兽医微生物学细菌的分类与命名共67页
细菌分类与命名ppt课件
种
菌株 是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可
以有许多菌株，其主要性状应完全相同，其次要性状 可稍有差异。
二、细菌的 命名 构成：细菌的学名(scientific name)------拉丁文名
命名依据：国际细菌命名法则：双名法（林奈）
兽医微生物学
由“属名+种名”构成，用拉丁文表示，属名在前，
S（沉降系数） rRNA(核糖体RNA)
③16S rRNA碱基序列的相似性
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细菌分类鉴定的特征和技 术 （一）形态学和生理生化特征
（二）血清学试验与噬菌体分型 （三）氨基酸的顺序和蛋白质的分析 （四）核酸的碱基组成和分子杂交
（一）形态学和生理生化 特征
1．形态学特征
兽医微生物学
（1）细菌形态：形状、大小、排列 （2）培养特征：菌落特征
（3）特殊结构：鞭毛、芽孢、荚膜、孢
子
（4）染色反应：革兰、抗酸
1．血清学试验
（二）血清学试验与噬菌 体分型
兽医微生物学
细菌细胞与病毒等都含有蛋白质、脂白
蛋、脂多糖等有抗原性的物质，由于不
同微生物抗原物质结构不同，赋予它们
同的噬菌型和利用噬菌体裂解这样的特异性进
行细菌鉴定.
（三）氨基酸的顺序和蛋 白质的分析
蛋白质是基因的产物,蛋白质的氨基酸顺
序直接反映mRNA顺序而与编码基因密切相 关。
兽医微生物学
可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的
比较来分析不同生物系统发育关系 ,序列 相似性越高,其亲缘关系愈近。
可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系
兽医微生物学
新名称的发表
根据细菌命名法规的规定，有效发表新 的细菌名称应在公开发行的刊物上进行。 若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB） 以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称 的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定 期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不 算合格发表，也不能取得国际上的承认。 发表新名称时，应在新名称之后加上所属 新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、 新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。
细菌的分类及命名优秀PPT资料
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法： 1）测定DNA碱基(G+C)mol％ 2）核酸分子杂交 3）16SrRNA寡核苷酸编目
பைடு நூலகம்）DNA碱基G+C%比例的测定
简称GC比 （G+C）%=—G—+C———×100%
A+T+G+C
亲缘关系相近的种ＧＣ比也相近， ＧＣ比差别大亲缘关系必然远 种内差距2.5~4.0％, 种间>5%, 属间 差距>10%
例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
金黄色葡萄球菌的学名为：
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
兽医微生物学重点知识
1、细菌的分类(三菌四体一病毒): 细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体、螺旋体、立克次氏体、病毒细菌的大小用μm表示，病毒的大小用nm表示细菌的形态比较简单，有球状、螺旋状、杆状三种基形态球菌的排列情况: 链球菌、双球菌、葡萄球菌、四联球菌、八叠球菌细菌细胞基本结构: 细胞壁、细胞膜、细胞质、拟核2、细胞壁:位于细菌细胞的外围，是一层坚韧而具有一定弹性的膜状结构。
用革兰染色法染色可将细菌分为革兰阳性菌和革兰阴性菌两大类。
①革兰阳性菌的细胞壁较厚，15-18nm，其主要成分是肽聚糖。
此外还有磷壁酸，多糖，蛋白质等。
磷壁酸是革兰阳性菌特有的成分，是特异的表面抗原。
②革兰阴性菌的细胞壁较薄，10-15nm，但结构较复杂。
除含有1~2层的肽聚糖结构外，还有外膜和周质间隙。
细胞壁的功能主要是维持细胞外形和提高机械强度，保护细菌耐受低渗环境。
还具有阻挡有害物质进入菌体、维持菌体内外离子平衡、参与菌体的正常分裂等作用。
并与细胞的致病性，抗原性、对噬菌体与药物的敏感性及革兰染色特性的密切相关。
3、原生质体: 革兰阳性菌经溶菌酶和青霉素处理后，可完全除去细胞壁。
形成仅由细胞膜包住细胞质的菌体原生质球: 革兰阴性菌经溶菌酶等作用，仅能去除细胞壁内层的肽聚糖，形成仍有外膜层包裹的菌体细菌L型: 指细菌自发或经诱导剂诱导形成的遗传稳定的细胞壁缺陷菌株4、细菌的特殊结构: 荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞、S层①荚膜:某些细菌在其生活过程中可在细胞壁的外周产生一层包围整个菌体、边界清楚的黏液样物质，称为荚膜夹膜具有保护细菌的功能，可抵抗动物体吞噬细胞的吞噬和抗体的作用，也常是营养物质的储藏和废物的排出之处②鞭毛: 多数弧菌、螺菌，许多杆菌，个别球菌的菌体表面长出的一至数十根弯曲的丝状物，称为鞭毛。
是细菌是运动器官，其显微结构由基体、鞭毛钩和鞭毛丝三个部分构成③菌毛:大多数革兰阴性菌，少数革兰阳性菌的菌体上生长的一种比鞭毛短的毛发状细丝，称为菌毛④芽胞:某些革兰阳性菌在一定的环境条件下，可在菌体内形成一个圆形或卵圆形的休眠体，称为芽胞。
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名-微生物命名规则细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学 (taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与判定的一门学科。
它的任务就是在全面认识细菌的生物学特色的基础上,研究它们的种类 ,探究其发源、演化以及与其她类群之间的亲缘关系,从而提出能反应自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。
它包含三个方面:分类 (classification)、命名 (nomenclature)与鉴定 (identification) 。
一、基本观点1、细菌分类就是依据每种细菌各自的特色,并依照它们的亲缘关系分门别类 ,以不一样样级编排成系统。
分类有两种 :①以细菌的形态与生理生化特征为依照的表型特色分类法 ,包含有传统分类法 (classical classification)与数值分类法(numerical classification);②用化学剖析与核酸剖析,以细菌大分子物质 (核酸、蛋白质 )构造的同源程度进行分类称种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。
2、细菌命名在分类基础上 ,赐予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中互相沟通成为可能。
依照细菌命名的法例,能保证全部的科研工作者以相同方式赐予细菌命名。
3、细菌判定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适合地点与已知细菌比较其相像性 ,用对照剖析方法确立细菌的分类地位。
若与已知细菌相同即采纳已知菌的名称 ,不一样者则按命名原则确立一个新名称。
二、分类等级细菌的分类等级与其她生物相同,挨次为界 (kingdom)、门(division) 、纲 (class)、目(order)、科 (family) 、属 (genus)、种 (species)。
细菌属于原核生物界 (procaryotae),包含有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体。
兽医微生物学分类
兽医微生物学
病毒学各论：
双股DNA病毒
痘病毒科
疱疹病毒科
腺病毒科
多瘤病毒科
乳头瘤病毒科
非洲猪瘟病毒科
单股DAN病毒
细小病毒科
圆环病毒科
双股RNA病毒
呼肠弧病毒科
双RNA病毒科
单股副链不分节段RNA病毒
副黏病毒科
弹状病毒科
单股副链分节段RNA病毒正黏病毒科
布尼亚病毒科
沙粒病毒科
单股正链不分节段RNA病毒冠状病毒科
黄病毒科
披膜病毒科
小RNA病毒科
杯状病毒科
星状病毒科
具有反转录作用病毒科
反转录病毒科
嗜肝DNA病毒科
细菌学各论
病原性球菌：
葡萄球菌属
链球菌属
其它球菌属
肠杆菌科
埃希氏菌属
沙门氏菌属
耶尔森氏菌属
志贺氏菌属
肠杆菌科其它菌属
巴氏杆菌科及相关菌属
巴氏杆菌属
里氏杆菌属
嗜血杆菌属
放线杆菌属
其它需氧或兼性厌氧杆菌属布氏杆菌属
假单细胞菌属
军团杆菌属
波氏杆菌属
弗朗西氏菌属
弧菌属
革兰氏阴性微需氧和厌氧杆菌弯曲杆菌属
拟杆菌属
梭杆菌属
螺杆菌属
革兰氏阳性无芽孢杆菌
李斯特氏杆菌
丹毒丝菌属
棒状杆菌属
分枝杆菌属
革兰氏阳性产芽孢杆菌
芽孢杆菌属
梭菌属
作者：冯晨
邮箱:fengdongliang37370@。
5细菌的分类与命名
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第四节 细菌分类的方法
• 长期以来，细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。 长期以来，细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。 此法首先要在细菌的各种性状中， 此法首先要在细菌的各种性状中，选择一项或数项被认 为是最主要的基本性质，作为分类指征， 为是最主要的基本性质，作为分类指征，在最高一级的 分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中， 分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中， 选择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类， 选择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类，依 此类推，一直划分到种。 此类推，一直划分到种。 • 数值分类法（numerical taxonomy） 原理是根据数值 数值分类法（ taxonomy） 分析，借助电子计算机，将拟分类的细菌按其性状相似 分析，借助电子计算机， 程度归类定位。 程度归类定位。
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第二节 细菌的命名
• 细菌的命名依据“国际细菌命名法规”（The 细菌的命名依据“国际细菌命名法规” Bacteria） International Code of Nomenclature of Bacteria） 的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法” 的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。 • 所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称与动、植 所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称与动、 物名称一样，由属名和种名两部分构成，属名在前， 物名称一样，由属名和种名两部分构成，属名在前，种 名在后，属名第一个字母必须大写，其余均应小写， 名在后，属名第一个字母必须大写，其余均应小写，即 使种名是以人名或地名命名的， 使种名是以人名或地名命名的，种名头一个字母也用小 写。 • 整个属名及种名在出版物中应排成斜体。 整个属名及种名在出版物中应排成斜体。 • 为便于国内交流，细菌的拉丁文名称一般都译为汉语， 为便于国内交流，细菌的拉丁文名称一般都译为汉语， 中文译名与拉丁名正好相反，种名在前，属名在后。 中文译名与拉丁名正好相反，种名在前，属名在后。
细菌的分类与命名
二、数值分类法
原理是根据数值分析，借助电子计算 机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定 位。
第七章 细菌的分类与命名
第五节 细菌的分类体系
一、伯吉氏系统学手册 二、原核生物 三、国际系统与进化微生物学杂志 四、国际著名的菌种保藏机构
第七章 细菌的分类与命名
第六节 细菌的鉴定 一、分类培养
双名法：
每一种细菌的拉丁名称由属名和种名二 部分组成，属名第一个字母必须大写，其余 均小写。如大肠杆菌的学名：Escherichia coli, E coli。
在现代细菌分类中，在属名和种名之后
，还加上首次定名人（加括号）、现定
名人和现名定名年份，用正体字。如大 肠杆菌的学名：Escherichia coli （ Migula）Castellani et Chalmers 1919, 指 Migula 于1895年命名此菌为Bacillus coli, Castellani 及 Chalmers 于1919年改为现 名。
过去分类：植物界 1974年后：原核生物
原核生物：
古细菌（Archaea）：是一个独特的系统进化类别， 产甲烷、极端耐盐、高度嗜热、细胞壁组成 与细菌不同。
细菌（Bacteria）:衣原体、立克次氏体、霉形体、螺 旋体、放线菌、蓝细菌、光合细菌等
分类系统：纲、目、科、属、种
属（Genus, genera）：具有若干共性的种的组合，与其
5、 细菌的分类体系
1. “伯吉氏系统细菌学手册” （ Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology）：自1923年出 版第一版以来，不断充实修改再版，1994年面世第 九版。
2. Balows等编著的“原核生物” ( The Prokaryyotes ) : 第二版，1992，可弥补伯吉氏手册 的不足。
兽医微生物学-细菌的分类及命名
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 – 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 – 如：Escherichia coli
二、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The International
Code of Nomenclature of Bacteria)
• 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 • 所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属
名和种名两部分组成，属名在前，第一个字母必须 大写，其余均应小字。整个属名及种名在出版物中 应排成斜体。 如：Escherichia coli 属名+种名
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
三、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
兽医微生物学细菌
科属名称葡萄球菌科葡萄球菌数金黄色葡萄球菌链球菌科链球菌属猪链球菌肠杆菌科艾希菌属大肠杆菌肠杆菌科沙门菌属气单胞菌科气单胞菌属巴氏杆菌科巴氏杆菌属多杀性巴氏杆菌巴氏杆菌科放线杆菌属胸膜肺炎放线杆菌巴氏杆菌科嗜血杆菌属副猪嗜血杆菌黄杆菌科里氏杆菌属。
布氏杆菌属。
假单胞菌科假单胞菌属铜绿假单胞菌产碱杆菌科波氏菌属支气管败血波氏菌。
劳森菌属胞内劳森菌李氏杆菌科李氏杆菌属产单核细胞李氏杆菌丹毒丝菌科丹毒丝菌属猪丹毒丝菌。
芽孢杆菌属炭疽芽孢杆菌。
梭菌属。
分支杆菌科分支杆菌属牛分支杆菌革兰染色++--------（柯氏染色红色）---+++++齐尼二氏染色（抗酸染色）呈红（非抗酸菌呈蓝）特殊结构无芽孢无鞭毛有的有荚膜基本无鞭毛，多数有荚膜无芽孢，周身鞭毛，某些致病菌有荚膜，有1型菌毛，少数性菌毛大多周身鞭毛且有1型菌毛有鞭毛、菌毛无鞭毛、不形成芽孢，有荚膜有荚膜有鞭毛无鞭毛无芽孢无鞭毛无芽孢，可形成荚膜无芽孢无荚膜无鞭毛无芽孢，无芽孢无鞭毛无芽孢，无荚膜，20-25度下有周鞭毛无芽孢，有荚膜，无鞭毛有芽孢椭圆形、小于菌体，位于中央；无鞭毛；可形成荚膜（普通培养基不形成）无鞭毛，有荚膜，芽胞椭圆形。
外形葡萄串状卵形或卵圆形，往往双球状直杆菌直杆菌短杆状，有时也可双球状/丝状卵球形，短杆状小球杆菌，有多形性多形性杆状/椭圆形球形/短杆状芽孢，端生单鞭毛。
杆状短杆状，多单在，有时也可排成V形或短链直或稍弯的细杆菌大杆菌，菌体接触面膨大呈竹节状，荚膜丰/厚杆状，菌端钝圆或尖锐，单在或短链状。
芽胞位于菌体中央膨起，形如梭状。
结核分支杆菌菌体细长，牛分支杆菌菌体较短粗，禽分支杆菌短小并具有多形性，副结核分支杆菌菌体以细长为主，常排列成丛或成堆。
菌落形态湿润光滑隆起（致病黄色） B溶血（致病菌株多能分解甘露醇）小菌落，灰白透明，稍黏 a或B溶血凸起、光滑湿润半透明灰白色，致病型B溶血（绵羊血平板）表面光滑，B溶血水滴样小菌落，不溶血带蓝色的光，菌落上似有一层白色云雾 B溶血圆形，表面光滑，边缘整齐，灰白色半透明 不溶血无色素，呈圆形，表面光滑细小，针尖大，半透明的菌落（S型：无色透明，表面光滑湿润，大小不等；R型：不太透明，多呈颗粒状，浅黄色到褐色，易碎或黏滞；M型：不透明，黏胶状）菌落有葡萄味圆形光滑边缘整齐 部分B溶血，并可同时出现大小不等的溶血菌落及不溶血变异菌落。
5细菌的分类与命名
细菌的分类与命名
动物医学院 张 炜
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内容提要
• 细菌的分类以种为基本单位，它的命名遵循“双名法“， 细菌的分类以种为基本单位，它的命名遵循“双名法“ 拉丁文。 用拉丁文。 • 细菌的分类鉴定参照的标准长期以来是根据其表型，目 细菌的分类鉴定参照的标准长期以来是根据其表型 表型， 进行分类。 前则多考虑其种系发生关系， 基因水平进行分类 前则多考虑其种系发生关系，从基因水平进行分类。 • 《伯吉氏系统细菌学手册》及《伯吉氏细菌鉴定手册》 伯吉氏系统细菌学手册》 伯吉氏细菌鉴定手册》 建立了细菌分类的公认体系。 建立了细菌分类的公认体系。 • “国际系统与进化微生物学杂志”反映分类的研究成果。 国际系统与进化微生物学杂志”反映分类的研究成果。 • 根据表型特征建立了一套动物致病菌检测程序，商品化 根据表型特征建立了一套动物致病菌检测程序， 的快速鉴定系统已应用于常规细菌学鉴定。 的快速鉴定系统已应用于常规细菌学鉴定。 • PCR方法也愈来愈广泛应用于细菌鉴定。 PCR方法也愈来愈广泛应用于细菌鉴定。 方法也愈来愈广泛应用于细菌鉴定
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DNA（G+C）mol%值 DNA（G+C）mol%值
• 除RNA病毒以外，各种生 RNA病毒以外 病毒以外， 物都具有遗传物质DNA DNA， 物都具有遗传物质DNA， DNA的鸟嘌呤 的鸟嘌呤（ 其DNA的鸟嘌呤（G）和胞 嘧啶（ 嘧啶（C）的摩尔百分数 是恒定的。微生物也一样， 是恒定的。微生物也一样， 亲缘关系密切、 亲缘关系密切、表型高度 相似的微生物往往有相似 G+C）mol%。 的（G+C）mol%。 • 超过5%时，就不可能属于 超过5% 5%时 同一种；相差超过10% 10%时 同一种；相差超过10%时， 则可为不同的属
细菌的分类及命名
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（二）数值分类法
是通过广泛比较分类单位的性状特征，然 后计算它们的相似性，再根据相似性的数 值划分类群的一种分类方法。
至少50－60个性状以上 同等重要 只能划分到类群
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方法步骤
根据较多特征分类，每一特征地位相同。 1、每一菌株为一操作单位，确定很多特征 （50—60 个）
鞭毛菌亚门 接合菌亚门 子囊菌亚门 担子菌亚门 半知菌亚门
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第八版 1995年
原生生物界
真核 生物域
假菌界 卵菌类
子囊菌门、担子菌门 真菌界 壶菌门、接合菌门
有丝孢真菌类
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酵母：lodder分类系统
菌种鉴定工作三部曲 1、获得该微生物的纯培养 2、测定一系列必要的鉴定指标 3、查找权威性鉴定手册
的细菌大于550 种。目前中国
各级疾病预防控制机构在细菌
学检验中比较多地应用了此项
技术
菌种
基本培养基 （液体）
检测、编码、查表、鉴定
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适用于API鉴定细 菌有700多种 30
API—细菌鉴定系统
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2、Enterotube 系统
不同培养基分装不同小槽中，同 步接种，培养后检测、查表、鉴定。
重要的G-细菌 1－11组
G+细菌 12－17组 光合菌、蓝细菌、古细菌等 18－25组
放线菌 26－33 组
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《伯杰氏系统细菌学手册》第2版，
分为5卷
古生菌域 泉古生菌门
广古生菌门
2门8纲－－－208个种
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36、“不可能”这个字(法语是一个字 )，只 在愚人 的字典 中找得 到。--拿 破仑。 37、不要生气要争气，不要看破要突 破，不 要嫉妒 要欣赏 ，不要 托延要 积极， 不要心 动要行 动。 38、勤奋，机会，乐观是成功的三要 素。(注 意：传 统观念 认为勤 奋和机 会是成 功的要 素，但 是经过 统计学 和成功 人士的 分析得 出，乐 观是成 功的第 三要素 。
42、只有在人群中间，才能认识自 己。——德国
43、重复别人所说的话，只需要教育； 而要挑战别人所说的话，则需要头脑。—— 玛丽·佩蒂博恩·普尔
44、卓越的人一大优点是：在不利与艰 难的遭遇里百折不饶。——贝多芬
45、自己的饭量自己知道。——苏联
39、没有不老的誓言，没有不变的承 诺，踏 上旅途 ，义无 反顾。 40、对时间的价值没有没有深切认识 的人， 决不会 坚韧勤 勉。
41、学问是异常珍贵的东西，从任何源泉吸 收都不可耻。——阿卜·日·法拉兹