肺癌驱动基因研究

YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
EGFR突变率分布 (N = 147)
3%
2%
7%
2%
外显子21 39%
外显子19 47%
外显子19+21 外显子18 外显子20+21 外显子20 外显子21 外显子19
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
c-Met
PIK3CA
NSCLC 不吸烟 吸烟
4.5% (20/448)
4.3% (11/255)
4.7% (9/193)
DDR2、FGFR2突变仅见于不吸烟者
4.4% (20/452)
4.6% (12/260)
4.2% (8/192)
STK11
7.9% (8/101) 2.1% (1/48) 13.2% (7/53)
1.5%(7/452)
2
0
1
0
2
PTEN
9.5%(21/220)
6
1
0
1
0
0
ALK
6.3%(15/239)
1
1
0
0
0
0
1
DDR2
1.2%(2/166)
0
0
0
0
0
0
0
0
FGFR2 0.6%(1/165)
0
0
0
0
0
0
0
0
0
23例EGFR突变的患者同时伴c-MET扩增或STK11、PIK3CA、BRAF或PTEN突变
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
吸烟状态对驱动基因突变频率的影响
组别
EGFR
PTEN
NSCLC 不吸烟 吸烟
28.4% (147/517)
40.9% (119/291)
12.4% (28/226)
9.5% (21/220)
6.3% (7/112)
13.0% (14/108)
组别
例数
主要激活突变或氨基酸变化
8
M125–Y126缺失,S59缺失,S69X,L9–S213 缺失
21 C71F,N91K,Q298X,Y68H
27
27
12例伴G12C,5例伴G12V,5例伴G12D,5伴 其他
20
外显子9
13
外显子20
6
外显子9+20
1 1例同时伴外显子9和20突变
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
基因突变特征(一)：EGFR (N=147)
外显子/区域 外显子18 外显子19 外显子20 外显子21 外显子19+21 外显子20+21
例数
主要激活突变或氨基酸变化
3 G719A,G719V,G719D
68
E746–A750缺失,E746–S752缺失,L747– A750(751,753)缺失
524例入选：腺癌354 例、鳞癌144例、大细 胞癌26例学证实肺癌
检测以下基因的变化： EGFR、KRAS、cMet、PIK3CA、BRAF、 PTEN、ALK、FGFR2、 DDR2和STK11
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
患者特征 (n=424)
变量 性别 年龄(岁) 是否吸烟 组织学状态
11 T790M,R776H
57 L858R,L858M,L861R
3 合并外显子19缺失和外显子21L858R
5 合并外显子20T790M和L858R,R776H和L858R
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
基因突变特征(二)
基因 STK11 PTEN KRAS
PIK3CA
外显子/区域 外显子1–5 外显子1–9 合计 密码子12 合计
分期
随访状态
组别 男 女 平均 范围 否 是 AC SCC LCC I II III IV 生存 死亡
例数(%) 361(68.9) 163(31.1)
59.3 23–88 292(55.7) 232(44.3) 354(67.6) 144(27.5) 26(4.9) 143(27.3) 72(13.7) 135(25.8) 174(33.2) 386(73.7) 138(26.3)
突变NSCLC患者的标准一线治疗 TKI耐药与KRAS突变、T790M突变和MET基因扩增有关
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
研究目的
广东省人民医院肺癌突变研究项目(Guangdong General Hospital Lung Cancer Mutation Project，GGHLCMP) 目的是研究烟草消费和组织学类型对驱动基因发生率的影 响，确定富含驱动基因的亚组人群
基因突变特征(三)
基因 BRAF
DDR2
FGFR2
外显子/区域 合计 外显子11 外显子15 合计 外显子6 外显子16 合计 外显子7
例数 7 4 3 2 1 1 1 1
主要激活突变或氨基酸变化
M117V R680L P303R
PLoS One. 2012;7(6):e40109.
驱动基因重叠突变
研 究 的 驱 动 基 因 谱 包 括 中 国 原 发 性 肺 癌 患 者 EGFR 、 KRAS 、 c-Met 、 PIK3CA 、 BRAF 、 STK11 、 PTEN 、 EML4-ALK融合基因、 DDR2和 FGFR2 基因
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
基于组织学类型和吸烟状态对非小细胞肺癌 患者驱动基因分析
YL .Wu PLoS One. 2012;7(6):e40109
研究背景
肺 癌 驱 动 基 因 包 括 EGFR 、 KRAS 、 BRAF 、 PIK3CA 和 EML4ALK。肿瘤的产生与进展与这些基因有关
其他基因包括STL11、PTEN、DDR2和 FGFR2等 靶向作用的EGFR-TKI，包括厄洛替尼和吉非替尼已成为伴EGFR
1219 例 剔 除 ： 门 诊丢失资料或合并 其他肿瘤
基因分析 N=1800
研究设计
57 例 剔 除 ： 8 例 腺 鳞 癌、13例其他肿瘤、 17 例 SCLC、 19 例 取 样前用过TKI
581例 组织学 证实肺癌
包括EGFR、KRAS、 ALK、ERCC1、β-微 管 蛋 白 、 RRM1 或 cMet
基因
合计
EGFR STK11 KRAS c-Met PIK3CA BRAF PTEN ALK DDR2
EGFR
28.4%(147/517)
STK11
8.9%(9/101)
1
KRAS
5.4%(27/498)
0
0
c-Met
4.5%(20/448)
7
0
1
PIK3CA 4.4%(20/452)
7
0
1
0Leabharlann Baidu
BRAF