诊断性试验Meta分析

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Revman,Stata,Meta-disc在诊断试验准确性(DTA)

系统评价中的应用

文献数据摘自《ProGRP与NSE对小细胞肺癌诊断价值的meta分析》

注:表中 10 个原始研究均使用酶联免疫吸附测定法检测阳性界值; TP= 真阳性数; FP= 假阳性数; FN= 假阴性数; TN= 真阴性数a:ProGRP,b: NSE

Revman5.2

新建诊断试验准确性(DTA)系统评价模板

添加所有纳入研究

此处对每篇文献QUADAS2质量特征进行描述,以便探讨异质性来源及作表图

数据分析里面添加所要研究的待评价诊断试验

可计算相关指标(似然比及诊断比值比和单独在干预系统评价里面作森林图)

添加分析里面制作SEN和SPE森林图及SROC曲线,可对数据进行重新制定

设置参数

若用户对上图窗口中的统计分析显示的结果不满意,可点击右上角的属性按钮

); 或依次展开树形目录分支"Data and Analyses→Analyses→ProGRP",选中"ProGRP"并单击右键,选择"Properties … ",弹出属性设置对话框。在图对话框中,可对统计指标(General)、SROC

图、森林图和异质性来源的参数进行设

Study Lamy 2000Molina 2009Nissan 2009

Schneider 2003Shibayama 2001Stieber 1999Sun 2005Takada 1996Yamaguchi 1995Yang 2005

TP 3541134

297411773802546

FP 18979

611222669

FN 164641

840292847917

TN 229218548

119234972034696072

Sensitivity (95% CI)0.69 [0.54, 0.81]0.47 [0.36, 0.58]0.77 [0.70, 0.83]

0.78 [0.62, 0.90]0.65 [0.55, 0.74]0.80 [0.73, 0.86]0.72 [0.62, 0.81]0.63 [0.54, 0.71]0.74 [0.56, 0.87]0.73 [0.60, 0.83]

Specificity (95% CI)

0.93 [0.89, 0.96]0.96 [0.93, 0.98]0.87 [0.85, 0.90]

0.95 [0.90, 0.98]0.96 [0.92, 0.98]0.98 [0.93, 1.00]0.90 [0.86, 0.94]0.99 [0.97, 1.00]0.91 [0.81, 0.97]0.89 [0.80, 0.95]

Sensitivity (95% CI)00.20.40.60.81

Specificity (95% CI)

00.20.40.60.81

置,并点击"Apply"使其生效,见下图。

亚组分析(假如,原文没做)

QUADAS-2偏倚表(图)制作

P a t i e n t S e l e c t i o n

Lamy 2000?Molina 2009

Nissan 2009

+

Schneider 2003?

Shibayama 2001

+Stieber 1999

Sun 2005

+

Takada 1996

?

Yamaguchi 1995

+

Yang 2005

?I n d e x T e s t

?

+

+–

?

+

+R e f e r e n c e S t a n d a r d

?

?

+

+?

?

+

+F l o w a n d T i m i n g

?

?

+

?

?–

?

+

+

Risk of Bias P a t i e n t S e l e c t i o n

––

?

––

?–?

I n d e x T e s t

?

?

?

–?

+

?––

R e f e r e n c e S t a n d a r d

?

?

–?

?

?–?

Applicability Concerns

–High ?Unclear +Low

异质性来源

在DTA系统评价里面不能直接进行似然比、诊断比值比的森林图以及各指标漏斗图制作,但可以改变四个表数据模式或直接计算相关指标,添加入干预性系统评价模板中进行制作及查看异质性、发表偏倚(漏斗图)。

Stata12

一拟合双变量混合效应模型:midas命令

1.计算所有诊断试验统计学指标(敏感度、特异度、似然比、诊断比值比等)及异质性检验统计量:

SUMMARY DATA AND PERFORMANCE ESTIMATES

Bivariate Binomial Mixed Model

Number of studies = 10

Reference-positive Subjects = 935

Reference-negative Subjects = 2417

Pretest Prob of Disease =0.279

Between-study variance(varlogitSEN) =0.136, 95% CI = [0.041-0.452] Between-study variance(varlogitSPE)= 0.406, 95% CI = [0.133-1.241] Correlation (Mixed Model)= -0.491

ROC Area, AUROC = 0.89 [0.86 - 0.92]

Heterogeneity (Chi-square): LRT_Q = 55.419, df =2.00, LRT_p =0.000 Inconsistency (I-square): LRT_I2 = 96.39, 95% CI = [93.72-99.06]

Parameter Estimate 95% CI

Sensitivity 0.702 [ 0.641, 0.756]

Specificity 0.943 [ 0.913, 0.963]

Positive Likelihood Ratio 12.348 [ 8.245, 18.494]

Negative Likelihood Ratio 0.316 [ 0.262, 0.381]

Diagnostic Score 3.665 [ 3.229, 4.102]

Diagnostic Odds Ratio 39.071 [ 25.251, 60.456]

2. 绘制敏感度、特异度森林图:

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