现代分子生物学重点
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现代分子生物学
第一章
DNA的发现:
1928年,英国Griffith的体内转化实验
1944年,Avery的体外转化实验
1952年,Hershey和Chase的噬菌体转导实验
分子生物学主要研究内容(p11)
DNA的重组技术
基因表达调控研究
生物大分子的结构功能研究——结构分子生物学
基因组,功能基因组与生物信息学研究
第二章
DNA RNA组成
脱氧核糖核酸 A T G C 核糖核酸 A U G C
原核生物DNA的主要特征
①一般只有一条染色体且带有单拷贝基因;
②整个染色体DNA几乎全部由功能基因与调控序列组成;
③几乎每个基因序列都与它所编码的蛋白质序列呈线性对应状态。
染色体作为遗传物质的特点:
(1)分子结构相对稳定(贮存遗传信息)
(2)通过自我复制使前后代保持连续性(传递遗传信息)
(3)通过指导蛋白质合成控制生物状态(表达遗传信息)
(4)引起生物遗传的变异(改变遗传信息)
C值以及C值反常
C值单倍体基因组DNA的总量
C值反常C值往往与种系进化的复杂程度不一致,某些低等生物却有较大的C值。如果这些DNA 都是编码蛋白质的功能基因,那么,很难想象在两个相近的物种中,他们的基因数目会
相差100倍,由此推断,许多DNA序列可能不编码蛋白质,是没有生理功能的。
DNA的中度重复序列,高度重复序列
中度各种rRNA,tRNA以及某些结构基因如组蛋白基因都属于这一类
高度卫星DNA
核小体
是由H2A H2B H3 H4 各2分子生成的八聚体和约200bp的DNA构成的,H1在核小体外面。
真核生物基因组的结构特点
①基因组庞大;
②大量重复序列;
③大部分为非编码序列,90%以上;
④转录产物为单顺反子;
⑤断裂基因;
⑥大量的顺式作用元件;
⑦DNA多态性:SNP和串联重复序列多态性;
⑧端粒(telomere)结构。
DNA的一级结构,二级结构
一级机构
指构成核酸的四种基本组成单位--脱氧核糖核苷酸(核苷酸)的连接和排列顺序,表示了该DNA分子
的化学组成。
DNA一级结构基本特点
①DNA由2条相互平行的脱氧核苷酸盘绕而成;
②DNA分子中的脱氧核糖和磷酸连接,排列在外侧,构成基本骨架,碱基排在内侧;
③两条链的碱基按照碱基互补配对原则通过氢键结合形成碱基对。
DNA的二级结构
定义:指两条脱氧多核苷酸链反向平行盘绕所组成的双螺旋结构。
两条相同、反向结合、碱基互补配对、氢键
分类:根据DNA双螺旋结构螺距和旋转方向不同,可以分为B-DNA,A-DNA,Z-DNA等
半保留复制:
DNA在复制前氢键断裂,双螺旋解旋并分开,每一条作为合成新链的模板,按碱基配对的规则产生互补的两条链。因此子代DNA双链中一条是原来的链,另一条是新合成的。
复制子(replicon):DNA复制时,并不是整条链全部打开,而是在复制的局部将链打开,形成复制单位。
即从起始位点到终止位点的全部DNA。
复制叉(replication fork):DNA分子在复制时,在复制起始位点两条链解开成单链,各自作为模板合成
互补链,所以这个复制起点呈现叉子的形式。
环状DNA的复制
⑴θ型⑵滚环型(rolling cycle)⑶D-环型(D-loop)
原核生物DNA复制的特点:
最小复制起始位点:一段245bp的序列,3个13聚体的回文结构+4个9聚体的重复序列(复制起始蛋白结合位点)。
原核DNA复制的过程:
1、DNA双螺旋的解旋
⑴解旋酶(helicase):dnaB编码的DnaB,通过水解ATP获得能量,沿5’→3’方向解开DNA双链。
(Rep 3’→5’)
⑵单链DNA结合蛋白(SSB):能结合并覆盖在单链DNA上,防止解开的DNA单链被酶降解以及
重新结合成双链,以保持单链的存在。原核生物SSB具“协同作用”。
⑶DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase):催化DNA断裂和重新连接。
2、DNA复制的引发
引发酶:引物合成。DNA聚合酶不能引发DNA新生链的合成,先由引发酶催化合成RNA引物,DNA聚合酶再从RNA引物3’端开始合成新的DNA链。
后随链:引发前体(6种蛋白组成)+引发酶组成引发体,发挥功效。
3、冈崎片段与半不连续复制
半不连续复制(semidiscontinuous replication):DNA复制时其中一条子链的合成是连续的,而另
一条子链的合成是不连续的,故称半不连续复制。
DNA复制时,DNA聚合酶合成方向都是5’→3’方向延伸。合成方向与复制叉移动的方向一致并连续合成的链为先导链(领头链);合成方向与复制叉移动的方向相反,先按5’→3’顺序合成一短DNA(冈崎片段),再连成一条完整的DNA链为滞后链(随从链)。
4、复制的终止
复制终止子序列(Ter):特定终止区域,Ter-tus复合物使DnaB不再解链,阻挡复制叉前移。
5、DNA聚合酶
以DNA为模板的DNA合成酶
以四种dNTP为底物
反应需要有模板的指导
Mg2+存在
反应需要有3 -OH存在