动物进化的进化树物种关系与进化历程
五个手指地进化解释
如果要分析人类为什么有五个手指，我们首先要从进化树中去寻找，最先出现五指结构的人类进化祖先。
请看下图的较详细的进化树图（见图一）。
仔细看看就不难看出进化树的红色枝叶部分的动物都具有较相似的前肢结构。
图一然后看看红色枝干中，最早出现前肢状结构的物种，我们就基本找到了问题的关键——两栖类。
两栖类起源于古总鳍鱼（见图二）。
最早的两栖类是尖头类（鱼头螈为代表种），距今3.5亿年前的泥盆纪晚期。
由于泥盆季晚期出现了季节性干旱，陆地面积更为扩大。
河流与湖泊周期性的变成污浊的池塘和广阔的泥滩。
同时海平面下降，使得一些鱼类只能生活在沿岸边留存的水塘或潮湿的岸边。
在如此恶劣的条件下，只有能行气呼吸、具“肺”（鳔）并有较强的偶鳍能在陆上爬行的种类才能更好地适应这种恶劣的环境条件。
在泥盆纪的鱼类中只有肺鱼和总鳍鱼能行“肺”呼吸，但肺鱼的偶鳍细弱，为双列式的，不能适应在陆上爬行。
只有总鳍鱼类，除具“肺”能行气呼吸外，尚具有类似陆生脊椎动物附肢的偶鳍，具有强壮的肌肉和类似陆生脊椎动物四肢的骨骼结构。
当然，总鳍鱼的鳍作为陆上活动的运动器官不是很有效的，但终究能使其从一个干涸的池塘爬行到另外有水的池塘。
气呼吸可使其在少氧的混浊的池塘和短时间越过陆地而存活。
缺乏这些适应能力的鱼类就可能被自然选择所淘汰。
因此，由逐渐适应和相对快速的一系列进化改变，具气呼吸与肉鳍的鱼越来越适应陆地生活，最后，某些总鳍鱼类进化成第一个类群的两栖动物，它们的鳍进化为陆生五指型附肢。
图二图三随后由两栖类进化出的所有物种，都带有五指前肢的特征。
部分物种有所简化，出现了四指、蹄等等。
但是仍然具有明显的相关特征。
（后附图供参考）当然，找到了五指前肢在物种进化历程中的出现点，和来龙去脉也许并不能然各位看官感到满足。
如果，您一定要问我，为什么不进化出三指前肢、四指前肢、六指前肢。
我想应该有下几点是较合理的推测。
1、减法论：从总鳍鱼骨骼数量较多的前肢，进化为两栖类较为典型的五指前肢，我们的老祖先们，进行了一段时间的减法练习。
动物的进化和物种形成
生态学研究：关注动物与环境的关系，如适应性、竞争、共生等
跨学科研究：结合生态学和行为学，研究动物进化与环境变化的相互作用
行为学研究：关注动物行为与进化的关系，如觅食、繁殖、迁徙等
汇报人：XXX
感谢您的观看
协同进化对物种形成的影响：促进物种多样性、增加物种适应性
动物进化的证据
化石记录：保存了动物进化的历史，如恐龙化石、始祖鸟化石等
分子生物学证据：通过比较不同物种的基因序列，了解动物进化的关系，如人类和黑猩猩的基因相似度达到98%
生态学证据：通过研究动物的生活环境和习性，了解动物进化的原因，如鸟类的飞行、哺乳动物的哺乳等
奥陶纪：生物种类进一步丰富，出现脊椎动物
泥盆纪：鱼类和两栖类动物繁盛，出现爬行动物
三叠纪：恐龙和翼龙等爬行动物崛起，哺乳动物开始出现
白垩纪：恐龙和翼龙等爬行动物达到鼎盛，哺乳动物继续发展
第四纪：哺乳动物成为地球的主宰，人类出现
物种形成：在适应环境和生态位分化的过程中，动物逐渐形成新的物种
适应环境：动物通过改变自身形态、生理和行为来适应环境变化
生态位分化：动物在进化过程中，逐渐形成不同的生态位，以避免竞争
例子：如鸟类的飞行能力、哺乳动物的恒温能力等都是适应环境的结果，而狮子和豹子在生态位上的分化则避免了直接的竞争。
现代动物的特点：高度适应环境，具有复杂的生理结构和行为模式
物种形成：地理隔离、生殖隔离等因素导致新物种的产生
演化：从简单到复杂的生物形态演变
汇报人：XXX
动物的进化和物种形成
目录
动物进化的历程
物种形成的机制
动物进化的证据
动物进化的意义
动物进化的未来研究
动物进化的历程
原始海洋生物：如海绵、水母等
构建生物进化树的方法比较
极为详细的建树方法，新手入门推荐生物进化树的构建目录前言 (2)一、 NCBI (6)二、 Mega (9)三、 DNAMAN (15)四、DNAStar (18)五、 Bio edit (21)前言1．背景资料进化树(evolutionary tree)又名系统树(phylogenetie tree)进化树，用来表示物种间亲缘关系远近的树状结构图。
在进化树中，各个分类单元（物种）依据进化关系的远近，被安放在树状图表上的不同位置。
所以，进化树简单地表示生物的进化历程和亲缘关系。
已发展成为多学科(包括生命科学中的进化论、遗传学、分类学、分子生物学、生物化学、生物物理学和生态学,又包括数学中的概率统计、图论、计算机科学和群论)交叉形成的一个边缘领域。
归纳总结生物进化的总趋势有以下几类：①结构上：由简单到复杂②生活环境上：由水生到陆生③进化水平上：由低等到高等一般来说，进化树是一个二叉树。
它由很多的分支和节点构成。
根据位置的不同，进化树的节点分为外部节点和内部节点，外部节点就是我们要进行分类的分类单元（物种）。
而物种之间的进化关系则用节点之间的连线表示。
内部节点表示进化事件发生的地方，或表示分类单元进化的祖先。
在同一个进化树中，分类单元的选择应当标准一致。
进化树上不同节点之间的连线称为分支，其中有一端与叶子节点相连的分支称为外枝，不与叶子节点相连的分支称为内枝。
进化树一般有两种：有根树和无根树。
有根树有一个鲜明的特征，那就是它有一个唯一的根节点。
这个根节点可以理解为所有其他节点的共同祖先。
所以，有根树能可以准确地反映各个物种的进化顺序，从根节点进化到任何其他节点只有能有一条惟一的路径。
无根树则不能直接给出根节点，无根树只反映各个不同节点之间的进化关系的远近，没有物种如何进化的过程。
但是，我们可以在无根树种指派根节点，从而找出各个物种的进化路径。
无根树有根树放射树分子进化树(以分子数据为依据构建的进化树)不仅精确地反映物种间或群体间在进化过程中发生的极微细的遗传变异(小至一个氨基酸或一个核昔酸差异)，而且借助化石提供的大分子类群的分化年代能定量地估计出物种间或群体间的分化年代，这对进化论的研究而言无疑是一场革命。
动物的进化发展和进化机制
生物多样性的意义：维持生 态平衡、提供资源、促进科 学研究
对人类的影响
医学研究：动 物进化为人类 医学研究提供 了重要参考
生态平衡：动 物进化对维持 生态平衡具有 重要作用
生物技术：动 物进化为人类 生物技术发展 提供了借鉴
环境保护：动 物进化对环境 保护具有重要 意义，如物种 多样性的保护
对地球生态系统的作用
面的改变
例子：白化病、色盲等 遗传病都是由基因突变
引起的
物种隔离
定义：不同物种之间无法进行生殖繁殖或其后代繁殖能力弱的现象 原因：地理隔离、生态隔离、行为隔离、生殖隔离等 影响：导致物种分化，形成新的物种 与进化的关系：物种隔离是进化的重要机制之一，有助于物种适应环境变化，提高生存能力。
协同进化
智能发展：动 物将进化出更 高的智能，如 更好的学习能 力、更强的解 决问题能力等
5 动物进化的意义
生物多样性的起源与保护
生物多样性的定义：生物种 类的多样性、基因的多样性、 生态系统的多样性
生物多样性的起源：物种形 成、物种分化、物种灭绝
生物多样性的保护：建立自 然保护区、保护濒危物种、 恢复生态系统
化石记录：化石 证据显示，不同 物种在进化过程 中存在过渡形态， 如恐龙到鸟类的 过渡形态
胚胎发育的证据
胚胎发育过程中，某 些器官和结构的出现 顺序与进化历程相符
胚胎发育过程中，某 些基因的表达与进化
历程相符
胚胎发育过程中，某 些器官和结构的形态
与进化历程相符
胚胎发育过程中，某 些蛋白质的合成与进
化历程相符
4 动物进化的趋势
适应性进化
自然选择： 适者生存， 不适者被淘
汰
物种形成： 新物种的产 生和旧物种
分子进化学中的进化树构建方法
分子进化学中的进化树构建方法随着科技的进步和生物技术的广泛应用，分子生物学的研究逐渐深入，成为生物学、生物技术和医药学等领域的重要研究方向。
而分子进化学作为分子生物学中的一个重要分支，研究物种间的分子差异和进化关系。
其中，构建进化树是分子进化学研究中的重要工作，下面我们来了解一下进化树构建的方法。
一、进化树的基本概念进化树是描述不同物种、不同基因或不同蛋白质之间进化关系的图形化表示。
在进化树中，每一个分支代表了一个物种、一个基因或一个蛋白质序列，分支的长度表示了物种、基因或序列的进化距离，而进化距离则是衡量不同物种或不同序列之间关系的基本参数。
而构建进化树的过程则是根据分子序列数据的重构得到物种或基因的进化树。
二、进化树的构建方法构建进化树有多种方法，主要有距离矩阵法、系统发育学法、最大似然法和贝叶斯法等。
下面我们逐一介绍这些方法的基本原理。
1.距离矩阵法距离矩阵法是最早采用的一种构建进化树的方法，它基于序列之间的距离矩阵计算和聚类方法来得到进化树。
该方法首先计算所有分子序列之间的距离（距离可由序列相似性计算得出），然后根据聚类方法构建进化树。
聚类方法包括单链接聚类、均链接聚类和最大链接聚类等。
距离矩阵法的优点是构建速度快、适用性广，但是对于高变异的序列来说，该方法可能会产生误导性的结果。
2.系统发育学法系统发育学法是基于系统学原理，采用系统发生学的理论和方法来构建进化树。
该方法主要是通过分子序列的相似性构建系统发育分析矩阵，然后利用不同的计算方法（如UPGMA、NJ和ML等）推断进化树。
系统发育学法的优点是能够更准确地反映分子序列的演化，并且可以通过不同的方法比较结果，但是该方法需要大量的计算资源和长时间的计算。
3.最大似然法最大似然法是一种统计学上的方法，通过最大化序列数据与观测数据的相似度，来推断出最可能的进化树。
该方法需要整合进化模型和数据，然后计算不同进化模型下数据的似然函数，最终选择似然度最大的进化树。
系统发育进化树作用-概述说明以及解释
系统发育进化树作用-概述说明以及解释1.引言1.1 概述系统发育进化树是生物学领域一个重要的概念和工具。
它通过对物种之间的遗传关系和演化历史进行系统分析和分类，构建出一颗树状结构，用以揭示物种之间的进化关系。
这种树状结构可以帮助我们更好地理解物种之间的演化历史以及它们之间的亲缘关系。
系统发育进化树的构建方法经历了长期的发展和完善，目前主要包括分子系统学和形态系统学两种方法。
分子系统学通过比对物种之间的DNA 或蛋白质序列，来推断它们之间的遗传关系；而形态系统学则是通过对物种的形态、生理学特征等进行比较和分类。
这些方法的结合可以更准确地揭示物种之间的演化关系。
系统发育进化树在生物学领域有着广泛的应用，不仅可以帮助我们解答物种起源、分化等基础科学问题，还可以指导生物分类学、生物地理学等实际应用领域的研究。
因此，系统发育进化树的建立和应用具有重要的理论和实践价值。
1.2 文章结构本文将分为三个主要部分来探讨系统发育进化树的作用。
首先，我们将在引言部分对本文的内容进行概述，介绍系统发育的基本概念以及文章的目的。
接下来，在正文部分，我们将详细介绍系统发育和进化树的构建方法，以及系统发育进化树在生物学研究中的应用。
最后，在结论部分，我们将强调系统发育进化树的重要性，并展望未来其在科学研究中的发展前景。
通过以上结构的安排，我们希望读者能够更全面地了解系统发育进化树的作用及其在生物学领域的重要性。
1.3 目的在本文中，我们的主要目的是探讨系统发育进化树在生物学研究中的重要作用。
我们将首先介绍系统发育的概念，探讨进化树的构建方法，然后详细讨论系统发育进化树在生物学领域中的应用。
通过对这些内容的分析和探讨，我们旨在揭示系统发育进化树在生物学研究中的重要性，为今后更深入的研究提供参考和启示。
同时，我们也将展望未来系统发育进化树在生物学领域的发展潜力，希望能为相关研究提供一定的借鉴和指导。
最终，我们将对本文进行总结，强调系统发育进化树在生物学研究中的重要性和必要性。
phylophlan构建进化树的原理
一、phylophlan的介绍phylophlan是一种用于建立进化树的工具，它利用基因组学数据来推断生物进化关系的工具。
通过比较不同物种的基因组序列，phylophlan可以帮助研究者理解生物物种之间的遗传差异和亲缘关系。
二、phylophlan的原理1. 建立物种基因组数据库phylophlan需要建立一个包含各种物种基因组数据的数据库。
这些基因组数据可以来自公共数据库或者用户自己的实验数据。
这些基因组数据包含了各种物种的DNA序列信息。
2. 提取共同的基因片段phylophlan会从不同物种的基因组数据中提取共同的基因片段。
这些共同的基因片段通常被称为核心基因组。
这些核心基因组在不同物种中存在，并且具有一定的保守性，可以在物种之间进行比较和分析。
3. 构建物种间的进化模型接下来，phylophlan利用这些核心基因组数据来构建不同物种之间的进化模型。
进化模型可以反映不同物种之间的亲缘关系和演化历史。
phylophlan利用这些进化模型来推断物种之间的共同祖先和演化路径。
4. 构建进化树phylophlan根据构建的进化模型，利用一定的算法来建立进化树。
进化树可以显示物种之间的亲缘关系和演化路径。
通过进化树，研究者可以更好地理解不同物种之间的遗传差异和演化关系。
三、应用举例1. 物种分类和演化研究phylophlan可以帮助生物学家更好地理解不同物种之间的遗传差异和亲缘关系，为物种分类和演化研究提供重要的工具和数据支持。
2. 药物研发和生物技术应用在药物研发和生物技术应用领域，phylophlan可以帮助科研人员对不同物种的基因组进行比较分析，找到相关的基因和信号通路，为药物研发和生物技术的应用提供重要的参考和支持。
四、结论phylophlan作为一种用于建立进化树的工具，可以帮助生物学家更好地理解不同物种之间的遗传差异和亲缘关系，为物种分类和演化研究提供重要的工具和数据支持。
phylophlan在药物研发和生物技术应用领域也具有重要的应用前景。
新人教版八年级生物下册第二节生物进化的历程ppt课件
键环节，即（
）
A:水生到陆生
B：简单到复杂
A
C：陆地到空中 D：单细胞到多细胞
9.脊椎动物进化的历程大致是（
）C
A：鱼类 两栖类 爬行类 鸟类
哺乳类
B：鱼类
爬行类 两栖类 鸟类
哺乳类
鸟类
C：鱼类 两栖类 爬行类
哺乳类
鸟类
D：鱼类 爬行类 两栖类
哺乳类
10.下列不是生物进化历程总趋势之一的是 （ ）
在生物“进化树”上，鸟类位于鱼类的上面，在形态结构方面，鱼 类结构较简单，适应环境变化的能力弱；鸟类比鱼类结构复杂，具有能 维持体温恒定的完善的血液循环系统等，适应环境变化能力强。在生活 环境方面，鱼类适于水中生活，鸟类适于陆地、空中生活。因此，鸟类 比鱼类更高等。
①无脊椎动物 ②原始单细胞动物 ③脊椎动物
A： ① ② ③ B： ① ③ ② C： ② ① ③ D： ③ ① ②
5.在动物进化的历程中，原始节肢动物出现后，它们有外骨骼和分节的附肢，这说明节肢
动物（ ）
B
①对陆地环境的适应能力较强 ②对阴湿的环境适应能力强 ③脱离了陆生环境 ④脱 离了水生环境 ⑤结构更加复杂 ⑥结构更加简单
始祖鸟化石复原图
辽 西 鸟 化 石
辽 西 鸟 复 原 图
辽 西 鸟 骨 骼
孔 子 鸟 复 原 图
②鸟类的进化过程（一类生物进化为另一类生物）：
某种爬行动物 辽西鸟 始祖鸟
孔子鸟
结论：越简单、越低等的生物的化石总是出现在越古老
的地层里，越复杂、越高等的生物的化石总是出现在越新 里。这说明生物是进化发展的。
（3）尝试写出植物的进化历程和动物的进化历程。
植物的进化历程：原始生命
进化树分析
二、系统发育树重建分析步骤
多序列比对（自动比对，手工校正） 确定替换模型 建立进化树 进化树评估
2.1多序列比对
序列多重比对的结果反映了序列之间的相似性， 为系统发育树的构建提供了有价值的信息。为提 高模型估算的精确性，不仅需要选择合适的比对 方法和参数，还需要对后续比对结果进行合理修 正，从中提取有意义的数据集用于系统发育树的 构建。
分子系统发育分析
一、分子进化的基本理论
系统发育（或种系发育、系统发生，phylogeny） 是指生物形成或进化的历史。 系统发育学(phylogenetics)研究物种之间的进化 关系，其基本思想是比较物种的特征，并认为特 征相似的物种在遗传学上接近。
一、分子进化的基本理论
系统发育学是进化生物学的一个重要研究领域， 系统发育分析早在达尔文时代就已经开始。从那 时起，科学家们就开始寻找物种的源头，分析物 种之间的进化关系，给各个物种分门别类。
一、分子进化的基本理论
所有的生物都可以追溯到共同的祖先，生物的产 生和分化就像树一样地生长、分叉，以树的形式 来表示生物之间的进化关系是非常自然的事。可 以用树中的各个分支点代表一类生物起源的相对 时间，两个分支点靠得越近，则对应的两群生物 进化关系越密切。
经典系统发育学
经典系统发育学 主要是物理或表型特征 如生物体的大小、颜色、触角个数 通过表型比较来推断生物体的基因型 (genotype)，研究物种之间的进化关系
系统发育树：三种类型
分支图
Taxon B Taxon C Taxon A Taxon D
1 1
进化树
6
时间度量树
Taxon B Taxon B Taxon C Taxon A Taxon D
系统进化树的评估标准
系统进化树的评估标准系统进化树是一种生物或物种演化关系的图形表示，它反映了生物之间的亲缘关系和演化历程。
在对系统进化树进行评估时，需要考虑多个方面，包括拓扑结构、统计学评估、生物学意义、计算复杂性以及可视化效果。
1.拓扑结构拓扑结构是系统进化树的重要特征之一，它反映了物种之间的演化关系。
评估系统进化树的拓扑结构时，需要考虑以下因素：（1）分支的长度和粗细：分支长度和粗细应该能够反映物种之间的亲缘关系和演化历程。
较长的分支意味着较近的亲缘关系，而较粗的分支则表示较多的遗传信息。
（2）分支的支撑度：分支的支撑度是指该分支在系统进化树中的出现频率。
较高的支撑度意味着该分支更加可靠和稳定。
（3）节点的支持度：节点是分支的交汇点，节点的支持度反映了该节点在系统进化树中的可靠性和稳定性。
较高的支持度意味着该节点更加可信。
（4）分支模式的一致性：如果不同数据集或不同方法得到的系统进化树具有相似的分支模式，那么说明该系统进化树更加可靠和稳定。
2.统计学评估统计学评估是系统进化树评估的重要方面之一，它可以帮助我们了解系统进化树的可靠性和稳定性。
评估时需要考虑以下因素：（1）统计量的置信区间：统计量的置信区间反映了估计值的精确度和可靠性。
较窄的置信区间意味着估计值更加精确和可靠。
（2）似然值或信息准则：似然值或信息准则是一种衡量模型适应性的指标，它可以用于评估不同模型的选择和参数设置是否合理。
较高的似然值或较低的信息准则意味着模型更加合理和适应。
3.生物学意义系统进化树具有重要的生物学意义，因为它可以反映物种之间的亲缘关系和演化历程。
评估系统进化树的生物学意义时，需要考虑以下因素：（1）演化解释的合理性：系统进化树应该能够合理地解释物种之间的亲缘关系和演化历程。
如果系统进化树的解释与已知的生物学知识相悖，那么它可能存在错误或偏差。
（2）分支模式的生物学意义：系统进化树的分支模式应该能够反映物种之间的生物学特征和演化规律。
手把手教你构建系统进化树
生物多样性的研究
生物多样性起源
系统进化树有助于研究生物多样性的起源和演化，了解不同物种的起源和演化历程。
生物多样性分布
通过分析不同地区或生态系统中的系统进化树，可以研究生物多样性的地理分布和生态分布。
生物地理学的研究
物种分布
系统进化树揭示了物种的分布特征和演化历程，有助于研究物种分布的规律和机制。
蛋白质结构预测
结合蛋白质结构预测技术， 从蛋白质结构层面揭示物 种间的进化关系。
新的解读方法的研究
树的可视化
研究如何将进化树以更直观、易懂的方式呈现， 帮助用户更好地理解物种间的进化关系。
树的意义
探索进化树在生物多样性保护、生物进化研究等 方面的实际应用价值。
树的可解释性
研究如何将进化树的构建过程和结果以可解释的 方式呈现，提高用户对进化树的理解和信任。
03 常用的构建系统进化树的 方法
Neighbor-Joining方法
总结词
基于距离矩阵的构建方法
详细描述
Neighbor-Joining方法是一种基于距离矩阵的进化树构建方法，通过比较不同物种之 间的进化距离，将距离最近的两个物种先聚类在一起，然后逐步添加其他物种，直到所
有物种都被包含在进化树中。
树的构建
树构建
详细描述：在完成序列比对后，可以使用各 种算法和软件工具来构建系统进化树。常用 的方法有距离矩阵法和最大似然法等。这些 方法基于不同的原理和假设，可以根据具体 情况选择适合的方法。构建系统进化树的过 程通常需要多次迭代和优化，以确保树的准
确性和可靠性。
树的优化
优化调整
VS
详细描述：在初步构建出系统进化树 后，需要进行优化调整。这一步骤包 括对树的布局、分支长度和节点标注 等进行调整，以提高树的易读性和可 解释性。此外，还可以使用各种软件 工具和可视化技术来增强树的可视化 效果和交互性。
中点法 进化树
中点法进化树在生物学研究中，中点法是一种常用的方法，它可以帮助我们更好地理解生物进化的过程。
本文将详细介绍中点法进化树的基本原理、操作步骤和注意事项，以便读者更好地掌握这一方法。
一、基本原理中点法进化树是一种基于生物样本的分析方法，通过比较不同物种之间的遗传差异，可以构建出进化树。
进化树是一种可视化工具，它可以帮助我们直观地展示生物进化的历程，从而更好地理解生物的起源、演化和发展。
二、操作步骤1.选择样本：选择多个物种的生物样本，以便进行遗传分析。
样本应该具有较高的遗传多样性，以确保分析结果的准确性。
2.提取DNA：对样本进行DNA提取，为后续的遗传分析提供基础。
3.基因测序：利用基因测序技术对DNA进行测序，获得基因序列数据。
4.数据整理：将基因序列数据整理成表格，以便进行后续的分析。
5.构建进化树：利用中点法算法，根据基因序列数据构建进化树。
算**自动识别不同物种之间的进化关系，并生成可视化的进化树。
三、注意事项1.样本选择：选择具有代表性的样本，以确保遗传分析的准确性。
2.数据整理：确保数据准确无误，以便进行后续的分析。
3.算法选择：选择适合的算法，以确保进化树的准确性。
中点法算法是一种常用的算法，可以有效地识别不同物种之间的进化关系。
4.可视化：进化树的可视化非常重要，它可以帮助我们更好地理解生物进化的历程。
因此，应该选择高质量的可视化工具，以确保进化树的清晰度和美观度。
总之，中点法进化树是一种非常实用的方法，可以帮助我们更好地理解生物进化的过程。
通过选择合适的样本、提取DNA、基因测序、数据整理和构建进化树等步骤，我们可以得到准确的进化树结果。
为了确保结果的准确性和美观度，需要注意样本选择、数据整理、算法选择和可视化等方面的问题。
最后，建议在实际应用中结合具体情况进行调整和改进，以更好地满足实际需求。
人教版八年级下册生物第七单元第三章第二节生物进化的历程及答案
人教版八年级下册生物第二节生物进化的历程一、能力提升1.下列关于化石的叙述,错误的是()A.化石是经过若干万年的复杂变化形成的B.化石是指古代生物的遗体、遗物或生活痕迹C.通过对不同年代化石的比较,可推断出生物进化的趋势D.和鸟类的化石相比,恐龙的化石出现在较晚近的地层中2.在下图所示的地层中发现了A、B两种生物化石,下列观点正确的是()A.生物A是由生物B进化来的B.生物A可能比生物B结构复杂C.生物A的个数比生物B多D.生物A比生物B体型大3.下列四类植物中,对水环境依赖程度最高的是()A.藻类植物B.苔藓植物C.蕨类植物D.种子植物4.科学家利用分子生物学技术比较不同生物同一种蛋白质的氨基酸序列发现,生物之间蛋白质分子的相似性越多,其亲缘关系就()A.越远B.越近C.较近D.较远5.比较下列数据,亲缘关系最近的一组生物是()A.人与黑猩猩B.黑猩猩与猕猴C.黑猩猩与向日葵D.果蝇与向日葵6.右图中的甲、乙、丙、丁四个地层是按照地质年代由古老到晚近的顺序划分的。
古生物学家发现:甲地层只有水生生物化石;乙地层的水生生物化石占多数;丙和丁地层的陆生生物化石越来越多。
由此看出生物在生活环境方面的进化趋势是()A.从水生到陆生B.从简单到复杂C.从低等到高等D.从陆生到水生7.右图表示植物进化的大致过程,图中①②③依次代表()A.藻类植物、蕨类植物、被子植物B.蕨类植物、藻类植物、被子植物C.被子植物、藻类植物、蕨类植物D.藻类植物、被子植物、蕨类植物8.依据生物进化的大致历程推测,最先在原始海洋中出现的是()A.原始的单细胞生物B.原始的线形动物C.原始的苔藓植物D.原始的蕨类植物9.下列植物按照从高等到低等的顺序排列正确的是()A.①②③④B.①②④③C.④③②①D.③④②①10.“国际黑猩猩基因测序与分析联盟”研究发现,黑猩猩与人类在基因上的相似程度达到90%以上。
这个研究成果可以直接说明()A.生物具有遗传和变异的特性B.人类和黑猩猩有较近的亲缘关系C.人类和黑猩猩的共同祖先是森林古猿D.人类是黑猩猩经过漫长的年代进化而来的11.下面是小勇同学学习了《生物进化的历程》后总结的观点,小旭同学说其中有一项是错误的,你认为错误的是()A.生物进化的最直接证据是同源器官的发现B.原始生命诞生的标志是原始新陈代谢和个体增殖C.地层中不同地质年代的化石揭示了生物进化的顺序D.米勒的实验可以说明原始地球能形成构成生物体的有机物12.下图为部分脊椎动物的进化树,下列有关叙述错误的是()A.①是鱼类,身体多呈流线型,可减小游泳时水的阻力B.②是哺乳动物,体表被毛,胎生、哺乳C.③是两栖动物,皮肤裸露且能分泌黏液,可进行气体交换D.④是鸟类,能用肺和气囊进行气体交换,适于飞行★13.“最早的鱼儿怎么没有下巴/最早的鸟儿怎么嘴长牙/最早登陆的鱼儿怎么没有腿……”,这是摘自诗歌《化石吟》的片段,以下说法错误的是()A.化石是研究生物进化的重要证据B.“最早的鸟儿”比“最早的鱼儿”先出现C.两栖动物是水生向陆生进化的过渡类型D.根据“最早的鸟儿”的特征,说明鸟类可能由爬行动物进化而来14.右图表示几类植物的进化关系,下列叙述错误的是()A.最低等的植物类群是甲B.乙和丙都是由甲进化来的C.乙的结构比丙复杂D.戊最有可能是水生的15.“进化树”可以直观地表示生物之间的亲缘关系和进化历程。
系统进化树的这些知识
系统进化树的这些知识，你都Get了吗？系统进化树（Phylogenetic tree，又称为系统发生树/系统发育树/系统演化树/进化树等），是用来表示物种间亲缘关系远近的树状结构图。
在系统进化树中，物种按照亲缘关系远近被安放在树状结构的不同位置，因而，进化树可以简单地表示生物的进化过程和亲缘关系。
自达尔文时期，很多生物学家就希望用一棵树的形式描述地球上所有生命的进化历程。
早期的系统发育研究主要基于生物的表型特征，通过表型比较来研究物种之间的进化关系，然而，利用表型特征进行系统发育分析存在很大的局限性，1965[1]年，Linus Pauling等提出了分子进化理论，基于分子特性（DNA、RNA和蛋白质分子），推断物种之间的系统发生关系，由于核苷酸和氨基酸序列中含有生物进化历史的全部信息，因此利用该方法构建的系统进化树更为准确。
图1 系统进化树理论上，一个DNA序列在物种形成或者基因复制时，会分成两个子序列，因而系统进化树是一般是二叉树，由许多节点和分支构成。
根据位置的不同，节点分为外部节点和内部节点，外部节点代表最终分类，可以是物种、群体，或者DNA、RAN、蛋白质等，内部节点表示该分支可能的祖先节点，不同节点间的连线则称为分支。
根据是否指定根节点，将系统发育树分为有根树和无根树。
有根树绘制过程中需要引入外群，因而具有一个根节点，作为树中所有物种（样本）的共同祖先节点，可以判断演化方向，反映分类单元间的进化关系，外群与进化树中其他物种（样本）的亲缘关系不宜太近，也不能太远，一般构建种内不同品种/亚种间的进化树，外群应选择同属内其他物种，构建属内不同种间的进化树，外群应选择科内其他属物种。
无根树绘制过程中并未引入外群，因而没有根节点，无法判断演化方向，只能表明不同单元之间的分类关系。
图2 无根树[2]（左）和有根树[3]（右）此外，系统进化树还可以根据分支长度是否具有意义分为标度树和非标度树。
标度树的分支长度表示变化的程度，而非标度树的分支只表示进化关系，支长无意义。
一文读懂进化树（图文详解）
⼀⽂读懂进化树（图⽂详解）⽬录Content⼀、什么是进化树⼆、进化树的构成1. 根 (Root)2. 结点 (Node)3. 进化⽀ (Branch)4. 外群5. 进化分⽀长度6. 距离标尺7. Bootstrap value三、进化树评估1. Bootstrap检验2. 重复取样值3. Bootstrap value 阈值4. Bootstrap value 与分⽀四、⼏种进化树图1.经典树图（Traditional）Rectangle Tree2.圈图（Circle Tree）3.辐射树（Radiation Tree）什么是进化树系统发育进化树 (Phylogenetic tree)：⼀般也叫系统进化树，进化树。
它可以利⽤树状分⽀图形来表⽰各物种或基因间的亲缘关系。
建进化树的过程，⽤术语讲：分⽀系统发育分析 (Molecular phylogenetic analysis)：是⽤来研究物种或序列进化和系统分类的⼀种⽅法。
⼀般研究对象是碱基序列或氨基酸序列，通过数理统计算法来计算⽣物间进化关系。
最后，根据计算结果，可视化为系统进化树。
进化树的构成我们模拟⼀个项⽬，使⽤⼈和⿏的各两个基因做进化树，结果如下：可以看到上⾯有⼀堆标注，下⾯来看看它们代表什么意义：1. 根 (所有分⽀的共同祖先叫做根根据有⽆根可分为：有根树：上⾯的图就是有根树，可以从树中找到共同的祖先。
⽆根树：顾名思义，没有根，也就找不到共同的祖先。
⽐如后边会提到的 Straight Tree2. 结点 (每个结点代表⼀个分类单元，物种上可以是属，种群等，基因上可以是基因家族，同源物等。
这⾥需要注意，有的⼈会把 node 翻译为节点，但是节点与结点有着不⼀样的含义：节点：通常被认为是⼀个实体，⽐如互联⽹上的每台计算机，蛋⽩互作⽹络的每个蛋⽩质。
结点：只是⼀个交叉点，指交汇点，并不代表⼀个实体或事物但是，也有另外⼀种解释：这种解释将 node 分为外部节点与内部节点：外部节点⼜叫叶节点，也就是最外层的⼈基因1，⼈基因2等，代表参与分析的序列样本内部节点，也就是我们使⽤蓝⾊标注的位置，代表假定祖先。
系统发生进化树-概述说明以及解释
系统发生进化树-概述说明以及解释1.引言1.1 概述系统发生是一门研究生物学和进化的学科，它通过对基因组数据的分析和比较，揭示了物种之间的进化关系和演化过程。
系统发生学的基本原理是基因组的变化遵循着大自然的规律，通过建立进化树来描述不同物种之间的关系和进化路径。
本文将探讨系统发生的概念、应用以及与进化树的关系，希望能够为读者带来对于系统发生学的深入理解和认识。
文章结构部分的内容可以包括对整篇文章的章节划分和每个章节的主要内容进行简要介绍。
文章结构部分如下：1.2 文章结构本文将分为引言、正文和结论三个部分。
在引言部分，将首先概述系统发生进化树的概念和意义，然后介绍本文的结构和撰写目的。
正文部分将分为三个子章节，分别探讨系统发生的概念、系统发生的应用以及系统发生与进化树之间的关系。
在结论部分，将对系统发生的重要性进行总结，并展望系统发生的未来发展。
最后，对本文的主要观点进行总结。
1.3 目的：本文旨在探讨系统发生进化树的概念，揭示其在生物学、计算机科学和其他领域的重要应用。
通过对系统发生的概念和应用进行深入分析，以及系统发生与进化树之间的关系进行探讨，旨在帮助读者更好地理解系统发生的意义和作用。
同时，本文也将展望系统发生未来的发展方向，探讨其在未来可能的应用领域，以期为相关领域的学者和从业人员提供有益的参考和启发。
通过本文的阐述，我们希望读者对系统发生进化树有一个全面而深入的了解，从而促进相关领域的学术和技术进步。
2.正文2.1 系统发生的概念系统发生的概念是指生物学中一种通过对生物进化的研究来推断物种之间的关系的方法。
系统发生利用了生物学中的各种数据，比如形态、细胞学、遗传学数据等，来构建物种之间的进化树。
这种方法通过研究不同种群之间的共同祖先和后代之间的分歧，揭示了不同物种之间的关联和进化路径。
系统发生的研究方法和技术不断更新，为研究者提供了更精确、更全面的物种进化信息，对生物学领域的研究有着重要的意义。
生物进化树的解读
生物进化树是一种用于展示生物系统进化关系的重要工具，它能够直观地呈现出生物之间的亲缘关系和演化历程。
通过解读生物进化树，我们可以更好地理解生物多样性和演化过程，以及物种之间的亲缘关系和遗传关系。
首先，生物进化树可以帮助我们了解生物的演化历程。
在进化树上，不同的生物种类被表示为不同的分支，而这些分支之间的距离和形态则反映了它们之间的遗传差异和演化历程。
通过对进化树的解读，我们可以了解不同物种的起源和演化过程，以及它们在生物系统中的地位和作用。
其次，生物进化树可以帮助我们理解物种之间的亲缘关系。
在进化树上，同一分支上的生物种类具有较近的亲缘关系，而不同分支上的生物种类则具有较远的亲缘关系。
通过对这些关系进行解读，我们可以了解不同物种之间的遗传差异和共同祖先，以及它们在演化过程中的演变方向和方式。
此外，生物进化树还可以帮助我们了解物种的多样性。
在进化树上，不同的分支代表了不同的物种或种群，而这些物种或种群之间的差异则反映了生物多样性的丰富性。
通过对这些差异进行解读，我们可以了解不同物种或种群的特征和适应环境的能力，以及它们在生态系统中的地位和作用。
最后，生物进化树还可以为我们提供一些生物学和生态学方面的启示。
例如，通过对进化树的解读，我们可以了解物种演化的趋势和规律，以及环境变化对物种演化的影响。
此外，进化树还可以为我们提供一些生物学和生态学方面的研究思路和方法，例如通过比较不同物种或种群的遗传差异来研究它们的遗传结构和适应能力。
总之，生物进化树是一种非常有用的工具，可以帮助我们更好地了解生物多样性和演化过程，以及物种之间的亲缘关系和遗传关系。
通过解读生物进化树，我们可以更好地认识和理解生物世界，并为生物学和生态学研究提供重要的启示和思路。
基因进化树意义
基因进化树意义基因进化树是基于生物学家对生物基因及其关系的研究，根据相同基因序列和序列间不同之处构建起来的一种树状结构。
这种结构以浅色为根，深色为枝，树干上的节点代表基因的共同祖先，树枝代表了基因的演化历程和进化关系，而叶子则表示基因的存在状态。
基因进化树的意义是研究基因进化关系的重要工具之一，也是生物分类学、演化生物学、种群遗传学、分子进化、生物系统学等领域的基础。
首先，基因进化树可以揭示生物进化的关系。
生物进化受到环境和基因的影响，进而在漫长的进化史中形成了多样化的生物形态。
基因序列是生物进化最为基础的组成部分之一。
基因在不同物种间的变异、突变以及分离等环节，携带的信息也有所不同，经过多次变异和选择后，就能由单个基因发展演化而来。
因此，基因进化树可以反映不同物种之间的进化关系和演化过程，有助于逐一还原和分析生物种类的演化流程。
其次，基因进化树的研究可以帮助构建基因家族。
同一个种类的生物，都有着相似或相同的基因家族类型，这些基因家族的产生和演化的关系都通过基因进化树来反映。
对研究生物家族的形成过程，有助于加深对某些生物的组成和属性的科学认知，使人们对生命的认识更加深化。
第三，基因进化树还能研究群体遗传学与进化过程。
进入二十一世纪，随着生物技术的发展，基因序列比对和分析技术也相应的发展和进步了。
基因进化树可以揭示不同种群间的遗传标记，推断种群遗传结构和演化路线，更好地解决种群遗传学和进化生物学中的问题。
例如，在生命树中，通过基因进化树的系统发育分析，可以推断在哺乳动物之类的动物中，不同物种的共同祖先、进化路线和演化模式，以及不同物种间的生物地理分布等。
第四，基因进化树还可以揭示分类学。
现代分类学起源于卡尔·林奈的工作，随后发展成为若干分类学派别，旨在将不同物种归类为不同的种类，同时研究物种间的相似性和差异性。
基因进化树将不同物种的基因序列联系起来，有助于将不同的有机体归类和分析它们之间的关系，以更好地反映生命的本质和分类学。
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动物进化的进化树物种关系与进化历程
动物进化的进化树物种关系与进化历程是生物学中一个重要的研究领域。
通过构建进化树，我们可以了解不同物种之间的亲缘关系以及它们的进化历程。
本文将介绍动物进化的进化树、物种关系以及动物的进化历程。
一、动物进化的进化树
动物进化的进化树是基于其遗传信息和形态特征的演化关系图。
这些树状图显示了不同物种之间的演化关系。
在进化树中，物种之间的分支表示它们之间的共同祖先，而分支之间的距离则表示演化的时间跨度。
进化树的分支越长，物种与物种之间的差距越大。
以鸟类为例，鸟类的进化树可以追溯到恐龙的共同祖先。
在进化树上，鸟类与鳄鱼和恐龙有共同的祖先，但与哺乳动物和爬行动物的共同祖先则远离。
这样的进化树分析可以帮助我们了解不同动物类群之间的演化关系，以及它们的共同起源。
二、物种关系
通过进化树的构建，我们可以了解不同物种之间的亲缘关系。
物种之间的亲缘关系可以分为近缘种和远缘种。
近缘种指的是演化树上靠近的分支，它们有着较近的共同祖先，并且在进化过程中的分化时间相对较近。
例如，猫科动物中的狮子和老虎就是近缘种，它们有着共同的祖先，并且在较短的时间内分化出了不同的物种。
远缘种指的是演化树上较远的分支，它们之间的共同祖先更为遥远，并且在进化历程中的分化时间相对较长。
例如，鸟类和爬行动物就是
远缘种，它们的共同祖先可以追溯到几亿年前。
三、动物的进化历程
动物的进化历程是指动物从原始形态到现代多样化形态的演化过程。
通过对化石记录和遗传分析的研究，可以揭示动物的进化历程。
例如，鸟类进化历程的研究表明，鸟类起源于具有带状牙齿的小型
肉食恐龙。
随着时间的推移，恐龙逐渐演化出了羽毛和飞行的适应性
特征，并形成了现代鸟类。
这一进化历程的揭示对于我们理解鸟类的
起源和多样化具有重要意义。
另一个例子是人类的进化历程。
通过研究早期人类化石和现代人类
的遗传信息，科学家可以了解人类从灵长类到现代人的演化历程。
人
类的进化历程包括了步行直立、大脑发展以及文化与语言能力的演化。
总结：
动物进化的进化树、物种关系与进化历程是研究动物演化的重要内容。
通过构建进化树，我们可以了解不同物种之间的亲缘关系以及它
们的共同起源。
物种关系包括近缘种和远缘种，它们之间的演化关系
程度不同。
动物的进化历程通过研究化石记录和遗传信息等多种方法
揭示。
了解动物的进化历程有助于我们更好地理解生物多样性的形成
和发展。