RNAi技术在昆虫学中的研究进展及展望_田宏刚-2012
RNAi技术研究进展
第25卷第4期2004年7月 江苏大学学报(自然科学版)Journal of Jiangsu University(Natural Science Edition) V ol.25N o.4July2004RNAi技术研究进展陈克平,唐旭东(江苏大学生命科学研究院,江苏镇江212013)摘要:RNAi是由双链RNA引起的基因沉默现象,它通过降解具有同源序列的mRNA起作用,特殊设计的siRNA能使目的基因发生特异性沉默.目前,获得siRNA已经非常方便,导入方式最常用的是微注射.RNAi技术有编码区RNAi和启动子区RNAi两大类,均可以产生类似基因敲除的功能,在家蚕功能基因的研究中已经使用了这种方法.随着RNAi技术的不断进步,RNAi可广泛地应用到功能基因组学,药物靶点筛选,疾病治疗等方面.关键词:RNAi;基因功能;RNAi技术中图分类号:Q756 文献标识码:D 文章编号:1671-7775(2004)04-0336-05Advances on research of RNA interferenceCHEN K e2ping,T ANG Xu2dong(Institute of Life Science,Jiangsu University,Zhenjiang,Jiangsu212013,China)Abstract:RNAi is a phenomenon of gene silence induced by double2stranded RNA(dsRNA)that is hom olo2g ous to target gene.N ow it is easy to obtain small interference RNA(siRNA),and siRNA is oftentransmittedinto organisms by microinjection.RNAi includes encoding region RNAi and prom oter region RNAi,which can be used to investigate gene function by degrading a special mRNA target in a cell or organism and thus knock2 ing out or knocking down the level of the encoded protein.They have been used to the analysis of silkw orm gene function.With the development of the technique,RNAi can be widely used to genomic analysis,medica2 tion target screening,disease treatment and s o on.K ey w ords:RNAi;gene function;RNAi technology R N Ai(R N A inter ference)是由双链R N A引发的转录或转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silenc2 ing,PTG S).长dsR N A被核酸酶降解成21~23bp大小的片段,与具有序列同源性的mR N A结合并使之降解,从而抑制基因的表达.目前已成功地在果蝇、线虫、锥虫、小鼠和哺乳动物中进行了R N Ai研究,其机制也逐渐被认识.由于其具有的独特优势,有望成为研究基因功能和进行基因治疗的有力工具.1 RNAi的产生与发展20多年前,Richard Jorgensen在研究改变色素的转基因矮牵牛时发现,导入色素外源基因并没有产生预期的花色加深,反而因为某些色素的缺失出现花色斑驳的现象.这表明不仅转进去的基因自身没有活性,外源DNA序列还在一定程度上对内源性基因表达产生阻断,把这种现象称为共抑制[1-3].1995年,美国华盛顿大学的G uo和K em phues[2]在研究线虫Caenorhabditis elegans中发现,用反义和正义RNA同样都有抑制par-1基因的表达.3年后(1998年),Fire和Mello及他们的研究组尝试使用反义RNA、正义RNA、dsRNA的阻断效应实验,发现作为沉默引发物的dsRNA混合物比单个收稿日期:2004-01-16基金项目:江苏省高新技术项目(BG2001317);国家财政部家蚕基因组计划技术平台建设项目作者简介:陈克平(1960-),男,安徽无为人,研究员,博士生导师(kpchen@),主要从事家蚕种质创新和家蚕功能基因组学的研究1正义或反义RNA 至少强10倍[4],他们把这种现象称为RNA 干涉(RNA interference ,RNAi )[5].RNAi 在自然界中广泛存在,目前已经在植物、真菌、囊虫、果蝇、线虫、鼠早期胚胎细胞、家蚕等不同种属的生物体中得到证实[6-8].由于它能够特异性地使一些基因得到沉默,所以可以代替基因敲除等研究特定基因的功能.随着人类基因组计划测序工作的完成,人类将进入后基因组时代即研究功能基因组学时代,确定特定基因的功能,迫切需要一种简单经济的方法进行研究,RNAi 以其独特的优势越来越受遗传学家和生物学家的重视,其机理也逐渐被人们阐明.2 RNAi 干涉的机制随着遗传和生化方面的研究不断深入,人们开始逐步了解RNAi 的发生机制.初步认为RNAi 主要分为三个阶段(图1).图1 RNAi 过程示意图Fig.1 Process of RNA inter ference (1)起始阶段.dsRNA 进入细胞,RNAi 核酸酶与dsRNA 结合,并将之降解成21~23bp 小的片段dsR 2NA (small interference RNA ,siRNA ),后者与RNAi 核酸酶结合成复合物.由于siRNA 和RNase Ⅲ切割产物的相似性,Benda Boss 等认为在形成siRNA 的过程中有RNase Ⅲ的参与[9,10],Bernstein 和他的同事发现果蝇中RNAi 的发生与这种酶有关,他们把这种蛋白称为Dicer [11].除了含有两个RNase Ⅲ共有区域外,Dicer 还含有一个解旋酶区域、一个dsRNA 结合区域和一个PAZ 区域.Dicer 酶具有高度保守性,在果蝇、烟草、线虫、哺乳动物和神经细胞中发现能够将相应种属的dsRNA 加工成特定长度的siRNA [12].最近,RNase Ⅲ接触反应区域结构的阐明导致了Dicer 切割产生22bp 片段模型的建立.在该模型中认为细菌RNase Ⅲ以二聚体酶形式起作用,反向平行的RNase Ⅲ区域产生两个复杂的接触反应中心.(2)效应阶段.复合物中siRNA 作为模板,其反义链与对应的同源mRNA 结合,有义链解离出来,mRNA 定位在原来有义链的位置上,同时降解mRNA并释放出RNAi 核酸酶,然后重复这一过程,特异性降解下一个对应的mRNA [13].在果蝇中,RNAi 通过一种称为RNA 诱导沉默复合物(RNA 2induced silenc 2ing com plex ,RISC )识别和降解目的mRNA [14].Z am ore 和他的同事们最近发现RISC 在胚胎提取物中以大约250kDa 大小的前体复合物的形式存在,在加入ATP 之后被激活形成约100kDa 大小的能切割mR 2NA 的复合物[15].siRNA 是双链结构,含有2个3’端突出碱基和一个5’端磷酸基团,该结构有利于siR 2NA 与RISC 复合物的结合.(3)扩增和扩散阶段.siRNA 的反义链与目的mRNA 结合后不仅诱导RISC 对该基因进行降解,而且还激活RdRp (RNA dependent RNA polymerase )介导的单链RNA 的合成,产生大量的dsRNA ,这些dsR 2NA 又被切割成许多siRNA ,进入下一个RNAi 循环.因此只要注射很少量的dsRNA ,就能在整个生物体中发生基因沉默.类似的沉默现象在植物中也有发现,同时也发现RNAi 不但能渗透到整株植物中还能传递到通过嫁接移植的后代植株中[16].出现这种现象首先要求一个细胞间有传递信号的系统,其次要有一个增强信号的机制.最近研究提出一种称为转移RNAi 的现象,转移RNAi 指的是伴随一个特定基因沉默信号的迁移.例如在线虫中,瞄准3’端转录的RNAi 导致相应mRNA 的沉默和与目的序列具有同源性的siRNA 的产生,而且与目的基因上游序列互补的siRNA 也有产生和积累[17].当这些siRNA 与其他dsRNA 互补时,其他dsRNA 也被抑制,于是实现了转移.不管是在植物还是线虫中,dsRNA 诱导的基因沉默都需要RdRp 的参与,它能够增强RNAi 信号[18].这种现象容易导致“RNA 依赖RNA 聚合酶活性是RNAi 所必须的”.然而到目前为止,只有西红柿中的RdRp 显示有这种活性,要证实这一结论必须通过进一步的生化研究,才能揭示这些蛋白在733第4期 陈克平等:RNAi 技术研究进展RNAi中的作用机制.3 RNAi技术进行RNAi首先要进行的是目的基因的选择,在目前所进行的实验中一般选择对应于能被容易检测的表型的目的序列.自从发现使用cDNA模板RNAi突变拟表型的外显率比使用基因组模板高后, cDNA序列成为指定的模板.然而,在没有cDNA的情况下,也可以使用富含外显子的基因组序列.RNAi效率可能受所用dsRNA长度和结构类似物等其他因素的影响.传递dsRNA的方法也可能影响RNAi反应的强度.在 C.elegan中传递RNA最普遍的方法是对微生物多核体、体腔或内脏进行微注射.在C.elegan中对成年蠕虫进行微注射被认为是最有效的RNAi途径.虽然其他传递RNA的方法强度较小,但是dsRNA浸泡、给蠕虫喂养表明 C.ele2 gan dsRNA的 E.coli的方法已经被用来进行整个基因组功能分析和高通量筛选.311 编码区RNAi和启动子区RNAi技术根据所选用序列的不同,可将RNAi分为:(1)编码区RNAi技术.自1998年在线虫中发现RNAi现象以来,以基因编码区为靶序列的编码区RNAi技术已用于线虫功能基因组的研究.最初这种技术是通过注射或浸泡等方法直接导入到线虫的性腺或早期胚胎中.这些方法虽然可以关闭目的基因的表达,产生突变表型,但这种表型变化却不能遗传.这种早期的RNAi技术可以用于研究与胚胎发育有关的基因的功能,但由于细胞分裂造成dsR2 NA的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性.为弥补早期RNAi技术的不足, T avernarakis[19]等对RNAi技术进行了改进,将目的基因的靶序列以反向重复的方式,由热激启动子控制在转基因生物中表达.热激处理后,反向重复序列在细胞内开始转录,其产物会形成具发夹环结构的dsRNA,从而产生RNAi,使目的基因沉默.这种改进的RNAi技术与传统的RNAi技术相比,具有明显的优点:首先转基因可以遗传给后代,有利于突变的分析;其次dsRNA可以被诱导产生,RNAi能够在发育特定阶段出现,从而使研究发育早期必需基因在发育晚期的功能成为可能;另外,当用细胞特异性启动子控制dsRNA的表达时,可以研究特定基因在不同器官中的功能.(2)启动子区RNAi技术.M. F.Mett等证明含有启动子区的dsRNA在植物体内同样被切割成21~23核苷酸长的片段,这种dsRNA可使内源相应的DNA序列甲基化,从而使启动子失去功能,使其下游基因沉默.由于多基因家族的各成员之间高度同源,因而使用编码区RNAi技术很难将各个成员区分开来研究,而多基因家族内的启动子序列通常比编码区变化大,采用启动子区RNAi技术有望将多基因家族的各个成员区分开来研究.这样综合编码区RNAi技术和启动子区RNAi技术的信息即可更全面地了解多基因家族各成员的功能.312 siRNA的获得及dsRNA的导入方法越来越多的研究人员开始采用siRNAs小分子来抑制特定的哺乳动物基因表达.到目前为止较为常用的5种制备siRNAs的方法包括:(1)化学合成,公司订购,比较方便但是价格贵成本高.(2)通过体外转录可以合成siRNAs,这种方法的成本相对化学合成法比较低,不足之处是实验的规模受到限制.(3)长片断dsRNAs经RNase III类酶降解(例如:Dicer, E.coli.RNase III),这个方法通常选择200~1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA,然后用RNase III或Dicer 在体外消化得到多种siRNA混合物,优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,缺点是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因.(4)siRNA表达载体或者病毒载体在细胞中表达siRNAs,多数的siRNA表达载体依赖3种RNA聚合酶III启动子(pol III)中的一种,操纵一段小的发夹siRNA在哺乳动物细胞中的表达.目前已经开始研究逆转录病毒和其他病毒载体用于siRNA表达,其优势在于可以直接高效率感染细胞进行基因沉默的研究,避免由于质粒转染效率低而带来的种种不便.(5)PCR制备的siRNA表达框在细胞中表达, siRNA表达框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中,主要缺点是PCR产物很难转染到细胞中.dsRNA的导入方式.在线虫中最常用的是微注射法,该方法最早使用于细菌转化试验中[20,21],R. Bettencourt通过注射dsRNA到蚕蛹胸部成功地抑制了Hemolin基因的表达[21].后来又发现将线虫浸泡833 江苏大学学报(自然科学版) 第25卷于dsRNA溶液中能得到有效的RNAi[22].Timmons等用能表达线虫dsRNA的工程菌E scherichia coli喂养线虫后也能使线虫的基因沉默[23].到目前为止,通过其他方法进行RNAi得到的表型效果都比直接注射弱.电穿孔也是一种可行的方法,已经由Ng o成功地应用于锥虫的研究[24].对于某一特定的生物体, dsRNA的具体导入方法依生物体的性质而定,一般使用浸泡的方法比较简单,而对于外壳坚硬的如蚕卵等不宜进行微注射或浸泡效果不明显的研究对象,可使用喂养能表达特定dsRNA的工程菌或病毒的方式.313 在家蚕中进行的RNAiQuan和K anda等[25]注射对应于家蚕白卵基因(Bmwh3)的双链RNA到野生型家蚕前胚期卵中诱导了类似于White egg3位点突变产生的表型.用白卵和半透明幼虫肤色定义诱导表型.N orthern杂交分析显示注射后的胚胎中内生的Bmwh3基因的表达被完全抑制.而且,从质粒中来的与dsRNA连载一起的G FP dsRNA抑制G FP基因的表达但不抑制Bmwh3基因的表达,这验证了RNAi的序列特异性.具体实验过程如下:(1)构建Bmwh3dsRNA和G FP dsRNA.Bmwh3 925bp大小的一个片段以Bmwh3cDNA为模板, CT ACGG AG CC AT CGG AGG T ATT和GG CCG TG C AAA2CTG2 T AT CT ATG为引物进行扩增.G FP基因706bp大小的一个片段以质粒pPIG A3G FP为模板,TGG TG AG2 C AAGGG CG AGG AG和T CG T CC ATG CCG AG AG T2G AT为引物进行扩增.后将PCR片段克隆进PGE M2T质粒载体.分离插入双向Bmwh3和G FP基因PCR片段的质粒,质粒用P stⅠ酶切进行线性化,作为RNA合成的模板.每个目的基因的正义反义链RNA用Ri2 boMAX Large Scale RNA Production System2T7 (Promega)合成.RNA合成后,反应混合物用酚、氯仿抽提,乙醇沉淀,溶于无RNase的水中.相等摩尔量的正义和反义链混合在10mm ol/L T ris2HCl (pH715)/20mm ol/L NaCl缓冲液中,加热到95℃1 min.为完全退火成dsRNA,加热后的溶液在25℃下放置12~16h.退火dsRNA用RNase在37℃下处理30min,酚、氯仿抽提,乙醇沉淀,溶于蒸馏水.dsRNA 组成用非变性琼脂糖凝胶电泳确认.注射液通过将dsRNA溶解于蒸馏水准备.(2)幼虫在25℃下人工饲料喂养,卵产下4h 后,在25℃下019mm ol/L HCl浸泡1h以打破滞育.6~7h后,微注射dsRNA,每个卵中注射2~3μl 溶液.注射后将卵在25℃下发育胚胎,发育4d后能够存活的卵通过带G FP2滤波器的荧光显微镜观察G FP基因的表达.N orthern杂交分析显示注射后的胚胎中内生的Bmwh3基因的表达被完全抑制.4 RNAi应用前景及展望由于RNAi可以特异性地抑制基因的表达,同时可将抑制表达时间控制在发育的特定阶段,产生类似基因敲除的功能,可用来促进新基因功能的研究.Andrew等利用喂养线虫能分泌dsRNA的工程菌研究了线虫染色体I上约90%的预测基因,使该染色体上已知表型的基因数由70增加到378.与传统的研究基因功能方法相比,RNAi是一种反向基因分析方法,即已知特定的基因序列,通过阻断这一基因的表达而表现出功能或表型的改变,从而揭示基因与功能关系.RNAi有着古老的根源,在进化过程中具有抵抗病毒入侵、抑制转座子活性,是生物天然防御系统的重要组成部分.RNAi可利用统一基因家族中多个基因含有一段同源性较高的保守序列的特性,设计针对它的dsRNA,将多个基因同时沉默.如肿瘤就是由多个基因控制的,单一基因阻断不能完全阻断肿瘤的生长[26,27],而使用RNAi技术就有望通过注射一次设计好的dsRNA将多个相关肿瘤基因抑制,这为进一步开发治疗肿瘤药物提供了新的思路.参考文献(R eferences)[1] Fire A.P otent and genetic inter ference by double2strandedRNA in Caenorhabditis elegans[J].Nature,1998,391:806-811.[2] G uo S,K em phues KJ.par-1,a gene required for estab2lishing polarity in C.elegans embry os,encodes putativeSer/Thr kinase that is asymmetrically distributed[J].Cell,1995,81:611-620.[3] T imm ons L,Fire A.S pecific inter ference by ingested dsR2NA[J].Nature,1998,395:854.[4] T imm ons L,C ourt D,Fire A.Ingestion of bacterially ex2pressed dsRNAs can produce specific and potent genetic in2ter ference in Caenorhabditis elegans[J].G ene,2001,263:103-112.[5] Schmid A,Schindelhoz B,Z inn K.C ombination RNAi:amethod for evaluating the function of gene families inDrosophila[J].Trend Neurosic,2002,25(2):71-74. 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RNAi技术在遗传学方面的研究进展
RNAi技术在遗传学方面的研究进展高利华 朱孟玲 (江苏农林职业技术学院 江苏句容 212400)R NA干扰(RN Ai)是最近几年发现和发展起来的一门新兴的在转录水平上的基因阻断技术 1。
RNA i是由双链R NA介导的,在转录后mRNA水平上关闭相应基因表达的过程,也就是序列特异性的转录后基因沉默(post-transcrip tional gene silencing,PT G S)。
RNA i是生物体中存在的一种普遍现象,代表了一种古老的细胞反应通路。
RNA i作为一种新兴的基因阻断技术,在基因组基因功能研究、遗传病的基因治疗和蛋白质功能研究方面已显示出巨大的前景。
为此,RNA i被美国!Science∀和!N ature∀杂志评为2002年度最重要的科技成果之一。
RNA研究的重大突破性进展,是近20年来可以与HGP相提并论的最重大的成果之一。
1 研究历史与分子机制1.1 研究历史1990年,为加深矮牵牛花的紫色,Jorgensen等人导入了一个强启动子控制的色素基因,可是结果与预期相反,许多花瓣颜色并未加深,反而呈杂色甚至白色,这是由于转基因和同源的内源基因的表达都被抑制了,Jorgensen把这个现象命名为共抑制(cosuppression)。
1995年,康奈尔大学的Su Guo博士在用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义R NA和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。
到1998年,A ndrew F ire的研究证明,在正义RNA阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链R NA。
这些双链RNA是体外转录正义RN A时生成的,于是提出了R NAi 这个词。
2002年,Zernicka-Coetz等用双链RN A注射小鼠受精卵和着床前的胚胎,结果发现导入的双链RN A可以特异性地抑制C-mos、E-cadherin和GFP基因的表达。
Judy L ieberman和Pr emlata Shankar首先向公众宣布了在动物中利用RNA i技术治疗疾病的研究进展。
RNAi技术及其在寄生虫研究中的应用
收稿日期:2007204204基金项目:新疆兵团科技局社会发展项目(2006GG31)作者简介:荣光(1978~),男,山东人,硕士研究生,主要从事动物传染病诊断与防制研究。
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RNAi技术在医学领域的研究进展
RNAi技术在医学领域的研究进展【摘要】 rnai是利用内外源mrna沉默目标基因的现象,目前已经应用于临床疾病的治疗。
本文主要讲述rnai在病毒性、遗传性、肿瘤疾病治疗方面的应用,展现二十一世纪医学领域中治疗手段发展的新突破。
【关键词】 rnai 医学治疗rnai technology in the field of medicine research progress author: liangying lishufen yuantianyou【 abstract 】 use rnai is internal and external source mrna silence the target genes phenomenon, at present has been applied to clinical disease treatment. this article mainly described in viral, inherited, rnai tumor disease treatment application, show the 21 st century in the field of medical treatment of the development of new breakthrough.【 key words 】 rnai medical treatmentrnai(rna interference,rnai)即rna干涉,是生物体内普遍存在的一种生物学现象,是由双链rna(dsrna)参与指导的,在特定酶的参与下以外源和内源mrna为降解目标的转基因沉默现象。
在过去几十年里rnai一直是生物科学中的一个亮点,人们通过向有机体引入小片段干涉rna分子(small interfering rnas,sirnas)和发夹样rna分子(small hairpin rnas,shrnas)能够特异地降解目标mrna这一特性来探索基因功能。
RNA干扰技术及其在寄生虫研究中的应用
RNA干扰技术及其在寄生虫研究中的应用
RNA干扰技术及其在寄生虫研究中的应用
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是双链RNA(dsR-NA)介导的序列特异靶基因转录后基因沉默的过程.RNAi天然存在于各种生物体中,如果蝇、线虫、原生动物、脊椎动物、高等植物等,在保持基因组的纯洁、抵抗病毒的入侵、控制生物发育、染色体的异染色质化等方面都具有非常重要的作用.自1998年Fire等[1]首次将RNAi现象定义为转录后基因沉默(PTGS)后,应用RNAi技术进行基因功能的研究迅速在各种生物中开展起来.本文就RNAi技术及其在寄生虫领域中的研究结果作一综述.
作者:姚利晓林矫矫蔡幼民作者单位:姚利晓(中国农科院上海家畜寄生虫病研究所农业部动物寄生虫学重点实验室,上海,200232;中国农业科学院研究生院,北京,100081)
林矫矫,蔡幼民(中国农科院上海家畜寄生虫病研究所农业部动物寄生虫学重点实验室,上海,200232)
刊名:中国人兽共患病学报ISTIC PKU 英文刊名:CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES 年,卷(期):2006 22(3) 分类号:Q852.7 关键词:。
鳞翅目昆虫RNAi新进展
鳞翅目昆虫RNAi新进展0 引言DNA 高通量和低成本的测序能力是现代生物学技术的最显著的进展,截至目前已有50个昆虫的基因组序列已完成或正在进行中(网址),在不久的将来至少每个昆虫目都有代表性的物种其基因组序列完成测序。
同时,基因组测序的不断发展也带来了众多未知功能的基因,特别是在这个令人惊奇的昆虫世界。
但是,这些发现导致的问题是如何揭示这些新基因的功能。
RNAi 技术通过降解选定基因的转录本产生功能缺失的表型,从而帮助我们克服所面临的挑战。
RNAi 不仅能够预测新基因的功能,揭示老基因的新功能,还能验证新基因已具有的功能[1]。
十年间,昆虫学家们从第一次在秀丽杆线虫中发现dsRNA 开始,逐步利用日益成熟的RNAi 技术,研究了大量基因的功能[2]。
特别是近三年来,生物学家们从模式生物果蝇[3] [4] [5]、家蚕[6] [7],到非模式生物赤拟谷盗[8] [9]、甘比亚按蚊[10] [11]、烟粉虱[12]等,越来越多的基因功能被详细阐述,范围涉及昆虫的各大纲目[1]。
就如任何技术都有两面性一样,RNAi 也不尽完善,同样具有缺点和技术障碍,特别是昆虫的第二大目鳞翅目,这类昆虫由于自身较强的系统恢复和自愈能力使得活体RNAi 技术遇到了一定的挑战,如何保证靶基因的高效、特异性沉默成了鳞翅目昆虫RNAi 的核心问题。
本文利用已建立的昆虫基因功能研究的RNAi 技术平台,对甜菜夜蛾进行活体饲喂或注射dsRNA 片段来干扰昆虫生长发育,在几丁质合成相关基因的功能研究上取得了新进展。
本实验团队主要针对几丁质合成通路的始末酶即海藻糖酶和几丁质合成酶,以及几丁质合成的重要调控基因几丁质酶、海藻糖合成酶和蜕皮激素受体,通过有效的RNAi 研究这些基因的生理功能及对甜菜夜蛾蜕皮变态的影响。
1 研究进展1.1 利用 RNAi 技术研究几丁质合成酶基因A 的生理功能1.1.1 注射法RNAi 研究几丁质合成酶基因A 的生理功能几丁质合成酶作为几丁质合成通路的重要控制靶标,以两种形式存在于昆虫体内。
RNAi技术防治害虫的研究进展
Ke r : y wo ds RNAi p s o tol d RNA ; e tc n r ;s
由于“ R” 3 问题 , 曾经风 光无 限的 化学 防治 只能 作 为 害虫 防治 的最 后 措 施 来救 急 , 近 年来 令 人 瞩 而 目的转基 因抗虫 植 物 ( 研 棉 等 ) 受 到抗 性 问题 如 也 的 困扰 j 。但 人 们 寻 找 害 虫 控 制 新 方 法 的 步 伐 从 未停 止 , 着 R 随 NA 干 涉 ( N ne e ne R Ai R A itr r c , N ) f e 技术 在基 因 功能研 究 、 因治疗 等方 面 的广 泛应 用 , 基 以及 R i 制 研 究 的深 入 , 用 R i 术 防 治 NA 机 利 NA 技 害虫 成 了人们 研究 的热点 之一 。
自主 性 的 。对应 用 R Ai 术 防治 害 虫来讲 , 究 的 焦点 集 中在 非 细胞 自主 性 R i即 昆 虫能通 N 技 研 NA ,
过 取食 来 内化 目标 基 因的 dR sNA。R Ai 术 防 治 害 虫的特 异 性极 高 , 会 出现 残 留污 染 问题 。 N 技 不 可 以通过 注射 、 饲喂 和 转基 因 dR s NA 来进行 害 虫的防 治 。本 文还 介 绍 了昆 虫吸收 dR A 的机 制 。 sN
p s b jc o ,edn dt n gn .na dt n temeh ns o bop o f s N yisc et yi e f n fe iga a se e I d io , c a i fasrt no R Asb et n i n r i h m i d n
1 RN i A 技术 防治 害虫 的原 理
RNAi在昆虫基因功能研究中的应用进展
RNAi在昆虫基因功能研究中的应用进展作者:张涛郅军锐叶茂来源:《山地农业生物学报》2018年第06期摘;要:RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由小分子dsRNA引起目的基因mRNA序列特异性降解,导致靶标基因沉默或表达量下调的现象。
RNAi在昆虫重要生理酶相关基因功能的研究中起着至关重要的作用。
本文主要对RNAi不同方法的应用、各方法的优缺点及影响RNAi效率的因素进行了综述,总结了RNAi不同方法对昆虫功能基因沉默效果的差异,及在昆虫基因功能研究中的应用进展。
关键词:RNA干扰;基因功能;脱靶效应;害虫防治中图分类号:S476文献标识码:A文章编号:1008-0457(2018)06-0063-07;国际DOI编码:10.15958/ki.sdnyswxb.2018.06.011昆虫的RNA干扰(RNA interference,RNAi)主要指外源双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的,通过阻碍特定基因的翻译或转录,引起内源靶标mRNA降解,从而导致靶标基因沉默或表达量明显下调的现象[1]。
对于揭示昆虫生长发育及抗性相关基因的功能具有不可或缺的作用。
近年来,基于昆虫基因组学[2-3]、转录组学[4]、代谢组学[5]、蛋白质组学[6]等分子生物学技术的发展。
RNAi自1998年在对秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans 进行基因沉默的研究中发现以来[7],RNAi技术已经被广泛应用于现代农业领域,其应用主要包括作物品种改良、生物防治、昆虫抗药性功能基因研究等方面[1]。
精确地说就是应用于基因功能和信号传导通路研究[8]。
近年来,RNAi技术在昆虫基因功能方面的研究也是如火如荼,不仅可以用于控制害虫,也可以利用RNAi保护益虫[9]。
RNAi方法自从被发现至今,就备受害虫防治研究领域的学者们青睐。
昆虫的RNAi因其具有较强的特异性、对环境相对友好以及高效等特点,在基因功能、抗药性研究和害虫防治等方面的研究不断取得新的进展[10-11]。
RNAi技术的发展与进展
RNAi技术的发展与进展RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种基因调控机制,它通过降解靶基因的mRNA,从而抑制或靶向基因表达。
自从RNAi被发现以来,它已经成为了生物研究、医学治疗,甚至是基因编辑的主要方法。
本文将探讨RNAi技术的发展与进展。
1. RNAi的发现和原理RNAi最早是在1998年由Andrew Fire和Craig Mello以线虫为模型生物发现的。
随后,RNAi被证明成为了所有真核生物都存在的现象。
RNAi的原理是利用双链RNA(dsRNA)的某一个部分诱导RNA内切酶复合物(RISC)的结合并裁剪其与mRNA互补的同源序列的mRNA,从而降低其表达。
RNAi还可以通过特殊的RNAs载体将siRNA引入到细胞中,从而实现特定基因表达的精确控制。
2. RNAi在基因敲除中的应用RNAi是基因敲除的一种基本技术。
在RNAi中,siRNA(short interfering RNA)可以被特异地引导RISC与mRNA靶向结合并降低基因表达水平。
这个过程是高度特异性,并且能够准确地敲除一个特定的靶基因。
因此,RNAi在基因敲除领域中成为了不可或缺的一种工具。
3. RNAi在研究中的应用RNAi在基因功能研究中广泛应用。
通过siRNA介导的RNAi治疗,可以实现对基因的精确控制,以便探究基因的功能和调控机制。
通过RNAi技术敲除一个基因还可以帮助人们揭示该基因的功能是否与某种疾病相关,并且可以用RNAi技术探究不同类型肿瘤细胞中的基因表达情况,从而进一步理解肿瘤发生和发展的机制。
4. RNAi在药物研发中的应用RNAi技术在药物研发中也有很大的潜力。
利用RNAi技术可以快速地识别和验证新的潜在药物靶点,并且能够对药物的作用实施更直接、更细致的监测和反馈。
因此,RNAi被视为一种快速、高效的药物筛选平台。
同时,RNAi还可以用于治疗许多由基因突变引起的疾病,包括癌症、感染和遗传性疾病。
生物学中的RNAi技术及其应用前景
生物学中的RNAi技术及其应用前景RNAi技术是指通过RNA介导的基因沉默作用,对靶向基因进行剪切或阻止转录,从而达到控制某种生物过程的目的。
RNAi技术近年来得到了广泛的关注和应用,其在基础生物学研究、生物技术和医药领域均有着重要的应用前景。
RNAi技术的基本原理是通过外源RNA分子(RNA干扰分子)进入细胞,切断靶向RNA分子(载体mRNA),从而避免其参与相应基因的表达,使该基因的表达水平下降。
RNA干扰分子可以是小干扰RNA(siRNA)或microRNA (miRNA)。
siRNA是双链RNA分子,通过与特定RNase酶的结合,进入RNA诱导沉默复合体(RISC)并沉默靶向基因;miRNA则是单链RNA,其通过与RISC的结合实现对基因的沉默。
RNAi技术的应用十分广泛,它可以用于基础生物学实验室中探索基因的功能、研究基因调控网络和信号通路。
例如,RNAi技术可以用于筛选靶向基因,帮助研究人员了解特定基因的功能和相互作用。
此外,RNAi技术也可以用在生物技术领域,例如基因治疗。
研究人员可以将具有治疗作用的siRNA送入人体细胞,从而沉默其特定基因,以达到治疗疾病的目的。
RNAi技术也可以用于农业生产中,例如通过沉默植物高度调控基因,以提高作物耐旱、抗病、高产等特性。
此外,RNA干扰还可以用于研究肿瘤基因并开发靶向性抗癌药物等方面。
然而,在RNAi技术的应用中,还存在一些问题和挑战。
例如,RNAi技术在使用非转染方法时,往往存在进入效率低、沉默效果不稳定等问题;而在使用转染方法的情况下,很容易发生细胞毒性等问题。
此外,RNA干扰分子的大量制备和稳定性也是RNAi技术应用的另一个难点。
因此,我们需要对RNAi技术进行不断的改进和优化,以更好地适用于不同的生物实验和应用领域。
总之,RNAi技术是一种非常有前途的生物技术手段,其广阔的应用前景将在未来的生命科学研究和医药产业中发挥越来越重要的作用。
利用RNA干扰技术沉默稻纵卷叶螟几丁质合成酶A基因
利用RNA干扰技术沉默稻纵卷叶螟几丁质合成酶A基因李娇;杜娟;李尚伟【摘要】稻纵卷叶螟(Cnaphalocrocis medinalis)是一种主要的水稻害虫,几丁质合成酶是昆虫体内几丁质合成通路中的一个关键酶,在昆虫生长发育中具有重要作用,是控制害虫的理想靶标。
本文采用 RNA 干扰(RNAi)技术,以稻纵卷叶螟几丁质合成酶 A 基因(CmCHSA)为靶标,设计两个靶位点 CmCHSA-I 和 CmCHSA-II,在体外分别合成其双链 RNA(dsRNA),用显微注射法导入3龄幼虫体内,然后通过表型观察和荧光定量 PCR(RT-qPCR)检测干扰效应。
结果表明,注射两种 dsRNA 后纵卷叶螟对水稻的取食明显下降,生长发育阻滞,虫体变小变黑和畸形,有的出现死亡。
RT-qPCR 表明,注射 CmCHSA-I 和 CmCHSA-II 两种 dsRNA 在96 h后,CmCHSA 的表达量相比对照分别下降了59%和64%。
注射 CmCHSA-I 和CmCHSA-II 两种 dsRNA 7 d 后,稻纵卷叶螟的死亡率分别为80%和83.33%,与对照组相比,分别增加了66.67%和70%。
本研究用注射法 RNAi 技术成功实现了对稻纵卷叶螟几丁质合成酶 A 基因的沉默,为利用该技术研究昆虫基因的功能,以及通过转基因 RNAi 技术防治稻纵卷叶螟奠定了基础。
%The rice leaf folder, Cnaphalocrocis medinalis (Lepidoptera: Pyralidae) is a chief pest of rice. Chitin synthase is a key enzyme in the pathway of insect chitin synthesis and plays an important role in insect growth and development. Thus, it is believed that this enzyme is an ideal target for pest control. In this study, we designed two target sites (CmCHSA-I and CmCHSA-II) specific to chitin synthase A (CmCHSA) in C. medinalis for RNA interference (RNAi) . CmCHSA-I and CmCHSA-II double-stranded RNAs (dsRNAs) were synthesized in vitro and were separately intro-duced into the 3rd instarlarvae through microinjection. RNAi effects were detected by phenotype observation and real-time quantitative PCR (RT-qPCR). After injection of dsRNA, the larvae developed loss of appetite, growth retardation,and malformation; some died. RT-qPCR showed that at the 96th h after injection of CmCHSA-I and CmCHSA-II dsR-NAs, the mRNA expression of CmCHSA decreased by 59% and 64%, respectively, in comparison with the control. At the 7th d after injection of CmCHSA-I and CmCHSA-II dsRNAs, the larval mortality rates were 80% and 83. 33%, re-spectively, increased by 66. 67% and 70%, compared to the control. CmCHSA was successfully silenced using RNAi by injection, which will lay the foundation for elucidating the function of insect genes as well as for controlling C. medinalis by transgenic RNAi.【期刊名称】《山地农业生物学报》【年(卷),期】2016(035)003【总页数】9页(P10-17,62)【关键词】RNA干扰;稻纵卷叶螟;几丁质合成酶A基因;双链RNA【作者】李娇;杜娟;李尚伟【作者单位】贵州大学昆虫研究所,贵州山地农业病虫害重点实验实,贵州贵阳550025; 贵州大学昆虫资源开发利用特色重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学昆虫研究所,贵州山地农业病虫害重点实验实,贵州贵阳 550025; 贵州大学昆虫资源开发利用特色重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学昆虫研究所,贵州山地农业病虫害重点实验实,贵州贵阳 550025; 贵州大学昆虫资源开发利用特色重点实验室,贵州贵阳 550025【正文语种】中文【中图分类】Q966水稻(Oryza sativa)是人类的一种主要粮食作物,世界上有一半以上的人口以稻米为主食。
植物学rnai技术在植物功能基因组学中的研究进展
1.2 RNAi的分子机制
外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,产生一些dsRNA。胞质中的核酸内切酶Dicer将这些dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的短双链RNA(大约21~25 bp),即siRNA。siRNA在RNA解旋酶的作用下 解链成正义链和反义链,然后反义siRNA再与体内一些酶结合 形成RNA诱导的沉默复合物 (RISC)。RISC与外源性基因表达的 mRNA的同源区进行特异性结 合,RISC具有核酸酶的功能,在结合部位切割mRNA, 被切割 后的断裂mRNA随即降解。
些些片片段段通通过过头头头头相相连连或或尾尾尾尾相相连连导导致致该该转转基基因因产产生生我我互互补补的的hhppRRNNAA((分分子子内内ddssRRNNAA))结结构构。。
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内含子有无在转录时通过拼接产生功能性间隔(spacer)内含子在介导基因沉默比无功能性的内含子更有效。形成带有内含子的ihpRNA载体,其沉默效率比hpRNA高达90%以上。
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4.3植物雄性不育的研究
刘乐承等人采用RNAi技术下调了白菜BcMF4基因的表达,导致了菜心转基因植株部分花粉的不育,证明BcMF4基因在普通白菜和菜心等白菜植物的花粉发育中起着重要作用.Cigan等利用RNAi技术直接沉默玉米的花粉囊基因表达的启动子MS45,从而抑制花粉囊的形成,形成玉米的雄性不育株;利用不同的启动子使已经沉默的启动子MS45重新表达,玉米植株重新恢复育性。
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植物RRNNAAii表达载体的构建
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Contents
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3 植物RNAi表达载体的构建
RNA农药的研究现状和发展前景
基因干扰(RNAi)是一种在动物、植物和微生物中高度保守的基因表达调控工具。
1998年z Fire等首次在秀丽隐杆线虫(Caenorhabditise1egans)中证明了触发基因沉默的关键因子是双链RNA(dsRNA),而非单链RNA o具体而言,dsRNA 被Dicer-Iike蛋白随机剪切成长度为21〜24nt的小RNA(siRNA或miRNA),siRNA与Argonaute蛋白(AGOs)结合形成RNA诱导的沉默复合体(RISCs),该复合体与目标RNA链互补,诱导mRNA降解或抑制翻译进程。
利用RNAi技术靶向有害生物的必须基因,实现高效的基因沉默,可有效控制病虫害的发生。
基于RNAi技术创制的新型核酸农药被称为农药史上第三次革命,与传统化学农药相比,具有靶向性高、易降解、靶点丰富及可灵活设计等优势。
目前,RNAi在植物病虫害防控领域的应用主要通过4种途径实现(图1):(1)HIGS,即培育表达dsRNA的转基因植物以防治病虫害;(2)VIGS,即利用病毒或微生物表达和递送靶标生物dsRNA的方法;(3)SIGS,即创制喷洒型RNA农药,直接喷施于植物表面以控制病原菌和害虫;(4)NDGS,即利用纳米载体递送dsRNA 以诱导靶标基因沉默的方法。
细融核病愎菌害虫细电膜本文介绍了以RNAi 为核心的病虫害防治技术的研究现状,分别论述了基于HIGS.VIGS 、SIGS 和NDGS 策略的RNAi 技术用于防治植物病虫害的应用实例及商业化情况,并对核转基因技术培育转基因作物和创制喷洒型RNA 农药的瓶颈问题进行总结,点明了叶绿体介导的RNAi 技术和纳米载体递送dsRNA 策略的优势。
dsRNA 的合成成本、保护剂和载体制备工艺、转基因植物和载体的生物安全性评估,仍然是未来在研发和商业化生产中需要关注的问题。
O1利用HIGS 策略防控病虫害1.1 核转基因技术的应用研究人员已成功实现利用转基因植物表达调控病虫害生长发育关键基因 叶锹体正义链分离_dsRNAsiRNA核酸除©O 正负电荷 /rJH 离了纳米就体 /dsRNA 复合物H1GS外源dsRNAsiRNA沉默复合体∣⅛jWmRNA Q内源mRNA 降斛\内体逃逸保妒&RNA ;、邳fC 森 释放dsRNANDGS图1RNAi 在植物病虫害防控领域的4种应用策略示意图dsRNA,降低靶基因的表达量,导致靶标生物死亡或发育畸形,从而控制病虫害发展的策略。
RNAi的研究进展
miRNA 与siRNA 的区别:
(1) miRNA是单链的,而siRNA则是双链的;
(2) miRNA参与正常情况下生长发育基因调控,而siRNA不参与动物体的正常生长,只有在病毒或其它dsRNA诱导情况下才产生siRNA,作为miRNA的完善和补充;
(3) miRNA在转录后水平调节基因表达,推测在翻译水平也起作用,而siRNA为转录后水平调节基因表达调控;
(3) 发夹样结构的siRNA实验证明,发夹样siRNA 能延长在细胞内的作用时间。此类结构可由具有回文序列的核苷酸链形成。但通常回文结构不易获得,也可用头碰头的对称序列来代替。转录发夹样siRNA 的模板必须与载体转录启动子紧密相连,而且尽可能有最短的多聚腺苷酸尾巴,这样才能诱导高效的RNAi 效应。Paddison 等提出类似的结构也可应用于长片段dsRNA (500bp 左右) ,而不会引起RNA 非特异性的降解。这为检测哺乳动物细胞中经过长期发育后的基因功能提供了新的途径。
RNA干扰技术在农作物害虫防治中的应用
RNA干扰技术在农作物害虫防治中的应用作者:郭强范仲学褚栋等来源:《山东农业科学》2012年第12期摘要:RNA干扰(RNAi)技术作为基因沉默的工具,已被广泛应用于农作物害虫防治研究。
准确选择靶基因、将dsRNA或siRNA导入昆虫体内、siRNA在昆虫体内的扩增和扩散是RNAi技术应用于农作物害虫防治的基础。
应用RNAi技术能有效地保护农作物抵抗害虫危害,在农作物遗传改良进行精准抗虫方面具有重大的应用前景。
关键词:RNA干扰,农作物,害虫防治中图分类号:S435 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2012)12-0016-04Application of RNAi Technique in Pest Management for CropGuo Qiang, Fan ZhongXue*, Chu Dong, Li XiaoQing(High-Tech Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences/Shandong Provincial Key Laboratoryof Crop Genetic Improvement and Ecology and Physiology, Jinan 250100, China)Abstract RNA interference (RNAi) technique as a tool for gene silencing has been widely used in agriculture for the management of insect pests. Accurately selecting target genes,transferring dsRNA or siRNA into insects and amplifying and spreading the siRNA within the insects are the base for the application of RNAi on pest management. The application of RNAi technique could effectively protect crops from insect pests, and it has better prospect in accurate management of agricultural pests.Key words RNAi; Crop; Pest managementRNA干扰(RNA interference,RNAi)是由与靶基因序列同源的双链RNA(dsRNA)介导的特异性基因表达沉默现象,是生物的一种古老并且进化上高度保守的基因表达调节机制。
RNAi技术在昆虫学中的研究进展及展望_田宏刚-2012
同区域设 计 dsRNA 可 以 有 效 避 免 OTEs 的 产 生, 这将会为我们 在 其 它 昆 虫 中 实 施 RNAi 起 到 一 定 的参考作用, 有助于我们在研究中得到较准确的 结果 。 我们知道 昆 虫 为 天 然 免 疫 系 统, 包括体液免 疫和细胞免疫 2 种方 式, 主 要 用 来 攻 击、 消灭入侵 从而为昆虫的发育提供保障 ( 王 英 和 黄 复 病原体, 生,2008 ) 。 RNAi 作 为 基 因 功 能 研 究 的 重 要 工 具, 研究发现 其 也 是 昆 虫 抵 抗 外 源 病 毒 的 一 种 重 要的天然免疫反应, 主 要 包 括 siRNA 和 miRNA 介 导的 2 种方式 。 siRNA 介 导 方 式 主 要 是 由 外 源 病 以病毒作为模板合成 毒进入生物 体 细 胞 内 以 后, 与病毒 RNA 相 对 应 的 dsRNA , 然 后 进 入 到 RNAi 途径被 Dicer 切 割 成 siRNA , 并 使 RNAi 信 号 在 入 从而导致病毒 RNA 的降解以 起 侵外细胞间传递, 到抵御病 毒 的 影 响 。 例 如 Dicer 基 因 突 变 的 果 蝇 与其野生型 相 比 对 病 毒 的 感 染 能 力 更 为 敏 感, 且 随着 病 毒 滴 度 的 提 高 其 死 亡 率 也 逐 渐 增 加 ( Galiana-Arnoux et al. ,2006 ) 。 这即说明了 RNAi 参与了抵抗病毒的免 疫 反 应 。 研 究 还 发 现 细 胞 内 源性的 miRNA 也 参 与 了 维 护 和 调 节 免 疫 反 应 的 其 作 用 方 式 与 siRNA 的 抗 病 毒 方 式 相 似 。 过程, RNAi 抵抗病毒的功能 在 植 物 中 最 初 发 现, 但是目 前的研究表 明 在 昆 虫 、 线虫和哺乳动物细胞中这 是一种 种抵抗病毒 的 天 然 免 疫 方 式 亦 广 泛 存 在, 古老 的 抵 抗 外 源 核 酸 的 保 护 机 制 ( Berkhout and Haasnoot ,2006 ; Ulvila et al. ,2010 ; Blair ,2011 ; Siu et al. ,2011 ) 。 在 这 些 生 物 体 中, 正是由于这 种免疫机制的存在, 才使我们通过 RNAi 对生物基 因功能的研究成为现实 。
RNAi技术防治害虫的研究进展
RNAi技术防治害虫的研究进展景天忠;董瀛谦;张海侠;刘璇【摘要】利用RNAi技术来防治害虫成了人们研究的热点之一.RNAi可分为细胞自主性的和非细胞自主性的.对应用RNAi技术防治害虫来讲,研究的焦点集中在非细胞自主性RNAi,即昆虫能通过取食来内化目标基因的dsRNA.RNAi技术防治害虫的特异性极高,不会出现残留污染问题.可以通过注射、饲喂和转基因dsRNA来进行害虫的防治.本文还介绍了昆虫吸收dsRNA的机制.【期刊名称】《中国森林病虫》【年(卷),期】2012(031)002【总页数】4页(P19-22)【关键词】RNAi;害虫防治;dsRNA【作者】景天忠;董瀛谦;张海侠;刘璇【作者单位】东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040【正文语种】中文【中图分类】S763.3由于“3R”问题,曾经风光无限的化学防治只能作为害虫防治的最后措施来救急,而近年来令人瞩目的转基因抗虫植物(如Bt棉等)也受到抗性问题的困扰[1]。
但人们寻找害虫控制新方法的步伐从未停止,随着 RNA干涉(RNA interference,RNAi)技术在基因功能研究、基因治疗等方面的广泛应用,以及RNAi机制研究的深入,利用RNAi技术防治害虫成了人们研究的热点之一[2]。
1 RNAi技术防治害虫的原理Fire等首先报道了外源的dsRNA可使与之同源的线虫内源的mRNA沉默,并将这一现象称为RNA干涉[3]。
在此之前这种技术在植物中称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing),在真菌中称为‘quelling’,但在动物中却是一项全新的技术。
目前,RNAi技术已用于基因组研究中对基因功能的鉴定、基因敲除(gene knockdown)、癌症及病毒病的控制。
利用饲喂法RNAi的研究昆虫生长发育相关基因的功能(可编辑)
中山大学博士学位论文利用饲喂法RNAi研究昆虫生长发育相关基因的功能姓名:田宏刚申请学位级别:博士专业:农业昆虫与害虫防治指导教师:张文庆20091125中山大学博士学位论文利用饲喂法研究昆虫生长发育相关基因的功能专业:农业昆虫与害虫防治博士生:田宏刚指导教师:张文庆教授摘要通过诱导的干扰埘已经被广泛地用来研究昆虫基因的功能。
特别是在近几年,通过饲喂的方法己在多种昆虫中诱导靶标基因的沉默。
然而,我们尚不知道通过喂食昆虫非中肠基因的能否诱导产生有死亡表型的基因沉默,以及通过饲喂的方式在刺吸式口器昆虫中是否同样有效本研究首先选取了鳞翅目夜蛾科昆虫甜菜夜蛾为研究对象,克隆了一个与系统相关的重要分子基因片段。
序列比对和系统分析表明,我们得到的这个基因片段为以妇基因的序列,由此说明甜菜夜蛾拥有基因并同时表明该昆虫存在系统的可能性。
然后,选择在表皮和气管中表达但不在中肠表达的几丁质合成酶基因删作为靶标基因,通过饲喂甜菜夜蛾细菌】表达的方法将导入幼虫体内,在持续饲喂七天后发现靶标基因的转录水平被特异性地抑制,而且甜菜夜蛾幼虫的生长发育受到了明显的抑制并产生了蜕皮障碍等死亡表型。
取食含有的饲料后,甜菜夜蛾四龄和五龄幼虫、预蛹和蛹的平均累计存活率分别为.%、.%、.%和.%;其中,五龄幼虫、预蛹和蛹的存活率显著低于个对照组。
研究结果还表明,通过取食细菌表达的对靶标基因的转录水平、组织结构和昆虫存活率的影响均与的浓度存在密切的关系。
为了研究饲喂的方法在刺吸式口器昆虫中能否诱导靶标基因的沉田宏刚利用饲喂法研究昆虫生长发育相关基因的功能为对象并选取了蜕皮激素受体基因默,我们又以褐飞虱作为靶标基因。
通过给褐飞虱饲喂的方式,发现在褐飞虱取食两天后其目标基因的表达即有了明显的下降,在取食四天和六天时的表达依然被抑制;目标基因表达水平的降低对褐飞虱的蜕皮、展翅等发育过程均产生了重要影响。
从三龄若虫开始饲喂两天、四天和六天后的平均存活率为.%、.%和.%;从四龄若虫开始饲喂两天、四天和六天后平均存活率为.%、.%和.%:从五龄若虫开始饲喂两天、四天和六天后的平均存活率则为.%、.%和.%。
利用RNAi技术控制害虫
利用RNAi技术控制害虫闸雯俊;游艾青;李三和;周雷;刘凯;陈志军;杨国才;刘凯;徐华山;李培德【摘要】RNA interference(RNAi), the sequence-specific suppression of gene expression, offers great opportunities for insect science, especially to analyze gene function, manage pest populations, and reduce disease pathogens. The accumulating body of literature on insect RNAi has revealed that the efficiency of RNAi varies between different species, the mode of RNAi de-livery, and the genes being targeted. There is also variation in the duration of transcript suppression. Double-stranded RNA (dsRNA) mediated RNAi has emerged as one of the most powerful strategies for the rapid analysis of gene function,particu-larly in organisms for which stable transgenesis is not available,such as insects.%RNAi能够抑制基因特异序列的表达,为昆虫学的研究提供了新方法,尤其是可以分析基因的功能,控制害虫种群以及减少疾病病原体的感染.昆虫RNAi的相关文献发现不同的种群、RNAi的摄入方式、靶标基因都会影响RNAi的效率,这也是转录本抑制程度存在差异的原因所在.对于那些不能稳定转基因的物种,如昆虫,利用dsRNA介导的RNAi技术是快速分析基因功能的重要手段.【期刊名称】《湖北农业科学》【年(卷),期】2017(056)006【总页数】4页(P1006-1009)【关键词】RNAi;害虫控制;dsRNA【作者】闸雯俊;游艾青;李三和;周雷;刘凯;陈志军;杨国才;刘凯;徐华山;李培德【作者单位】湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064;湖北省农业科学院粮食作物研究所∕粮食作物种质创新与品种改良湖北省重点实验室,武汉 430064【正文语种】中文【中图分类】S476.9RNA干扰(RNA interference,RNAi)已经彻底改变了昆虫学研究的范围,因为它使研究者能够抑制目的基因的表达,从而将改变的表型和基因功能联系起来。
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* 资助项目: 国家自然科学基金( 31101432 ) 、 西北农林科技大学博士科研启动基金( 2010 BSJJ064 edu. cn * *通讯作者, 12 05 , 12 20 收稿日期: 2011 接受日期: 2011-
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转录后基因沉默现象( post transcriptional gene silencing ,PTGS ) 是最初在植物中被发现的( Napoli et al. ,1990 ) , — — 但是导致基因沉默的真正原因 — 由 dsRNA ( double-strand RNA ) 介 导 产 生 的 RNAi 现象 直 到 1998 年 才 在 线 虫 Caenorhabditis elegans 1998 ) 。 现 已 在 真 菌 、 中得以 阐 明 ( Fire et al. , 植 物、 线虫 、 昆虫 、 小鼠等许多真核生物体内都发现 了这种现象, 目前的研究认为 RNAi 是生物进化过 程 中 保 留 下 来 的 一 种 抵 抗 病 毒 侵 入 ( viral invasion ) 、 转 座 子 扩 展 ( transposon expansion ) 和 对 基因 表 达 的 转 录 后 调 节 的 强 有 力 机 制 ( Buckingham et al. , 2004 ; Tijsterman et al. ,
2004 ) 。 由于 RNAi 诱导基因沉默的特异性和高效 性, 特别是在非模式生 物 之 中 操 作 的 简 便 性, 现已 广泛的用于 多 种 生 物 的 基 因 功 能 研 究 之 中, 而且 在基于 RNAi 技术 的 有 害 生 物 控 制 和 疾 病 医 疗 方 面 也 都 展 现 出 良 好 的 应 用 前 景 ( Auer and Frederick ,2009 ; Perrimon et al. ,2010 ) 。 在昆虫学研究中, 现在已经采用注射 、 饲喂导 入 dsRNA 或 siRNA ( small interfering RNA ) 的 方 法 在 多 种 昆 虫 之 中 发 现 可 以 诱 导 RNAi 的 产 生 ( Terenius et al. , 2011 ) 。 这些昆虫包括鞘翅目 、 鳞 翅目 、 膜翅目 、 双 翅 目 和 直 翅 目 等 种 类 的 昆 虫, 而 且研究还发现 在 大 多 数 昆 虫 之 中 RNAi 是 系 统 性
应用昆虫学报 Chinese Journal of Applied Entomology
2012 , 49 ( 2 ) : 309 — 316
RNAi 技术在昆虫学中的研究进展及展望 *
田宏刚
1
张文庆
2* * 杨凌 712100 ; 510275 )
( 1. 西北农林科技大学应用昆虫学重点实验室
2. 中山大学有害生物控制与资源利用国家重点实验室
712100 ,China ;
510275 ,China )
Abstract
RNAi has been recognized as an innate immune mechanism against extracellular viruses , based on this
biological mechanism ,RNAi technology has been established in insects and used widely to investigate kinds of insects ’ gene functions. In the past years ,researchers have found that RNAi has a potential use against insect pests and control beneficial insects ’disease ,and which may will provide a huge boost for agricultural pest control. We reviewed recent advances focusing on RNAi and insect immunology , as well as its use in gene function study , insect pest control , beneficial insects ’disease control along with the insect system biology ,we also prospect the future development of RNAi applied in entomology. Key words RNAi ,insect ,gene function ,insect pest control
应用昆虫学报 Chinese Journal of Applied Entomology
49 卷
的, 在某些 昆 虫 如 赤 拟 谷 盗 Tribolium castaeum 和 蟋蟀 Gryllus bimaculatus 之 中 还 发 现, 对亲本实施 RNAi 在 其 子 代 中 仍 可 观 察 到 基 因 沉 默 现 象 ( Bucher et al. ,2002 ; Ronco et al. ,2008 ) 。 随 着 利用 研究的深入 和 多 种 昆 虫 基 因 组 序 列 的 公 布, RNAi 方法对 单 个 基 因 功 能 的 分 析 已 发 展 到 对 多 个基因 乃 至 整 个 基 因 组 水 平 基 因 功 能 的 研 究 之 中 。 近年来, 利用 RNAi 介导的转基因植物控制害 虫, 以及在野 外 控 制 益 虫 病 害 的 研 究 方 面 亦 有 了 2007 ; Mao et al. , 2007 ; 成 功的报道( Baum et al. , Hunter et al. , 2010 ; Mao et al. , 2010 ) 。 本文重点 就 RNAi 与昆 虫 免 疫 和 RNAi 技 术 在 昆 虫 学 中 的 应用, 以及 RNAi 在昆虫系统生物学研究中的最新 进展进行综述 。
广州
摘
要
RNAi 是一种对抗外源病毒的天然免疫方式, 在昆虫中, 基于生物体中的这种内在机制 而 建 立 的 RNAi 技
术已经被广泛用来研究多种昆虫基因的功能 。 近年的研 究 结 果 表 明 RNAi 技 术 在 抵 御 害 虫 和 防 治 益 虫 疾 病 方 面 具有潜在的应用价值, 有可能对农业有害生物的控制 起 到 巨 大 的 推 动 作 用 。 本 文 综 述 了 RNAi 与 昆 虫 免 疫 、 及其 在昆虫基因功能研究 、 害虫控制 、 益虫疾病控制和昆虫系统生物学方面的最新研究进展, 并展望了 RNAi 在 昆 虫 学 研究中的发展趋势 。 关键词 RNAi ,昆虫,基因功能,害虫控制
Advances and prospects of RNAi technology in entomology
TIAN Hong-Gang 1
* ZHANG Wen-Qing 2 *
( 1. Key Laboratory of Applied Entomology ,Northwest A&F University ,Yangling 2. State Key Laboratory of Biocontrol ,Sun Yat-sen University ,Guangzhou
同区域设 计 dsRNA 可 以 有 效 避 免 OTEs 的 产 生, 这将会为我们 在 其 它 昆 虫 中 实 施 RNAi 起 到 一 定 的参考作用, 有助于我们在研究中得到较准确的 结果 。 我们知道 昆 虫 为 天 然 免 疫 系 统, 包括体液免 疫和细胞免疫 2 种方 式, 主 要 用 来 攻 击、 消灭入侵 从而为昆虫的发育提供保障 ( 王 英 和 黄 复 病原体, 生,2008 ) 。 RNAi 作 为 基 因 功 能 研 究 的 重 要 工 具, 研究发现 其 也 是 昆 虫 抵 抗 外 源 病 毒 的 一 种 重 要的天然免疫反应, 主 要 包 括 siRNA 和 miRNA 介 导的 2 种方式 。 siRNA 介 导 方 式 主 要 是 由 外 源 病 以病毒作为模板合成 毒进入生物 体 细 胞 内 以 后, 与病毒 RNA 相 对 应 的 dsRNA , 然 后 进 入 到 RNAi 途径被 Dicer 切 割 成 siRNA , 并 使 RNAi 信 号 在 入 从而导致病毒 RNA 的降解以 起 侵外细胞间传递, 到抵御病 毒 的 影 响 。 例 如 Dicer 基 因 突 变 的 果 蝇 与其野生型 相 比 对 病 毒 的 感 染 能 力 更 为 敏 感, 且 随着 病 毒 滴 度 的 提 高 其 死 亡 率 也 逐 渐 增 加 ( Galiana-Arnoux et al. ,2006 ) 。 这即说明了 RNAi 参与了抵抗病毒的免 疫 反 应 。 研 究 还 发 现 细 胞 内 源性的 miRNA 也 参 与 了 维 护 和 调 节 免 疫 反 应 的 其 作 用 方 式 与 siRNA 的 抗 病 毒 方 式 相 似 。 过程, RNAi 抵抗病毒的功能 在 植 物 中 最 初 发 现, 但是目 前的研究表 明 在 昆 虫 、 线虫和哺乳动物细胞中这 是一种 种抵抗病毒 的 天 然 免 疫 方 式 亦 广 泛 存 在, 古老 的 抵 抗 外 源 核 酸 的 保 护 机 制 ( Berkhout and Haasnoot ,2006 ; Ulvila et al. ,2010 ; Blair ,2011 ; Siu et al. ,2011 ) 。 在 这 些 生 物 体 中, 正是由于这 种免疫机制的存在, 才使我们通过 RNAi 对生物基 因功能的研究成为现实 。
1
RNAi 与昆虫免疫
RNAi 一般由 dsRNA 介导, 然后被细胞内一种
称之 为 Dicer 的 酶 切 割 成 21 ~ 25 nt 的 siRNA , siRNA 与 RISC ( RNA-induced silencing complex ) 结 合, 在 ATP 供能的情况下, 寻找到与 siRNA 序列互 补的靶 mRNA 进行切割, 使其降解, 最终达到了降 导 低 mRNA 表达 水 平 的 作 用 。 现 在 的 研 究 发 现, 致靶标基因沉默的小 分 子 RNA 除 了 siRNA 以 外, 还 有 miRNA ( microRNA ) 和 endo-siRNA ( endogenous small interfering RNAs ) ( Okamura and Lai ,2008 ; Ulvila et al. ,2010 ; Yamaguchi et al. , 2011 ) 。 在昆 虫 基 因 功 能 研 究 中, 导入虫体的长链 dsRNA 进 入 细 胞 内 即 会 被 Dicer 切 割 成 许 多 小 片 段的 siRNA , 而 这 些 siRNA 除 了 会 与 互 补 mRNA 结合外, 还有 一 些 siRNA 可 能 会 与 某 些 非 靶 标 基 即导 致 非 靶 标 基 因 沉 默 而 产 生 脱 靶 效 应 因结合, ( off-target effects , OTEs ) ( Seinen et al. ,2010 ) 。 在果 蝇 Drosophila melanogaster 之 中 的 研 究 发 现 RNAi 筛 选 时 dsRNA 设 计 不 恰 当 会 产 生 许 多 OTEs , 而且当 siRNA 分子中有大于 19 以上的碱基 与非靶标基因互补时, 那么 OTEs 的几率则会快速 2006 ) 。 由 增加( Kulkarni et al. ,2006 ; Ma et al. , OTEs 对 于 我 们 通 过 RNAi 来 鉴 定 基 此可以看出, 所 以 设 计 合 适 的 dsRNA 因功能会有 较 大 的 影 响, 以避免 OTEs 的 产 生 对 我 们 得 到 准 确 的 实 验 结 果 显得尤为重要 。 Seinen ( 2010 ) 和 Booker ( 2011 ) 通 发现针对基因不 过对果蝇进 行 生 物 信 息 学 分 析,