RNA建库流程 ppt课件
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RNA建库流程
2014.4.11
一、RNA-seq实验流程
From Weihua Zeng & Ali Mortazavi Nature immunology
样品制备 样品检测 文库构建 文库库检
上机测序
1
二、文库类型
根据研究对象不同选择相应的建库方法：
mRNA
RNA
Non-coding RNA
货号
规格
MRZB12424
6/24Rxns
MRZPL116 MRZSR116 MRZE706
6/24Rxns 6/24Rxns 6/24Rxns
MRZG12324
6/24Rxns
5
✓ Ribo-Zero™ Kit Selection Guide
6
普通转录组、DGE文库
链特异性文库
7
Small RNA文库构建流程
P
OH
如何避免降解的mRNA/rRNA等污染： •样品严格质检，RIN值合格。 •PAGE胶电泳纯化，回收符合small RNA大小的片段（140-160bp）。
M1
1
1
1
M2
160bp 140bp
RNA建库流程
10
片段选择 PCR扩增、纯化
文库质量检测 上机测序
Oligo dT磁珠富集mRNA
Ribo-zero kit去除rRNA
4
Ribo-zero kit去除rRNA
产品
厂家
Ribo-Zero Magnetic Kit（bacteria）
Epicentre
Ribo-Zero Magnetic Kit (Plant Leaf)
DGE文库 真核普通转录组文库
真核链特异性文库 原核链特异性文库
lncRNA文库
Small RNA文库
mБайду номын сангаасNA/lncRNA
建库流程
真核mRNA
Total RNA
原核mRNA/lncRNA
oligodT磁珠富集mRNA
Ribo-zero kit去除rRNA
打断、双链cDNA合成 末端修复、加A加接头
Ribo-Zero Magnetic Kit (Plant Seed/Root) Ribo-Zero Magnetic Gold Kit (Epidemiology)
Ribo-Zero Magnetic Gold Kit (Human/Mouse/Rat)
Epicentre Epicentre Epicentre Epicentre
2014.4.11
一、RNA-seq实验流程
From Weihua Zeng & Ali Mortazavi Nature immunology
样品制备 样品检测 文库构建 文库库检
上机测序
1
二、文库类型
根据研究对象不同选择相应的建库方法：
mRNA
RNA
Non-coding RNA
货号
规格
MRZB12424
6/24Rxns
MRZPL116 MRZSR116 MRZE706
6/24Rxns 6/24Rxns 6/24Rxns
MRZG12324
6/24Rxns
5
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6
普通转录组、DGE文库
链特异性文库
7
Small RNA文库构建流程
P
OH
如何避免降解的mRNA/rRNA等污染： •样品严格质检，RIN值合格。 •PAGE胶电泳纯化，回收符合small RNA大小的片段（140-160bp）。
M1
1
1
1
M2
160bp 140bp
RNA建库流程
10
片段选择 PCR扩增、纯化
文库质量检测 上机测序
Oligo dT磁珠富集mRNA
Ribo-zero kit去除rRNA
4
Ribo-zero kit去除rRNA
产品
厂家
Ribo-Zero Magnetic Kit（bacteria）
Epicentre
Ribo-Zero Magnetic Kit (Plant Leaf)
DGE文库 真核普通转录组文库
真核链特异性文库 原核链特异性文库
lncRNA文库
Small RNA文库
mБайду номын сангаасNA/lncRNA
建库流程
真核mRNA
Total RNA
原核mRNA/lncRNA
oligodT磁珠富集mRNA
Ribo-zero kit去除rRNA
打断、双链cDNA合成 末端修复、加A加接头
Ribo-Zero Magnetic Kit (Plant Seed/Root) Ribo-Zero Magnetic Gold Kit (Epidemiology)
Ribo-Zero Magnetic Gold Kit (Human/Mouse/Rat)
Epicentre Epicentre Epicentre Epicentre