PIK3CA TP53基因项目立项分析
乳腺癌的分子病理特征
乳腺癌的分子病理特征导读：形态学上相似或不相似的不同亚型乳腺癌在分子水平上有何异同呢？下面就以美国TCGA项目乳腺癌的研究给大家做一个梳理。
乳腺癌是一种严重威胁女性健康的常见恶性肿瘤，近年来发病率呈逐年上升趋势。
在乳腺癌的研究方面，让我们看看其他国家的小伙伴们都做了些什么。
在CBioPortal上有这么几个大手笔的研究（其实样本量也就是just so so，就是数据类型多了些）：Breast cancer patient xenografts(British Columbia, Nature 2014) ; Breast InvasiveCarcinoma(British Columbia, Nature 2012) ; Breast Invasive Carcinoma(Broad ,Nature 2012); Breast Invasive Carcinoma(Sanger, Nature2012); Breast Invasive Carcinoma(TCGA, Cell 2015) ; Breast Invasive Carcinoma(TCGA,Nature 2012) ; Breast Invasive Carcinoma (TCGA ,Provisional)。
每个研究中样本量和所检测的数据类型如下：那这些大研究中都包含些什么样的数据呢？下面就来看一下大家熟知的TCGA计划，就进行了多水平的研究，包括突变，拷贝数变异，m RNA表达，mi RNA 的表达，甲基化，蛋白表达等几个层面的研究。
那这些数据都是利用何种检测手段获得的呢？以2012年发表在Nature上的Comprehensive molecular portraits of human breast tumors（The CancerGenome Atlas Network）为例，共利用了6种技术平台：1)Gene expression DNA microarrays; 2) DNA methylationarrays; 3) microRNA sequencing; 4) Affymetrix SNP arrays; 5) exome sequencing; and 6) Reverse Phase Protein Arrays。
PIK3CA基因的生物信息学分析
Ｓ ｉｏ Ｈｅ Ｘｉｏｅ ｇ， ａ ｇ Ｓ ｌｎ ｕ Ｊａ ， ａ ｆｎ Ｗ ｎ ｕ ａ
Ｄｐ ｒ ｅｔｆＢｏｈｍｉｒ Ｃ ａｇｈ ｄｃｌ ｏｅｅ ｅａｔ ｎ ｉ ｅ ｓｙ ｈ ｎｚｉ ｍ ｏ ｃ ｔ Ｍｅｉ ｌｇ ａＣｌ
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第 ２ ４卷 ２１ ０ ０年
第 ２期 ４月
长治 ｌ 院学报 学
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关 键词
中 图分 类 号
ＰＫ Ｃ 生物 信 息学 ； 列分析 Ｉ ３ Ａ； 序
二代测序检测乳腺癌PIK3CA、TP53、PTEN基因突变及其临床意义
[作者简介]陆琦然(1994-02~),女,江苏东台人,硕士研究生,研究方向:乳腺癌诊疗。
E-mail:1063671621@ [通讯作者]孙洁(1985-12~),女,江苏苏州人,硕士,主治医师,研究方向:甲状腺和乳腺疾病诊治。
E-mail:sunjie_soochow@二代测序检测乳腺癌PIK3CA 、TP53、PTEN 基因突变及其临床意义陆琦然刘建夏於恩桥孙洁苏州大学附属第一医院甲状腺乳腺外科（江苏苏州215000）·临床论著·Clinical Article ·530乳腺癌是女性中发病率最高的肿瘤,也是女性死亡率最高的癌症(15.0%)[1]。
近年来精准医疗理念越发深入人心,从基因层面上进一步了解乳腺癌成为近几年医学发展的热门。
这要求科学不断发展,以追求越来越精准的基因检测,于是近年来第二代测序(next-generation sequencing,NGS)应运而生, NGS技术具备速度快、通量高及敏感度高等优势,大大弥补了第一代测序sanger法的不足[2]。
磷脂酰肌醇激酶-3催化亚基α基因(phosphoinositide-3-kinase catalytic alpha polypeptide gene,PIK3CA)是最近数十年来在乳腺癌中发现的一种高突变率原癌基因。
其突变可导致不同水平的多种信号通路的异常调控,从而通过原位杂交促进癌细胞的增殖和存活[3]。
已经有研究证明,PIK3CA基因的突变打开了乳腺癌PI3K/AKT/mTOR这条“旁门左道”,可能导致人表皮生长因子受体-2(human epidermal growth factor receptor-2,HER-2)过表达患者的靶向治疗和激素受体阳性患者的内分泌治疗出现耐药[4]。
肿瘤蛋白p53基因(TP53)基即P53基因,由11个外显子组成,是最早开始研究的几个抑癌基因之一,可诱发细胞凋亡,主导细胞分化[5]。
研究胃癌中PIK3CA基因的突变及其在靶向治疗中的作用
研究胃癌中PIK3CA基因的突变及其在靶向治疗中的作用胃癌是全球范围内发病率最高的癌症之一，其病因的复杂性和病理学的异质性导致治疗效果较差。
近年来，研究人员发现PIK3CA基因的突变与胃癌的发生和发展密切相关，并开始探索该基因在靶向治疗中的作用。
一、PIK3CA基因及其突变在胃癌中的表现PIK3CA基因位于人类染色体3q26.3，其编码的PI3Kα是PI3K家族中最重要的成员之一。
PI3K-FPKB-mTOR信号通路在胃癌的发生和发展中起着关键作用，而PIK3CA基因的突变会导致该通路异常激活，从而促进胃癌的增殖、侵袭和转移。
研究表明，PIK3CA基因的突变在胃癌中的发病率为10%-30%。
突变类型主要包括点突变和插入/删除突变，其中点突变占据绝大多数。
这些突变主要位于PI3Kα的催化亚单位中的热点区域，如E542K、E545K、H1047R等。
二、PIK3CA基因突变与胃癌的预后和治疗许多前瞻性研究发现，与野生型患者相比，携带PIK3CA突变的胃癌患者具有较差的预后，包括较短的无进展生存期和总生存期。
这表明PIK3CA突变可以作为胃癌预后的一个独立预测因子。
在靶向治疗中，PIK3CA基因突变的存在也对治疗效果产生重要影响。
一些研究表明，PIK3CA突变与HER2阳性患者对曲妥珠单抗（trastuzumab）治疗的抵抗性密切相关。
基于这种发现，一些研究人员开始将PIK3CA突变作为预测HER2阳性胃癌患者治疗效果的一个指标，以便更好地选择治疗方案。
此外，抑制PI3Kα通路的一些分子靶向药物也已经进入临床前和临床试验阶段，为进一步探索PIK3CA在靶向治疗中的应用提供了新的可能性。
三、对PIK3CA基因突变进行治疗的挑战尽管PIK3CA基因突变在胃癌中表现出重要的生物学特征，并已成为临床治疗的一个重要靶点，但其在治疗中仍存在很多挑战。
其中包括以下几个方面：1、PIK3CA基因突变在不同的组织和环境中的表现可能有所不同，这意味着需要针对不同个体制定个性化治疗方案。
TP53调控通路相关基因功能单核苷酸多态性与HPV相关宫颈癌关系的研究的开题报告
TP53调控通路相关基因功能单核苷酸多态性与HPV 相关宫颈癌关系的研究的开题报告研究背景与意义：宫颈癌是女性生殖系统中最常见的恶性肿瘤之一，约占女性恶性肿瘤的10%。
HPV（Human Papillomavirus）病毒是宫颈癌的主要致病因素，但并非所有感染HPV的女性都会患上宫颈癌。
因此，研究宫颈癌的发病机制对于早期发现和治疗该疾病具有重要意义。
TP53是人类最常变异的肿瘤抑制基因，它通过调节细胞周期、细胞凋亡等多种途径来维持细胞的正常生长和发育。
研究表明，TP53基因在宫颈癌的发生和发展中扮演着重要的角色。
同时，单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）是一种常见的基因变异形式，与个体生物学、遗传疾病发生和药物反应等方面密切相关。
因此，研究TP53调控通路相关基因功能SNP与HPV相关宫颈癌发生的关系，有助于深入理解宫颈癌的发生和发展机制，为宫颈癌的早期诊断和治疗提供重要依据。
研究目的和内容：本研究的目的是探究TP53调控通路相关基因功能SNP与HPV相关宫颈癌发生的关系。
具体内容包括：1. 筛选TP53调控通路相关基因功能SNP选取先前研究表明与宫颈癌发病相关的TP53调控通路相关基因，通过基因测序技术筛选其功能SNP，建立SNP数据库。
2. 检测功能SNP与宫颈癌的相关性选取一定规模的HPV感染者和非感染者，根据其病理诊断结果分组，检测SNP在两组之间的分布差异，并分析其与宫颈癌发病风险之间的关系。
3. 分析功能SNP的生物学意义利用单细胞转录组学和蛋白质组学方法，比较各功能SNP的对应基因表达和蛋白质翻译水平的变化，进一步阐明SNP对宫颈癌发生机制的影响。
研究预期结果：通过本研究，可以筛选出与TP53调控通路相关基因功能SNP及其发生机制，进一步为研究宫颈癌的发生机制提供依据，为宫颈癌的早期诊断和治疗提供理论依据和技术支持。
TP53和KRAS突变预示肺腺癌使用PD-1疗效更好？
TP53和KRAS突变预⽰肺腺癌使⽤PD-1疗效更好？名词解释1、TP53基因TP53基因是⼀个肿瘤的抑癌基因，抑癌基因可以⽐作是汽车的刹车，该基因在细胞增殖中起到⼀个刹车的作⽤，通俗地说，如果⼀个细胞出现问题了，TP53基因翻译的蛋⽩会启动刹车，不让这个有问题的细胞继续分裂了，看看是否能修复好，如果不能修复好就启动⾃杀凋亡。
所以很多肿瘤都有TP53基因的突变，失去了正常的抑癌基因的功能。
不过针对TP53基因的靶向药物没有获批，本⾝也⽐较困难。
2、肿瘤突变负荷肿瘤突变负荷（TMB），肿瘤组织样本进⾏测序，每1M碱基序列中突变的总数，或者说是肿瘤基因突变密度，或者说是肿瘤基因组中平均有多少突变。
3、肿瘤免疫原性肿瘤免疫原性：指的是肿瘤抗原性物质引起宿主免疫系统识别、攻击的性能。
背景免疫检查点抑制剂如PD-1的疗效预测是⼀个⽐较复杂的事情，PD-L1的蛋⽩表达、肿瘤突变负荷（TMB）、CD8阳性T细胞浸润密度等被提倡来预测PD-1药物的疗效。
但是仍然有很多治疗应答是不能⽤这⼏种⽣物标志物来解释的，吴⼀龙教授带领的研究团队研究了TP53基因和KRAS基因的突变状态，发现TP53和KRAS这两个基因对PD-L1的表达、免疫系统T细胞的浸润、肿瘤免疫原性的增强具有显著影响。
如果⾮⼩细胞肺腺癌患者存在TP53基因突变，或者KRAS基因突变，则往往预⽰着对PD-1药物有较为敏感。
图1：TP53和KRAS基因突变与PD-L1的⾼表达是正相关如上图1所⽰，TP53或KRAS基因突变会导致PD-L1的表达增加，如果是TP53和KRAS共突变，则PD-L1的表达更显著增加，也就是这两个基因突变导致PD-L1表达增加⽅⾯是协同的。
图2：TP53和KRAS基因突变导致PD-L1蛋⽩和CD8阳性T细胞增加的关系肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的出现也是⼀个预测PD-1疗效的有效指标，如图2所⽰，这是⼀个免疫组化的检测结果，可以看出TP53基因、KRAS基因如果发⽣了突变，则PD-L1蛋⽩表达增加，同时CD8阳性的T细胞浸润也增加了。
pik3ca基因保守区域
pik3ca基因保守区域摘要：1.引言2.pik3ca 基因保守区域的概念3.pik3ca 基因保守区域的作用4.pik3ca 基因保守区域在医学研究中的应用5.结论正文：1.引言Pik3ca 基因保守区域作为近年来生物医学领域的研究热点，引起了广泛的关注。
本文旨在介绍pik3ca 基因保守区域的概念、作用以及在医学研究中的应用，以期为相关研究提供参考。
2.pik3ca 基因保守区域的概念Pik3ca 基因保守区域是指在进化过程中，该基因序列在不同物种间保持高度相似性的区域。
这些区域通常对基因功能至关重要，因此在不同物种中具有较高的保守性。
Pik3ca 基因是磷脂酰肌醇3-激酶catalytic 亚基alpha （PI3KCA）的编码基因，该基因在多种生物过程中发挥着重要作用，包括细胞增殖、分化、迁移和凋亡等。
3.pik3ca 基因保守区域的作用Pik3ca 基因保守区域在生物体内起着关键作用。
首先，这些区域可以影响基因的表达水平，进而调控相关生物学过程。
其次，保守区域内的突变可能导致基因功能异常，从而引发疾病。
最后，研究pik3ca 基因保守区域有助于揭示生物进化的规律，为进化生物学提供重要信息。
4.pik3ca 基因保守区域在医学研究中的应用近年来，随着生物医学研究的深入，pik3ca 基因保守区域在医学领域的应用逐渐显现。
例如，研究发现pik3ca 基因保守区域内的突变与多种癌症的发生密切相关，因此，这些区域可作为癌症诊断和治疗的潜在靶点。
此外，pik3ca 基因保守区域在神经系统疾病、免疫疾病等方面的研究也取得了一定的进展。
5.结论综上所述，pik3ca 基因保守区域作为生物医学领域的研究重点，具有重要的理论和实际意义。
PIK3CA基因变异与肺癌临床特征及生存相关性分析演示课件
80%
融合
与其他基因融合产生异常的融合 蛋白，影响PIK3CA基因的正常功 能。
PIK3CA基因变异与肺癌的关系
PIK3CA基因变异在肺癌中较为常见 ，与肺癌的发生、发展、转移和耐药 性等有关。
PIK3CA基因变异通常与肺癌的病理类 型、分期和预后等临床特征相关。
02
PIK3CA基因变异与肺癌临床特征
PIK3CA基因是磷脂酰肌醇激酶-3的编码基因，参与细胞信号转导 和肿瘤发生发展过程。
PIK3CA基因通过调控细胞增殖、分化、迁移和存活等过程，影响 肿瘤细胞的生长和扩散。
PIK3CA基因变异类型
80%
点突变
导致PIK3CA基因编码的蛋白结 构改变，影响其功能。
100%
扩增
PIK3CA基因拷贝数增加，导致 其表达水平升高。
深入研究PIK3CA基因变异对肺癌细胞生物学行 为的影响机制。
开发基于PIK3CA基因变异的肺癌诊断、治疗及 预后评估的生物标志物和药物靶点。
THANK YOU
感谢聆听
预测模型可以综合考虑患者的临床特征、生物学指标和治疗方案等因素，为患者提供更加个性化的治疗 方案。
目前已经有一些肺癌生存率预测模型被提出并应用于临床实践，但仍需不断优化和完善，以提高预测的 准确性和可靠性。
04
PIK3CA基因变异肺癌治疗策略
肺癌治疗现状
化疗
化疗是肺癌的主要治疗方法之一，但治疗效果有限， 且副作用较大。
PIK3CA基因变异可以影响肺 癌细胞的生长、增殖和转移等 过程，从而影响患者的生存率 。
PIK3CA基因变异与肺癌生存 率之间的关系是研究的热点之 一。
研究发现，PIK3CA基因变异 与肺癌患者的生存率存在一定 的相关性，但具体机制仍需进 一步探讨。
pik3ca基因保守区域
pik3ca基因保守区域摘要：1.概述pik3ca 基因保守区域2.pik3ca 基因保守区域的功能3.pik3ca 基因保守区域的研究进展4.pik3ca 基因保守区域的应用前景正文：1.概述pik3ca 基因保守区域pik3ca 基因，全称为磷酸肌醇3-激酶催化亚基α，是一种在细胞内起着重要信号转导作用的酶。
pik3ca 基因保守区域是指在pik3ca 基因序列中，具有较高序列保守性的区域。
这些区域在进化过程中保持相对稳定，对于pik3ca 基因的功能和结构具有关键意义。
2.pik3ca 基因保守区域的功能pik3ca 基因保守区域在细胞内信号传导过程中发挥着关键作用。
它们主要参与调节细胞生长、增殖、分化以及凋亡等生物学过程。
其中，pik3ca 基因保守区域的一个重要功能是激活磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）信号通路。
通过这一信号通路，细胞可以感知到外部环境的变化，从而调整自身的生长和功能。
3.pik3ca 基因保守区域的研究进展近年来，随着研究的深入，科学家们对pik3ca 基因保守区域的认识也不断加深。
许多研究发现，pik3ca 基因保守区域在某些类型的癌症中起着重要作用，如乳腺癌、肺癌等。
这些保守区域的突变可能导致PI3K 信号通路的异常激活，从而促进肿瘤的发生和发展。
因此，研究pik3ca 基因保守区域对于揭示肿瘤发生机制及开发新型抗肿瘤药物具有重要价值。
4.pik3ca 基因保守区域的应用前景随着对pik3ca 基因保守区域的研究不断取得进展，其在医学领域的应用前景也日益明朗。
一方面，通过检测pik3ca 基因保守区域的突变，有助于诊断和预测某些类型癌症的风险，为临床精准医学提供依据。
另一方面，针对pik3ca 基因保守区域的研究成果，可以为新型抗肿瘤药物的研发提供靶点。
例如，目前已经有一些针对pik3ca 基因保守区域的抑制剂进入临床研究，有望为肿瘤患者带来更好的治疗效果。
总之，pik3ca 基因保守区域作为一个具有重要生物学功能的区域，其在医学领域的应用前景广阔。
PIK3CATP53基因项目立项详解
耐 药 厄洛替尼
吉非替尼
FDA要求使用西妥昔单抗、帕尼单抗 治疗结直肠癌前，必须进行KRAS基 因检测
4
1. 项目背景
① PIK3CA 基因定位于3q26.3，长34kb，包含21个外显子，编码1068种氨 基酸，该组氨基酸产生一组长124kD的蛋白。PIK3CA编码I类磷脂酰肌 醇-3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinases,PI3Ks)的p110催化亚单位，即 PI3Kp110a。 I类PI3K为异源二聚体，由一个调节亚基（p85）和一个催 化亚基（p110）组成。
Wu et al (2005a) Samuels et al(2004)
Wu et al (2005a) Lee et al (2004) Saal et al (2005) Saal et al (2005)
Total breast 26% (195/750) Colon Colon Colon 31.6 (74/234) 13.6 (14/103) 18.8 (6/32)
cancer Liver Sample source % PIK3CA mutation (primary tissue vs Exon mutated cancer cell line) Primary 9 and 20 35.6 (26/73) Total liver 36% (26/73) 33.3 (4/12) 21.4 (9/42) 18.1 (13/72) 40.0 (28/70) 20.7 (19/92) 8.3 (1/12) 33.3 (5/15) 26.9 (25/93) 28.0 (14/50) 26.4 (77/292)
PIK3CA 基因突变检测试剂盒(PCR-荧光探针法)
PIK3CA突变的再思考
PIK3CA突变的再思考编译：oyasimi来源：肿瘤资讯在ER+/HER2-乳腺癌中，PI3K/AKT通路常被异常激活，该通路中的PIK3CA，PIK3R1等基因存在高频突变，近年来国内外的学者致力于绘制乳腺癌中的PI3K通路图谱。
本文主要介绍了Luen等人对BIG1-98研究进行了再分析，通过测序，对PI3K通路进行了研究，并就PIK3CA突变这一生物标志物的来处与归处进行了分析与探讨。
2018ASCO，PIK3CA突变靶向药物Taselisib的III期临床试验公布了阳性结果，在这个背景下，对PIK3CA突变作为生物标志物的价值进行重新思考，显得尤为重要。
尚无明确生物标记物可用于指导乳腺癌的AI治疗策略选择辅助内分泌治疗是I-III期激素受体阳性乳腺癌的标准治疗之一。
辅助内分泌的治疗目的为改善患者的DFS与提高患者OS，具体治疗策略因人而异，包括5-10年三苯氧胺（TAM），5-10年的芳香化酶抑制剂（AI），或三苯氧胺2-5年后序贯3年或以上的芳香化酶抑制剂。
临床试验证明AI联合TAM对比AI仅获得较小的DFS获益。
因此，指南多推荐AI作为绝经后乳腺癌患者的辅助内分泌治疗选择，绝经前的高危乳腺癌也可考虑AI联合卵巢抑制的方案。
在对辅助内分泌治疗研究的过程中，发现了一些具有较好预测价值的生物标志物，如激素受体表达状态等，在内分泌策略选择中还需考虑绝经状态、骨骼健康和并发症等因素。
但还未发现对内分泌策略选择有明确指导作用的生物标志物。
BIG1-98研究的再分析BIG1-98试验将8010例绝经后HR+乳腺癌随机化后分入4个5年治疗组，分别予以三苯氧胺，来曲唑，三苯氧胺序贯来曲唑，来曲唑序贯三苯氧胺的治疗，该试验对初始接受三苯氧胺及初始接受来曲唑的两组人群进行了对比，中位随访时间为8.1年，随访期间出现841例复发，5年DFS在初始使用来曲唑的乳腺癌中显著提高（84% vs.81.4%; HR 0.81; 95%CI, 0.70-0.93,P=0.003）。
tp53突变调控基因表达的研究方法
tp53突变调控基因表达的研究方法TP53基因又称为P53，是一种抑癌基因，该基因编码一种分子量为53kDa 的蛋白质。
细胞中抑制癌变的基因"TP53"会判断DNA变异的程度，如果变异较小，这种基因就促使细胞自我修复，若DNA变异较大，"TP53"就诱导细胞凋亡。
在人的基因里面，TP53是非常重要的抑癌基因，在正常细胞中低表达，在恶性肿瘤中高表达。
关于TP53突变调控基因表达的研究方法，主要可以参考以下步骤：1. 确定研究目的：了解TP53突变对基因表达的调控作用，以及这种调控作用对细胞生长、增殖和损伤修复的影响。
2. 收集样本：收集具有TP53突变和正常TP53基因的细胞样本，以及相应的正常细胞样本作为对照。
3. 基因表达分析：通过基因表达谱分析技术，比较突变和正常细胞样本中基因表达水平的差异。
这可以通过微阵列技术、高通量测序等技术实现。
4. 数据分析：对基因表达谱数据进行统计分析，找出TP53突变对基因表达的影响。
包括对差异表达基因的筛选、聚类分析、功能注释等。
5. 实验验证：对于筛选出的差异表达基因，可以通过进一步的实验验证TP53突变对其调控作用。
例如，使用荧光定量PCR、Western blot等技术验证基因的表达水平。
6. 功能研究：深入研究TP53突变对细胞生长、增殖和损伤修复的影响，可以通过细胞生物学实验、动物模型等手段进行。
7. 结果分析：综合分析实验结果，理解TP53突变对基因表达的调控机制及其对细胞生长、增殖和损伤修复的影响。
8. 撰写论文：将研究结果整理成论文，并按照学术规范进行撰写和发表。
通过以上步骤，可以对TP53突变调控基因表达进行深入研究，为癌症治疗提供新的思路和靶点。
不过请注意，具体的研究方法可能因实验室条件、研究目的和样本来源等因素而有所不同，请根据实际情况进行调整。
同时，也需要注意遵守学术道德和规范，确保研究的准确性和可靠性。
PIK3CA被写进乳腺癌NCCN指南，你们的报告更新了吗？
PIK3CA被写进乳腺癌NCCN指南，你们的报告更新了吗？2019年7月2日，NCCN发布了乳腺癌指南2019 V2版，较2019 V1版指南中新增了PIK3CA基因突变检测以及针对PIK3CA基因突变的治疗方案——氟维司群联合特异性PI3K抑制剂Alpelisib。
而FDA已于5月24日批准诺华公司(Novartis)的PI3K抑制剂Alpelisib(Piqray)上市，可与内分泌疗法氟维司群联用，用于治疗接受过内分泌疗法后疾病进展、携带PIK3CA基因突变、HR+/HER2-晚期或转移性绝经后妇女和男性乳腺癌患者，值得一提的是这是首款应用于实体瘤的PI3K抑制剂。
仅过去一个月时间，该疗法就被纳入NCCN指南，这标志着乳腺癌靶向治疗进程在加快。
下面为大家具体介绍本次NCCN乳腺癌指南更新内容中关于PIK3CA的详细信息。
1指南重要更新1PIK3CA基因检测：HR+/HER2-的乳腺癌患者如果考虑使用Alpelisib，可以进行组织或血液的PIK3CA基因检测；可以对肿瘤组织或外周血循环肿瘤DNA（ctDNA）进行PIK3CA突变检测，如果液体活检阴性，推荐进行肿瘤组织检测[1]；2PIK3CA突变阳性治疗方案：对PIK3CA基因突变且HER2阴性的绝经后乳腺癌患者，首选Fulvestrant（氟维司群）+ Alpelisib 联合治疗方案（1类证据）[1]。
指南中关于PIK3CA的更新主要集中于PIK3CA基因的检测以及后续的治疗方案。
需要指出的是在批准该疗法的同时，FDA还批准了其伴随诊断产品——Qiagen的 Therascreen®PIK3CA RGQ PCR Kit，用以检测组织和/或液体活检中的PIK3CA突变，来筛选获益人群[2]。
2PI3K抑制剂Alpelisib疗法获批的临床试验Alpelisib能够获批主要是基于SOLAR-1的研究结果，对入组的572例PIK3CA基因突变（或未突变）的HR+/HER2-晚期或转移性乳腺癌患者中分为两组随机试验。
乳腺癌组织中PIK3CA基因热点突变区域研究的开题报告
乳腺癌组织中PIK3CA基因热点突变区域研究的开题报告
背景：
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，也是引起女性死亡的主要因素之一。
基于人类癌症基因组计划的研究，乳腺癌中最经常突变的基因是PIK3CA。
PIK3CA编码
p110α亚单位，在PI3K/Akt通路中扮演着重要的角色，该通路广泛参与着乳腺癌的发
生和发展。
PIK3CA的热点突变区域包括exon 9和exon 20，分别对应的是E542K 和
E545K两个热点突变及H1047R热点突变。
然而，目前PIK3CA基因热点突变在中国乳腺癌患者中的分布情况和与生存率的相关性尚不是很清楚。
研究目的：
本研究旨在分析中国乳腺癌患者中PIK3CA基因热点突变区域的分布情况，并研究这些突变与患者生存率的相关性，为乳腺癌的预后评估提供新的分子指标。
研究方法：
本研究将收集200例中国乳腺癌患者组织标本，通过基因测序技术分析PIK3CA
基因热点突变区域的分布情况。
同时，采用生存分析方法，探讨各种PIK3CA基因突变及其联合突变与乳腺癌患者生存率的相关性。
最后，结合临床数据，分析PIK3CA基因突变在乳腺癌临床治疗中的指导作用。
研究意义：
本研究有望为中国乳腺癌患者的预后评估提供新的分子指标，为乳腺癌的个体化治疗和精准医疗提供依据，并可能有助于改善乳腺癌患者的生存率和生活质量。
同时，本研究也有助于深入探究PIK3CA基因在乳腺癌发生发展中的机制。
tp53、braf、pik3ca及pten基因与结肠癌相关性的临床研究
上海地区PIK3CA基因突变检测室间质量评价分析
ＤＯＩ：１０．１３６０２／ｊ．ｃｎｋｉ．ｊｃｌｓ．２０２０．０５．１４·质量管理研究·上海地区ＰＩＫ３ＣＡ基因突变检测室间质量评价分析王雪亮，徐幸，魏萌，孔骏，肖艳群，周靖（上海市临床检验中心分子生物学室，上海２００１２６）摘要：目的 利用室间质量评价评估上海地区临床实验室ＰＩＫ３ＣＡ基因突变的检测能力。
方法 选用含有特定ＰＩＫ３ＣＡ突变型的福尔马林固定石蜡包埋细胞样本作为室间质评样本，对其均匀性和稳定性进行评价后，将５个样本随机编号后发送至参评实验室，要求实验室在规定时间内检测并回报结果，综合分析评价回报结果。
结果 均匀性和稳定性均符合中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求。
２０１８年和２０１９年分别收到有效回报结果２８份和１９份，回报结果完全正确的实验室分别为７８．６％（２２／２８）和８９．５％（１７／１９），成绩不合格实验室分别为１７．９％（５／２８）和１０．５％（２／１９）。
样本的整体符合率分别为８６．４％（１２１／１４０）和９３．７％（８９／９５），其中假阳性率为８．６％（１２／１４０）和２．１％（２／９５），假阴性率为８．３％（７／８４）和５．３％（４／７６）。
结论 上海地区临床实验室ＰＩＫ３ＣＡ基因突变检测质量整体较好，但部分实验室检测能力尚需提高。
实验室通过参加室间质量评价可发现自身问题，持续改进并提高其检测质量。
关键词：肿瘤标志物；基因检测；ＰＩＫ３ＣＡ突变；质量保证；室间质量评价中图分类号：Ｒ４４６ 文献标志码：ＡＥｘｔｅｒｎａｌｑｕａｌｉｔｙａｓｓｅｓｓｍｅｎｔｆｏｒＰＩＫ３ＣＡｍｕｔａｔｉｏｎｔｅｓｔｉｎｇｉｎＳｈａｎｇｈａｉａｒｅａ，ＣｈｉｎａＷＡＮＧＸｕｅｌｉａｎｇ，ＸＵＸｉｎｇ，ＷＥＩＭｅｎｇ，ＫＯＮＧＪｕｎ，ＸＩＡＯＹａｎｑｕｎ，ＺＨＯＵＪｉｎｇ（ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙ，ＳｈａｎｇｈａｉＣｅｎｔｅｒｆｏｒＣｌｉｎｉｃａｌＬａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２００１２６，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ ＴｏｅｖａｌｕａｔｅｔｈｅｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅｏｆｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓｆｏｒｔｅｓｔｉｎｇＰＩＫ３ＣＡｇｅｎｅｍｕｔａｔｉｏｎｉｎＳｈａｎｇｈａｉａｒｅａｂｙｕｓｉｎｇｅｘｔｅｒｎａｌｑｕａｌｉｔｙａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＥＱＡ）．Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｆｏｒｍａｌｉｎ ｆｉｘｅｄｐａｒａｆｆｉｎ ｅｍｂｅｄｄｅｄ（ＦＦＰＥ）ｃｅｌｌｓａｍｐｌｅｓ，ｋｎｏｗｎｔｏｃｏｎｔａｉｎｓｐｅｃｉｆｉｃＰＩＫ３ＣＡｍｕｔａｎｔｓ，ｗｅｒｅｕｓｅｄａｓＥＱＡｓａｍｐｌｅｓ．ＴｈｅｈｏｍｏｇｅｎｅｉｔｙａｎｄｓｔａｂｉｌｉｔｙｏｆｔｈｅＥＱＡｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｅｖａｌｕａｔｅｄ．Ｔｈｅｐａｎｅｌｓｃｏｎｓｉｓｔｅｄｏｆ５ｂｌｉｎｄｌｙｃｏｄｅｄｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｄｔｏＥＱＡｐａｒｔｉｃｉｐａｎｔｓｗｈｉｃｈｗｅｒｅｒｅｑｕｉｒｅｄｔｏｔｅｓｔａｎｄｒｅｐｏｒｔｔｈｅｉｒｒｅｓｕｌｔｓｗｉｔｈｉｎａａｐｐｏｉｎｔｅｄｔｉｍｅ．Ａｌｌｔｈｅｒｅｐｏｒｔｅｄｒｅｓｕｌｔｓｗｅｒｅｓｕｍｍａｒｉｚｅｄａｎｄｅｖａｌｕａｔｅｄ．Ｒｅｓｕｌｔｓ ＴｈｅｈｏｍｏｇｅｎｅｉｔｙａｎｄｓｔａｂｉｌｉｔｙｍｅｅｔｔｈｅｒｅｑｕｉｒｅｍｅｎｔｓｏｆｔｈｅＣｈｉｎａＮａｔｉｏｎａｌＡｃｃｒｅｄｉｔａｔｉｏｎＳｅｒｖｉｃｅｆｏｒＣｏｎｆｏｒｍｉｔｙＡｓｓｅｓｓｍｅｎｔ．Ｉｎｔｈｅｙｅａｒ２０１８，２８ｒｅｓｕｌｔｓｗｅｒｅｓｕｂｍｉｔｔｅｄａｎｄ１９ｒｅｓｕｌｔｓｗｅｒｅｓｕｂｍｉｔｔｅｄｉｎ２０１９ｆｒｏｍｖａｌｉｄｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ．Ｔｈｅｐｅｒｃｅｎｔａｇｅｏｆｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓｗｉｔｈｃｏｍｐｌｅｔｅｌｙｃｏｒｒｅｃｔｒｅｓｕｌｔｓｗａｓ７８．６％（２２／２８）ｉｎ２０１８ａｎｄ８９．５％（１７／１９）ｉｎ２０１９，ａｎｄｔｈｏｓｅｗｉｔｈｕｎｑｕａｌｉｆｉｅｄｒｅｓｕｌｔｓｗｅｒｅ１７．９％（５／２８）ｉｎ２０１８ａｎｄ１０．５％（２／１９）ｉｎ２０１９．Ｔｈｅｏｖｅｒａｌｌｃｏｉｎｃｉ ｄｅｎｃｅｒａｔｅｏｆｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｉｎｔｈｅｔｅｓｔｉｎｇｓａｍｐｌｅｓｗａｓ８６．４％（１２１／１４０）ｉｎ２０１８ａｎｄ９３．７％（８９／９５）ｉｎ２０１９ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅｆａｌｓｅｐｏｓｉｔｉｖｅｒａｔｅｓｗｅｒｅ８．６％（１２／１４０）ｉｎ２０１８ａｎｄ２．１％（２／９５）ｉｎ２０１９，ａｎｄｔｈｅｆａｌｓｅ ｎｅｇａｔｉｖｅｒａｔｅｓｗｅｒｅ８．３％（７／８４）ｉｎ２０１８ａｎｄ５．３％（４／７６）ｉｎ２０１９．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ ＭｏｓｔｏｆｐａｒｔｉｃｉｐａｔｉｎｇｃｌｉｎｉｃａｌｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓｓｈｏｗｅｄｇｏｏｄｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅｉｎｔｅｓｔｉｎｇＰＩＫ３ＣＡｇｅｎｅｍｕｔａ ｔｉｏｎ，ｂｕｔｔｈｅｏｐｅｒａｔｉｏｎｓｉｎａｐａｒｔｏｆｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓｎｅｅｄｔｏｂｅｉｍｐｒｏｖｅｄ．ＴｈｅｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓｍａｙｆｉｎｄｏｕｔｔｈｅｉｒｏｗｎｄｅｆｅｃｔｓｂｙｐａｒｔｉｃｉｐａｔｉｎｇｔｈｅＥＱＡｐｒｏｇｒａｍａｎｄｇｒａｄｕａｌｌｙｉｍｐｒｏｖｅｔｈｅｉｒｔｅｓｔｉｎｇｑｕａｌｉｔｙ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｔｕｍｏｒｍａｒｋｅｒｓ；ｇｅｎｅｔｉｃｔｅｓｔｉｎｇ；ＰＩＫ３ＣＡｍｕｔａｔｉｏｎｓ；ｑｕａｌｉｔｙａｓｓｕｒａｎｃｅ；ｅｘｔｅｒｎａｌｑｕａｌｉｔｙａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ磷脂酰肌醇 ３ 激酶催化亚单位α（ｐｈｏｓｐｈａｔｉｄｙｌｉｎｏｓｉｔｏｌ ４，５ Ｂｉｓｐｈｏｓｐｈａｔｅ３ Ｋｉｎａｓｅ，ＰＩＫ３ＣＡ）是Ⅰ类磷脂酰肌醇 ３ 激酶ｐ１１０α催化亚基的编码基因。
肺腺癌tp53临床实验
肺腺癌tp53临床实验肺腺癌 TP53 临床实验肺腺癌是一种常见的肺癌亚型，其发生率逐年增加。
在肺腺癌的研究中，TP53 基因突变是一个重要的研究方向。
本实验旨在探究 TP53 基因突变与肺腺癌发展和预后的关系，为该疾病的早期诊断和分子靶向治疗提供依据。
1. 实验目的本实验旨在研究 TP53 基因突变与肺腺癌发展和预后的关系，为肺腺癌的早期诊断和精准治疗提供科学依据。
2. 实验方法2.1 病例选择收集并纳入肺腺癌患者的临床数据和组织样本。
2.2 DNA 提取与测序从肺腺癌患者的组织样本中提取 DNA，并使用测序技术对 TP53 基因进行全面测序。
2.3 突变分析使用生物信息学工具进行 TP53 基因突变分析，找出患者样本中的各类突变类型和频率。
3. 实验结果3.1 TP53 基因突变状况在收集的肺腺癌患者样本中，发现了多种 TP53 基因突变，包括错义突变、无义突变和非同义突变等。
3.2 TP53 基因突变与临床特征的关系对突变结果与患者的临床特征进行统计分析，发现 TP53 基因突变与年龄、性别、肿瘤分期等临床特征之间存在一定的相关性。
3.3 TP53 基因突变与预后的关系对患者样本的预后数据进行分析，发现 TP53 基因突变与肺腺癌患者的生存期和生存率呈负相关。
4. 实验讨论4.1 TP53 基因突变在肺腺癌中的重要性TP53 基因是细胞周期调节和DNA损伤修复的重要调控基因，其突变与多种癌症的发生和发展有关。
本实验结果表明，肺腺癌中 TP53 基因突变的频率较高，提示其在肺腺癌的发生发展中具有重要作用。
4.2 TP53 基因突变与临床特征的关系本实验发现 TP53 基因突变与肺腺癌患者的年龄、性别、肿瘤分期等临床特征存在相关性。
这些结果为临床上对肺腺癌患者进行个体化诊疗提供了依据。
4.3 TP53 基因突变与预后的关系实验结果显示 TP53 基因突变与肺腺癌患者的生存期和生存率呈负相关。
这一发现提示 TP53 基因突变可能是肺腺癌预后不良的潜在因素，进一步验证其作为肺腺癌预后的预测指标的可行性。
pik3ca基因保守区域
pik3ca基因保守区域（最新版）目录1.PIK3CA 基因的概述2.PIK3CA 基因保守区域的定义和特点3.PIK3CA 基因保守区域的功能4.PIK3CA 基因保守区域的研究进展5.PIK3CA 基因保守区域的应用前景正文1.PIK3CA 基因的概述PIK3CA 基因，全称为磷酸肌醇酸酸酯激酶 3 催化亚基α，是一种在细胞内发挥重要作用的蛋白质。
它属于 PI3K/AKT 信号通路中的关键组成部分，该信号通路在细胞生长、增殖、分化和凋亡等过程中具有重要意义。
2.PIK3CA 基因保守区域的定义和特点PIK3CA 基因保守区域是指在进化过程中高度保守的核苷酸序列，这些序列在多种生物体中具有很高的相似性。
保守区域的特点是它们在进化过程中不易发生改变，这是因为这些区域对蛋白质的功能和稳定性具有关键作用。
3.PIK3CA 基因保守区域的功能PIK3CA 基因保守区域主要负责维持 PIK3CA 蛋白的结构稳定，以及参与细胞内信号传导过程。
保守区域的突变可能导致蛋白质功能异常，从而影响信号通路的正常运作，进一步引发一系列生理和病理过程。
4.PIK3CA 基因保守区域的研究进展近年来，关于 PIK3CA 基因保守区域的研究取得了重要进展。
研究人员已经识别出了多个保守区域，并对其功能和结构特征进行了深入研究。
此外，一些针对 PIK3CA 基因保守区域的药物也被开发出来，用于治疗与PIK3CA 相关的疾病，如乳腺癌等。
5.PIK3CA 基因保守区域的应用前景随着对 PIK3CA 基因保守区域的研究不断深入，未来有望开发出更多针对该区域的靶向治疗药物，以提高治疗效果和减少副作用。
胃癌组织中PIK3CA基因热点突变筛查及临床意义
胃癌组织中PIK3CA基因热点突变筛查及临床意义郝兰香;潘超;蔡建春【期刊名称】《基础医学与临床》【年(卷),期】2014(034)012【摘要】目的检测中国人群胃癌组织中PIK3 CA基因突变频率及热点突变模式,探讨PIK3 CA基因突变的临床意义.方法应用荧光PCR法筛查胃癌PIK3 CA基因突变阳性病例,Sanger DNA测序法检测PIK3CA基因热点突变模式;统计分析PIK3 CA基因突变与胃癌临床病理特征之间的关系.结果 400例肿瘤标本中检测出PIK3 CA基因突变率为7.5％ (30/400),突变位点主要集中在第9外显子(E542K,E545K)和第20外显子(H1047R,H1047L);且PIK3 CA基因突变与肿瘤预后相关(P＜0.05),而与肿瘤大小、组织学分级、淋巴结状态、患者年龄等因素无关.结论中国人群胃癌组织中PIK3CA基因突变具独特的突变频率与突变模式;PIK3 CA基因突变对于胃癌预后判断及基因靶向治疗具潜在临床价值.【总页数】5页(P1671-1675)【作者】郝兰香;潘超;蔡建春【作者单位】厦门大学附属中山医院病理科,福建厦门361004;厦门大学附属中山医院病理科,福建厦门361004;厦门大学附属中山医院胃肠外科,福建厦门361004【正文语种】中文【中图分类】R735.2【相关文献】1.结直肠癌KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因联合突变分析及临床意义 [J], 梁跃;李光学;马庆庆2.胃癌组织中PIK3CA基因突变频率及热点突变模式 [J], 邹伟;张欢3.PIK3CA基因突变及PTEN表达缺失在乳腺癌中的临床意义 [J], 胡晓清;许践刚;张宪波;周浩亮;赵挺4.二代测序检测乳腺癌PIK3CA、TP53、PTEN基因突变及其临床意义 [J], 陆琦然;刘建夏;於恩桥;孙洁5.鼻咽癌组织中PIK3CA基因热点突变区的突变筛查 [J], 刘鹏;李大疆;覃海德;张如华;陈丽珍;曾益新因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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2. 临床意义---突变率
Sample source
% PIK3CA mutation (primary tissue vs Exon mutated
cancer cell line)
35.6 (26/73)
Primary
9 and 20
Total liver 36% (26/73)
C2, helical and kinase Campbell et al(2004)
Helical and kinase
Wu et al (2005a)
kinase
Samuels et al(2004)
Helical and kinase
Wu et al (2005a)
Helical and kinase
厦门艾德生物医药科技有限公司
2013.04.02
7
1. 项目背景
⑤ 其他的PIK3CA基因突变检测试剂盒：
产品名称
公司
一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR分型检测试 剂盒及检测方法
广州达健
一种检测人PIK3CA基因突变的方法和试剂盒
苏州科贝
用于检测直肠癌PIK3CA基因热点突变位点
杭州艾迪康医学检验
霍夫曼-拉罗奇有限公司 广州益善生物技术股份有限公司 广州益善生物技术股份有限公司
宁波有成生物医药科技有限公司 武汉友芝友医疗科技有限公司 武汉康圣达医学检验所有限公司
广州达健生物科技有限公司 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
苏州科贝生物技术有限公司
申请号或授权公告号 CN102453765B
CN201280046858 CN201010160769
Lee et al (2004)
p85, helical and kinase Saal et al (2005)
p85, C2, helical and kinase
Saal et al (2005)
6
1. 项目背景
④ CFDA注册产品：
产品名称
生产单位
批准日期
人PIK3CA基因突变检测试剂盒 （荧光PCR法）
北京雅康博生物科技有限公司
2014.06.17
人类PIK3CA基因突变检测试剂 盒（流式荧光杂交法）
益善生物技术股份有限公司
2014.07.07
人类PIK3CA基因突变检测试剂 盒（荧光PCR法）
PIK3CA 基因突变检测试剂盒(PCR-荧光探针法)
北京鑫诺美迪基因检测技术有 限公司
8
1. 项目背景
⑥ 国内相关专利：
专利名称 PIK3CA基因驱动突变的检测探针、引物及试剂盒
PIK3CA H1047R敲入非人动物乳腺癌模型 一种PIK3CA基因突变检测液相芯片
PIK3CA基因突变的检测探针、液相芯片及其检测方法 一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR检测试剂盒及检测方法
一种用于检测PIK3CA基因突变的试剂盒 引物及该引物质谱检测PIK3CA基因热点突变的方法 一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR分型检测试剂盒及其检测方法 用于检测结直肠癌PIK3CA基因热点突变位点的试剂盒
一种检测人PIK3CA基因突变的方法和试剂盒
申请（专利权）人 厦门艾德生物医药科技有限公司
Primary
1, 4, 7, 9, 13, 18, 20
Total breast 26% (195/750)
Helical and kinase Bachman et al(2004)
p85, helical and kinase Bachman et al(2004)
Helical and kinase Levine et al(2005)
Functional domain
Helical and kinase
Reference
Lee et al (2004)
33.3 (4/12) 21.4 (9/42) 18.1 (13/72) 40.0 (28/70) 20.7 (19/92) 8.3 (1/12) 33.3 (5/15) 26.9 (25/93) 28.0 (14/50)
CN101445832B CN201310260412 CN201410734805 CN201210574584 CN201210330990 CN201210234133 CN2010106085来自09cancer
Liver
Breast Breast Breast Breast Breast Breast Breast Breast Breast Breast
5
1. 项目背景
② PIK3CA 的突变约4/5发生在螺旋区(exon9)和激酶区(exon20)这两个热点
区域。 ③ PIK3CA基因突变引起p110a异常激活，进而活化PI3Ks，激活下游Akt等信
号分子，激活或抑制其下游靶蛋白进而调节细胞的增殖、分化、凋亡以及 迁移等生物学效应，最终导致肿瘤的发生。
PIK3CA、TP53 基因项目立项报告
分子诊断部 徐正红
20150302
一．PIK3CA基因项目 二．TP53基因项目 三．技术方法 四．风险评估
2
一. PIK3CA基因项目
3
西妥昔单抗
耐 帕尼单抗 药 厄洛替尼
吉非替尼
1. 项目背景
FDA要求对拟采用易瑞沙、特罗凯等 EGFR-TKI治疗的患者,进行EGFR基因突 变检测
26.4 (77/292)
Cell lines Primary Primary Primary Primary Primary Cell lines Primary Cell lines
9 and 20 1, 9 and 20
9 and 20 6, 7, 9 and 20
9 and 20 20
9 and 20 9 and 20 1, 9 and 20
FDA要求使用西妥昔单抗、帕尼单抗 治疗结直肠癌前，必须进行KRAS基 因检测
4
1. 项目背景
① PIK3CA 基因定位于3q26.3，长34kb，包含21个外显子，编码1068种氨 基酸，该组氨基酸产生一组长124kD的蛋白。PIK3CA编码I类磷脂酰肌 醇-3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinases,PI3Ks)的p110催化亚单位，即 PI3Kp110a。 I类PI3K为异源二聚体，由一个调节亚基（p85）和一个催 化亚基（p110）组成。