基因表达与基因表达调控PPT
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分子生物学课件 第9章 原核生物基因调控
C蛋白与Ara结合成C-Ara复合物是Ci型诱导蛋白,
结合araI时,araI作为正控制的元件,促进araBAD 基 因的表达 。
34
9.7 翻译水平的调控
9.7.1反义RNA的调控
聂理
35
反义RNA
反义RNA有多种符号 = antisense RNA = -RNA = stRNA(small temporal RNA) = micRNA( mRNA-interfering complementary RNA) 即 干扰和抑制mRNA翻译的互补RNA片段
为诱导物开启lac操纵子结构基因……。
17
9.4.2乳糖操纵子正控制机理
CRP:cyclic AMP receptor protein, =“cAMP受体蛋白”, =“降解物基因活化蛋白(CAP)” ①当环境中有葡糖时: 抑制cAMP 产生,纯CAP是失活态蛋白。 ②当环境中无葡糖时: 有利于 cAMP 产生和cAMP-CAP形成。
22
9.5.2 衰减子
衰减子也叫弱化子
attenuator
聂理
23
9.5.2.1衰减子组成
trp操纵子前导区L,转录出RNA前导序列161nt。
1~26nt翻译的 SD序列区
27~71nt含14个氨基酸 密码的前导肽区
115~159nt衰减子区
具有终止子 结构特征
24
9.5.2.2衰减子调控机制
41
9.7.3 核开关 riboswitch
核开关也叫核糖开关。 是mRNA所形成的调节基因表达的结构。 在mRNA的非翻译区(5’-UTR,3’-UTR), 与小分子效应物可逆结合而改变其结构, 根据构象特征信号来影响mRNA的表达, (如影响转录、翻译等) 从而达到调控基因开关的目的。
结合araI时,araI作为正控制的元件,促进araBAD 基 因的表达 。
34
9.7 翻译水平的调控
9.7.1反义RNA的调控
聂理
35
反义RNA
反义RNA有多种符号 = antisense RNA = -RNA = stRNA(small temporal RNA) = micRNA( mRNA-interfering complementary RNA) 即 干扰和抑制mRNA翻译的互补RNA片段
为诱导物开启lac操纵子结构基因……。
17
9.4.2乳糖操纵子正控制机理
CRP:cyclic AMP receptor protein, =“cAMP受体蛋白”, =“降解物基因活化蛋白(CAP)” ①当环境中有葡糖时: 抑制cAMP 产生,纯CAP是失活态蛋白。 ②当环境中无葡糖时: 有利于 cAMP 产生和cAMP-CAP形成。
22
9.5.2 衰减子
衰减子也叫弱化子
attenuator
聂理
23
9.5.2.1衰减子组成
trp操纵子前导区L,转录出RNA前导序列161nt。
1~26nt翻译的 SD序列区
27~71nt含14个氨基酸 密码的前导肽区
115~159nt衰减子区
具有终止子 结构特征
24
9.5.2.2衰减子调控机制
41
9.7.3 核开关 riboswitch
核开关也叫核糖开关。 是mRNA所形成的调节基因表达的结构。 在mRNA的非翻译区(5’-UTR,3’-UTR), 与小分子效应物可逆结合而改变其结构, 根据构象特征信号来影响mRNA的表达, (如影响转录、翻译等) 从而达到调控基因开关的目的。
生物化学》ppt课件14.第十四章-基因表达调控
操纵子(operon)是原核生物中几个功能相关的 结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协 同单位。操纵子的本质是DNA序列。
1.操纵子的结构与功能
一个操纵子=调节序列+启动序列+操纵序列+编码序列
⑴调节序列(inhibitor,I):编码一种阻遏蛋白(repressor) 。 ⑵启动序列(promoter,P):结合RNA聚合酶,启动转录。 ⑶操纵序列(operator,O):阻遏蛋白的结合位点。 ⑷编码序列(coding sequence):编码功能性蛋白,2~6个。
第一节 基因表达调控的 概念和原理
(Concept and principle: Regulation of Gene Expression)
一、基因表达调控的概念
(一)基因表达(gene expression) 是指基因经过
转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白 质分子的过程。
(二)基因表达的时间性及空间性
转录激活域
谷氨酰胺富含域 脯氨酸富含域
蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域)
1.同源结构域
2.锌指
3.碱C
H
C
Cys
H
His
其他氨基酸
(四)真核生物基因表达调控模式
1.真核生物基因表达调控较复杂,除转录起始阶段 受到调节外,在转录后水平、翻译水平及翻译后水平 等均受调控。
2.真核RNA聚合酶Ⅱ在转录因子帮助下,形成的 转录起始复合物。
白 因 子 , 决 定 三 种 RNA(mRNA 、 tRNA 及 rRNA)转录的类别。
2.特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的时
1.操纵子的结构与功能
一个操纵子=调节序列+启动序列+操纵序列+编码序列
⑴调节序列(inhibitor,I):编码一种阻遏蛋白(repressor) 。 ⑵启动序列(promoter,P):结合RNA聚合酶,启动转录。 ⑶操纵序列(operator,O):阻遏蛋白的结合位点。 ⑷编码序列(coding sequence):编码功能性蛋白,2~6个。
第一节 基因表达调控的 概念和原理
(Concept and principle: Regulation of Gene Expression)
一、基因表达调控的概念
(一)基因表达(gene expression) 是指基因经过
转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白 质分子的过程。
(二)基因表达的时间性及空间性
转录激活域
谷氨酰胺富含域 脯氨酸富含域
蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域)
1.同源结构域
2.锌指
3.碱C
H
C
Cys
H
His
其他氨基酸
(四)真核生物基因表达调控模式
1.真核生物基因表达调控较复杂,除转录起始阶段 受到调节外,在转录后水平、翻译水平及翻译后水平 等均受调控。
2.真核RNA聚合酶Ⅱ在转录因子帮助下,形成的 转录起始复合物。
白 因 子 , 决 定 三 种 RNA(mRNA 、 tRNA 及 rRNA)转录的类别。
2.特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的时
真核生物的基因表达调控ppt(共59张PPT)
在转录水平上的基因表达调控
真核生物的蛋白质基因的转录除了启动子、RNA聚合酶II和基础转录因 子以外,还需要其它顺式作用元件和反式作用因子的参与。 参与基因表达调控的主要顺式作用元件有:增强子、沉默子、绝缘 子和各种反应元件;参与基因表达调控的反式作用因子也称为转录 因子,它们包括激活蛋白、辅激活蛋白、阻遏蛋白和辅阻遏蛋白。 激活蛋白与增强子结合激活基因的表达,而阻遏蛋白与沉默子结合 ,抑制基因的表达,某些转录因子既可以作为激活蛋白也可以作为 阻遏蛋白其作用,究竟是起何种作用取决于被调节的基因。辅激活 蛋白缺乏DNA结合位点,但它们能够通过蛋白质与蛋白质的相互作 用而行使功能,作用方式包括:招募其它转录因子和携带修饰酶( 如激酶或乙酰基转移酶)到转录复合物而刺激激活蛋白的活性;辅 阻遏蛋白也缺乏DNA结合位点,但同样通过蛋白质与蛋白质的相互 作用而起作用,作用机理包括:掩盖激活蛋白的激活位点、作为负 别构效应物和携带去修饰酶去中和修饰酶(如磷酸酶或组蛋白去乙 酰基酶)的活性。
真核生物与原核生物在 调控机制上的主要差异
调控的原因:原核生物基因表达调节的目的是为了更有效 和更经济地对环境的变化做出反应,而多细胞真核生物基 因表达调节的主要目的是细胞分化,它需要在不同的生长 时期和不同的发育阶段具有不同的基因表达样式; 调控的层次:原核生物基因表达调控主要集中在转录水平 ,但真核生物基因表达的转录后水平调节与其在转录水平 上的调节各占“半壁江山”,而某些调控层次是真核生物特有 的,比如染色质水平、RNA后加工水平和mRNA运输等;
调控的手段:原核生物绝大多数的基因组织成操纵子,但真核 生物一般无操纵子结构。
在染色质水平上的基因调控
原核生物的DNA绝大多数处于完全暴露和可接近的状态,而真核生物 DNA大部分被遮挡并组织成染色质。因此,原核生物DNA转录的“默认 状态”是开放,其调控机制主要是通过阻遏蛋白进行的负调控,而真核生 物DNA转录的“默认状态”是关闭,其调控机制主要是通过激活蛋白进行 的正调控。 染色质的结构是一种动态可变的结构,其结构的变化能直接影响到基因 的表达。已有众多证据表明,一个基因在表达前后,其所在位置的染色 质结构会发生重塑或重建。由于染色质的组成单位是核小体,因此,染 色质结构的改变是从核小体的变化开始的,而核小体的变化是从组蛋白 的共价修饰和去修饰开始的。
教学课件第五章基因表达的调控Regulationandcontrolofgene
阿拉伯糖操纵子的基因结构图
操纵子由结构基因B、A、D以及调控元件I1、 I2、O1、O2和启动子构成。araC基因编码调 节蛋白AraC。
23
AraC 对阿拉伯糖操纵子的调节图
不存在阿拉伯糖时,AraC二聚体与O1、O2及I1 结合,二聚体间相互作用使DNA弯曲成环结构。
由于I2不被占据,B、A、D基因不发生转录,但
例:色氨酸操纵子表达的调控有两种方式: a.通过阻遏蛋白的负调控 b.通过衰减子作用
31
(2)转录衰减的调控
调节区
trpR RNA聚P合酶O
RNA聚合酶
Trp 低时
Trp 高时 Trp
140个核苷酸
结构基因
mRNA 6700个核苷酸
色氨酸操纵子
32
调节区
trpR
PO
前导序列
前导mRNA
1
2
结构基因
(constitutive gene expression)
基因较少受环境因素影响,而是在个 体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织 中持续表达,或变化很小。如管家基因。
5
(二)诱导和阻遏表达
诱导表达(induction expression)
在特定环境信号刺激下,有些基 因的表达表现为开放或增强。
阻遏表达(repression expression)
在特定环境信号刺激下,有些基因 的表达表现为关闭或下降。
6
协调表达(coordinance expression)
在一定机制下,功能相关的一组 基因,协调一致,共同表达。
7
四、基因表达的调控的概念
机体各种细胞中含有的相同遗传 信息(相同的结构基因),根据机体的 不同发育阶段、不同的组织细胞及不 同的功能状态,选择性、程序性地表 达特定数量的特定基因的过程。
操纵子由结构基因B、A、D以及调控元件I1、 I2、O1、O2和启动子构成。araC基因编码调 节蛋白AraC。
23
AraC 对阿拉伯糖操纵子的调节图
不存在阿拉伯糖时,AraC二聚体与O1、O2及I1 结合,二聚体间相互作用使DNA弯曲成环结构。
由于I2不被占据,B、A、D基因不发生转录,但
例:色氨酸操纵子表达的调控有两种方式: a.通过阻遏蛋白的负调控 b.通过衰减子作用
31
(2)转录衰减的调控
调节区
trpR RNA聚P合酶O
RNA聚合酶
Trp 低时
Trp 高时 Trp
140个核苷酸
结构基因
mRNA 6700个核苷酸
色氨酸操纵子
32
调节区
trpR
PO
前导序列
前导mRNA
1
2
结构基因
(constitutive gene expression)
基因较少受环境因素影响,而是在个 体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织 中持续表达,或变化很小。如管家基因。
5
(二)诱导和阻遏表达
诱导表达(induction expression)
在特定环境信号刺激下,有些基 因的表达表现为开放或增强。
阻遏表达(repression expression)
在特定环境信号刺激下,有些基因 的表达表现为关闭或下降。
6
协调表达(coordinance expression)
在一定机制下,功能相关的一组 基因,协调一致,共同表达。
7
四、基因表达的调控的概念
机体各种细胞中含有的相同遗传 信息(相同的结构基因),根据机体的 不同发育阶段、不同的组织细胞及不 同的功能状态,选择性、程序性地表 达特定数量的特定基因的过程。
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25.01.2021
24
二、蛋白质的生物合成——翻译
以特定核苷酸序列的mRNA为模板,合成相应 氨基酸序列的多肽链,即将带有遗传信息的核苷 酸顺序转换为氨基酸顺序的过程
组成蛋白质的氨基酸由其特定的tRNA携带和 转运,在核蛋白体上按照模板mRNA所提供的编 码信息合成具有特定序列的多肽链
25.01.2021
线粒体RNAs
不敏感
25.01.2021
11
(二)转录的过程 1. 起始
●原核细胞 ●真核细胞
RNA聚合酶与启动子相互作用
RNA聚合酶、反式作用因子与顺 式元件相互作用——拼板理论
25.01.2021
12
原核生物启动子
TTGACA
5’ DNA 3’
-35区
Pribnow box
Start of transcription
15bp
TATAAT
10bp
RNA polymerase
-10区
3’ 5’ +1
25.01.2021
13
真核生物启动子
GC box
GCGC
5’ 3’ DNA
CAAT box
CCAAT
-70区
TATA box
Hogness box
Start of transcription
TATA
10bp
3’
-25区
25.01.2021
22
●RNA编辑 (RNA editing)
RNA编辑是对mRNA前 体的序列进行的改编,在 mRNA前体分子的碱基序列 中 C被U取代,A被G取代, 使成熟mRNA的序列与基因 组DNA序列不同
25.01.2021
23
3. 真核生物成熟mRNA的运输
信使核糖核蛋白颗粒(mRNP) 成熟mRNA+蛋白质→细胞核→细胞质
27
● 模板 mRNA
mRNA是翻译的直接模板 mRNA的寿命一般较短
5’ +1
RNA polymerase
25.01.2021
14
2.延伸 ●原核细胞
核心酶催化
●真核细胞
磷酸化的RNA聚合酶催 化,核小体解聚
25.01.2021
15
3. 终止
●原核细胞
依赖ρ因子
结合富含C的RNA区段,发 挥ATP酶及解螺旋酶活性
不依赖ρ因子
●真核细胞
RNA 3‘ 端形成茎环结构
25
(一) 翻译的体系 (二) 翻译的基本过程 (三) 肽链翻译后的加工修饰 (四) 蛋白质的分拣与转运
25.01.2021
26
(一) 翻译的体系
●模板
mRNA
●氨基酸运输 ●肽链合成场所 ●蛋白质因子 ●原料
tRNA 核糖体(rRNA+蛋白质) 起始、延长、终止因子 20种有遗传密码的氨基酸
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核酸酶
真核基因3’
切除3’尾
poly(A)
3’-OH引入
端AATAA
10—25碱基 100-200bp A
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20
●剪接(splicing)
由小分子细胞核内核蛋白颗粒(snRNP) 去除核不均一RNA(hnRNA)中的内含子 转录序列
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21
选择性剪接
通过不同剪接方式选择性使用外显子,合成功 能不同而结构只有微小差异的蛋白质
转录终止的修饰点处切离并加尾
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16
ρ因子和RNA转录产物结合RNA聚合酶构象改变引起转录终止
DNA
RNA-pol
3´
RNA
polyC
5’
ρ
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17
(三)转录后加工
1. 原核细胞和真核细胞的差异
●原核细胞
tRNA和rRNA需加工,mRNA不需加工
●真核细胞
tRNA、rRNA和mRNA均需加工
第五章
基因表达与基因表达调控
25.01.2021
1
第一节 基因表达的过程和特点 第二节 环境对基因表达的影响 第三节 原核生物基因表达的调控 第四节 真核生物基因表达的调控 第五节 基因表达调控异常与疾病
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2
基因表达(gene expression)
是指基因所贮存的遗传信息通过转录 (transcription)和翻译(translation) 产生具有生物功能的多肽和蛋白质的过程
β
σ 识别转录起始点
αα
决定被转录的基因
核心酶
β’ α
βα
10
真核生物的RNA聚合酶
种类
细胞内定位
转录产物
对抑制剂鹅膏 蕈碱反应
RNA-pol I RNA-pol II
核仁 核质
45S-rRNA hnRNA
不敏感 低浓度敏感
RNA-pol III 核质 Mt RNA-pol 线粒体
5S-rRNA,tRNA,snRNA 高浓度敏感
25.01.2021
6
一、基因的转录
● 定义 转录是以DNA为模板合成RNA的过程
● 转录产物 mRNA、tRNA、rRNA、小分子RNA
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7
(一)基因转录的基本方式
1. 转录的体系
模板 原料
DNA ATP、CTP、GTP、UTP
RNA聚合酶
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● 原核细胞 全酶(holoenzyme)α2ββ'σ ●真核细胞 RNA聚合酶I
25.01.2021
18
2. 真核生物mRNA的转录后加工
● 5'端加帽
转录未终止时加入m7G5'ppp,与稳
定mRNA及翻译起始有关
磷酸酶
5’pppG…
ppi
pppG pi
5’pG…
5’GpppG…
CH3 甲基化酶
mGpppG…
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●3'端加尾
加尾信号处切离,并加poly (A),与稳 定mRNA及翻译效率有关
A-T,G-C
A-U,C-A,G-C
5
复制和转录的比较
类似点 多核苷酸链的合成方向都是5’—3’ 在3’-OH末端与加入的核苷酸形成磷酸二酯键
不同点 对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基因, 而且每个基因的转录都受到相对独立的控制 转录是不对称的 转录时不需要引物 RNA链的合成是连续的
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3
第一节 基因表达的过程和特点
一、基因的转录—RNA的合成 二、蛋白质的生物合成—翻译
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模板 原料 酶 产物 配对
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复制和转录的区别
复制
转录
两股链均复制 dNTP
模板链转录 NTP
DNA聚合酶
RNA聚合酶
子代双链DNA mRNA, tRNA, rRNA
RNA聚合酶II RNA聚合酶III
8
RNA合成链
5’ 3’
结构基因
3’ 5’
编码链,反意义链,Crick 链
25.01.2021
9
E.coli RNA聚合酶全酶 (holoenzyme) 的结构
25.01.2021
β’ 结合DNA模板
与转录全过程有关