第三章 酶

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生物化学第三章 酶

生物化学第三章  酶

(四)酶的比活力(比活性) • 酶的比活力是指每单位质量样品中的酶 活力,即每毫克酶蛋白中所含的活力单 位数或每千克酶蛋白中所含的Kat数。
比活力=
酶活力单位数 酶蛋白质量(mg)
• 比活力是表示酶制剂纯度的一个重要指 标,对同一种酶而言,酶的比活力越高, 纯度越高。
七、酶促反应动力学
• 酶促反应动力学主要研究酶催化的反 应速度及影响反应速度的各种因素。 • 在探讨各种因素对酶促反应速度的影 响时,通常测定其初始速度来代表酶
单纯酶 酶→ 结合酶(全酶)→ 辅助因子→ 酶蛋白 辅酶 辅基 金属离子

●酶蛋白与辅助因子单独存在时均无催化活性,二 者只有结合成完整的分子时,才具有催化活性。 ●一种酶蛋白只与一种辅酶结合,组成一种全酶, 催化一种或一类底物进行某种化学反应。 ●一种辅酶可以和多种酶蛋白结合,组成多种全酶, 分别催化不同底物进行同一类反应。
(三) 诱导契合学说-关于酶作用专一性的假说 ●1890年,Emil Fischer提出“锁钥学说” :底 物的结构和酶活性部位的结构非常吻合,就象 锁和钥匙一样,这样它们就能紧密结合形成中 间产物。
底物
+

酶 –底物复合物
●1958年,Koshland提出“诱导契合学说”: 酶活性部位的结构与底物的结构并不特别 吻合,但活性部位具有一定的柔性,当底 物与酶接近时,可以诱导酶活性中心的构 象发生改 变,使之 成为能与 底物分子 密切结合 的构象 。
促反应速度,即底物转化量 <5% 时的
反应速度。
(一)酶浓度对反应速度的影响 • 当反应系统中底物的浓度足够大时, 酶促反应速度与酶浓度成正比,即 ν =k[E]。
(二) 底物浓度对反应速度的影响

第三章 酶

第三章  酶
浓度呈正比。
(三)Km的求测方法
1. 双曲线法
2. 双倒数作图法
斜率=Km/Vmax
1.0
1 = v
Km . Vmax
1 1 + [S] Vmax
0.8
0.6
1/v
0.4
-1/Km
0.2
1/Vmax
0.0 -4 -2 0 2 4
-1
6
8
10
1/[S](1/mmol.L )
3.Hanes作图法
二、酶浓度对反应速度的影响
酶的活性中心:在酶分子上,必需基团在空 间结构上彼此靠近,形成具有特定空间结构 的区域,能与底物特异结合并将底物转化为 产物,此区域称为酶的活性中心。
活性中心内的必需基团
结合基团 与底物相结合 催化基团 催化底物转变成产物
活性中心外的必需基团 位于活性中心以外,维持酶活性中 心应有的空间构象所必需。
白结合紧密,用透析或超滤的方法不能将其除
去的称为辅基。
金属离子的作用
1.稳定酶分子构象。 2.参与催化反应或传递电子。 3.在酶与底物间起桥梁作用。
4.中和阴离子降低反应中的静电斥力。
根据金属离子与酶结合的形式不同,可将
酶分为金属酶和金属活化酶。
小分子有机物的作用
其结构中常含有维生素或维生素类物 质,以辅酶或辅基的形式参与酶的催化过
活性中心以外 的必需基团
底物
催化基团
结合基团
活性中心
第二节 酶促反应的特性与催化机制
酶与一般催化剂的共同点
只能催化热力学上允许进行的化学反应。 能缩短反应达到平衡所需的时间,而不能 改变平衡点。 对可逆反应的正反两个方向都具有的催化
作用。

生物化学 第3章 酶

生物化学 第3章 酶

生物化学第3章酶生物化学第3章酶第3章酶自学建议1.掌握酶及所有相关的概念、酶的结构与功能的关系、酶的工作原理、酶促反应动力学特点、意义及应用。

2.熟识酶的分子共同组成与酶的调节。

3.了解酶的分类与命名及酶与医学的关系。

基本知识点酶是对其特异底物起高效催化作用的蛋白质。

单纯酶是仅由氨基酸残基组成的蛋白质,融合酶除所含蛋白质部分外,还所含非蛋白质辅助因子。

辅助因子就是金属离子或小分子有机化合物,后者称作辅酶,其中与酶蛋白共价紧密结合的辅酶又称辅基。

酶分子中一些在一级结构上可能相距很远的必需基团,在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物,这一区域称为酶的活性中心。

同工酶就是指催化剂相同化学反应,酶蛋白的分子结构、化学性质乃至免疫学性质相同的一组酶,就是由相同基因编码的多肽链,或同一基因mRNA分解成的相同mrna所译者的相同多肽链共同组成的蛋白质。

酶促反应具有高效率、高度特异性和可调节性。

酶与底物诱导契合形成酶-底物复合物,通过邻近效应、定向排列、表面效应使底物容易转变成过渡态。

酶通过多元催化发挥高效催化作用。

酶促反应动力学研究影响酶促反应速率及其影响因素,后者包括底物浓度、酶浓度、温度、ph、抑制剂和激活剂等。

底物浓度对反应速率的影响可用米氏方程表示。

v?vmax[s]km?[s]其中,km为米氏常数,其值等同于反应速率为最小反应速率一半时的底物浓度,具备关键意义。

vmax和km需用米氏方程的双倒数作图去求得。

酶在拉沙泰格赖厄县ph和拉沙泰格赖厄县温度时催化活性最低,但拉沙泰格赖厄县ph和拉沙泰格赖厄县温度不是酶的特征性常数,受到许多因素的影响。

酶的抑制作用包含不可逆遏制与对称遏制两种。

对称遏制中,竞争抑制作用的表观km值减小,vmax维持不变;非竞争抑制作用的km值维持不变,vmax增大,反竞争抑制作用的km值与vmax均增大。

在机体内酶活性与含量的调节是代谢调节的重要途径。

生化第三章酶

生化第三章酶

第三章酶本章要点生物催化剂——酶:由活细胞产生的、对其底物具有高度特异性和高度催化效能的蛋白质。

一、酶的分子结构与功能1.单体酶:由单一亚基构成的酶。

(如溶菌酶)2.寡聚酶:由多个相同或不同的亚基以非共价键连接组成的酶。

(如磷酸果糖激酶-1)3.多酶复合物(多酶体系):几种具有不同催化功能的酶可彼此聚合。

(如丙酮酸脱氢酶复合物)4.多功能酶(串联酶):一些酶在一条肽链上同时具有多种不同的催化功能。

(如氨基甲酰磷酸合成酶Ⅱ)(一)、酶的分子组成中常含有辅助因子1.酶蛋白主要决定酶促反应的特异性及其催化机制;辅助因子主要决定酶促反应的性质和类型。

2.酶蛋白和辅助因子单独存在时均无催化活性,只有全酶才具有催化作用。

3.辅酶与酶蛋白的结合疏松,可以用透析和超滤的方法除去。

在酶促反应中,辅酶作为底物接受质子或基团后离开酶蛋白,参加另一酶促反应并将所携带的质子或基团转移出去,或者相反。

4.辅基则与酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤将其除去。

在酶促反应中,辅基不能离开酶蛋白。

5.作为辅助因子的有机化合物多为B族维生素的衍生物或卟啉化合物,它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子(或基团)或起运载体作用。

金属离子时最常见的辅助因子,约2/3的酶含有金属离子。

6.金属离子作为酶的辅助因子的主要作用①作为酶活性中心的组成部分参加催化反应,使底物与酶活性中心的必需基团形成正确的空间排列,有利于酶促反应的发生;②作为连接酶与底物的桥梁,形成三元复合物;③金属离子还可以中和电荷,减小静电斥力,有利于底物与酶的结合;④金属离子与酶的结合还可以稳定酶的空间构象。

7.金属酶:有的金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。

8.金属激活酶:有的金属离子虽为酶的活性所必需,但与酶的结合是可逆结合。

(二)、酶的活性中心是酶分子执行其催化功能的部位1.酶的活性中心(活性部位):酶分子中能与底物特异地结合并催化底物转变为产物的具有特定三维结构的区域。

第三章--酶

第三章--酶

第三章酶生物体内不断进行着各种化学变化。

绿色植物和某些细菌能以十分简单的物质(如水、CO2和无机盐)为原料合成各种复杂物质,并把太阳能转化为化学能贮存于有机物质中;而其他生物又能分解这些复杂物质,从中获取能量。

例如,动物以植物体中的淀粉等复杂物质为食物,•将淀粉降解成单糖,并在细胞内进一步分解为CO2和水,同时释放能量供动物生长、发育、运动等各种生命活动需要。

在实验室中,复杂有机物的合成与分解必需在高温、高压、强酸或强碱等剧烈条件下进行,而在生物体内虽然条件十分温和,许多复杂的化学变化却进行得极顺利和迅速,这种使化学反应变得容易和迅速的根本原因就是生物体内普遍存在着生物催化剂——酶。

酶与其他催化剂不同,它具有很大的专一性和极高的催化效率,能在机体中十分温和的条件下起高效率的催化作用,这不是无机催化剂所能比拟的。

人们对酶的认识起源于生产实践。

我国几千年前就开始制作发酵饮料及食品。

夏禹时代,酿酒已经出现,周代已能制作饴糖和酱。

春秋战国时期已能用曲治疗消化不良。

1833年Payon和Persoz从麦芽提取液中分离得到一种能水解淀粉的物质,称之为淀粉酶。

1857 年微生物学家Pasteur等人提出酒精发酵是酵母细胞活动的结果,1878年提出了“酶”•这个概,Liebig等人提出发酵现象是由溶解于细胞液中的酶引起的。

1913年Michaelis和Menten提出了酶动力学原理——米氏学说,•这对酶学反应机理的研究是一个突破。

1926年Sumner第一次从刀豆中提取出了脲酶结晶,并第一次证明酶有蛋白质性质。

20世纪30年代Northrop又分离出了结晶的胃蛋白酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白酶,并进行了动力学探讨,确立了酶的蛋白质本质。

现已鉴定出4 000多种酶,其中不少得到结晶,很多种的一级结构或三级结构也已经阐明。

随着酶学理论研究的不断深入必将对生命本质的探索作出更大的贡献。

第一节酶的命名与分类一、习惯命名法1961年以前使用的酶的名称都是习惯沿用的,称为习惯名。

第03章酶催化作用机制

第03章酶催化作用机制

V
Vmax
[S]
随着底物浓度的增高 反应速度不再成正比例加速。
V
Vmax
[S]
当底物浓度高达一定程度 反应速度不再增加,达最大速度,说明酶已 经被底物所饱和。
1. 米氏方程
第 三 章 酶 催 化 作 用 机 制
1913年,米彻利斯(Michaelis)和曼吞 (Menton)在前人研究的基础上,推导出 著名的米氏方程: v——反应速度; S——底物浓度; v m —— 最大反应速度; K m —— 米氏常数,为 酶催化反应速度等于最大反应速度一半时 的底物浓度。
(一)酶的刚性与“琐和钥匙”学说
第 三 章 酶 催 化 作 用 机 制
1890年,德 国化学家费舍 尔(Fisher) 提出了著名的 “琐和钥匙” 此学说认为:酶与底物都是刚性的,二者 学说。 结构间天然存在互补的关系,就像锁和钥
匙一样。此学说较好的解释了酶对底物选 择的专一性,但不能解释酶能够高效催化 反应的原因。
中间产物学说
中间产物
第 三 章 酶 催 化 作 用 机 制
酶促反应速度与底物浓度的关系,可以用 中间产物学说加以解释。 酶促反应模式——中间产物学说
E+S
k1 k2
ES
k3
E+P
推导过程
米-曼氏方程式推导基于两个假设:
第 三 章 酶 催 化 作 用 机 制
E与S形成ES复合物的反应是快速平衡反应,
Dixon plot
Cornish-Bowden plot
酶的转换数
定义 — 当酶被底物充分饱和时,单位时间内 (每秒钟)每个酶分子催化底物转变 为产物的分子数(微摩尔数)。 意义 — 可用来比较每单位酶的催化能力。

第三章 酶

第三章 酶

※ 研究一种因素的 影响时,其余各因 素均恒定
一.底物浓度对酶促应速度的影响
v
在其他因素不变的情况下,底物浓度 对反应速度的影响呈矩形双曲线关系。
Vm 0.3
初 0.2 速 Vm 度 2 V 0.1
[S]与v关系: 当[S]很低时,[S]与v成比例,呈一级反应 当[S]较高时,[S]与v不成比例 当[S]很高时,[S],v不变,呈零级反应
(二)Km与Vmax的意义
1.Km的推导
V= Vmax [S] Km + [S]
V Vmax Vmax/2 Km [S]
Vmax 2
Vmax[S] = Km + [S] Km=[S]
当反应速度等于最大速度一半时, 即V = 1/2 Vmax, Km = [S]
2.Km值的定义:
Km是酶-底物复合物(ES)稳定性的量度,等于 复合物的分解速率与生成速率的比值,其值等于 酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度,单 位是mol/L或mmol/L K2+K3 Km= K1 Km值的意义: Km可近似表示酶对底物的亲和力。 同一酶对于不同底物有不同的Km值。 Km是酶的特征性常数之一,可确定最适底物。
(1)表示酶与底物亲和力:
Km越大,表示E与S的亲和力越小,Km越小, 表示E与S的亲和力越大。
K1 E+S K2 ES
K3
E+P
Km=
K2+k3 K1 Km=
,当K2>>K3时,K3可忽略不计,
K2
K1
[E][S] = =Ks [ES]
(2)Km值是酶的一种特征性常数
Km值的大小与酶的结构、底物的种类及反应 条件有关,而与酶的浓度无关,即不同的酶Km 值不同,可用于鉴别酶。

生物化学03第三章 酶

生物化学03第三章 酶

三、 酶的命名与分类
(一)酶的命名
1.习惯命名法——推荐名称
通常以酶催化的底物、反应的性质以及酶的来源命名。 (1) 依据酶所催化的底物命名,如淀粉酶等。 (2) 依据催化反应类型命名,如脱氢酶、转氨酶等。 (3) 综合上述两项原则命名,如乳酸脱氢酶等。 2. 系统命名法——系统名称 规定各种酶名称要明确标示酶的底物与反应类型,如 果一种酶催化两个底物,应在酶系统名称中同时写入 两种底物的名称,用“:”把它们分开,如果底物之 一是水,则水可省略不写。
底物
反应总能量改变
产物 应 过 程
酶促反应活化能的改变

一、酶的活性中心(active center)
(一)什么是活性中心(活性部位)
指在整个酶分子中,只有一小部分区域 的aa残基参与对底物的结合和催化作用,这
些特异的aa残基比较集中的区域称为酶的活
性中心或称活性部位。
(二)酶活性中心的组成
结合部位:酶分子中与结合底物有关的部位。
1. 结合酶的酶蛋白与辅助因子协同作用才能发挥 催化作用。
酶蛋白
(无催化活性)
+ 辅助因子
(无催化活性)
全酶
(有催化活性)
2.全酶各部分在催化反应中的作用
(1)酶蛋白决定反应的特异性。 (2)辅助因子决定反应的种类与性质。
3.辅酶:属于有机分子类型的辅因子;辅酶又可
分为一般的辅酶和辅基两类(按其与酶蛋白结合
酶的调节部位可以与某些化合物可逆地非共价结 合,使酶发生结构的改变,进而改变酶的催化活性, 这种酶活性的调节方式称~。

别构酶:多为寡聚酶
正效应物(别构激活剂) 负效应物(别构抑制剂)
效应物(别构效应剂) (多为小分子化合物)

第三章 酶

第三章 酶


酶与非生物催化剂的共性


1.都能降低反应能阈 2.能加快反应速度,但不能改变反应的平衡 点 3.反应前后不发生质与量的变化
酶作为生物催化剂的特点



1. 酶催化效率极高 2.酶的催化作用具有高度的专一性 3.反应条件温和 4.酶的催化活性是受调节和控制的
酶的催化作用具有高度的专一性
一、单成分酶和双成分酶


单纯蛋白质酶:本身就是具有催化活性的单纯 蛋白质分子,如胰蛋白酶等。 结合蛋白质酶:除蛋白质外,还含有非蛋白质 部分。蛋白质部分称为酶蛋白,非蛋白质部分 称为辅助因子。酶蛋白与辅助因子单独存在时 均无催化活性,只有这两部分结合起来组成复 合物才能显示催化活性。此复合物称为全酶: 全酶=酶蛋白+辅助因子
第三章 酶
第一节 概述

酶的概念 酶是由活细胞产生的具有高效催化能力和 催化专一性的蛋白质,又叫做生物催化剂。
没有酶就没有新陈代谢,也就没有生命。 发酵生产,归根结底就是利用活细胞产生 的酶系将原料转化为人们所需的种种产物。
第二节 酶催化作用的特点
一、酶与非生物催化剂的共性 二、酶作为生物催化剂的特点
蛋白质的空间结构




一级结构:构成蛋白质的单元氨基酸通过肽键连 接形成的线性序列,多为肽链。 二级结构:一级结构中部分肽链的弯曲或折叠产 生二级结构。包括α-螺旋、β-折叠、β-转角、无 规则卷曲。 三级结构:在二级结构基础上进一步折叠成紧密 的三维形式。 四级结构:多亚基蛋白质分子中各个具有三级结 构的多肽链,以适当的方式聚合所形成的蛋白质 的三维结构。
一、单成分酶和双成分酶
同一种辅酶往往能与多种不同的酶蛋白结合, 但每一种酶蛋白只能与特定的辅酶结合成一种 全酶。

第三章 酶

第三章  酶

第三章酶一名词解释米氏常数(K m值)/ 单体酶(monomeric enzyme)/ 寡聚酶(oligomeric enzyme)/ 多酶体系(multienzyme system)/ 激活剂(activator)/ 抑制剂(inhibitor inhibiton)/ 变构酶(allosteric enzyme)/ 同工酶(isozyme)/ 酶的比活力(enzymatic compare energy)/ 活性中心(active center)①米氏常数(Km值):酶促反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度。

②单体酶:仅有一个活性中心,由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子。

③寡聚酶:由两个或多个相同或不同亚基组成的酶。

单独的亚基一般无活性。

④多酶体系:多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续反应的体系。

⑤激活剂:凡是能提高酶活性、加速酶促反应进行的物质。

⑥抑制剂:能使酶的活性下降而不引起酶蛋白变性的物质。

⑦变构酶:生物体内的一些代谢物可以与酶分子的调节部位进行非共价可逆性结合,改变酶分子构像,进而改变酶的活性。

酶的这种调节作用称为变构调节(allosteric regulation)。

受变构调节的酶称为变构酶。

⑧同工酶:能催化相同的化学反应,但在蛋白质分子的结构、理化性质和生物学性质方面都存在明显差异的一组酶。

⑨酶的比活力:比活力是指每毫克蛋白所具有的酶活力。

单位:U/mg蛋白质⑩活性中心:酶分子中能直接与底物分子结合,并催化底物化学反应的部位。

二英文缩写符号及功能NAD+ / FAD / FH4 / NADP+ / FMN / CoA / ACP / TPP / PLP①NAD+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,在氧化还原反应中传递氢原子。

②FAD:黄素腺嘌呤二核苷酸,作为多种氧化还原酶的辅基,起传递氢原子作用。

③FH4:四氢叶酸,是体内一碳单位转移酶系的辅酶。

④NADP+:烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,在氧化还原反应中传递氢原子。

生物化学生物化学生物化学第三章酶

生物化学生物化学生物化学第三章酶

特点:
*抑制剂只与ES结合; *抑制程度取决与[I]及[S]; *动力学特点:Vmax↓,表观Km↓。
各种可逆性抑制作用的比较
作用特征
与I结合的组分 表观Km Vmax
竞争性 抑制 E 增大 不变
非竞争性 反竞争性
抑制
抑制
E、ES
ES
不变
减小
降低
降低
六、激活剂对反响速度的影响
激活剂(activator)
单位时间内产物的生成量来表示 *反响速度取其初速度,即底物的消耗量很小
〔一般在5﹪以内〕时的反响速度 *底物浓度远远大于酶浓度
V
Vmax
[S] 1、当底物浓度较低时,反响速度与底物浓度成正比;反响为一级反响。
V
Vmax
响。
[S] 2、随着底物浓度的增高,反响速度不再成正比例加速;反响为混合级反
V
Vmax
结合基团
活性中心 必需基团
催化基团

活性中心外基团
非必需基团
二、酶作用专一性的机制 1、锁钥学说(lock and key hypothesis) 2、诱导契合学说(induced-fit hypothesis)
1. 锁 钥 学 说
锁钥学说:
认为整个酶分子的天然构象是具有刚性构造, 酶:钥匙, 底物:锁。一一对映。
〔2〕国际单位Kat:1972年,指在最适条件下1秒钟内转化1mol底物 所需的酶量。 即 1 Kat=1mol/s
Kat和IU的换算关系:1 Kat=6×107 IU, 1 IU =16.67n Kat
(3)比活力〔specific activity〕 酶的比活力〔比活性〕:每单位〔一般是mg〕蛋白质中的 酶活力单位数〔酶单位/mg蛋白〕。

生物化学——第三章酶

生物化学——第三章酶

2)高度专一性
• 酶的专一性 (Specificity)(特异性)
指酶在催化生化反应时对底物的选择性。
3)反应条件温和,对环境变化敏感
• 酶促反应一般在pH 5-8 水溶液中进行,反应温度范
围为20-40C。 • 高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。
4) 酶的催化活力受调控
如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈调节、酶原激活 及激素控制等。
结构专一性 键专一
基团专一
1)绝对专一性
(结构专一性)
• 酶对底物的要求非常严格,只作用于一个特定的 底物。这种专一性称为绝对专一性(Absolute specificity)。
• 例:脲酶、
O
2HN-C-NH2
• 精氨酸酶
2)相对专一性(Relative Specificity)
• 酶的作用对象不是一种底物,而是一类化合物或
+ E
酶 与 中 间 产 物
3、决定酶专一性的机制
(a)锁钥学说:认为整个酶分子的天然构象是具有刚
性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如
同一把钥匙对一把锁一样
(b)诱导契合学说:
酶表面并没有一种与底物互补的固定形状,但酶的活性 中心具有一定的柔性,两者相遇底物诱导酶构象发生变 化,才形成了互补形状。
(2)酸碱性基团:
CH2 H2N CH2 C
• Asp和Glu的羧基
• Lys的氨基
OH H2N
• Tyr的酚羟基
• His的咪唑基 • Cys的巯基等
活性中心的结构特点
• 只占酶分子总体积的很小一部分 • 具有三维空间结构
• 酶的活性部位和底物的辨认和结合过程,称
为诱导契合(induced-fit)

第3章 酶

第3章 酶

d[ES]/dt=k1[E][S]-k-1[ES]-k2[ES]
稳态平衡假说: E+S
k1 k-1
ES
k2
P+E
Michaelis和Menten假定ES形成和解离能够
快速达到平衡, ES的生成速度等于分解速度
稳态假说推导米式方程 ES生成速度:k1[E][S] ES分解速度:k-1[ES]+k2[ES] 以上两个速度相等: k1[E][S] = k-1[ES]+k2[ES] [Et] = [E]+ [ES] v = k2[ES] Vmax = k2 [Et]
5.异构酶(EC5.3.1.9)
催化同分异构体相互转化, A ← B 丙氨酸消旋酶
6.合成酶(连接酶)
催化一切必须与ATP分解相偶联、并由两种物质合 成一种物质的反应。
A + B +ATP → AB + ADP + Pi L-酪氨酸:tRNA连接酶(酪氨酰tRNA合成酶) T4DNA连接酶
3.3. 酶反应动力学
透析等简单方法与酶蛋白分离的小分子。
辅基(prosthetic group):以共价键与酶蛋白结合 牢固,不能用透析除去,需要经过一定的化学处 理才能分开的小分子
酶蛋白决定酶专一性,辅助因子决定酶促反应的
类型和反应的性质
生物体内酶种类很多,辅助因子种类很少,一种
辅助因子可与多种酶蛋白结合,如: NAD+ 构成
v=(d[P]/dt)t=0=k2[ES]=k2[Et][S]/(Km+[S])
一个反应的最大速率Vmax出现在高浓度底物、当酶 被饱和时,即当酶完全形成ES时 Vmax= k2[Et],
V max [ S ] 得米-曼氏方程, v Km [ S ]

第三章 酶(Chem)

第三章 酶(Chem)

Buchner的贡献
Pasteur认识到成醇发酵是由酶类催化的, 但却错误地认为这些酶类与酵母细胞的 完整结构和生命活动是密不可分的。
1897年Buchner成功地用不含细胞的酵母汁 完成了发酵,这是酶学发展历史上划时 代的大事件。
The Nobel Prize in Chemistry 1907
第二节酶的命名和分类
一.酶的命名法 (一)习惯命名法(1961年前使用):
– 原则 • 依据其底物命名 • 依据其催化的反应性质命名 • 底物+反应 • 有时还加上酶的来源或酶的其他特点。
– 特点:简单、应用历史悠久 – 缺点:缺乏系统性,一酶数名或一名数酶
• 国际系统命名法
– 原则
• 每一种酶有一个系统名称和习惯名称;
丙酮酸 + CO2 草酰乙酸
第三节酶作用的专一性
• 结构专一性 • 立体异构专一性 • 关于酶作用专一性的假说
一.结构专一性
结构专一性所讨论的是酶作用所要求的的化学键 及其键的两端的基团的性质。
1.绝对专一性
只作用于一个底物而不作用于任何其它物质。如脲酶
2.相对专一性
可作用于一类底物,按其专一性的程度又可分为:
米氏方程
Michaelis和Menten总结了前人的工作,于 1913年提出了酶促动力学原理—米氏方 程,促进了对酶反应机理的研究。
酶的蛋白质本质的证明
1926年Sumner从刀豆中首次得到了纯化的 结晶酶—脲酶,并证明了它的蛋白质本 质。
1930年—1936年Northrop和Kunitz对胃蛋白 酶、胰蛋白酶和糜蛋白酶的结晶研究。
• 辅基:以共价键与脱辅酶牢固结合,不 易用透析法出去;
• 金属离子:主要的催化中心;一种桥梁 基,通过形成一种配位复合物,将底物 与酶结合在一起;作为一种使酶蛋白的 构象稳定于催化活性形式的物质
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同工酶:酶分子组成结构不同,理化性质 不同和免疫学性质不同而能催化同一个化 学反应的一组酶互称同工酶。
不同组织中LDH同工酶的电泳图谱
LDH1(H4) LDH2(H3M) LDH3(H2M2) LDH4(HM3) LDH5(M4) 心肌 肾 肝 骨骼肌 血清
+
-
原点
乳酸脱氢酶同工酶形成示意图
蛋白质类辅酶 蛋白质类辅酶本身不起催化作用, 但为某些酶的活性所必需。他们一般分 子较小,有较高的耐热性,主要参与氧 化还原反应和电子传递作用,如:铁硫 蛋白和细胞色素等,利用分子中的金属 离子的价键变化参加反应。
第二节 酶的结构与功能
三、酶的结构与功能 (一)酶的活性中心和必需基团 结合基团 活性中心内必需基团 催化基团 活性中心外必需基团
* 当v=Vmax/2时,Km=[S]( Km的单位为浓度单位)
* 是酶在一定条件下的特征物理常数,通过测定Km的
(1)酶是蛋白质: 1926年,James Summer由刀豆制出脲酶结晶确立酶是蛋白质的观念, 其具有蛋白质的一切性质。 (2)核酶的发现: 1981~1982年,Thomas R.Cech实验发现有催化活性的天然RNA— Ribozyme。 L19 RNA和核糖核酸酶P的RNA组分具有酶活性是两个最著名的例子。 1955年,发现DNA的催化活性。 (3)抗体酶(abzyme): 1986年,Richard Lerrur和Peter Schaltz运用单克隆抗体技术制备 了具有酶活性的抗体(catalytic antibody)。
限速酶: 在多酶体系中控制着整个代 谢通路进行速度, 所催化的反应速度 最慢的酶, 通过别构和化学修饰调节 此酶活性。 一、别构酶 别构调节:特异的代谢物分子结合于 一些酶活性中心以外的部位,改变酶 的构象,从而改变酶活性的方式。受 此调节的酶为别构酶。
酶的别构(变构)效应示意图
效应剂
别 构 中 心
氨肽酶
(芳香) (硷性)
羧肽酶 羧肽酶
(丙)
胰凝乳 蛋白酶
胃蛋白酶
弹性蛋白酶 胰蛋白酶
第一节:酶是生物催化剂
三、酶的分类与命名 酶的命名有两在体系: 习惯命名法
系统命名法
第一节:酶是生物催化剂
习惯命名法的命名原则: 1、酶催化的化学反应性质 2、酶的作用底物 3、酶的来源 习惯命名法的优点是: 1、方便实用 2、简单直观
2、亲电催化: 催化剂与底物的作用与 亲核催化相反,亲电子催化剂从底物中 吸取一个电子对。酶分子亲电子的基团 有亲核碱基被质子化的共轭酸。 有时其必需的亲电子物质不是上述 的共轭酸,而是由酶中非蛋白组成的辅 因子提供,其中金属阳离子是很重要的 一类。
调节酶:是指能对代谢进行调节的 酶,调节酶分子中有活性区和调节 区,其催化活力可因与调节剂的结 合而改变,有调节代调代谢的功能。 调节酶分共价调节和变构调节两类。
第二节 酶的结构与功能
二、酶的化学组成 单纯酶 酶蛋白 结合酶 辅助因子 全酶
第二节 酶的结构与功能
辅酶或辅基
辅 助 因 子 金属酶 金属离子 金属活化酶
第二节 酶的结构与功能
金属离子在酶活性中的作用 1、维持酶分子活性构象; 2、在酶催化过程中起传递电子的作用; 3、在酶与底物之间起桥梁作用; 4、利用离子的电荷影响酶的活性,以 利于酶与底物之间的结合。
乳酸脱氢酶 EC 1. 1. 1. 27
第1大类,氧化还原酶 第1亚类,氧化基团CHOH 第1亚亚类,H受体为NAD+ 该酶在亚亚类中的流水编号
第一节:酶是生物催化剂
习惯命名法的缺点是: 不同地区的人,习惯不同,往往出 现一酶多名或多酶一名的现象,这一情 况对于不同地区的人们在学术交流中产 生障碍和不必要的争议。
维生素与辅酶
维生素
1. B1(硫胺素) 2. B2(核黄素 )
辅酶
TPP FMN、FAD
功能
醛基转移、 α -酮酸脱羧 氧化还原反应、 氢转移
3. PP [尼克酸(酰胺)]
4. 泛酸(遍多酸) 5. B6 [吡哆醇(醛、酸)] 6. 叶酸 7. 生物素 8. C(抗坏血酸) 9. 硫辛酸 10. B12(氰钴氨素)
R R R R R R
C C
C
C C
无催化活性构象(T-型)
有催化活性构象(R-型)
别构酶的序变模型
Sபைடு நூலகம்
S
S
S S
S
S S S
S
S S S S
亚基全部 处于R型
亚基全部 处于T型
依次序变化
别构酶的齐变模型
T状态(对称亚基)
S
S
S
S S
S
S S S
S
S S S S
T状态(对称亚基)
对称亚基
齐步变化
酶的共价修饰 反应是酶促反 应,只要有少 量信号分子 (如激素)存 在,即可通过 加速这种酶促 反应,而使大 量的另一种酶 发生化学修饰, 从而获得放大 效应。这种调 节方式快速、 效率极高。
肾上腺素或 胰高血糖素
1、腺苷酸环化酶
(无活性) 腺苷酸环化酶(活性)
肾上腺素或 胰高血糖素
1
2、ATP
cAMP
第三节 酶的作用原理
1、亲核催化作用:具有一个非共用电 子对的基团或原子,攻击缺少电子具有 部分正电性的原子,并利用非共用电子 对形成共价键催化反应。酶分子中具有 催化功能的亲核基团主要是:组氨酸的 咪唑基、丝氨酸的羟基及半胱氨酸的巯 基。
第三节 酶的作用原理
第三节 酶的作用原理
第三节 酶的作用原理
对称亚基
v
a
b
[S] 别构酶v与[S]的关系曲线 a: 普通酶 b: 别构酶
共价调节酶:一个酶在另一个 酶的作用下,发生共价键的变 化,从而引起酶分子的空间结 构发生改变,而对代谢进行调 节的调节方式称为共价调节。
ATP
激酶
ADP
磷酸化酶
(无活性)
磷酸化酶
P -OH
磷酸酯酶 (有活性)
P
H2O
酶级联系统 调控示意图 意义:由于
第三节 酶的作用原理
第三节 酶的作用原理
第三节 酶的作用原理
第三节 酶的作用原理
(二)底 物变形与 张力作用
第三节 酶的作用原理
(三)共价催化作用 酶与底物结合形 成一个活性很高的共价中间产物,这个 中间产物以较大的几率转变为过渡状态, 因此反应的活化能大大降低,底物可以 越过较低的能阈而形成产物。共价催化 作用可分为亲核催化作用和亲电子催化 作用两大类。
单分子酶促反应的米氏方程及Km
k2 ES E S P E k 1
k1
米氏方程:
Vmax S v K m S
米氏常数:
k 1 k2 Km k1
推导原则:从酶被底物饱和的现象出发,按照
“稳态平 衡”假说的设想进行推导。
米氏常数的意义
G 能 量 水 平
E1
ES
E2
E+S
P+ E
反应过程
第三节 酶的作用原理
二、中间复合物学说和酶作用的过渡态
k2 E S ES P E k 1
k1
为Tyr 248 为Arg 145 为Glu 270
Zn
为底物
Zn
第三节 酶的作用原理
三、酶作用高效率的机制 (一)底物的趋近与定向效应
结构基因 a b
乳酸脱氢酶同 工酶电泳图谱
mRNA

多肽 亚基
点样线
M4 M3H M2H2
MH3
四聚体 H4
+
酶促反应动力学
酶促反应的动力学是用数学的手段 对影响酶促反应速度的因素进行定量描 述的处理方法。 影响酶促反应速度的因素总结起来有:
1、底物浓度 2、酶浓度 3、温度 4、pH值 5、激动剂 6、抑制剂
第一节:酶是生物催化剂
一、酶的生物学意义 酶是由活细胞合成并分泌 的具有催化作用的蛋白质或核酸(RNA)。 与一般催化剂比较,酶有以下的共同点 1、酶能提高化学反应速度,在反应前后酶的数量和 质量不发生变化; 2、酶即能提高正反应速度,也能提高副反应速度; 3、酶只能缩短反应达到平衡的时间,而不能改变 平衡常数; 4、酶只能催化热力学允许的反应。
第一节:酶是生物催化剂
与一般催化剂比较,酶所具有的特点: 1、酶的作用条件温和; 2、酶的效率高; 3、酶具有高度的专一性; 4、酶活性的可调节性;
5、酶的自我更新。
第一节:酶是生物催化剂
绝对专一性 对底物选择 相对专一性 对化学键选择 立体专一性
第一节:酶是生物催化剂
消化道内几种蛋白酶的专一性
第一节:酶是生物催化剂
酶的分类 国际酶学委员会根据酶所催化的化 学反应类型,将酶分为六大类:
1、氧化还原酶类(oxidoreductases) 2、转移酶类(transferases) 3、水解酶类(hydrolases) 4、裂合酶类(lyases) 5、异构酶类(isomerases) 6、合成酶类(ligases)
活性 中心

调控部位(Regulatory site):酶分子中存在着一 些可以与其他分子发生某种程度的结合的部位, 从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或 抑制作用
ATCase的结构及其 催化链的别构过度作 用
C C C
C
ATP(正效应剂) CTP(负效应剂)
C
R R
C C
R R R R
P
2ATP
2ADP
Mg2+
2Pi 2H2O
OH 磷蛋白磷酸酶 O P 磷酸化酶 b 二聚体 无活性 磷酸化酶 a 二聚体 低活性
O
O P
P
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