五种致泻性大肠埃希氏菌多重PCR检测试剂盒...
致泻大肠埃希氏菌
3.
生化反应
生化反应十分活泼,是鉴定肠道菌的重要 依据。 乳糖发酵试验在初步鉴别肠道致病和非致 病菌时有重要意义,肠道致病一般不分解乳 糖,而非致病菌多数能分解乳糖。
鉴定中最重要的生化反应
乳糖发酵试验
肠道非致病菌(埃希菌属) 发酵乳糖、产酸产气+
肠道致病菌(志贺菌属、
沙门菌属等)不发酵乳糖 —
4. 抗原构造复杂
在肉汤培养基中生长18-24小时变为均匀浑浊,而 后底部出现粘性沉淀物,并伴有臭味。
培养特性
部分菌落可出现β溶血。 在远藤琼脂上长成带金属光泽的红色菌落。
在SS琼脂平板上多不生长,少数生长的细菌
也因发酵乳糖产酸而形成红色菌落。
在伊红美兰琼脂上形成具有金属光泽的黑色菌落。
在麦康凯琼脂上培养24小时后孤立菌落呈红色。
肠产毒性大肠埃希氏菌 (Enterotoxigenic E. coli,ETEC)
引起婴幼儿和旅游者腹泻,出现轻度水泻, 也可呈严重的霍乱样症状。腹泻常为自限性, 一般2-3天即愈。致病因素是LT或ST,或两者 同时致病。有些菌株具有定居因子,常见者 为O6:K15:H16、O25:K7:H42。鉴定ETEC 主要测定大肠杆菌肠毒素,血清型有一定参 考意义。
分类
肠杆菌科
埃希氏菌属
大肠埃希氏菌
致泻大肠埃希氏菌
肠道致病性大 肠埃希氏菌 EPEC
肠道出血性大 肠埃希氏菌 EHEC
产肠毒素大肠 埃希氏菌 ETEC
肠道侵袭性大 肠埃希氏菌 EIEC
致泻大肠埃希氏菌
致泻性大肠埃希氏菌的形态特点、培养特性和生化 特性均与非致病的大肠埃希氏菌非常相似,以至难 以区分,只能通过血清学的方法,从抗原结构的差 异来区别。 在致泻性大肠埃希氏菌中,有些血清型能够引起人 的食物中毒,有些血清型能够引起人的肠道内外感 染。还有一些血清型的菌株能够使畜禽发病,危害 畜牧业,降低畜产食品的质量。致泻性大肠埃希氏 菌可从饮用水,未消毒牛乳,病畜脏器、禽类及其 人畜粪便污染的各种食品中分离出来。
致泻大肠埃希氏菌的危害程度评估报告
致泻大肠埃希氏菌的危害程度评估报告Document serial number【KK89K-LLS98YT-SS8CB-SSUT-SST108】致泻大肠埃希氏菌危害程度评估报告一、生物学特性大肠埃希氏菌更习惯称为大肠杆菌,分类于肠杆菌科,归属于埃希氏菌属,统称为致泻性大肠杆菌,一般包括五种:即肠毒素性大肠杆菌(ETEC)、致病性大肠杆菌(EPEC)、出血性大肠杆菌(EHEC)、侵袭性大肠杆菌(EIEC)和粘附性大肠杆菌(EAEC)。
大肠埃希氏菌为两端钝圆的短小杆菌,一般大小约0.5μ-0.8μm*1.0μm-3.0μm,因生长条件不同,个别菌体可呈近似球状或长丝状。
此菌多单独存在或成双,但不呈长链状排列。
约有50%左右的菌株具有周生鞭毛而能运动,但多数菌体只有1-4根,一般不超过10根,故菌体动力弱;多数菌株生长有比鞭毛细、短、直且数量多的菌毛,有的菌株具有荚膜或微荚膜;不形成芽胞,对普通碱性染料着色良好,革兰氏染色阴性。
此菌合成代谢能力强,在含无机盐、胺盐、葡萄糖的普通培养基上生长良好。
最适生长温度为37℃,在42-44℃条件下仍能生长,生长温度范围为15-46℃。
在普通营养琼脂上生长表现3种菌落形态:光滑型、粗糙型、粘液型。
大肠埃希氏菌兼性厌氧,在有氧条件下生长良好,最适生长pH为6.8-8.0,所用培养基pH为7.0-7.5,若pH值低于6.0或高于8.0则生长缓慢。
大肠埃希氏菌生华物性是,发酵葡萄糖、乳糖、麦芽糖和甘露醇产酸产气,分解蔗糖因菌株而异,录素酶试验阴性,IMVi试验++--,有些菌株如碱性异型菌群,微产碱,不产气,无动力,易与志贺菌混淆。
大肠埃希氏菌的抗原构造主要由菌体抗原(O),鞭毛抗原(H)和荚膜抗原(K)三部分组成。
现巳知有171个O抗原、99个K抗原和56个H抗原。
二、危害程度分类根据中华人民共和国卫生部制定《人间传染的病原微生物名录》该菌危害程度为第三类。
三、致病性和感染剂量致泻大肠埃希氏菌在人和动物的大便中大量存在,引起人体以腹泻症状为主的全球性疾病,其中尤以EPEC、ETEC所占比例为大。
食品中肠道出血性大肠埃希氏菌能力验证结果分析与讨论
中国检验检测202丨年第1期食品中肠道出血性大肠埃希氏菌能力验证结果分析与讨论马蓉吉瑞周露马秋莲朱聿元(宝应县产品质量综合检验检测中心,宝应225800)摘要:为了提升实验室对食品中肠道出血性大肠埃希氏菌的检测能力,增强实验室竞争能力,本实验室参加了认监委 组织的食品中肠道出血性大肠埃希氏菌检测能力验证活动依据GB4789. 6-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验致 泻大肠埃希氏菌检验》,采用PCR方法检测毒力基因,对疑似菌进行鉴定。
发现编号19-H566和19-L321样品均检出肠道出 血性大肠埃希氏菌。
说明利用PCR方法检测致泻性大肠埃希氏菌的毒力基因能够有效的鉴别其致病型。
关键词:能力验证;肠道出血性大肠埃希氏菌;PCR检测中图分类号:TS201.3 文献标识码:A DOI:10. 16428/lO-1469/tb.2021. 01.030〇引言大肠埃希氏菌属于大肠埃希氏菌属,广泛分布在 人体和自然界中,大部分菌种对人体不会产生危害i l]。
但是,有些带有致病基因的菌种会引起人类肠道感染,并可引发致死性并发症:2],这类菌株被称为致泻性大 肠埃希氏菌(DEC)。
根据致泻性大肠埃希氏菌的致病 情况不同可将其分为5种类型及11种相关毒力基因:肠道出血性大肠埃希氏菌(EHEC)、肠道侵袭性大肠埃 希氏菌(EIEC)、肠道致病性大肠埃希氏菌(EPEC)、肠 产肠毒素大肠埃希氏菌(ETEC)、肠粘附性大肠埃希氏 菌(EAEC)。
其中,肠道出血性大肠埃希氏菌为最严重 的一种致病性大肠埃希菌,自1983年以来多次在世界 各地广泛流行,对人类的健康构成极大威胁11。
肠道 出血性大肠埃希氏菌的感染基本属于食源性疾病,牛 肉、牛奶、鸡肉、蔬菜、水果、饮料及水等均可成为传染 源0],因此,对食品中肠道出血性大肠埃希氏菌的检测 就显得尤为重要。
然而,传统的微生物学分离、鉴定以 及血清学方法在检测病原微生物方面日益显现不足,PCR技术,B P聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)以其快速、灵敏以及特异性强的优势,成为了病 原微生物快速鉴别与分型的重要技术之一。
致泻大肠埃希氏菌
第二法 PCR 方法1
7 操作步骤 增菌、分离、初步生化试验同 5.1-5.3。 用 5.3.1 中已培养的营养琼脂斜面上生长的菌苔,采用 PCR 检测特异毒力基因方法鉴 别 5 种致泻大肠埃希氏菌,然后再进行血清学分型实验。 8 PCR 试验 8.1 标准菌株 标准菌株一览表见表 3。 表3 菌株名称 EPEC STEC ETEC EIEC EAEC 大肠埃希氏菌 8.2 引物合成 多重 PCR 引物序列见表 4。
五种致泻大肠埃希氏菌目的基因引物序列 引物序列 5′-ATT CTG GCT CTC TTC TTC TTT ATG GCT G-3′ 5′-CGT CCC CTT TTA CAA ACT TCA TCG C-3′ 5′-GAC ACC TCA TTG CTG AAG TCG-3′ 5′-CCA GAA CAC CTC CGT TAT GC-3′ 5′-CGA TGT TAC GGT TTG TTA CTG TGA CAG C-3′ 5′-AAT GCC ACG CTT CCC AGA ATT G-3′ 5′-GTT TTG ACC ATC TTC GTC TGA TTA TTG AG-3′ 5′-AGC GTA AGG CTT CTG CTG TGA C-3′ 5′-GAA CAG GAG GTT TCT GCG TTA GGT G-3′ 5′-CTT TCA ATG GCT TTT TTT TGG GAG TC-3′ 5′-CCT CTT TTA GYC AGA CAR CTG AAT CAS TTG-3′ 5′-CAG GCA GGA TTA CAA CAA AGT TCA CAG-3′ 5′-TGT CTT TTT CAC CTT TCG CTC-3′ 5′-CGG TAC AAG CAG GAT TAC AAC AC-3′ 5′-CGA TCA AGA ATC CCT AAC AGA AGA ATC AC-3′ 5′-CGA TAG ATG GCG AGA AAT TAT ATC CCG-3′ 5′-TGC CAT CAA CAC AGT ATA TCC G-3′ 5′-ACG GCT TTG TAG TCC TTC CAT-3′ 5′-ACG CAG AGT TGC CTG ATA AAG-3′ 5′-AAT ACA GAA TCG TCA GCA TCA GC-3′ 5′-AAA TGT CAG TGA ACC GAC GAT TGG-3′ 5′-AGC CGT TTC CGC AGA AGC C-3′ 5′-AAA GTG TGG GTC AAT AAT CAG GAA GTG-3′ 5′-ATG CCA GTC CAG CGT TTT TGC-3′ 片段大小 (bp) 544 910 244 324 655
腹泻病例中5种致泻性大肠埃希菌的分子分型研究
分析检测腹泻病例中5种致泻性大肠埃希菌的分子分型研究王雪梅,张 苗(淄博市疾病预防控制中心,山东淄博 255206)摘 要:目的:对腹泻病例中致泻性大肠埃希菌(DEC)进行PCR毒力基因检测,了解其流行特征,通过脉冲场凝胶电泳确定菌株之间的相关性,为预防疾病提供技术支持。
方法:采集腹泻患者粪便,利用毛细管电泳仪对可疑DEC进行确认,收集患者信息,采用PFGE技术进行分子分型,用BioNumerics 软件进行聚类分析。
结果:检出的92例DEC阳性病例中,0~12岁患者15例;13~44岁患者60例;45~59岁患者9例;≥60岁患者8例。
92株DEC中共有89种带型,DNA条带相似度为9.36%~100.00%。
结论:不同年龄人群检出率有所差异,年龄在13~44岁检出率最高。
DEC菌株分子分型带型分散,呈现高度多态性。
关键词:致泻性大肠埃希菌;流行特征;脉冲场凝胶电泳Molecular Typing of Five Diarrheagenic Escherichia coliin Diarrhea CasesWANG Xuemei, ZHANG Miao(Zibo Center for Disease Control and Prevention, Zibo 255206, China) Abstract: Objective: PCR virulence gene detection of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) in diarrhea cases was carried out to understand its epidemic characteristics. The correlation between strains was determined by pulsed field gel electrophoresis, provide technical support for disease prevention. Method: Collect feces from diarrhea patients, confirm suspicious DEC using capillary electrophoresis, collect patient information, use PFGE technology for molecular typing, and use BioNumerics software for cluster analysis. Result: Among the 92 DEC positive cases detected, there were 15 cases aged 0~12 years old; 60 patients aged 13~44; 9 cases detected between 45 and 59 years old; 8 patients ≥60 years old. 92 strains of DEC have a total of 89 band types, with a DNA band similarity of 9.36%~100.0%. Conclusion: The detection rate varies among different age groups, with the highest detection rate occurring between the ages of 13 and 44. The molecular typing bands of DEC strains are scattered and exhibit high polymorphism.Keywords: diarrheagenic Escherichia coli; popular characteristics; pulsed field gel electrophoresis大肠埃希氏菌是人体的正常菌群,后来人们发现某些大肠埃希菌可引起腹泻并在人群中流行,称为致泻大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)。
多重PCR法在食品中致泻大肠埃希氏菌质控考核中的应用
多重PCR法在食品中致泻大肠埃希氏菌质控考核中的应用摘要:目的通过多重PCR方法检测质控样本中致泻性大肠埃希氏菌方法:参照GB4789.6-2016《食品安全国家标准食品微生物学致泻大肠埃希氏菌菌检验》进行检验,结果编号15-1样品检出EHEC,15-2样品检出ETEC。
本实验室顺利完成考核,结果与考核方一致。
结论:多重PCR法在质控考核中,能够对目标菌快速鉴别,能够快速顺利完成质控考核,同时了解该实验室检验能力和实验室质控水平,提高检验机构出具检验数据的可靠性和有效性,保证实验室的检测水平。
关键词:质控考核;致泻大肠埃希氏菌;多重PCR1.引言大肠埃希氏菌俗称大肠杆菌,是人类和动物的肠道中重要的正常菌群,为宿主提供一些有营养作用的合成代谢产物。
多数大肠埃希氏菌并不致病,当机体抵抗力下降或侵入肠外组织或器官时,可作為条件致病菌而引起肠道外的感染,引起胃肠炎的大肠埃希氏菌分为五类即肠致病性大肠埃希氏菌(EPEC)、肠产肠毒素大肠埃希氏菌(ETEC)、肠侵袭性大肠埃希氏菌(EIEC)、肠出血性大肠埃希氏菌(EHEC)和粘附性肠埃希氏菌(EAEC)[1]。
快速检测和鉴定病原菌是及时有效地控制与预防传染病传播的重要手段。
传统的微生物学分离与鉴定以及血清学方法在鉴别与鉴定病原微生物方面日益显现出不足。
PCR法快速、敏感、特异,是对病原菌快速鉴别与分型的重要技术之一,而多重PCR更以其突出的优越性得到了广泛的应用[2]。
2.材料与方法2.1样品样品编号为15-1,15-2,每份考核样品包含西林瓶1个,西林瓶中装有白色冻干菌球。
本次考核共计2份样品。
2.2试剂及仪器营养肉汤、肠道菌增菌肉汤、麦康凯琼脂(MAC)、伊红美蓝琼脂(EMB)、三糖铁(TSI)琼脂、大肠埃希氏菌生化套盒、无菌双蒸水,以上试剂均使用北京路桥。
五种致泻大肠埃希氏菌DNA提取试剂盒、多重PCR及实时荧光PCR试剂盒均使用北京卓诚惠生,实时定量PCR仪器(BIO-RAD公司),凝胶成像仪(BIO-RAD公司),电泳仪。
大肠埃希氏菌鉴定试剂盒
大肠埃希氏菌干制生化鉴定试剂盒E.coli Dehydration Biochemical Identification Kit大肠埃希氏菌干制生化鉴定试剂盒组成:干制生化鉴定试剂:4种/盒×10 盒;0.5麦氏浊度比浊管:1支;配套试剂:Kovacs氏靛基质试剂1瓶、甲基红试剂1瓶、V-P甲、乙液试剂各1瓶; 使用说明书:1份实验操作步骤: 1. 从铝箔袋中取出试剂盒,打开盒盖,在试剂盒的长条槽中加入0.5mL无菌水;2. 用接种环从平板上挑取新鲜培养的单个纯菌落至适量无菌水中,制成0.5麦氏浊度的均一菌悬液;3. 接种菌悬液分别至试剂盒的4个圆孔中,每孔接种量0.2mL,盖上盒盖,36℃±1℃培养24h。
结果判定:保存条件和保质期:室温避光保存1年。
其他相关试剂盒:名称用途及用法大肠埃希氏菌干制生化鉴定试剂盒E.coli Dehydration Biochemical Identification Kit 用于大肠杆菌的IMVC 生化系统鉴定(GB4789.38-2012),包括蛋白胨水、MR、VP和西蒙氏枸橼酸盐共 4 种生化鉴定试验和配套试剂(靛基质、甲基红、VP甲乙液)阪崎肠杆菌干制生化鉴定试剂盒Enterobacter sakazakii Dehydration Biochemical Identification Kit 用于阪崎肠杆菌的生化鉴定(GB4789.40-2010),包括氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、鸟氨酸脱羧酶、精氨酸双水解酶、西蒙氏柠檬酸盐、D-山梨醇、L-鼠李糖、D-蜜二糖、D-蔗糖和苦杏仁苷共10种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡)志贺氏菌干制生化鉴定试剂盒Shigella Dehydration Biochemical Identification Kit 用于志贺氏菌的生化鉴定(GB4789.5-2012),包括氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、鸟氨酸脱羧酶、靛基质、尿素、水杨苷、七叶苷、甘露醇、棉子糖、ONPG、甘油、葡萄糖铵、西蒙氏柠檬酸盐、粘液酸对照、粘液酸、三糖铁、半固体共17 种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、靛基质)单增李斯特氏菌干制生化鉴定试剂盒Listeria Monocytogenes Dehydration Biochemical Identification Kit 用于单增李斯特氏菌的生化鉴定(GB4789.30-2010),包括MR、VP、葡萄糖、麦芽糖、鼠李糖、木糖、甘露醇、七叶苷共8 种生化鉴定试验和配套试剂(糖发酵添加剂、甲基红、VP 甲乙液)沙门氏菌干制生化鉴定试剂盒Salmonella Dehydration Biochemical Identification Kit 用于沙门氏菌的生化鉴定(GB4789.4-2010),包括氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、氰化钾对照、氰化钾、靛基质、尿素、甘露醇、山梨醇、ONPG、三糖铁共10 种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、靛基质)大肠埃希氏菌O157:H7干制生化鉴定试剂盒E.coli O157:H7 Dehydration Biochemical Identification Kit 用于大肠埃希氏菌O157:H7/NM的生化鉴定(GB/T4789.36-2008),包括氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、鸟氨酸脱羧酶、MR、VP、靛基质、西蒙氏柠檬酸盐、纤维二糖、棉子糖、三糖铁、半固体共11种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、靛基质、甲基红、VP甲乙液)蜡样芽孢杆菌干制生化鉴定试剂盒Bacillus cereus Dehydration Biochemical Identification Kit 用于蜡样芽孢杆菌的生化鉴定(GB 4789.14-2014),包括葡萄糖、VP、硝酸盐、明胶、动力培养基(蜡样)、甘露醇、西蒙氏柠檬酸盐、溶菌酶肉汤共8种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、硝酸盐还原甲乙液、VP 甲乙液)副溶血性弧菌干制生化鉴定试剂盒Vibrio parahaemolyticus Dehydration Biochemical 用于副溶血性弧菌的生化鉴定(GB 4789.7-2013),包括无盐胨水、6% 盐胨水、8% 盐胨水、10% 盐胨水、葡萄糖、蔗糖、乳糖、Identification Kit 甘露醇、氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、鸟氨酸脱羧酶、精氨酸双水解酶、VP、ONPG、3%NaCl三糖铁、3%NaCl半固体共16种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、糖发酵添加剂、VP甲乙液)致泻大肠埃希氏菌干制生化鉴定试剂盒Diarrheogenic E.coli Dehydration Biochemical Identification Kit 用于致泻大肠埃希氏菌的生化鉴定(GB/T4789.6- 2003),包括氨基酸对照、赖氨酸脱羧酶、氰化钾对照、氰化钾、靛基质、尿素、三糖铁、半固体共8种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、靛基质)小肠结肠炎耶尔森氏菌干制生化鉴定试剂盒Yersinia enterocolitica Dehydration Biochemical Identification Kit 用于小肠结肠炎耶尔森氏菌的生化鉴定(GB/T 4789.8-2008),包括氨基酸对照、鸟氨酸脱羧酶、VP、蔗糖、鼠李糖、棉子糖、甘露醇、山梨醇、尿素、半固体共10 种生化鉴定试验和配套试剂(无菌石蜡、糖发酵添加剂、VP 甲乙液)。
多重PCR方法快速检测4种主要致腹泻性大肠埃希菌
大肠 埃 希 菌的 方 法 具 有 重要 意义 。基 于 E E T肠 毒 素 基 因 、 P C A 基 因 、 H C O抗 原 基 因 和 EE T CL EE E E IC侵
袭 性 质 粒 特 异 性 基 因 , 计 了 4对 特 异 性 引物 , 过 对 单 一 P R反 应 条 件 的优 化 建 立 了快 速 检 测 4种 主 要 致 设 通 C
微 生物学 杂 志 21年5 0 0 月第3 卷 第3 JU N L F IR B L G a 21 V1 0 。3 0 期 O R A C O I O YM y 00 o 3 N. OM O .
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பைடு நூலகம்
多重 P R方 法 快 速 检 测 4种 主 要 致腹 泻 性 大 肠 埃 希 茵 C
徐 义 刚’ 崔 丽春 ,李 苏龙 , ,姜 艳 春 谢 晓峰 , ,刘 新 亮
( .黑 龙 江 出入 境 检 验 检 疫 局 检 验 检 疫 技 术 中 心 , 龙 江 哈 尔 滨 1 黑 10 0 ;.东 北 林 业 大 学 , 龙 江 哈 尔 滨 5 0 12 黑 104 ) 50 0
Ab ta t E t ( x e i E cl E E ) e t o a o e i E cl E E ) e t o e 0r i E cl ( H C) sr c ne 】 唔 nc . o t ro i( T C , ne p t g nc . o r h i( P C , ne h m r g . o E E , r h c i
Es he i h a c l u t- c r c i o iby M liPCR e ho M t d
XU Yig n ,CUILic u ,LIS lng JANG h c u ,XI Xio fn , L U Xi .i n —a g —h n u—o , I Ya . h n E a —e g I n1 g a
5种致泻大肠埃希氏菌不同浓度下的国标法检出率分析
5种致泻大肠埃希氏菌不同浓度下的国标法检出率分析胡春红,陆其聪*(四川省轻工业研究设计院有限公司,四川成都 610081)摘 要:目的:研究5种致泻大肠埃希氏菌使用GB 4789.6—2016法检测时,不同初始浓度下,二次增菌取不同接种体积的检出率。
方法:不同初始浓度下(1~3 CFU·mL-1,10~30 CFU·mL-1,100~300 CFU·mL-1)的5种致泻大肠埃希氏菌加入营养肉汤增菌后,取不同体积(10 μL、50 μL、100 μL、500 μL、1 000 μL)的预增菌液接种于肠道增菌肉汤管中,培养后划线于伊红美蓝琼脂(Eosin-Methylene Blue,EMB)和麦康凯琼脂(MacConkey Agar,MAC)平板,观察并记录平板中菌落生长情况,计算检出率。
结果:5种致泻大肠埃希氏菌接种量在10 CFU及以上时,二次增菌时取10 μL预增菌液至肠道增菌肉汤中,均能检出。
5种致泻大肠埃希氏菌接种量在1~3 CFU时,二次增菌时取10 μL和50 μL预增菌液至肠道增菌肉汤中,平均检出率均不能达到100%;二次增菌时接种体积增加到100 μL时,肠道集聚性大肠埃希菌EAEC(CICC24186)、肠出血性大肠埃希菌EHEC(CICC24187)、产肠毒素大肠埃希菌ETEC(CICC24190)的检出率能达到100%,而肠道侵袭性大肠埃希菌EIEC(CICC24188)、肠道致病性大肠埃希菌EPEC (CICC24189)的检出率仍不能达到100%。
结论:在实际检测工作中,在所检样品中致泻大肠埃希氏菌含量较低时,可以考虑增加二次增菌的接种量,减少漏检可能。
关键词:致泻大肠埃希氏菌;国家标准方法;检出率Analysis of the Detection Rate of 5 Kinds of Diarrheagenic Escherichia Coli at Different Concentrations by NationalStandard MethodHU Chunhong, LU Qicong*(Sichuan Light Industry Research and Design Institute Co., Ltd., Chengdu 610081, China) Abstract: Objective: To study the detection rates of 5 types of diarrhea causing Escherichia coli using the GB 4789.6—2016 method at different initial concentrations and different inoculation volumes for secondary enrichment. Method: Five types of diarrhea causing Escherichia coli at different initial concentrations (1~3 CFU·mL-1, 10~30 CFU·mL-1, 100~300 CFU·mL-1) were added to nutrient broth for enrichment, and different volumes (10 μL, 50 μL, 100 μL, 500 μL, 1 000 μL) inoculate the pre enrichment solution into the intestinal enrichment broth tube, and after cultivation, line it on eosin methylene blue (EMB) and macconkey agar (MAC) plates. Observe and record the bacterial colony growth in the plates, and calculate the detection rate. Result: When the inoculation amount of 5 types of diarrhea causing Escherichia coli was 10 CFU or above, 10 μL of pre enriched liquid was taken into the intestinal enrichment broth during the second enrichment, and all of them could be detected. When the inoculation amount of 5 types of diarrhea causing Escherichia coli is 1~3 CFU, 10 μL and 50 μL of pre enriched liquid are taken during the second enrichment into the intestinal enrichment broth, and the average detection作者简介:胡春红(1991—),女,四川内江人,本科,助理工程师。
五种致泻性大肠埃希氏菌多重PCR检测试剂盒
五种致泻性大肠埃希氏菌多重PCR检测试剂盒研发背景大部分的大肠杆菌是人或动物倡导的共生菌,但其中也有部分菌株可引起腹泻等疾病。
致泻大肠杆菌不但可引起传染性疾病而且可引起食源性疾病的暴发。
根据发病机制、临床特征、流行病学特征、O抗原血清及细菌的毒力测定,可将致泻大肠杆菌分为5类:致病性大肠杆菌(EPEC)、产毒性大肠杆菌(ETEC)、侵袭性大肠杆菌(EIEC)、粘附性大肠杆菌(EAEC)、出血性大肠杆菌(EHEC)。
目前针对致泻大肠杆菌的常规实验室检测方法仍然较为薄弱,需要研究快速、简便、准确的分子生物学方法。
【检验原理】五种致泻性大肠杆菌(EPEC、EHEC、EAEC、EIEC、ETEC)共含有11种毒力基因,针对这11种毒力基因,天津生物芯片试剂盒使用11对特异引物,与样本中基因组的相应靶位点特异性结合,PCR反应后,不同类型的样本产生不同的扩增片段,从而达到对五种致泻性大肠杆菌快速分型检测的目的。
【使用方法】1.试剂配制(试剂准备区)从试剂盒中取出PCR反应液在室温融化,将PCR反应液充分震荡混匀,所有试剂在使用前2000rpm离心10s。
设所需要的管数n(n=样本数+1管阴性对照品),每个测试反应体系试剂配置如下表。
计算所需要的n管反应的各试剂的使用量,加入至适当体积的无菌离心管中,充分混合均匀,分装至无菌PCR反应管中,每管24μl。
2.PCR扩增(扩增和产物分析区)将样本、阴性对照品使用前恢复至室温,2000rpm离心10s。
向每个PCR反应管中分别加入样本、阴性对照品各1μl,震荡混匀,于2000rpm离心10s。
将PCR管放入PCR仪中,使用以下程序进行扩增反应,整个扩增反应约需2小时:Step 1 94℃ 5minStep 2 94℃ 30sStep 3 63℃ 30s 30 个循环Step 4 72℃ 90sStep 5 72℃ 5min3.结果判断(扩增和产物分析区)从PCR管中取出2μl PCR产物与9μl阳性对照品一起进行浓度为2%的琼脂糖凝胶电泳检测,在紫外灯下阳性对照品从上至下应有11条带,分别为1487bp、1111bp、910bp、766bp、655bp、544bp、400bp、324bp、244bp、171bp和102bp。
大肠埃希氏菌实验室检验方法
大肠埃希氏菌实验室检验方法简介大肠埃希氏菌(Escherichia coli)是一种常见的肠道细菌,它可以引起多种疾病,包括食物中毒、泌尿道感染和肠道感染等。
因此,对大肠埃希氏菌进行实验室检验是非常重要的。
本文将介绍大肠埃希氏菌实验室检验的方法和步骤。
实验室检验方法大肠埃希氏菌实验室检验主要包括以下几个方面:1.样品采集:根据不同的检验要求,可以采集不同的样品,例如食物、水样、粪便等。
采集样品时需要注意避免污染和交叉感染。
2.样品处理:对于食物和水样,通常需要进行前处理步骤,如浸泡、稀释等。
对于粪便样品,可以直接进行处理。
3.培养方法:将样品接种到适当的培养基上,培养培养基通常包括富营养的琼脂、选择性培养基等。
大肠埃希氏菌喜欢在富含葡萄糖的培养基上生长。
4.鉴定方法:通过观察菌落形态、生理生化特性和抗生素敏感性等指标,进行大肠埃希氏菌的鉴定。
常用的鉴定方法包括免疫学方法、分子生物学方法和生化试剂盒等。
5.结果判读:根据鉴定结果,判断样品中是否存在大肠埃希氏菌。
根据不同的检验要求,可以进行定性或定量判读。
实验步骤下面是一个常见的大肠埃希氏菌实验室检验的步骤示例:1.样品采集:根据检验要求,采集相应的样品。
例如,如果是食物样品,可以使用无菌取样棒在食物表面轻轻刮取一些,然后放入无菌容器中。
2.样品处理:对于食物样品,可以将其浸泡在含有缓冲液的容器中,摇动一段时间,使菌落充分分散。
对于水样,可以进行适当的稀释。
3.培养方法:将处理后的样品接种到富含葡萄糖的培养基上,如MacConkey琼脂或EC琼脂。
根据需要,可以使用选择性培养基,如Eosin MethyleneBlue琼脂。
4.培养条件:将接种的培养基置于适当的温度和湿度条件下,一般为37摄氏度,培养时间通常为24小时。
5.菌落观察:观察培养基上的菌落形态,大肠埃希氏菌通常呈现为粉红色的菌落,具有金属光泽。
6.鉴定方法:根据需要,可以进行进一步的鉴定。
5类致泻性大肠埃希氏菌多重荧光PCR检测方法的建立
Establishment of Multiplex Real-Time PCR Assay to Detect Five Strains of Diarrheagenic Escherichia coli
HU Antuoபைடு நூலகம்,2, WANG Ping1, ZHANG Caixia1,3, CAI Yang1,4, CHEN Ying1,*
3. College of Food Science and Engineering, Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430070, China; 4. Jilin Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Changchun 130062, China)
method were finally tested. Results: The primers and probes specifically amplified 11 gene fragments, and the sensitivities of systems A and B were 2.6 × 104 and 2.2 × 104 copies/reaction, respectively. Conclusion: The multiplex real-time PCR
大肠埃希氏菌检测标准
大肠埃希氏菌(Escherichia coli)是一种常见的细菌,其中某些菌株可能引起食物中毒或感染。
大肠埃希氏菌的检测标准可以根据不同的应用领域和目的而有所不同。
以下是一般食品安全和公共卫生领域中常见的大肠埃希氏菌检测标准:
食品中的大肠埃希氏菌检测:
检测方法:常用的检测方法包括培养法、分子生物学方法(如PCR)和免疫学方法(如ELISA)等。
培养法是最常用的方法,通过培养食物样品中的细菌并进行鉴定和计数。
标准数量限制:食品中大肠埃希氏菌的数量通常以菌落形成单位(CFU)来表示。
不同国家和地区可能有不同的标准限制,通常要求食品样品中大肠埃希氏菌数量低于一定的阈值。
饮用水中的大肠埃希氏菌检测:
检测方法:常用的检测方法包括多管发酵法、膜过滤法和分子生物学方法等。
多管发酵法和膜过滤法通过将水样进行培养并进行鉴定和计数。
分子生物学方法可以通过检测特定的基因序列来识别大肠埃希氏菌。
标准数量限制:饮用水中大肠埃希氏菌的数量通常以菌落形成单位(CFU)或基因检测结果来表示。
不同国家和地区可能有不同的标准限制,通常要求饮用水中大肠埃希氏菌数量低于一定的阈值。
5种致泻大肠埃希氏菌实时荧光定量PCR快速检测技术
5种致泻大肠埃希氏菌实时荧光定量PCR快速检测技术王芳妹;钟文涛;王淑好;卢琳;韩奉玲【摘要】将5种致泻大肠埃希氏菌的毒力基因保守序列进行设计并合成了引物和探针,建立的多重实时荧光PCR 4种试剂盒可以同时检测5种致泻大肠埃希氏菌.结果表明:4种试剂盒的12对毒力基因通过5种致泻大肠埃希氏菌的标准储备菌株均得到验证;并且12对毒力基因只对对应的致泻大肠埃希氏菌特异性起作用,对常见的食源性致病菌都无扩增曲线;escV、bfpB、stx 1、ipaH和invE基因的检出限是10 CFU/mL,aggR基因的检出限是102 CFU/mL,astA和pic基因的检出限是103 CFU/mL,而stx 2 A、ipaH和stIb基因菌液浓度<10 CFU/mL时,均可观察到明显的\"S\"型扩增曲线,且线形较好;并且对抽查和委托检验的肉类、奶和动物腹泻物以及人工污染样品等40份样品进行检测,共检出11份阳性样本,与GB 4789.6—2016标准检测结果相一致,表明建立的4种试剂盒方法具有良好的实用性.【期刊名称】《食品与机械》【年(卷),期】2019(035)005【总页数】8页(P88-95)【关键词】致泻大肠埃希氏菌;实时荧光定量PCR;毒力基因【作者】王芳妹;钟文涛;王淑好;卢琳;韩奉玲【作者单位】湖南省产商品质量监督检验研究院,湖南长沙 410007;湖南师范大学生命科学学院,湖南长沙 410081;湖南师范大学蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室,湖南长沙 410081;湖南省产商品质量监督检验研究院,湖南长沙 410007;湖南省产商品质量监督检验研究院,湖南长沙 410007;湖南省产商品质量监督检验研究院,湖南长沙 410007;湖南省产商品质量监督检验研究院,湖南长沙 410007【正文语种】中文致泻大肠埃希氏菌是一类能引起人体腹泻的食源性病源微生物。
由于致泻性大肠埃希氏菌相同的基因片段内保守区很相似,检测单一基因片段特异性并不高,难以确认或排除致泻性大肠埃希氏菌感染,很容易造成漏检[1-3]。
基于多重PCR_检测食品中致泻大肠埃希氏菌
分析检测基于多重PCR检测食品中致泻大肠埃希氏菌谭 波,黄坤宁*(贵州省检测技术研究应用中心,贵州贵阳 550014)摘 要:目的:提高实验室对食品中致泻大肠埃希氏菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)的检测能力与检测效率,验证DEC多重PCR试剂盒的适用性。
方法:依据《食品安全国家标准食品微生物学检验致泻大肠埃希氏菌检验》(GB 4789.6—2016)分离鉴定样品23-H770、23-X371,用DEC多重PCR检测试剂盒检测5种DEC的12条特征基因。
结果:23-H770未检出DEC,23-X371检出STEC/EHEC,阴、阳性对照菌种均检出GB 4789.6—2016中5种DEC目标条带与型别对照表相应基因条带,且空白对照12条目标基因条带均未检出。
结论:能力验证样品评价结果为“满意”,多重PCR检测试剂盒能快速准确检测EPEC、EIEC、ETEC、STEC/EHEC和EAEC。
关键词:多重PCR;致泻大肠埃希氏菌;电泳;检测Detection of Diarrheogenic Escherichia coli in Food Based onMultiplex PCRTAN Bo, HUANG Kunning*(Guizhou Testing Technology Research and Application Center, Guiyang 550014, China) Abstract: Objective: To improve the detection capability and efficiency of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) in food, and to verify the applicability of DEC multiplex PCR kit. Method: Samples 23-H770 and 23-X371 were isolated and identified according to GB 4789.6—2016, and 12 characteristic genes of 5 species of DEC were detected with DEC multiple PCR detection kit. Result: DEC was not detected in 23-H770, STEC/EHEC was detected in 23-X371, and GB 4789.6—2016 were detected in all the five DEC target bands and corresponding gene bands in the genotype comparison table, while none of the 12 target gene bands were detected in the blank control. Conclusion: The evaluation result of ability verification sample is satisfactory. The multiplex PCR kit can detect EPEC, EIEC, ETEC, STEC/EHEC and EAEC quickly and accurately.Keywords: multiplex PCR; diarrheagenic Escherichia coli; electrophoresis; detection致泻大肠埃希氏菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)是一类可引起人体腹泻症状的大肠埃希氏菌(Escherichia coli),常见的DEC主要有5种[1-2]。
致泻大肠埃希氏菌
ETEC
157
171
766
EAEC
102已培养的营养琼脂斜面上生长的菌苔 1 环~2 环,至装有 1 mL0.85%灭菌 生理盐水的 Eppendorf 管内,混匀。4 ℃~8 ℃,12 000 r/min 离心 15 min,弃去上清。沉 淀加入 100 µL 灭菌去离子水中,混匀。100 ℃煮沸 12 min,12 000 r/min 离心 5 min,上清 即为 PCR 扩增模板,可直接用于 PCR 反应。 8.4 多重 PCR 五种致泻大肠埃希氏菌目的基因多重 PCR 扩增加样体系见表 5。PCR 反应条件:预变 性 94 ℃ 5 min。变性 94 ℃ 30 s,复性 63 ℃ 30 s,延伸 72 ℃ 1.5 min,30 个循环。最 后 72 ℃延伸 5 min。
致泻大肠埃希氏菌检验标准操作程序
本操作程序规定了食品中致泻大肠埃希氏菌的检验方法。 本操作程序适用于食品中致泻大肠埃希菌的检验。 2 设备和材料 除微生物实验室常规灭菌及培养设备外,其他设备和材料如下: 2.1 冰箱:0~4℃。 2.2 恒温培养箱:36± 1℃。 2.3 恒温水浴锅:44.5± 0.2℃。 2.4 显微镜:10-100× 。 2.5 均质器。 2.6 天平,感量为 0.1g。 2.7 灭菌广口瓶:500mL 或无菌均质袋。 2.8 灭菌锥形瓶:500mL,250mL。 2.9 灭菌吸管:1mL(具 0.01mL 刻度)、5mL(具 0.1mL 刻度)或微量移液器及吸头。 2.10 灭菌培养皿:直径 90mm。 2.11 灭菌试管:10mm× 75mm。16mm× 160mm。 2.12 1.5 mL Eppendorf 管。 2.13 全自动微生物生化鉴定系统。 2.14 PCR 仪。 2.15 电泳仪。 2.16 凝胶成像系统。 3 培养基和试剂 3.1 EC 肉汤:见附录 A 中 A.1。 3.4 麦康凯琼脂(MAC):见附录 A 中 A.2。 3.5 伊红美蓝琼脂(EMB):见附录 A 中 A.3。 3.6 三糖铁琼脂(TSI):见附录 A 中 A.4。 3.7 营养琼脂斜面:见附录 A 中 A.5。 3.8 赖氨酸脱羧酶试验培养基:见附录 A 中 A.6。 3.9 尿素琼脂(pH7.2):见附录 A 中 A.7。 3.10 蛋白胨水(靛基质试验):见附录 A 中 A.8。 3.11 半固体琼脂:见附录 A 中 A.9。 3.12 革兰氏染色液:见附录 A 中 A.10。
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五种致泻性大肠埃希氏菌多重PCR检测试剂盒
研发背景
大部分的大肠杆菌是人或动物倡导的共生菌,但其中也有部分菌株可引起腹泻等疾病。
致泻大肠杆菌不但可引起传染性疾病而且可引起食源性疾病的暴发。
根据发病机制、临床特征、流行病学特征、O抗原血清及细菌的毒力测定,可将致泻大肠杆菌分为5类:致病性大肠杆菌(EPEC)、产毒性大肠杆菌(ETEC)、侵袭性大肠杆菌(EIEC)、粘附性大肠杆菌(EAEC)、出血性大肠杆菌(EHEC)。
目前针对致泻大肠杆菌的常规实验室检测方法仍然较为薄弱,需要研究快速、简便、准确的分子生物学方法。
【检验原理】
五种致泻性大肠杆菌(EPEC、EHEC、EAEC、EIEC、ETEC)共含有11种毒力基因,针对这11种毒力基因,天津生物芯片试剂盒使用11对特异引物,与样本中基因组的相应靶位点特异性结合,PCR反应后,不同类型的样本产生不同的扩增片段,从而达到对五种致泻性大肠杆菌快速分型检测的目的。
【使用方法】
1.试剂配制(试剂准备区)
从试剂盒中取出PCR反应液在室温融化,将PCR反应液充分震荡混匀,所有试剂在使用前2000rpm离心10s。
设所需要的管数n(n=样本数+1管阴性对照品),每个测试反应体系试剂配置如下表。
计算所需要的n管反应的各试剂的使用量,加入至适当体积的无菌离心管中,充分混合均匀,分装至无菌PCR反应管中,每管24μl。
2.PCR扩增(扩增和产物分析区)
将样本、阴性对照品使用前恢复至室温,2000rpm离心10s。
向每个PCR反应管中分别加入样本、阴性对照品各1μl,震荡混匀,于2000rpm离心10s。
将PCR管放入PCR仪中,使用以下程序进行扩增反应,整个扩增反应约需2小时:
Step 1 94℃ 5min
Step 2 94℃ 30s
Step 3 63℃ 30s 30 个循环
Step 4 72℃ 90s
Step 5 72℃ 5min
3.结果判断(扩增和产物分析区)
从PCR管中取出2μl PCR产物与9μl阳性对照品一起进行浓度为2%的琼脂糖凝胶电泳检测,在紫外灯下阳性对照品从上至下应有11条带,分别为1487bp、1111bp、910bp、766bp、655bp、544bp、400bp、324bp、244bp、171bp和102bp。
样品观察到1487bp、910bp、544bp条带即为毒力基因uidA、bfpB和escV阳性,即为典型EPEC菌株。
观察到1487bp、544bp、324bp、244bp条带即为毒力基因uidA、escV、stx2A和stx1A 阳性,即为典型的EHEC菌株。
观察到1487bp、655bp和171bp条带即为毒力基因uidA、elt和estlb阳性,即为典型的ETEC菌株。
观察到1487bp和766bp条带即为毒力基因uidA和invE阳性,即为典型的EIEC菌株。
观察到1487bp、1111bp、400bp和102bp条带即为毒力基因uidA、pic、aggR和astA 阳性,即为典型的EAEC菌株。
阴性对照品结果应为阴性。
产品特点
●高效鉴定:通过同步扩增致泻性大肠埃希氏菌典型毒力基因和种属鉴定基因,快速实现
对EPEC/ EHEC/ ETEC/ EIEC/ EAEC等五种致泻性大肠埃希氏菌的型别划分和鉴定。
●精确提示毒力基因信息:试剂盒覆盖五种致泻性大肠杆菌全部11种毒力因子,通过对
条带大小或荧光信号的判读即可轻松获得待检样品所携带的毒力基因信息。
●配备设备要求低:该产品对仪器要求不高,普通分子生物学实验室条件即可实现操作。
●快速简便:该试剂盒操作方法简单,快速:实验全程耗时仅2h左右。
●产品通过大量菌株测试验证:天津生物芯片拥有庞大的标准菌株库(菌株资源达3500
余种)。
凭借公司拥有的丰富的菌种资源,对该试剂盒进行了40余种不同来源标准菌株和临床菌株的保守性验证及80余种近缘标准菌株和临床菌株的特异性验证,以确保试剂盒的保守性与特异性。
●雄厚的研发实力打造高水准质优产品:创新、专业化的研发团队长期从事微生物检测产
品开发工作,充分掌握大量关键技术,通过最严谨而科学的实验,打造出一个个高水准质优产品。
【注意事项】
1.实验前请仔细阅读本说明书。
2.本试剂盒不做临床诊断。
3.实验室管理应严格按照PCR基因扩增实验室的管理规范,试验人员必须进行专
业培训,实验过程中严格分区进行(试剂准备区、样本制备区、扩增和产物分
析区),实验操作的每个阶段使用专用的仪器和设备,各区用品不能交叉使用。
4.样本准备和试剂准备阶段应使用生物安全柜,实验过程中穿工作服,带一次性
手套,使用自卸管移液器。
5.对每次实验进行质量控制。
6.试剂使用前要完全解冻,并混合均匀,但应避免反复冻融。
7.样本制备区所用过的吸头请打入盛有消毒剂的容器,并与废弃物一起灭菌后方
可丢弃。
8.实验完毕用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器。
9.所有检测样品应视为具有传染性物质,操作和处理均需符合相关法规要求:卫
生部《微生物生物医学实验室生物安全通用准则》和《医疗废物管理条例》。
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