定量PCR加样操作流程

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定量PCR的实验流程及注意事项

定量PCR的实验流程及注意事项

qPCR实验设计需要考虑的问题
● 绝对定量与相对定量 ● 使用SYBR或是Taqman探针 ● 对照组的设置 ● 标准品的选择 ● 看家基因的选择 ● 引物与探针的设计 ● 扩增子的设计 ● 实验循环条件的设计
扩增子设计
● 扩增子长度:75-200bp ● 避免二级结构 ● 利用mFold 分析二级结构
借助熔解曲线分析结果
10,000 copies of input nucleic acid
80 copies
Amplicon
Nonspecific product
qPCR实验设计需要考虑的问题
● 绝对定量与相对定量 ● 使用SYBR或是Taqman探针 ● 对照组的设置 ● 标准品的选择 ● 看家基因的选择 ● 引物与探针的设计 ● 扩增子的设计 ● 实验循环条件的设计
好的引物及扩增子设计
● 提高扩增反应的效率 ● 提高反应的特异性、减少非特异性扩增 ● 提高产量和灵敏度 ● 减少多重PCR的交叉影响
准确、可重复的结果
引物设计
● 避免二级结构 ● GC含量控制在50-60% ● 连续的G或C不超过3个碱基 ● 5’末端不含G
通过引物设计提高特异性
● BLAST ● 使用SYBR Green方法时考虑到以后采用探针法 ● 进行多重PCR的可能 ● 测试多个引物对 ● 选择无引物二聚体且扩增效率最高的引物对
未知样品 标准品梯度 阳性对照 阴性对照 基因组对照
● 校准生物学误差:看家基因 ● 降低其余误差: 样品重复实验
重复
● 定量PCR中样本(包括对照及标准品)一般需要3个重复 ● 一般重复间允许的差异≤0.5Ct(理想的状态≤0.25Ct) ● 理想的重复:
¾ 准备反应体系master mix, 包括样本 ¾ 使用热启动taq酶,避免非特异产物的扩增 ¾ 分装mix时使用一个枪头 ¾ 充分旋涡震荡5秒以上

荧光定量PCR操作流程

荧光定量PCR操作流程

荧光定量PCR操作流程1.目的基因引物的合成设计合成200-300bp目的基因片段的引物,利用primer 5.0引物设计工具或者手工合成,引物合成过程中注意上下游的Tm值要相似、GC碱基在上下游的引物里均匀、引物与模板序列紧密互补、引物间避免形成稳定的二聚体或发夹结构等事项。

2 总RNA提取(1)准备研钵(灭菌)、离心管(1.5ML),枪头、手套(一次性)、异丙醇、乙醇,三氯甲烷2)取适量家蚕组织,加液氮充分研磨;匀浆加1ml RNAiso Plus后匀浆;3)室温放置5min (可在-70℃下保存1个月)4)加0.2ml氯仿(chloroform),振荡混匀,室温放置5分钟;5)12000g,15min,4℃;6)取上清(约0.6ml),加与上清等体积异丙醇,室温放置10分钟;7)12000g,10min,4℃;8)取沉淀(RNA呈胶状沉淀),加1ml 75%乙醇(可在-20℃保存1年)洗涤;9)12000g,5min,4℃;10)取沉淀,室温干燥10min;11)溶解于DEPC处理水中12)-80℃保存,尽快使用,或在8)保存。

3 反转录(TOYOBO试剂盒)Nuclease-free water up to 10ul5ⅹRT buffer 2ulRT Enzyme Mix 0.5ulPrimer Mix 0.5ulRNA 0.5-1ug4定量PCR反应(本实验室7300系统)SYBR 10ulForward Primer 1ulReverse Primer 1ulROXⅠ 0.4ulc DNA模板2ul一个模板重复三次以尽量减小误差;每个模板都要设内参。

内参是生物体或者细胞中稳定表达的基因,表达量几乎不变。

而后按照试剂盒说明操作流程设定仪器参数即可。

荧光定量PCR实验标准操作 SOP

荧光定量PCR实验标准操作 SOP

荧光定量PCR实验操作SOP一、实验目的通过本操作获得准确、无误差、客观的样品基因扩增数据,用于下一步实验结果的分析。

二、实验准备:1. 进行荧光定量PCR实验操作之前,荧光定量PCR 操作实验室需紫外灯照射15 分钟,关闭紫外灯后开启通风系统抽风15分钟。

2. 进入荧光定量PCR操作实验室后需要佩戴一次性无菌口罩、无菌乳胶手套、实验中尽量避免与同事交谈,防止PCR模板污染。

3. 实验前将70%乙醇涂布于操作台及器具(移液器等)表面,两分钟后用纸巾擦除。

4. 准备实验中放污染材料的器皿、用于荧光定量PCR 实验操作的耗材(要求无菌)1ml枪头、200ul枪头、10ul枪头、1.5ml 离心管,用于荧光定量PCR 操作的试剂: 荧光定量PCR Master Mix、H2O,DNA 或cDNA 模板(注意必须在配制完荧光定量PCR所需MIX后才可以取出).5. 一个实验区域在同一时间段只进行一种实验。

6. 实验结束后移出个人专用材料(实验记录本)至个人专用区域保管;封好污染材料盛放器皿并移出至污物袋;移出共用器具至专门区域保管;将70%乙醇涂布于操作台或器具表面,两分钟后用纸巾擦除;打开紫外灯照射至少15分钟。

三、实验步骤:1. 荧光定量PCR MIX 的配置:在实验记录本上记录下要进行实验的样品内容、日期、实验样品孔信息(无特殊要求每样品每基因均按照3平行孔实验),然后计算出所需MIX 体积,分别加入后混匀分装至PCR扩增板,单孔荧光定量PCR孔Master Mix 按照20uL反应体系内容如下:Primer F: 0.8ul(0.4uM)Primer R: 0.8ul(0.4uM)2×TB Green Premix: 10ulROX: 0.4ulH2O: 6ulMIX Total: 18ulMIX配制通常准备10%冗余量。

2. MIX 配置好后混匀快速分装至PCR反应板,快速准确的将样品DNA/cDNA 小心加入装有反应液体的反应管内:DNA/cDNA Template: 2ul(<100ng)荧光定量PCR 反应总体积:20ul.3. 模板加好后, 盖紧盖子并做好标记, 写上编号(用防水笔书写);4. 严格按照荧光定量PCR 仪的操作手册启动仪器,设置实验扩增程序(包含荧光定量PCR 扩增程序、荧光定量PCR 样品孔信息),保存文件,最好以日期及样品名称命。

pcr定量检测流程

pcr定量检测流程

pcr定量检测流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

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②核酸提取:使用磁珠法、酚-氯仿法或盐析法等,从样本中提取纯化的DNA 或RNA,严格控制操作以防核酸降解和污染。

③试剂准备:配置PCR反应液,包括模板核酸、特异性引物、荧光探针、dNTPs、缓冲液及热稳定DNA聚合酶等。

④加样与封管:将配置好的反应液精确加入反应管中,每管含有所需的所有反应组分,密封管盖以防污染。

⑤仪器设置:在实时荧光定量PCR仪上设定实验参数,包括循环次数、退火温度、延伸时间和荧光采集模式等。

⑥循环扩增:仪器自动执行PCR循环过程,包括高温变性、适温退火和中温延伸,每次循环使靶序列呈指数扩增。

⑦荧光检测:在每次循环的延伸阶段,仪器实时监测荧光信号强度,代表扩增产物的累积。

⑧数据分析:通过仪器软件分析荧光信号随循环数增加的变化,计算Ct值(循环阈值),依据标准曲线定量原始模板量。

⑨结果判定:根据Ct值与已知标准品的比较,得出样本中靶基因的绝对或相对定量结果,判断阴阳性或表达水平。

荧光定量pcr操作流程

荧光定量pcr操作流程

荧光定量pcr操作流程
荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种常用的分子生物学技术。

它可以有效地扩增DNA片段,具有极高的精确度,广泛应用于分子生物学、遗传学和病原学等领域。

本文将介绍荧光定量PCR的操作流程。

首先,要准备所需的试剂和仪器。

PCR反应所需的试剂包括DNA 模板、双链引物、PCR酶、dNTPs等,而仪器则包括PCR微量热循环仪、荧光检测仪等。

其次,将所需试剂按一定比例配置,并分装到PCR微量热循环仪的反应液体中。

然后,将液体加到PCR微量热循环仪的反应槽中,设定温度及时间,以完成PCR扩增反应。

最后,将扩增产物稀释,用荧光检测仪进行定量检测,并计算扩增倍数,从而完成荧光定量PCR的操作步骤。

总之,荧光定量PCR技术是一种常用的分子生物学技术。

它可以有效地扩增DNA片段,有助于深入探究DNA序列,从而为分子生物学、遗传学和病原学等领域的研究发现提供重要线索。

完成荧光定量PCR操作的步骤包括准备试剂和仪器、配置反应液体、PCR扩增反应、定量检测和计算扩增倍数等。

定量PCR加样操作流程

定量PCR加样操作流程

QPS-201加样流程和Step One Plus仪器的仪器操作要准备的东西:1.八排管和盖子2.96孔细胞培养板3.移液器:10ul,20ul,100ul,200ul。

4.枪头10ul,20ul,100ul,200ul或者300ul。

5.200ul和600ul的PCR管。

6.试剂:QPk-201,上下游引物,cDNA,去RNA酶的PCR水7.注意事项:A.引物的储存浓度100nm,工作浓度:5-10nmol,引物要过量,上下游引物要先混匀在一起,然后再加。

内参actin和目标基因的引物都要混匀。

混匀后的引物可用半个月,用时要反复混匀,水样的东西混20下,油状的(酶)东西至少要混30下。

B.试剂配总管用,cDNA和酶mix配一管,引物和水配一管。

混匀之后,再分别加到管子里。

为什么试剂要配总管呢?cDNA模板量很少,所以加多加少对实验影响很大,酶加10ul,样多,少量的东西要想混匀,必须放在大量的东西里这样再去混匀,就可以使每个管子里的样品都能保证是一致的。

C.内参和目标基因都要跑3个复孔,取平均值,差异CT值要在0.5之内,如果Ct值>0.5,结果就不可信,要重新再做。

(一)QPk-201加样流程:用QPk-201做样品体系是20ul的。

cDNA :2ulPCR水:6ul上下游引物共:2ul酶MIX:10ul一共是20ul体系。

把cDNA :2ul和酶mix:10ul共12ul配一管。

把引物:2ul和水6ul共8ul配一管。

以下以样品为例,加样流程如下:目标基因STOB1,样品六个,编号:1,2,3,C5,C6,C7内参基因actin目标基因STOB1STOB1STOB1内参ActionActionAction如何计算是关键:6个样品,每个样品配一管,再分6次加,但是要考虑都损失,所以要多加10%的量,以避免最后没得加了。

cDNA和酶配一管:cDNA:2×6×1.1=13.2ul酶Mix:10×6×1.1=66ul,在总管里吹打30次混匀,取12ul。

定量PCR的实验流程及注意事项

定量PCR的实验流程及注意事项

定量PCR的实验流程及注意事项一、实验流程:1. Primer设计:为了进行定量PCR实验,需要设计一对与目标DNA 或RNA序列特异性结合的引物。

确保引物的特异性和互补性,通过使引物的浓度相等可以最大限度地提高PCR反应的扩增效率。

2.模板DNA或RNA提取:从细胞或组织中提取目标DNA或RNA。

可以使用商业化的DNA/RNA提取试剂盒或其他方法进行提取。

注意保持样品的完整性,避免污染和降解。

3.RNA逆转录(如果需要):如果目标是RNA,则需要使用反转录酶将mRNA转换为cDNA。

通常,使用逆转录酶和随机引物进行逆转录反应。

4. qPCR反应体系:准备PCR反应体系,其中包含引物、模板DNA或cDNA、酶(如Taq DNA聚合酶、逆转录酶等)和反应缓冲溶液。

同时还可以加入SYBR Green等荧光染料或探针以实现实时监测PCR反应的进行。

5.PCR反应条件:设置合适的PCR反应条件,如温度和时间等。

通常情况下,PCR反应会进行多个循环,每个循环包括退火、延伸和变性三个步骤。

6.实时检测PCR反应:在PCR反应过程中,使用实时荧光检测系统实时监测PCR产物的积累。

根据荧光信号变化的阈值周期数(Ct值),可以推断出目标DNA或RNA的初始浓度。

7.标准曲线构建:通过使用已知浓度的目标DNA或RNA来构建标准曲线。

将标准曲线与待测样品的Ct值进行比较,可以计算出目标物浓度。

8.数据分析:根据标准曲线和待测样品的Ct值,计算出目标物的相对或绝对浓度。

可以使用专业的数据分析软件对实验结果进行统计分析和解释。

二、注意事项:1.特异性引物设计:确保引物与目标DNA或RNA的特异性结合,避免引物与非目标序列的扩增。

2.制备PCR反应的质量控制:采用无菌、无核酸污染的试剂和实验环境,避免引入杂质干扰PCR反应。

3.避免PCR反应产物的污染:使用专门用品和设备进行PCR实验,避免引入外源性DNA或RNA。

4.逆转录反应的标准化:如果进行RNA定量PCR,应尽量标准化逆转录反应的条件,以获得准确的cDNA模板。

qpcr的操作流程

qpcr的操作流程

qpcr的操作流程
实时荧光定量PCR(qPCR)是一种高效、准确的分子生物学技朧,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定等领域。

下面将介绍qPCR的操作流程。

1. 样品处理:首先需要从样品中提取RNA或DNA,并进行适当
的纯化处理。

确保提取的核酸质量和浓度符合实验要求。

2. 质控检测:对提取的核酸进行质控检测,包括测定纯度、浓
度和完整性。

确保核酸的质量符合实验要求。

3. 反转录:对RNA进行反转录反应,将RNA转录为cDNA。


转录反应需要使用逆转录酶和引物,确保反转录产物的质量和完整性。

4. 准备qPCR反应体系:根据实验设计和引物设计,准备qPCR
反应体系。

包括模板DNA或cDNA、引物、探针、核酸酶、缓冲液等。

确保反应体系的配比准确。

5. 进行qPCR反应:将准备好的反应体系加入到qPCR仪器中,
进行PCR扩增反应。

根据实验设计和引物特性,设置合适的PCR程
序和参数。

6. 数据分析:分析qPCR反应的数据,包括计算Ct值、绘制标
准曲线、计算目标基因的相对表达量等。

确保数据的准确性和可靠性。

7. 结果解读:根据数据分析结果,解读实验结果。

判断目标基因的表达水平、基因型等信息,为后续实验和研究提供参考。

总的来说,qPCR操作流程包括样品处理、质控检测、反转录、准备反应体系、进行PCR反应、数据分析和结果解读等步骤。

通过严格的实验设计和操作规范,可以获得准确、可靠的实验结果,为分子生物学研究提供重要的数据支持。

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR操作步骤以下实验步骤仅供参考:1样品RNA的抽提①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。

②两相分离每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。

手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。

4℃下12000rpm离心15分钟。

离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及无色水相上层。

RNA全部被分配于水相中。

水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。

③RNA沉淀将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。

加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA,混匀后15到30℃孵育10分钟后,于4℃下12000rpm离心10分钟。

此时离心前不可见的RNA 沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。

④RNA清洗移去上清液,每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀。

混匀后,4℃下7000rpm离心5分钟。

⑤RNA干燥小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。

⑥溶解RNA沉淀溶解RNA时,先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用。

2RNA质量检测1)紫外吸收法测定先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。

然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液浓度和纯度。

①浓度测定A260下读值为1表示40μgRNA/ml。

样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260×稀释倍数×40μg/ml。

具体计算如下:RNA溶于40μlDEPC水中,取5ul,1:100稀释至495μl的TE 中,测得A260=0.21RNA浓度=0.21×100×40μg/ml=840μg/ml或0.84μg/μl取5ul用来测量以后,剩余样品RNA为35μl,剩余RNA总量为:35μl×0.84μg/μl=29.4μg②纯度检测RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1。

96孔板荧光定量pcr加样技巧

96孔板荧光定量pcr加样技巧

96孔板荧光定量pcr加样技巧
1.准备样品:将需要检测的DNA或cDNA样品冻存或提取干净,在使用前进行稀释。

2.准备PCR反应体系:按照实验室的标准制备好PCR反应体系,加入引物、荧光探针和DNA聚合酶等试剂。

3.在96孔板中加入PCR反应体系:按照实验需要的样品量和反应体系量,在96孔板中加入适当的体积PCR反应体系。

4.加入样品:用多道移液器或单通道移液器分别加入稀释好的样品和负对照样品,确保每个样品或对照物都加入到了正确的位置。

5.加盖并旋紧:在反应体系和样品加入完成后,最好使用96孔板封口膜或强力透明胶贴将板盖起来并旋紧,以防止样品反应后溢出。

6.放入PCR仪中嵌板运行:将加好反应体系的96孔板放入PCR仪中进行测试。

7.数据分析:通过PCR仪检测数据,利用数据分析软件进行定量PCR 数据的分析和解释。

实时荧光定量PCR(Real-Time-PCR)实验流程

实时荧光定量PCR(Real-Time-PCR)实验流程

实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验流程一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA 的降解,保持RNA的完整性。

在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2ug进行RNA的甲醛变性胶电泳检测,如果存在DNA污染时,要用DNase I进行消化(因为在处理过程中RNA极易降解,建议体系中加入适量RNA酶抑制剂)。

二、DNase I 消化样品RNA 中的DNA用DNase I 消化DNA组份加量模板(RNA) 10ugRNase Inhibitor 4ulDNase I buffer 10ulDNase I 10ulDEPC处理H2O 至100ul混匀,37℃90min三、RNA琼脂糖凝胶电泳1.1%的琼脂糖凝胶电泳凝胶的配制:1)称取琼脂糖0.45g放入三角瓶中,向其中加入4.5ml的10×MOPS缓冲液和39.5ml 的DEPC水,放微波炉里溶化。

2)待冷却到60摄氏度左右时,加入1ml甲醛,摇匀(避免产生气泡)。

倒入凝胶板上凝固30min。

2.取各个RNA样品4µl,加入6×RNA电泳上样缓冲液2µl混匀,加入变性胶加样孔中。

3.120V电压下电泳25min。

用凝胶紫外分析仪观察,照相保存。

4.RNA电泳结果如下图所示。

可见28S和18S两条明亮条带,无DNA条带污染。

四.RNA反转录为cDNA反转录程序(以MBI的M-MLV为例) 组份加量(20ul体系) 加量(40ul 体系)模板(RNA) 0.1~2.5ug(根据条带的亮度适当调整) 3ug(根据条带的亮度适当调整)引物T18(50uM)(或其他引物) 2.0ul 4.0ulDEPC处理H2O 至12.5ul 至25ul混匀,70℃5min,立即冰浴5*buffer 4.0ul 8.0uldNTP(10mM) 2.0ul 4.0ulRNase Inhibitor 0.5ul 1.0ul混匀,37℃5minM-MLV 1.0ul 2.0ul42℃60min ,70℃10min反转录引物的选择与Real-Time PCR引物设计的要求1)随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难以拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。

荧光定量PCR操作流程总结

荧光定量PCR操作流程总结

荧光定量PCR操作流程一、RNA提取准备物品:无RNA酶大中小枪头;一套枪;trizol试剂;无RNA酶EP管(1.5mL、200uL);DEPC水;氯仿;75%DEPC乙醇;异丙醇等1、1mLTrizol样品加200uL氯仿,用力晃动15s2、冰上静置5min3、4℃12000rpm 离心15min4、小心吸取上清水相400-500uL至新的无酶EP管5、按照体积1:1加异丙醇,颠倒混匀6、置于冰上30min7、4℃12000rpm 离心10min8、倒掉上清,加入500uL75%DEPC乙醇,轻弹管底使RNA沉淀漂起9、4℃12000rpm 离心5min10、吸上清弃掉,尽量吸干净11、12000rpm 离心5min12、吸上清弃掉,尽量吸干净,开盖超净台内凉置5min13、每管加20uLDEPC水溶解,弹管底使溶解混匀14、56℃助溶10min15、置于冰上测RNA浓度(Gen5 核酸检测执行)16、擦手纸蘸蒸馏水擦RNA浓度检测板加样孔,再用擦镜纸擦干17、1234孔各加2uLDEPC水,检测,本底为绿色即可继续测样本(2uL)18、依次按编号加入2uL样本,软件关闭后重新打开,选择样本检测19、批准出结果260/280=1.8-2则样品合格二、反转录qPCR准备物品:无RNA酶大中小枪头;无RNA酶EP管(1.5mL、200uL);RTmix;DEPC水1、计算1000ng(反转录RNA上样量1000ng)的RNA体积,必要时稀释2、反转录体系20uL(RTmix 4uL ;RNA样品约2uL ;DEPC水补齐20uL )3、弹管底混匀瞬时离心4、Bio-rad 中间选项takaraRT run 16min5、dd水稀释cDNA,使cDNA浓度约为10ng/uL,100uL分装后-20℃保存三、荧光定量PCR准备物品:8联管;引物;cDNA;200uLEP管;无菌枪头1、引物稀释dd水溶解稀释引物,旋涡混匀,引物储存浓度10nM/uL2、定量PCR10uL体系引物F 0.4uL引物R 0.4uLcDNA 1uL(终浓度为1ng/uL)SYBR 5uL(含染料、DNA扩增酶、DNTP、Mg2+、扩增缓冲液等)dd水3.2uL3、布板一个指标三个重复4、取10个200uL无酶EP管,按顺序编号123456789105、按照一个指标:六个孔+2个孔(防止枪误差导致各孔不均)=8孔的剂量配制混合:引物F 0.4uL*8=3.2 uL引物R 0.4uL*8=3.2 uLSYBR 5uL*8=40 uLdd水3.2uL*8=25.6 uL6、按照布板依次加入8联管中(置于冰上),最后每孔加1 uL cDNA(P5 P10 cDNA不同),设置不加cDNA模板的阴性对照。

实时荧光定量 PCR 仪快速操作指南说明书

实时荧光定量 PCR 仪快速操作指南说明书

实时荧光定量PCR仪快速操作指南1.连接电源从包装箱里取出仪器放置在实验台上,拿出电源线和电源适配器,将电源线一端与电源适配器相连,另一端连接至交流220V电源插座(AC85~264V)电源适配器的输出端连接到仪器电源插孔。

接口插入仪器电源插孔,注意插孔方向箭头方向朝上。

打开仪器背面的电源开关开启仪器,仪器自检成功,自动进入到软件界面。

2.样品准备◼准备试剂Q1600实时荧光定量PCR仪使用0.2ml透明离心试管根据试剂要求选用10-100μl合适的加液量。

◼离心操作配置完成试剂样本的试管在放入仪器之前,要用离心机进行离心操作,确保试剂液体处于试管底部,且液体内部不含有气泡。

◼放置样品将反应管按照顺序放入加热孔内。

3.设置程序,运行实验软件操作基本步骤:◼新建实验新建实验,选择运行槽◼基本设置设置实验名称,实验类型,检测项目,选择使用的染料。

◼样本设置设置样品名称,样本ID号,选择样本类型◼程序设置设置需要的反应程序◼保存文件单击保存,保存实验文件◼运行单击运行,运行实验。

4.结果分析◼实验结束,软件自动计算Ct值,根据判定规则自动出结果。

◼如需进行熔解分析和基因分型,在软件分析类型里选择相应的分析功能。

5.结果导出◼导出实验结果单击导出,导出实验数据。

◼结果打印连接配置的热敏打印机,选中要打印的样品孔,单击打印,打印实验结果。

6.关闭仪器◼实验结束,取出反应管◼长按仪器前面板关机按键,关闭仪器◼长时间不使用仪器,请关闭仪器背部左下角电源开关。

pcr实验流程和注意事项

pcr实验流程和注意事项

PCR实验流程如下:
试剂准备阶段:在试剂贮存和准备区的超净工作台或生物安全柜进行,用确保无污染的移液器、枪头及容器等进行分装。

所有的PCR体系都应该在-20℃保存,除了ddH2O之外,其余的试剂组份需完全融化之后再加入,以免影响浓度。

配制反应体系应在快速进行,以减少非特异性扩增。

体系配制完成之后应马上进行PCR反应。

样本制备阶段:样本制备是整个PCR反应中最为关键的环节,在接收样本时一定要确保样本的密封性以及样本编号的唯一性。

严格遵守操作规程进行加样操作,操作时候尽量少说话或者不说话。

所有操作需要在生物安全柜内进行,操作前后生物安全柜需要进行紫外灯消毒,注意生物安全柜中物品的排放。

戴手套并勤于更换,要有无核酸观念。

在样本检测的同时设立对照(阳性对照、阴性对照、阴性模板、试剂对照)。

PCR实验注意事项:
引物长度通常在18-22个碱基之间。

解链温度Tm值通常要在52-58度之间。

GC含量也是一个重要的因素。

以上信息仅供参考,具体步骤和注意事项可能会因实际情况而有所不同,建议咨询专业人士获取更准确的信息。

实时定量PCR步骤

实时定量PCR步骤

实时定量PCR步骤实时定量PCR(Real Time Quantitative PCR)是一种用于检测和定量DNA序列或基因表达水平的方法。

它是PCR技术的变体,可以实时监测PCR反应的进行,并在放大过程中定量目标DNA序列的数量。

下面是实时定量PCR的详细步骤:步骤1:实验准备1.1收集所需的实验材料,包括PCR反应液组分(引物、探针、dNTPs、缓冲液、聚酶等)、PCR管和盖膜、模板DNA样品、阳性和阴性对照样品等。

1.2预先冷藏和解冻所有的试剂和样品。

1.3清洁操作台面,并准备离心机、实时荧光PCR仪和计算机等设备。

步骤2:引物和探针设计2.1根据待测目标序列,使用生物信息学工具设计引物和探针,确保具有高度特异性和高扩增效率。

2.2检查引物和探针的熔解温度是否相近,并避免二次结构和杂交问题。

步骤3:制备PCR反应液3.1根据PCR反应体系计算所需的试剂量,并根据实验板的数量和样品数量,按比例制备PCR反应液。

3.2在一个干净的离心管中,将缓冲液、dNTPs、引物、探针、酶和染料等反应组分按照特定顺序加入。

3.3使用纯水调整总反应体积,确保每个样品反应液体积相等。

步骤4:添加模板DNA4.1准备好模板DNA样品,可以是基因组DNA、cDNA或其他。

4.2将模板DNA分别加入各个PCR反应管中,注意避免污染和交叉污染。

步骤5:进行PCR反应5.1将PCR反应管密封,并在PCR仪上进行扩增。

此时,PCR仪应可提供实时荧光信号监测功能。

5.2设置PCR仪的温度程序和循环次数,通常包括热激活、扩增和延伸等不同的阶段。

5.3监测PCR仪上的实时荧光信号,并记录下所有的扩增曲线。

实时荧光信号的强度与扩增产物的数量成正比。

5.4在每个PCR循环的结束时,建议进行一次熔解曲线分析,以确定PCR产物的特异性。

步骤6:数据分析6.1使用PCR仪上的软件工具,导出扩增曲线数据。

6.2使用阈值周期(Ct)方法,根据扩增曲线与阈值线的交叉点来定量反应液中目标序列的数量。

实时荧光定量PCR详细操作步骤

实时荧光定量PCR详细操作步骤

实时荧光定量PCR详细操作步骤1.实验前准备a.首先,准备所需的引物和探针。

引物是用于扩增待测DNA或RNA序列的短链DNA片段,而探针是荧光标记的DNA分子,用于标记和检测扩增产物。

可以使用商业引物和探针,或者设计自定义的引物和探针。

b.准备样品。

样品可以是DNA或RNA提取物,也可以是cDNA反应产物。

确保样品的质量和纯度,避免污染和降解。

c. 准备Master Mix。

Master Mix是一个预混合的反应液,包含引物、探针、核酸酶、逆转录酶、聚合酶和其他所需的试剂。

根据实验设计确定Master Mix的配方和浓度。

2.反应管设定a. 将适量的Master Mix加入每个反应管中。

根据实验设计,确定每个反应管中所需Master Mix的体积。

b.加入适量的模板DNA或RNA溶液。

根据实验设计,确定每个反应管中所需模板溶液的体积。

c.加入适量的引物和探针。

根据实验设计,确定每个反应管中所需引物和探针的体积。

d.加入适量的缓冲溶液和其他试剂。

根据实验设计,确定每个反应管中所需缓冲溶液和其他试剂的体积。

3.PCR程序设定a.设定PCR程序。

根据引物和探针的特性,确定PCR程序的温度和时间参数。

通常包括一个初始变性步骤(95°C,5分钟),40个循环的扩增步骤(95°C,30秒;温度调节,30秒;扩增,30秒-1分钟),以及最终的降温步骤(4°C或25°C)。

b.设定数据采集方式。

实时荧光定量PCR系统可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号变化,并实时记录和分析数据。

根据实验设计和PCR程序,选择合适的数据采集方式,在合适的时间点记录荧光信号。

4.实验操作a.将反应管安置在实时荧光定量PCR仪中。

确保反应管正确放置在PCR仪的样品槽中,并密封好。

b.启动PCR程序。

根据PCR仪的操作说明,启动PCR程序并开始反应。

c. 监测PCR反应过程。

实时观察PCR反应过程中的荧光信号变化。

定量PCR加样操作流程

定量PCR加样操作流程

定量PCR加样操作流程定量PCR(Quantitative PCR,qPCR)是一种用于精确测定目标DNA 或RNA分子在样本中的相对或绝对含量的技术。

在定量PCR实验中,需要进行一系列加样操作,以确保正确反映目标分子的浓度。

下面将详细介绍定量PCR的加样操作流程。

1.设计引物和探针:在进行定量PCR之前,需要设计一对引物和一种探针,用于扩增和检测目标分子的特定序列。

引物和探针的设计需要考虑到特异性和效率,并且应该使扩增产物的大小恰好在所需范围内。

2.准备实验材料:在进行定量PCR之前,需要准备一系列实验材料,包括:-收集所需的引物和探针;-准备PCR反应液,包括缓冲液、dNTPs、酶、MgCl2和DNA模板等;-防护用品,如手套和护目镜,以确保实验操作的安全性。

3.制备PCR反应体系:根据PCR反应的种类和厂家提供的建议,按照实验方案准备PCR反应液。

反应液通常由多个组分组成,其中包括DNA模板、引物、探针、酶、缓冲液、dNTPs、MgCl2和水。

4.为每个样品制备PCR反应管:为每个样品准备PCR反应管,确保每个反应管都包含相同的PCR反应液。

如果有多个样品需要测试,可以通过分装PCR反应液到每个反应管中来实现。

5.添加DNA模板:在每个PCR反应管中,将一定体积的DNA模板加入到PCR反应液中。

DNA模板的体积应当根据所用方法和预期浓度来确定。

6.加入引物和探针:根据引物和探针的设计,向每个PCR反应管中加入适量的引物和探针。

确保每个反应管都包含相同浓度的引物和探针。

7.混匀反应液:通过轻轻的振动或轻微的离心来混合PCR反应液,以确保其中的各个组分均匀混合。

8.加盖或密封反应管:将PCR反应管盖上或用密封膜密封,以防止反应过程中的污染和蒸发。

9.进行PCR扩增:将PCR反应管置于热循环仪中进行PCR扩增。

根据实验方案设置PCR程序,包括预扩增步骤、扩增步骤和终止步骤。

10.数据分析和解读:在PCR扩增完成后,可以使用荧光定量PCR仪测量每个反应管中荧光信号的强度。

定性pcr操作流程

定性pcr操作流程

定性pcr操作流程
定性PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种用于检测DNA
序列的技术,通过扩增特定DNA片段来确定样本中是否存在目标序列。

下面将介绍定性PCR的操作流程。

1. 样本准备:首先需要准备待测样本,可以是DNA提取物、细
胞提取物或者其他含有目标DNA的样本。

确保样本的纯度和浓度符
合实验要求。

2. 反应体系准备:将PCR反应体系按照实验方案准备好,通常
包括DNA模板、引物、核酸酶、缓冲液、dNTPs等。

引物是PCR反
应的关键,它们是用于扩增目标DNA片段的短链DNA片段。

3. PCR扩增:将反应体系加入PCR仪器中,设置好扩增程序。

PCR程序通常包括变性、退火和延伸三个步骤,通过循环这三个步
骤来扩增目标DNA片段。

4. 凝胶电泳:扩增反应结束后,将PCR产物进行凝胶电泳分析。

将PCR产物与DNA分子量标准一起加载到琼脂糖凝胶上,然后进行
电泳分离。

通过观察凝胶图谱,可以确定PCR反应是否成功,目标DNA片段是否存在。

5. 结果分析:根据凝胶电泳结果,判断PCR反应是否成功,目
标DNA片段是否存在。

如果目标DNA片段存在,则可以进一步进行
测序或其他实验。

总的来说,定性PCR操作流程包括样本准备、反应体系准备、PCR扩增、凝胶电泳和结果分析等步骤。

通过这些步骤,可以快速、准确地检测目标DNA片段的存在与否,为后续实验提供重要数据支持。

PCR技术在分子生物学研究中具有广泛的应用,为科学研究和
临床诊断提供了重要的工具。

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QPS-201加样流程和Step One Plus仪器的仪器操作
要准备的东西:
1.八排管和盖子
2.96孔细胞培养板
3.移液器:10ul,20ul,100ul,200ul。

4.枪头10ul,20ul,100ul,200ul或者300ul。

5.200ul和600ul的PCR管。

6.试剂:QPk-201,上下游引物,cDNA,去RNA酶的PCR水
7.注意事项:
A.引物的储存浓度100nm,工作浓度:5-10nmol,引物要过量,上下游引物要先混匀在一起,然后再加。

内参actin和目标基因的引物都要混匀。

混匀后的引物可用半个月,用时要反复混匀,水样的东西混20下,油状的(酶)东西至少要混30下。

B.试剂配总管用,cDNA和酶mix配一管,引物和水配一管。

混匀之后,再分别加到管子里。

为什么试剂要配总管呢?cDNA模板量很少,所以加多加少对实验影响很大,酶加10ul,样多,少量的东西要想混匀,必须放在大量的东西里这样再去混匀,就可以使每个管子里的样品都能保证是一致的。

C.内参和目标基因都要跑3个复孔,取平均值,差异CT值要在0.5之内,如果Ct值>0.5,结果就不可信,要重新再做。

(一)QPk-201加样流程:
用QPk-201做样品体系是20ul的。

cDNA :2ul
PCR水:6ul
上下游引物共:2ul
酶MIX:10ul
一共是20ul体系。

把cDNA :2ul和酶mix:10ul共12ul配一管。

把引物:2ul和水6ul共8ul配一管。

以下以样品为例,加样流程如下:
目标基因STOB1,样品六个,编号:1,2,3,C5,C6,C7
内参基因actin
如何计算是关键:
6个样品,每个样品配一管,再分6次加,但是要考虑都损失,所以要多加10%的量,以避免最后没得加了。

cDNA和酶配一管①:
cDNA:2×6×1.1=13.2ul
酶Mix:10×6×1.1=66ul,在总管里吹打30次混匀,取12ul。

引物和水配一管②:
引物:2×18×1.1=39.6ul
PCR水:6×18×1.1=118.8ul,在总管里吹打20次混匀,取8ul。

配完之后要混匀。

剩下的就是加样,贴在一侧的壁上,加样时,先吹打,再吸,贴壁打到底,按着不松,把移液器收回来。

加一个样品,就换一个枪头。

加另一管的时候,把管子反过来,再在这一侧壁上加管②,的就不用换枪头了。

这个加样的步骤一般是在碎冰上操作的,试剂一定要放在冰上的。

加完之后,轻轻的盖上盖子,放在离心机里离心,让试剂都落到管子底部去。

离心完之后,就可以放到定量PCR仪的黑色的96孔板子上了,然后打开机器,放进去,开始设置了。

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