分子生物学每章作业及其答案
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二简答题-1)DNA的一级、二级和三级结构;2)原核和真核生物基因组的特点;3) DNA 的半保留复制机制;4) DNA复制精确性的分子机理;
(1)DNA一级结构:是指4种核苷酸的连接及排列顺序,表示了该DNA分子的化学构成。DNA的二级结构:是指两条脱氧多核苷酸链反向平行盘绕所形成的双螺旋结构。
DNA的三级结构:是指DNA中单链与双链、双链之间的相互作用形成的三链或四链结构。
(2) 原核生物基因组的特点:基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。只有一个复制起点。有操纵子结构。编码蛋白质的结构基因是单拷贝的,但rRNA基因往往是多拷贝的。非编码的DNA所占比例很少,类似病毒基因组。基因组DNA具有多调控区。与真核生物类似,具有可移动的DNA序列
真核生物基因组的特点:1.基因组较庞大:2.大量重复顺序3.大部分为非编码序列4. 转录产物是单顺反子5.真核基因是断裂基因,有内含子结构6.存在大量的顺式作用元件。7.存在大量的DNA多态性8.具有端粒结构
3) DNA的半保留复制机制;
DNA在进行复制的时候链间氢键断裂,双链解旋分开,每条链作为模板在其上合成互补链,经过一系列酶(DNA聚合酶、解旋酶、链接酶等)的作用生成两个新的DNA分子。子代DNA分子其中的一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种方式称半保留复制。
4) DNA复制精确性的分子机理;
1.严格的碱基配对
2.DNA聚合酶对碱基的选择
3.DNA聚合酶的校读功能
4.修复(错配修复、切除修复、重组修复、直接修复、SOS)
第三章生物信息的传递(上)—从DNA到RNA
简答题-1)原核与真核生物mRNA的区别;2)RNA转录的基本过程及加工方式;3)列举几个RNA转录的顺式作用元件(如TATA box)及其作用方式。
(1)原核生物mRNA的特征
1) 半衰期短:转录与翻译同步,翻译没有完成可能mRNA 5’端就开始降解;
2) 多顺反子形式:操纵子-功能相关的几个基因一起转录为一条mRNA分子;
3) 无5’帽结构,3’没有或很短polyA尾巴
真核生物mRNA的特征
mRNA前体长5-10倍以上,加工为成熟mRNA的结构与DNA序列有差异:
1) 5’端存在帽结构2) 3’端polyA尾巴
真核细胞mRNA结构为:5’cap-5’UTR-coding region-3’UTR-polyA tail,病毒mRNA 亦是单顺反子结构。UTR为DNA转录没有加工的不翻译区。
2)RNA转录的基本过程及加工方式
转录的基本过程包括模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止。
1.模板识别阶段主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。转录起始前,启动子附近的DNA双链分开形成转录泡以促使底物核糖核苷酸与模板DNA的碱基配对。
2、转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生。
3、转录起始后直到形成9个核苷酸短链是通过启动子阶段,通过启动子的时间越短,该基因转录起始的频率也越高。
4、RNA聚合酶离开启动子,沿DNA链移动并使新生RNA链不断伸长的过程就是转录的延伸。
5、当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,这就是转录的终止。
加工方式:切除内含子(剪接)、加帽、加尾等,以及甲基化、巯基化、异戊烯化、假尿苷形成.
3)列举几个RNA转录的顺式作用元件(如TATA box)及其作用方式
INR: 转录起始+1上游邻近序列, 确定真正的起始位点, 一致序列为PyAPyTCPyPyPy(HIV-1、ML病毒);
TATA box:在起始位点+1上游约20-30bp处, TATA盒结合RNA聚合酶参与转录起始.动物和低等真核中的一致序列为TATA(A/T)A;
第四章生物信息的传递(下)—从mRNA到蛋白质
简答题-1)原核生物蛋白质合成机制;
机制:1.氨基酸的活化;2.翻译的起始;3.肽键的生成;4.肽链的终止;5.蛋白质前体的加工;6.蛋白质的折叠;7.蛋白质合成的抑制剂;
遗传密码的破译及其特征;
破译:以均聚物,随机共聚物和特定序列的共聚物为模板指导多肽的合成;2.核糖体结合技术。
特征:1.密码的连续性;2.密码的简并性;3.密码的通用性与特殊性4;密码子与反密码子的相互作用。
原核与真核生物核糖体的组成与结构;
原核生物核糖体的组成:由50S和30S大小亚基组成,大亚基含23S rRNA、5S rRNA和蛋白质,小亚基含16S rRNA和蛋白质。
真核生物核糖体的组成:由60S和40S大小亚基组成,大亚基为28S、5.8S和5S rRNA,小亚基为18S rRNA,及多种蛋白质.
蛋白质合成后转运的分子机制。
1.线粒体蛋白质的跨膜运输:(通过线粒体膜的蛋白质是在合成以后再运转的。这个过程有如下特征:①通过线粒体膜的蛋白质在运转之前大多数以前体形式存在,它由成熟蛋白质和N 端延伸出的一段前导肽(leader peptide)共同组成。②蛋白质通过线粒体内膜的运转是一种需能过程;③蛋白质通过线粒体膜运转时,首先由外膜上的Tom受体复合蛋白识别与Hsp70或MSF等分子伴侣相结合的待运转多肽,通过Tom和Tim组成的膜通道进入线粒体内腔。)
2.叶绿体蛋白质的跨膜运输:(叶绿体定位信号肽一般有两个部分,第一部分决定该蛋白质能否进入叶绿体基质,第二部分决定该蛋白能否进入类囊体。在这一模型中,蛋白质运转是在翻译后进行的,在运转过程中没有蛋白质的合成。)
第五章分子生物学研究法(上)—DNA、RNA及蛋白质操作技术
简答题
1)重组DNA的基本操作技术(DNA片段切割-载体连接-转化-筛选);
DNA分子的切割与连接、核酸分子杂交、凝胶电泳、细胞转化、核酸序列分析以及基因的人工合成、定点突变和PCR扩增等。
2)PCR原理及其应用;