细胞表面标志 PCR array 芯片
组织芯片的概念及原理
组织芯片的概念及原理关键词：细胞株肿瘤细胞菌种保藏中心 ATCC 中国微生物菌种网北京标准物质网组织芯片(tissue chip)，也称组织微阵列(tissuemmroarray)，该技术是将数十个甚至上千个不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一载体上，进行同一指标的原位组织学研究，是一种高通量、大样本以及快速的分子水平分析工具。
组织芯片的制作原理与单个切片相同，只是样本数量增加。
组织芯片的种类包括人的常规石蜡包埋样本的组织芯片、各种实验动物的组织芯片、细胞株及一些病原微生物的芯片等。
在已有的石蜡包埋组织芯片的基础上，Feizo等创建了冷冻组织微阵列技术。
近年来出现了一种新技术，称为下一代组织芯片技术(next-generation tissue。
microarray，ngTMA)，该技术将组织学专业知识与数字化病理技术及自动化组织芯片技术相结合，能精准定位所需要的组织区域或细胞类型，避免无效组织的出现，有助于肿瘤微环境中的病理学研究。
组织芯片主要用于各种原位组织技术实验中，包括常规形态学观察、各种特殊染色、免疫组织化学染色、核酸原位杂交、原位PCR、荧光原位杂交、原位RT-PCR和寡核苷酸启动的DNA合成(PRINS)等；其次用于临床和基础的研究，如分子诊断、预后指标筛选、治疗靶点定位、抗体和药物筛选、基因和表达分析等。
组织芯片的设计应考虑组织的种类及芯片上每一样本组织片的大小。
此外，组织片的大小对某一器官或组织所存在病变的代表程度如何也是考量因素。
一般而言，芯片上组织样本数量越大，组织的面积越小，细胞数量也越少。
在直径约为2mm的组织芯片上有约100000个细胞，而在直径为0．6mm的组织片上只有约30 000个细胞，故在组织芯片的设计中并不是组织片的数量越多越好，最常用的组织芯片的样本含量仍以60～100个为主，组织片的直径可为2mm，这样既可提供较大面积的组织进行形态学观察，又可定位和半定量观察免疫组化或原位杂交等的检测信号(图9-7-1)。
pcr array操作流程
pcr array操作流程PCR array操作流程PCR array是一种高通量PCR技术，它可以在一次实验中同时检测多个基因的表达水平。
本文将介绍PCR array的操作流程，包括样品准备、试剂配置、PCR反应、数据分析等步骤。
一、样品准备1. 收集需要检测的样品，如细胞培养物、组织样本等。
确保样品来源准确，避免混淆和误判。
2. 根据实验设计，将样品分成不同组别，每个组别包含相同数量的样品。
确保每个组别的样品来源均匀，避免批次效应对实验结果的影响。
3. 将样品转移到离心管中，进行离心以去除细胞碎片和其他杂质。
确保样品纯净度和质量。
二、试剂配置1. 根据PCR array的使用说明书，将所需试剂配置好。
试剂包括PCR master mix、primer mix、SYBR Green等。
2. 严格按照试剂配置表中的配比和体积，将试剂加入到每个PCR孔中。
确保试剂的准确性和一致性。
三、PCR反应1. 将配置好的试剂加入到每个PCR孔中，注意避免气泡的产生。
2. 将PCR板放入PCR仪中，设置好PCR程序参数，如温度、时间等。
确保PCR程序的准确性和一致性。
3. 启动PCR仪，进行PCR反应。
反应结束后，将PCR板取出。
四、数据分析1. 将PCR板中的数据导出到计算机中，使用相应的数据分析软件进行分析。
2. 根据实验设计和研究目的，选择适当的统计方法进行数据处理和分析。
3. 绘制图表，展示PCR array的结果。
可以使用柱状图、热图等方式来呈现基因的表达水平差异。
4. 进行生物信息学分析，如通路分析、基因功能注释等，探索基因的生物学意义。
PCR array操作流程包括样品准备、试剂配置、PCR反应和数据分析等步骤。
在实验过程中，需要严格控制每个步骤的准确性和一致性，以确保实验结果的可靠性和可重复性。
PCR array技术的广泛应用，为我们研究基因表达调控提供了一种高效、准确的方法。
炎症因子PCR array 芯片
Inflammatory Response and Autoimmunity PCR ArrayCatalog No.PAHS-077A（人）炎症反应与自身免疫PCR芯片The Human Inflammatory Response and Autoimmunity RT²Profiler™PCR Array profiles the expression of84key genes involved in autoimmune and inflammatory immune responses.It represents the expression of inflammatory cytokines and chemokines as well as their receptors.It also contains genes related to the metabolism of cytokines and involved in cytokine-cytokine receptor interactions.Thoroughly researched panels of genes involved in the acute-phase response,inflammatory response, and humoral immune responses are represented as ing real-time PCR,you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to inflammatory and autoimmune responses with this array.炎症反应与自身免疫RT²Profiler™PCR Array可以同时测定84个与炎症反应与自身免疫相关的基因。
生物芯片技术
FGR
FES
ABL
INT2
PIK3CA
NMYC
AKT2
FGFR1
JUNB
AKT1
KRAS2
CDK4
AR
RDA Protocol
RNA extraction and cDNA preparation from archived tissue specimens(tester and driver) Generation of amplified cDNA fragments (‘amplicons’) Subtractive hybridization of amplicons Enrichment of cDNA fragments from differentially expressed genes
DNA Chip Technology
Solid support (glass, plastic, metal, silicon) Miniaturized array of DNA (genetic material) Work on the biochemical principle of DNA/DNA hybridization Hybridized probes (DNA molecules) are fluorescently labeled
应用之一 基因表达谱（gene expression pattern）
Research Use. Clinical Diagnostic Use.
Biological Sample
Functional Information
One Disease——One Gene Expression Pattern
Prototype AmpliOnc™ I Biochip
PCR Array介绍-最新
PCR Array介绍1.什么是PCR Array？a.功能分类芯片或PCR 列阵，它结合了实时定量PCR技术灵敏可靠的优势以及微列阵技术同时检测多种基因表达量的优势，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
b.使用定量PCR 的方法在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或某生物学功能相关的84个或370个重要基因的表达量变化进行检测的。
c.完全克服了常规杂交芯片假阳性率高及海量数据难于有效分析的缺陷，使用方便，只要有定量PCR仪就可以进行该实验，并且赠送配套的数据分析程序。
2.PCR Array的实验目的？主要用于检测某信号通路或某生物学功能相关的一系列重要基因的表达量变化。
3.PCR Array带来的便利？a．即用，免去了复杂的引物设计和实验条件的摸索过程。
b．可以直接了解在某信号通路或某疾病中非常重要的基因，而不需要再检索和阅读大量的文献和进行前期实验的验证。
c．实验所得到的数据，可以很方便的进行在线分析，得到的数据分析图可以直接用于发表的文章。
d．总之，PCR Array可以提供准确而可靠的实验数据，并且帮助您节约大量的时间和精力。
4.PCR Array的实验流程？整个实验流程非常简洁，便于操作。
a．从样本中提取总RNA。
（我们推荐使用QIAGEN的RNeasy Mini Kits和RNase Free DNase Set）b．将RNA反转录为cDNA。
（需要使用与PCR Array 相配套的RT² First Strand Kit）c．配置PCR的反应体系。
（需要使用与PCR Array 相配套的RT² SYBR Green Master mixes）d．进行Real-Time PCR实验。
（需要使用推荐的参数设置）e．数据分析。
（有免费的分析程序）5.PCR Array的质量？a．在实验中所需要的每条引物，每种试剂，每个实验条件，每个操作流程，包括每个plate的制作都是经过了严格的质检。
SNP Array
SNP Array在一张约一厘米见方的固体（通常是硅或玻璃）平面上固定大量称之为探针的短序列。
探针与样品中的靶序列在一定条件下发生杂交反应，通过荧光、化学发光标记的方法读取每个位点的复杂信息。
它是生物学家受到计算机芯片制造和广为应用的启迪，融微电子学、生命科学、计算机科学和光电化学为一体，在原来核酸杂交（Northern、Southern）的基础上发展起来的一项新技术基因芯片技术的优点：（1）实验所需DNA样本量较少，一次实验即可检查全基因组的染色体拷贝数变化，可实现一次实验同时检测多种疾病。
（2）不仅适用于外周血、培养细胞和新鲜组织样本的研究，还可用于对存档组织的研究，也可用于因DNA量过少而经PCR扩增的样本的研究。
Array-CGH是在CGH（Comparative Genomic Hybridization，比较基因组杂交）技术上发展起来的芯片技术。
其原理是：先分别将样本与正常人基因组DNA打碎，再利用双色荧光杂交的策略，对样本基因组DNA片段进行红色荧光（Cy5荧光素）标记，而对照的正常人基因组DNA片段用绿色荧光（Cy3荧光素）标记，再将这些标记后的片段作为探针，与高密度的涵盖整个人类基因组的DNA芯片杂交。
通过这两组探针的竞争杂交，再利用共聚焦显微镜等数码摄像系统对结果进行扫描，并对芯片上每个点（对应于人类基因组的不同位置）的发光强度进行比较。
红绿色均等的区域是样本细胞与正常细胞均具有的正常部分，而红色较强的部分即样本染色体区域重复的部分；反之，以绿色为主的部分则是样本染色体缺失的部分，以此对染色体拷贝数的变化进行定量研究。
Array-CGH芯片技术的局限性：（1）检测到的最小的DNA重复或缺失是在3-5Mb，故对于低水平的DNA重复或缺失会漏检。
（2）相差染色体的拷贝数不变时，不能检测出平等染色体的易位。
（3）无法检测拷贝数不变的染色体异常，如单亲二倍体和杂合性缺失。
SNP-array芯片技术单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNP）是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性而形成的遗传标记。
PCR ARRAY应用指南
PCR ARRAY应用指导作者：上海沃吉基因PCR ARRAY应用一：分子机制探究信号通路PCR芯片PCR ARRAY应用二：转录组测序之后通路PCR芯片验证PCR ARRAY应用三：生物标志物研究之MICRORNA PCR 芯片PCR ARRAY应用四：microRNA 靶基因PCR芯片PCR ARRAY应用五：肿瘤研究PCR 芯片PCR ARRAY应用六：转录组测序之后差异基因PCR 芯片PCR ARRAY应用七：细胞功能之氧化应激PCR芯片PCR ARRAY应用八：动物模型之信号通路PCR芯片PCR ARRAY应用九：肿瘤LNCRNA PCR芯片PCR ARRAY应用十：分子功能之代谢PCR芯片案例一：ADAR1通过调节RLR依赖性信号通路来促进KSHV裂解激活文章信息：ADAR1 Facilitates KSHV Lytic Reactivation by Modulating the RLR-Dependent Signaling PathwayHuirong Zhang, Guoxin Ni, Blossom Damaniadoi: 10.1016/j.celrep.2020.107564发表杂志：Cell Reports（IF=7）材料：人iSLK.219细胞，TREx BCBL1-RTA细胞，293FT细胞实验方法：KSHV病毒感染iSLK.219细胞和BCBL1-TREx-RTA细胞，转染siRNA，后用含有84个目的基因的人类干扰素和受体PCR阵列进行qPCR检测实验目的：，KSHV病毒裂解再激活过程中，ADAR1在信号通路中的作用使用芯片：人类干扰素和受体PCR阵列案例二：组蛋白甲基转移酶EZH2 / 1的抑制剂的抗病毒效应研究文章信息：inhibitors of the Histone Methyltransferases EZH2/1 Induce a Potent Antiviral State and Suppress Infection by Diverse Viral PathogensJesse H. Arbuckle, Paul J. Gardina, David N. Gordon, Heather D. Hickman, Jonathan W. Yewdell, Theodore C. Pierson, Timothy G. Myers, Thomas M. KristieDOI: 10.1128/mBio.01141-17发表杂志：MBIO（IF=6）材料：HFF细胞实验方法：先用HSV病毒感染HFF细胞，再用EZH2 / 1的抑制剂处理HFF细胞，后用IFN qPCR芯片检测细胞内差异基因，再通过转录组测序分析抗病毒机制实验目的：确定IFN和IFN受体基因表达的差异使用芯片：IFN qPCR阵列案例三：LCa淋巴结转移的miRNA特征定义：miR-449a靶向Notch基因并抑制细胞迁移和侵袭文章信息：Definition of miRNA Signatures of Nodal Metastasis in LCa: miR-449a Targets Notch Genes and Suppresses Cell Migration and InvasionHiromichi Kawasaki, Takashi Takeuchi, Filippo Ricciardiello, Angela Lombardi, Elia Biganzoli, Marco Fornili, Davide De Bortoli, Massimo Mesolelladoi: 10.1016/j.omtn.2020.04.006发表杂志：Molecular Therapy-Nucleic Acids（IF=5）材料：淋巴结转移（N=23）或无淋巴结转移（N=23）的LCa患者及其邻近的正常对照组（N=30）收集的临床LCa组织样本实验方法：通过含有309个miRNA的miRNA芯片对组织样品进行的qPCR检测，对LCa组织进行miRNA筛选实验目的：确定LCa组织中的差异表达的miRNA使用芯片：人miRNA ARRAY案例四：miR-21对lncRNA GAS5的负调控文章信息：Negative regulation of lncRNA GAS5 by miR-21Z Zhang, Z Zhu, K Watabe, X Zhang, C Bai, M Xu, F Wu & Y-Y Mohttps:///10.1038/cdd.2013.110发表杂志：Cell Death & Differentiation（IF=8）材料：乳腺癌MCF-7细胞和MDA-MB-231细胞，正常细胞MCF-10A实验方法：通过83个人类疾病相关IncRNA阵列检测miR-21对IncRNA表达的影响。
PCR Array介绍
细菌、真菌、病毒 Antibacterial Response Necrosis Antifungal Response Antiviral Response HIV Infection and Host Response Interferon α, β Response Interferons and Receptors
毒性 Nephrotoxicity Hepatotoxicity Cardiotoxicity Molecular Toxicology PathwayFinder Stress & Toxicity PathwayFinder
老年病 Hypertension Atherosclerosis Alzheimer's Disease Parkinson's Disease
c． 全球有 1000 多个实验室（包括 300 多个大学）在使用该产品，其中包括：辉瑞， 罗氏，礼来，诺华，拜耳，Harvard，Yale，Stanford 等。
6. PCR Array 可以在哪些仪器上使用？ 可以在任何一种常见的定量 PCR 仪器上使用。
7. PCR Array 的大概价格是多少？
肝癌 肺癌 乳腺癌 雌激素及乳腺癌相关 前列腺癌 癌基因及抑癌基因 细胞凋亡 血管生成 细胞周期 细胞衰老 肿瘤转移 肿瘤坏死因子（TNF）配体和受 体 p53 信号通路 血管生长因子及血管生成抑制因 子 DNA 损伤信号通路 DNA 修复 端粒与端粒酶 自噬作用 血管内皮细胞 血管内皮生长因子信号 Cell Death PathwayFinder Cancer PathwayFinder
产品 RNeasy Mini Kit (50) RNase Free DNase Set （50） RT2 First Strand Kit （12） plate 96 （2） SYBR GREEN Master mix plate 96 （12） SYBR GREEN Master mix plate 96 （24） SYBR GREEN Master mix plate 384 （1，4*96） SYBR GREEN Master mix plate 384 （4，4*96） SYBR GREEN Master mix
动脉粥样硬化PCR array 芯片
Atherosclerosis PCR Array 动脉粥样硬化PCR芯片Catalog No.PAHS-038A（人）Catalog No.PAMM-038A（小鼠）The Atherosclerosis RT²Profiler™PCR Array profiles the expression of84genes related to atherosclerosis.Genes involved in the processes of blood coagulation and circulation are included as well as genes involved in cell-adhesion and lipid transport and metabolism.Genes involved in the stress response,cell growth and proliferation,and apoptosis are represented as ing real-time PCR,you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to the atherosclerosis with this array.动脉粥样硬化RT²Profiler™PCR Array可以同时测定84个与动脉粥样硬化有关的关键基因。
其中包括与血液循环和血液凝结过程有关的基因，还有与细胞黏附和脂转运代谢有关的基因。
同时还包括了一些与应激反应、细胞生长和增殖、凋亡相关的基因。
利用实时定量PCR，你可以方便并且可信地对与动脉粥样硬化相关的基因进行同时检测。
Response to Stress:Inflammatory Response:CCL2,CCL5,CCR1,CCR2,IL1R1,IL1R2,ITGB2,NFKB1,NOS3,SELE,SPP1,TNF.Response to Oxidative Stress:APOE,CCL5,SOD1.Response to Pests,Pathogens or Parasites:CCL2,CCR2,CSF2,FN1,IL4,ITGB2,TNF.Response to Virus:CCL5,IFNAR2,TNF.Response to Wounding:CCR1,CCR2,CTGF,FN1,PDGFB,TNF,VWF.Other Genes Related to Stress Response:IFNG,PPARG,VEGF.Apoptosis:Anti-apoptosis:BCL2,BCL2A1,BCL2L1,BIRC3,CCL2,CFLAR,FAS(TNFRSF6),IL1A,IL2,NFKB1,SERPINB2,SPP1,TGFB1,TNF,TNFAIP3.Induction of Apoptosis:APOE,BAX,BID,CFLAR,FAS(TNFRSF6).Other Genes Related to Apoptosis:IL5,ITGB2.Blood Coagulation and Circulation:Blood Coagulation:FGA,ITGA2,LPA,SERPINE1.Circulation:APOA1,APOB,APOE,COL3A1,ELN,ENG,LPA,LPL,NPY.Platelet Activation:PDGFA,PDGFB,PDGFRB,VWF.Regulation of Blood Pressure:ACE,FGA.Adhesion Molecules:Cell-cell Adhesion:CD44,CDH5,ICAM1,ITGB2,SELE,SELL,TNF,VCAM1,VEGF.Cell-matrix Adhesion:CD44,ITGA2,ITGA5,ITGAX,ITGB2,SPP1.Other Genes Involved in Adhesion:CCL2,CCL5,CCR1,CTGF,ELN,ENG,FN1,LAMA1,SELPLG,THBS4,TNC,VWF.Extracellular Molecules:ECM Protease Inhibitors:LPA,SERPINB2,SERPINE1.ECM Proteases:ACE,MMP1,MMP3.Extracellular Matrix(ECM)Structural Constituents:COL3A1,ELN,FN1.Other Extracellular Molecules:ADFP,APOA1,APOB,APOE,CCL2,CCL5,CSF2,CTGF,FGA,FGF2,HBEGF(DTR),IFNAR2,IFNG,IL1A,IL2,IL3,IL4,IL5, LAMA1,LIF,LPL,NPY,PDGFA,PDGFB,SPP1,THBS4,TNC,VEGF,VWF.Lipid Transport and Metabolism:Cholesterol Metabolism:ABCA1,APOA1,APOB,APOE,IL4,LDLR.Fatty Acid Metabolism:FABP3,LPL,PPARA,PTGS1.Lipid Transport:ABCA1,APOA1,APOB,APOE,FABP3,LDLR,LPA,LPL,MSR1.Lipoprotein Metabolism:APOA1,APOE,LDLR,LPL.Steroid Metabolism:NR1H3,PPARA,PPARD,PPARG,RXRA.Other Genes Related to Lipid Metabolism:ADFP,APOE,LPA.Cell Growth and Proliferation:Growth Factors and Receptors:CSF2,KDR,PDGFRB,SPP1.Negative Regulation of Cell Proliferation:BCL2,FABP3,IL1A.Positive Regulation of Cell Proliferation:CSF1,FGA,FGF2,HBEGF(DTR),IL2,IL3,IL5,IL6,IL7,LIF,VEGF.Regulation of the Cell Cycle:FGF2,IL1A,PDGFA,PDGFB,TGFB1,TGFB2,VEGF.Other Genes Involved in Cell Growth and Proliferation:CTGF,ELN,IFNG,IL4,NPY.Transcription Regulators:Nuclear Receptors:NR1H3,PPARA,PPARD,PPARG,RXRA.Other Transcription Regulators:EGR1,KLF2,NFKB1,TNF,TNFAIP3.应激反应有关基因；凋亡相关基因；凝血及血循环相关基因；黏附分子；细胞外分子；脂类转运和代谢分子；细胞生长和增殖相关基因；转录调节因子。
PCR Array介绍
一、产品介绍：BioTNT qPCR Array专为检测不同组织或细胞中特定基因的表达量而设计，这些基因按照预制或定制要求成套设置。
检测结果所显示的表达差异可帮助研究者鉴定或验证这些基因的生物学意义，以及与其研究的重要相关性。
对于目录(预制)产品，每块384孔板包含84对PCR引物，可以进行4个样本单孔或者两个样本双复的实验。
这些引物全部经过预先验证，并包被于指定的板孔中。
在同一块96孔板上，有12个(384孔板有48个)反应孔包被了不同类型的对照，用以检测从反转录到qPCR整个过程的反应效率。
逆转录试剂和以荧光染料SYBR®Green 为基础的定量检测试剂作为被推荐的RT-qPCR试剂产品可与qPCR Array配套使用。
该系列试剂均经过优化，具有高的灵敏度、效率和特异性。
其他公司的类似试剂可能适用，但未验证过，不推荐使用。
产品优势BioTNT QPCR芯片特点：灵敏度高，样本使用量低线性范围广，可同时检测表达水平差异大的基因每个基因的检测引物优化后保证高扩增率和产物单一重复性高，Ct值的平均差异只有0.25个循环覆盖范围广：目录产品包含通路分析、疾病研究；定制产品可根据客户要求选择设置数据分析方便：专用软件方便数据统计与分析二．运输和储存条件：4度运输。
-20°C储存至少6个月；三．适用仪器：lifetechnoliges（原ABI）7900，Viaa 7 等可使用384微孔板的QPCR 仪器。
也可以定制其他机器形式：Biotnt 可提供多种与以下qPCR仪器匹配的qPCR array类型。
重要提示：在订购前，请根据您的qPCR仪器型号选购合适的array类型；在收到产品后，请及时确认收到的array是否与您的qPCR仪器匹配。
如果您的仪器类型不在下表所列类型中，请及时联系本公司技术支持咨询。
四．质量标准（QC）1. biotnt gene qPCR array中检测的基因引物，经实验验证结果分析，融解曲线均呈单一锐锋，电泳条带均呈单一条带，说明这些引物均是特异扩增引物，验证合格。
pcr array操作流程
pcr array操作流程PCR（Polymerase Chain Reaction）是一种用于扩增DNA片段的重要技术，它在分子生物学和遗传学研究中得到了广泛应用。
PCR array是一种利用PCR技术进行高通量基因表达分析的方法，能够同时检测多个目标基因，在生物医学研究和临床诊断中具有重要意义。
本文将介绍PCR array的操作流程，并探讨其在科研和医学领域中的应用前景。
一、实验前的准备工作在进行PCR array实验前，需要准备一系列实验所需的试剂和设备。
首先，要选择适合的PCR芯片，根据研究的需求和目标基因的数量选择合适的PCR array产品。
其次，需要准备好目标基因的引物和探针，确保其质量良好。
同时，还需要准备PCR反应体系中所需的酶、缓冲液、核酸模板等试剂，并按照实验所需的浓度进行稀释和调整。
此外，还需要准备PCR仪、离心机、聚丙烯酰胺凝胶电泳系统等实验设备。
二、PCR array实验的步骤1. 样品的制备：根据实验设计和研究目的，选择适当的样品进行提取DNA或RNA。
样品的制备应遵循标准的提取方法，确保样品的纯度和完整性。
同时，还需要根据实验要求进行必要的稀释和调整。
2. PCR芯片的准备：将PCR芯片从冰箱中取出，迅速离心，然后加入相应的PCR反应混合液。
将芯片放入PCR仪中，按照预设的PCR程序进行扩增反应。
反应结束后，将PCR芯片取出，进行后续的处理。
3. 数据收集和分析：将PCR芯片放入相应的扫描仪中，获取芯片上的荧光信号。
得到的原始数据可以利用PCR array分析软件进行处理和分析。
根据实验设计和研究目的，选择合适的统计方法和数据处理流程，得到最终的分析结果。
三、PCR array的应用PCR array技术在生物医学研究和临床诊断中具有广泛的应用前景。
首先，在基因表达研究中，PCR array可以同时检测多个目标基因的表达水平，帮助研究人员快速筛选和验证候选基因，揭示基因调控网络和信号通路，加深对疾病发生机制的理解。
细胞芯片技术原理及应用
细胞芯片技术原理及应用细胞芯片技术是以活细胞作为研究对象的一种生物芯片技术。
它是适应后基因组时代人类对生命科学探索的要求而产生。
作为细胞研究领域的一种新技术，其既保持传统的细胞研究方法的优点如原位检测等，又满足了高通量获取活细胞信息等方面的要求。
一、细胞芯片技术基本原理细胞芯片技术是充分运用显微技术或纳米技术，利用几何学、力学、电磁学等原理，在芯片上完成对细胞的捕获、固定、平衡、运输、刺激及培养等精确控制，并通过微型化的化学分析方法，实现对细胞样品的高通量、多参数、连续原位信号检测和细胞组分的理化分析等研究目的。
新型细胞芯片应满足以下3个方面的功能：①在芯片上实现对细胞的精确控制与运输；②在芯片上完成对细胞的特征化修饰；③在芯片上实现细胞与内外环境的交流和联系。
二、微流体细胞芯片微流体细胞芯片是一种高通量、自动化的集成微型芯片装置，具有对细胞样品具有预处理和分析的能力。
通过在芯片上构建各种微流体通道体系，并运用不同的方法在流体通道体系中准确控制细胞的运输、平衡与定位，进而实现对细胞样品进行药物刺激等试验过程的原位监测和细胞组分的分析。
微流体细胞芯片制作方法多样，类型不一，发展较快，应用的范围也比较广泛，内容涉及细胞的固定培养、鉴定筛选、分化刺激、原位检测、药物开发筛选和组分分析等各个方面。
三、微量电穿孔细胞芯片当给细胞一定的阈电压时，细胞膜具有短暂的强渗透性。
利用细胞膜的这种特性将外源DNA、RNA、蛋白质、多肽、氨基酸和药物等精确转导入靶细胞的技术称为电穿孔技术。
该技术能直接应用于基因治疗。
微量电穿孔细胞芯片正是将这种技术与生物芯片技术相结合的产物，是细胞操作调控微型化的一种手段。
该技术采用一种微型装置，将细胞与芯片上的电子集成电路相结合，利用细胞膜微孔的渗透性，通过控制电子集成电路给细胞施加一定的电压，使细胞膜微孔张开，从而在不影响周围细胞的情况下可将外源DNA、RNA、蛋白质、多肽、氨基酸和药物等顺利的导入或从靶细胞中提取出来，并进行后续研究。
生物芯片分类及应用
Liquichip技术特点描述
1．基于bead的这种固相反应技术，具有 灵敏度高、信号强度高、灵活性好、所需样品量少的特点。 2．与传统的蛋白芯片相比，有两大优势，反应速度更快，灵活性更好。 3．由于检测方法的特点，在大部分的实验过程中，都不需要洗脱步骤，省时，且不会破坏反应的动态平衡。 4．有配套的蛋白表达和纯化体系。（his-tag）
Lquichip应 用 领 域：
蛋白质定量 蛋白质功能研究 蛋白表达谱分析。 蛋白质与蛋白质、蛋白质与核酸相互作用的研究。包括：免疫分析、酶分析、受体-配基分析、蛋白质核酸相互作用分析分析。
微阵列芯片
蛋白芯片 基因芯片
蛋白芯片(Protein Chips)
高通量微阵列蛋白分析方法
微阵列芯片 （Microarray） 微型实验室芯片 (Lab-on-a-chip) 液体芯片 (Liquichip)
（二）、生物芯片分类及应用
Lab-on-a-chip
微型实验室芯片是通过在芯片上刻成微流路径从而将涉及生物检测的主要步骤—样品准备/生化反应/结果检测—整合在一张芯片上。
D
P
非接触式点样： synQUAD Technology
Œ
Aspirate and Print for Making Arrays
Characteristics of synQUAD Technology
Wide dispense range Low nanoliter to high microliter Excellent linearity Precise and accurate CV’s typically less than 10% Precision less than 5% Non-contact dispense mechanism Easier mechanical alignment (384, 1536,…) “On-the-fly” printing possible Capable of dispensing onto membranes or slides Multiple liquid handling modes Aspirate/Dispense Continuous Reagent Dispensing
细胞因子芯片
细胞因子芯片细胞因子芯片（cytokine chip）是一种用于检测和分析细胞因子的微芯片技术。
细胞因子是由多种细胞合成和释放的一类分子信号物质，它们在生物体内起着重要的调节和调控作用。
细胞因子芯片通过高通量和高灵敏度的方法，可以同时检测和分析多种细胞因子，从而帮助科研人员更全面地了解和研究细胞因子在生物体内的功能和调控机制。
细胞因子芯片采用了微阵列（microarray）技术，即在微米尺度上将多个探针固定在芯片表面。
这些探针可以是抗体、寡核苷酸或其他与细胞因子结合的分子。
当样品中存在细胞因子时，它们会与芯片表面的相应探针结合，形成特异性的信号。
通过检测和分析这些信号，可以确定样品中细胞因子的种类和浓度。
细胞因子芯片具有几个优点。
首先，它可以实现高通量的分析，即可以同时检测和分析多个细胞因子。
这对于研究细胞因子的相互作用和调控网络非常有帮助。
其次，细胞因子芯片具有高灵敏度和高选择性，可以在样品中检测到非常低浓度的细胞因子。
这对于疾病的早期诊断和治疗有着重要意义。
此外，细胞因子芯片还可以实现实时和动态的监测，可以观察到细胞因子在不同时间点和条件下的变化情况。
细胞因子芯片在生物医学研究和临床应用中有着广泛的应用前景。
一方面，它可以帮助科研人员更全面地了解和研究细胞因子在人体内的功能和调控机制。
例如，在免疫学研究中，细胞因子芯片可以用于研究免疫细胞之间的相互作用和信号传导机制，以及免疫反应的调控和调节机制。
另一方面，细胞因子芯片可以应用于临床诊断和治疗。
例如，在癌症研究中，细胞因子芯片可以用于早期癌症的诊断和预测，以及癌症治疗效果的评估。
此外，细胞因子芯片还可以用于监测炎症和感染等疾病的进展和治疗效果。
尽管细胞因子芯片在细胞因子研究和应用中具有许多优势，但也面临一些挑战和限制。
首先，细胞因子芯片的制备和操作技术相对复杂，需要较高的实验技术和设备支持。
其次，细胞因子芯片对于样品的预处理和操作要求较高，需要对样品进行处理和纯化，以消除可能干扰细胞因子分析的物质。
snp array检测原理
snp array检测原理
snp（single nucleotide polymorphism）array是一种用于检测基
因组中单核苷酸多态性的技术。
其基本原理是通过比较个体之间的DNA序列差异来检测特定的单核苷酸变异。
首先，对待检测的基因组进行DNA提取，并产生大量的
DNA片段。
然后，使用PCR（聚合酶链反应）扩增这些DNA 片段，以增加其数量。
接下来，使用snp array芯片来检测这些扩增的DNA片段中的SNP位点。
snp array芯片上包含了大量已知的SNP标记位点，每个位点上可能有不同的等位基因。
这些位点上的等位基因可能与特定疾病、特征或药物反应相关。
将扩增的DNA片段与snp array芯片上的探针进行杂交反应。
探针与芯片上的位点上的目标DNA序列互补配对。
如果样品
中的DNA序列与探针上的序列完全匹配，就会发生探针与目
标DNA的特异性结合。
然后，通过检测和分析探针与目标DNA的配对情况，来确定
待检测的基因组中的SNP位点的等位基因情况。
这可以通过
测量芯片上的标记物的荧光强度来实现。
不同的等位基因可能具有不同的荧光信号。
最后，通过比较待测个体之间的SNP位点的等位基因组合，
可以检测到个体之间的遗传差异。
这些差异可能与疾病易感性、药物反应性等相关。
总之，snp array检测原理是利用芯片上的探针与待检测基因组中的DNA序列进行特异性结合，并通过测量芯片上标记物的荧光强度来确定SNP位点的等位基因情况，从而检测个体之间的遗传差异。
PCRArray技术原理详细介绍
PCRArray技术原理详细介绍PCR Array 技术原理：PCR Arrays是分析一组特定基因表达的可靠工具，引物经过优化。
每个96孔板、384孔板PCR Array都包含SYBR® Green优化的引物分析，可对相关的通路或疾病相关的基因进行细致的研究，并含有相应的RNA、DNA质量控制。
PCR Arrays也可针对您特定的研究兴趣对一些基因作定制化分析。
高品质引物设计和qPCR Master mix使PCRArray可在统一的循环条件下同时扩增96或384个不同的基因特异性产物。
PCR Arrays进行的基因表达分析具有real-time PCR的灵敏度和微阵列的多基因检测能力。
这种整合使PCR Array具有高特异性和扩增效率，可获得准确的SYBR® Green real-time PCR结果。
PCR芯片在任何研究实验室都易于使用。
PCR Arrays具有足够高的敏感度，可使用从常规样本（0.1–5 µg RNA）、FFPE样本和小样本（1–100 ng RNA）制备的RNA。
PCR Array 性能优势：灵敏度：每个芯片使用至少1 ng或至多5 µg总RNA可获得高于80%的阳性信号率，即使细胞中细胞因子的表达量很低，25 ng总RNA的阳性率也>80%。
重复性：图为对比不同研究人员在间隔3个月的时间下使用不同批次的Human Drug Metabolism PCR Arrays芯片所得到的重复结果，计算两次CT值结果的相关系数，分别为0.995 +0.001和 0.998 +0.000。
特异性：PCR Array体系使用高品质RNA，可在预期位置形成单条带，无引物二聚体或其他二级产物，由此可获得高度准确的real-time PCR结果。
统一的PCR扩增效率：对多种样本的多个基因进行准确的基因表达比较，需要PCR芯片技术具有统一的PCR扩增效率。
pcr微通道生物芯片制备
pcr微通道生物芯片制备
PCR微通道生物芯片（PCR Microchannel Array，PMAC）是由美国微视科技（MicroVision）发明的最新一代高灵敏性微流控PCR检测技术。
其主要由微滴发生器部件、预混合液储存器、微通道PCR位点部件以及检测仪构成。
PMAC与传统PCR技术相比，有着许多优点：一是它可以在短时间内对大量序列进行检测，具有高灵敏性和重复性检测；二是PMAC的灵敏度极高，可以探测到只有少量基因片
段的基因；三是它有框架反应，可以有效提高检测效率；四是它不需要喷射装置，可以在
实验室做微量检测；五是高通量检测，可以快速、准确地检测出病毒甚至癌症抑制剂等复
杂和难测基因。
PMAC制备步骤：①根据检测建立序列，位点数和材料尺寸；②膜材料预处理，贴附测序探针；③制备预混合液，按照实验方案把样本加入混合液；④将全部液体液体灌注到PCR芯片的微通道中；⑤用微发射器加入反应液，进行PCR反应；⑥检测结果并记录或打
印图形。
最后，从环境、测序速率和实验经济性等方面考虑，PMAC不仅在各种基因检测上表现出极高的效率，而且对于复杂序列的检测表现也出色。
该技术的强大功能使其为科学研究、医疗诊断和药物研究等领域带来了巨大的帮助。
基因芯片实验原理及方法
基因芯片(Gene Chip,DNA Chip)，又称DNA微阵列(DNA Micorarray)，是指按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。
在一定条件下，载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。
如果把样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号。
详细实验方法∙基因芯片实验原理与方法实验材料∙组织或细胞样本试剂、试剂盒∙Oligo-dT (T15) - Roche∙dNTPs∙RNasin∙Superscript II∙Cot-1 DNA∙EDTA∙NaOH∙Tris仪器、耗材∙扫描仪：ScanArray 3000∙图像处理软件：Genepix 3.0∙Cartesian 7500点样仪∙硅烷化玻片∙PCR仪器∙Scan Microarray一、目的本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。
了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。
基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被首次提出，其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要，可以说，人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因，而对深人研究基因突变和基因表达的有效方法的需求又是促进基因芯片技术发展的动力。
由于基因芯片高速度、高通量、集约化和低成本的特点，基诞生以来就受到科学界的广泛关注，正如晶体管电路向集成电路发展的经历一样，分子生物学技术的集成化正在使生命科学的研究和应用发生一场革命。
根据固定在芯片载体上的核酸分子的不同，基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核昔酸芯片等。
寡核昔酸芯片主要基于光引导聚合技术，该技术是Affymetrix公司开发的专利技术，由于其突出的优点，正得到越来越广泛的应用。
二、原理基因芯片(Gene Chip,DNA Chip)，又称DNA微阵列(DNA Micorarray)，是指按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。
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Cell Surface Markers PCR Array
Catalog No.PAHS-055A（人）
细胞表面标志物PCR芯片
The Human Cell Surface Markers RT²Profiler™PCR Array profiles the expression of84genes relevant to research at the cell surface marker level.These markers have been used in studies including:1)determination of the extent of leukocyte infiltration among cancer tissues;2)characterization of cell populations isolated from patients with chronic inflammatory diseases such as atherosclerosis,asthma,inflammatory bowel disease,and arthritis;3)determination of T-and B-cell lineage and clonality;4) characterization of leukocyte populations for use in the prognosis of disease stage and progression;and5)analysis of the composition of immune infiltrates and their association with organ ing real-time PCR,you can easily and reliably analyze expression of a focused panel of genes related to cell surface markers with this array.
细胞表面标记物RT²Profiler™PCR Array可以同时检测84个研究中至关重要的细胞表面标志物的表达水平。
这些标志物主要用于以下研究：1）确定肿瘤组织中白细胞浸润的程度；2）对于慢性炎症病人，如动脉粥样硬化、哮喘、炎症性肠病和关节炎等，可通过细胞表面标记物对细胞分型；3）确定T细胞和B细胞谱系和克隆系；4）对白细胞进行分型，从而预测疾病的发展阶段及进展；5）分析免疫浸润的原理和与器官排斥反应的关系。
利用实时定量PCR，你可以方便并且可信地对与TNF信号相关的基因进行同时检测。
B-cell Surface Markers:
Activated B-cells:CD28,CD38,CD69,CD80,CD83,CD86,DPP4,FCER2,IL2RA,TNFRSF8,CD70(TNFSF7).
Mature B-cells:CD19,CD22,CD24,CD37,CD40,CD72,CD74,CD79A,CD79B,CR2,IL1R2,ITGA2,ITGA3,MS4A1,ST6GAL1.
Other B-cell Surface Markers:CD1C,CHST10,HLA-A,HLA-DRA,NT5E.
T-cell surface markers:
Cytotoxic T-cells:CD8A,CD8B1.
Helper T-cells:CD4.
Activated T-cells:ALCAM,CD2,CD38,CD40LG,CD69,CD83,CD96,CTLA4,DPP4,HLA-DRA,IL12RB1,IL2RA,ITGA1,TNFRSF4,TNFRSF8,CD70(TNFSF7).
Other T-cell Surface Markers:CD160,CD28,CD37,CD3D,CD3G,CD3Z,CD5,CD6,CD7,FAS,KLRB1,KLRD1,NT5E,ST6GAL1.
Natural Killer(NK)Cell Surface Markers:CD2,CD244,CD3Z,CD7,CD96,CHST10,IL12RB1,KLRB1,KLRC1,KLRD1,NCAM1.
Monocyte and Macrophage Cell Surface Markers:
Activated Macrophages:CD69,ENG,FCER2,IL2RA.
Other Monocyte and Macrophage Surface Markers:C5R1,CD163,CD40,CD63,CD74,CD86,CHST10,CSF1R,DPP4,FCGR1A,HLA-DRA,ICAM2,IL1R2, ITGA1,ITGA2,S100A8,TNFRSF8,CD70(TNFSF7).
Endothelial Cell Surface Markers:ENG,ICAM2,NOS3,PECAM1,SELP,TEK,VCAM1,VWF.
Smooth Muscle Cell Surface Markers:MYH10,MYH9,MYOCD.
Dendritic Cell Surface Markers:CD1A,CD209,CD40,CD83,CD86,CR2,FCER2.
Mast Cell Surface Markers:C5R1,FCER1A,FCER2,TPSAB1.
Fibroblast(Stromal)Surface Markers:ALCAM,COL1A1,COL1A2.
Epithelial Cell Surface Markers:CD1D,KRT18,KRT5,KRT8,TACSTD1.
Adipocyte Surface Markers:RETN.
B细胞表面标记物、T细胞表面标记物、自然杀伤细胞表面标记物、单核细胞和巨噬细胞表面标记物、内皮细胞表面标记物、平滑肌细胞表面标记物、树突状细胞表面标记物、肥大细胞表面标记物、成纤维细胞（基质细胞）表面标记物、表皮细胞表面标记物、脂肪细胞标记物。