(完整版)总RNA提取的原理、步骤

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总RNA提取实验原理

总RNA提取实验原理

总RNA提取实验原理总RNA提取实验是一种用于从细胞或组织样品中提取总RNA(total RNA)的实验方法。

总RNA包含细胞内的所有RNA,包括mRNA(messenger RNA)、rRNA(ribosomal RNA)和tRNA(transfer RNA)等。

总RNA提取是进行分子生物学研究的重要步骤之一,它使得研究者可以获取样品中的全部RNA,并进一步应用于RNA测序、RT-PCR等实验。

1. 细胞或组织的破碎:首先将待提取的细胞或组织样品加入破碎缓冲液中,通常包含Tris-HCl缓冲液、EDTA、SDS等。

这些缓冲液中的成分有助于维持适宜的pH值和细胞膜的稳定性。

然后利用机械或化学方法,破坏细胞或组织的结构,以释放RNA。

例如,可通过高速离心破碎细胞,或使用离解酶(如蛋白酶K)降解维持细胞结构的蛋白质。

2.RNA的溶解:破碎后的样品中含有RNA、DNA、蛋白质和其他杂质。

为了分离RNA,需要加入盐溶液(如醋酸钠、乙酸铵等)来改变样品的离子强度,从而促进RNA的溶解。

同时,可以加入乙醇沉淀,将RNA从溶液中沉淀下来。

3.RNA的洗涤:通过多次洗涤,可以去除样品中的DNA、蛋白质和其他杂质。

洗涤时可使用乙醇、乙酸盐等具有去除杂质作用的溶液。

洗涤过程可以使用离心等方法将杂质沉淀下来,然后将上清液收集。

4.RNA的纯化:纯化步骤旨在去除残留的DNA、蛋白质和其他污染物,以获得纯净的RNA。

纯化的方法包括酚/氯仿提取法、硅胶柱提取法等。

其中,酚/氯仿法利用酚醇将DNA溶解于有机相中,而RNA则溶解于水相中。

硅胶柱提取法则依靠RNA与硅胶的亲和力差异,通过将样品通过硅胶柱,使得RNA与硅胶结合,而DNA和蛋白质则被去除。

总RNA提取实验需要注意以下几点:首先,实验室操作环境要经过彻底清洁消毒,以防止RNA的降解或污染;其次,实验中使用的试剂和仪器要保持优良的质量,以确保提取的RNA质量;另外,实验过程中要避免样品受到RNase的污染,RNase是一种常见的蛋白质酶,能够降解RNA,因此需要在RNase-free条件下进行实验。

RNA提取原理及步骤

RNA提取原理及步骤

细菌总RNA提取一、TRIzol溶液提取细胞总RNA实验原理1. TRIzol溶液的成分及作用:苯酚、异硫氰酸胍、8-羟基喹啉等。

其中苯酚可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,8-羟基喹啉(可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用)、异硫氰酸胍(是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离)、β-巯基乙醇(主要作用是破坏RNase 蛋白质中的二硫键)。

因此内源和外源RNase(RNA酶)受抑制,在样品裂解或匀浆过程中,TRIZOL能保持RNA完整性。

2. 提取原理:细胞用TRIzol溶液裂解后,加入氯仿后溶液分为水相和有机相,RNA在水相中(上层)、中层为DNA、下层为粉色的蛋白质层。

之后将水相取出,用异丙醇或者无水乙醇沉淀回收RNA。

RNA沉淀用70%的乙醇进行漂洗,最后加ddH2O溶解。

二、实验步骤1.取一只2mL离心管,加入大肠杆菌培养液0.7ml,10,000 rpm离心2 min,倒掉上清液。

2.加入2mL TRIzol溶液, 至菌体彻底悬浮并彻底裂解。

之后,在室温下放置5min,使核酸蛋白质彻底分离。

3.往管中加入0.4ml氯仿,盖好管盖,剧烈震荡15sec,之后在室温放置3min。

4.4℃,13000rmp,离心15min。

取出后,可见样品分成三层,RNA在水相中(上层)、中层为DNA、下层为粉色的蛋白质。

5.将上层水相小心取出(约0.5ml),加入1.5ml离心管中,往管中加入等体积的异丙醇。

室温下在室温放置5min。

6. 4℃,13000rmp,离心10min。

离心后,可见管底见胶装沉淀。

7.加入2ml 70%乙醇洗涤沉淀,之后倒出液体,注意不要将沉淀倒出,若沉淀松动,可稍离心。

8.用黄色枪头将剩余液体全部吸出后,往管中加入25μl ddH2O,彻底溶解RNA。

9.电泳检测RNA以及昨天实验的DNA。

各取8μl样品与2μl loading buffer 混匀,点样。

总rna的提取方法

总rna的提取方法

总rna的提取方法
总RNA(total RNA)是指从细胞或组织中提取出来的包含所有类型的RNA的混合物。

下面是一种常见的总RNA提取方法:
1. 细胞/组织样品准备:收集足够数量的细胞或组织样品,并将其保存在适当的缓冲液中(如RIPA缓冲液)。

2. 细胞破碎:将细胞样品经过离心等步骤,去除缓冲液,然后加入细胞破裂缓冲液(常见的破裂缓冲液成分包括TRIzol、RLT缓冲液等),使用搅拌器或超声波进行细胞破碎。

3. RNA提取:加入氯仿或类似的有机物,进行混匀,离心,使得混合液分为上清液(含有DNA和RNA)和有机相(含有脂质和蛋白质)。

4. 上清液沉淀:将上清液转移至新的管中,加入同等体积的异丙醇,轻轻混匀,离心15分钟以使RNA沉淀。

5. RNA洗涤:轻轻倒掉上清液,用70%乙醇洗涤RNA沉淀,再次离心。

6. RNA溶解:将RNA沉淀干燥,加入适当的RNase-free水溶解RNA。

7. RNA质量检测:使用比色法或荧光法测定RNA浓度和纯度(如比例计算
A260/A280)。

这些步骤是总RNA提取的一般流程,具体的操作步骤可能会因实验目的、样品类型和提取试剂盒等因素而有所不同。

同时,为了确保RNA的完整性和减少污染,实验操作中还应遵循严格的无RNase和无DNA污染的条件。

提rna步骤及原理

提rna步骤及原理

提rna步骤及原理RNA是一种重要的生物大分子,它参与了许多基因表达和调控过程。

研究RNA的结构和功能对于理解生物体内的生物学过程至关重要。

下面将介绍RNA的提取步骤以及其原理。

1. 细胞破碎:首先需要破碎细胞壁,使RNA释放出来。

可以通过机械破碎、酶解或超声波破碎等方法,将待提取的细胞或组织进行处理,使其细胞壁破裂。

2. 蛋白质消化:为了去除细胞中的蛋白质,需要进行蛋白酶处理,将蛋白质分解释放RNA。

常用的蛋白酶有蛋白酶K、蛋白酶ase等。

3. RNA沉淀:利用盐溶液将RNA沉淀下来。

常用的盐溶液有醋酸钠、氯化钠等。

加入盐溶液后,RNA会形成带负电荷的物质,与阳离子结合形成沉淀。

4. RNA纯化:通过将RNA溶解于适当的缓冲液中,并加入醇类或其他试剂,去除干扰物质如DNA、蛋白质和多余的盐等。

这里主要利用了RNA在不同条件下的溶解性差异,从而将RNA纯化。

5. RNA沉淀及洗涤:使用无水乙醚、异丙醇等有机溶剂,将纯化后的RNA沉淀下来。

然后进行洗涤以去除残留的盐和其他杂质。

6. RNA溶解:将RNA沉淀融于适当的溶液中,如去离子水或缓冲液,以便后续实验的进行。

RNA提取的原理主要基于RNA具有独特的化学结构和物理性质。

RNA是由核苷酸组成的,与DNA相似,但其具有URACIL(U)碱基而非胸腺嘧啶(T)碱基。

RNA在细胞内参与转录和翻译过程,是转录过程产生的物质,通过提取RNA可以获得物种特异性的RNA序列,进而进行RNA测序、定量PCR等分子生物学实验。

在RNA提取过程中,细胞破碎、蛋白质消化、RNA沉淀、纯化及溶解等步骤的设计,使得RNA能够被高效地提取出来,并且不受到外界干扰物质的影响,确保获取纯净的RNA样品,用于后续的实验分析。

总RNA提取

总RNA提取

总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。

若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。

在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。

1.提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放臵5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放臵2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;4.取上层水相臵于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放臵10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下自然干燥;7.用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。

8.TRIZOL百科名片TRIzol是一种新型总RNA抽提试剂,可以直接从细胞或组织中提取总RNA。

其含有苯酚、异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。

TRIzol 在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,因此对纯化DNA及标准化RNA的生产十分有用。

主要成分TRIzol的主要成分是苯酚。

苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。

苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。

rna提取各步骤原理

rna提取各步骤原理

rna提取各步骤原理RNA提取是分子生物学研究中的一项重要技术,用于从细胞或组织中提取RNA分子。

RNA提取的过程包括细胞破碎、RNA溶解、RNA纯化和RNA沉淀等步骤。

下面将分别介绍这些步骤的原理。

1. 细胞破碎细胞破碎是RNA提取的第一步,其目的是将细胞的细胞膜和细胞壁破坏,释放细胞内的RNA分子。

常见的细胞破碎方法有机械破碎、化学破碎和冻融破碎等。

机械破碎利用高速离心或超声波等力量将细胞破碎,化学破碎则通过加入细胞破碎缓冲液,使细胞发生溶解和破裂,冻融破碎则是通过反复冻结和融化来破坏细胞。

2. RNA溶解RNA提取的第二步是将细胞破碎后的RNA溶解在溶解液中,使其能够在后续的纯化步骤中更好地被提取出来。

RNA溶解液一般包含酸性物质和蛋白酶,酸性物质可以中和细胞碱性成分,使RNA分子得以溶解,而蛋白酶则可以降解细胞内的蛋白质,减少RNA与蛋白质的结合。

3. RNA纯化RNA提取的第三步是将RNA从其他细胞成分中纯化出来,以获得较纯的RNA样品。

RNA纯化的常见方法有酚/氯仿法、硅胶柱法和磁珠法等。

酚/氯仿法通过酚和氯仿的密度差异将RNA分离出来,硅胶柱法是利用硅胶柱的亲合性将RNA吸附在硅胶表面,磁珠法则利用磁珠表面的亲合配体与RNA的亲和性将RNA捕获。

4. RNA沉淀RNA提取的最后一步是将纯化后的RNA进行沉淀,以去除残余的杂质并集中RNA分子。

RNA沉淀常使用乙醇沉淀法,即在加入乙醇的条件下,使RNA分子与乙醇结合形成可见的沉淀物,然后通过离心将沉淀物沉淀下来。

沉淀后的RNA可以通过去除乙醇并溶解在适当的缓冲液中,得到最终的RNA样品。

总结起来,RNA提取的步骤包括细胞破碎、RNA溶解、RNA纯化和RNA沉淀,每一步都有其特定的原理和方法。

通过这些步骤,可以从细胞或组织中提取出纯度较高的RNA样品,为后续的RNA 分析和研究提供基础。

RNA提取技术的发展不仅在分子生物学研究中具有重要意义,也在临床诊断和药物研发等领域发挥着重要作用。

RNA提取原理及步骤

RNA提取原理及步骤

细菌总RNA提取一、TRIzol溶液提取细胞总RNA实验原理1. TRIzol溶液的成分及作用:苯酚、异硫氰酸胍、8-羟基喹啉等。

其中苯酚可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,8-羟基喹啉(可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用)、异硫氰酸胍(是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离)、β-巯基乙醇(主要作用是破坏RNase 蛋白质中的二硫键)。

因此内源和外源RNase(RNA酶)受抑制,在样品裂解或匀浆过程中,TRIZOL能保持RNA完整性。

2. 提取原理:细胞用TRIzol溶液裂解后,加入氯仿后溶液分为水相和有机相,RNA在水相中(上层)、中层为DNA、下层为粉色的蛋白质层。

之后将水相取出,用异丙醇或者无水乙醇沉淀回收RNA。

RNA沉淀用70%的乙醇进行漂洗,最后加ddH2O溶解。

二、实验步骤1.取一只2mL离心管,加入大肠杆菌培养液0.7ml,10,000 rpm离心2 min,倒掉上清液。

2.加入2mL TRIzol溶液, 至菌体彻底悬浮并彻底裂解。

之后,在室温下放置5min,使核酸蛋白质彻底分离。

3.往管中加入0.4ml氯仿,盖好管盖,剧烈震荡15sec,之后在室温放置3min。

4.4℃,13000rmp,离心15min。

取出后,可见样品分成三层,RNA在水相中(上层)、中层为DNA、下层为粉色的蛋白质。

5.将上层水相小心取出(约0.5ml),加入1.5ml离心管中,往管中加入等体积的异丙醇。

室温下在室温放置5min。

6. 4℃,13000rmp,离心10min。

离心后,可见管底见胶装沉淀。

7.加入2ml 70%乙醇洗涤沉淀,之后倒出液体,注意不要将沉淀倒出,若沉淀松动,可稍离心。

8.用黄色枪头将剩余液体全部吸出后,往管中加入25μl ddH2O,彻底溶解RNA。

9.电泳检测RNA以及昨天实验的DNA。

各取8μl样品与2μl loading buffer 混匀,点样。

总RNA提取的原理步骤

总RNA提取的原理步骤

总RNA提取的原理步骤
1.细胞破碎:首先需要破坏细胞膜以释放细胞内的RNA。

这可以通过
物理方法(如机械破碎或超声波破碎)或化学方法(如细胞裂解酶或去涂
膜剂)来实现。

2. 去除DNA:细胞内还存在DNA,因此需要使用RNase-free DNase
对DNA进行降解,以避免后续的RNA提取过程中DNA的污染。

3.分离RNA:接下来需要将RNA与其他细胞组分分离。

这可以通过加
入异丙醇或酚/氯仿混合物等有机溶剂,使RNA以水相形式存在并与有机
相相分离。

4.沉淀RNA:将有机相中的RNA沉淀下来,可以通过离心或使用醇沉
淀法实现。

有机相中的RNA会以颗粒状沉积于管壁上。

5. 洗涤和溶解:沉淀下来的RNA还会残留有一些污染物,因此需要
进行洗涤以去除这些污染物。

通常使用乙醇洗涤来去除盐和其他杂质。

最后,RNA可以通过溶解于适当的缓冲液中,如TE缓冲液或RNase-free水。

6.RNA质量检测:为了评估RNA的质量和纯度,一般会使用紫外吸收
光谱仪测定RNA的吸光度比值(A260/A280),以确定是否含有污染物。

总RNA提取的效率和纯度取决于多种因素,包括样本类型、细胞破碎
方法、RNase的去除和混合物分离的效果等。

因此,在总RNA提取过程中,需要注意严格控制废液的处理、采用无RNase酶的耗材和试剂、严格遵循
操作规程等。

总体而言,总RNA提取是从细胞或组织样本中提取总碱基为基础的RNA混合物的过程,它为后续的转录组学研究、基因表达分析等提供了重要的基础。

Trizol法提取RNA原理及实验步骤(新手详细注释版)

Trizol法提取RNA原理及实验步骤(新手详细注释版)

Trizol法提取RNA原理及实验步骤(新手详细注释版)展开全文!Trizol法使用步骤一、分离纯化的基本原理研究基因的表达和调控时常常要从组织中分离和纯化RNA。

RNA 质量的高低常常影响cDNA库,RT-PCR和Northern Blot等分子生物学实验的成败。

Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。

二、需自备的试剂和材料无水乙醇、氯仿、1.5ml Eppendorf管(RNase-free)、Tips (RNase-free)三、准备工作RNase酶非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。

它在一些极端的条件可以暂时失活,但限制因素去除后有迅速复性。

用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是RNase完全失活。

它广泛存在于人的皮肤上,因此,在与RNA制备有关的分子生物学实验时,必须戴手套。

RNase的又一污染源是取液器,根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。

一般情况下采用用DEPC(焦炭酸二磷脂,一种RNase抑制剂)配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部,基本达到要求。

取RNase-free的物品时必须戴手套。

1、塑料制品的处理尽可能使用无菌,一次性塑料制品,已标明RNase-Free的塑料制品,如没有开封使用过通常没有必要再次处理。

对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使用。

处理步骤如下:1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。

注意:DEPC为剧毒物,活性很强,小心在通风柜中使用。

2)处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。

3)在通风柜中室温处理过夜。

4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住含已DEPC水处理过的塑料制品的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少30分钟。

5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。

置于干净处备用。

2、璃玻和金属物品250°C高压灭菌烘烤3小时以上。

(完整版)总RNA提取的原理、步骤

(完整版)总RNA提取的原理、步骤

总RNA提取的原理、步骤1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。

当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。

水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。

2.简易步骤细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆↓室温静置5分钟↓加入1/5 TRIZOL试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀↓室温静置5分钟,12000g 4℃离心l5分钟↓将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀↓室温静置10分钟,12000g 4℃离心l0分钟,弃上清↓向沉淀中加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4℃离心5分钟↓弃上清保留沉淀,干燥↓沉淀物溶解于11μl的DEPC处理水中↓注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。

注意事项①全程配戴一次性手套。

皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。

培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。

②使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。

③在TRIZOL中,RNA是隔离在RNA酶污染之外的。

而对样品的后续操作会要求用无RNA酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。

玻璃器皿可以在150°C的烘箱中烘烤4小时。

塑料器皿可以在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。

④用TRIZOL抽提RNA时要戴手套和护眼罩。

避免接触皮肤和衣服。

在化学通风橱完成操作。

避免呼吸道吸入。

如无例外,所有的操作应该在15 -30°C的条件下完成,试剂亦在15 -30°C的条件下。

⑤75%乙醇(用DEPC处理过的水配制:将水加入无RNA酶的玻璃瓶中,加入DEPC至0.01% (v/v)。

实验一RNA提取方法及原理

实验一RNA提取方法及原理

实验一RNA提取方法及原理RNA提取是从生物样本中提取RNA分子的一系列操作过程,其中包括细胞破碎、RNA与其他分子的分离和纯化。

RNA提取可用于研究基因表达、编码RNA功能等生物学研究领域。

一、RNA提取方法1.直接方法直接法是一种快速且简单的RNA提取方法,适用于较小的样本。

该方法不需要扩增RNA,并且避免了DNA污染。

主要步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀、RNA沉淀和洗涤。

直接方法可用于提取总RNA或其中一种特定类型的RNA(如mRNA)。

2.两步法两步法是RNA提取的常用方法之一,适用于大多数样本。

首先使用各种方法破碎细胞,使RNA释放出来。

然后通过蛋白质沉淀、RNA沉淀和洗涤来纯化RNA。

两步法具有更好的RNA纯度和更高的产量。

3.树脂结合法树脂结合法是一种通过RNA与树脂结合来纯化RNA的方法。

树脂有很强的亲和力,可以选择性地结合RNA。

树脂结合法适用于小样本量或从混合样本中纯化特定RNA的情况。

4.直接PCR法直接PCR法是一种将RNA直接用于PCR扩增的方法。

它通过添加DNA合成酶和逆转录酶,将RNA转录成cDNA,并立即进行PCR扩增。

二、RNA提取原理RNA提取的原理是利用物理和化学方法破坏细胞膜,使RNA释放出来,然后通过沉淀和洗涤来纯化RNA。

细胞破碎:细胞破碎的方法有多种选择,包括机械破碎、酶解和化学破碎等。

机械破碎可通过震荡或高压细胞破碎仪实现。

酶解法是利用酶消化细胞膜,促进RNA的释放。

化学破碎是利用化学物质,如氯仿、酚和乙酸酐等。

蛋白质沉淀:加入蛋白质沉淀剂(如酒精或异丙醇)可使蛋白质沉淀而RNA在上清液中。

RNA沉淀:加入RNA沉淀剂,通过离心将RNA从上清液中沉淀下来。

RNA沉淀后,上清液中的DNA和蛋白质会被除去。

洗涤:通过加入酒精或异丙醇溶液洗涤RNA,除去残留的污染物,如盐和酚。

在RNA提取过程中,需要注意一些关键点,以确保提取到高质量的RNA。

例如,实验过程中需注意酶和核酸酶的污染,使用无核酸酶的试剂和工具。

提取植物rna的步骤及原理

提取植物rna的步骤及原理

提取植物rna的步骤及原理答案:一、实验目的通过本实验学习从植物组织中提取RNA的方法二、实验原理RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的RNA,必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。

高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活RNA酶,所以RNA从细胞中释放出来时不被降解。

细胞裂解后,除了RNA,还有DNA、蛋白质和细胞碎片,通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、均一的总RNA。

三、仪器、药品与试剂配方(一) 仪器1.低温离心机2.分光光度计3.琼脂糖胶电泳系统,用前先用1% Na OH溶液浸泡过夜,之后再用DEPC水浸泡冲洗。

4.高压灭菌锅5.研钵、剪刀、一次性手套等(二) 药品1.焦碳酸二乙酯(DEPC)2.吗啉代丙烷磺酸(MOPS)3.异硫氰酸胍4.醋酸钠(NaAc)5.氯仿6.苯酚7.甲醛8.乙醇9.乙二胺四乙酸(EDTA)10.琼脂糖11.异丙醇(三) 试剂配方1.0.1% DEPC水0.1 ml DEPC 加入100 ml三蒸水中,振摇过夜,再湿热灭菌。

2.2 mol/L NaAc、0.5 mol/L EDTA、4 mol/L异硫氰酸胍、4 mol/L LiCl等均用DEPC 水配制。

3.5ΧMOPS 电泳缓冲液(pH 7.0)MOPS 0.1 mol/LNaAc 40 mmol/LEDTA 5 mmol/L四、实验步骤(一)总RNA的提取(方案一)1.实验前10天左右播种水稻种子,在3-4叶期,剪取1.2 g幼叶。

放入研钵,在液氮中研磨成粉末状,移入10 mL离心管。

加入4 mol/L异硫氰酸胍4 mL苯酚3 mL2 mol/L NaAc (pH 4.8) 0.3 mL氯仿0.6 mL混匀,冰浴放置30 min。

2.4℃,8000 r/min,离心13 min。

3.弃沉淀,取上清至另一干净无菌离心管中。

4.加入2倍体积无水乙醇,-70℃,0.5 h。

总RNA的提取原理总RNA提取

总RNA的提取原理总RNA提取

总RNA的提取原理总RNA提取总RNA提取是生物学研究中常用的一种实验步骤,旨在从生物样品(如细胞或组织)中分离出所有的RNA分子,包括mRNA、rRNA和tRNA等。

总RNA提取的原理主要涉及以下几个方面:1.细胞破碎:总RNA提取的第一步是将细胞或组织破碎,以释放RNA。

破碎方法通常包括融解细胞膜和核膜,如物理破碎(机械剪切或超声波破碎)和化学破碎(利用洗涤剂、有机溶剂或酶等)。

2.RNA的稳定化:由于RNA易受到核酸酶的降解,因此在总RNA提取过程中需要将RNA稳定化以防止其降解。

常用的方法是在提取缓冲液中加入抑制核酸酶活性的剂。

3.蛋白质的去除:总RNA提取中需要将蛋白质从RNA中分离。

通常采用蛋白酶K或亲水基团(如硅胶或磷酸纤维素)来与蛋白质发生相互作用,从而将蛋白质分离出来。

4.RNA的纯化:在总RNA提取中,需要将RNA和其他杂质分离开来,以得到纯净的RNA。

常用的方法包括酚-氯仿提取、离心柱层析和磁珠层析等。

其中,酚-氯仿提取法是一种常用且经典的RNA纯化方法,通过酚醇中RNA在水相中的溶解度较高,而DNA和蛋白质则更倾向于酚醇相,从而实现RNA的分离。

总RNA提取的流程通常包括以下几个步骤:1.样品的处理:对细胞或组织样品进行处理,包括破碎细胞膜和核膜。

2.RNA的稳定化:将样品在提取缓冲液中孵育以稳定RNA。

3.蛋白质的去除:通过蛋白酶或亲水基团与蛋白质发生相互作用,将蛋白质分离出来。

4.RNA的纯化:通过酚-氯仿提取、离心柱层析或磁珠层析等方法将RNA纯化。

5.RNA的定量和质量检测:使用比色法、吸光度法或聚丙烯酰胺凝胶电泳等方法定量和检测RNA的质量。

总RNA提取是一种常用的实验步骤,在分子生物学和遗传学研究中起着重要的作用。

它可用于研究基因调控机制、新基因的发现、遗传多样性分析等研究领域,并为后续的转录组分析、RT-PCR和RNA测序等方法提供基础。

RNA提取的原理与方法

RNA提取的原理与方法

RNA提取的原理与方法1.细胞破碎:首先需要使细胞破碎,使RNA暴露在细胞外部。

这可以通过物理方法(如振荡器、超声波处理)或化学方法(如细胞裂解缓冲液的使用)来实现。

2. RNA稳定性保护:细胞破碎后,RNA容易被内源性核酸酶降解,因此需要加入RNase抑制剂来保护RNA的完整性。

3.蛋白质沉淀:为了去除DNA和蛋白质,可以加入蛋白酶K或其他蛋白质沉淀剂,如氯酸酚、酚/氯仿等,将蛋白质沉淀下来。

4.RNA纯化:在RNA与其他杂质分子被蛋白酶沉淀下来后,可以通过酚/氯仿法、硅胶膜法、离心柱法等方法纯化RNA。

其中最常用的方法是酚/氯仿法,利用RNA在酚相上溶解度较高、而DNA和蛋白质在水相上溶解度较高的差异来实现RNA的纯化。

5.RNA沉淀:将纯化后的RNA通过加入适量的醋酸乙酯或异丙醇进行沉淀,将RNA沉淀下来。

6. RNA溶解:将RNA沉淀物重悬于适当的缓冲液中,如RNase-free水或核酸稀释缓冲液。

1.酚/氯仿法:酚/氯仿法是一种经典的RNA提取方法,通过利用RNA、DNA和蛋白质在酚相和水相之间的差异来分离纯化RNA。

该方法简单易行,适用于大多数生物样本。

2.硅胶膜法:硅胶膜法是一种基于RNA与硅胶膜之间的亲和性质,将RNA结合在硅胶膜上,通过洗脱来纯化RNA。

该方法适用于RNA的小样本量提取,纯化效果较好,但操作较为复杂。

3.离心柱法:离心柱法是一种快速、方便的RNA提取方法,它基于在离心柱内含有离心柱膜,通过对样品进行破碎和混合,RNA能够在膜上固定,去除DNA和蛋白质等杂质。

该方法适用于多样本高通量分析。

4.磁珠法:磁珠法利用了具有特定亲和性的磁珠与RNA的结合来纯化RNA。

该方法高度自动化,适用于高通量分析,但对特定仪器设备的需求较高。

在进行RNA提取时,需要注意以下几点:1.细胞破碎后,尽快进行RNA提取,以避免RNA的降解。

2. 使用无RNase的试剂和消毒工具,以防止RNase的污染。

动物组织细胞总RNA的提取实验原理及步骤

动物组织细胞总RNA的提取实验原理及步骤

实验十一动物组织细胞总RNA的提取一、实验原理RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。

对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。

获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。

由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。

再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。

在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase 活性,保护RNA分子不被降解。

因此提取必须在无RNase的环境中进行。

可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。

提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。

并有助于除去非核酸成分。

本实验介绍异硫氰酸胍法和TRIzol法提取动物组织总RNA并通过电泳进行鉴定。

二、仪器和试剂1.仪器:超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管、玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。

2.试剂:(1)细胞裂解液:异硫氰酸胍 4mol/L柠檬酸钠(pH7.0) 25mmol/L十二烷基肌氨酸钠 0.5%β-巯基乙醇 0.1mol/L称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。

然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍 25g,混合,完全溶解后4℃保存备用。

(2)10×凝胶缓冲液:吗啉代丙璜酸(MOPS)(pH7.0) 200mmol/LNaAc 100mmol/LEDTA(pH 8.0) 10mmol/L过滤除菌后避光保存。

提取rna的步骤及原理

提取rna的步骤及原理

提取rna的步骤及原理RNA提取是分子生物学实验中的一项重要步骤,它是从生物样本中分离出RNA分子的过程。

RNA提取的原理是利用化学方法破坏细胞膜和核膜,使得细胞内的RNA分子释放出来,并且通过特定的提取试剂将RNA分子纯化出来。

下面将介绍RNA提取的步骤及原理。

首先,准备样本。

样本可以是细胞、组织或者血液等生物材料,需要将样本收集到离心管中,并且在样本收集后尽快进行RNA提取,以保证RNA的完整性和稳定性。

其次,细胞破裂。

细胞破裂是RNA提取的关键步骤之一,可以通过机械破碎或者化学方法来实现。

机械破碎是利用高速离心或者超声波等物理手段破坏细胞膜和核膜,释放细胞内的RNA分子。

化学方法则是利用洗涤缓冲液或者酶来破坏细胞膜和核膜,使得RNA分子得以释放。

接下来,RNA纯化。

RNA纯化是为了去除样本中的DNA、蛋白质和其他杂质,使得提取得到的RNA分子纯度较高。

RNA纯化的方法有很多种,常用的方法包括酚氯仿法、硅胶柱法和磁珠法等。

其中,酚氯仿法是通过酚和氯仿的密度差异来分离RNA和其他杂质,硅胶柱法则是利用硅胶柱的亲和性吸附RNA分子,而磁珠法则是利用磁珠表面修饰的特定配体与RNA分子结合,然后通过磁场分离RNA。

最后,RNA溶解。

提取得到的RNA通常以水溶液的形式保存,因此需要将RNA溶解在适当的缓冲液中,以便后续的RNA定量和实验操作。

总的来说,RNA提取的步骤包括样本准备、细胞破裂、RNA纯化和RNA溶解。

通过这些步骤,我们可以从生物样本中高效、纯度较高地提取出RNA分子,为后续的RNA分析实验提供可靠的样本基础。

在实际操作中,需要根据样本的特性和实验的要求选择合适的RNA提取试剂盒,并严格按照试剂盒说明书中的操作步骤进行实验。

此外,为了保证提取得到的RNA质量和数量,需要注意实验中的细节操作,如样本保存、试剂配置、离心参数等,以确保实验的准确性和可重复性。

总之,RNA提取是分子生物学实验中的重要步骤,掌握好RNA提取的原理和操作技巧对于后续的实验结果具有重要的影响。

Agilent实验原理及步骤

Agilent实验原理及步骤

Agilent 实验原理及步骤一、总RNA抽提(TRIzol法)1.每2×107细胞加入1 ml Trizol,在旋涡震荡器上混匀;对于组织样品,每100mg组织可以加入1 ml Trizol,用液氮研磨或采用电动匀浆器充分打碎组织块。

2.加入约1/5体积的氯仿,上下颠倒充分混匀1 分钟左右,室温下静置5 分钟。

3.4℃,12,000 rpm 离心15 分钟后小心取出上清液,将上清夜转入新的1.5 ml离心管,加入等体积的异丙醇,轻轻颠倒混匀,室温静置5 分钟。

(15ml离心管用7,500rpm离心20min)4.4℃,12000 rpm离心10 分钟后,去上清,向沉淀中加入2/5体积的70% 乙醇, 4℃,12000 rpm离心洗涤沉淀15 分钟。

(15ml离心管用7,500rpm离心20min)5.去上清,沉淀室温晾干后加入适量无RNA酶的水充分溶解沉淀,测定OD260和OD280值。

(optional)对于从组织样本抽提的总 RNA,为了更好的去除基因组DNA 的污染,可以采用无RNA 酶的DNA酶I 处理,从而提高样品纯度。

二、总RNA质量检测(琼脂糖电泳以及Lab-on-a-chip电泳检测)(一)琼脂糖胶电泳1、配置用DEPC处理的电泳缓冲液50⨯TAE,高压灭菌后待用。

2、使用电泳槽前用3%H2O2浸泡15min,然后用DEPC处理的水冲洗,倒入适量1⨯TAE电泳缓冲液。

3、称取适量琼脂糖,加入1⨯TAE电泳缓冲液,制备1%的胶(注意使用专用的溶液和相关设备,避免引入外源RNA酶)。

4、用专用6⨯Loading buffer做指示剂,取10µl上样电泳(电压100伏)15min。

5、关闭电源,取出电泳胶,在凝胶成像仪上观测、拍照,保存图像。

6、评价总 RNA或 mRNA质量(见FAQ)。

通过目测28S和18S的亮度比例可以初步评价总RNA的质量。

一般认为28S:18S ≥2可以初步判定总RNA 质量较好,如图1所示。

RNA提取原理及实验详细步骤介绍

RNA提取原理及实验详细步骤介绍

总RNA提取一、实验材料及作用原理1,Trizol主要成分:苯酚,8-羟基喹啉,异硫氰酸胍,β-巯基乙醇Trizol 法提RNA时,加入氯仿RNA在上层水相,DNA及蛋白质在下层有机相中(也有人说是在中间层和有机相中)。

酚氯仿法提取DNA时:提取试剂Tris 饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1à主要成分苯酚,氯仿,异戊醇用酚氯仿法提取DNA时,DNA出现在水相中,DNA出现在不同位置的原因是Trizol方法是通过剧烈变性,导致基因组DNA和核蛋白,如核小体,发生共沉淀,因此,加入有机溶剂萃取后,基因组DNA不会溶解,可能会出现在沉淀或者两相之间的界面。

而游离的RNA,以及部分DNA碎片则会保留在水相中。

TRIZOL是一种新型总RNA抽提试剂,可以直接从细胞或组织中提取总RNA;TRNzol可保持RNA完整性,同时裂解细胞,溶解细胞内含物。

异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,其主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白/核酸物质解聚得到释放。

酚可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNAase。

在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA 在上层水相中,取出水相后,用异丙醇沉淀可回收RNA,用乙醇沉淀中间层可回收DNA,用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。

2,异丙醇的作用是通过羟基的疏水作用使得RNA链中的亲水基团收到保护,等同于沉淀。

因为RNA和某些杂质不溶于异丙醇,所以用乙醇来沉淀去盐和有机溶剂。

3,D EPC(Diethyl pyrocarbonate),中文名为焦碳酸二乙酯。

分子式为C6H10O5,分子量为162.14。

是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。

通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性,常用于生物实验中RNA的提取等。

DEPC37℃溶于水中,处理12h,然后120℃高温高压灭菌30min。

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总RNA提取的原理、步骤
1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)
TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。

当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。

水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。

2.简易步骤
细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆

室温静置5分钟

加入1/5 TRIZOL试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀

室温静置5分钟,12000g 4℃离心l5分钟

将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀

室温静置10分钟,12000g 4℃离心l0分钟,弃上清

向沉淀中加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4℃离心5分钟

弃上清保留沉淀,干燥

沉淀物溶解于11μl的DEPC处理水中

注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。

注意事项
①全程配戴一次性手套。

皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。

培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。

②使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。

③在TRIZOL中,RNA是隔离在RNA酶污染之外的。

而对样品的后续操作会要求用无RNA酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。

玻璃器皿可以在150°C的烘箱中烘烤4小时。

塑料器皿可以在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。

④用TRIZOL抽提RNA时要戴手套和护眼罩。

避免接触皮肤和衣服。

在化学通风橱完成操作。

避免呼吸道吸入。

如无例外,所有的操作应该在15 -30°C的条件下完成,试剂亦在
15 -30°C的条件下。

⑤75%乙醇(用DEPC处理过的水配制:将水加入无RNA酶的玻璃瓶中,加入DEPC至
0.01% (v/v)。

放置过夜并高压灭菌。

)
⑥每50—100 mg组织加1ml的TRIZOL。

匀浆化时组织样品容积不能超过TRIZOL容积的10%。

⑦单层生长的细胞直接往直径3.5 cm的培养板中加入1ml的TRIZOL溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。

依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL 量(每10 cm2加1 ml)。

当TRIZOL量不足时可导致抽提的RNA中污染有DNA。

⑧在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C保存至少一个月。

RNA沉淀(RNA 洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C至少可以保存一周,在–5—–20°C下至少可保存一年。

逆转录cDNA及注意事项
如果cDNA当天不使用,则要保存在-20℃或-70℃。

RNA逆转录成cDNA操作流程简图如下:(在冰盒上操作)
1.将提取的RNA溶解于11 μl DEPC-t净化水中,加入1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP 轻微震荡后离心3-5秒。

2.在PCR扩增仪上70℃ 5分钟。

3.冰上冷却1分钟,并短暂离心,向反应体系中加入5×reaction buffer 4μl,RibolockTM Ribonuclease inhibitor (20 u/μl) 1μl,10 mM dNTP mix 2μl。

4.轻微震荡后离心3-5秒,在PCR扩增仪上37℃ 5分钟。

5.向反应体系中加入RevertAidTM M-MuLV Reverse Transcriptase (200u/ul) 1μl,在PCR 扩增仪上42℃ 60分钟进行逆转录,70℃ 10分钟灭活逆转录酶。

6.收集反应产物,冰上冷却。

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