CMA在产前诊断中的应用
泌尿系统畸形胎儿染色体核型及CMA产前诊断
·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2017年第9卷第2期泌尿系统畸形胎儿染色体核型及CMA产前诊断商梅娇1 周 2(1.厦门大学附属第一医院产科,福建厦门 361003;2.中山大学附属第一医院妇产科胎儿中心,广东广州 510080)【摘要】 目的 探讨常规G显带染色体核型分析及染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanaly sis,CMA)技术在先天性泌尿系统畸形胎儿产前诊断中的应用价值及发病相关性,探讨泌尿系统畸形可能的致病机制。
方法 回顾性研究134例产前超声检查发现胎儿泌尿系统畸形并行常规G显带染色体核型分析的病例,其中30例按照AffymetrixCytoScanHD芯片平台的操作手册对胎儿及部分父母的DNA进行消化、连接、PCR、片段化、标记、杂交、洗染并全基因组扫描,采用配套的CHAS软件进行结果分析。
结果 ①134例泌尿系统畸形病例,128例胎儿染色体正常;2例异常,分别为46,XY,del(21)(qter p11:)和46,XY,der(22)t(Y,22)(q11;q13.3),4例染色体多态性,染色体异常率为1.50%(2/134)。
②30例CMA结果均成功获得分析,19例结果正常,检出11例CNVs,CNVs检出率为36.7%(11/30);30例行CMA检测病例仅1例常规染色体核型分析异常(CMA亦检出病理性CNVs),余29例均正常,泌尿系统畸形但染色体核型正常胎儿CNVs检出率为34.5%(10/29)。
③11例CNVs,20%(6/30)考虑为良性CNVs,16.7%(5/30)为病理性CNVs。
6例良性CNVs胎儿,其中5例行父母亲外周血CMA检测,发现均为来源父系或母系的遗传。
5例病理性CNVs胎儿,有3例行父母外周血CMA检测,发现均为新发CNVs。
29例泌尿系统畸形但染色体核型正常胎儿的病理性CNVs检出率为13.8%(4/29)。
2014年染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用协作组目前,G 显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH) 技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal mlcroarray analysis,CMA) 技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA 技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array- based comparative genomic hybridization ,aCGH) 技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array) 技术。
前者需要将待测样本DNA 与正常对照样本DNA 分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA 与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH 技术能够很好地检出CNV,而SNP array 除了能够检出CNV 外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomy,UPD) 和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP 检测探针的芯片,可同时具有CNV 和SNP 芯片的特点。
2010 年,国际细胞基因组芯片标准协作组(lntemational Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium) 在研究了21698 例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV 的检出率为 12.2%,比传统G 显带核型分析技术的检出率提高了10%。
潍坊地区染色体核型分析和CMA技术在预防出生缺陷中的应用研究
中外医疗China &Foreign Medical TreatmentDOI:10.16662/ki.1674-0742.2021.25.036潍坊地区染色体核型分析和CMA 技术在预防出生缺陷中的应用研究吉龙龙1,郑国华1,于淼2,孙明强1,翟玉涵11.潍坊市妇幼保健院检验科,山东潍坊261011;2.潍坊市妇幼保健院审计科,山东潍坊261011[摘要]目的探讨潍坊地区染色体核型分析和微阵列分析(CMA)技术在预防出生缺陷中的应用价值。
方法方便选取2019年1—12月于该院进行产前诊断的92例孕妇作为研究对象,均自愿接受染色体核型分析和CMA 检测,对其两种方法的检查结果及临床资料进行对比分析。
结果92例孕妇的染色体核型分析和CMA 检测的异常率分别为9.78%和10.87%,两种检测方法的染色体异常检出率比较,差异无统计学意义(χ2=0.059,P>0.05),且CMA 和核型分析结果相符率为90.22%。
CMA 可敏感地检出染色体的微缺失和微重复,染色体核型分析可更好地检出染色体倒位和嵌合。
结论染色体核型分析和CMA 技术均可敏感地检出胎儿染色体异常,CMA 对染色体微重复和微缺失的检出敏感性更高,核型分析在检出易位、倒位等方面更具优势,临床上产前诊断医师可将二者结合应用于产前诊断中以提高染色体异常的检出率,减少出生缺陷的发生。
[关键词]染色体核型分析;微阵列分析技术;出生缺陷;染色体异常[中图分类号]R714[文献标识码]A[文章编号]1674-0742(2021)09(a)-0036-04Application of Chromosome Karyotype Analysis and CMA Technology inPrevention of Birth Defects in Weifang AreaJI Longlong 1,ZHENG Guohua 1,YU Miao 2,SUN Mingqiang 1,ZHAI Yuhan 11.Department of Laboratory Medicine,Weifang Maternal and Child Health Hospital,Weifang,Shandong Province,261011China;2.Auditing Department,Weifang Maternal and Child Health Hospital,Weifang,Shandong Province,261011China [Abstract]Objective To explore the application value of chromosome karyotype analysis and microarray analysis (CMA)technology in the prevention of birth defects in Weifang.Methods Conveniently selected 92pregnant women who underwentprenatal diagnosis in the hospital from January to December 2019as the research subjects.All of them voluntarily accepted chromosome karyotype analysis and CMA testing,and compared the results of the two methods and clinical data.Results The abnormal rates of chromosome karyotype analysis and CMA detection of 92pregnant women were 9.78%and 10.87%,respectively.There was no statistically significant difference in the detection rates of chromosome abnormalities between the two detection methods (χ2=0.059,P>0.05),and the coincidence rate of CMA and karyotype analysis results was 90.22%.CMA can sensitively detect chromosome microdeletion and microduplication,and chromosome karyotype analysis can better detect chromosome inversion and mosaicism.Conclusion Both chromosome karyotype analysis and CMA technology can detect fetal chromosomal abnormalities sensitively.CMA is more sensitive to the detection of chromosome microrepetition and microdeletion,and karyotype analysis has more advantages in detecting translocation and inversion.Clinical prenatal diagnostics can combine the two to improve the detection rate of chromosomal abnormalities and reduce the occurrence of birth defects.[Key words]Chromosome karyotype analysis;Microarray analysis technique;Birth defects;Chromosomal abnormalities [基金项目]潍坊市卫生健康委员会科研项目计划(wfwsjk_2019_071)。
核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用
《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期·论著· 核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用刘建珍 林铿 许碧秋 陈鸿桢 (广州市花都区妇幼保健院,广东广州,510800)【摘要】 目的 探讨核型分析联合染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrays,CMA)技术在胎儿超声异常的应用价值。
方法 分析2020年1月至2022年6月就诊于广州市花都区妇幼保健院的220例胎儿超声异常病例的核型分析和CMA结果,按超声情况分为单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常共五组,分析各组染色体异常情况。
结果 核型分析、CMA在胎儿超声异常病例的染色体异常检出率分别为8.18%(18/220)、11.36%(25/220),两种技术对于胎儿染色体异常的检出率差异无统计学意义(χ2=1.26,犘=0.26)。
核型分析较CMA额外检出2例平衡易位,CMA较核型分析额外检出6例拷贝数变异(CNVs)和3例纯合区域(ROH)。
单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常的染色体异常检出率分别为11.11%(4/36)、25.00%(2/8)、16.67(2/12)、10.26%(16/156)、50.00%(4/8)。
多发结构异常的胎儿染色体异常率高于单发结构异常,多项软指标异常胎儿染色体异常率显著高于单项软指标异常,差异有统计学意义(χ2=11.23,犘=0.00)。
结论 胎儿超声异常与染色体异常的关系密切,多项超声异常的胎儿染色体异常风险增加。
核型分析能有效检出染色体平衡易位,CMA对CNVs和ROH检测效能高,两者联合能提高胎儿超声异常的染色体异常检出率,明确致病片段来源及性质,并使异常结果得到验证。
【关键词】 胎儿超声异常;核型分析;染色体微阵列分析【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.02.005 通信作者:陈鸿桢,Email:527538053@qq.com犃狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀狅犳犽犪狉狔狅狋狔狆犻犮犮狅犿犫犻狀犲犱犮犺狉狅犿狅狊狅犿犪犾犿犻犮狉狅犪狉狉犪狔狊犻狀犳犲狋犪犾狌犾狋狉犪狊狅狌狀犱犪犫狀狅狉犿犪犾犻狋犻犲狊犔犻狌犑犻犪狀狕犺犲狀,犔犻狀犓犲狀犵,犡狌犅犻狇犻狌,犆犺犲狀犎狅狀犵狕犺犲狀 (犎狌犪犱狌犕犪狋犲狉狀犻狋狔犪狀犱犆犺犻犾犱犎犲犪犾狋犺犮犪狉犲犎狅狊狆犻狋犪犾,犌狌犪狀犵狕犺狅狌犌狌犪狀犵犱狅狀犵,510800,犆犺犻狀犪)【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toexploretheapplicationofkaryotypiccombinedchromosomalmicroarrays(CMA)infetalultrasoundabnormalities.犕犲狋犺狅犱狊 AnalyzedthekaryotypingandCMAresultsof220fetalultrasoundabnormalitiesvisitedinourhospitalfromJanuary2020toJune2022,andtheultrasoundconditionsweredividedintofivegroups:singlestructuralabnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalities,andthedetectionofchromosomalabnormalitiesineachgroupwasanalyzed.犚犲狊狌犾狋狊 ThedetectionratesofchromosomalabnormalitiesinultrasoundfetalabnormalitiesbykaryotypeanalysisandCMAwere8.18%(18/220)and11.36%(25/220),respectively,andtherewasnosignificantdifferenceinthedetectionrateofchromosomalabnormalitiesbetweenthetwotechniques(χ2=1.26,犘=0.26).Karyotypeanalysisdetected2additionalcasesofequilibriumtranslocation,6additionalcasesofcopynumbervariation(CNVs)and3additionalcasesofhomozygousregion(ROH)comparedwithCMAanalysis.Thedetectionratesofchromosomalabnormalitiesofsinglestructural32Copyright ©博看网. All Rights Reserved.·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期abnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalitieswere11.11%(4/36),25.00%(2/8),16.67(2/12),10.26%(16/156)and50.00%(4/8),respectively.Thefetalchromosomalabnormalityrateofmultiplestructuralabnormalitieswashigherthanthatofsinglestructuralabnormalities,andthefetalchromosomalabnormalitiesofmultiplesoftindexabnormalitiesweresignificantlyhigherthanthatofsinglesoftindexabnormalities,andthedifferencewasstatisticallysignificant(χ2=11.23,犘=0.00).犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Fetalultrasoundabnormalitiesarecloselyrelatedtochromosomalabnormalities,andtheriskoffetalchromosomalabnormalitiesincreaseswithmultipleultrasoundabnormalities.Karyotypeanalysiscaneffectivelydetectthebalancedtranslocationofchromosomes,andCMAhashighefficiencyinthedetectionofCNVsandROH.Thecombinationofthetwocanimprovethedetectionrateofchromosomalabnormalitiesinfetalultrasoundabnormalities,identifythesourceandnatureofpathogenicfragments,andvalidatetheabnormalresults.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Fetalultrasoundabnormalities;Karyotypeanalysis;Chromosomemicroarrayanalysis 超声异常包括结构异常和软指标异常,胎儿超声异常与染色体异常密切相关[1]。
羊水原位培养法联合染色体微阵列分析在产前诊断中的应用
羊水原位培养法联合染色体微阵列分析在产前诊断中的应用向文秀;钱罡【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2024(42)2【摘要】目的评估羊水原位培养法联合染色体微阵列分析(CMA)技术在产前诊断检出胎儿染色体异常中的应用价值。
方法回顾性分析2018年10月至2023年2月于怀化市妇幼保健院因不同产前诊断指征而行羊水穿刺术的3133例孕妇,比较羊.水原位培养法和CMA法在胎儿染色体异常方面的检出率和差异。
结果在3133例样本中,双指征组的异常检出率均较单指征组分别增加0.95%(羊水原位培养法)和2.36%(CMA);两种技术联合检测共检出796例异常(检出率25.41%),其中羊水原位培养法检出300例(9.58%),CMA法检出706例(22.53%)。
两者均能检出145例非整倍体异常和31例染色体结构异常,但CMA另增加检出169例提示致病或可能致病的染色体拷贝数变异(CNV)、杂合性缺失(L0H)、杂合性不存在(A0H)/纯合区域(ROH)及单亲体二倍体异常(UPD),而羊水原位培养法增加检出11例染色体结构异常。
两者联合检出嵌合体23例(0.73%)。
结论羊水原位培养法与CMA技术互为补充,联合应用可显著提高胎儿染色体异常的检出率,可为产前遗传咨.询提供更详细准确的信息,有助于孕妇决策是否终止妊娠。
【总页数】5页(P85-89)【作者】向文秀;钱罡【作者单位】怀化市妇幼保健院遗传科;浙江博圣生物技术股份有限公司【正文语种】中文【中图分类】R466【相关文献】1.荧光原位杂交与染色体微阵列分析技术在胎儿标记染色体产前诊断中的应用2.染色体微阵列分析技术在759例不同产前诊断指征孕妇羊水中的临床应用分析3.染色体核型分析联合染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用价值4.比较羊水细胞原位培养法和胰酶消化法在产前诊断染色体检查中的应用价值因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
应用CMA产前诊断10q23缺失综合征1例
·病例报道·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2018年第10卷第3期应用CMA产前诊断10q23缺失综合征1例罗晓辉1 杜娜2 胡蓉1 卢建1 李怡1 黄伟伟1(1.广东省妇幼保健院医学遗传中心,广东广州 510080;2.广东省妇幼保健院新生儿科,广东广州 510080)【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 B犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2018.03.012 通讯作者:黄伟伟,E mail:254129529@qq.com 10q23缺失综合征(chromosome10q23deletionsyndrome)是一种罕见的染色体微缺失综合征,缺失区域包含犅犕犘犚1犃、犖犌犚3、犌犚犐犇1等致病基因。
10q23缺失综合征表型复杂多样,表型可为发育迟缓、语言发育迟缓,特殊面容(眼距宽、低位耳等),有少许患者可见心脏、手脚等先天畸形[1]。
染色体异常是导致新生儿出生缺陷的关键因素。
10q23微缺失综合征的产前诊断目前报道较少,本文对1例10q23缺失综合征的病例进行产前诊断及遗传学分析,现将该病例报道如下。
1 资料与方法1.1 一般资料 孕妇,32岁,G4P1A2,因“停经17+周,超声发现胎儿NT增厚(3.3mm)”来本科室就诊,孕妇孕期顺利,无特殊不适。
无抽烟、嗜酒史,无胎儿畸形家族史,2018年1月3日孕妇超声提示:宫内妊娠,单活胎,胎儿NT增厚。
1.2 方法 1.2.1 标本采集 该孕妇接受检测前的遗传咨询并签署同意书,根据孕周行羊膜腔穿刺,在B超探头引导下行羊膜腔穿刺术抽取羊水30ml进行培养以及染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)。
1.2.2 CMA检测 采用美国Affymetric公司提供的高分辨全基因组CytoScan750K芯片,实验操作严格按照Affymetric公司提供的操作流程。
染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用
·综述·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第8卷第3期染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用顾莹1 黄欢2 孙丽洲2(1.连云港市妇幼保健院生殖遗传科,江苏连云港 222006;2.江苏省妇幼保健院产科,江苏南京 210036)【摘要】 染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)技术是一种通过对染色体进行全基因组扫描,发现染色体组的数目和结构异常的检测技术。
CMA以其高分辨率、高效率、高自动化操作等优点,不仅能有效检测传统核型分析技术所能检测的染色体数目异常及非平衡性结构异常,还能检测染色体组亚显微结构水平上不平衡重排引起的拷贝数变异(copynumbervariation,CNV),成为现代临床遗传学常规诊断工具,并被引入到产前胎儿遗传疾病检测中。
本文将就产前胎儿遗传病、胎儿遗传病检测的技术回顾、CMA技术的发展及在胎儿遗传病检测中的应用、优势和面临的挑战等做一个详细的综述。
【关键词】 染色体微阵列分析;产前诊断;遗传病;遗传咨询【中图分类号】 R714.53 【文献标识码】 A犱狅犻:10.13470/j.cnki.cjpd.2016.03.011 遗传病指人体遗传物质(包括细胞核DNA和核外线粒体DNA)发生变异或可遗传性修饰而导致的疾病,可由亲代遗传给子代,故称遗传病。
在产前胎儿检测的遗传性疾病中主要包括染色体病、基因病、线粒体病等。
目前已发现的人类染色体异常超过10000种[1],主要包括数目异常,如唐氏综合征21号染色体比正常多一条,女性先天卵巢发育不全缺少一条X染色体;部分染色体大片段结构变异,罗氏易位等;染色体亚显微结构的微缺失或重复,如17q21.31微缺失综合征和22q1l.2微重复综合征。
染色体病对胎儿的危害尤其巨大,除极少数三体和性染色体异常可以存活下来,大多数的染色体数目异常均以流产、死胎而告终,而染色体结构异常则是引起新生儿出生缺陷非常重要的原因,包括智力低下、发育迟缓、多器官畸形等[2],而目前尚无有效的治疗措施,因此需要及早准确检测和积极干预。
染色体微阵列分析在产前诊断中的应用价值
染色体微阵列分析在产前诊断中的应用价值李敏;张庆娥;董晶晶;周月云;郑建丽【期刊名称】《中国妇幼健康研究》【年(卷),期】2022(33)5【摘要】目的探讨染色体微阵列分析(CMA)在产前诊断中的应用价值。
方法选取2018年1月至2021年1月就诊于盐城市妇幼保健院的不良孕产史、无创DNA 产前检测筛查异常、超声检查异常、高龄、血清学筛查异常、父母染色体异常等808例孕妇,行染色体核型分析和CMA检查,并对两种检查结果进行比较分析。
结果CMA共检出染色体数目异常79例(9.78%),其中21三体41例(51.90%)、18三体15例(18.99%)、X三体13例(16.46%)、X四体1例(1.27%)、Y三体6例(7.59%)、其他三体3例(3.80%),与染色体核型分析一致;染色体核型分析检出染色体结构异常9例(1.11%),其中缺失3例(33.33%)、重复2例(22.22%)、嵌合体4例(44.44%)。
CMA检出拷贝数目变异(CNVs)93例(11.51%),其中微重复55例(59.14%)、微缺失38例(40.86%),杂合性缺失(LOH)/单亲二倍型(UPD)10例;CMA染色体异常检出率为23.02%(186/808),明显高于染色体核型分析的10.89%(88/808)(χ^(2)=42.208,P<0.05)。
在93例CNVs中,临床意义不明的CNV(VUS)占64.52%(60/93),良性占25.81%(24/93),致病性CNVs占9.68%(9/93);VUS和良性的发生率均明显高于致病性CNVs发生率,差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为62.004、8.392,P<0.05)。
结论CMA用于产前诊断有助于提高染色体异常检出率,但多数CNVs为VUS,因此CMA的数据库还有待进一步完善,以准确判读CNVs的类型进行产前指导。
【总页数】6页(P96-101)【作者】李敏;张庆娥;董晶晶;周月云;郑建丽【作者单位】盐城市妇幼保健院产前诊断中心【正文语种】中文【中图分类】R173【相关文献】1.染色体微阵列分析技术在侧脑室增宽胎儿产前诊断中的应用价值2.染色体微阵列分析在超声软指标产前诊断中的应用价值3.荧光原位杂交与染色体微阵列分析技术在胎儿标记染色体产前诊断中的应用4.染色体微阵列分析在单纯不良孕产史孕妇产前诊断中的应用价值5.染色体核型分析联合染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用价值因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用
基因组印记异常的案例分析
总结词
基因组印记异常是指基因组中某些基因的印记表达异 常,可能导致胎儿发育异常或疾病,CMA技术有助于 发现基因组印记异常。
原理
通过微阵列芯片与待测样本DNA进行 杂交,检测基因组中碱基序列的变异, 并将变异结果进行高分辨率的定位和 识别。
CMA技术的优势和局限性
优势
高分辨率、高灵敏度、高特异性、快速检测、可检测多种染色体异常和基因组变异。
局限性
无法检测染色体结构异常、无法检测单基因遗传病、无法检测线粒体基因组变异、存在假阳性或假阴性的可能。
印记异常研究
CMA技术能够用于印记异常 的深入研究,为疾病发病机 制和遗传学研究提供有力支 持。
03
CMA技术在产前诊断中的临床 价值
提高产前诊断的准确性和可靠性
CMA技术通过高分辨率的微阵列芯 片,能够检测到染色体的微小变异, 包括拷贝数变异和单核苷酸变异,从 而提高了产前诊断的准确性。
与传统的染色体核型分析相比,CMA 技术具有更高的灵敏度和特异性,能 够更准确地检测出染色体异常,避免 了漏诊和误诊的情况。
降低假阳性率和假阴性率
CMA技术能够更准确地检测出染色体 异常,从而降低了假阳性率和假阴性 率,避免了不必要的侵入性产前诊断 和终止妊娠。
CMA技术可以检测到染色体的微小变 异,而传统的染色体核型分析可能无 法检测到这些变异,因此CMA技术能 够更全面地评估胎儿的染色体异常风 险。
为遗传咨询和生育建议提供依据
CMA技术能够检测出罕见疾病, 如肌萎缩侧索硬化症、脊髓性肌 萎缩症等。
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)目前,G显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array.based comparative genomic hybridization,aCGH)技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array.SNP array)技术。
前者需要将待测样本DNA与正常对照样本DNA分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH技术能够很好地检出CNV,而SNP array除了能够检出CNV外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomv,UPD)和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP检测探针的芯片,可同时具有CNV和SNP芯片的特点”。
2010年,国际细胞基因组芯片标准协作组(International Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium)在研究了2 1 698例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV的检出率为12.2%,比传统G显带核型分析技术的检出率提高了10%。
染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用
3. VOUS:应建议父母行CMA 检测,通过家系综合分析以协助对胎儿检测结 11 果的判断。
(1)新发CNV:若有证据表明该区域内有疾病表型相关的功能基因,通常 认为是可能致病性;若该区域内无基因,通常认为是可能良性,也有可能目 前未发现其临床意义。 (2) 遗传性CNV: ①若胎儿父母有临床表型,且该区域内有疾病表型相关的功能基因,通常认 为该CNV 为可能致病性。 ②若胎儿父母无临床表型,通常情况下,可判断该CNV 为家族性良性CNV; 若胎儿CNV与亲代CNV 大小不同,且缺失或重复的范围扩大了,则应考虑 为可能致病性。此外,还需考虑不完全外显、临床表型差异(父母可能有亚 临床表现精选)ppt课的件 可能。
CMA芯片平台选择
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基于微阵列的比较基因组杂交技术(aCGH)
优势:用户可根据需要设计并制作芯片 可针对特定区域设计高密度探针 以增加在该区域的检测灵敏度和特异性
单核苷酸多态性微阵列技术(SNP array)
优势:SNP 芯片除了带有拷贝数信息外, 还带有SNP 分型的信息; 可检测杂合性缺失(loss of heterozygous,LOH),从而用于检测
1
精选ppt课件
2 主要内容
➢ CMA在产前诊断中的应用概况 ➢ CMA芯片平台选择 ➢ CMA应用于产前诊断的临床指征 ➢ CMA检测前后的遗传咨询及结果解释
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CMA在产前诊断中的应用概况
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CMA在产前诊断中的应用概况
4 2013 年Hillman 等的meta 分析共涉及25 篇文献共18 113 例个体:
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CMA检测前的遗传咨询
3. 检出疾病的遗传异质性:所检出的某些遗传性疾病由于外显率和表现度的差异, 在不同患者间临床表现可能存在很大的变异。 4. 可能检出与临床表型不相关的CNV:通过CMA 技术检测可能发现非亲生父亲、 近亲婚配、迟发性的遗传病或成人期发病的遗传病(如肿瘤),这些结果应该让孕 妇及家属选择是否被告知。
211081161_核型异常产前诊断中CMA与核型检测的应用分析
《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第1期·论著· 核型异常产前诊断中CMA与核型检测的应用分析曾丹 范舒舒 徐静 苗淑红 江玫玫(汕头大学医学院附属粤北人民医院,广东韶关 512026)【摘要】 目的 探讨核型异常产前诊断中CMA分析的临床意义。
方法 收集本中心2017年1月至2021年6月羊膜腔穿刺产前诊断中行核型及染色体微阵列(CMA)联合分析890例羊水标本,对其中染色体核型异常的83例样本进行分析。
结果 890例染色体核型和CMA检测均成功,检出异常核型83例,检出率为9.3%(83/890),染色体数目异常52例;结构异常20例,包括平衡结构异常13例,非平衡结构异常7例;嵌合11例。
结论 染色体核型分析对染色体平衡性结构异常、倒位、嵌合及复杂核型检测更有优势,而CMA技术则对非平衡性结构异常,定位染色体来源、区带、片段大小,变异类型等检测更有优势。
在经济条件允许的情况下,产前诊断标本建议行CMA和染色体联合检测,给临床医师遗传咨询提供更多信息指引。
【关键词】 核型异常;CMA;产前诊断【中图分类号】 R715.5 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.01.007 通信作者:范舒舒,Email:shaoguanfss@yahoo.com犃狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犆犕犃犪狀犱犽犪狉狔狅狋狔狆犲狋犲狊狋犻狀犵犻狀狆狉犲狀犪狋犪犾犱犻犪犵狀狅狊犻狊狅犳犽犪狉狔狅狋狔狆犲犪犫狀狅狉犿犪犾犻狋犻犲狊犣犲狀犵犇犪狀,犉犪狀犛犺狌狊犺狌,犡狌犑犻狀犵,犕犻犪狅犛犺狌犺狅狀犵,犑犻犪狀犵犕犲犻犿犲犻犢狌犲犅犲犻犘犲狅狆犾犲’狊犎狅狊狆犻狋犪犾犃犳犳犻犾犻犪狋犲犱狋狅犛犺犪狀狋狅狌犝狀犻狏犲狉狊犻狋狔犕犲犱犻犮犻狀犲犆狅犾犾犲犵犲,犛犺犪狅犵狌犪狀512026,犌狌犪狀犵犱狅狀犵犘狉狅狏犻狀犮犲,犆犺犻狀犪【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 ToinvestigatetheclinicalsignificanceofCMAanalysisintheprenataldiagnosisofkaryotypeabnormalities.犕犲狋犺狅犱狊 Collect890amnioticfluidsamplesfromJanuary2017toJune2021intheprenataldiagnosisofamniocentesisconductedbyourcenterforjointanalysisofkaryotypeandchromosomemicroarray(CMA),andselect83sampleswithabnormalkaryotype.犚犲狊狌犾狋狊 890casesofchromosomekaryotypeandCMAdetectionweresuccessful,83casesofabnormalkaryotypeweredetected,thedetectionratewas9.3%(83/890),52casesofabnormalchromosomenumber20casesofstructuralabnormalities,including13casesofbalancedstructuralabnormalitiesand7casesofunbalancedstructuralabnormalities;11casesofchimerism.犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Karyotypeanalysishasmoreadvantagesfordetectionofchromosomebalancedstructuralabnormalities,inversion,chimerismandcomplexkaryotypes,whileCMAtechnologyhasmoreadvantagesfordetectionofunbalancedstructuralabnormalities,locationofchromosomeorigin,banding,segmentsize,variationtype,etc.Ifeconomicconditionspermit,itisrecommendedthatprenataldiagnosticsamplesshouldbejointlytestedwithCMAandchromosomestoprovidemoreinformationandguidanceforgeneticcounselingofclinicians.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Karyotypeabnormalities;CMA;Prenataldiagnosis 产前诊断是预防胎儿出生缺陷的一道重要防线,侵入性产前诊断羊膜腔穿刺行染色体核型分析是目前诊断染色体异常的“金标准”,对大于5Mb片段以上的染色体缺失或重复、胎儿染色体数目异常53Copyright ©博看网. All Rights Reserved.·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第1期及结构异常均可做出全面的分析[1],但其培养时间长可能对染色体核型结果造成影响,而CMA称为"分子核型”,可检出染色体大于1Kb的拷贝数变异(CNVs)的微缺失/微重复,目前已成为产前诊断一线检测手段[1 2],本研究从890例羊膜腔产前诊断中选取染色体核型异常的83例,探讨核型异常产前诊断中CMA分析的临床意义。
羊水细胞染色体核型分析结合cma在孕妇产前诊断中的应用分析
羊水细胞染色体核型分析结合CMA在孕妇产前诊断中的应用分析曾研章广东省阳江市妇幼保健院,广东阳江 529500[摘要] 目的 探讨羊水细胞染色体核型分析结合染色体微阵列分析(CMA)在孕妇产前诊断中的应用价值。
方法 纳入2018年4月~2019年3月我院行产前诊断的126例孕妇为研究对象,所有孕妇均接受羊水细胞染色体核型分析,同时接受CMA分析,比较两种方法的检出结果。
结果 胎儿染色体非整倍体异常的检出情况显示CMA检测和羊水细胞染色体核型分析结果一致,作出了DNA水平的精细分析;经CMA检出染色体不平衡变异与染色体核型分析结果相同,并且更加精确的作出异常定位,显示亚显微水平的微缺失与微重复。
1例低水平嵌合,CMA检无法完全检出,另1例染色体核型分析结果与CMA检测一致,并且CMA 检测显示出更为精确的异常位点;羊水细胞染色体核型分析正常但CMA异常的胎儿拷贝数具有致病性,CMA技术检出率比羊水细胞染色体核型分析提高2.38%(3/126)。
结论 CMA技术在孕妇产前诊断中的有效性和准确性更高,临床上可以结合两种检测方式提高胎儿出生缺陷的检出率。
[关键词] 产前诊断;羊水细胞染色体核型分析;染色体微阵列分析;不平衡变异;微缺失;微重复;检出率[中图分类号] R714.5 [文献标识码] A [文章编号] 2095-0616(2019)24-96-04Analysis on application of amniotic fluid cell chromosome karyotype analysis combined with CMA in prenatal diagnosis of pregnant womenZENG YanzhangYangjiang Maternal and Child Health Hospital,Guangdong,Yangjiang 529500,China[Abstract] Objective To explore the application value of amniotic fluid cell chromosome karyotype analysis combined with chromosome microarray analysis(CMA)in prenatal diagnosis of pregnant women.Methods126 pregnant women who underwent prenatal diagnosis in our hospital from April 2018 to March 2019 were selected as research objects.All pregnant women received amniotic fluid cell chromosome karyotype analysis and CMA analysis. The detection results of the two methods were compared. Results The detection of fetal chromosome aneuploidy abnormalities showed that CMA detection was consistent with the results of chromosome karyotype analysis of amniotic fluid cells,and detailed analysis of DNA level was made.The chromosome imbalance variation detected by CMA was the same as the result of karyotype analysis,and the abnormal location was more accurate,showing microdeletion and microduplication at the sub-microscopic level.There was 1 case of low level chimerism,which could not be completely detected by CMA test.Another karyotype analysis result was consistent with CMA detection,and CMA detection showed more accurate abnormal sites.Amniotic fluid cell karyotype analysis was normal,but abnormal fetal copy number of CMA was pathogenic.The detection rate of CMA technology was 2.38%(3/126),higher than that of amniotic fluid cell karyotype analysis. Conclusion CMA technology is more effective and accurate in prenatal diagnosis of pregnant women.Clinically,two detection methods can be combined to improve the detection rate of fetal birth defects.[Key words]Prenatal diagnosis;Amniotic fluid cell chromosome karyotype analysis;Chromosome microarray analysis;Unbalanced variation;Microdeletion;Microduplication;Detection rate产前诊断在预防出生缺陷胎儿中是一条主要的途径,羊膜腔穿刺羊水细胞染色体核型分析是用于产前诊断染色体异常的“金标准”,对于非整倍体的检出率较高,对于10Mb及以上的缺失或重复、胎儿染色体数目异常和结构异常均可作出全面的分析[1]。
CMA在胎儿神经系统异常产前诊断中的应用分析
CMA在胎儿神经系统异常产前诊断中的应用分析宁舒婷;曹少华;何劭君;何明聪;王力川;李敏清【摘要】目的探讨染色体微阵列分析(CMA)在胎儿神经系统异常产前诊断中的应用.方法选取超声提示胎儿神经系统异常孕妇共121例,同时行染色体核型分析及CMA检测.结果检出11例胎儿染色体核型异常,检出率为9.09% (11/121).检出26例胎儿基因组拷贝数变异(CNVs),检出率为21.49% (26/121),其中致病性CNVs 15例,检出率为12.40%(15/121);临床意义不明的染色体拷贝数变异(VOUS) 11例,检出率为9.09% (11/121).结论在胎儿神经系统异常产前诊断中,尽管CMA 检测存在临床意义不明病例,增加了遗传咨询的难度,但其能提高异常病例的检出率.【期刊名称】《微创医学》【年(卷),期】2019(014)003【总页数】3页(P287-289)【关键词】染色体微阵列分析;胎儿神经系统畸形;产前诊断;不明拷贝数变异【作者】宁舒婷;曹少华;何劭君;何明聪;王力川;李敏清【作者单位】广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002;广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002;广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002;广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002;广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002;广西壮族自治区妇幼保健院,南宁市530002【正文语种】中文【中图分类】R714胎儿神经系统异常是常见的先天结构异常,包括脊柱裂、脑膨出、侧脑室增宽、颅后窝增宽、全前脑、无脑儿、颅内占位、小脑发育不良、胼胝体发育不良等,发生率为0.14%~0.16%[1]。
常见致畸因素为遗传、感染、接触毒害物质等。
而胎儿神经系统结构异常与染色体核型异常关系密切,特别是18-三体和13-三体[2]。
但是传统的细胞核型分析只能发现5Mb以上的遗传物质改变,目前迅速发展的染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis,CMA),通过检测基因组拷贝数变化(copy number variations,CNVs),可发现染色体结构的细微变化,能检出小于100 kb的CNVs,从而发现一些染色体微缺失或微重复,可额外发现6%~15%的染色体细微变异[3],而这些变异是传统的染色体核型分析不能发现的。
染色体微阵列分析技术在心脏强回声胎儿产前诊断中的应用研究
染色体微阵列分析技术在心脏强回声胎儿产前诊断中的应用研究林忱昭;王旻;胡建苏;黄秀琼【期刊名称】《中国医药科学》【年(卷),期】2024(14)4【摘要】目的评价染色体微阵列分析技术(CMA)用于心脏强回声(EIF)胎儿产前诊断的价值。
方法选取2017年7月至2023年6月在福建医科大学附属福州市第一医院产科435例接受羊水或脐静脉穿刺的EIF胎儿为研究对象,将其分为单一EIF 组(A组)、EIF合并心脏超声指标异常组(B组)、EIF合并心外超声指标异常组(C 组)。
对435例胎儿行CMA检测,并同时进行染色体核型分析。
结果在435例产前超声提示EIF胎儿中,共检出14例染色体核型异常,核型检测异常率为3.25%(14/435);A、B、C组检出核型异常率分别为0(0/20)、2.39%(6/251)和4.88%(8/164)。
CMA检测异常率为14.25%(62/435);62例CMA异常样本中,11例为染色体数目异常、3例为染色体嵌合体,与核型检测相符;另5例为杂合性缺失;43例为拷贝数变异(CNVs),CNVs总检出率为9.89%(43/435)。
A、B、C组CNVs检出率分别为20.00%(4/20)、10.36%(26/251)、7.93%(13/164),差异无统计学意义(χ^(2)=3.071,P=0.145)。
结论CMA能够有效提高EIF胎儿染色体异常检测结果阳性率,对染色体微小缺失或重复具有良好的诊断敏感性。
【总页数】5页(P93-97)【作者】林忱昭;王旻;胡建苏;黄秀琼【作者单位】福建医科大学附属福州市第一医院产科;福建医科大学附属福州市第一医院超声科;福建医科大学附属福州市第一医院检验【正文语种】中文【中图分类】R714.5【相关文献】1.荧光原位杂交与染色体微阵列分析技术在胎儿标记染色体产前诊断中的应用2.染色体微阵列联合核型分析在先天性心脏病胎儿产前诊断中的应用3.超声软指标异常胎儿产前诊断中染色体微阵列技术应用研究4.染色体核型联合染色体微阵列分析序贯全外显子组测序在胎儿先天性心脏病产前诊断中的应用因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
CMA技术产前诊断van der Woude综合征1例
《中国产前诊断杂志(电子版)》 2017年第9卷第1期·病例报道· CMA技术产前诊断vanderWoude综合征1例卢建 黄伟伟 李怡 周伟宁(广东省妇幼保健院医学遗传中心,广东广州 510010)【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 B犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2017.01.015 唇裂和(或)腭裂是最常见的出生缺陷之一,根据是否伴有身体其他先天畸形,唇腭裂又分为孤立型或综合征型。
目前已知综合征型唇腭裂超过300个,其中范德伍综合征(vanderWoudesyndrome,VWS)是最常见的唇腭裂综合征之一,占唇腭裂发病总数的2%。
它的主要临床表现有下唇部凹陷或瘘管、唇裂和(或)腭裂、悬雍垂裂、牙齿发育不全等。
遗传模式呈常染色体显性遗传,其发病率约为1/35000~1/100000。
1 临床资料与方法1.1 临床资料 孕妇33岁,G4P2A1,此次停经24+周,超声发现唇腭裂(图1)来本科室进行咨询。
丈夫35岁,2人非近亲结婚,育有2女,体健,家族中无唇腭裂患者。
孕妇妊娠期内无抽烟、嗜酒史,无服用药物及射线接触史。
在充分知情同意后,对孕妇行羊膜腔穿刺抽取胎儿羊水细胞。
图1 胎儿羊水细胞核型结果(46,XY)1.2 方法1.2.1 染色体 G显带制备使用羊水原位培养法对羊水细胞进行培养,常规G显带(320~400条带)检测。
1.2.2 染色体微阵列分析(CMA) 使用QIA GEN公司生产的QiampDNABloodMiniKit对羊水细胞进行基因组DNA的提取,使用美国昂飞公75·病例报道·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2017年第9卷第1期司生产的cyto750k芯片进行CMA检测。
检测结果使用ChromosomeAnalysisSuite(ChAS;ver sion2.1).软件进行分析。
1.3 结果 胎儿染色体G显带结果显示为正常的核型结果(图2)。
基于核型分析和CMA的产前诊断中胎儿染色体疾病的早期预测方法研究
基于核型分析和CMA的产前诊断中胎儿染色体疾病的早期预测方法研究黄少云【期刊名称】《智慧健康》【年(卷),期】2024(10)6【摘要】目的研究核型分析和染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)在产科产前诊断中对胎儿染色体疾病的早期预测价值。
方法回顾分析2021年12月—2022年12月于本院产科行产前检查,并接受羊水穿刺术的孕妇431例,对其核型及CMA进行分析。
结果纳入研究的431例孕妇均穿刺成功并完成细胞培养,成功率100%。
术后对孕妇随访,有39例孕妇因电话自动拦截、拒绝、停机、号码错误而失访,1例孕妇术后见发烧,1例孕妇完成检查后当日见阴道出血,于本院住院后无碍,1例孕妇术后3日见红,不良事件发生率0.77%。
本次研究中未见流产病例。
431例检查结果中,有38例提示染色体异常,检出率8.82%;其中数目异常9例,占23.68%;结构异常29例,占76.32%。
进一步分析可知,异常主要集中于12、13、14、15、18、21号染色体及X、Y染色体上。
异常类型包括标准型(21-三体型)、易位型、微结构异常型等。
夫妻一方染色体异常共4例,检测出胎儿染色体异常1例,异常检出率25%。
本次研究中年龄≥35岁的孕妇72人,检出胎儿染色体异常1例,检出率1.39%。
结论核型分析联合CMA技术能提升异常检出率,明确致病片段来源,为产前诊断及遗传咨询提供科学可靠的依据,安全可靠。
【总页数】5页(P56-59)【作者】黄少云【作者单位】安徽省妇幼保健院【正文语种】中文【中图分类】R71【相关文献】1.羊水细胞染色体核型分析结合CMA在孕妇产前诊断中的应用分析2.联合CMA 和核型分析研究NT增厚胎儿的产前诊断3.传统染色体核型分析及CMA在产前诊断中的应用价值比较4.染色体核型联合染色体微阵列分析序贯全外显子组测序在胎儿先天性心脏病产前诊断中的应用因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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a-CGH+SNP
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Affymetrix基因芯片技术平台
人基因组:3×109bp 基因:2×109 Affymetrix芯片:750K 每4kb一个探针,100%覆盖国际细胞遗 传学学会认可的基因,93%覆盖X染色体 基因,83%覆盖OMIM疾病相关基因
染色体核型检查未见异常 CMA可发现pCNVs 19-29.7%
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CMA的临床应用
ACMG推荐CMA取代核型作为DD/ID一线遗传学诊断方法
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CMA的临床应用
Angelman综合征(快乐木偶综合征)
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CMA的临床应用 我中心CMA检查指针:
孕期超声检查提示胎儿超声异常(28-34周) 智力低下/自闭症/发育迟滞 习惯性流产/死胎 染色体核型分析发现Marker染色体 既往头胎因智力低下、自闭症、胎儿多发畸形等 已经进行基因芯片检测发现问题,再次妊娠时
CMA可将检出率提高5.2-6.5%
多发畸形 9.5% 单系统畸形 5.6%
(骨骼系统、神经系统)
软指标 2.6%
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CMA的临床应用
ACOG推荐用CMA取代核型检测超声结构异常胎儿
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CMA的临床应用
DiGeorge(22q11.2)综合征
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CMA的临床应用
发育迟滞/智力低下/自闭症(DD/ID/Autism):
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CMA的临床应用 取材要求: 4℃保存,尽快送检
羊水:6-8ml,无菌,2管(备用,培养)
胎儿肌肉:三角肌,1cm3
绒毛组织
全血(EDTA抗凝)
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CMA结果解释
先症者:
智力低下 小头畸形
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CMA结果解释
胎儿:
父母:
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CMA在产前诊断中的应用
(Chromosome microarray analysis)
Hale Waihona Puke LOGO产前诊断中心2014.12.12
胡婷
染色体分析方法的不断进步
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染色体分析方法的不断进步
原位杂交(FISH)
染色体核型分析
定量荧光PCR(QF-PCR)
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染色体微阵列分析(CMA)
Microarray: 通过把标准的全基因组核苷酸 序列或者靶向核苷酸序列固定 在一块面积很小的硅片、玻片 或尼龙膜上而构成微阵列。
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Affymetrix基因芯片技术平台
优势:
不足:
Gain Loss GainMosaic LossMosaic UPD
点突变 多倍体 平衡性改变 单基因病 遗传代谢性疾病
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常见的微缺失/微重复综合征
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CMA的临床应用
超声异常:
染色体核型检测异常率9-35%