蛋白质考题及答案解析
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蛋白质结构与功能试题
一、问答题:
1.影响蛋白质二级结构改变的因素有哪些?
参考答案:
温度;pH;邻近氨基酸残基的二级结构倾向;肽链中远程肽段的影响;肽段是处于分子表面还是被包埋在分子内部
2.如下图所示。多聚谷氨酸poly (Glu) 是由多个L-Glu聚合形成的多肽链,在pH为3的溶液中能
形成a-螺旋构象,当pH升高到7时,则由a-螺旋变为无规卷曲,旋光率陡然下降。同样,多聚赖氨酸poly (Lys) 在pH为10的溶液中具有a-螺旋结构,当pH降低至7时,旋光率也发生陡然下降,由a-螺旋结构变为无规卷曲。请解释pH对poly (Glu) 和poly (Lys) 构象变化的影响。
答案要点:pH=3接近Glu g-COOH的p K R (4.07),侧链基团为质子化不带电荷状态,可形成a-螺旋结构。其余情况按此思路分析。Lys e-NH2 p K R 为10.54。
3.胶原蛋白的结构特点(原胶原分子的一级结构和高级结构)
1)在体内,胶原蛋白以胶原纤维的形式存在,胶原纤维的基本结构单位是原胶原分子
2)每个原胶原分子由三条左手螺旋的a链(a-肽链)组成右手超螺旋结构,每条a链约含
1000个氨基酸残基
3)a链间靠H-键和范得华力维系,胶原纤维可以通过分子内和分子间的进一步交联增强稳定
性
4)a链一级结构序列96%遵守(Gly-X-Y)n。x多为脯氨酸Pro;y多为羟基脯氨酸Hyp或羟基
赖氨酸Hly
5)胶原蛋白是糖蛋白,少量糖与5-羟赖氨酸(Hyl)残基的碳羟基共价连接
6)具有较好的弹性和抗张强度
4.形成结构域的意义是什么?
参考答案:
1)各结构域分别折叠,其动力学上更有利
2)结构域自身紧密装配,结构域之间的柔性连接使每个结构域间可以作较大幅度的相对运
动
3)多个结构域形成的间隙部位往往是蛋白质的功能部位,结构域的相互作用有利于蛋白质
分子产生别构效应
5.简述三种浓缩蛋白质溶液的方法及原理
1)超滤法:将蛋白质样品装入适当的超滤管中,经一定时间离心,溶剂穿过超滤管滤膜流出而
使蛋白质溶液得以浓缩
2)硫酸铵沉淀法:通过盐析作用使蛋白质在高浓度中性盐中析出而浓缩。
3)透析袋浓缩法:将蛋白质样品装入透析袋中,封闭透析袋两端,将透析袋包埋与蔗糖、甘油
或聚乙二醇8000中,放置于4°C,透析袋中溶剂将被吸出而达到浓缩的效果。
或者:
4)有机试剂沉淀法(如丙酮、聚乙二醇即PEG等):破坏蛋白质的水化层及表面电荷而使蛋白
质沉淀
5)冷冻干燥法:将待干燥物快速冻结冰后,在高真空条件下将其中的冰升华为水蒸气而去除的
干燥方法。由于冰的升华带走热量使冻干整个过程保持低温冻结状态,有利于保留一些生物样品(如蛋白质)的活性。
6.某一溶液(20mmol/L NaCl,50mmol/L Tris·HCl,pH
7.5)中含有A、B、C、D四种蛋白质,
其等电点分别为A(p I 8.3)、B(p I 7.0)、C (p I 6.8)、和D (p I 6.2)。将该溶液经阴离子交换柱层析来对蛋白质进行分离纯化,将其上样、清洗,然后再逐渐提高盐浓度进行洗脱。从理论上判断哪种蛋白质会最先从层析柱中被洗脱出来?为什么?
提示:A蛋白质最先流出。
阴离子柱结合带负电荷的分子。当溶液pH >蛋白质p I时,蛋白质所带净电荷为“负”,能够结合在层析柱上。当溶液pH < p I,蛋白质所带净电荷为“正”,不能结合到层析柱上,而直接穿过层析柱而流出。
7.分子伴侣均采用的基本循环作用模式是什么?
结合底物(错误折叠的蛋白质或新生肽链)®去折叠化(或防止新生肽链折叠)®解聚聚集的多肽链并同时自发折叠成天然构象、或者若不能形成天然构象则进入蛋白酶体介导的降解途径。
8.蛋白质一级结构的比较可以获得哪些信息?
不同种属来源的同一蛋白质比较:揭示生物进化信息
功能相似的蛋白质比较:功能越相近的蛋白质,结构上的同源性越高,可划分蛋白质家族
功能相差较远的蛋白质一级结构比较:建立蛋白质超家族;发现蛋白质含有的新moti f或结构域,并揭示可能的新功能
9.为什么可以采用Ni-柱亲和层析(固定化金属螯合亲和层析,Immobilized Metal-chelate Affinity
Chromatography,IMAC)纯化His-tagged蛋白质?如何能够将His-tagged蛋白质从Ni-柱上洗脱下来?
参考答案:
1) His-tagged蛋白质通常在N端或者C端带有6´His标签,这些His能专一性地结合在螯合
有Ni2+(或Zn2+、Co2+)亲和柱上,杂蛋白则穿过亲和柱而与His-tagged蛋白质分离。
2) 增大洗脱液中的咪唑浓度。高浓度咪唑溶液中的咪唑可与His-tagged蛋白质竞争结合Ni-
柱中的Ni,从而将His-tagged蛋白质洗脱下来。
10. 蛋白质的分类方式主要有哪几种?(答出两种即可)
按化学组成分类:简单蛋白质、复合蛋白质(或结合蛋白质)
按分子形状和溶解性分类:球状蛋白质、纤维状蛋白质、膜蛋白
按功能分类:活性蛋白质、非活性蛋白质
按二级结构单元排列方式分类:全a域、全b域、交替的a/b域、非交替a+b域、不规则小蛋白
11. 丝心蛋白的主要结构特点有哪些?
反平行的b折叠片以平行的方式堆积成多层片层结构;
一级结构多为Gly-Ser/Ala的重复排列,Gly位于折叠片平面的一侧,Ser/Ala等排列在平面的另一侧。层与层间,Gly与Gly相对,Ser/Ala与Ser/Ala相对;
链间主要以氢键连接,层间主要靠范德华作用维系
12. 蛋白质翻译后修饰主要有哪些方式?这些修饰一般发生在哪些氨基酸的侧链上?
N-端乙酰化
蛋白质多肽链中Ser、Thr、Tyr侧链的磷酸化
蛋白质多肽链中Ser、Thr、Asn侧链糖基化
蛋白质多肽链中Lys侧链泛素化
13.凝胶过滤柱层析测定蛋白质分子量的原理
测定几种已知分子量的蛋白质中在凝胶过滤层析中的洗脱体积v e,v e(or v e/v0)与对应蛋白质分子量自然对数(logMr)成反比,以logMr为横坐标、v e为纵坐标做出标准曲线。测定目的蛋白质的v e,从标准曲线上查出蛋白质分子量的logMr,即可得到蛋白质的分子量。
14.Pro为什么既不利于a-螺旋的形成,也不利于b-折叠的形成?
Pro的a-NH2形成吡咯环成为亚氨基,在多肽链中形成肽键后,其N上无H,不能形成稳定a-螺旋和b-折叠结构中的氢键;此外,吡咯环的限制,二面角f不能满足a-螺旋所需的二面角角度,因此,Pro既不利于a-螺旋的形成,也不利于b-折叠的形成。
15. 蛋白质主要有哪些重要功能?请作简要说明。(答出4种即可)
参考答案:
1) 酶的催化作用(代谢过程中几乎每一步反应都有酶的催化)
2) 机械支持(细胞骨架蛋白等。如:微丝中的肌动蛋白,微管中的微管蛋白,中间纤维
中的角蛋白)
3) 运输(如血红蛋白对O2、CO2的运输,跨膜运输的通道蛋白、载体蛋白等)
4) 免疫保护(如抗体对机体的保护作用,凝血酶的凝血作用)
5) 生长和分化的控制(蛋白类激素如胰岛素,真核生物转录因子等)
6) 神经冲动的产生和传递(如乙酰胆碱受体蛋白)
7) 信号转导(G蛋白、受体蛋白)
8) 电子传递(呼吸链中的电子载体复合体)
9) 贮存(铁蛋白、肌红蛋白等)
二、名词解释
1.蛋白质的分子伴侣