pubmed使用教程
《PUBMED使用方法》课件
登录到PUBMED
在主页的右上方选择“Sign in”,然后输入您的 NCBI登录信息,登录即可。
PUBMED的搜索功能和使用技巧
1 快速搜索技巧
使用搜索词时,可以写单词的缩写、同义词以及纳入相关的关键字。
PUBMED使用方法
Welcome to this presentation on how to use PUBMED. Discover the advantages of this platform, tips on searching for articles and much more.
什么是PUBMED?
PUBMED是什么?
PUBMED是运行于美国国家医学图书馆之上的免费文献检索工具,提供了数百万份的医学 文献和研究报告
PUBMED的优势与作用
PUBMED 收录的期刊文献广泛,资源丰富,并且是医学领域权威性很强的检索工具之一, 多国医生和科研人员使用。
注册和登录PUBMED账号
注册PUBMED账号
2 高级搜索技巧
在高级搜索中,可以使用布尔逻辑运算符(AND、OR和NOT),以更精确地定义搜索问 题。
3 搜索结果的过滤
过滤筛选与精简搜索结果相当,可以更快更容易地找到所需内容。
如何阅读PUBMED上的论文
1
选定论文
查找感兴趣的论文,结合年份,作者,期刊等进行检索。
2
查看摘要
确认论文的基本信息并查看摘要,摘要内容包括背景、目的、方法、结果、结论 以及前景。
PUBMED的其他相关资源和服务
NLM
PubMed的使用
Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Comment CorrectionsCorporate Author [CN] Create Date [CRDT] EC/RN Number [RN] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] Issue [IP] Journal Title [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] OwnerPagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharmacological Action MeSH Terms [PA] Place of Publication [PL] PMCID & MIDPublication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Substance Name [NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID]Volume [VI]
PubMed使用教程指南
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索步骤 -回复
pubmed检索步骤-回复Pubmed是世界上最大的医学文献数据库之一,提供了大量的生物医学文献资料,包括期刊文章、会议摘要、学位论文等。
Pubmed的使用可以帮助研究人员快速检索到相关的医学文献,有效地支持他们的科研工作。
本文将介绍使用Pubmed进行文献检索的步骤,并以"乳腺癌治疗的最新进展"为例进行说明。
第一步:进入Pubmed网站首先,我们需要打开网页浏览器,输入"第二步:选择搜索关键词在Pubmed的首页上,我们可以看到一个搜索框。
输入"乳腺癌治疗的最新进展"作为关键词进行搜索。
在这里,我们需要注意的是,关键词的选择应该准确反映我们所关注的研究主题,以便能够检索到相关的文献。
第三步:筛选搜索结果点击搜索按钮后,Pubmed会根据关键词进行检索,并列出包含这些关键词的文献列表。
在这里,我们可以看到大量的搜索结果。
为了筛选出最相关的文献,我们可以使用Pubmed的搜索筛选工具。
在搜索结果页面的左侧,有一栏搜索筛选工具。
我们可以根据不同的筛选条件,比如出版日期、文章类型、研究主题等进行进一步的筛选。
以乳腺癌治疗的最新进展为例,我们可以选择筛选条件为"出版日期",选择"最近五年",以获取最近的研究进展。
第四步:查看摘要和全文在筛选出相关的文献后,我们可以点击文献标题或摘要,进一步查看文献的详细信息。
在这里,我们可以通过查看摘要了解到文献的研究内容、方法和主要结论。
如果我们对某篇文献特别感兴趣,想要获取全文信息,可以通过点击链接或按钮,获取全文或者转至相关网页。
然而,需要注意的是,Pubmed并不提供所有文献的全文,有些文章可能需要通过其他渠道获得。
第五步:导出文献信息在Pubmed上查到的文献信息可以方便地导出到其他文献管理软件,如EndNote等。
在详细信息页面,Pubmed提供了一个"导出"按钮,点击后可以选择导出格式,然后将文献信息导出到所选的文献管理软件中。
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献,可以按照以下步骤进行:1. 访问PubMed网站,打开浏览器,输入"/pubmed",进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题,明确你感兴趣的研究主题,可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索,在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的,以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项,如果你想进一步精确搜索结果,可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮,可以在更多的搜索字段中输入关键词,如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果,当你点击搜索按钮后,PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围,如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文,在搜索结果中,你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述,帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文,可以直接阅读,而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献,如果你找到了感兴趣的文献,可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献,在每篇文献的页面上,你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助,可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒,PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录,搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来,PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献,以及利用检索历史和搜索提醒功能。
pubmed高级检索方法
pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。
当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
PubMed使用手册
PubMed使用手册【基本查询方法】∙一个检索词:一个单词:在文本框中输入检索词,按GO查询。
含两个单词以上的检索词:需要加双引号,注意是英文输入状态下的双引号。
如:"ultrasonic diagnosis"是正确的,“ultrasonic diagnosis”是错误的∙两个以上的检索词:可使用 AND、OR 连接各检索词。
如:"three dimensional ultrasound" AND thyroid ∙可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。
【完全手册】PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。
(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。
例如:键入"Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
(2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。
该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。
如:在检索提问框中键入:"new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。
(3)短语表(Phrase list)。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
PubMed使用教程指南
2024/9/21
19
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
发送至检索恇
点击选中
20
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
点击执行检索
21
一、基本检索
6.期刊检索
2024/9/21
检索成果
22
二、辅助检索区
1.Limit (限定检索) 2.Preview/index(预览/索引) 3.History(检索史) 4.Clipborard(剪贴板) 5.Detail(检索式详览)
28
2024/9/21
环节1 点击预览和索引
环节2 输入待选词
环节4 拟定与检索栏中 检索提问旳逻辑关系
环节3 索引选词
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3.History(检索史)
▪ 检索式回忆 ▪ 编辑检索式 ▪ 如#3 AND child
2024/9/21
30
检索历史回忆
2024/9/21
检索式
检索时间 检出篇数
检索式编号可替代检索式进行输入检索
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2024/9/21
点击有关规范词
64
2024/9/21
选择检索 选择副主题词
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2024/9/21
执行检索
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检索成果 题录:著者、篇名、刊名
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2.阿司匹林治疗心肌梗死
2024/9/21
首先,将概念切提成2个面: Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗
然后,分别进行规范词选择检索
68
2024/9/21
69
2024/9/21
70
2024/9/21
PubMed中文使用手册 (PDF)
PubMed中文使用手册Jeffrey Wu(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
PubMed检索方法
PubMed检索方法PubMed是一个由美国国立医学图书馆维护的生物医学文献数据库,它收录了世界各地的医学和生命科学相关的学术文章。
在PubMed中,用户可以使用各种检索方法来查找自己需要的文献,以下是一些常用的PubMed检索方法。
1. 关键词:用户可以在PubMed的栏中输入一个或多个关键词来检索文献。
关键词可以是疾病名称、治疗方法、药物名称、基因名称等。
使用关键词时,可以通过AND、OR和NOT等逻辑运算符来组合关键词以获得更精确的结果。
3. MeSH词汇检索:MeSH(Medical Subject Headings)是一种标准化的医学主题词汇,它用于对PubMed文献进行分类和索引。
用户可以在PubMed的主页上找到一个名为“MeSH Database”的链接,通过这个链接可以访问MeSH词汇数据库。
在数据库中,用户可以浏览和MeSH词汇,然后使用这些词汇来检索PubMed文献。
使用MeSH词汇检索可以帮助用户找到与特定主题相关的所有文献,而不仅仅是包含特定关键词的文献。
5. 文献筛选:在PubMed的结果页面中,用户可以使用不同的筛选选项来缩小结果的范围。
例如,用户可以选择只显示最新发布的文献、只显示免费全文、只显示临床试验结果等。
这些筛选选项可以帮助用户快速找到他们需要的文献,而不必浏览大量的结果。
总之,PubMed提供了多种检索方法来帮助用户找到他们所需的文献。
用户可以根据自己的需求和研究主题选择适合的检索方法,并根据需要进行进一步的筛选和浏览。
通过熟练掌握PubMed的检索方法,用户可以更高效地进行文献检索和阅读,从而提高他们的研究工作的质量和效率。
PubMed使用方法攻略
PubMed使用方法攻略PubMed使用手册一、PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统,是NCBI的Entrez系统的数据库之一。
该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的70多外国家4800多种主要生物医学文献的书目索引文摘数据库,并提供部分免费和付费的全文链接服务。
二、页面介绍:登录/entrez/ query.fcgi后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:主页面左侧框的介绍:1) MeSH Database你可以用它来分层流览MesH表2) Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
3) Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
4) Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
5) Related Resources·Order Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
·Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
三、检索方法:1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:·键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;·对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”·以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名。
pubmed使用指南
4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻 辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。 5、剪贴板:使用“send to Clipboard”,可把检索结果存入 剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有 记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为 summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录 题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页 的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果 默认summary格式(题录格式),可以选择display下拉菜 单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。 练习题: 1、检索AIDS(2008年)英文综述文献 2、查找PUBMED收录我院的论文数量
2024年pubmed数据库使用指南
概述:
PubMed是一个生命科学领域的文献数据库,是生物医学文献检索的重要工具。
本文对PubMed数据库的使用做一个简要介绍,以帮助读者更好地利用这个数据库进行文献检索。
1. PubMed数据库的结构和特点:
PubMed数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发维护的。
它是一个免费的公共数据库,收录了生物医学和生命科学领域的大量学术文献,包括期刊文章、会议论文、学位论文等。
2.检索策略:
(1)关键词检索:根据文献的关键词进行检索。
关键词可以是疾病名、药物名、基因名等。
使用AND、OR、NOT等逻辑符号来组合关键词,以缩小或扩大范围。
(2)高级检索:在PubMed的高级界面中,可以通过使用多个字段、设置日期范围、对检索结果进行限定等方式,更精确地进行文献检索。
3.结果筛选和排序:
(1)限制结果:通过在界面的左侧面板中选择相关选项,可以限制结果的类型、语言、年份等。
(2)排序方式:结果默认按相关性排序,但也可以按出版日期、被引用次数等进行排序。
4.期刊和发表者信息:
5.数据库更新与同步:
(1)PubMed数据库每周更新,保持最新的文献信息。
(2)可以通过RSS订阅或设置自动更新来获取最新的文献信息。
6.其他功能和工具:。
PubMed中文使用手册
P u b M e d中文使用手册work Information Technology Company.2020YEARPubMed中文使用手册(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
PubMed使用教程指南
PubMed使用教程指南PubMed使用教程指南1:简介1.1 PubMed概述1.2 文档目的和范围1.3 文档结构2:注册和登录2.1 注册过程2.2 登录步骤2.3 用户账户管理3:检索和筛选文献3.1 关键字检索3.2 高级检索3.3 检索结果筛选和排序3.4 收藏和导出文献4:文献详细信息和摘要4.1 文献详细信息页4.2 文献摘要和关键词4.3 相关文献推荐5:全文获取途径5.1 免费全文获取5.2 付费全文获取5.3 图书馆访问6:文献浏览和阅读工具6.1 在线阅读器6.2 PDF和打印6.3 标注和笔记7:数据库交互和导出选项7.1 搜索历史和搜索警报设置7.2 保存和导出搜索结果7.3 数据库交互和集成8: PubMed Central (PMC) 8.1 PMC概述8.2 PMC文献访问和8.3 PMC作者和机构信息9:其他功能和资源9.1 科学计量指数和引用分析9.2 转录本数据库和序列检索9.3 生物医学主题词(MeSH)搜索附录:附件1: PubMed常见问题解答 (FAQs)附件2: PubMed搜索示例附件3: PubMed用户指南(官方文档)法律名词及注释:1:版权(Copyright):著作权法所规定的权利,授予创作者对其所创作作品的独占权利。
2:公共领域(Public Domn):指作品的版权保护期已经过去,不再受版权法保护,可以自由使用。
3:开放获取(Open Access):指文献免费并可自由获取的出版模式,通常由作者或资助机构支付出版费用,以使文献对全球范围内的读者免费开放。
4:数据共享(Data Sharing):研究数据的共享原则,将研究数据公开存档并向其他研究人员开放,促进科学研究的可重复性和透明度。
5:版权许可(Copyright License):版权持有者授权他人使用、复制或再分发作品的许可证。
6:存取策略(Access Policy):指特定出版物的访问规则和限制,如开放获取、订阅制度等。
Pubmed教程
pubmed 教程--pubmed使用全攻略(1)第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。
进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。
这是PubMed的核心部分。
大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。
在主界面的左侧框(如左图),有:• Journal Browser 期刊浏览• MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表• Single Citation Matcher(单引文匹配)输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
• Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
• Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4 个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
• Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)3) Related Resources• Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。
• Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLI NE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
• Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
• Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
PubMed使用指南
PubMed使用指南PubMed使用指南介绍PubMed是一个免费的生物医学文献数据库,由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
本文档旨在为用户提供对PubMed的全面指南,以帮助他们更有效地搜索和浏览相关文献。
1. 注册和登录1.1 注册PubMed账户1.1.1 访问PubMed官方网站()。
1.1.2 页面右上角的“Sign In”按钮。
1.1.3 在弹出的对话框中选择“Create an Account”选项。
1.1.4 填写所需信息,如姓名、电子邮件地址和密码,并完成注册流程。
1.2 登录PubMed账户1.2.1 访问PubMed官方网站。
1.2.2 页面右上角的“Sign In”按钮。
1.2.3 输入您在注册过程中设置的电子邮件地址和密码,然后“Sign In”。
2. 搜索和过滤2.1 基本搜索2.1.1 在PubMed主页的搜索栏中输入关键词或短语,并“Search”按钮。
2.1.2 在搜索结果页面上,您可以浏览与搜索词相关的文献列表。
2.2 高级搜索2.2.1 PubMed主页搜索栏右侧的“Advanced”。
2.2.2 在高级搜索页面上,您可以输入更多的搜索条件来限定您的搜索结果。
2.2.3 “Search”按钮进行搜索。
3. 浏览和筛选结果3.1 结果列表3.1.1 在搜索结果页面上,您可以看到搜索词相关的文献标题和作者信息。
3.1.2 文献标题可查看文献的详细信息。
3.2 结果过滤3.2.1 使用左侧的过滤器栏来筛选搜索结果,如出版日期、文献类型、作者、免费全文等。
3.2.2 过滤器栏下方的“Show additional filters”以展开更多过滤选项。
4. 查看文献详细信息4.1 摘要信息4.1.1 在文献详细信息页中,您可以查看该文献的摘要信息,包括背景、目的、方法、结果和结论。
4.1.2 “Abstract”标签以查看完整的摘要内容。
pubmed使用指南
输入待检刊名 输入待检第一著者
特定文献查找(已知文献第一著 者,欲查其他信息如其他著者等)
得出其他著者
插入文件 输入EMAIL地址
用于核对批量文献信息 输入已知文献信息
3.临床问题(Clinical Queries)
专门为临床医生设计的一种检索服务, ▪ Search by clinical study category
(4)通过“期刊数据库”检索
强制将其作为一个词组检索
这是第二个概念面检出的结果10112条记录 MeSH Database
文摘中的期刊图标链接
可对任何具有实质意义的词都可以进行检索,如:
强制将其作为一个词组检索
Limit 对检索结果进行多重限定
asthma/drug therapy
Linkout链接
3.截词检索
有限截词检索
一、基本检索
4.逻辑组配检索
逻辑组配检索
一、基本检索
5.作者检索
(1)通过“limit” 的”search by author”
一、基本检索
5.作者检索
(2)用字段限定[
(3)通过系统自动 匹配功能自动检索
一、基本检索
6.期刊检索
(1)用字段限定[ta]检索
1.哮喘的药物治疗
选择MeSH Database 输入检索词(单词、词组) (不能输有运算符的语句如: asthma AND therapy)
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检索语法
• 1.自然语言检索 (topics)
在检索栏中输入一个或多个检索词 (系统默认空格为AND 检索) 如:placenta growth oxygen
布尔逻辑运算式:AND OR NOT (运算符须大写) 如:common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。
检索语法
• 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索 输入 “hypertension therapy(高血压治疗)
("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR "therapeutics"[All Fields])
检索语法
• 2.著者检索(authors): 著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
检索语法
• 3.期刊检索(NLM Catlog): 刊名输全称 new england journal of medicine Medline认可的标准缩写形式 如:clin exp immunol[so] 国际标准期刊号 如:1059-1524
▫ 来源于全世界70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊, 这些期刊大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委 员会Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC)评估挑选, 以及美国国立医学图书馆和数据协作采集 专家 (各专业协会)推荐。 ▫ 近年数据涉及37种语种,回溯至1950年的数据涉及60种语种。 数据库47%为美国本土出版的文献, 90%为英文文献,79% 的文献有著者撰写的英文文摘。(以上数据根据2007年11月 数据库提供)。
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NCBI与Entrez
• NCBI凭借其雄厚的科技技术力量以及在生命技术 方面的巨大影响,创办了一个生物技术和生命科 学的优秀网站,建立了一系列的生物信息事实数 据库和文献数据库,并提供基于因特网的免费的 信息服务。 • Entrez是NCBI网站基于多种数据库的集成检索系 统,也是网上最大的免费检索生物医学资源的网 站。
Pubmed检索系统
• • • • • • • (一)概述 (二)主要数据收录 (三)基本检索 (四)高级检索 (五)PubMed其它检索服务 (六)结果处理 (七)获取原文及相关资源链接
(一)概述
• PubMed()是由美国国立医学 图书馆(NLM)下属美国生物技术信息中心(NCBI) 研制的基于Web的文摘数据库,是NCBI整合检索系 统Entrez中数据库之一。 • 通过NCBI整合检索系统PubMed可以链接到分子生 物信息学数据库文件,获取核酸序列、蛋白质序 列; 从核酸序列翻译到蛋白质的序列;获取基因组和染色 体图谱;蛋白质三维结构等其他生物信息数据库信息。 • Pubmed是目前世界上使用最广泛的免费Medline检 索系统,它提供Medline、PreMedline等数据库的检 索。
检索语法 • 运算符
字段限定符:[] (教材86页) 例如:Stem[ti] AND neuroscience
截词符:”*”作为通配符进行截词检索。(教材89页) 例如:bacter* (系统会找到前一部分是bacter的单词, 如: bacteria、bacterium等) 强迫短语符:用双引号来强制系统进行短语检索。(教 材89页) 例如: “oxygen free radicals” (不再自动转换匹配和 扩 展检索)
学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共 卫生、卫生政策发展或者相关教育活动的内容。2000年起增加收录对生 物医学的实习者、研究员和教育家至关重要的专业内容,包括生物、环境 科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面 的研究内容。
(二)主要收录数据
• Medline文献来源
高级检索
• Search Builder:协助编写检索式 • Index:索引
• Search History:检索史
高级检索界面
限定(Limits)
检索限定:字段限制:著者、刊名、篇名、滤过 (filter原文收藏处)等 数据输入时间:默认检索可回溯到1950年,限制 选择30天-10年 文献类型限制 语种限制 子文档
Entrez检索平台
• Entrez是NCBI为广大生物研究人员提供的一个 基于文本的集成检索系统。通过该平台可检索到 NCBI提供的28个数据库,这些数据库包含文献 数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质 结 构数据库、种群研究库、表达库、完全人类 基因组库、分类信息库。 • 其中,Pubmed属于文献数据库。文献数据库主 要收藏生物医学方面的期刊、图书等。
摘自上海交通大学-生命医药学科博客: /lam/article.asp?id=269
The end
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检索结果
使用Mesh检索
查找主题词
主题词
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款目词
树状词表
构建检索 式
检索结果
期刊数据库
• 通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。 • 提供电子原文的超链键。
特定文献检索
• Single citation mathcer 输入题录信息,查找特定文献进行补缺。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如:已知:第一著者是Challis DE,出处是 Pediatric Research;2000,47(3):309-15, 要求写出其他合著者
Pubmed
南京医科大学图书馆
了解Pubmed • NIH、NLM、NCBI与Entrez
• NIH(National Institute of Health):美国国立卫 生研究院 • NLM(Natioanl Library of Medicine):美国国立 医学图书馆 • NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国生物技术信息中心) • Entrez
PubMed特点
1.免费提供题录和文摘 2.提供与原文的网址链接(部分免费获取) 3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
(二)主要收录数据
• Medline
美国国立医学图书馆创建的医学文献数据库
• 收录内容:
▫ 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献,包括行为科
检索语法
• 自动转换匹配检索词 (教材88页) 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 (教材26页)、 刊名转换表、短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹 配。 如:renal failure (肾衰竭) 转换为 "renal insufficiency"[MeSH Terms] OR ("renal"[All Fields] AND "insufficiency"[All Fields]) OR "renal insufficiency"[All Fields] OR ("renal"[All Fields] AND "failure"[All Fields]) OR "renal failure"[All Fields]
• Medline数据题录标有[PubMed-indexed for Medline]
(二)主要收录数据
• In process数据
▫ 1996年8月开始,PubMed每天收录由Medline的期刊出 版商提供的尚未经规范处理的数据,该库中的记录只有 简单的书目信息和文摘。该库中的数据每周一次转入 Medline。当进入Medline时就会被标入Medline。当进 入Medline时就会被标引MeSH(数据库规范控制词表详 见MeSH Database内容)词、文献类型及其它数据。
Mesh主题词表
• 功能: 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词 • 特点: 一般检索逻辑关系粗浅、修饰概念匹配不特定、 检索词涵盖不全面 规范检索逻辑关系紧密、修饰概念匹配特定、下 位词检索全面
示例
• 例:欲查肾衰竭(renal failure)饮食疗法(diet therapy) 的相关文献?
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PMC(Pubmed Center)
• 生命科学期刊资源中心(教材105页) • 免费提供近200种期刊的10多万篇全文(不包括 PubMed动态免费全文)
My NCBI
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GoPubmed
• Gopubmed是一种Pubmed检索工具,是对于 Pubmed资源的另一种组合检索方式,它比 Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我 们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研究 过程、研究动态和各种信息之间的相关性