乙醇等有机溶剂晶因此可以通过乙醇沉淀来纯化和浓缩DNA二、实验用品试剂:1mol/L(M)Tris-Cl(pH8.0),0.5M EDTA(pH8.0),5M NaClTES(15mM Tris,15mM EDTA,15mM NaCl)Tris饱和酚(PH8.0)氯仿/异戊醇(V/V=24/1)10%SDS5mg/ml Protease K70%乙醇、无水乙醇TE缓冲液(pH8.0):10mM T ris-Cl(PH8.0)1mM E DTA(PH8.0)10mg/mL 溴化乙锭(EB)耗材:仪器:低温离心机、移液枪一套,低温冰箱,恒温水浴锅、紫外分光光度计(Eppendorf)。
三、实验步骤4.1取血样:实验人员相互取血样5ml.(用品:采血管、采血针、无水乙醇、棉签、橡皮管、废液缸)4.2血液样品的预处理:分取2ml 血样加入到离心管A中用于酚氯仿法提取DNA。
1) 破除RBC:用移液器将采血管中剩余的3ml血样中的血凝块取出转移到组织匀浆器中研磨粉碎,再移入50ml 离心管B 中,再加入5倍体积无菌水,颠倒混匀,冰上静置十分钟,用于试剂盒法提取DNA。
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作者: 渭水凡夫(站内联系TA)发布: 2013-04-06最近在博客上看到的一篇可以作为入门级《分子生物学十万个为什么》和大家分享一下用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。
加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。
加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。
最后用95%乙醇沉淀DNA。
溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。
加4毫升10%SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60 ℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。
加固体氯化钠,使溶液氯化钠浓度达到1mol/L,充分搅拌10分钟;除杂质:加等体积氯仿-异戊醇混合液,充分震荡10分钟, 8000 r/min离心7分钟,取上层液量好体积,倒入烧杯中(离心管),加同体积的氯仿-异戊醇混合液,重复上次操作。
直至界面不出现蛋白凝胶为止;沉淀:准确量取上清液体积,加2倍体积95%冷乙醇,搅拌后,置冰箱静止冷却,待有白色丝状物出现,约10-15分钟,离心8000 r/min离心7分钟,得白色沉淀;溶解:将沉淀物用L NaOH约10毫升溶解,得DNA溶液。
溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
溶液II-NaOH-SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH>1 2或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为/L,加抽提液时,该系统的pH就高达,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。
溶液III--3mol/L NaAc()溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用的NaAc溶液是为了把的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS-蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
为什么用无水乙醇沉淀DNA?用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。
乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。
一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。
因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。
但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。
折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。
也可以用倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。
一般在室温下放置15-30分钟即可。
在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达~L?在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。
在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响D NA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。
加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。
也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀,去除RNase。
在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。
7.为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液?在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。
磷酸盐缓冲系统(pKa=)和硼酸系统(pKa=)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀;在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳苯酚、氯仿、异戊醇在DNA提取时的作用抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。
经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。
而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。
作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。
所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。
经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。
也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1?抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。
经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。
而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。
作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DN A,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。
所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。
经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。
也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase的活性。