李金明-个体化医学检测质量保证指南(简)
免疫质量管理
3.正确诊断指数
(约登指数Youden’s index)
r =1-(假阳性率+假阴性率)
=(灵敏度+特异度)-1
r值范围在0--1之间。r越大,准确性越高,与 实际越符合。
筛检试验与诊断试验的区别
筛检试验
诊断试验
对象不 同
健康人或无疑病人与无 病者区分开来
病人与可疑有病但实际 无病的人区分开来
要求不 同
费用不 同 处理不 同
快速、简便、高灵敏度
简单、廉价 阳性者须进一步作诊断 试验以便确诊
科学性、准确性
一般花费较贵 结果阳性者要随之以治 疗
8
确认试验
➢ 确认试验用于验证筛查试验或者诊断 试验结果。该试验必须具有较高的特 异性以及高阳性预测值。如螺旋体抗 体荧光吸附(FTA-ABS)梅毒血清学试 验。
临床敏感性
➢ 在患有明确临床疾病的患者中,其测定阳性或超过正 常范围的比率(即出现阳性结果和确定犯病)
临床特异性
➢ 在没有特定临床疾病的患者中,其测定引性或在正 常范围的比率
阴性
C
D
(疾病可能不存在) (假阴性) (真阴性)
合计
A+C
B+D
阳性预测值 A 100% A B
阴性预测值 D 100% CD
合计 A+B C+D A+B+C+D
阳性预测值
灵敏度
灵敏度 现患率 现患率 (1 特异度)(1
现患率)
5
❖ 灵敏度越高,阴性预测值越高 ❖ 特异度越高,阳性预测值越高 ❖ 与受检人群目标疾病患病率(P)密切相关
李金明-临床分子诊断质量保证
实验室仪器设备及管理
加样器:维护、校准 扩增仪:维护、校准 杂交仪:维护、校准 测序仪:维护、校准 芯片扫描仪:维护、校准 恒温干浴仪或水浴箱:维护、校准 离心机:维护 生物安全柜:维护 冰箱:维护
理想的试剂
试剂方法的性能验证及每批试剂的质检 性能指标:
重复性 准确性(定量:回收率、标准物质等;定性:方法学比较等) 线性范围(定量) 分析特异性 测定下限 抗干扰能力
CLIA uses the term “verification”: specifically to relate to confirmation that the laboratory using a test can replicate the manufacturer’s performance claims when the test is used according to the package insert. (CLIA 性能验证术语特指使用某特定检测试剂或系统的实验室按 照所提供的试剂盒或检测系统说明书使用时,能复现生产 厂家所宣称的检测性能。)
自建方法和自配试剂
有严格的试剂制备SOP 建立相应的性能指标:重复性、准确性、特异
性、测定下限和抗干扰能力等 应做成一个试剂盒的样子:名称、方法、制备
日期、制备人、有效期等 有使用说明书
实验室质量管理的“灵魂”
标准操作程序(SOP)是实验室的“最高标准”!
SOP等于试剂盒说明书吗?
源于一些标准文件(如仪器试剂说明书、国际国内标准文件) 和实验室实际工作经验积累。 因此高于相关标准文件!!!
[Luminex])
PCR-Sanger测序
PCR-焦磷酸测序
PCR-新一代测序?
PCR-SSCP、RFLP、dHPLC等
李金明-个体化医学检测质量保证指南(简)
性能验证与性能确认的实际操作区别
性能指标及所建议的 研究
可报告范围, 线性范围研 究(定量检测)
要求
FDA批准的检测
实验室自建方法或自配试剂(LDT)
覆盖所述线性范围内5~7个浓度,每个浓度双份 覆盖预计测定范围内(或超出所确定的最宽的可能范围的20〜30%)7~9个浓度,
基因扩增仪器设备的质控
仪器设备
扩增仪
加样器 水浴箱 酶标仪
质控方法
频度
仪器校验实验 当仪器移动时
热电偶监测温度 每月一次
扩增功能检测 每 4 个月一次
程序打印
校准
温度检测
预防性维护 及校准
每次测定时 每年 2 次 每次实验 每年 2 次
失控标准
实验失败 如靶温度或温度 差异超出允许范 围
待测孔未出现扩 增,检测温度
测序区空气流向 缓冲间扩增 与检测区 空气流向缓冲间
标本与文 库制备区 空气流向
缓冲间
试剂准备区
空气流向 缓冲间
专用走廊工作流向标本与制备区 扩增与检测区测序区
植入前胚胎遗传学诊断(全基因组低拷贝测序)
电泳区 空气流向 缓冲间增一区 空气流向 缓冲间
The FDA and ISO both define the term “validation” as “confirmation by examination and provision of objective evidence that the particular requirements for a specific intended use can be consistently fulfilled” .
李金明
技 术 委 员 会 委 员 ,中 国输 血 协 会 专 家 委员 会 成
员 ,中 国 医 院管 理 协 会 临 床 检 验 专 业 管理 委员 会 委 员 ,卫 生 部 临床 检 验 标 准 化 委 员 会 委 员 , 国家认 可委 标准 物质 / 准样 品委员会 委员 ,中 标 南 大学湘 雅 医学 院兼 职教 授等 学术 职务 。 李 金 明研究 员 率 先在 国内开 展 I 核 酸检 验 的质 量控 制 和标 准 化工 作 ,长 期从 事 临床 分 子诊 断 方法 临床
都 医学 发展科 研基 金课 题 1 ;作 为分课 题负 责人 承担 欧盟第 六框 架计 划 (P ) 项 F 6 国际合 作研 究项 目、科技
重大专项、 “ 十五”攻关 、国家科技基础条件平 台建设项 目等多项课题。主持和主要参与项 目分获 20 01 年 、20 年和 2 0 年北京市科技奖和中华医学科技奖三等奖。以第一作者 、通讯作者发表论文 10 03 08 0 余
・
专 家风 采 ・
李金明
李金 明, 《 分子诊 断与治疗杂志 》第 一届
编辑委 员会 副主 编 。
16 年 2 93 月出生。19 年毕业于中国协和 93
医科大 学 ,获博 士学位 。
中 国 医学 科 学 院北 京 协 和 医 学 院博 士 生 导
师 ,享受 国务 院政府 特殊津贴 。现任卫生部临 床检验 中心临床免疫室主任 ,研究员 ,兼 任国 际临床化学协会 (F C) IC 分子诊断委员会委员 ,
及标准化研究 ,负责全国医院和血站实验室感染性疾病临床免疫学和 P R检验 ,以及 自身抗体免疫检验 C
临床免疫测定的质量控制及结果的可比性-李金明
AF-CDC
AF-CDC AF-CDC
抗PM/Scl 抗体
抗SSA/Ro抗体
ANA#11(2310)
Lot#C103BG 滴度1:4~1:32
AF-CDC
CAP
乙型肝炎表面抗原国家标准物质
项目 研制者 发布年 编 号 浓 度 (IU/ml)
临床免疫测定的质量控制 及结果的可比性
李金明 卫生部临床检验中心
《卫生部办公厅关于医疗机构间医学检验、医学 影像检查互认有关问题的通知》(卫办医发 〔2006〕32号)
•
•
对于参加国家级质量控制和省级质量控制的、 稳定性好、质量比较容易控制和费用较高的检 查项目,应当组织辖区内有条件的医院间逐步 开展检查互认工作。 对于参加国家级质量控制的检查项目,有条件 的省、自治区、直辖市之间可以探索开展检查 互认;参加省级质量控制的检查项目,可以在 本省、自治区、直辖市范围内实行检查互认。
实验室设施、仪器设备及管理
实验室空间及工作流程的设计 实验室环境条件的控制:温湿度控制设 备、稳压或不间断电源 仪器设备及管理:酶标仪、洗板机、全 自动免疫分析仪、加样器等应建立技术 档案,并定期维护和校准
实验室环境条件的控制和监控
实验室温度和湿度的记录及其意义 温度和湿度计的放置
实验台(仪器设 备)
定量测定的标准物质
项目
人血清补体C1q, C4, C5, B因子,和总功能补体 CH50 人血清免疫球蛋白G,A和M(IgG, IgA and IgM) 人血清免疫球蛋白E 甲胎蛋白(AFP)
/pr oducts
编 号
高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化(李金明)
高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化李金明国家卫生计生委临床检验中心全国cfDNA检测标准化高峰论坛2016.11.23-24 长沙基因测序技术的发展●1953年:DNA双股螺旋的发现(英国剑桥大学James Watson 和Francis Crick )●1965年:酵母tRNA测序(美国Comell大学Rober Holley,小片段重叠法)●1971年:λ噬菌体两个粘性末端的完整序列(吴瑞博士,华裔分子生物学专家,引物延伸测序)●1975年:加减法DNA测序(英国剑桥大学Fred )●1977年:Sanger测序(英国剑桥大学Fred Sanger)和Maxam-Gillbert DNA化学降解法测序(美国哈佛Alan Maxam &Walter Gilbert)●1996年:焦磷酸测序(瑞典皇家技术研究所Ronaghi M等)●2005年:Genome Sequencer20新一代测序仪(大规模并行焦磷酸合成测序法,454life Science公司的创始人Jonathan Rothberg)●2007年:454、Solexa公司和Agencourt(SoliD测序仪)公司分别被Roche、illumina和ABI公司收购。
新一代测序技术(next-generation sequencing)2007年被Nature Methods评为生物领域影响力最大的技术精准医学不等于高通量测序高通量测序是目前精准医学实践最为成熟的支撑技术高通量测序技术的临床应用●染色体非整倍体无创产前筛查(NIPT)●胚胎植入前遗传学筛查(Preimplantation GeneticScreening,PGS)和胚胎植入前基因诊断(Preimplantation Genetic Dignosis,PGD)●肿瘤靶向治疗基因突变检测●单基因遗传病检测●病原微生物检测:如HPV基因分型、宏基因组(Metagenomics)测序●┈┈高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化●国家卫生计生委医政医管局高通量测序临床应用试点实验室:评审标准、评审、试点实验室基本要求、管理试点实验室●2015年增加质评调查:全国肿瘤诊断与治疗高通量测序检测●2016年新增质评计划:染色体非整倍体(21、13、18)无创产筛●2016年质评调查:肿瘤游离DNA(ctDNA)检测●2017年正式开展:全国肿瘤基因突变高通量测序(组织样本)检测质评计划批准的第一批四个专业的试点单位全面质量管理?●写你所应做的●做你所写的●记录你已做的●分析你已做的以ISO的标准如ISO15189为标志的!标准化?标准化是对实际与潜在的问题作出统一规定,供共同和反复使用,以在预定的领域内获取最佳秩序和效益的活动。
临床PCR实验室的设计及质量管理体系的建立 李金明
临床PCR实验室得设计及质量管理体系得建立卫生部临床检验中心李金明核酸(DNA与RNA)就是生命现象得基础。
小到病毒、细菌等微生物,大到动植物与人类,都无一例外.因为主导生命活动得受体、细胞因子、酶、激素等均不过就是核酸发挥功能作用得表型,均由核酸决定,在核苷酸序列上哪怕就是单个碱基得变异,都会引起表型得完全改变,并进而影响生命功能得发挥,导致疾病得发生。
因此,在核酸或称为基因水平上检测,对临床疾病本质得揭示就要更深一步。
也正因为核酸就是生物体生命活动之源,对于感染性病原体得检测,从核酸着手,最能反映病原体在机体内得出现与消长.自从美国Cetus公司Mullis博士在1983年发明聚合酶链反应(PCR)这种核酸扩增技术以来,由于其极高得检测灵敏度与特异性,因而在临床感染性疾病、遗传病、肿瘤等得诊断与疗效观察上得到了广泛得应用,在器官移植得基因配型上也就是难以替代得技术。
其应用大大提高了上述疾病诊断得准确性与快速性.但临床PCR检验必须按规范要求进行,并有严格得实验室质量管理,否则,因其极高得检测灵敏度,实验室稍有以前扩增产物得污染,或在标本核酸提取过程中标本间得交叉污染,均可导致假阳性结果得出现。
同时,也会因为试剂与实验消耗品得质量不过关、仪器设备得维护校准不到位,或操作得不规范等,也很容易出现假阴性结果.第一节临床PCR实验室得分区规划设计如何规划设计一个合格得实验室就是每一个临床PCR实验室首先要遇到得问题,因为一个实验室一旦经过设计并完成装修,如不符合要求,则会出现很大得麻烦,甚至不得不拆了重来。
那么怎样才能设计一个合格得实验室呢?简单地说,就就是十六个字,“各区独立、注意风向、因地制宜、方便工作".同时要注意临床标本得接收问题。
对于临床PCR实验室得分区及其设备配置,卫生部颁发得《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》(卫医发[2002]10号)中作了明确规定,并且卫生临床检验中心发出得配套文件《临床基因扩增检验实验室工作规范》(卫检字[2002]8号)又对各区得功能及注意事项作了阐述。
感染性疾病相关
感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南前言感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病,快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。
随着分子检测技术的不断发展和完善,分子检测在病原微生物感染诊断及治疗监测上的临床应用日益广泛,已成为一些重要的感染性疾病的诊断和疗效评价中不可缺少的重要工具。
为使我国的感染性疾病分子检测临床应用健康有序发展,更好的为医患提供高质量的服务,有必要制订感染性疾病相关的分子检测技术指南,规范临床实验室相关分子检测操作程序,指导从事感染性疾病分子诊断的医务人员正确开展工作。
本指南以大量、丰富的临床实践为基础,同时消化吸取了大量国内外文献的精华,广泛征求相关学科专家的意见,遵循科学性、实用性、可行性的原则,反复修改而成。
我们衷心希望《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》能够对广大检验人员起到很好的帮助和指导作用,从而为提高感染性疾病临床诊治水平发挥积极的作用本指南起草单位:中国医科大学附属第一医院、国家卫生计生委临床检验中心本指南起草人:尚红、李金明、郭晓临、代娣、程仕彤目录1. 本指南适用范围 (3)2. 标准术语 (3)3. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测概述 (9)4. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析前质量控制 (12)4.1 标本采集 (13)4.2 标本的转运 (16)4.3 标本的接收 (17)4.4 标本的保存 (18)4.5 检验项目的选择 (19)5. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析中质量控制 (20)5.1 实验室的设计要求 (20)5.2常用的分子检测方法 (21)5.3 试剂和方法的选择 (29)5.4 设备维护和校准 (36)5.5 人员培训 (36)5.6 试剂性能验证 (37)6. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析后质量控制 (40)6.1 结果报告 (40)6.2 结果的解释及医患的沟通 (41)6.3 检测后标本的保存及处理 (42)7. 质量保证 (42)7.1 标准操作程序 (42)7.2 质控品 (42)7.3 室内质量控制 (43)7.4 室间质量评价 (47)8. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测应用 (48)8.1 乙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (48)8.2 丙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (52)8.3 结核分枝杆菌感染诊疗的个体化分子检测 (56)8.4 人获得性免疫缺陷病毒感染诊疗的个体化分子检测 (57)附录 (65)参考文献 (66)1.本指南适用范围本指南由国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会编订,是国家卫生计生委个体化医学检测技术系列指南之一,旨为临床实验室进行感染性疾病相关的个体化医学分子检测提供参考和指导。
1. 李金明-个体化医学检测实验室规范化管理(简)
HLA-B*5701 PML/RARα
抗病毒 TPMT
风湿病
肌肉骨骼疾病 精神类疾病 神经系统疾病
卡利普多
西酞普兰、安定 氯巴占 克拉匹多、普拉格雷、替格瑞洛 右兰索拉唑、艾美拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑 曲螺酮、乙炔雌二醇 伏立康唑 塞来昔布
CYP2C19
诊断医学
70%以上信息 来自实验室 分子诊断对 检验医学的 划时代意义!
个体化医疗 (personalized medicine) 精准医疗 (precision medicine) 移动医疗 数字医疗
预测
诊断
监测
预后
目前国内的临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测
较少部分用于遗传病的产前诊断
相关药物
波西普韦、聚乙二醇化干扰素α-2b、特拉匹韦 Brentuximab vedotin(SGN-35) 卡培他滨 卡马西平、苯妥英 阿巴卡韦 依维莫司、拉帕替尼、帕尼珠单抗、曲妥珠单抗 伊马替尼、舒尼替尼 白消安、达沙替尼、伊马替尼、尼罗替尼 克罗米芬 可唑替尼 地尼白介素 右兰索拉唑 伊马替尼 茚达特罗 伊立替康 异山梨醇、肼屈嗪 利福平、异烟肼、吡嗪酰胺 秦铭泽 来那度胺 马拉韦罗 霉酚酸 普伐他汀 苯乙酸钠、苯甲酸钠、苯丁酸钠
HER2/NEU
C-Kit Ph染色体 Rh基因型 ALK CD25 CYP1A2 PDGFR UGT1A1
结肠癌
心血管系统疾病 抗感染 肺部疾病 脊髓增生异常综合征 AIDS 移植 代谢及内分泌系统疾病 胃肠道疾病
分子诊断的概念
采用分子生物学方法(基因扩增、测序、杂交
、蛋白质组分析、代谢组学分析等)检测患者
体内特定遗传物质的结构或表达水平的变化而 做出的诊断。分子诊断的靶标包括DNA、 RNA、蛋白质和小分子代谢物。
感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南
感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南前言感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病,快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。
随着分子检测技术的不断发展和完善,分子检测在病原微生物感染诊断及治疗监测上的临床应用日益广泛,已成为一些重要的感染性疾病的诊断和疗效评价中不可缺少的重要工具。
为使我国的感染性疾病分子检测临床应用健康有序发展,更好的为医患提供高质量的服务,有必要制订感染性疾病相关的分子检测技术指南,规范临床实验室相关分子检测操作程序,指导从事感染性疾病分子诊断的医务人员正确开展工作。
本指南以大量、丰富的临床实践为基础,同时消化吸取了大量国内外文献的精华,广泛征求相关学科专家的意见,遵循科学性、实用性、可行性的原则,反复修改而成。
我们衷心希望《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》能够对广大检验人员起到很好的帮助和指导作用,从而为提高感染性疾病临床诊治水平发挥积极的作用本指南起草单位:中国医科大学附属第一医院、国家卫生计生委临床检验中心本指南起草人:尚红、李金明、郭晓临、代娣、程仕彤目录1. 本指南适用范围 (3)2. 标准术语 (3)3. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测概述 (9)4. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析前质量控制 (12)4.1 标本采集 (13)4.2 标本的转运 (16)4.3 标本的接收 (17)4.4 标本的保存 (18)4.5 检验项目的选择 (19)5. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析中质量控制 (20)5.1 实验室的设计要求 (20)5.2常用的分子检测方法 (21)5.3 试剂和方法的选择 (29)5.4 设备维护和校准 (36)5.5 人员培训 (36)5.6 试剂性能验证 (37)6. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析后质量控制 (40)6.1 结果报告 (40)6.2 结果的解释及医患的沟通 (41)6.3 检测后标本的保存及处理 (42)7. 质量保证 (42)7.1 标准操作程序 (42)7.2 质控品 (42)7.3 室内质量控制 (43)7.4 室间质量评价 (47)8. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测应用 (48)8.1 乙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (48)8.2 丙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (52)8.3 结核分枝杆菌感染诊疗的个体化分子检测 (56)8.4 人获得性免疫缺陷病毒感染诊疗的个体化分子检测 (57)附录 (65)参考文献 (66)1.本指南适用范围本指南由国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会编订,是国家卫生计生委个体化医学检测技术系列指南之一,旨为临床实验室进行感染性疾病相关的个体化医学分子检测提供参考和指导。
感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南
感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南前言感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病,快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。
随着分子检测技术的不断发展和完善,分子检测在病原微生物感染诊断及治疗监测上的临床应用日益广泛,已成为一些重要的感染性疾病的诊断和疗效评价中不可缺少的重要工具。
为使我国的感染性疾病分子检测临床应用健康有序发展,更好的为医患提供高质量的服务,有必要制订感染性疾病相关的分子检测技术指南,标准临床实验室相关分子检测操作程序,指导从事感染性疾病分子诊断的医务人员正确开展工作。
本指南以大量、丰富的临床实践为基础,同时消化吸取了大量国内外文献的精华,广泛征求相关学科专家的意见,遵循科学性、实用性、可行性的原则,反复修改而成。
我们衷心希望《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》能够对广阔检验人员起到很好的帮助和指导作用,从而为提高感染性疾病临床诊治水平发挥积极的作用本指南起草单位:中国医科大学附属第一医院、国家卫生计生委临床检验中心本指南起草人:尚红、李金明、郭晓临、代娣、程仕彤目录1. 本指南适用范围 (3)2. 标准术语 (3)3. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测概述 (9)4. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析前质量控制 (12)4.1 标本采集 (13)4.2 标本的转运 (16)4.3 标本的接收 (17)4.4 标本的保存 (18)4.5 检验项目的选择 (19)5. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析中质量控制 (20)5.1 实验室的设计要求 (20)5.2常用的分子检测方法 (21)5.3 试剂和方法的选择 (29)5.4 设备维护和校准 (36)5.5 人员培训 (36)5.6 试剂性能验证 (37)6. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析后质量控制 (40)6.1 结果报告 (40)6.2 结果的解释及医患的沟通 (41)6.3 检测后标本的保存及处理 (42)7. 质量保证 (42)7.1 标准操作程序 (42)7.2 质控品 (42)7.3 室内质量控制 (43)7.4 室间质量评价 (47)8. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测应用 (48)8.1 乙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (48)8.2 丙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (52)8.3 结核分枝杆菌感染诊疗的个体化分子检测 (56)8.4 人获得性免疫缺陷病毒感染诊疗的个体化分子检测 (57)附录 (65)参考文献 (66)1.本指南适用范围本指南由国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会编订,是国家卫生计生委个体化医学检测技术系列指南之一,旨为临床实验室进行感染性疾病相关的个体化医学分子检测提供参考和指导。
卫生部临床检验中心李金明教授解读《精准医学与临床实验室规范化》
卫生部临床检验中心李金明教授解读《精准医学与临床实验室规范化》近日,卫生部临床检验中心临床免疫室李金明主任,为大家讲述关于精准医学与临床实验室规范化的相关内容。
近年来,精准医学是一个特别热点的话题,尤其是2015年初奥巴马提出了“精准医学计划”,希望精准医学可以引领一个医学新时代。
而在此之前我们也经常听到一个概念叫“个体化治疗”,请问您认为这两个概念有哪些区别呢?李金明:这个问题其实提的非常好。
其实在我们讲精准医学之前,有一个概念叫个体化医学,英文叫“Personalized Medicine”,精准医学叫“Precision medicine”。
其实,这两个概念是一脉相承的,并且这两个概念在内容上是完全一致的。
在2008年美国总统科学与技术顾问委员会对“Personalized Medicine”这个概念有一个专门的定义,其核心含义是根据病人的遗传背景,也就是基因检测把病人分为两类。
分类是为了药物治疗,一类可以用这个药物,而另一类不适合这个药物,减少药物副作用(安全性),节省医疗资源(经济性)。
其实在2015年1月美国总统奥巴马提出了“Precision medicine”这个概念之前的5-6年,很多杂志上已经出现过这个概念。
这个概念的核心含义是根据患者的遗传背景、生活方式、环境因素等来量体裁衣的对患者用药,也是保证有效性、安全性和经济性。
所以“Precision medicine” 和“Personalized Medicine” 这两个概念是一脉相承的。
那么为什么后来欧美的学者要推动用“Precision medicine”替代“Personalized Medicine”,一个核心的原因就是怕民众造成误解。
因为“Personalized Medicine”的前身叫“Individual medicine”,说容易让民众理解为会为每一个人准备一种药物。
那么其实不是的,是把病人分类。
用“精准医学”能够更好的阐述,不容易造成误解,这是最主要的原因。
自身抗体检测的质量保证
抗核抗体(ANA)间接免疫荧光 (IF)检测标准化的关键点
多价和IgG特异的标记结合物:IF-ANA试验中这两种标记 物均可用到。SLE患者96%产生IgG类ANA,使用IgG特异 的标记结合物,不能检测与类风关、药物、年龄相关的 的标记结合物 能检 与类 关 药物 年龄相关的 IgM类ANA(通常无诊断意义),然而有4%的SLE患者产 生较大量的IgM ANA。 ANA 荧光标记物的参考制剂: The International Union of Immunological Societies (IUIS) 标准化委员会和WHO已 建立了两个WHO/IUIS 国际标准标记物制剂. FITC标记的 羊抗人 Ig (480010) and标记的羊抗人IgM (anti-u chain) 可从the WHO Immunology Unit (Geneva, Switzerland)得 到。其可用来检测商品或个别制备的标记物的特异性和检 测性能。 测性能
抗核抗体(ANA)间接免疫荧光 (IF)检测标准化的关键点
SS-A/Ro 抗原:使用小鼠或大鼠组织作为基质 时, SS-A/Ro 抗原量极少,测不到。人类上 SS A/Ro 皮样细胞系如Hep-2 或KB 细胞作为基质用丙 酮固定后,该抗原可检测到。使用这种基质, 酮固定后 该抗原可检测到 使用这种基质 一些所谓“ANA阴性”的SLE患者可出现阳性 结果。 结果 Anticentromere 抗体 :测定这种抗体,须采 用组织培养细胞系。 用组织培养细胞系 类风关相关的核抗原 类风关相关的核抗原(RANA):只存在于含 只存在于含 EB病毒基因组的细胞内。
理想的试剂
试剂的标准化
抗核抗体(ANA)间接免疫荧光 (IF)检测标准化的关键点
基质和固定剂:基质最常用Hep-2细胞。固定剂: 丙酮 使用乙醇或甲醇固定,或固定前洗基质, 丙酮(使用乙醇或甲醇固定,或固定前洗基质, 可溶解SS-A/Ro抗原及nRNP抗原,致假阴性结果) 参考区间:大多数细胞中DNA、组蛋白、Sm、 nuclear RNP和SS B/La含量高 但在特定组织中 RNP和SS-B/La含量高,但在特定组织中, SS-A/Ro, PCNA, RANA和Ku 抗原含量低。基质 中抗原含量的差异,影响测定的特异性和敏感性。 中抗原含量的差异 影响测定的特异性和敏感性 因此,每个实验室都应有其自己的参考区间。
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基因扩增仪器设备的质控
仪器设备
扩增仪
加样器 水浴箱 酶标仪
质控方法
频度
仪器校验实验 当仪器移动时
热电偶监测温度 每月一次
实验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定分区的多 少及各区域的空间大小。
至少具体需要多少个区,同样是“个体化”的,以“工作有序、互不干扰、防 止污染、报告及时“作为基本原则。
缓冲间的功能是“控制空气的流向”。 生物安全柜可考虑“A2”。
产前筛查与产前诊断(全基因组低拷贝测序技术)
3. 所申请的检验项目; 4. 患者的相关临床资料,包括初步诊断结果; 5. 样本采集日期和采集时间; 6. 实验室接受样本的日期和时间; 7. 与检验有关的既往史等; 8. 样本是否合格:有无癌变组织、血液样本有无溶血、容
器有无破损等。 9. 医生的签名。
患者的正确识别
(6)样本保存温度和时间的要求。用于DNA检测时,样本可在2~8℃ 保存72h。用于RNA检测时,样本一旦采集送达实验室后,如不能立 即提取,应冻存于-70℃。临床体液样本的长期保存(>2周)在保存 于-70℃。已提取纯化的RNA最好在乙醇沉淀后保存在-70℃。如果样 本中含有红细胞,应尽可能去除红细胞后,再进行冻存。石蜡包埋组 织则可在2-8℃长期保存。
在对患者进行取血或采样前,检验人员需要首先确 定患者的身份。
在对患者进行确认时,应准确核实患者的姓名、性 别、住院号等信息。对于不能说话的或意识不清醒 的患者应由相关陪同人员、医生或护士加以确认。
如果有腕带,患者的腕带上通常附有上述信息,采 血或取其他临床样本时检验人员应先确认这些信息。
(3)实验室应向样本采集人员明确以下信息(如有可能体现在申 请单中),具体包括:采集时间;采集部位;样本类型;采集量;采 样质量的要求;拒收样本的类型。
(4)样本运送和保存中的生物安全。
样本的采集、运送和保存(2)
(5)样本运送温度和时间的要求。DNA检测样本,可室温下运送, 建议8h内送至实验室。靶核酸为RNA时,10 min可室温运送,如所需 运送时间较长,则应将样本置于冰上,必须保证样本与冰屑充分接触, 且冰屑应达到样本的高度,建议采集后4h内送到。 冰冻组织样本最好 保证其在运送过程中不发生融化,石蜡包埋组织则可在室温下运送。
测序区空气流向 缓冲间扩增 与检测区 空气流向缓冲间
标本与文 库制备区 空气流向
缓冲间
试剂准备区
空气流向 缓冲间
专用走廊工作流向标本与制备区 扩增与检测区测序区
植入前胚胎遗传学诊断(全基因组低拷贝测序)
电泳区 空气流向 缓冲间增一区 空气流向 缓冲间
个体化医学检测质量保证指南
李金明 国家卫生计生委临床检验中心
适用范围
本指南适用于通过分析基因及基因结 构改变、基因表达及代谢变化,对患 者疾病进行预测、诊断、治疗决策、 监测和预后的临床检测。
标本采集、 运送和保 存(分析
前)
涉及临床医生 标本采集环节 和实验室
结果报告 解释及临
床应用 (分析后)
常见标本的类型
血液 分泌物 胸腹水 痰 粪便 尿 脑脊液 胚胎样本 骨髓穿刺样本/细针穿刺细胞 组织(新鲜组织、活检组织、手术切除样本、甲醛固定的石蜡包埋组
织(FFPET) )
临床分子诊断样本的接收
样本拒收标准:容器破损、量不够、时间不符 合要求、重度溶血、重度脂血、重度黄胆、无 靶细胞?
RNA:RNA易于降解,在-20℃条件下,RNA酶 也可能发挥作用。因此,纯化后的RNA应当经过 乙醇沉淀,并在-70℃以下保存。
分析中的质量保证
临床基因扩增检验实验室设计
产物分析区
空气流向 专用走廊
扩增区
空气流向 缓冲间
标本制备区
空气流向 缓冲间
试剂准备区
空气流向 缓冲间
工作流向
“各区独立 注意风向 因地制宜 方便工作”
样Hale Waihona Puke 的采集、运送和保存(1) 1. 基本原则 (1)应按照CFDA批准的检测试剂说明书制订的标准操作程序
(SOP)进行。如为实验室自制试剂,则实验室应当建立样本的采集、 运送和保存的SOP,并严格执行。
(2)样本采集和运送容器:密闭的、一次性、无菌、无核酸酶及其 他扩增抑制物。血液和骨髓穿刺样本通常需要先抗凝,抗凝剂一般应 EDTA和枸橼酸盐,避免使用肝素。如检测的靶核酸为胞内RNA,试 管内应含有一定量的RNA稳定剂。
专用走廊
WGA制备区
试剂准备区
空气流向 缓冲间
空气流向 缓冲间
遗传病诊断+肿瘤诊断与治疗(杂交捕获测序技术+Sanger测序验证)
电泳区测测序序区区文库检检测测区区空气流向空气流向
空气流向
缓冲
杂杂交交捕捕获获区区 ((扩扩增增一一区区))
用于肿瘤组织基因突变检测的样本,在分子检 测须由病理医师进行镜下肿瘤细胞评估,然后 富集肿瘤肿瘤细胞用于核酸提取。肿瘤细胞所 占比例应达到所用扩增检测方法的要求
纯化后的DNA和RNA的保存
DNA:如果纯化后的DNA无DNA酶的污染,则可 在TE缓冲液中室温保存26周;2-8℃保存一年;20℃保存7年;-70℃保存7年以上。怀疑可能存在 DNA酶污染的样本,则保存在-20℃以下。
DNA打断区
空气流向
空空气气流流向向
空气流向
缓冲间
缓冲间缓缓冲冲间间标本标与本与制文备区 库制备区试剂准备区
空气流向
空气流向
缓冲间
缓冲间
专用走廊
实验室仪器设备及管理
加样器:维护、校准 扩增仪:维护、校准 恒温干浴仪或水浴箱:维护、校准 离心机:维护 生物安全柜:维护 冰箱:维护
涉及实验室人 员和临床医生
质量 保证
室内质控 (分析中)
涉及实验室
室间质评 (分析中)
涉及实验室
分析前质量保证
申请单应包括的内容
1. 患者的惟一标识:患者的姓名、出生日期、性别、民族、 住院号、就诊科室、床号,有条件的医院尽量使用条码标 志或其他唯一标示;
2. 样本的类型:血液、其他体液、活检组织、手术切除样 本等;