分子生物学复习重点

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分子生物学研究:核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构特征及其重要性、规律性和相互关系的科学。1953年,Watson和Crick提出脱氧核糖核苷酸的双螺旋膜型。

染色体包括:DNA和蛋白质两大部分。

基因组:由生物体内所有的染色体组成的。

真核细胞染色体的组成包括:蛋白质:组蛋白(染色体结构蛋白,组成核小体)、非组蛋白(RNA聚合酶、肌动蛋白、肌球蛋白、微管蛋白),真核生物基因组DNA,染色质和核小体。

DNA包装步骤:(核小体,螺线管,超螺线管,染色体)

1)核小体的形成是染色体中DNA压缩的第一阶段。核小体的组成:组蛋白+200bp DNA。核小体组

蛋白:H2A、H2B、H3、H4各两分子生成的八聚体,并伴有H1在核小体在外边,直径10nm。

2)将200bp的DNA分子(2nm)缠绕在核小体外,从68nm压缩到10nm中,压缩率1/7

3)六个核小体形成一个螺线管,压缩率1/6,直径30nm

4)螺线管形成超螺线管,压缩率1/40,直径4000nm

5)超螺线管形成染色单体,压缩率1/5

DNA的结构:

(1)DNA的一级结构:四种核苷酸的连接排列顺序。

(2)DNA的二级结构:两条多核苷酸链反相平行盘绕所成的双螺旋结构。

(3)DNA的高级结构:多数为双链DNA,少数为单链;形成超螺旋,构成质粒

分类:右手螺旋(A-DNA构象、B-DNA构象)、左手螺旋(Z-DNA构象)

B-DNA构象特点:1)A-T丰富的DNA片段常呈B-DNA构型;2)脱氧核苷酸在外侧,碱基在内侧;3)链间形成的有螺旋状凹槽构成:大沟、小沟(沟用来接收Pr 的结合);4)相邻碱基对平面间距0.34nm,结构重复周期3.4nm,双螺旋直径2.0nm;5)磷酸二脂键链接核苷酸;6)脱氧核糖环平面基本与纵轴大致平行A-DNA构象:DNA模板链与转录所得RNA链间形成的双链,双链RNA之间形成的构象也是A-DNA构象.

Z-DNA构象特点:1)12个碱基一圈,比A构型紧;2)只有一个螺旋沟,难于蛋白质结合;3)重复的结构式二核苷酸;4)碱基不再中央,外圈的碱基难被化学物质结合识别

意义:用于调控基因转录,Z构型变为B构型,可以使得近端区域活化转录;使得远端基因转录停止。DNA的复制:

(1)步骤:1)解链:DNA链改变构象,从复制叉开始解链,此为DNA复制的起点

2)拓扑:防止超螺旋

3)单链结合蛋白(SSB)结合单链DNA:

4)引物结合:RNA引物提供3`-OH末端

5) DNA聚合酶:去掉结合蛋白,切除RNA引物

6)滑动夹:推动DNA聚合酶前进

7 )DNA连接

(2)原料:1)拓扑异构酶;2)解旋酶;3)单链结合蛋白(SSB);4)引物合成酶;5 )DNA聚合酶3(复制链);、

6) DNA聚合酶1(切引物);7)连接酶;8) dNTP;9 )RNA引物(含3`-OH末端)

DNA半保留复制:每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链来自新和成的。

DNA半不连续复制:DNA复制时,双链解开,SSB和DNA聚合酶3共同作用合成前导链随复制叉前进(5`端→3`端);另一条后随链的复制由RNA引物开始一个片段一个片段的复制(5`端→3`端),形成众多冈崎片段,之后切除引物,用DNA连接酶连接断开的单链。

DNA修复:(分类,定义,AP位点)

(1)错配修复:保存母链,修正子链。识别新合成链中的错配并校正DNA子链。

(2)切除修复:

1)碱基切除修复:切除AP位点(存在于DNA链上的去嘌呤或去嘧啶位点)两端的磷酸二酯键,换上相应的核苷酸。

2)核苷酸切除修复:切除无法形成氢键的核苷酸。

DNA的转座:或称移位,是由可移位因子介导的遗传物质重排现象。

转座子:又称易位子,存在于染色体DNA上的可自主复制和移位的基本单位。

分类:插入序列(IS)、复合型转座子

玉米中的控制因子:Ac-Ds系统(激活-解离系统):Ac能够自主转座,形成不稳定基因突变,使Ds 因子活化、转座。Ds属于非自主因子,解离因子,当Ac存在时导致附近结构基因失活和表达水平的变化。转座作用的机制:转座可被分为复制型和非复制型两类。

基因表达:转录(拷贝出一条与DNA链序列完全相同的RNA单链的过程,是基因表达的核心步骤)和翻译(以新生的mRNA为模板,把核苷酸三联遗传密码翻译成氨基酸、合成多肽的过程,是基因表达的最终目的)。

DPPH依赖于RNA聚合酶

基因转录:

(1)启动子:基因转录起始所必需的一段DNA序列,确保转录精确起始,是基因表达调控的上游顺式作用元件之一。是指确保转录精确而有效地起始的DNA序列。

(2)转录单元:是一段从启动子开始至终止子结束DNA序列,RNA聚合酶从转录起点开始沿模板前进,直到终止子为止,转录出一条RNA连。

(3)增强子,或强化子:一种能强化转录起始的序列。

(4)原核生物包括:-10区与-35区,其最佳距离大约是16-19bp。

真核生物mRNA特点:(1)mRNA的5`端存在“帽子”结构(甲基化鸟嘌呤);(2)绝大多数真核生物mRNA 具有多聚A尾巴

(1)“帽子”结构作用:1有助于翻译的开始:与核糖体小亚基相结合;2保护mRNA不被降解,半衰期长;3成熟产物运输过程中的必需物质;4促进转录

(2)多聚腺苷酸尾巴作用:1穿过核膜所必须的部分;2提高mRNA的稳定性;3与翻译有关

原核生物转录终止的类型:不依赖于ρ因子的终止和依赖于ρ因子的终止类型

RNA的编辑:是某些RNA,特别是一种mRNA前体的加工方式,如插入、删除、取代一些核苷酸残基,导致DNA所编码的遗传信息的改变,因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。

核酶:一类具有催化功能的RNA分子,通过催化RNA链中磷酸二酯键的断裂,特异性剪切底物RNA分子,从而断裂基因的表达。

其根据不同的核酸具有的催化功能分为:剪切型核酶、剪接型核酶。

遗传密码的性质:(1)密码的连续性;(2)密码的简并性(一个氨基酸有多个密码子);(3)密码的通用性与特殊性;(4)密码子和反密码子相互作用

tRNA的L形状的三级结构

(1)tRNA的种类:1)起始tRNA:原核生物起始tRNA携带甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物起始tRNA 携带甲硫氨酸(Met);2)同工tRNA;3)校正tRNA

无义突变:蛋白质合成提前终止(合成UAG、UGA、UAA),合成无功能的多肽。

错义突变:结构基因中某个核苷酸变化,使得一种氨基酸的密码变成另一种氨基酸的密码。

(2)氨酰-tRNA合成酶:是一类催化氨基酸与tRNA结合的特异性酶。AA-tRNA合成酶既要识别tRNA,又要能识别氨基酸它对两者都具有高度的专一性。

蛋白质的生物合成包括:1、氨基酸活化2、肽链的起始3、伸长、终止以及新合成多肽链的折叠和加工。在真核生物中,起始氨基酸是甲硫氨酸,在原核生物中,起始氨基酸是甲酰基氨基酸。

生物翻译:

(1)原核生物翻译的起始:

1)30SrRNA和50SrRNA相分离

2)30S小亚基先与mRNA模板相结合(需要识别SD序列)

3)30S小亚基再与fMet-tRNA Met(甲酰甲硫氨酸-氨酰tRNA)结合

4)30S小亚基与50S大亚基结合

(2)真核生物翻译的起始:

1)40SrRNA与60SrRNA相分离

2)40S小亚基首先与fMet-tRNA Met结合

3)40S小亚基mRNA模板相结合(无需识别SD序列)

4)40S小亚基与60 S大亚基结合成80S·mRNA·Met-tRNA Met起始复合物

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