枯草芽孢杆菌表达手册 个人翻译中文版
枯草芽孢杆菌遗传表达方法
枯草芽孢杆菌遗传表达方法
枯草芽孢杆菌那可是个厉害的小家伙!咱先说说它的遗传表达方法步骤吧。
嘿,你想啊,就像搭积木一样,首先得准备好各种材料。
找到合适的载体,这载体就好比是一辆小货车,能把咱要的基因运到枯草芽孢杆菌里面去。
然后把目的基因连接到载体上,这一步可得小心翼翼,就像给项链穿珠子,不能有一点差错。
接着把连接好的载体导入枯草芽孢杆菌,这就像是把新成员介绍给大家庭。
导入的方法有好多呢,比如转化、转导啥的。
那注意事项呢?哎呀,可不能马虎。
载体得选合适了,不然就像穿了不合脚的鞋子,走不了路。
基因连接的时候要保证准确无误,要是弄错了,那可就糟糕啦!导入的时候条件也得控制好,温度啦、浓度啦,都得恰到好处。
再说安全性,这枯草芽孢杆菌一般来说还挺安全的。
它不像有些家伙那么调皮捣蛋,基本不会对人和环境造成大的危害。
稳定性也不错哦,一旦基因表达成功,通常能比较稳定地发挥作用。
就像一个靠谱的小伙伴,不会突然掉链子。
它的应用场景可广啦!在食品工业中,可以用来生产各种酶,就像一个小魔法师,变出各种有用的东西。
在农业上呢,能帮助植物生长,抵抗
病虫害,这不就像一个小卫士嘛!在医药领域也有大用处,可以生产一些药物成分。
那优势呢?成本低呀,操作相对简单,而且表达效率还挺高。
这就好比找到了一个既便宜又好用的工具,谁不喜欢呢?
实际案例来啦!有个食品加工厂,用枯草芽孢杆菌生产一种酶,大大提高了生产效率,产品质量也更好了。
这效果,那可真是杠杠的!
总之,枯草芽孢杆菌的遗传表达方法是个很有前途的技术,能在很多领域大显身手,给我们的生活带来更多的便利和惊喜。
枯草芽孢杆菌使用说明
枯草芽孢杆菌使用说明枯草芽孢杆菌,听起来是不是很专业?它就是咱们生活中一个不起眼的小帮手。
别看名字有点儿拗口,这小家伙可是个了不起的角色。
你知道吗?它在土壤里就像个勤劳的小蚂蚁,默默地工作,帮助植物更好地生长,简直就是植物界的保姆。
说起这家伙,真是让人爱不释手。
它的好处多得数不胜数,像是为植物保驾护航,保护它们免受各种病菌的侵扰,真是个“贴心小棉袄”。
咱们平时种花种菜,很多时候都想让植物长得更茁壮。
可别小看了这枯草芽孢杆菌,它不仅能提高植物的免疫力,还能让土壤更加肥沃。
要是你觉得土壤干巴巴的,没关系,来点儿枯草芽孢杆菌,立刻给土壤加点儿营养。
就像给自己喝一杯营养奶昔,嗖的一下,身体立马有劲儿。
这小东西还能分泌一些对植物有益的物质,简直就是个“调味师”。
它帮植物吸收营养,能把土壤里的矿物质变得更容易被植物吸收,这样植物就能长得更加健康。
说到使用,枯草芽孢杆菌可真是方便。
你可以把它拌到土里,或者稀释后喷洒在叶子上。
就像给植物洗个澡,清爽又舒服。
它耐高温、耐干旱,真是个“百变小天才”,无论你是在北方的干旱地区,还是南方的潮湿环境,它都能适应。
用起来也简单,跟喝水似的,随便往土里一撒,植物就能感受到它的温暖。
要是你每天都给植物来点儿,它们肯定会笑得合不拢嘴。
很多人用它的时候,还不知道这小家伙的神奇之处。
除了让植物长得更好,它对环境也有好处。
可以说是个“环保小卫士”。
它能减少化肥的使用,让土壤恢复生机,保护咱们的地球母亲。
植物不仅能长得好,连空气也变得更清新,简直是一举两得。
你想想,周围的花花草草都长得旺盛,空气清新,简直就像走进了仙境,心情都变得好起来。
使用它的时候也得讲究方法。
别想着越多越好,适量才是关键。
就像咱们喝酒,喝多了可就闹心了。
这小家伙用得当,效果才能最大化。
别急,慢慢来,给植物一点儿时间,它们会把你想要的回报都送回来。
使用后,观察植物的变化,简直就像看着小宝宝慢慢长大,心里那个满足啊,别提有多开心了。
枯草芽孢杆菌表达系统
B.subtilis表达系统有着较多的优点,相对于大肠杆菌 表达系统研究较少,存在问题也很多,仍需要进行大量的实 验对它的稳定性以及表达系统进行更好的了解 其优势将逐步显现,成为未来外源基因最具潜力的表达 载体。
参考文献: 《枯草芽孢杆菌表达系统的研究进展》 《枯草芽孢杆菌新型表达系统和遗传操作体系的建立和应用》 《枯草芽孢杆菌的研究与应用》
• 限制外源蛋白在枯草杆菌中高效表达的瓶颈。 • 质粒本身的不稳定性: 分离型不稳定:整个质粒丢失 结构型不稳定:质粒本身非常规重组 • 菌株特性引起的不稳定性 原噬菌体3区域中编码的基因使得重组质粒的转化 效率急剧下降,同时对外源基因有排斥性。 • 如何解决: 构建整合质粒,构建原噬菌体3区域的缺陷性菌株。
基因工程中新型表达系统
-B.subtilis 表达系统
生物工程学院 生工1005
Diagram
宿主菌株表达载体存 Nhomakorabea问题工业应用
宿主菌株—枯草芽孢杆菌
• B. subtilis属革兰氏阳性菌,细胞壁仅含肽聚糖和磷壁质。 • 非致病性的重要工业微生物,其全基因组测序已经完成。人们 对其遗传背景和生理特性的了解仅次于E.coli。 • 70年代后,随着DNA重组技术的发展,金黄色葡萄球菌抗性 标记质粒的应用,该表达系统发展更为迅速。 • 成功表达了多种外源基因,广泛应用于工业生产,发现了本系 统的许多特点,同时也暴露出本系统存在蛋白酶和质粒不稳定 等问题.
优点:相对分子质量小,有唯一的酶切位点,较高的拷贝数,
适合筛选的抗性标记
以天然质粒为基础构建:双标记质粒,穿梭质粒,探针质粒等
2、整合质粒载体 在大肠杆菌质粒载体基础上构建,含有芽孢杆菌的抗
性标记以及待整合目的基因,能通过同源重组整合到宿
微生物学术语双语(中英文)对照
Brock Biology of MicroorganismsBilingual Glossary(For Internal Circulation Only)微生物学术语双语(中英文)对照北京林业大学生物科学与技术学院微生物教研室谢响明生物秀-专心做生物www.bbioo.com2007年6月10日Catalogue目录Chapter1 Microorganisms and MicrobiologyChapter 2 An Overview of Microbial LifeChapter 3 MacromoleculesChapter 4 Cell Structure/FunctionChapter5 Nutrition, Laboratory Culture, and Metabolism of MicroorganismsChapter 6 Microbial GrowthChapter 7 Principles of Microbial Molecular Biology Chapter 8 Regulation of Gene ExpressionChapter 9 Essentials of VirologyChapter 10 Bacterial GeneticsChapter 11 Microbial Evolution and Systematics Chapter 15 Microbial GenomicsChapter 18 Methods in Microbial EcologyChapter 19 Microbial Habitats, Nutrients Cycles Chapter 20 Microbial Growth ControlBilingual Glossary for MicrobiologyChapter 1Landmark:里程碑Ramifications:分支non-cellular life :非细胞生命prion:朊病毒microbial diversity and evolution:微生物的多样性和进化pathogens:病原体genetic engineering:基因工程entity:实体macromolecules:大分子Reproduction:繁殖Differentiation:分化Communication:信息沟通coding devices:编码机制attributes:特征,品质coordination.:协调regulation:调节optimally attuned to最适地调和populations:种群habitat.:生境assemblages:集合体microbial communities:微生物群落biofilms:生物被膜hot springs:温泉Aquatic:水生的Terrestrial:陆生的Prokaryotic cells:原核细胞ecosystem :生态系统biomass:生物量nitrogen:氮phosphorus:磷Bubonic Plague:鼠疫Fleas:跳蚤Mortality:死亡率Grotesque:奇异Liquefy:液化Influenza and pneumonia:流感和肺炎Tuberculosis:肺结核spontaneous generation:自然发生学说microbes:微生物Broth:肉汤Flask:烧瓶Guncotton filters:棉花滤器Dissolved:溶解的Ether:醚Particles:微粒flask with swan neck:曲颈瓶sterilization:灭菌vaccines:疫苗anthrax:炭疽热fowl cholera:禽流感rabies:狂犬病Germ theory:病菌说Koch’s postulates:科赫假设(法则) contagious diseases:传染病artificially infected animals:人工感染的动物Solid medium:固体培养基Gelatin:明胶Agar:琼脂Colony formation:菌落形成Differential staining:鉴别染色Pure culture:纯培养isolation:分离, 隔离inoculation:接种Tuberculin:结核菌素Diagnosis:诊断Subdisciplines:(学科的)分支enrichment culture:富集培养aerobic:需氧的N-fixing bacteria:固氮细菌sulfate-reducing:硫酸盐还原sulfur-oxidizing bacteria:硫氧化细菌root nodule:根瘤Lactobacillus:乳酸杆菌tobacco mosaic virus:烟草花叶病毒tenets:原则virology:病毒学nitrifying bacteria:硝化细菌nitrification:硝化作用oxidation of ammonia to nitrate:从氨氧化为硝酸盐hydrogen sulfide:硫化氰chemolithotrophy:无机化能营养型autotrophs:自养生物anaerobe :厌氧生物Clostridium pasteurianum:巴斯德羧菌属Medical microbiology and immunology:医学微生物学和免疫学Aquatic microbiology:水生微生物学Microbial ecology:微生物生态学Microbial systematic:微生物的系统学Microbial physiology:微生物生理学Cytology :细胞学Bacterial genetics:细菌遗传学Chapter 2Evolutionary History:进化史Elements:原理,基础Viral Structure:病毒结构The Tree of Life:生命树Physiological:生理学的Eukaryotic:真核的Cytoplasmic (cell)membrane:细胞质膜Cytoplasm:细胞质Macromolecules:大分子Ribosome:核糖体organic molecules:有机分子inorganic ions:无机离子rod-shaped prokaryote:杆状原核生物organelles:细胞器Archaea:古生菌Nucleus:细胞核(nuclear的复数)Mitochondrion(Mitochondrion复数)线粒体Chloroplast:叶绿体Metazoans:后生生物Cytoplasmic:细胞质的Membrane:膜,隔膜Endoplasmic reticulum:内质网Nucleoid:类核,拟核Nucleolus:核仁Nuclear:核的,细胞核Static:静态的metabolic abilities:代谢能力biosynthetic:生物合成genetic alterations:遗传改造Genomes:基因组Chromosome:染色体Circular:环状copy:拷贝haploid:单倍体extrachromosomal:染色体外的plasmids:质粒conferring:赋予properties:性质,特性Packaged :包裹的Yeast:酵母Folding:折叠的Packing:包装gene expression:基因表达diploid:二倍体cell division:细胞分裂mitosis:有丝分裂mitotic division:有丝分裂a full complement of genes:一整套基因meiosis:减数分裂gametes:配子sexual reproduction:有性繁殖Fusion:融合Zygote:接合子,受精卵Sequenced:测序的Phylogeny:系统发生Phylogenetically:系统发生地deduced from 从推论出comparative sequencing:比较测序Ribosomal RNA:核糖体RNAbarometers :气压计clinic:临床microbiology:微生物学identical copies:相同的拷贝polymerase chain reaction (PCR):聚合酶链式反应aligned :排列的algorithm:运算法则pair-wise comparisons:配对比较Domains:域Lineages:血统,世系Proteobacteria:蛋白细菌Cyanobacteria:蓝细菌Hyperthermophiles:极端嗜热菌Methanogens:产甲烷菌extreme halophiles:极端嗜盐菌slime molds:黏菌flagellates:鞭毛虫giardia:双滴虫(贾弟虫属)Eukarya (eukaryotes):真核生物Morphology:形态学Motility:运动性Mechanism:机制Developmental biology:发育生物学Adaptation:适应environmental extremes:极端环境Organic chemicals:有机化合物Inorganic chemicals:无机化合物Oxidizing:氧化Conserved:保存,保留high-energy compound:高能量化合物Aerobes:需氧生物Anaerobes:厌氧生物Chemoorganotrophs:化能有机营养生物Chemolithotrophs:化能无机营养生物Phototrophic:光和营养的Pigments:色素major nutrient:主要营养Heterotrophic:异养的Autotrophic:自养的Autotrophs;自养生物primary producers:初级生产者extreme environmental habitats:极端环境生境extremophiles:极端环境微生物,嗜极菌hot spring:温泉tolerant :忍耐的pathogenic:致病的Phylum:门Aquifex:产液菌属Thermotoga:栖热孢菌属green nonsulfur bacteria:绿色非硫细菌deinococcus:异常球菌属spirochetes:螺旋体green sulfur bacteria紫硫细菌planctomyces:浮霉状菌属phylogenetic:系统发生的depicted:描述的marine:海洋halobacterium:盐杆菌属natronobacterium:嗜盐碱杆菌属halophilic methanogens:嗜盐产烷生物methanosarcina:甲烷八叠球菌属thermoplasma:热源体属methanobacterium:甲烷杆菌属methanococcus:甲烷球菌属pyrococcus:火球菌属pyrolobus:热叶菌属methanopyrus:嗜热甲烷菌属thermoproteus:热变形菌属desulfurococcus:硫还原球菌属sulfolobus:硫化叶菌属hyperthermophiles:嗜热细菌halophiles:嗜盐菌acidophiles:嗜酸菌filamentous:丝状的Protozoans:原生动物Motile:运动的Lichens:地衣Diplomonads:双滴虫Trichomonads:毛滴虫,微孢子虫Flagellates:鞭毛虫Ciliates:纤毛虫Green algae:绿藻Red algae:红藻Fungi:真菌Diatoms:硅藻属Brown algae:褐藻Apex:顶点Chapter 4Locomotion:运动、行动Inclusions:内含物、包涵物Light Microscopy:光学显微镜Bright-field:明视野Phase contrast:相差Dark-field:暗视野Fluorescence:荧光Magnification:放大率Resolution:分辨率Staining:染色Increasing Contrast for Bright-Field Microscopy:提高明视野显微镜的对比效果positively charged (cationic):带正电的(阳离子,正离子)negatively charged:带负电的polysaccharide:多糖cationic dyes:阳离子染料Methylene blue:亚甲蓝Crystal violet:结晶紫Safranin:番红Differential stains-Gram stain:鉴别染色—格兰氏染色Gram-positive:格兰氏阳性Gram-negative:格兰氏阴性ethanol decolorizing:乙醇脱色refractive index:折射率specimen:样品scatter:分散,散射chlorophyll (autofluorescence):叶绿素(自身荧光)Three-Dimensional Imaging:三维成像Drawbacks:限制,缺点Differential Interference Contrast Microscopy (DIC):相差干涉显微镜Nucleus:核Eukaryotic cells:真核细胞Spores:孢子、芽孢Vacuole:液泡Granule:颗粒internal structure:内部结构Atomic Force Microscopy (AFM):原子力显微镜Fixatives:固定剂Coatings:膜、层、覆盖物Hydrated:水合物Confocal Scanning Laser Microscopy (CSLM):聚焦扫描激光显微镜Couples:连接,伴随Habitat:生境resolving power:分辨率vacuum:真空Transmission Electron Microscope (TEM):透射电子显微镜thin sectioning, 超薄切片EM staining:电子显微镜染色Scanning Electron Microscope (SEM):扫描电子显微镜external features:外部特征prokaryote:原核生物Coccus (cocci):球菌Rod:杆菌Spirilla:螺菌Spirochetes:螺旋体Appendaged bacteria:附属细菌Filamentous bacteria:丝状细菌in general inversely proportional to cell size:从大体上说是于细胞大小成反比的nanobacteria:纳米细菌precipitates:沉淀物biofilms:生物膜surface-to-volume (S/V) ratio表面积与体积比Membrane Transport Systems:膜运输系统Peptidoglycan:肽聚糖outer Membrane:外膜Glycerol backbone:甘油主键fatty acids:脂肪酸phosphate-containing groups-ester linkage:含有磷酸的基团—酯键phospholipid bilayer:磷脂双分子层hydrophobic:疏水的hydrophilic:亲水的phosphate group:磷酸基团embedded:内嵌的hydrophobic external surface spanning the membrane:疏水的外表面跨膜hydrogen bonds:氢键hydrophobic interaction:疏水相互作用transverse:横切fluid mosaic:流动镶嵌Membrane Strengthening Agents: Sterols and Hopanoids:膜巩固剂:固醇和类何帕烷chemical composition:化学组分methanotrophic:嗜甲烷细菌mycoplasmas:支原体exception:例外side chains:侧链isoprene:异戊二烯Glycerol diethers:甘油二醚glycerol tetraethers:甘油四醚monolayers:单分子层hyperthermophilic:极端嗜热Permeability barrier:渗透屏障(透性障)passive leakage:被动泄漏Protein anchor:蛋白锚定Energy conservation:能量贮存Proton motive force:质子动力Aquaporins:水通道蛋白low osmotic conditions:低渗透势条件hypo-osmotic shock:低渗透压休克Simple diffusion:简单扩散Carrier-mediated process:载体介导过程Uptake:摄取、吸收Saturated:饱和的Symporter:同向运输蛋白Uniporter:单向运输蛋白Antiporters:逆向运输蛋白Lac Permease:乳糖透过酶Lactose:乳糖Group translocation:基团转位Phosphotransferase system:磷酸转移酶系统Glucose:葡萄糖Mannose:甘露糖Fructose:果糖Phosphorylation:磷酸化Dephosphorylation:去磷酸化cascading fashion:级联方式phosphoenolpyruvate:磷酸烯醇式丙酮酸Periplasmic:周质的periplasmic -binding protein:周质结合蛋白maltose:麦芽糖disaccharide sugar:双糖a family of related proteins:相关蛋白的家族High affinity for substrate:对底物的高亲和力Hydrolysis:水解drive transport across the membrane:促进跨膜运输translocase:移位酶amylase:淀粉酶cellulase:纤维素酶starch:淀粉cellulose:纤维素toxin:毒素deleterious:有害的solutes:溶质turgor pressure:膨胀压Multilayered structure and complex:多层结构和复合体Periplasm space:周质空间Teichoic acids:磷壁酸ribitol phosphate residues核糖醇磷酸盐残基Lipoteichoic acid:脂磷壁酸Murein:胞壁质Derive:衍生物N-acetylglucosamine (G):N—乙酰葡糖胺N-acetylmuramic acid (M):N—乙酰胞壁酸L-alanine:L—丙氨酸D-glutamic acid:D—谷氨酸L-lysine:L—赖氨酸diaminopimelic acid (DAP):二氨基庚二酸tetrapeptide:四肽glycan:聚糖ß-1,4 linkage:ß-1,4连接interbridge:肽间桥capsular polymers:荚膜Protoplasts:原生质体Spheroplasts:原生质球Mycoplasma:支原体Osmotically:渗透地Thermoplasma:热原体属Lysozyme:溶菌酶Penicillin:青霉素ß-1,4 –glycosidic bonds:ß-1,4糖苷键saliva:唾液autolysin:自溶素transpeptidation:转肽Pseudopeptidoglycan:假肽聚糖N-acetyltalosaminuronic acids:N-乙酰塔罗糖胺糖醛酸Glycosidic bonds:糖苷键Polysaccharide:多糖Glycoprotein:糖蛋白Methanosarcina:甲烷八叠球菌glucuronic acid葡糖醛酸:galactosamine:半乳糖胺acetate:乙酸haiophilic Archaea:嗜盐古生菌Halococcus:盐球菌Paracrystalline surface layer:类结晶表面层hexagonal symmetry:六角对称lipopolysaccharide (LPS layer) :脂多糖Core polysaccharide:核心多糖O-polysaccharide:O—特异侧链LipidA:类脂ADisaccharide:双糖Endotoxin:内毒素Pathogenic:致病的Shigella:志贺氏菌属mol-weight :分子量Hydrolytic enzymes:水解酶Chemoreceptor:化学受体Flagella:鞭毛(复数)Flagellum:鞭毛Peritrichous:周生Polar:极生Lophotrichous:丛生Filament:鞭毛丝Flagellin:鞭毛蛋白Hook:钩motor portion:motor蛋白L-ring:L环P-ring:P环MS-ring:MS环Flexing:摆动Cheetah:猎豹Gliding:滑动Cyanobacteria:蓝细菌Myxococcus xanthus:黄色粘球菌physical or chemical gradients:物理或化学梯度Chemotaxes:趋化性Phototaxes:趋光性Other Taxes:其他趋性Temporal:时间的Spatial:空间的Tumbles:翻滚Attractant:引诱剂Scotophobotaxis (darkness escaping phototaxis):避暗趋光性Aerotaxis:趋氧性Osmotaxis:趋渗透性Elucidated:阐述signal transduction pathway,:信号传导途径Gas Vesicle:气泡Endospore:芽孢Fimbriae:菌毛Pili:性毛Pellicles:菌膜Conjugation:接合Symmetries:对称性Capsules and Slime Layers:荚膜和黏液层The Glycocalyx:多糖包被Matrix:矩阵Deformed:变形Phagocytic:吞噬细胞的Desiccation:干燥作用Carbon Storage Polymers:碳源贮存物PHB, poly-ß-hydroxybutyric acid:聚ß羟丁酸PHA, poly-ß-hydroxyalkanoate:聚ß羟基链烷酸Magnetosomes:磁小体Intracellular crystal particles:细胞内晶体颗粒Magnetotaxis:趋磁性aquatic Bacteria:水生细菌buoyancy:浮力purple and green phototrophic bacteria:紫色和绿色光养细菌watertight:防水的ribs:脊ß-sheet:ß折叠ą-helix:ą螺旋Germination:萌发Halotolerant:耐盐的Permian:休眠Dominican amberGut:消化道Morphology:形态学Refractile:折光的Exosporium:孢子外壁Cortex:皮层Calcium-dipicolinic acid complex:钙—吡啶二羧酸Cytoplasm:细胞质Small acid-soluble spore proteins (SASPs:酸溶小芽孢蛋白Ceases:终止Sporulation:芽孢形成Bacillus subtili:枯草芽孢杆菌s Outgrowth:生长Chapter 51. Oxidation-Reduction 氧化还原反应2. Catabolic Pathways 异化途径3. Proton Motive Force 质子动势4. Macronutrients 大量营养元素5. Cytochromes 细胞色素6. cellular respiration 细胞呼吸7. Siderophores 铁传递蛋白8. hydroxamate, 异羟肟酸9.enterobactin 肠杆菌素10.Acuqchelin儿茶酚11. Micronutrients 微量营养元素12. Trace elements微量元素13. Streptococcus链球菌属14. Lactobacillus乳杆菌属15. Leuconostoc明串球菌属16. distilled water 蒸馏水17. casein 酪蛋白18. soybean 大豆19. Leuconostoc mesenteroides肠膜明串珠菌20. Fastidious 营养复杂的,挑剔的21. Aseptic Technique 无菌技术22. Exergonic 放能的23. Endergonic 吸能的24. Redox 氧化还原作用25. hydrogen atom 氢原子26. reactants 反应物27. Chemoorganotrophy 化能有机营养28. Photophosphorylation 光和磷酸化29. Pyruvate 丙酮酸盐(或酯)30. Glycolysis 糖酵解31. glyceraldehyde 3-phosphate 3-磷酸甘油醛32. Saccharomyces cerevisa e啤酒酵母33. Beverage 饮料34. Yogurt 酸奶酪,酵母乳35. Pickled vegetables 盐渍蔬菜36. anaerobically 厌氧地37. Aerobic oxidation 有氧氧化38. Anaerobic oxidation 无氧氧化39. Dehydrogenase 脱氢酶40. Flavoproteins 黄素蛋白41. Iron-sulfur proteins 铁硫蛋白42. Quinones-non-protein 辅酶Q43. Heme 亚铁血红素44. Chemiosmosis 化学渗透势45. electrochemically potential 电子势46. alkaline 碱性的47. headpiece 帽子,头盔48. cyanide 氰化物49. Dinitrophenol(DNP) 二硝基苯酚50. Dicumarol 血液凝固防止剂51. the Citric Acid Cycle 柠檬酸循环52. aerobic respiration有氧呼吸53. Nitrate 硝酸盐54. ferric iron 铁离子55. sulfate 硫酸盐56. carbonate 碳酸盐57. Chemolithotrophy 矿质(无机)化能营养58. Ammonia 氨,氨水59. Chemolithotrophs 化能自养60. chemoorganotrophs 化能异养61. Phototrophy 光合营养62. Photoautotrophs 光合自养生物63. Phtoheterotrophs 光合异养生物64. Catabolism 分解代谢65. Anabolism 合成代谢Chapter 6Binary Fission二分裂Peptidoglycan肽聚糖Viable Counts活菌计数Turbidity浊度Continuous Culture连续培养Preexisting先前存在的Duplicate复制Monomers单体Coenzymes辅酶Cofactors辅助因子Polymerization reactions聚合反应Polymers聚合体Fts(f ilamentous t emperature s ensitive )Protein :丝状温敏蛋白mitochondria 线粒体chloroplasts叶绿体tubulin微管蛋白Divisome:分裂体Apparatus设备,仪器Cylinder圆柱体polymerize to form an intact ring聚合形成完整环penicillin青霉素MreBhomology 相同actin肌动蛋白cytoskeleton细胞骨架structural integrity结构的完整性autolysins自溶素lysozyme溶解酵素bactoprenol:细菌萜醇N-acetyl glucosamine N-乙酰葡糖胺N-acetylemuramic acid N-乙酰胞壁酸Pentapeptide peptidoglycan precursors五肽肽聚糖前体物Transpeptidation 转肽作用muramic acid residues 胞壁酸残基adjacent glycan chains 邻近多糖链noteworthy 值得注目的periplasm 周质Unsterilized 未灭菌的Detrimental 有害的Slope 斜面Semilogarithmic 半对数的Vessel 导管,器皿Elapsed时间流逝Inoculum 接种体Cryptic 秘密的Counting chambers:计数室plate count 平板计数colony count菌落计数Serial Dilutions 系列稀释Statistically:统计学地colony-forming unit 菌落形成单位Anomaly 不规则Magnitude 数量,量级Photometer 光度计Spectrophotometer 分光光度计The Chemostat 恒化器Cardinal 主要的,最重要的Optimum 最适宜的Pschrophile 嗜冷生物Mesophile 嗜温生物Thermophile 嗜热生物Hyperthermophile 极端嗜热生物Extremophiles 极端生物Psychrotolerant 耐寒的unsaturated fatty acids 不饱和脂肪酸morphological and physiological types形态的和生理的类型a critical amino acid substitution关键的氨基酸替代物counterpart 副本,配对物hydrophobic interiors 疏水的内部saturated fatty acids 饱和脂肪酸isoprene 异戊二烯monolayer 单层melting 熔化annealing退火Acidophile 嗜酸细菌Thiobacillus硫杆菌属Sulfolobus 硫化叶菌属Thermoplasma热源体属Alkaliphile 嗜碱微生物Carotenoids:类胡萝卜素Proteases 蛋白酶Lipases 脂肪酶Detergent 清洁剂Water activity:水活度vapor pressure 蒸汽压Osmophiles 嗜渗透微生物Xerophiles 旱生生物Sucrose 蔗糖Trehalose 海藻糖Glycerol 甘油,丙三醇Glycosides 配糖类Glycine 甘氨酸,氨基乙酸Betaine 甜菜碱Praline 果仁糖Staphylococcus葡萄球菌potassium ions钾离子Aerobes 需氧生物Anaerobes 厌氧生物thioglycolate broth巯基乙酸盐肉汤Anoxic jar 厌氧罐anoxic glove bag 厌氧手套peroxidase enzymes 过氧化物酶Airborn bacteria 空气携带菌Catalase 过氧化氢酶Peroxidase 过氧化物酶Superoxide dismutase 超氧化歧化酶(SOD)Superoxide reductase 超氧化还原酶obligately anaerobic:专性厌氧的Pyrococcus furiousus:激烈热球菌Chapter 7Pneumococcus 肺炎球菌Pathogenic 致病的Pneumonia 肺炎polysaccharide capsule 多糖荚膜pathogenicity 致病性transformation 转化Versatile 通用的,万能的in vivo体内in vitro体外ultracentrifugal, 超离心的diffusive 扩散electrophoretic 电泳的Polypeptide cleaving enzymes 多肽裂解酶Ribonulclease 核糖核酸酶Deoxyribonuclease 脱氧核糖核酸酶Amino acid 氨基酸hydrogen bonds 氢键grooves 凹槽polynucleotide多(聚)核苷酸Supercoiling 超螺旋Twisted 盘旋Predominantly 主要地Nucleosome 核小体Torsion 扭转Gyrase 解旋酶Topoisomerase:拓扑异构酶Nonchromosomal 非染色体的Extracellular 细胞外的Templates 模板deoxyribonucleic acid 脱氧核糖核酸isotope同位素Density gradient equilibrium sedimentation密度梯度平衡沉降Cesium chloride 氯化铯Centrifugation 离心Detection of peaks检测高峰fidelity 忠诚度dilemma 进退两难的局面Okazaki fragment 冈崎片断Polymerase 聚合酶Exonuclease 核酸外切酶Ligase 连接酶Helicase 螺旋酶Initiation 起始Elongation 延伸Termination 终止Triphosphate 三磷酸盐Purine 嘌呤Bacillus subtilis :枯草芽孢杆菌intrinsic terminators 内在终止子Transcription 转录Cotranscribed 共转录Polycistronic 多顺反子性的Operon 操纵子introns 内含子exons 外显子Splicing 拼接Ribonucleoprotein核蛋白(略作RNP)Capping 加帽Polyadenylation 多聚腺苷酸Deciphering 译码Polylysine多聚赖氨酸Polyproline 多聚脯氨酸Proline 脯氨酸Polyphenylalanine多聚苯基丙氨酸Phenylalanine 苯基丙氨酸Trinucleotide 三核苷酸密码子Codons 密码子codon-degeneracy:密码子的简并性Formylmethionine 甲酰甲硫氨酸Methionine 蛋氨酸Methylated 甲基化的Synthetase 合成酶Catalyzing 催化The peptide transferase reaction 转肽反应Streptomycin 链霉素Puromycin 嘌呤霉素Chloramphenicol 氯霉素Cycloheximide 放线菌酮,环己酰亚胺Tetracycline 四环素molecular chaperones 分子伴侣aggregation 聚合Signal recognition particle (SRP) 信号识别颗粒Chapter 8Scarce protein 稀有蛋白Abundant protein 丰度蛋白Posttranslationally 翻译后地Coarser 粗糙的Precursor 前体物(分子),-先导物Degrading 降解Allostery 变构Conformational change 构象变化Isozymes 同工酶Covalent modification 共价修饰Methylation 甲基化Glutamine synthetase 谷氨酸盐合成酶allosteric enzyme 变构酶adenylylation 腺嘌呤形成Global Control全局调控Regulator proteins调节蛋白Histones 组蛋白Nucleosomes 核小体Inducer诱导物Substrate 底物Corepressor 辅阻遏物Polymerase 聚合酶Maltose regulon 麦芽糖调节子consensus sequence 保守序列utilization 利用operons 操纵子Regulon调节子global regulatory system全局调控系统lac Operon 乳糖操纵子simultaneously 同时地Constitutive mutant组成型突变体lactose 乳糖Glucose 葡萄糖glucose effect葡萄糖效应diauxic growth二次生长Catabolite Repression分解代谢物阻遏catabolite activator protein (CAP)激活蛋白(活化蛋白)cAMP-receptor protein (CRP)环腺苷酸受体蛋白hydrolyze 水解galactose 半乳糖Galactosidase半乳糖苷酶Hydrolysis 水解Modulates 调节galactoside permease 半乳糖苷透性酶thiogalactoside transacetylase 硫代半乳糖苷转乙酰酶allolactose 异乳糖diffusible 可扩散的Intact copy完整拷贝positive control正调节negative control副调节Attenuation 衰减,弱化Two-component Regulatory Systems双组分调控系统Sensory proteins (transducers)感受器蛋白MCP –transducers MCP感受器m ethyl-accepting c hemotaxis proteins(MCP)接受甲基趋化性蛋白Methylase甲基化酶Chemotaxis 趋化性Tryptophan Operon 色氨酸操纵子Tandom 串联重复Insufficient 不足Termination 终止Dual Regulation of Trp Operon色氨酸的二重调节Translational attenuation翻译衰减(弱化)Bacillus subtilis 枯草芽孢杆菌trp attenuation protein色氨酸弱化蛋白Polycistronic 多顺反子性的Heat Shock Response 热激反应Global Control Networks全局调控网络Quorum Sensing:最少密度感应degraded by proteases 被蛋白酶降解Heat shock protein热激蛋白chaperones (chaperonin) 分子伴侣acylated homoserine lactone 酰化的高丝氨酸内酯bioluminescence 生物发光Sensor Kinases感受器激酶phosphorylation 磷酸化The phosphoryl group 磷酰基团Demethylated 脱甲基Flagellum 鞭毛Rotation of flagellum鞭毛旋转clockwise 顺时针counterclockwise 逆时针Antisense Nucleic Acid反义核酸Compartmentation分区Polycistronic mRNA多顺反子mRNA Splicing 接合,粘接Chapter 9Essentials本质Viral Replication病毒复制Viral Diversity病毒多样性Chromosome染色体Conferring new properties on the host赋予宿主新的特性Extracellular state-virus particles (virions)胞外状态-病毒颗粒(病毒粒子)Lysis:裂解genomic nucleic acid基因组核酸Intracellular state胞内状态the central dogma of molecular biology分子生物学中心法则Taxonomy分类学Bacteriophage嗜菌体Order目family (and subfamily)科(亚科)genus属species种morphology形态学suffix后缀Hepadnaviruses嗜肝DNA病毒Smallpox 天花病毒Polio virus 脊髄灰质炎病毒Nucleocapsid核壳体naked and enveloped裸露和包被的self-assembly自我装配molecular chaperones分子伴侣Virus Symmetry病毒对称Helical symmetry螺旋状对称Tobacco mosaic virus (TMV)烟草花叶病毒Icosahedral Symmetry二十面体Complex viruses复合体病毒Complex Symmetry复合体对称lipid bilayer脂双层glycoproteins糖蛋白Lysozyme溶菌酶reverse transcriptase逆转录酶retroviruses逆转录病毒Neuraminadase 神经氨酸酶(唾液酸苷酶)Semiliquid半流体Protoplasts原生质体Monolayer单层permanent cell lines:亲本细胞系primary cell lines:原初细胞系virus infection unit病毒侵染单位Plaque嗜菌斑tumor virus肿瘤病毒Plaque assay空斑测定Titer滴度,效价Suspension悬浮液plaque-forming units噬菌斑形成单位Attachment and Penetration吸附和侵入tail fibers尾丝polysaccharide多聚糖tail pins尾针Contraction 收缩tail sheath尾鞘Restriction enzyme限制性酶Invasion入侵methylation of purine and pyrimidine bases嘌呤和嘧啶碱基的甲基化glucosylation糖基化methylation甲基化Virulent Bacteriophage裂性噬菌体Temperate Bacteriophage温和噬菌体Viriods and Prions类病毒和朊病毒Schematic representations示意表示图Linear线性的Encode编码Hydroxymethylcytosine羟甲基胞嘧啶Cytosine胞嘧啶restriction endonucleases限制性内切酶circularly permuted环状变化Terminal repeats 末端重复Concatemer多联体Lysogeny溶原性Synchrony同步Provirus前病毒nitrogen mustards氮芥cohesive粘性的lysis or lysogeny裂解或溶源bidirection双向repressor protein 阻遏蛋白irrevocably不可逆地integrase整合酶PE(promoter establishment)启动子建立Topoisomerase拓扑异构酶Bracket括号Excisionase切除酶Compartmentation分隔Polycistronic多顺反子性的Monocistronic单顺反子性的5’ methylated guanosine triphosphate cap and 3’ poly A tail:5’甲基化三磷酸鸟苷酸帽子和3’多聚腺苷酸尾巴Endocytosis 内吞作用Lytic infection裂解传染Persistent infection持久传染Latent infection潜伏传染Foci焦距benign 良性的malignant 恶性的metastasis转移oncogenes致癌基因intermediate中间的Human immunodefiency virus (HIV)人类免疫缺陷病毒acquired immunodefiency syndrome (AIDS)获得性免疫缺陷综合症internal proteins内部蛋白endonuclease核酸内切酶Protease蛋白酶5’ capped and 3’ polyadenylated: 5’帽化和3’聚腺苷酸化Encapsidation壳体化Budding出芽RNA dependent DNA polymerase(RdDp)依赖于RNA的DNA聚合酶DNA dependent DNA polymerase(DdDp)依赖于DNA的DNA聚合酶Ribonuclease H核糖核酸酶Hcoconut cadang-cadang viroid椰子可可树类病毒citrus exocortis viroid柑橘裂皮类病毒scrape刮伤BSE: bovine spongiform encephalopathy牛绵状脑病pathogenic proteins病原蛋白质insoluble不可溶解的mad cow disease 疯牛病Chapter 10In Vivo活体内Mutants突变体Carcinogenesis致癌作用The Ames Test埃姆斯试验Genotype基因型Phenotype表现型lowercase letters小写字母uppercase letters大写字母italics斜体字superscript上标progeny后代Screening筛选Selection挑选Penicillin青霉素Lysozyme水解酶Spheroplast原生质球Nutritional Mutants营养突变体Imprint印迹Prototroph原养型Auxotroph营养缺陷型histidine auxotrophs组氨酸营养缺陷型微生物Spontaneous自发的Induced诱发的Point mutations点突变Base-Pair Substitutions碱基置换Silent mutation沉默突变Missense mutation错义突变Triplet三联体Temperature-sensitive mutants 温度敏感突变体conditionally lethal mutants条件致死突变体Nonsense mutation 无义突变Back Mutations or Reversions回复突变Compensate 补偿Transposition转位,转座proof-reading校对epidemic流行病Mutagens诱变剂Base analogs碱基类似物Radiation 辐射Transposon转位子,转座子Site-Directed Mutagenesis定点突变Mutagenicity致突变性Protocol 方案salmonella enterica沙门氏肠菌Trp- auxotroph色氨酸营养缺陷型Errorprone错误倾向Plasmids质粒Homologous 同源的redundant pathways冗余的途径Homologous Recombination同源重组SSB protein单链结合蛋白RecA protein RecA蛋白Nick formation缺口形成Strand invasion链侵入Heteroduplex formation 杂合双链形成Transformation转化Transduction转导Conjugation接合Transfection 转染Artificially Induced Competence人工诱导感受态Acinetobacter不动杆菌属Azotobacter固氮菌属Bacillus杆菌属Streptococcus链球菌属Haemophilus嗜血菌属Neisseria奈瑟球菌属Thermus栖热菌属Electroporation电穿孔Generalized transduction普遍性转导Specialized transduction特异性(局限性)转导Recipient受体temperate or virulent温和的或者裂性的lysogenization溶源化作用randomly incorporate随机整合Phage Conversion溶源转变,噬菌体转变Prophage前噬菌体Polysaccharide多糖Nontoxin非毒素Corynebacterium diphtheriae白喉杆菌toxin 毒素Supercoiled configuration超螺旋构型Incompatibility 不相容性,不亲和性Episomes游离体,附加体Curing(噬菌体)治愈Conjugative可接合的Hfr (high frequency of recombination)高频重组Rhizobium根瘤菌属Pseudomonas of octane辛烷假单胞菌camphor and naphthalene樟脑和卫生球Bacteriocins细菌素Resistance Plasmids- R Plasmids抗性质粒Sulfonamides磺胺药物Streptomycin链霉素Spectinomycin壮观霉素fusidic acid梭链孢酸chloramphenicol 氯霉素tetracycline四环素mercury汞Therapies治疗物Diarrhea痢疾CFA-colonization factor antigen 入侵因子抗原hemolysin and enterotoxin溶血素和肠毒素a wider spectrum of activity广谱活性colicins大肠肝菌素subtilisin枯草杆菌蛋白酶NisinA乳酸菌肽Arolling cycle replication滚环复制pilus菌毛IS(insertion sequences)插入序列Interrupted Mating中断杂交Agitation搅拌transposable elements转座因子transposase转位酶inverted terminal repeats末端反向重复序列Conservation保存,保守Replicative重复的Bacteriophages噬菌体Cointegrate共合体cointegrate structure共合体结构Mutagenesis with Transponsable Elements用转座子诱变insertional inactivation插入失活neomycin and kanamycin resistance新霉素和卡那霉素抗性tetracycline 四环素biological mutagen生物诱变剂vector载体Integrons整合子Integrase整合酶Genetic Map基因图谱Operon操纵子Polycistronic mRNA 多顺反子mRNABidirection双向Highly expressed genes高度表达基因Horizontal gene transfer水平基因转移Haemophilus influenzae流感嗜血杆菌Hyperthermophiles极端嗜热微生物Mycoplasma genitalium生殖道支原体Chlorella 绿藻的一种Methanococcus jannaschii詹氏甲烷球菌Pseudomonas aeruginosa铜绿假单胞菌Saccharomyces cerevisiae啤酒酵母Streptomyces coelicolor天蓝色链霉菌Treponema pallidum苍白密螺旋体(梅毒密螺旋体)Thermotoga maritima海栖热孢菌Unidentified reading frame-URF未经确认的阅读框架Genomic mining基因组挖掘Paralogs侧向同源Orthologs直向同源obligate parasitic bacterium严格寄生菌Helicobacter pylori螺旋幽门菌cyanobacterium Synechocytis 蓝细菌introns内含子Plasmodium falciparum疟原虫Malaria疟疾Encephalitozoon cuniculi 家兔脑内原虫病Ustilago maydis玉米黑粉病Phytopathogenic fungus植物病原真菌smut disease黑穗病Chapter 11Stromatolites叠层石Fossiled 化石Filamentous丝状的Systematics系统学Taxonomy分类法Diversification多样化Phylogeny系统发生, 发展史Endosymbiosis内共生Prokaryotes原核生物trapped sediments捕捉的沉淀物phototrophic bacteria光养细菌anoxygenic phototrophic bacteria 厌氧光养细菌lipoprotein vesicles脂蛋白小泡cyanobacterium 蓝细菌entity实体ferrous亚铁的photosynthesis光合作用oxygenation加氧作用,氧气形成oxic有氧的ozone shield臭氧层eukaryotes cell真核细胞chemoorganotrophic化能有机营养mitochondrion线粒体cytoplasm细胞质chloroplast叶绿体endosymbiotic内共生的phototroph光养生物,光能利用菌symbionts共生体metazoan后生生物Evolutionary Chronometers进化时钟Homologous function相同功能Sequence alignment序列排列,序列对比ATPase ATP酶genetic recombination遗传重组Ribosomal核糖体的Phylogenetic系统发生的Cellular细胞的Microbial Community Analysis微生物群体分析phylogenetic tree系统发育树Evolutionary distance ED 进化距离fluorescent i n-s itu h ybridization荧光素原位杂交Horizontal (lateral) gene transfer 水平(侧向)基因转移human genome人类基因组nematode线虫yeast酵母mustard芥菜parasites寄生虫vertebrates脊椎动物Peptidoglycan肽聚糖Cellulose纤维素Chitin几丁质,壳质Archaea古生菌Lipids脂质Ester酯RNA polymerase RNA聚合酶Polypeptides多肽Framework框架Phenotype显型,表现型Phylogenetics系统发生学Classical Taxonomy Morphology传统形态分类学fatty acid methyl ester (FAME) 脂肪酸甲基酯hybridization杂交genus属Molecular fingerprinting分子指纹PCR amplification聚合酶链式反应扩增Speciation物种形成coexist 共存prime ecological niche最初生态位ecotypes生态型Nomenclature命名法Manual手册Chapter 18Biodiversity 生物多样性Quantification 定量microorganisms微生物habitats栖息地Enrichment富集培养Staining染色Radioisotopes放射性同位素Microelectrodes微电极in situ(原位)Pure Culture纯培养Counterselective反选择enrichment vehicle富集培养手段purple紫色phototrophic光养anaerobes厌氧微生物microbial ecosystem 微生物生态系统tubes试管Agar shake琼脂震荡法dilution 稀释molten agar熔化的琼脂serial dilution 系列稀释inoculum接种体most probable numbers (MPN)最大概率数The Laser Tweezers 激光镊子microscopy显微镜术infrared laser 红外线激光器micromanipulation device显微操作装置trapped捕集的laser beam 激光柱contaminating污染Stable Isotope稳定同位素Azotobacter n.固氮(细)菌。
枯草芽孢杆菌标准版资料
经济用途
*可使葡萄糖、半乳糖、 麦芽糖及甘露醇产酸,能 利用柠檬酸盐水解酪 蛋白 和淀粉。
*工业上用来生产淀粉酶及蛋 *分布极广,可产生数种抗 白酶,也用于肌苷发酵和 素
透明,污白色或 *取土样时最好选取如花坛等地方的土样,去掉表层5~10cm的土壤后取样。
在液体培养基中不混浊或轻度混浊,外表有呈暗色、带皱褶的菌膜飘浮 外表色暗,有皱褶状,不透明
微黄色,在液体 能分解植物组织的果胶和多糖;
*工业上用来生产淀粉酶及蛋白酶,也用于肌苷发酵和制造纳豆〔大豆制品之一种〕
培养基中生长时, 常形成皱醭
制造纳豆〔大豆制品之一 种〕
*还是重要的工业生产菌种和遗 传工程中的受体菌。
如何从土壤中别离枯草芽孢杆菌?
*取土样时最好选取如花坛等地方的土样,去掉表 层5~10cm的土壤后取样。
*放入100ml三角瓶中,参加30ml水,常压加热至 水沸腾后维持20min,取出,置28-37摄氏度培养 24-48h,液面那么产生黄白色皮膜。 用接种环取皮膜适量于无菌水中分散,稀释涂布于 蔗糖豆芽汁琼脂平皿,置28-37摄氏度培养24-48h, 挑取典型菌落。
枯草壤、空 气和腐败有机物上
易在枯草浸汁中繁殖
故名:枯草芽孢杆菌
枯草芽孢杆菌
拉丁学名:Bacillus subtilis
• 芽孢杆菌属的一种 • 单个细胞
0.7~0.8×2~3微米 • 细胞染色均匀,很
少成链
枯草芽孢杆菌
革兰氏阳性菌,无荚膜,周生 鞭毛,能运动,需氧型
杀菌剂和植物生长调节剂中英文对照全(2017)
咪鲜胺 腐霉利 霜霉威 丙环唑 丙森锌 丙氧喹啉 丙硫菌唑 吡唑醚菌酯 唑菌酯 吡菌苯威 啶斑肟 嘧霉胺
Pyriofenone Pyroquilon Quinoxyfen Quintozene Sedaxane Silthiopham Simeconazole Spiroxamine Streptomycin
咪唑菌衣酯 氰菌胺 苯锈啶 丁苯吗啉 三苯锡 嘧菌腙 氟啶胺 咯菌腈 氟吗啉 氟吡菌胺 氟吡菌酰胺 氟嘧菌酯 氟喹唑 氟硅唑 磺菌胺 Flutianil 氟酰胺 粉唑醇 氟唑菌酰胺 灭菌丹 乙膦酸 麦穗宁 福拉比 双胍盐 超敏蛋白 己唑醇 恶霉灵 抑霉唑 亚胺唑 双胍辛胺 种菌唑 异稻瘟净 异菌脲 缬霉威 Isofetamid 稻瘟灵 吡唑萘菌胺 异噻菌胺
Fenamidone Fenamistrobin
Fenarimol Fenbuconazole
Fenhexamid Fenitropan Fenoxanil Fenpropidin Fenpropimorph
Fentin Ferimzone Fluazinam Fludioxonil Flumorph Fluopicolide Fluopyram Fluoxastrobin Fluquinconazole Flusilazole Flusulfamide Flutianil Flutolanil Flutriafol Fluxapyroxad
Polyoxin Probenazole Prochloraz Procymidone Propamocarb Propiconazole
Propineb Proquinazid Prothioconazole Pyraclostrobin Pyraoxystrobin Pyribencarb Pyrifenox Pyrimethanil
枯草芽孢杆菌
构建芽孢杆菌标准化质粒
为了使枯草芽孢杆菌满足合成生物学模式生物的要求,核心就是构建模块化的标准。这倒
也不是很困难,只需要将大肠杆菌的基因零件标准在枯草芽孢杆菌的质粒上重构一下就可 以了,枯草芽孢杆菌质粒与大肠杆菌不同之处是存在基因组整合位点,将这个位点引入还
有零件标准的质粒中,就构建成了枯草芽孢杆菌标准化质粒了。
营养周期与大肠杆菌非常相似。然而,在 诸如饥饿等压力源的情况下,细胞进入孢 子形成,首先进行极细胞分裂,然后形成 内生孢子。如果环境条件再次合适,则孢 子会发芽并重新进入营养循环。
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芽孢杆菌的分化
枯草芽孢杆菌的自然栖息地是土壤,被迫适应许多环
境变化。因此,枯草芽孢杆菌的特征在于快速和狡猾 的反射和复杂的生活方式。由于其天然的能力,它可
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载体的整合机制
它们都通过在特定位点的双重同源 重组插入到基因组中。因此,枯草 芽孢杆菌中的靶基因被破坏,可以 通过特定的检测来选择。
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启动子的评估方式
01
发光测量
02
β-半乳糖苷酶测 定
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三组启动子的评估
一,安德森系列启动子评估 它们已经在大肠杆菌中被广泛测量,在枯草芽孢杆菌中测定了11只安德森启动子,并显示相对较弱的 活性。 二,组成型芽孢杆菌启动子
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创建B 4 - 22核心部分
引入枯草芽孢杆菌作为基于BioBrick的合成生物学的新孢杆菌的特定部分 Vertors(载体) promoters(启动子) reporters(通讯员) affinity tags(亲和标签) 我们所有的标签都是由GeneArt合成的。我们的亲和标签还未验证。
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实验中过滤器的问题
枯草芽孢杆菌ppt课件
, 不 管 来 生多么美丽, 我 不 愿 失
记
求天长地久 的美景, 我只要生生 世世的轮
回里有你。
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谢谢
11 、越是没有本领的就越加自命不凡。 ——邓拓 12 、越是无能的人,越喜欢挑剔别人的错儿。 —— 爱尔兰 13 、知人者智,自知者明。胜人者有力,自胜者强。 ——老子 14 、意志坚强的人能把世界放在手中像泥块一样任意揉捏。 ——歌德 15、最具挑战性的挑战莫过于提升自我。 ——迈克尔·F ·斯特利
1 、不要轻言放弃,否则对不起自己。
2、要冒一次险!整个生命就是一场冒险。走得最远的人,常是愿意 去做,并愿意去冒险的人。 “稳妥”之船,从未能从岸边走远。 --戴尔 .卡耐基。
梦境
3、人生就像一杯没有加糖的咖啡,喝起来是苦涩的,回味起来却有 久久不会退去的余香。
枯草芽孢杆菌PPT精今的 不 4、守业的最好办法就是不断的发展。
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枯草芽孢杆菌表达手册_个人翻译中文版
枯草芽孢杆菌表达载体 产品信息和说明2005年11月目录1.简介 (3)2. pHT 载体 (3)2.1. pHT01载体图谱 (4)2.2. pHT43载体图谱 (5)2.3. pHT01衍生物中标签的定位 (5)3. 实验方案 (6)4. 参考文献 (6)5. 订单信息,运输和存储 (6)本载体系统由德国拜罗伊特大学遗传研究所的沃尔夫冈·舒曼实验室开发。
仅用于科研!本手册由wy135033405翻译百度文库首发任何意见请PM枯草芽孢杆菌表达载体通过质粒在枯草芽孢杆菌中高效表达胞内/胞外重组蛋白1.简介革兰氏阳性菌因其在农业,医疗和食品生物技术和重组蛋白生产等方面的贡献而广为人知。
在所有革兰氏阳性菌中,枯草芽孢杆菌载体因下列原因尤为引人瞩目。
(一)无致病性,且一般认为安全的有机体;(二)无明显的密码子偏好性;(三)可直接将功能性胞外蛋白分泌到培养基中(目前,大约60%的市售酶由芽孢杆菌生产);(四)具备包含转录,翻译,蛋白质折叠、分泌机制,遗传操作和大规模发酵的大信息量机体。
但是下述两个障碍减少了枯草芽孢杆菌的使用:(一)产生一定数目的识别并降解外源蛋白的胞外蛋白酶;(二)载体质粒稳定性。
第一个障碍已因蛋白酶缺失株的构建而基本解决。
第二个因引入使用θ-复制模式质粒被完全克服,如由天然质粒pAMβ1和pBS72衍生的一些质粒(Jannière等,1990;Titok等,2003)。
最近,基于大肠杆菌 - 枯草杆菌穿梭质粒pMTLBS72的四种不同表达载体的构建和使用展示出全面的结构稳定性,业已出版(Nguyen等,2005)。
两个新的载体pHT01和pHT43允许在细胞质中高水平表达重组蛋白,其中pHT43载体引导重组蛋白到培养基。
这两个载体基于强σA-依赖性启动子的枯草杆菌gro E操纵子通过添加lac操纵子改造成为一种高效可控的(IPTG诱导的)启动子。
pHT01衍生载体可与8×His 标签(pHT08),链球菌标签(pHT9)或C - Myc的标签(pHT10)相结合。
枯草芽孢杆菌概况18页
枯草芽孢杆菌研究概况国内外关于枯草芽孢杆菌的研究与应用已有100多年的历史,早期大部分工作集中在形态观察、分类鉴定、生理机制、功能发掘及防治等方面。
近年来,对枯草芽孢杆菌的研究渐进到遗传学与分子生物学领域,研究内容体现在特定功能基因的寻找并克隆到需要的物种中或者通过诱变、基因工程等手段对枯草芽孢杆菌生产菌进行遗传改造等。
2.1国外研究概况1945年Johnson等报道,枯草芽孢杆菌具有防治植物病害的作用。
此后,用枯草芽孢杆菌制备生防制剂防治植物病害的研究成为国内外研究的热点。
1980年Papavizas G C报道,枯草芽孢杆菌可以防治水稻等作物的多种土传真菌病害。
1992年Hwang等报道,用枯草芽孢杆菌可以防治豌豆的Rhizoctoni根腐病。
20世纪90年代后,国外已有多种枯草芽孢杆菌制剂投放市场。
美国Agraquest公司用枯草芽孢杆菌(B.subtilis)QST 713菌株和QST 2808菌株分别开发出活菌杀菌剂Serenade TM和Souata AS,已在美国登记使用,叶面施用可防治蔬菜、樱桃、葡萄、葫芦和胡桃的白粉病、霜霉病、疫病、灰霉病等细菌和真菌病害。
GBO3(商品名为Kodiak)和MBI 600(商品名为Subtilex)分别由美国Gustafson公司和Microbio Ltd公司开发,根部施用或拌种可防治镰刀菌(Fusarium spp.)、曲霉属(Aspergillus spp.)、链格孢属(Alternaria spp.)和丝核菌属(Rhizoctonia spp.)引起的豆类、麦类、棉花和花生根部病害。
2019年Gustafson将解淀粉枯草芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌混合制成混合生防药剂,称为BioYield。
解淀粉枯草芽孢杆菌变种(B.subtilis var.amyloliquefaciens FZB24)作为植物促长剂被Taensa公司商品化生产,商品名Taegro TM。
枯草芽孢杆菌表达系统及抗菌肽的表达综述-畜牧兽医论文-农学论文
枯草芽孢杆菌表达系统及抗菌肽的表达综述-畜牧兽医论文-农学论文——文章均为WORD文档,下载后可直接编辑使用亦可打印——由于抗生素药物的滥用,出现了越来越多的抗生素耐药菌株,传统抗生素替代药物的开发已成为目前研究热点。
在生物机体中分离出的抗菌肽被认为是一种最有潜力的抗菌类药物。
抗菌肽一般含有10 ~ 50 个氨基酸,整体带有2 ~ 9 个的正电荷,较大部分(30%)的疏水性氨基酸(Hancock 和Sahl,2006)。
抗菌肽具有抗菌谱广、抗菌活性高、不易产生耐药性、无毒副作用(仅少数种类具有溶血活性)、无残留与无污染等优点,符合畜产品安全生产的需要,适合在饲料生产中使用,具有作为新一代饲料添加剂的潜质(单安山等,2012)。
枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)是广泛存在于土壤和动物胃肠道的一类革兰氏阳性菌,目前已作为重要的工业菌种被越来越多地应用于畜牧业生产中。
枯草芽孢杆菌具有易于分离培养、较清晰的遗传背景、良好的分泌性及无致病性等优点。
近几年来利用重组枯草芽孢杆菌生产饲用酶、饲用活性代谢产物以及作为肠道益生菌成为热点研究领域。
本文对枯草芽孢杆菌表达系统及抗菌肽在其中的表达进行了简要的综述,以期为开发饲用型抗菌制剂提供参考。
1 枯草芽孢杆菌表达系统枯草芽孢杆菌属于芽孢杆菌属,是一类好氧型、内生抗逆性孢子的革兰氏阳性菌。
其细胞呈直杆状,大小为(0.8 ~ 1.2)m(1.5 ~ 4.0)m,广泛分布于土壤及腐败的有机物中。
因其培养简单快速,具有较强的分泌蛋白质的能力、非致病性及良好的发酵基础和生产技术,故枯草芽孢杆菌是目前生产各种工业用酶,如淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶等的理想表达宿主,是微生物研究领域中的一种重要模式菌株。
枯草芽孢杆菌具有自己独特的生长规律:生长延滞期、对数期、稳定期、衰亡期及芽孢发育期。
其在不同的生长阶段基因表达不同,有多种不同时序性的因子来调节(Staroń 等,2009)。
枯草芽孢杆菌PPT精选文档共36页
枯草芽孢杆菌PPT精选文档
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7、翩翩新 来燕,双双入我庐 ,先巢故尚在,相 将还旧居。
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9、 陶渊 明( 约 365年 —427年 ),字 元亮, (又 一说名 潜,字 渊明 )号五 柳先生 ,私 谥“靖 节”, 东晋 末期南 朝宋初 期诗 人、文 学家、 辞赋 家、散
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易
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41、学问是异常珍贵的东西,从任何源泉吸 收都不可耻。——阿卜·日·法拉兹
42、只有在人群中间,才能认识自 己。——德国
43、重复别人所说的话,只需要教育; 而要挑战别人所说的话,则需要头脑。—— 玛丽·佩蒂博恩·普尔
44、卓越的人一大优点是:在不利与艰 难的遭遇里百折不饶。——贝多芬
45、自己的饭量自己知道。——苏联
枯草芽孢杆菌
枯草芽孢杆菌枯草芽孢杆菌的简介和在各领域的作用一、枯草芽孢杆菌简介枯草芽孢杆菌,就是芽孢杆菌属的一种。
单个细胞0.7~0.8×2~3微米,着色光滑。
并无夹馍,周生鞭毛,能够运动。
革兰氏阳性菌,芽孢0.6~0.9×1.0~1.5微米,椭圆至柱状,坐落于菌体中央或稍偏,芽孢构成后菌体不管状。
菌落表面坚硬不透明化,污白色或微黄色。
枯草芽抱著杆菌菌体生长过程中产生的枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质,这些物质对致病菌或内源性病毒感染的条件致病菌存有显著的抑制作用。
枯草芽孢杆菌快速消耗环境中的游离氧,导致肠道低氧,推动有益厌氧菌生长,并产生乳酸等有机酸类,减少肠道ph值,间接遏制其他致病菌生长。
枯草芽孢杆菌菌体自身制备α-淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等酶类,在消化道中与动物体内的消化酶类一同发挥作用,能够制备维生素b1、b2、b6、烟酸等多种b族维生素,提升动物体内干扰素和巨噬细胞的活性,在饲料中应用领域广为。
它还可以用以提升水质,应用领域在污水处理和环境保护中。
和其他微生物混合采用,还可以用作生物肥料和土地改良等。
二、枯草芽孢杆菌的应用领域枯草芽孢杆菌就是一种较好的菌种,应用领域很广,可以运用在饲料公司。
用做饲料添加剂。
可以用在生物有机肥公司,用做生物肥料的发酵剂,可以应用领域在养殖场,轻易嵌入给动物喝,可以应用领域在鱼塘净化水质。
或者一些城市环境监测部门或环保公司,他们敢于污水或污染物的处理。
以及一些糖厂或公司用于治理污染等.三、枯草芽孢杆菌在农业中的促进作用1、提高作物抗病、抗寒、抗旱能力2、减少土壤养分、改进土壤结构、提升化肥利用率;3、促进土壤中的有机质分解成腐殖质,刺激作物生长。
4、推动作物生长、明朗、降低成本、减少产量、提升总收入;5、有一定的固氮、解磷、解钾作用。
四、枯草芽孢杆菌在水产种的促进作用1、枯草芽孢杆菌有肥水的作用枯草芽孢杆菌制剂种的活菌,可以在水中产生多种分解酶,将有机肥中的大分子水解沦为小分子,但这一过程出现在芽孢杆菌转化成倍增产卵之后。
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枯草芽孢杆菌表达载体 产品信息和说明
2005年11月
目录
1.简介 (3)
2. pHT 载体 (3)
2.1. pHT01载体图谱 (4)
2.2. pHT43载体图谱 (5)
2.3. pHT01衍生物中标签的定位 (5)
3. 实验方案 (6)
4. 参考文献 (6)
5. 订单信息,运输和存储 (6)
本载体系统由德国拜罗伊特大学遗传研究所的沃尔夫冈·舒曼实验室
开发。
仅用于科研!
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枯草芽孢杆菌表达载体
通过质粒在枯草芽孢杆菌中高效表达胞内/胞外重组蛋白
1.简介
革兰氏阳性菌因其在农业,医疗和食品生物技术和重组蛋白生产等方面的贡献而广为人知。
在所有革兰氏阳性菌中,枯草芽孢杆菌载体因下列原因尤为引人瞩目。
(一)无致病性,且一般认为安全的有机体;(二)无明显的密码子偏好性;(三)可直接将功能性胞外蛋白分泌到培养基中(目前,大约60%的市售酶由芽孢杆菌生产);(四)具备包含转录,翻译,蛋白质折叠、分泌机制,遗传操作和大规模发酵的大信息量机体。
但是下述两个障碍减少了枯草芽孢杆菌的使用:(一)产生一定数目的识别并降解外源蛋白的胞外蛋白酶;(二)载体质粒稳定性。
第一个障碍已因蛋白酶缺失株的构建而基本解决。
第二个因引入使用θ-复制模式质粒被完全克服,如由天然质粒pAMβ1和pBS72衍生的一些质粒(Jannière等,1990;Titok等,2003)。
最近,基于大肠杆菌 - 枯草杆菌穿梭质粒pMTLBS72的四种不同表达载体的构建和使用展示出全面的结构稳定性,业已出版(Nguyen等,2005)。
两个新的载体pHT01和pHT43允许在细胞质中高水平表达重组蛋白,其中pHT43载体引导重组蛋白到培养基。
这两个载体基于强σA-依赖性启动子的枯草杆菌gro E操纵子通过添加lac操纵子改造成为一种高效可控的(IPTG诱导的)启动子。
pHT01衍生载体可与8×His 标签(pHT08),链球菌标签(pHT9)或C - Myc的标签(pHT10)相结合。
2. pHT 载体
所有在枯草芽孢杆菌的gro ESL操纵子之前使强启动子与lac操纵子融合的载体都可通过加入IPTG进行诱导。
尽管当未添加诱导物时表达组件的背景表达水平很低,还是成功从约1300种诱导因子中筛选出一种来使用bga B报道基因(Phan等,2005)。
当分别将htp G 和pbp E基因融合到gro E启动子时,加入IPTG后,表达的重组蛋白可能分别占细胞总蛋白的10%和13%(Phan等,2005)。
热纤梭菌的amyQα-淀粉酶和纤维素酶A、B的高水平表达实验证实。
该载体还插入了一个高效SD序列以及一个多克隆位点(BamH I, Xba I, Aat II, Sma I)。
编码α-淀粉酶的amyQ基因的信号肽编码区域与pHT01的SD序列融合,构成了pHT43,以此获得分泌的重组蛋白。
P grac : P grac 启动子(包含gro E 启动子;
lac O 操纵子和gsi B SD 序列)
CoIE1 ori: CoIE1 起始子
Amp R : 青霉素抗性基因
LacI: lacI 基因 (lac 抑制子)
Cm R : 氯霉素抗性基因
完整的DNA 序列可根据要求提供
P grac: P grac启动子(包含gro E启动
子;
lac O操纵子和gsi B SD序列)
CoIE1 ori: CoIE1 起始子
Amp R: 青霉素抗性基因
LacI: lacI 基因 (lac 抑制子)
Cm R: 氯霉素抗性基因
SamyQ: amyQ 信号序列
完整的DNA序列可根据要求提供
2.3. pHT01衍生物中标签的定位pHT08中 8×His标签的定位
pHT09中Strep标签的定位
pHT10中c-Myc标签的定位
3. 实验方案
对大肠杆菌和枯草芽孢分子遗传操作(生长,转化等)的详细协议可以在有关实验室手册如Sambrook 和Russell (2001年)中可以找到。
对于枯草杆菌改造我们推荐Anagnostopoulos 和Spizizen (1961)的方案,需稍加修改:
1. 20mL
LS 培养基(Spizizen 培养基* 补充加入0.5%葡萄糖,5μg/mL DL-色氨酸,5μg/mL 尿嘧啶,0.01% 干酪素水解物,0.1%酵母提取物[Difco 公司],1mM MgSO 4,2.5mM MgCl ,0.5 mM CaCl )中接种在HS 培养基(Spizizen 培养基* 补充加入0.5%葡萄糖,522μg/mL DL-色氨酸,5μg/mL 尿嘧啶,0.01% 干酪素水解物,0.1%酵母提取物[Difco 公司],8μg/mL 精氨酸,0.4μg/mL 组氨酸,1mM MgSO )中37C 过夜培养的5mL 中的1mL ,30C 缓慢摇3到4小时。
4o o 2.用10μL 的0.1M EGTA 室温孵育这1mLHS 培养物5分钟(对数晚期/稳定早期; OD )而后加入1~2578μg 质粒DNA 。
3.37o C 摇2小时供其发展抗生素抗性后将细胞涂布至选择性平板。
*Spizizen 培养基配方:2g NH 4SO 4,14g K 2HPO 4,6g KH 2PO 4,1g 柠檬酸钠;加100mL 蒸馏水,高压灭菌,然后再加0.1mL 1M MgSO 4。
4. 参考文献
Anagnostopoulos, C. and Spizizen, J. (1961). Requirements for transformation in Bacillus subtilis. J. Bacteriol. 81:741-746.
Jannière, L., Bruand, C. and Ehrlich, S.D. (1990). Structurally stable Bacillus subtilis cloning vectors, Gene 87:53-61.
Nguyen, D.H., Nguyen, Q.A., Ferreira, R.C., Ferreira, L.C.S., Tran, L.T. and Schumann, W. (2005). Construction of plasmid-based expression vectors for Bacillus subtilis. Plasmid; in press.
Phan, T.T.P., Nguyen, H.D. and Schumann, W. (2005). Novel plasmid-based expression vectors for intra- and extracellular production of recombinant proteins in Bacillus subtilis. Protein Expr. Purif.; in press.
Sambrook, J. and Russel, D.W. (2001) Molecular Cloning: A laboratory manual.
Titok, M.A., Chapuis, J., Selezneva, Y.V ., Lagodich, A.V ., Prokulevich, V .A., Ehrlich, S.D. and Jannière, L. (2003). Bacillus subtilis soil isolates: plasmid replicon analysis and construction of a new theta-replicating vector, Plasmid 49:53-62.
5. 订单信息,运输和存储
订单号 PBS001 PBS002 PBS003 PBS004 PBS005 描述 pHt01载体,冻干DNA 质粒 pHt43载体,冻干DNA 质粒 pHt08载体,冻干DNA 质粒 pHt09载体,冻干DNA 质粒 pHt10载体,冻干DNA 质粒 含量 10μg 10μg 10μg 10μg 10μg
室温运送。
冻干质粒4o C储存。
无菌水或缓冲液中解旋的DNA我们建议-20o C保存。