基因在大肠杆菌、酵母中的高效的表达技巧
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第四章基因在大肠杆菌、酵母中的高效的表达
前言
基因表达是指结构基因在生物体中的转录、翻译以及所有加工过程。
基因工程主要目标之一是生产常规方法难以生产的大量蛋白质产物—即实现基因的高效表达。
基因高效表达研究是指外源基因在某种细胞中的表达活动,即剪切下外源基因片段,拼接到另一个基因表达体系中,使其能获得原生物活性又可高产的表达产物。
第一节基因的表达系统与表达策略
一、最佳的基因表达体系:
⑴目的基因的表达产量高;
⑵表达产物稳定;
⑶生物活性高;
⑷表达产物容易分离纯化。
二、宿主细胞的选择
(一)适合目的基因表达的宿主细胞的要求:
1、容易获得较高浓度的细胞;
2、能利用易得廉价原料;
3、不致病、不产生内毒素;
4、发热量低、需氧低、适当的发酵温度和细胞形态;
5、容易进行代谢调控;
6、容易进行DNA重组技术操作;
7、产物的产量、产率高,
8、产物容易提取纯化。
(二)宿主细胞分为两大类:
1、原核细胞:常用有大肠杆菌、枯草芽胞杆菌、链霉菌等;
2、真核细胞:常用有酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞等。
大肠杆菌目前仍是基因工程研究中采用最多的原核表达体系。
优越性:
①对大肠杆菌的基础生物学、分子遗传学等背景知识和基因表达的调控机理已有了深刻了解。
②有各类菌株和载体系列。
③目前以实现多种基因的高效表达。表达基因产物形式多样:细胞内不溶性表达(包含体)、细胞内可溶性表达、细胞周质表达等。
④易培养,成本低。
缺点:
①大肠杆菌中的表达不存在信号肽,产品多为胞内产物,提取困难。
②因分泌能力不足,真核蛋白质常形成不溶性的包含体,表达产物需经变性复性才恢复活性。
③蛋白质不能糖基化。产物蛋白质N端多余一个蛋氨酸残基。
④其内毒素很难除去。
酵母酵母菌是研究基因表达最有效的单细胞真核微生物。其基因组小,世代时间短,有单倍体双倍体两种形式,繁殖迅速,无毒性。能外分泌,产物可糖基化。已有不少真核基因成功表达。
三、根据表达蛋白用途选择基因的表达策略
1.生物化学和分子生物学研究
2.表达蛋白质用作抗原
3.结构研究
真核基因表达的特点
●一条成熟的mRNA只能翻译成一条多肽,不存在象原核生物那样的多基因操纵子模
式;
●基因转录调节区很大,而且往往远离启动子达几百个甚至上千个碱基,它们并不直
接影响RNA聚合酶与启动子区的结合,而是通过改变基因5’上游区DNA的构型来影响RNA聚合酶与启动子区的结合;
●mRNA合成后穿过核膜进入细胞质中后才进行翻译工作,而且通常都有复杂的成熟
和剪接过程;
●基因的启动子区和原核基因差异很大,而且有增强子序列存在。
原核体系中表达真核基因的困难
1.细菌的RNA聚合酶不识别真核基因的启动子;
2.真核基因转录的mRNA在原核细胞中不能结合到核糖体上;
3.真核基因一般含有内含子,而原核细胞没有象真核细胞那样的转录后加工系统,所
以mRNA中的内含子部分不能被切除,不能形成成熟的RNA,也就不能表达出有功能的真核蛋白;
4.表达的真核蛋白在原核细胞中很不稳定,容易被细菌蛋白酶降解破坏。
四、构建表达载体的策略
⑴将真核基因克隆到一个强大的原核启动子和SD序列的下游,使得真核基因处于原核调控体系中。
⑵采用真核基因的cDNA序列作为构建表达载体的目的基因,这样就解决了原核细胞没有RNA剪接功能的问题。
⑶构建载体时,将真核基因插在几个原核密码子的后面,翻译后就得到了原核多肽和真核多肽的融合蛋白,这样就可以避免被原核蛋白酶的识别和降解,最后可以将融合多肽切除。
第二节基因在大肠杆菌中的高效表达
一、大肠杆菌表达载体的成份
⑴启动子
要求是:①强启动子②是诱导性的,如热诱导和化学诱导。
⑵转录终止子
使转录终止,增强mRNA的稳定性,提高蛋白质产物的表达水平。
尤其是将两个终止子串联,转录终止功能更强。
⑶核糖体结合位点
在转录起始位点下游的一段DNA序列(SD,5’AGGAGG3’)
(4)筛选标记基因
(5)密码子的选择
二、常见的大肠杆菌表达系统
①T7表达系统T7噬菌RNA聚合酶能选择性的激活T7噬菌体启动子的转录,其mRNA合成速率相当于大肠杆菌RNA聚合酶的5倍。
②Lac表达系统是β-半乳糖苷酶编码基因LacZ的转录的调控序列,该启动子可以被IPTG 诱导,所以在培养基中加入该安慰诱导物就可以诱导目的基因的表达。
③Tac表达系统是一种由Lac和Trp启动子杂合而成的启动子,其强度得到了很大的提高,也可被IPTG诱导表达。
④λPL表达系统是负责λDNA分子转录的启动子之一,是一种极强的启动子。
三、影响克隆基因表达效率的因素
一般而言,所用启动子的强度、DNA的转录起始序列、密码子的选择、mRNA的二级结构、转录的终止、基因的拷贝数等都会在一定程度上影响到转基因的表达。
1.启动子的结构对表达效率的影响
大多数大肠杆菌启动子都含有两种保守区,即-10区(位于转录其始位点上游5-10bp,故称为-10区,序列为5’--TATAAT)和-35区(位于转录起始位点上游25bp处,一般有10bp组成,5’-- TTGACA故称为-35区,)。当然,实际的启动子中很少具备与上述序列完全一致的区域,但是研究表明,启动子的这两个区域与上述保守序列的相似程度越高,该启动子的表达能力也就越强。另外,这两个保守区间的距离也是影响启动子强度的重要因素,即这个间距越是接近于17bp,启动子的活性就越强。
2.翻译起始序列对表达效率的影响
mRNA的有效翻译依赖于核糖体和其的稳定结合,大肠杆菌的mRNA序列中,核糖体的结合位点是起始密码子AUG和其上游的SD序列。所谓SD序列就是由Shine-Dalgarno 首先提出的一种位于位于起始密码子上游的一段保守序列,为细菌核糖体有效结合和翻译起始所必需。一般SD序列的长度约为3-9bp,位于起始密码子上游3-11碱基的位置,它与16S 核糖体RNA的3‘端互补,控制了翻译的起始。
3.启动子与克隆基因间的距离对基因表达的影响
研究表明启动子和目的基因间的距离对基因的表达效率影响很大,所以在构建新的表达载体时要考虑到这一因素的影响。另外,在克隆基因的末端要就近插入有效的终止子序列,否则会导致细胞能量的大量消耗,或是形成不应有的二级结构,最终影响的目的基因的表达效率。