Western_Blot详解及问题分析
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
确保膜和胶块之间没有气泡
缓冲液中离子浓度太低,电流或电压 太高。转膜过程注意降温
Western Blot
转移到膜上的蛋白很少 原 因 蛋白分子量< 10KD
蛋白的等电点< 9 SDS浓度不合适 凝胶太厚 蛋白分子量<10KD时,减 少转膜时间;使用小孔径 的膜 2. 更换高pH值Buffer 3. 在阴极buffer中加入 0.005 - 0.01% SDS 可提 高转膜效率 4. 延长转膜时间
① 100mM Tris-HCl(pH6.8) ② 200mM DTT ③ 4%SDS ④ 0.2%溴酚兰 ⑤ 20%甘油 ⑥ ddH2O
DTT可临用前以1:4比例混合加入,亦可全部配好分装,-20℃冻存。
按1:1比例与蛋白质样品混合,95~100℃加热5~15min, 冰上冷却后再上样,上样量一般为20-25μl,总蛋白量20~ 50μg。
Western Blot
【SDS-PAGE基本原理】
SDS-PAGE 是在蛋白质样品中加入SDS和含有巯基乙醇的 样品处理液,SDS是一种很强的阴离子表面活性剂,它可 以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级 和三级结构。 强还原剂巯基乙醇(或二硫苏糖醇,DTT)可以断开二硫
键破坏蛋白质的四级结构。使蛋白质分子被解聚成肽链 形成单链分子。解聚后的侧链与SDS充分结合形成带负电 荷的蛋白质-SDS复合物。 蛋白质分子结合SDS阴离子后,所带负电荷的量远远超 过了它原有的净电荷,从而消除了不同种蛋白质之间所 带净电荷的差异。蛋白质的电泳迁移率主要决定于亚基 的相对分子质量,而与其所带电荷的性质无关。
Western Blot
Western Blot常见问题分析
Western Blot
SDS-PAGE电泳
胶不平? 凝胶漏液? 胶板洗刷干净
加入AP和TEMED的量要合适
加入试剂后摇匀,使其充分混合,防 止部分胶块聚合不均匀
温度合适,受热不均匀导致胶聚合不
均匀 两块玻璃板底部要对齐
Western Blot
不连续电泳:
作用
浓缩胶 分离胶 使蛋白样品浓缩 使蛋白样品分离
缓冲液PH
pH6.8TrisCl pH8.8TrisCl
凝胶浓度
低,2-5% 高,根据蛋 白大小
电泳缓冲液:pH8.3 Tris-甘氨酸系统。
Western Blot
灌制分离胶
隔绝空气
ddH2O 0.1%SDS:<8% 异丁醇:>8%
蛋白质浓度测定的各种方法汇总:
http://bbs.bbioo.com/thread-23639-1-1.html
Western Blot
蛋白样品的变性
2×SDS-PAGE上样缓冲液:
1M Tris-HCl(pH6.8) 1M DTT SDS 甘油 溴酚蓝 总体积 10 ml 20 ml 4g 20 ml 0.2 g 100ml
Western Blot
转移膜的选择
最常用于Western Blot的转移膜主要是硝酸 纤维素(Nitrocellulose,NC)膜和聚偏二氟 乙烯 (Polyvinylidene Fluoride, PVDF)膜, 此外也有用尼龙膜、DEAE纤维素膜做蛋白 印迹。尼龙膜和NC膜的特点相似,主要用于 核酸杂交。 各种膜的详细特点介绍:
回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 最后用TBS漂洗膜2次,每次10min。
Western Blot
二抗与底物反应显色
•辣根过氧化物酶法(HRP)
•碱性磷酸酶法(AP)
•化学发光显色法(HRP)
Western Blot
膜解吸方法(膜的重复利用)
通过加热和去污剂进行解吸 原理:组合使用去污剂和加热使抗体解离, 适用于任何化学发光底物系统。 酸解吸 原理:使用低pH改变抗体结构从而使结合位 点失活,从而将抗体与抗原分离,适用于任 何化学发光底物系统。
http://www.bbioo.com/bio101/2008/21461_2.htm
Western Blot
湿转系统
Western Blot
半干转移系统
Western Blot
转膜后检测(此步可以省略)
丽春红染色 蛋白带出现后,于室温用去离子水漂洗硝酸纤 维素滤膜,换水几次。 印度墨汁染色 只用于放射性标记抗体或放射性标记A蛋白探 针的Western印迹过程。
有机溶剂提取法 对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取,
包括乙醇、丙酮和丁醇等。
通过层析或电洗脱法制备目的蛋白
Western Blot
蛋白样品的定量
目前常用比色法测定样品蛋白的含量:Bradford 法(考马斯亮蓝法)、Lowry法(Folin-酚试剂 法)、 BCA法等。但各有优缺点,大家可以根据 具体情况选取。按相应蛋白质定量试剂盒操作说 明操作,测定样品浓度。
Western Blot
SDS:
阴离子去污剂 变性剂 氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束。 蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电 荷量,消除了不 同分子之间原有的电荷差异。 与强还原剂一起使蛋白分子氢键、疏水键打开,使蛋白质分子线 性化。
Western Blot
Western Blot
Western Blot 流程
蛋白样品的制备
•SDS-PAGE •转膜 •封闭 •一抗杂交 •二抗杂交 •底物显色
Western Blot
蛋白样品的提取
通过有机溶剂或水溶法制备总蛋白
水溶液提取法 针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系 统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质 最常用的溶剂 。
蛋白质-SDS胶束的特点:
(1)具有相同的形状,形状 像一个长椭圆棒
(2)平均1g 蛋白质结合
1.4g SDS (3)短轴对不同的蛋白质亚 基-SDS胶束基本上是相同的 (4)长轴的长度则与亚基分
子量的大小成正比
Western Blot
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳
不连续的电泳缓冲体系。 SDS—蛋白质复合物在凝胶电泳时,不再受蛋白质电 荷与形状的影响,而只取决于蛋白质分子量的大小。
Western Blot
灌制积层胶
插入梳子
Western Blot
Staking gel
Separating gel
Western Blot
转膜
要将电泳后分离的蛋白质从凝胶中转移到固 相载体(例如NC膜)上,通常有两种方法: 毛细管印迹法和电泳印迹法。 常用的电泳转移方法有湿转和半干转。两者 的原理完全相同,只是用于固定胶/膜叠层和 施加电场的机械装置不同。
N,N’-亚甲基双丙烯酰胺(N,N’-methylenebisacylamide,
简称Bis)在催化剂和加速剂作用下聚合交联而成的三维网
状结构的凝胶。化学惰性强,具有一定的机械强度和透明
度。是良好的电泳介质。
Western Blot
聚丙烯酰胺凝胶的聚合方式:
• 单体:丙烯酰胺(Acr);
• 交联剂:甲叉双丙烯酰胺(Bis);
条带比正常的窄? “微笑”或“倒微笑” 条带?
Western Blot
转膜及抗体检测
凝胶肿胀或卷曲? 可将凝胶在转膜之前放到转膜缓冲液 中浸泡5-10min
条带歪斜或漂移?
单个或多个白点? 转膜缓冲液过热?
电转仪长期使用导致海绵变薄,“三
明治”结构不紧凑导致。可在两块海 绵之间垫上少许普通的草纸
(核黄素——TMTED)体系。
Western Blot
凝胶浓度与蛋白分离范围
凝胶浓度(%)
15
线性分离范围(KD)
12-43
10
7.5 5.0
16-68
36-94 57-212
SDS-PAGE浓缩胶(5% Acrylamide)及分离胶配方 表:http://bbs.bbioo.com/thread-20726-1-1.html
Western Blot
杂交信号很弱
原 因 抗体保存不当
抗原不充足 膜的漂洗过度
1.
1. 2. 3.
对 策
2.
3.
抗体长期保存应在-70℃ ,使用前做效价检测 增加蛋白上样量,做已知 标准量蛋白的对照 减少漂洗的时间和次数
Western Blot
出现非特异带
原因
1.
2.
一抗不是唯一特 异的 二抗出现非特异 结合
Western Blot
Western Blot 基本原理
Western Blot
Western Blot 优点
高分辨率的电泳技术 特异敏感的抗原-抗体反应
1-5ng中等大小的靶蛋白
Western Blot
Western Blot应用
目的蛋白的表达特性分析 目的蛋白与其它蛋白的互作 目的蛋白的组织定位 目的蛋白的表达量分析
Western Blot
SDS-PAGE电泳
凝胶聚合不均匀,灌胶时候尽量混合 均匀,动作轻缓 拔梳子要迅速,清洗加样孔要小心, 以免把上样带扭曲 样品盐浓度过高会挤压其他条带导致 宽窄不一,纯化样品,调整盐浓度 胶板底部有气泡会影响电泳效果,应 赶走气泡。同时注意电泳槽装置是否 合适
Western Blot
凝胶成分
丙烯酰胺和N,N’-亚甲双丙烯酰胺 SDS 配胶的Tris缓冲液 TEMED 过硫酸铵 Tris-甘氨酸电泳缓冲液
Western Blot
PAGE:聚丙烯酰胺凝胶
聚丙烯酰胺凝胶(polyacrylamide gel)是由单体丙烯酰 胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂(crosslinker)
Western Blot
封闭
为避免作为检测试剂的特异性第一抗体与膜 发生非特异性结合,使非特异性背景提高, 需对膜上的潜在结合位点进行封闭处理。
5%脱脂奶粉或BSA(室温孵育1h) Western Blot 膜封闭液(生物试剂公司) Tween-20的作用:减少非特异性吸附,不影
响抗体与抗原的结合。
Western Blot
一抗、二抗孵育
把NC膜放在密闭塑料袋或者培养皿中,根据膜面积以 0.1mL/cm2的量加入一抗溶液,摇床上平缓摇动,于室 温孵育1-2小时或4℃过夜。
回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。
加入用封闭液配制的二抗,摇床上缓慢摇动,于室温 孵育1-2小时或4℃过夜。
• 催化剂:过硫酸胺或核黄素(AP); • 加速剂:四甲基乙二胺(TEMED);
Biblioteka Baidu
• 产物:三维网状结构凝胶
• 聚丙烯酰胺凝胶聚合机理是通过提供氧游离基(free radicals) 的催化,使体系发生氧化还原作用(catalyst-redox systems)来
完成的。催化体系主要有化学催化(AP—TEMED)和光化学催化
蛋白质免疫印迹技术及
常见问题分析
张绍进
Western Blot
Western Blot简介
Western Blot一般流程 Western Blot常见问题分析
Western Blot
Western Blot 简介:
印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利 用相应的探测反应来检测样品的一种方法。
1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC
膜)上,并利用DNA-RNA杂交检测特定的DNA片段的方 法,称为Southern印迹法。
而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,
对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的 蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后 蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法。
Western Blot
Western Blot结果分析
目的蛋白的灰度值除以内参的灰度值以校正 误差,所得结果代表某样品的目的蛋白相对 含量。 Western Blot结果分析软件Gel-Pro Analyzer 4 绿色版(附动画演示教程)
http://bbs.bbioo.com/thread-44929-1-1.html
1.
1. 2. 3. 4.
对 策
Western Blot
背景太高
原 因 膜没有均匀浸湿
膜或者缓冲液污染 封闭不充分 抗体与封闭剂出现交 叉反应 抗体浓度过高
1.
1.
2.
3. 4.
2.
对 策
3.
5.
4.
转膜前用100%甲醇将膜完 全浸湿 拿取膜与吸水纸时要戴手 套,更换新鲜转膜缓冲液 检测一抗、二抗与封闭剂 是否有交叉反应 杂交前检测一抗、二抗的 工作浓度