1.基因组学简介
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The father of medicine
基因组学的起源（The origin of genomics）
Law of dominance （显性） 1865 Mendel’s laws of inheritance Law of segregation（分离）
Law of independent assortment（自由组合） 1910 Thomas Hunt Morgan(摩尔根) Law of linkage and crossing-over 1977 Sanger测序：第一次将测序简单化、可视化——NTP+ddNTP（双脱氧核苷酸，无法形成磷酸二酯键）→电泳——一代测序的基础 1983 第一个疾病基因发现——Huntington舞蹈症4p16.3 1985 PCR 1987 The Origin of “Genomics” 基因组学的元年 1990 人类基因组计划正式启动 2001 Collins(鸟枪法) VS Venter人类基因组工作草图发表
BRCA1/BRCA2 （Brest cancer，乳腺癌/卵巢癌相关）
肿瘤抑制基因，在调节人体细胞的复制、遗传物质DNA损伤修复、细胞的正常生长方面有重要作用。
Nuclear genome
33Mb 33亿个碱基对 20000-25000 genes (introns & exons) Mendelian inheritance（X-linked, auto, paternal Y）
Haplogroup（单倍群）
一组相似的单体型，源自一个SNP突变的祖先 #Y染色体单倍群
最常被研究的单倍群是Y染色体单群和线粒体DNA单倍群
4P医学
Predictive medicine（预测医学） Preventative medicine（预防医学） Personalized medicine（个体化、精准医学） Participatory （公众参与性）
Mitochondrial genome
37genes (No introns) 高突变率 Maternal inheritance 母系遗传——extranuclear inheritance
Mitochondrial genome Heteroplasmy（异质性）
一个个体/细胞可以同时存在多种类型的线粒体DNA
Mitochondrial genetic bottleneck（线粒体遗传瓶颈）
母亲体内只有一小部分线粒体DNA分子会遗传给下一代
Mitochondrial threshold effect（线粒体阈值效应）
大多数情况下，遗传缺陷的表型表现只有当超过阈值水平时才会发生
Haplotype（单体型）
一组相互关联的单核苷酸多态性基因(SNP)位点，往往一起出现
一、基因组医学简介
基因组学（Genomics）
Gene 基因 Omics 组学
人类基因组计划（Human Genome Project, HGP）
1985年美国科学家提出，1990年正式启动，2001年人类基因组工作草图发表，2003年完成 包括人和一些常用的模式生物
Hippocrates 希Байду номын сангаас克拉底
同病同治→同病异治
Right patients Right drugs Right dosage(剂量) Right time
药物研发过程
1.计算机辅助药物设计CADD（3-5年） 2.Ⅰ期临床：安全性、耐受性、药代动力学（1年） 3.Ⅱ期临床：安全性、疗效、剂量（安慰剂/已上市药物 for 对照）（单盲2年） 4.Ⅲ期临床：安全性、疗效的确证阶段（足够样本量的随机双盲对照试验）（双盲3年） 5.Ⅳ期及Ⅴ期为非必要
基因组学的起源（The origin of genomics）
Law of dominance （显性） 1865 Mendel’s laws of inheritance Law of segregation（分离）
Law of independent assortment（自由组合） 1910 Thomas Hunt Morgan(摩尔根) Law of linkage and crossing-over 1977 Sanger测序：第一次将测序简单化、可视化——NTP+ddNTP（双脱氧核苷酸，无法形成磷酸二酯键）→电泳——一代测序的基础 1983 第一个疾病基因发现——Huntington舞蹈症4p16.3 1985 PCR 1987 The Origin of “Genomics” 基因组学的元年 1990 人类基因组计划正式启动 2001 Collins(鸟枪法) VS Venter人类基因组工作草图发表
BRCA1/BRCA2 （Brest cancer，乳腺癌/卵巢癌相关）
肿瘤抑制基因，在调节人体细胞的复制、遗传物质DNA损伤修复、细胞的正常生长方面有重要作用。
Nuclear genome
33Mb 33亿个碱基对 20000-25000 genes (introns & exons) Mendelian inheritance（X-linked, auto, paternal Y）
Haplogroup（单倍群）
一组相似的单体型，源自一个SNP突变的祖先 #Y染色体单倍群
最常被研究的单倍群是Y染色体单群和线粒体DNA单倍群
4P医学
Predictive medicine（预测医学） Preventative medicine（预防医学） Personalized medicine（个体化、精准医学） Participatory （公众参与性）
Mitochondrial genome
37genes (No introns) 高突变率 Maternal inheritance 母系遗传——extranuclear inheritance
Mitochondrial genome Heteroplasmy（异质性）
一个个体/细胞可以同时存在多种类型的线粒体DNA
Mitochondrial genetic bottleneck（线粒体遗传瓶颈）
母亲体内只有一小部分线粒体DNA分子会遗传给下一代
Mitochondrial threshold effect（线粒体阈值效应）
大多数情况下，遗传缺陷的表型表现只有当超过阈值水平时才会发生
Haplotype（单体型）
一组相互关联的单核苷酸多态性基因(SNP)位点，往往一起出现
一、基因组医学简介
基因组学（Genomics）
Gene 基因 Omics 组学
人类基因组计划（Human Genome Project, HGP）
1985年美国科学家提出，1990年正式启动，2001年人类基因组工作草图发表，2003年完成 包括人和一些常用的模式生物
Hippocrates 希Байду номын сангаас克拉底
同病同治→同病异治
Right patients Right drugs Right dosage(剂量) Right time
药物研发过程
1.计算机辅助药物设计CADD（3-5年） 2.Ⅰ期临床：安全性、耐受性、药代动力学（1年） 3.Ⅱ期临床：安全性、疗效、剂量（安慰剂/已上市药物 for 对照）（单盲2年） 4.Ⅲ期临床：安全性、疗效的确证阶段（足够样本量的随机双盲对照试验）（双盲3年） 5.Ⅳ期及Ⅴ期为非必要