用ImagePro Plus 分析免疫组化图片(1)
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用Image-Pro Plus ( IPP ) 分析免疫
组化图片
精品课件
1.免疫组化图片分析原理
根据染色染料颜色的深浅及分布面积大小来确 定目标蛋白的量。
染色区域分布面积与目标蛋白量成正比。 染色的颜色深浅与目标蛋白量的定量关系符合
朗伯-比尔定律，是对数关系。
精品课件
1.1光密度与灰度—迷惑人的不同概念
随机选取几个区域 但是能作到“随机”吗？
精品课件
2.3 ImagePro plus的独特优势。
准确地按照一个颜色标准来选取一个AOI (area of interesting ) 。测量这个区域 的光密度参数。
精品课件
使用IPP比前两种方法更好。
在查到文献中使用的图象分析方法是前两种的 时候，完全可以用IPP的分析测量来代替。结 果更加准确。不必照搬文献上所述的方法。随 着计算机技术的发展，以后也许还会有更好的 图象分析方法及图象分析程序的。
方法与光密度相同，故也用OD值。这个OD与前面的OD 又有不同的意义。它就是荧光的光密度。反映着荧光 物质的多少。
精品课件
处理照片时用的却是灰度
各种图象被拍摄成照片进行数字图象处理时， 计算机是对照片的灰度进行测量和计算的。为 了定量物质含量，最后还是需要转换为OD值来 表示。
所以对免疫组化照片的分析结果应该是一个OD 值，光密度。不应该是灰度。
IOD对整张图片的面积作平均。 IOD对特定组织区域的面积作平均。 IOD对显色的组织区域作平均。
精品课件
对整张图片区域进行平均的情况比 较少，这张图片中黄色的IOD值主 要来自于中间一块区域内。
精品课件
右上角的空白区面积应该扣除。
精品课件
也许应是这个特定的组织区域
精品课件
这个区域是特定染色的区域。在计算 IOD时能同时计算出来，但以此为平均 面积往往并不正确。
精品课件
对单个细胞的分析比较
单个细胞的IOD 单个细胞的mean density 照片上各细胞IOD或mean density的平均值
精品课件
边界不清晰的贴壁细胞
整张图片IOD/细胞个数（照片中细胞数目不多， 数起来不费事）
精品课件
细胞簇的分析
测量整张图片黄色区域IOD。 再测量细胞分布的区域面积 area。 对染成蓝色的细胞核计数，作为细胞数N。 以 IOD /（N ）作为统计指标。或IOD/area
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1.3比较两张照片的染色物质量的差别
两张照片染色深度一样，染色面积大的质量大
照片A
照片B
精品课件
比较两张照片的染色物质量的差别
两张照片染色区域面积相同，染色深的质量大
照片A
照片B
精品课件
这回该怎么看？
A的颜色深，面积小。 B的颜色浅，面积大。
照片A
百度文库
照片B
精品课件
比较体积！
IODdensi(txy, y)ds
精品课件
1.2定量分析的指标： IOD ( Integrated option density ) 与Mean Density
将图片上各点的光密度值累加起来，得到IOD。 此值与目标物质的总量成正比。
IOD值除以有效目标分布区域的面积，得到 Mean density，此值反映了目标物质的单位面 积浓度。对样品照片进行数字图像分析比较时， 就是比较它们之间的平均光密度值的大小。
准确地说，是对免疫组化照片的特定染色区域 的灰度进行分析从而测量出组织切片的光密度 值。
精品课件
用标准样品才能把OD值 与样品量关联到一起
OD值是一个没有单位的相对值。 使用酶标仪或分光光度计时要作标准曲线。
对电泳条带进行定量分析时一样要作标准曲 线。 电泳条带照片的灰度值与样品量的关系为指 数函数。在把灰度值转换成OD值时，用一个 标准点进行定量分析是不准确的。多个标准 点的标准曲线亦有很大误差，因此只能说是 半定量分析。
理论上OD值是从零到无穷大。实际应用中，OD值的范围常用 0-2.0或者0-3.0。
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用OD值是正确的
分光光度计与酶标仪的测定值是OD值 透射的显微镜图象上的光强度要用OD值 蛋白电泳条带的测量也是OD值。 萤光显微镜及萤光分光光度计的测量值是萤光强度
(Fluorescence intensity) 用EB染色的DNA凝胶电泳条带也是萤光强度，但处理
光密度：吸收光的物质的光学密度。 （optical density,就是常说的OD值）光密度 值是直接与染色物质的量相关的。
灰度：灰是不够黑，是反射亮度的单位。电子 照片上像素的亮度称为灰度。
精品课件
Gray: between white and blEaxacmpkle:
1.The bright value on display screen is gray value.
S
densi(tmy ea)nIOD/ area
光 密 度
精品课件
尺寸
1.4 实际图片的情况很复杂的。
阳性样品染色深，阴性样品染色浅。
精品课件
直接比较整张图片的IOD 等于在比较整张图片的mean density
精品课件
哪一个染色物更多？
染色区域颜色深度接近，染色面积有差异。
精品课件
使用不同的area会得到不同的结论 要结合切片情况来判断。
其测定原理有点象分光光度计，直接测定切片 的整体光密度。
可以根据照片上象素点的亮度来区分测定区域 其缺陷是显而易见的。复染上的其他颜色的染
料也会产生光密度吸收，导致严重的干扰。
精品课件
2.2 抽样测量光密度
在彩色电子图片上选取目标颜色区域，抽样测 量这些小区域的灰度值，取其平均值作为比较 染色深浅的指标。
2.The dark value on a white paper is also the gray value.
255
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Optical Density: 吸光物质的光学密度.
被测物质的量越多，光密度(OD值)越高，透射出的光越少，反 映在照片上就越黑。
OD值与物质的量直接相关，数字图象上点的灰度值与对应物质 OD值成对数关系，符合朗伯-比尔定律。
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2.从图片上分析光密度方法
的技术进步
简单测量整张照片的光密度值。 在照片上随机选取数个区域，测量其光密度值。
计算其平均值作为整张照片的光密度值。 在照片上准确选择被染上染料的特定颜色的区
域，计算这些区域的累积光密度值（IOD）， 进而计算统计区域的平均光密度值。
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2.1测定整张照片的光密度-图象分析 仪
组化图片
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1.免疫组化图片分析原理
根据染色染料颜色的深浅及分布面积大小来确 定目标蛋白的量。
染色区域分布面积与目标蛋白量成正比。 染色的颜色深浅与目标蛋白量的定量关系符合
朗伯-比尔定律，是对数关系。
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1.1光密度与灰度—迷惑人的不同概念
随机选取几个区域 但是能作到“随机”吗？
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2.3 ImagePro plus的独特优势。
准确地按照一个颜色标准来选取一个AOI (area of interesting ) 。测量这个区域 的光密度参数。
精品课件
使用IPP比前两种方法更好。
在查到文献中使用的图象分析方法是前两种的 时候，完全可以用IPP的分析测量来代替。结 果更加准确。不必照搬文献上所述的方法。随 着计算机技术的发展，以后也许还会有更好的 图象分析方法及图象分析程序的。
方法与光密度相同，故也用OD值。这个OD与前面的OD 又有不同的意义。它就是荧光的光密度。反映着荧光 物质的多少。
精品课件
处理照片时用的却是灰度
各种图象被拍摄成照片进行数字图象处理时， 计算机是对照片的灰度进行测量和计算的。为 了定量物质含量，最后还是需要转换为OD值来 表示。
所以对免疫组化照片的分析结果应该是一个OD 值，光密度。不应该是灰度。
IOD对整张图片的面积作平均。 IOD对特定组织区域的面积作平均。 IOD对显色的组织区域作平均。
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对整张图片区域进行平均的情况比 较少，这张图片中黄色的IOD值主 要来自于中间一块区域内。
精品课件
右上角的空白区面积应该扣除。
精品课件
也许应是这个特定的组织区域
精品课件
这个区域是特定染色的区域。在计算 IOD时能同时计算出来，但以此为平均 面积往往并不正确。
精品课件
对单个细胞的分析比较
单个细胞的IOD 单个细胞的mean density 照片上各细胞IOD或mean density的平均值
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边界不清晰的贴壁细胞
整张图片IOD/细胞个数（照片中细胞数目不多， 数起来不费事）
精品课件
细胞簇的分析
测量整张图片黄色区域IOD。 再测量细胞分布的区域面积 area。 对染成蓝色的细胞核计数，作为细胞数N。 以 IOD /（N ）作为统计指标。或IOD/area
精品课件
1.3比较两张照片的染色物质量的差别
两张照片染色深度一样，染色面积大的质量大
照片A
照片B
精品课件
比较两张照片的染色物质量的差别
两张照片染色区域面积相同，染色深的质量大
照片A
照片B
精品课件
这回该怎么看？
A的颜色深，面积小。 B的颜色浅，面积大。
照片A
百度文库
照片B
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比较体积！
IODdensi(txy, y)ds
精品课件
1.2定量分析的指标： IOD ( Integrated option density ) 与Mean Density
将图片上各点的光密度值累加起来，得到IOD。 此值与目标物质的总量成正比。
IOD值除以有效目标分布区域的面积，得到 Mean density，此值反映了目标物质的单位面 积浓度。对样品照片进行数字图像分析比较时， 就是比较它们之间的平均光密度值的大小。
准确地说，是对免疫组化照片的特定染色区域 的灰度进行分析从而测量出组织切片的光密度 值。
精品课件
用标准样品才能把OD值 与样品量关联到一起
OD值是一个没有单位的相对值。 使用酶标仪或分光光度计时要作标准曲线。
对电泳条带进行定量分析时一样要作标准曲 线。 电泳条带照片的灰度值与样品量的关系为指 数函数。在把灰度值转换成OD值时，用一个 标准点进行定量分析是不准确的。多个标准 点的标准曲线亦有很大误差，因此只能说是 半定量分析。
理论上OD值是从零到无穷大。实际应用中，OD值的范围常用 0-2.0或者0-3.0。
精品课件
用OD值是正确的
分光光度计与酶标仪的测定值是OD值 透射的显微镜图象上的光强度要用OD值 蛋白电泳条带的测量也是OD值。 萤光显微镜及萤光分光光度计的测量值是萤光强度
(Fluorescence intensity) 用EB染色的DNA凝胶电泳条带也是萤光强度，但处理
光密度：吸收光的物质的光学密度。 （optical density,就是常说的OD值）光密度 值是直接与染色物质的量相关的。
灰度：灰是不够黑，是反射亮度的单位。电子 照片上像素的亮度称为灰度。
精品课件
Gray: between white and blEaxacmpkle:
1.The bright value on display screen is gray value.
S
densi(tmy ea)nIOD/ area
光 密 度
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尺寸
1.4 实际图片的情况很复杂的。
阳性样品染色深，阴性样品染色浅。
精品课件
直接比较整张图片的IOD 等于在比较整张图片的mean density
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哪一个染色物更多？
染色区域颜色深度接近，染色面积有差异。
精品课件
使用不同的area会得到不同的结论 要结合切片情况来判断。
其测定原理有点象分光光度计，直接测定切片 的整体光密度。
可以根据照片上象素点的亮度来区分测定区域 其缺陷是显而易见的。复染上的其他颜色的染
料也会产生光密度吸收，导致严重的干扰。
精品课件
2.2 抽样测量光密度
在彩色电子图片上选取目标颜色区域，抽样测 量这些小区域的灰度值，取其平均值作为比较 染色深浅的指标。
2.The dark value on a white paper is also the gray value.
255
精品课件
Optical Density: 吸光物质的光学密度.
被测物质的量越多，光密度(OD值)越高，透射出的光越少，反 映在照片上就越黑。
OD值与物质的量直接相关，数字图象上点的灰度值与对应物质 OD值成对数关系，符合朗伯-比尔定律。
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2.从图片上分析光密度方法
的技术进步
简单测量整张照片的光密度值。 在照片上随机选取数个区域，测量其光密度值。
计算其平均值作为整张照片的光密度值。 在照片上准确选择被染上染料的特定颜色的区
域，计算这些区域的累积光密度值（IOD）， 进而计算统计区域的平均光密度值。
精品课件
2.1测定整张照片的光密度-图象分析 仪