分子诊断知识点
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1、基因(gene)是含有生物信息的DNA 功能片段,根据这些生物信息可以编码具有生物功能的产物,包括RNA 和蛋白质(多数).
2、基因组genome, 指细胞或生物体一套完整的遗传物质,包括所有基因和基因间的区域(序列)。
3、基因组学genomics 以基因组为研究对象的一门学科,包括基因组作图、基因组测序、基因定位、基因功能分析
4、结构基因:编码RNA 或蛋白质的核苷酸序列
5、基因表达:DNA 携带遗传信息通过转录传递给RNA,mRNA 通过翻译将基因的遗传信息在细胞内合成具有生物功能的各种蛋白质的过程
6、C 值基因组DNA 全部碱基(对)数。C 值是物种的一个重要特性常数。C 值矛盾,C 值悖论:生物体的进化程度与基因组大小之间不完全成比例的现象
7、N 值矛盾,N 值悖论:基因组中的基因数目与生物进化程度或复杂程度的不对称性
8、必需基因(致死基因)关系到生物体存活的基因。可通过基因突变实验确定必需基因。:
9、原核生物基因组1、细菌、支原体、立克次体、衣原体、螺旋体、放线菌、蓝绿藻等
10、重叠基因:是指两个或两个以上的基因共有一段DNA 序列,或是指一段DNA 序列为两个或两个以上基因的组成部分。
11、操纵子:由一组功能相关的结构基因连同其上游调控序列共同组成一个转录单位
12、质粒的分类致育质粒F 质粒)编码性菌毛,介导细菌之间的接合传递;耐药性质粒R 质粒)编码细菌对抗菌药物或重金属盐类的耐药性;毒力质粒Vi 质粒)编码与该菌致病性有关的毒力因子;细菌素质粒编码细菌产生细菌素;代谢质粒编码产生相关的代谢酶。
13、严紧控制型拷贝数少,一般<10 个,分子量大;调节因子是蛋白质,复制受限,受染色体DNA 复制系统的控制;严谨控制机理(低拷贝原因),认为是该质粒可以产生阻遏蛋白,反馈抑制自身DNA 合成。松弛控制型拷贝数多,10-200 个,分子量小;调节因子是RNA,复制不受染色体DNA 复制系统限制基因工程使用松弛型(高拷贝数)质粒,以获得较多的基因产物。
14、质粒性质
1、质粒的转移:可以通过转化、转导或接合作用而由一个细菌细胞转移到另一个细菌细胞中,使两个细胞都成为带有质粒的细胞;质粒转移时,它可以单独转移,也可以携带着染色体(片段)一起进行转移,所以它可成为基因工程的载体。
2、质粒具有选择性标记:质粒有抗药性基因、营养缺陷型基因、抗重金属盐基因等多种选择性标记
3、质粒的不相容性:质粒已成为分子克隆的有用工具,是目的DNA 的载体。载体质粒大多是在天然质粒基础上经人工构建而成,
15、质粒特点:1、有限制性核酸内切酶单一切口,可用以重组外源DNA;2、有筛选标记,如抗药基因等;3、插入外源DNA 后,仍能转化宿主细胞,并能复制。
16、质粒基因转移的方式1.接合作用当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DN 从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌)的DNA 转移称为接合作用 2.转化作用通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用3、转导作用当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA 转移及基因重组即为转导作用4、转染作用通过感染方式将外来DNA 引入宿主细胞,并导致宿主细胞遗传性状改变的过程称为转染(transfection) 。转染是转化的一种特殊形式。
17、完整的病毒颗粒包括:衣壳、基因组(DNA 或RNA)、被膜、病毒颗粒中的其他内容物
18、病毒分段基因组:流感病毒属分段RNA 病毒:意义:a)降低包装压力b)降低了造成断裂的可能性,提高编码能力c) 有分段基因组的病毒一般感染效率较低,只有全部基因组核酸片段存在时,病毒才具有感染能力。植物病毒d) 由于分段基因组易发生重组,故病毒容易变异。19、病毒基因组特点:1、有特殊的末端序列:粘性末段、反向互补序列、长末端重复序列、帽和尾结构等;2、结构紧密,体现在不仅非编码序列少,而且有重叠基因的存在;真核生物
20、染色体的包装:(1)染色体的一级结构—核小体(2)染色体的二级结构—螺线管3)染色体的三级结构—超螺线管(4)染色体的四级结构—染色单体
21、真核生物染色体基因组一般特征1、真核生物的基因组比较庞大;2、线性双链DNA 和二倍体;3、真核细胞基因转录产物为单顺反子。4、存在重复序列,重复次数可达百万次以上5、基因是不连续的(断裂基因)
22、单顺反子:一个结构基因经过转录生成一个mRNA 分子,再翻译生成一种蛋白质;
23、重复序列:指多拷贝的相同或近似序列的DNA 片段高度重复序列:按其结构特点分为三种:1、反向重复序列2、卫星DNA 由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA 分开,因而称为卫星DNA (或随体DNA)3、较复杂的重复单位组成的重复顺序中度重复顺序:依据重复顺序的长度,中度重复顺序可分为:短散布元件和长散布元件Alu 家族是哺乳动物基因组中含量最丰富的一种中度重复顺序家族(短分散元件),Alu 家族每个成员的长度约300bp ,每个单位长度中有一个限制性内切酶AluⅠ的切点(AG↓CT),Alu 可将其切成长130 和170bp 的两段,因而定名为Alu 序列(或Alu 家族)
24、断裂基因(split gene):真核生物的结构基因,由若干个编码区和非编码区相间隔但又连续镶嵌而成,为一连续的氨基酸组成的完整的蛋白质编码,或为具有特殊功能的tRNA 或rRNA 编码,因此称为断裂基因。并非真核生物所有的结构基因均为splitting gene 例:组蛋白基因家族、干扰素、酵母中多数基因
25、线粒体DNA 的遗传特性:母系遗传、突变率高、异质性、阈值效应、半自助复制与协同效应
26、阈值效应:mtDNA 突变导致氧化磷酸化水平降低,当突变的mtDNA 达到一定比例时,使得线粒体总的能量供应降低到维持组织正常功能所需能量的最低值时,才可能引起某组织或器官的功能异常而出现临床症状。
27、DNA 分子多态性的主要方式:微卫星DNA 多态性(同一位点不同个体之间有不同长度的微卫星DNA)、单个核苷酸的变异—单核苷酸多态性(SNP)等
28、STR 结构:微卫星DNA 又称短串联重复STR,指以1-6 个碱基为核心单位串联重复而成的一类序列。微卫星DNA 结构序列由中间的核心区(重复序列)和外围的侧翼区(非重复序列)组成,其核心序列为1~6bp,为高度重复序列。成因:1.姊妹染色单体的不均等交换2.复制滑移
29、SNP:SNP 是基因组中散在的单个核苷酸的变异形成的一种DNA 分子多态性位置:编码区SNP cSNP)、基因周边区SNP pSNP )基因间SNP iSNP )SNP 非编、码区:SNP 编码区= 5:1 成因:单个核苷酸(碱基)置换:转换:嘧啶—嘧啶,嘌呤—嘌呤;颠换:嘧啶—嘌呤,嘌呤—嘧啶转换:颠换=3:1。
蛋白质组
1、蛋白质组:生物体的全套蛋白质;或一个生命单位的全套蛋白质
2、蛋白质组特性:与基因组相比,蛋白质组有高度动态性:有组织特异性、生长发育特异