核酶PPT课件
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第七讲核酶
核酶的发现被认为是近十多年生化领域内最令人鼓舞的发
现之一。为此Cech和Altman共同获得了1989年度诺贝尔化 学奖。
The Mi RNA in ribonuclease P is catalytic The intron in the pre-rRNA of Tetrahemena is self-spliced
剪接机制 L-19IVS在体外的多种酶活性 核酶是一种金属依赖酶 结构与功能的关系
Ⅰ类内含子的剪接机制
I型内含子核酶所催化的典型反应是包括两步磷酸酯键转移反应的
RNA剪接反应.在这个反应中需要镁离子、外源鸟苷或其磷酸化衍 生物(GMP、GDP、GTP).
首先,一个外源鸟苷的3羟基攻击5 ’剪接位点的磷原子,并与内
氨基酸就可以形成1个蛋白质酶的三维结构,
而且其活性中心具有很强的刚性。
而由4种核苷酸组成的核酶则不具有蛋白质酶
的这些特性。科学研究表明:核酶需要较大的
结构才能提供较稳定的活性中心,从而有效地
提高反应速度;而小的核酶结构只勉强可以满
足催化反应的需要。最小的天然核酶---锺头
核酶的基本结构也不少于30个核苷酸。
锤头核酶 发夹核酶 剪切型核酶 丁型肝炎病毒(HDV)核酶 RNaseP Ⅰ类内含子 剪接型核酶 II类内含子
根据催化反应
二、剪接型核酶
剪接型核酶的作用机制是通过既剪有接的方
式除去内含子(Intron).
剪接型核酶分类
1、I类内含子
2、II类内含子
1.I类内含子的自我剪接(Self-splicing)
(二)核酶与蛋白质酶的比较
1. 核酶与蛋白质酶在结构上的比较 蛋白质是由20多种不同的氨基酸组成的多肽 聚合物,而核酶是由4种核苷酸组成的聚合 物,因此蛋白质的一级结构要比核酶复杂的 多。
核酶
4、核酶抗肝炎病毒的研究 目前人们已进行了核酶抗甲型肝炎病毒(HAV)、乙型 肝炎病毒( HBV)、丙型肝炎病毒( HCV)以及HDV作 用的研究
5、抗人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-Ⅰ)核酶 1998年,美国加利福尼亚大学Wong-Staal等利用 发夹核酶抑制HIV-Ⅰ基因表达,并在Ⅰ期临床实验中受到 良好效果。
蓝(N.
Lan)等对镰形细胞贫血突变的β珠蛋白
mRNA(βS RNA)进行了修复 。
4 核酶技术在化妆品方面应用
随着反义核酶技术的发展和成熟,已逐渐应用于抗某些人体寄生虫病 的研究。 采用反义技术开发新的生物医学美容产品,使生物医学美容从生理上 完成人体的延缓衰老、抗皱、去痘、美白与健康, 已经成为高科技化妆品研究的一个热点
化学本质是RNA; 底物:RNA、肽键、ā-葡聚糖分支酶 反应特异性(专一性),依据碱基配对; 催化效率低 是一种金属依赖酶
三、核酶(ribozyme)的分类
锤头核酶 发夹核酶 剪切型核酶 丁型肝炎病毒(HDV)核酶
根据催化反应 剪接型核酶
RNaseP I内含子
II内含子
2.剪切型核酶
2 白血病是造血系统的恶性肿 瘤,目前尚缺少有效的治疗方法 。核酶的发现,尤其是锤头状 核酶,为白血病的基因治疗带 来了新的希望。
核酶的应用
3 抗肿瘤治疗
核酶是天然的具有催化能力的RNA分 子,能特异性地催化RNA剪接。 针 对某些病原或肿瘤的基因设计特异性 核酶,并将其导入细胞以阻断或降低 这些基因在细胞内的表达,最终可达 到抑制病原增殖、肿瘤扩散的目的。
3、抗生素对活性的影响:大多数为抑制效应;
酶九章-核酶 PPT课件
第九章
核 酶 工 程
1981年Cech等发现四膜虫的核 糖体前体RNA可以在没有蛋白 质存在的情况下自身催化切除 内含子,完成加工过程。
该具有催化活性的RNA的 发现改变了传统上“酶是蛋白 质” 的观念,从此对具有催化 活性的RNA,即核酶(ribozyme) 的结构、催化机制以及应用的 研究日益深入。
核酸酶
剪切型或 分子间催化剪切型 核酸酶
自身催化剪切型或 分子内催化剪切型 核酸酶
核酸酶
似乎最有应用前景,因为人们 对它的剪切机制和分子结构要 求已经有所了解,可以针对病 毒核酸、不良基因或恶性基因 进行人工设计、合成相应的各 种RNA或DNA片段作为核酸酶基 因,定向地剪切病毒核酸或不 良基因以及它们的转录中间产 物,抑制它们的表达,进行疾
三 蛋白质-RNA复合酶(RNaseP)
蛋白质-RNA复合酶主要催化 tRNA前体成熟过程。
——例如S. Altman和N. Pace两个 研究组合作发现的大肠杆菌 tRNA5’成熟酶。
蛋白质-RNA复合酶酶由蛋白质和 M1RNA两个组分构成.
——蛋白质的分子量为20kDa, ——M1RNA含有377个核苷酸。 M1RNA单独具有全酶活性, 蛋白质只是维护M1RNA的构 象。
实验证明来自不同原核细胞 RNaseP中的M1RNA具有相似的三维 结构。
——与前面几种剪切型核酶不同的是, RNaseP催化得到的产物的3’端是羟基, 5’端是磷酸。
四
组I内含子和组II内含子
组I内含子(group I intron)和组II 内含子(group II intron)
——这类核酶比较复杂,通常包 括200个以上核苷酸,主要催化 mRNA前体的拼接反应。
核酸分子在总体的催化潜 力上和蛋白质相差甚远,但由 于可以遗传和变异而被自然界 保留下来催化一些特殊的反应。
核 酶 工 程
1981年Cech等发现四膜虫的核 糖体前体RNA可以在没有蛋白 质存在的情况下自身催化切除 内含子,完成加工过程。
该具有催化活性的RNA的 发现改变了传统上“酶是蛋白 质” 的观念,从此对具有催化 活性的RNA,即核酶(ribozyme) 的结构、催化机制以及应用的 研究日益深入。
核酸酶
剪切型或 分子间催化剪切型 核酸酶
自身催化剪切型或 分子内催化剪切型 核酸酶
核酸酶
似乎最有应用前景,因为人们 对它的剪切机制和分子结构要 求已经有所了解,可以针对病 毒核酸、不良基因或恶性基因 进行人工设计、合成相应的各 种RNA或DNA片段作为核酸酶基 因,定向地剪切病毒核酸或不 良基因以及它们的转录中间产 物,抑制它们的表达,进行疾
三 蛋白质-RNA复合酶(RNaseP)
蛋白质-RNA复合酶主要催化 tRNA前体成熟过程。
——例如S. Altman和N. Pace两个 研究组合作发现的大肠杆菌 tRNA5’成熟酶。
蛋白质-RNA复合酶酶由蛋白质和 M1RNA两个组分构成.
——蛋白质的分子量为20kDa, ——M1RNA含有377个核苷酸。 M1RNA单独具有全酶活性, 蛋白质只是维护M1RNA的构 象。
实验证明来自不同原核细胞 RNaseP中的M1RNA具有相似的三维 结构。
——与前面几种剪切型核酶不同的是, RNaseP催化得到的产物的3’端是羟基, 5’端是磷酸。
四
组I内含子和组II内含子
组I内含子(group I intron)和组II 内含子(group II intron)
——这类核酶比较复杂,通常包 括200个以上核苷酸,主要催化 mRNA前体的拼接反应。
核酸分子在总体的催化潜 力上和蛋白质相差甚远,但由 于可以遗传和变异而被自然界 保留下来催化一些特殊的反应。
5第五章核酶课件
二、自剪接型机制
Cech小组研究四膜虫26s per-rRNA基因转录问题时,发现转录产物很不稳 定,几秒钟之内自动切除413nt的内含子片段,并产生成熟的rRNA分子, 此过程没有任何蛋白质或酶存在情况下发生。
第Ⅰ类剪 接 在G、GMP、GDP或GTP辅因子参与下, RNA能自身剪接
pG-3'-OH作为亲核基团进攻内含子5'末端剪切接点的磷酸基团使3'-磷酸酯 键准确断裂,产生新5'-端和新3'-端。
1983年Altman和Pace报道RNaseP可催化per-tRNA加工。
RNaseP Per-tRNA
5-端成熟的tRNA
A G
UA
CA
CG
CG
UG
UA CG
A C
pppG
CPAoGrtGioCnCrAemGUovAeAdAbAyARGNCaAseUPUACCCCUGpG
C A C
水解3-磷酸酯键留下成熟的5-端的p-G
N.Pace两个研究组合作发现E.coli tRNA5'-端成熟酶(RNase P)。
这种酶由蛋白质和M1RNA两个组分构成,其中蛋白质的分子只 是维护M1RNA的构象。实验证明,来自不同原核生物细胞蛋白 质-RNA复合酶中的M1RAN具有相似的三维结构。与前面几种 剪切型核酶不同的是,蛋白质-RNA复合酶催化得到的产物的3'-
5' per-rRNA UpCpUpApApApNN---NN GpUpApAp
3'
pG3'-OH
Mg2+
5' pGpApApAp
亲核进攻UpA间磷原 子使3'-磷酸酯键断裂
5'
核酶抗体酶ppt课件
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3、核酶作用的特点
化学本质 RNA 底物 RNA 肽键 ā-葡聚糖分支酶 反应特异性(专一性)碱基 催化效率 低 产物
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4.核酶的分类
锤头核酶
发夹核酶 剪切型核酶 丁型肝炎病毒(HDV)核酶
根据催化反应
RNaseP
I内含子
剪接型核酶 II内含子
2. 免疫源性低,很少引起免疫反应。 3. 针对锤头核酶而言,催化结构域小,既可作为转基因表达产 物,也可以直接以人工合成的寡核苷酸形式在体内转运。
二、在其他领域的应用
防治动、植物 病毒侵害:马铃薯纺锤形块茎类病毒负链 的多价核酶构建,马铃薯卷叶病毒复制酶基因负链的突变 核酶的克隆等
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剪切位点
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RNaseP底物的二级结构
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1、转核苷酸作用 2CpCpCpCpC CpCpCpCpCpC +CpCpCpC
2、水解作用 CpCpCpCpC CpCpCpC + pC
3、转磷酸作用 CpCpCpCpCpCp+UpCpU
CpCpCpCpCpC + UpCpUp 4、去磷酸作用
核糖核酸酶P(RNaseP)是内切核酸酶,是核
糖核蛋白体复合物,能剪切所有tRNA前体的 5‘端,除去多余的序列,形成3’-OH 和 5’磷酸末端。
RNaseP由M1RNA和蛋白质亚基组成。
体外: M1RNA具催化作用
蛋白质作为辅助因子
体内: M1RNA和蛋白质对酶活性都是必需的。
2、1剪切机制 Mg 2+
2、2结构与功能的关系 M1RNA 5‘端完 整结构对维持催化活性是必需的。
3、核酶作用的特点
化学本质 RNA 底物 RNA 肽键 ā-葡聚糖分支酶 反应特异性(专一性)碱基 催化效率 低 产物
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4.核酶的分类
锤头核酶
发夹核酶 剪切型核酶 丁型肝炎病毒(HDV)核酶
根据催化反应
RNaseP
I内含子
剪接型核酶 II内含子
2. 免疫源性低,很少引起免疫反应。 3. 针对锤头核酶而言,催化结构域小,既可作为转基因表达产 物,也可以直接以人工合成的寡核苷酸形式在体内转运。
二、在其他领域的应用
防治动、植物 病毒侵害:马铃薯纺锤形块茎类病毒负链 的多价核酶构建,马铃薯卷叶病毒复制酶基因负链的突变 核酶的克隆等
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剪切位点
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RNaseP底物的二级结构
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1、转核苷酸作用 2CpCpCpCpC CpCpCpCpCpC +CpCpCpC
2、水解作用 CpCpCpCpC CpCpCpC + pC
3、转磷酸作用 CpCpCpCpCpCp+UpCpU
CpCpCpCpCpC + UpCpUp 4、去磷酸作用
核糖核酸酶P(RNaseP)是内切核酸酶,是核
糖核蛋白体复合物,能剪切所有tRNA前体的 5‘端,除去多余的序列,形成3’-OH 和 5’磷酸末端。
RNaseP由M1RNA和蛋白质亚基组成。
体外: M1RNA具催化作用
蛋白质作为辅助因子
体内: M1RNA和蛋白质对酶活性都是必需的。
2、1剪切机制 Mg 2+
2、2结构与功能的关系 M1RNA 5‘端完 整结构对维持催化活性是必需的。
核酶课件(ribozyme)47页PPT
25、学习是劳动,是充满思想的劳动。——乌申斯基
谢谢!
核酶课件(ribozyme)
6、纪律是自由的第一条件。——黑格 尔 7、纪律是集体的面貌,集体的声音, 集体的 动作, 集体的 表情, 集体的 信念。 ——马 卡连柯
8、我们现在必须完全保持党的纪律, 否则一 切都会 陷入污 泥中 ——马 克思 9、学校没有纪律便如磨坊没有水。— —夸美 纽斯
10、一个人应该:活泼而守纪律,天 真而不 幼稚, 勇敢而 鲁莽, 倔强而 有原则 ,热情 而不冲 动,乐 观而不 盲目。 ——马 克思
21、要知道对好事的称颂过于夸大,也会招来人们的反感轻蔑和嫉妒。——培根 22、业精于勤,荒于嬉;行成于思,毁于随。——韩愈
23、一切节省,归根到底都归结为时间的节省。——马克思 24、意志命运往往背道而驰,决心到最后会全部推倒。——莎士比亚
谢谢!
核酶课件(ribozyme)
6、纪律是自由的第一条件。——黑格 尔 7、纪律是集体的面貌,集体的声音, 集体的 动作, 集体的 表情, 集体的 信念。 ——马 卡连柯
8、我们现在必须完全保持党的纪律, 否则一 切都会 陷入污 泥中 ——马 克思 9、学校没有纪律便如磨坊没有水。— —夸美 纽斯
10、一个人应该:活泼而守纪律,天 真而不 幼稚, 勇敢而 鲁莽, 倔强而 有原则 ,热情 而不冲 动,乐 观而不 盲目。 ——马 克思
21、要知道对好事的称颂过于夸大,也会招来人们的反感轻蔑和嫉妒。——培根 22、业精于勤,荒于嬉;行成于思,毁于随。——韩愈
23、一切节省,归根到底都归结为时间的节省。——马克思 24、意志命运往往背道而驰,决心到最后会全部推倒。——莎士比亚
核酶 (2)
3、抗生素对活性的影响:大多数为抑制效应;
4、变形剂对活性的影响 5、温度对活性的影响:在65℃范围内随温度升高而增 加,37 ℃时均有适宜的活性。
核酶的应用
一 抗病治疗
二 RNA的治疗 三 核酶在医学上的应用 四 化妆品方面的应用 五 其他
一 抗病治疗
1 对于艾滋病毒HIV的转录信息 来源于RNA而非DNA,核酶能够 在特定位点切断RNA,使得它失 去活性。
蓝(N.
Lan)等对镰形细胞贫血突变的β珠蛋白
mRNA(βS RNA)进行了修复 。
4 核酶技术在化妆品方面应用
随着反义核酶技术的发展和成熟,已逐渐应用于抗某些人体寄生虫病 的研究。 采用反义技术开发新的生物医学美容产品,使生物医学美容从生理上 完成人体的延缓衰老、抗皱、去痘、美白与健康, 已经成为高科技化妆品研究的一个热点
2‘
p 5‘
HO-A
Ⅱ 类 内 含 子 的 剪 接 机 制
p
3‘
套环的形成
Mg 2+
3’
OH
p-A
p
第一次转 酯基反应 中利用一 个位于内 含子中的 腺苷酸残 基作为亲 核体
外显子连接 p
P-A
HO 3’
影响核酶活性的因素
1、pH值对活性的影响:pH7.0-7.5时核酶活性最高; 2、二价金属阳离子对活性的影响:如Mg 2+ Mn 2+;
价金属离子参与。
单金属离子催化
双金属离子催化
锤头结构的 五种类型
R示酶,S示底物,箭头示剪切位点
1.剪接型核酶
(1)定义
指RNA分子被磷酸二酯酶水解切割后,伴随着形成新的 磷酸二酯键,即磷酸二酯键的转移反应或称转酯反应。
第八章 核酶和抗体酶 PPT课件
一、 抗体酶概述
概念
• 是一种具有催化功能的免疫球蛋白(抗体分子), 在其可变区赋予了酶的属性,属于化学人工酶
酶与抗体的差别
酶是能与反应过渡态选择结合的催化性物质,抗 体是和基态分子结合的非催化性物质
二、 抗体酶的催化反应
1、酰基转移反应
二、 抗体酶的催化反应
2、重排反应
二、 抗体酶的催化反应
Thomas Cech University of Colorado at Boulder, USA
一、核酶的发现
1983年美国S.Altman等研究RNaseP(由20%蛋 白质和80%的RNA组成),发现RNaseP中的RNA可 催化E. coli tRNA的前体加工
Sidney Altman Yale University New
这类RNA进行自 身催化的反应是只切 不接。
特点:在 Mg 2+ 或其 他二价金属离子存在 下,在特定的位点, 自我剪切,产生5’OH 和2’,3’-环磷酸 二酯末端。
核酶自身剪切反应
锤头型核酶的二级结构 和空间立体结构示意图
三个双螺旋区 13个核苷酸残基保 守序列
剪切反应在右上方 GUX序列的3’端自 动发生
3、氧化还原反应
二、 抗体酶的催化反应
4、金属螯和合反应
二、 抗体酶的催化反应
5、磷酸酯水解反应
二、 抗体酶的催化反应
6、磷酸酯闭环反应
二、 抗体酶的催化反应
7、光诱导反应
a. 光聚合反应(二聚作用)
二、 抗体酶的催化反应
7、光诱导反应
b. 光裂解反应
三、 抗体酶的制备方法
1、拷贝法 2、引入法
I型内含子
根 剪接型核酶
第四节 核酶、抗体酶、同功酶、酶工程
固定化酶具有可反复使用,酶性能稳定,产物易分离等优点。 例:酶电极
2. 生物酶工程
酶学和DNA重组技术相结合。
基因工程技术大量生产克隆酶 基因定点突变,获得遗传修饰酶
设计新酶基因,合成优质酶
Fig.2-42 Schematic illustration of DNA cloning.
天然存在的酶。
指当细胞加入特定诱导物后诱导产生 的酶。诱导物一般是底物或其类似物。
例:大肠杆菌-半乳糖苷酶的诱导生成
去掉
-半乳糖苷酶 ( g )
诱导物
加入
诱导物
细菌蛋白总量(g)
Fig.3ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ28 -半乳糖苷酶的诱导生成
五、 酶工程
(一)酶在工业、农业、医药及科学研究中的巨大作用
工业:淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、凝乳酶等。 农业:淀粉酶、纤维素酶、果胶酶等 医药:血清GPT、GOT; 乳酸脱氢酶H4、 M4
抗原结合部位 重链(H) 轻链(L) 铰链区 V:可变区 C:恒定区 Fc:基部片断 Fab: 臂片断(抗原结合片断)
免疫球蛋白(抗体)的结构
抗体酶本质上是抗体,但在可变区具有酶活性,所以称为 抗体酶。
磷酸吡哆醛
(a)半抗原-载体蛋白 (b)抗体酶催化的氨基转移反应
羟酯
环状过渡态
内酯
环状磷酸酯
第四节
核酶、抗体酶、 同工酶、酶工程
一、核酶( ribozyme)
• 定义: 化学本质为RNA的酶。它具有识别和转化单链
RNA的能力。
例:L19RNA 1982, Cech 等,研究四膜虫rRNA 前体的成熟。 L19RNA —395个核苷酸构成的线状 RNA分子
外显子 鸟苷
内含子
2. 生物酶工程
酶学和DNA重组技术相结合。
基因工程技术大量生产克隆酶 基因定点突变,获得遗传修饰酶
设计新酶基因,合成优质酶
Fig.2-42 Schematic illustration of DNA cloning.
天然存在的酶。
指当细胞加入特定诱导物后诱导产生 的酶。诱导物一般是底物或其类似物。
例:大肠杆菌-半乳糖苷酶的诱导生成
去掉
-半乳糖苷酶 ( g )
诱导物
加入
诱导物
细菌蛋白总量(g)
Fig.3ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ28 -半乳糖苷酶的诱导生成
五、 酶工程
(一)酶在工业、农业、医药及科学研究中的巨大作用
工业:淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、凝乳酶等。 农业:淀粉酶、纤维素酶、果胶酶等 医药:血清GPT、GOT; 乳酸脱氢酶H4、 M4
抗原结合部位 重链(H) 轻链(L) 铰链区 V:可变区 C:恒定区 Fc:基部片断 Fab: 臂片断(抗原结合片断)
免疫球蛋白(抗体)的结构
抗体酶本质上是抗体,但在可变区具有酶活性,所以称为 抗体酶。
磷酸吡哆醛
(a)半抗原-载体蛋白 (b)抗体酶催化的氨基转移反应
羟酯
环状过渡态
内酯
环状磷酸酯
第四节
核酶、抗体酶、 同工酶、酶工程
一、核酶( ribozyme)
• 定义: 化学本质为RNA的酶。它具有识别和转化单链
RNA的能力。
例:L19RNA 1982, Cech 等,研究四膜虫rRNA 前体的成熟。 L19RNA —395个核苷酸构成的线状 RNA分子
外显子 鸟苷
内含子
第七章 核酶工程_PPT幻灯片
19
20
21
发夹型核酶
❖ 发夹状二级结构,由50个碱基的核酶和14个碱基 的底物形成,包括4个螺旋和5个突环(图7-3)
22
蛋白质-RNA复合酶
❖ 由蛋白质和RNA两个组分构成
❖ 如大肠杆菌tRNA5’成熟酶,主要催化tRNA 前体成熟过程,M1RNA组分单独具有全酶 活性,蛋白质只维护M1RNA的构象
在临床肿瘤组织样本中也发现,hTR通常 在正常组织及肿瘤组织中均能检测到,但 hTERT只特异性表达于肿瘤组织。
27
所有这一切说明,蛋白催化亚单位是端粒酶 活性的限制因素。
端粒酶激活可能是一个多步骤过程,至少包 括以下两个层次:其一是端粒酶RNA成分的上调; 其二是蛋白组分特别是催化亚单位的表达。
-G CAGGG-
(2)
G GGCCUGU+ GA5
(3)
------
(1)
------
-GG CGGG-
(2)
G
------
(3)
GGCCGCU+ GA5 7
通过这些研究,已经知道RNA催化剂的活性 部位及其底物专一性。
RNA催化剂的这个特性,由人工制造出一系 列新的催化剂,不断扩大其应用领域。
体外试验中将人端粒酶模板成分hTR ( human telomerase RNA component) 与 hTERT混合可重构端粒酶活性。
26
端粒酶与衰老有关
在端粒酶阴性的二倍体细胞中转入编码 hTERT的基因,也可激活端粒酶,结果DNA 分子端粒长度增加,细胞寿命延长,老化过 程减缓,但其核型及表型均保持正常,没有 恶性转变的迹象。
尤其通过对真核生物的RNase P结构与功 能的研究,已经知道一类结构相似的小分子 可成为我们所需要的催化剂。
20
21
发夹型核酶
❖ 发夹状二级结构,由50个碱基的核酶和14个碱基 的底物形成,包括4个螺旋和5个突环(图7-3)
22
蛋白质-RNA复合酶
❖ 由蛋白质和RNA两个组分构成
❖ 如大肠杆菌tRNA5’成熟酶,主要催化tRNA 前体成熟过程,M1RNA组分单独具有全酶 活性,蛋白质只维护M1RNA的构象
在临床肿瘤组织样本中也发现,hTR通常 在正常组织及肿瘤组织中均能检测到,但 hTERT只特异性表达于肿瘤组织。
27
所有这一切说明,蛋白催化亚单位是端粒酶 活性的限制因素。
端粒酶激活可能是一个多步骤过程,至少包 括以下两个层次:其一是端粒酶RNA成分的上调; 其二是蛋白组分特别是催化亚单位的表达。
-G CAGGG-
(2)
G GGCCUGU+ GA5
(3)
------
(1)
------
-GG CGGG-
(2)
G
------
(3)
GGCCGCU+ GA5 7
通过这些研究,已经知道RNA催化剂的活性 部位及其底物专一性。
RNA催化剂的这个特性,由人工制造出一系 列新的催化剂,不断扩大其应用领域。
体外试验中将人端粒酶模板成分hTR ( human telomerase RNA component) 与 hTERT混合可重构端粒酶活性。
26
端粒酶与衰老有关
在端粒酶阴性的二倍体细胞中转入编码 hTERT的基因,也可激活端粒酶,结果DNA 分子端粒长度增加,细胞寿命延长,老化过 程减缓,但其核型及表型均保持正常,没有 恶性转变的迹象。
尤其通过对真核生物的RNase P结构与功 能的研究,已经知道一类结构相似的小分子 可成为我们所需要的催化剂。
第七章 核 酶 工 程
第三节 脱氧核酶 1994年,Breaker等利用体外选择技术首 次发现了切割RNA 的DNA分子,并将其 命名为脱氧核酶(deoxyribozyme or DNAzyme)。
体外选择(in vitro selection) 是从顺序随机的 RNA或DNA分子构成的大容量随机分子库 出发,在其中筛选得到极少数具有特定功 能的分子。
总结:MIRNA是一种真正的生物催化剂。
因为它符合催化剂条件,即在体外条件下能单
独催化别的分子(tRNA前体)的切割反应,
少量的MIRNA就能使反应大大加速,且自
身在反应前后不改变。
第一节天然核酶
1、剪切型核酶,这类核酶催化自身或者异体 RNA的切割,相当于核酸内切酶,主要包括锤 头型核酶,发夹型核酶,丁型肝炎病毒(HDV) 核酶,以及有蛋白质参与协助完成催化的 RNaseP; 2、剪接型核酶,这类核酶主要包括组I内含子 和组II内含子,实现mRNA前体自我拼接,具 有核酸内切酶和连接酶两种活性。
路易斯(Lewis)提出了酸碱电子理论 (又称路易斯酸碱理论):凡是能给出 电子对的物质(分子、离子或原子团) 为碱,凡能接受电子对的物质(分子、 离子或原子团)为酸。酸碱反应不再是 质子的转移而是电子的转移,是碱性物 质提供电子对与酸性物质生成配位共价 键的反应
HDV中的核酶的催化机制
HDV中的核酶显示了与以上不同的催化 机制(图 7-2c),胞嘧啶(C76)充当广义碱, 嘧啶环上的N吸引2’羟基上的质子,活 化了羟基上的O,这个O亲核攻击相邻的 核酸骨架上的P,经过过渡态形成磷酸内 酯键,而原来核酸骨架的磷酸酯键断裂。
Anti-ras ribozymes B细胞白血病-淋巴瘤 人免疫缺陷病毒I 人免疫缺陷病毒I 乙肝病毒, 丙肝病毒
16章RNA的代谢3核酶(Ribozyme) 生物化学清晰易学版课件
➢ 逆转录酶出错倾向高,病毒基因突变速度快。
HIV基因组
TAT: TransActivator of Transcription
VIF: Virion Infectivity Factor
REV: Regulator of Virion Protein Expression VPU: Viral Protein U
发生病毒基因组的整合。 ➢ 带有癌基因的病毒可引起宿主细胞的转化。 RNA
肿瘤病毒如劳氏肉瘤病毒中的src基因编码一个酪 氨酸激酶,可引起细胞癌变。
病毒致癌理论
➢ Rous:1907年,从母鸡身上的恶性结缔组织(肉 瘤)中提取滤液,接种到健康的鸡体内,鸡患上 同样的肿瘤。
➢ 表明:滤液中含致病原,可传播肿瘤。 ➢ Rous获1966年诺贝尔生理学和医学奖 ➢ 致癌RNA病毒:能引起鸟类、哺乳类等动物白血
• 通常为60个核苷酸左右 底物部分 • 同一分子上包括有催化
部份和底物部份 • 催化部份和底物部份组
成锤头结构 • 高度专一的核酸内切酶
活性
作用底物与酶可以是同一分子,也可是 不同分子
人工设计的核酶
➢粗线表示合成的核酸分子 ➢细线表示天然的核酸分子 ➢X 表示共有序列 ➢箭头表示切断点
第七节 以RNA为模板的DNA
L-19 IVS催化RNA寡核苷酸链延长
核酶作用的特点
➢ 底物:RNA或自身,具底物特异性 ➢ 反应:转酯作用和磷酸二酯键的水解(切割) ➢ 需要Mg 2+ 、游离鸟嘌呤核苷酸, 不需能量和
蛋白质辅助因子
• 除rRNA外,tRNA、mRNA的加工也可采用 自我剪接方式。
• 最简单的核酶二级结构——槌头状结构 (hammerhead structure)
HIV基因组
TAT: TransActivator of Transcription
VIF: Virion Infectivity Factor
REV: Regulator of Virion Protein Expression VPU: Viral Protein U
发生病毒基因组的整合。 ➢ 带有癌基因的病毒可引起宿主细胞的转化。 RNA
肿瘤病毒如劳氏肉瘤病毒中的src基因编码一个酪 氨酸激酶,可引起细胞癌变。
病毒致癌理论
➢ Rous:1907年,从母鸡身上的恶性结缔组织(肉 瘤)中提取滤液,接种到健康的鸡体内,鸡患上 同样的肿瘤。
➢ 表明:滤液中含致病原,可传播肿瘤。 ➢ Rous获1966年诺贝尔生理学和医学奖 ➢ 致癌RNA病毒:能引起鸟类、哺乳类等动物白血
• 通常为60个核苷酸左右 底物部分 • 同一分子上包括有催化
部份和底物部份 • 催化部份和底物部份组
成锤头结构 • 高度专一的核酸内切酶
活性
作用底物与酶可以是同一分子,也可是 不同分子
人工设计的核酶
➢粗线表示合成的核酸分子 ➢细线表示天然的核酸分子 ➢X 表示共有序列 ➢箭头表示切断点
第七节 以RNA为模板的DNA
L-19 IVS催化RNA寡核苷酸链延长
核酶作用的特点
➢ 底物:RNA或自身,具底物特异性 ➢ 反应:转酯作用和磷酸二酯键的水解(切割) ➢ 需要Mg 2+ 、游离鸟嘌呤核苷酸, 不需能量和
蛋白质辅助因子
• 除rRNA外,tRNA、mRNA的加工也可采用 自我剪接方式。
• 最简单的核酶二级结构——槌头状结构 (hammerhead structure)
核酶
Sidney Altman
奥尔特曼(S.Altman) 奥尔特曼(S.Altman)(1939-) 美国 人,因发现RNA的生物催化作用而获 奖. 1978年和1981年奥尔特曼与切赫分 别发现了核糖核酸(RNA)自身具有的 生物催化作用,这项研究不仅为探索 RNA的复制能力提供了线索,而且说 明了最早的生命物质是同时具有生物 催化功能和遗传功能的RNA,打破了 蛋白质是生物起源的定论。
核酶的发现: T.Cech的工作 核酶的发现: T.Cech的工作
T.Cech的重要发现开始于1982年 T.Cech的重要发现开始于1982年 研究目的:细胞中DNA转录成r 研究目的:细胞中DNA转录成rRNA 后,rRNA中一些无意义的序列,或 后,rRNA中一些无意义的序列,或 “内含子”(intron),如何从RNA 内含子” intron),如何从RNA 分子中剪切下来的。根据过去传统 分子中剪切下来的。根据过去传统 的概念,这一过程必须要有蛋白质 酶来完成。
T.Cech的工作 T.Cech的工作
研究对象:原生动物四膜虫(Tetrahymena 研究对象:原生动物四膜虫(Tetrahymena Thermophila):含有一种RNA,其组成中除 Thermophila):含有一种RNA,其组成中除 了核糖体RNA外还有一个由413个核苷酸组 了核糖体RNA外还有一个由413个核苷酸组 成的插入序列(interveningsequenc,IVS)。 成的插入序列(interveningsequenc,IVS)。 研究发现:转录产物rRNA前体很不稳定, 研究发现:转录产物rRNA前体很不稳定, 在鸟苷和Mg 存在下切除自身的413个核苷 在鸟苷和Mg2+存在下切除自身的413个核苷 酸的内含子(IVS),使两个外显子拼接起 酸的内含子(IVS),使两个外显子拼接起 来,变成成熟的rRNA分子。催化反应是在 来,变成成熟的rRNA分子。催化反应是在 没有任何蛋白质酶的存在下发生的,称为自 我剪接。
核酶PPT课件
(三)核酶是一种金属依赖酶。
金属离子的作用:
特异的结构作用,或参与活性部位的化学过程 促进RNA的总体折叠 二价金属离子(如Mg 2+ )与底物活性部位直接相互作用,
参与过渡中间复合物的形成
C C C U C U
O
o P OA +o
HOG
3’
C C C U C U O
o P OA o
OG
过渡态
IVS具有类似蛋白酶的功能,能够打断及重建磷酸二脂键。
相信rRNA前体能靠自己完成剪接过程。在一定条件下rRNA前体可以 按一定方式盘绕,进而自己切割自己,以后再把保留rRNA部分的末 端连接起来。即它是可以催化自由底物的具有酶活性的RNA。
RNA分子具有自身断裂的催化作用,以及酶活性的另一个重要方面即 催化其他分子的反应。
(三)脱氧核酶催化特征
• 裂解位点为嘌呤、嘧啶连接 • 双链稳定性越高,酶活性越高 • 结合臂的长度影响酶催化转换性 RNA-DNA 比 RNA-RNA 稳定性差。 • 对Mg 2+,Zn 2+,Ca 2+,Mn 2+有依赖性 • 组氨酸,精氨酸促进催化活性 • 极强的切割特异性(单碱基错配即可大幅降低切割活性)
过去都认为核酸酶P的催化作用由RNA和蛋白质共同完成的。
而该实验证明,核酸酶P的催化作用是由RNA完成的,而其中 的蛋白质在细胞内仅仅起稳定构象的作用。
核酶的发现对于所有酶都是蛋白质的传统观念提出了挑战。1989年, 核酶的发现者T.Cech和S.Ahman被授予诺贝尔化学奖。
(Thomas Robert Cech) (SidneyAltman)
• 核酶催化切割反应的可逆性问题 • 提高催化效率 • 寻找合适载体将核酶高效、特异地导入靶细胞 • 使核酶在细胞内有调控地高效表达 • 增强核酶在细胞内的稳定性 • 对宿主的损伤问题有待进一步考察
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核酶、反义核酸和小分子RNA(snRNA)是RNA修复的常用工具。 核酶是天然的具有催化能力的RNA分子,能特异性地催化RNA剪接。 经过基因工程改造的核酶,可以位点特异性地切割任意给定的RNA 分子。
利用核酶的剪接能力,可引入新的基因功能或修复已有的基因缺陷。
(三)在农业等其他领域的应用
意力已集中到最近发现的具有酶活性的RNA分子上。
1981年,Cech发现四膜虫rRNA的前体在没有蛋白质的情况下能专一 地催化寡聚核苷酸底物的切割与连接,具有分子内催化的活性。
1983年,Altman等发现大肠杆菌RNaseP的蛋白质部分除去后,在 体外高浓度Mg2+存在下,与留下的RNA部分(M1 RNA)具有与全 酶相同的催化活性。
对Mg 2+,Zn 2+,Ca 2+,Mn 2+有依赖性 组氨酸,精氨酸促进催化活性
•
极强的切割特异性(单碱基错配即可大幅降低切割活性)
四、核酶的应用
(一)应用于生命起源的研究
• • •
生命的起源? 新的观点:生命从RNA开始 体内选择技术的应用已经找到了一些催化基本生化反应(如 RNA剪切、连接、合成以及肽键合成等)的核酶,这些结果支
I类内含子
II类内含子
2. 剪切型核酶
这类核酶的作用是只剪不接,催化自身RNA或不同的RNA分
子 自身催化剪切型RNA 异体催化剪切型RNA:核糖核酸酶P(RNaseP)
(二)核酶的结构
•锤头结构 (Hammerhead) •发夹结构(Hairpin) •斧头结构(Axehead) •假结样结构(Pseudoknot-like)
1986年,Cech又证实rRNA前体的内含子能催化分子间反应。
T.Cech的工作
T.Cech的重要发现开始于1981年。 研究目的:细胞中DNA转录成rRNA后,rRNA中一些无意义的
序列,或“内含子”(intron),如何从RNA分子中剪切下来
的。根据过去传统的概念,这一过程必须要有蛋白质酶来完成。
3’
o
o
P
O
o G
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+ o P-oG o
过渡态
C C C U C U
O
C C C U C U
2+ O Mg
o
P
O
OA
o G
o
Mg 2+
P
O
OA
o G
过渡态
金属离子催化
(四)核酸酶P(RNaseP)
RNase P功能:核糖核蛋白体复合物,能剪切所有tRNA前体的5‘端,
除去多余的序列,形成3’-OH 和 5’-磷酸末端。
(三)核酶是一种金属依赖酶。
金属离子的作用:
特异的结构作用,或参与活性部位的化学过程 促进RNA的总体折叠 二价金属离子(如Mg 2+ )与底物活性部位直接相互作用, 参与过渡中间复合物的形成
C C C U C U
O o P
OA
C C C U C U
O
C C C U C U
OH OA
+ HOG
IVS具有类似蛋白酶的功能,能够打断及重建磷酸二脂键。 相信rRNA前体能靠自己完成剪接过程。在一定条件下rRNA前体可以 按一定方式盘绕,进而自己切割自己,以后再把保留rRNA部分的末 端连接起来。即它是可以催化自由底物的具有酶活性的RNA。
RNA分子具有自身断裂的催化作用,以及酶活性的另一个重要方面即 催化其他分子的反应。
(SidneyAltman)
(四)核酶发现的意义
1. 它突破了“酶是蛋白质”的传统概念。
现代的酶定义:酶由生物体内活细胞产生的、具有催化功能的生物大
分子。
2. 核酸性酶的发现对科学家们普遍感兴趣的生命的起源这一问题有了 新的认识,对生物前化学有重要贡献。
长期以来,人们认为所有的生命形式在冗长的相互依赖的循环中,信
过去都认为核酸酶P的催化作用由RNA和蛋白质共同完成的。
而该实验证明,核酸酶P的催化作用是由RNA完成的,而其中
的蛋白质在细胞内仅仅起稳定构象的作用。
核酶的发现对于所有酶都是蛋白质的传统观念提出了挑战。1989年, 核酶的发现者T.Cech和S.Ahman被授予诺贝尔化学奖。
(Thomas Robert Cech)
持了在蛋白质产生以前核酶可能参与催化最初的新陈代谢的设
想。
(二)在医学领域中的应用
•
通过识别特定位点而抑制目标基因的表达,抑制效率高,专一
性强。
• • 免疫源性低,很少引起免疫反应 针对锤头核酶而言,催化结构域小,既可作为转基因表达产物, 也可以直接以人工合成的寡核苷酸形式在体内转运。
RNA治疗——RNA的修复
(三) 核酶的发现
1968年Francis Crick在他的论文“基因密码的起源”一文中提到 “可能第一个酶是具有复制能力的RNA”时,没有人予以注意。
20年后,在1987年第52届冷泉港定量生物学国际讨论会上Alan Weiner做会议总结时又重复了20年前Francis Crick的话,会议注
具有RNA切割活性; 具有DNA连接酶活性; 具有卟啉金属化酶和过氧化酶活性; 具有DNA水解活性;
具有DNA激酶活性;
具有N2糖基化活性; 具有DNA戴帽活性。
(三)脱氧核酶催化特征
• •
裂解位点为嘌呤、嘧啶连接 双链稳定性越高,酶活性越高
•
• •
结合臂的长度影响酶催化转换性 RNA-DNA 比 RNA-RNA 稳定性差。
1773年,意大利科学家斯帕兰扎尼(L.Spallanzani,1729—1799)设计 了一个巧妙的实验:将肉块放入小巧的金属笼中,然后让鹰吞下去。 过一段时间他将小笼取出,发现肉块消失了。于是,他推断胃液中一 定含有消化肉块的物质。但是什么,他不清楚。 1836年,德国科学家施旺(T.Schwann,1810—1882)从胃液中提取出 了消化蛋白质的物质。解开胃的消化之谜。
RNaseP由M1RNA和蛋白质亚基组成。 M1RNA具催化作用:375个碱基
体外:
蛋白质作为辅助因子:119个氨基酸残基
体内: M1RNA和蛋白质对酶活性都是必需的。
RNaseP底物的二级结构
(五)影响核酶活性的因素
pH值:pH7.0-7.5时核酶活性最高; 二价金属离子:如Mg 2+ Mn 2+; 抗生素:大多数为抑制效应; 变性剂:
息分子和功能分子是分离的。核酸是信息分子,而蛋白质是功能分子。
核酸性酶的发现给人们以启示,即RNA分子不但有复制的功能,含有
复制的信息,而且还有催化的功能。因此既是信息分子,又是功能分
子。这些新的概念无疑将对生物前化学的研究开辟新的思路。
二、核酶
核酶(ribozyme)泛指一类具有催化功能的RNA分子。一般是指 无需蛋白质参与或不与蛋白质结合,就具有催化功能的RNA分子。
核 酶
Ribozyme
一、概
述
(一) 对酶及生物催化剂的认识的发展
蛋白质类:天然酶 enzyme
极端酶 extremozyme 抗体酶 abzyme 生物催化剂 (Biocatalyst)
克隆酶 遗传修饰酶
生物工程酶
核酸类: Ribozyme
蛋白质工程新酶
Deoxyribozyme、
其它:模拟酶
(二) 酶的发现
S.Altman的研究工作
t-RNA分子的剪接过程。
研究目的:t-RNA分子的剪接过程。 研究发现:在较高浓度的镁离子和适量精氨酸参与下,核糖核酸酶 P (ribonuclease P, RNase P )中的 RNA能够切割tRNA前体的5’端。
核糖核酸酶P是一种核糖核蛋白, 含有一个单链RNA分子, 长度为375 个碱基,结合一个相对分子质量为20kDa的多肽(119个氨基酸残基)。
T.Cech的工作
研究对象:原生动物四膜虫,其含有一种RNA,其组成中除了核糖体 RNA外还有一个由413个核苷酸组成的插入序列(interveningsequenc, IVS)。
研究发现:转录产物rRNA前体很不稳定,在鸟苷和Mg2+存在下切除 自身的413个核苷酸的内含子(IVS),使两个外显子拼接起来,变成 成熟的rRNA分子。催化反应是在没有任何蛋白质酶的存在下发生的, 称为自我剪接。
(一)核酶(ribozyme)的分类
锤头核酶 发夹核酶 剪切型核酶 丁型肝炎病毒(HDV)核酶
根据催化反应
剪接型核酶
RNaseP
I内含子 II内含子
1.剪接型核酶
定义:指RNA分子被磷酸二酯酶水解切割后,伴随着形成新的磷酸 二酯键,即磷酸二酯键的转移反应或称转酯反应。
作用机制:通过既剪又接的方式除去内含子。 分类:
1926年,美国科学家萨姆钠(J.B.Sumner,1887—1955)从刀豆 种子中提取出脲酶的结晶,并通过化学实验证实脲酶是一种蛋白质。
20世纪30年代,科学家们相继提取出多种酶的蛋白质结晶,并指 出酶是一类具有生物催化作用的蛋白质。
20世纪30年代
酶定义:酶是一类具有生物催化作用的蛋白质。
•
防治动、植物 病毒侵害:马铃薯纺锤形块茎类病毒负链的多
价核酶构建,马铃薯卷叶病毒复制酶基因负链的突变核酶的克
隆等。
五、核酶技术面临的问题
•
核酶催化切割反应的可逆性问题
•
• • • •
提高催化效率
寻找合适载体将核酶高效、特异地导入靶细胞 使核酶在细胞内有调控地高效表达 增强核酶在细胞内的稳定性 对宿主的损伤问题有待进一步考察