GEO数据库使用
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GEO数据库使用
GEO Introduction
GEO: GSM(样本编号）, GLP（检 测平台）, GSE（基因数据结果）
Loading GEO dataset
GSE41804_family
GSE41804_series_matrix
基因表达的分析
确定要分析的基因，列出该基因mRNA的NCBI标记号如 NM_101523，有的基因有多个转录本，可能有多个mRNA 标记号。
在下载的GEO数据库family.soft表中搜索该基因的标记号 确定该基因对应的基因芯片号。
用该基因芯片号在GEO数据库series_matix表中搜索该芯 片号对应的所有样本的荧光信号值即基因表达值。分析不 同样本中该基因的表达差异。
根据样本数据确定该基因的高ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ达组和低表达组，进行相 应的数据分析。
进行多个基因的表达相关性分析。
GEO Introduction
GEO: GSM(样本编号）, GLP（检 测平台）, GSE（基因数据结果）
Loading GEO dataset
GSE41804_family
GSE41804_series_matrix
基因表达的分析
确定要分析的基因，列出该基因mRNA的NCBI标记号如 NM_101523，有的基因有多个转录本，可能有多个mRNA 标记号。
在下载的GEO数据库family.soft表中搜索该基因的标记号 确定该基因对应的基因芯片号。
用该基因芯片号在GEO数据库series_matix表中搜索该芯 片号对应的所有样本的荧光信号值即基因表达值。分析不 同样本中该基因的表达差异。
根据样本数据确定该基因的高ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ达组和低表达组，进行相 应的数据分析。
进行多个基因的表达相关性分析。