天然产物立体结构测定法

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• 圆二色谱有正Cotton效应曲线和负Cotton效 应曲线。 • 峰形向下的为负,峰形向上的为正。
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2. ORD、CD及UV谱线特点及关系
旋光光谱是非吸收光谱,不具有紫外吸收的手性
化合物也可测定旋光光谱。 谱线特征:不具有生色团的手性化合物产生平滑 谱线,具有生色团的手性化合物产生具有S 曲线 式Cotton 效应的谱线。 Cotton效应:平滑曲线在接近所测化合物的最大 吸收波长处出现的异常S 曲线。 圆二色谱是吸收光谱,具有紫外吸收的手性化合物 可测定圆二色谱。 谱线特征:产生具有峰状或谷状Cotton 效应的图谱。 Cotton效应:平滑曲线在所测化合物的最大吸收波 长处出现的异常的峰状或谷状曲线。峰为正Cotton, 谷为负Cotton。 在化合物紫外最大吸收处,是ORD产生Cotton效 应谱线跨越基线的位置;是CD产生Cotton效应 谱线的位置。
6. 吴红华, 李志峰, 张起辉, 裴月湖. CD在木脂素类化合物绝对构型测定中 的应用. 沈阳药科大学学报, 2010, 27 (7): 587-594.
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一、立体构型的测定方法简介
基本概念: • 1. 相对构型(relative configuration): • 或-取向,糖端基或-构型 • 2. 绝对构型(absolute configuration): • R, S, 糖的D-, L-型, 如2R, 3R-, • 3. 构象(conformation):
O2N O H COOH
O
NO2
引起Cotton效应的结构因素大致可分三类:
1. 由固有的手性发色团产生,如不共面的取代联苯或螺己 省等。
2. 原发色团是对称的,但在手性环境中被扭曲。如优势构 象被固定的环己酮。
3.由分子轨道不互相重叠的发色团偶极相互作用产生的。
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采用两种方法研究:
(1)利用普通的圆二色谱方法研究。含有n→π* 跃迁 的生色团,如环己酮类、内酯类、α,β-不饱和酮类等; 手性中心在生色团α位;联苯类。分子具有稳定构象或已 知相对构型。 (2)利用激子手性法(裂分的圆二色谱)研究。含有两 个π→π*跃迁的生色团,如烯类、苯环(取代)、萘环、 卟啉环等;手性中心与生色团间具有确定的空间关系;两 生色团间具有确定的两面角,即稳定构象。
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- 0.03 + 0.07
H3C
21 20
- 0.11
H
26
+ 0.07
H
22
RO
23 24
H
25
H
- 0.04
OH
H
H
27 CH
+ 0.07 + 0.08
3
- 0.10
Δδ = δS -δR
H COOH H
22
实例2:phyllactone B
23
实例3:combretastatin D-1
实例1:seco-coccinic acid E from Kadsura
coccinea
MTPA酯化物的制备:
OH
OH
OMTPA
TMSCHN2 rt, 10 h
H COOH H
COOCH3 H H
(+) or (-) MTPACl rt, 4 h
COOCH3 H H
6
6a
6b 6c
Ref. Nan Wang, et al. Lanostane-Type Triterpenoids from the Roots of Kadsura coccinea. J Nat Prod, 2008, 71(6), 990-994
HO
COOH
H-3 3.67 (dd, J = 10.5, 2.3Hz)
2
HO
1
3
H
7
立体构型的测定方法简介
• • • • • 1. 化学转变法 2. 旋光比较法 3. CD/ORD 4. 单晶衍射法 5. 核磁共振法
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化学转变法
• Prelog法,Horeau法(用于叔醇或仲醇) • 均需通过反应(不对称合成),最后测定旋光, 样品用量大。 • 原理是根据不同构型的手性中心的反应活性不同, 加入光学活性试剂,最终的产物的旋光不同。 • Horeau法:
O O
S-MTPA酯
F E D C B A MeO O Ph CF3
*
H O
R-MTPA酯
注意:S-MTPCl形成酯后变为R-MTPA酯 OCH3> COCl > CF3> Ph; OCH3 > CF3 > COOR > Ph
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OR CC-CB-CA
*
H
CD-CE-CF
Δδ =δS- δR
19
20
4. 吴立军. 实用天然有机产物化学. 人民卫生出版社,2007. 5. Desmond Slade, Daneel Ferreira, Jennie P J Marais. Circular dichroism, a powerful tool for the assessment of absolute configuration of flavonoids. Phytochemistry, 2005, 66: 2177.
右旋圆偏振光
左旋圆偏振光
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(1)旋光光谱测定原理(ORD, optical rotation dispersion)
α为旋转角,单位是rad/cm。 旋光度 = π( nL- nR) / λ
nL- nR是连续波长的平面偏振光通过手性分子
介质时, 左旋圆偏振光与右旋圆偏振光的折射率之差。
[α]D = α/ l×c
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该方法同样适用于伯醇的β位的绝对构 型的判定
H O H O
Ar OMe
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三、旋光光谱与圆二色谱
• 1.测定原理: • 一个平面偏振光可分解成一个左旋圆偏振光和一个右旋圆偏振 光。当平面偏振光通过手性中心时,左旋圆偏振光和右旋圆偏 振光的折射率不同,传播速度不同,当再合成平面偏振光时, 偏振面就发生了旋转,这就是产生旋光的光学原理。随着波长 变短,折射率差Βιβλιοθήκη Baidu增大,比旋度增大。人的眼睛对黄光最敏感, 故规定在钠光(589nm)下测定旋光值。
HO
COOH
HOH2C O HO HO OH
-D-Glc
OH HO
O
CH2OH OH OH
HO
HO
-L-Glc
5
OH
OH
HO
O
HO O CH2OH OH OH HO
OH O HOH2C O HO HO OH O
O OH O
O
3,5,7,4’-tetrahydroxy flavone-3-O--DHO O pyranoglucoside
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应用圆二色谱研究前应具备的条件:
(1)被研究的手性分子应当结构确定,被研究部位 的相对构型确定。 (2)当被研究的分子不含有生色团时,如分子具有 可引入生色团的基团,如羟基、氨基等,可引入 适当的生色团(试剂),利用激子手性CD测定方 法进行研究。
COOH HO
HO
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圆二色谱测定时的要求
1. 应使用光谱纯级别的溶剂, 对被测样品有较好溶解度。与样品不发 生作用,在测定波长无吸收。 2. 非极性溶剂最好,极性溶剂有可能改变被测分子的优势构象,不利 于图谱间的比较。乙腈、甲基环己烷。 3. 强的氢键型溶剂可以与含有氧原子的光学活性化合物形成氢键,由
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ATMA法和NMA法 特点:芳环的屏蔽效应远远强于MTPA,尤其 适用于长链化合物仲醇绝对构型的测定
COOH MeO COOH 2NMA OMe
9ATMA
COOH OMe 2ATMA
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• 9ATMA,1NMA,2NMA酯中的值较大,所以 往往只需要R-或S-中一种对映体即可,通 过与原来醇中质子化学位移的比较,即可 测定其绝对构型。
[M] D17 = [α] × 相对分子量/ 100
• 计算公式: [α]D = α/ l×c D: 589 nm , l: 池长,dm, c: 溶液浓度, g/ml
• 注意:
对映异构体:已知化合物和新化合物 (+)- Lyoniresinol
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• 注意:
一个手性化合物的比旋光度随着测定温度、溶液浓度、
[M] D= [α] × 相对分子量/ 100
以旋光率[α]或摩尔旋光度[M]为纵坐标,以波长为 横坐标,所测旋光率的谱线即为旋光光谱。
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ORD谱的分类
(1). 平坦谱线 • 无峰无谷,有旋光性,但手性中 心附近无生色团。 (2). 单纯Cotton曲线 • 有峰有谷,手性中心附近有生色团。 • 正Cotton曲线: 长波 短波,先峰后谷 • 负Cotton曲线: 长波 短波,先谷后峰 (3). 复合Cotton曲线 • 有几个峰和几个谷。
消旋苯基丁酰氯 (或酸酐)
测定过量酰氯水解后 的酸的旋光
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化学沟通或降解转化成构型已知的化合物,比较旋光度
10
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*
*
12
GC法 测定单糖的绝对构型
D-或L-单糖
D-半胱氨酸甲酯盐酸盐
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旋光比较法
• 某些类型化合物已总结出一些经验性的结构与旋光性的关系规则。
• 如:-OH脂肪酸的旋光度为[]18D - 4.0,2位为R构型 • 比旋光度报告形式: [α] D17 = + 213 ± 0.3 (c 0.57, CHCl3) c = g /100 ml
HO O OH O
OH
OH O
3,5,7,4’-tetrahydroxy flavone-3-O--Lpyranoglucoside
OH OH
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NOE
立体结构的测定程序:
H H CH2OH O HO HO OH OR
• 1. 平面结构的确定:1D-NMR, 2DNMR (COSY, HSQC, HMBC, etc.) • 2. 相对构型的确定: 1H NMR的偶合常数, NOESY • 3. 绝对构型的确定: 已知化合物:比较[], CD 注意:对映异构体的核磁数据应完全 一致。
天然产物立体结构测定法
中药学院 华会明 2012-5
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主要内容:
一、立体构型的测定方法简介
二、旋光光谱与圆二色谱(ORD和CD) 三、核磁共振法——Mosher法
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参考文献:
1. 叶秀林. 立体化学. 北京大学出版社,1999 2. 吴立军. 旋光谱和圆二色谱在有机化学中的应用. 沈阳药学院学报, 1989, 6(2), (3), (4), 7(1) 3. 北京药物所. 中草药现代研究(仪器分析卷)p. 285
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• (1).一个复杂的化合物,并不一定其所有的吸收峰都呈现光学 活性负担(如III带)。 • (2).CD谱能很明确的表现出吸收带的圆二色性(如I带和II带) • (3). 由于旋光性的叠加ORD不如CD谱明确。
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3. 圆二色谱测定条件与方法
同时具备3个条件的手性化合物可以用圆二色谱研究 HOOC *跃迁或π→π*); 即:分子中具有生色团(具有n→π O O H 不对称中心在生色团附近;具有稳定的构象。 O
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(2)圆二色谱(circular dichroism,CD)测定原理
当分子中具有生色团时,手性分子对左旋圆偏振光和右旋圆偏振光的 吸收是不同的,即L R。当再合成平面偏振光时就变成椭圆的。 Δε= εL - εR = ΔA / C×l = (dl-dr) / C ×l εL 与 εR为左、右圆偏振光的吸收系数 d 为光密度;C 为物质的量浓度 mole/L;l 为池长。 以摩尔椭圆度[]或 Δε为纵坐标,以波长为横坐标,获得的谱线为圆 二色谱。 • 圆二色谱仪记录的是椭圆度 ,通常以millidegrees表示。 • 通常使用摩尔椭圆度[]: []= (λ)M/ 100×l×c c(浓度)=g/ml, l(测量池池长)=dm • 换算关系为:[] 3300
溶剂变化而变化,因此测定时应当注意选择与文献报告相同 或相近的温度、溶剂,以及配制相近浓度的溶液,否则难以 比较。有些生物碱的比旋光度受pH、溶剂、成盐、温度、浓 度影响。 • 烟碱 • 麻黄碱 中性时 左旋(l), 酸性 右旋(d); 右旋; 右旋; 氯仿中 左旋, 水中
• 北美黄连碱 中性时 左旋, 酸性
Ph Cl O
R-MTPCl S-MTPA
OMe CF3
MeO Cl O
Ph CF3
S-MTPCl R-MTPA
注意:S-MTPCl与R-MTPA的取代基取向相同 OCH3> COCl > CF3> Ph; OCH3 > CF3 > COOH > Ph
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F E D C B A
Ph
OMe CF3
* H
• 吐根碱
游离型 氯仿中 左旋,盐酸盐 右旋。
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二、核磁共振法
• 特点: • 样品用量少,衍生物制备简单,测定快速 准确。衍生化试剂昂贵。
• 方法: • Mosher法,9ATMA法,NMA法
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Mosher法——仲醇绝对构型
使用R和S-α-甲氧基三氟甲基苯基乙酰 氯(MTPCl)或R和S-α-甲氧基三氟甲基苯 基乙酸(MTPA),将待测的手性醇转化为相 应的MTPA酯。
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