临床数据中心的构建与应用
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临床数据中心的构建与应用
目的建立以患者为中心、实时的、可扩展的、物理的临床数据中心(CDR),支持医院对临床数据的多元化应用。方法根据HL7和电子病历共享文档规范,基于企业总线型集成平台(ESB),通过中心字典对所需求数据进行标准化处理,实现在香港大学深圳医院的临床数据中心(CDR)的构建。结果实现了全院级的临床数据中心,支持对异构的16个系统,105电子病历文档的数据集成,方便了临床人员对患者数据的查询。结论临床数据中心的构建为医院的医疗质量,临床多元化的数据应用提供了有效的支持。
标签:临床数据中心(CDR);企业总线型的集成平台(ESB);唯一病人号(UPID);HL7 卫生信息交换标准;RIM 参考信息模型
香港大学深圳医院作为一家综合性三家医院,从2012年7月开院至今,已经有20多个临床系统在运行,以支持医院开展的临床业务。通过各个专科业务系统在应用,医院临床数据的范围得到的扩大,临床的数据量得到了大的增长。由于医院信息化系统的多样性和复杂性,使得临床数据分散的存在不同业务系统的数据库里。如何在异构的系统和数据环境里获取、浏览、共享甚至分析和利用这些数据,成为了医院信息化的挑战[1]。
1 现状和问题
在数据共享和交换方面,由于各个系统的设计初衷是为了支撑部门或者科室业务的运行,因系统架构不同,数据模型不一致,数据格式和内容缺乏标准,造成各系统产生临床数据共享和交换困难。在临床数据整合和统一展示方面,临床用户希望在一个界面里看到患者历次的、各项诊疗记录。在对临床数据的分析和利用方面,如何對散落在不同系统的临床数据进行分析和挖掘,以支持医疗管理的需求,为建立医疗大数据打下基础[2]。
该院为解决上述问题,依托于企业服务总线型(ESB)的基于HL7标准的数据集成和交换平台,基于HL7 CDA和国家卫生计生委的《电子病历共享文档规范》(下简称《规范》)标准,建立了全院级别的以患者为中心、实时的、可扩展的、物理的临床数据中心(CDR)。
2 建设思路和实施情况
2.1 数据建模方法
参考HL7 RIMM模型,进行领域派生和和精细化扩展,以覆盖医院业务领域的各个业务场景,最终映射成数据库的逻辑和物理结构。该院的CDR以患者为中心,以历次患者诊疗记录为核心,关联着临床不同类型不同来源的数据。
采用3层关联来数据模型的关系和临床数据的整合。第1层:CDR内建患
者主索引,通过唯一病人号与患者主索引关联,一一对应着患者的身份信息资料。第2层:通过唯一患者号将患者身份与历次就诊记录集相关联。病人的就诊信息可以来源于不同部门和不同的数据源。以该院为例,患者的来源有:门(急)诊、住院、体检、国际诊疗中心。通过医院服务入口域编号和当次就诊流水号合并,与唯一病人号关联。从而达到唯一病人号与历次诊疗记录的1:N的关系。第3层:按照医疗业务模型,将医院的数据分为医嘱、申请、检验、检查、手术等类型。通过就诊流水号与业务系统的唯一编码关联,从而关联和整合患者历次就诊的所有临床数据。
该数据模型的构建充分考虑到了医疗机构的通用性和扩展。以患者为中心,以历次诊疗记录为核心,医疗可以根据实际的业务数据特色进行选择和扩展。见图1。
目前,该院临床数据中心整合了来自于16个系统,包括诊断、处方、医嘱、发药、护理、检验、超声/X光/CT/MRI/内镜、病理、心电、手术麻醉、ICU、体检等临床数据。
2.2 电子病历文书的处理方法
医院的电子病历文书通常用异构的系统产生,存放在不同的数据库里。该院借鉴HL7 V3 CDA和《规范》《电子病历基本数据集》标准,根据该院的实际业务定义了该院的电子共享文档标准。
首先,按照该院电子病历的结构化现状,制定该院电子病历的Entry级别。其次,该院对电子病历共享文档的标准进行了扩展。在遇到比HL7或者《规范》数据元结构化粒度更细的数据项,采用包含原元数据编码,在后面增加扩展码的方式来扩展。对于HL7或者《规范》没有的内容,采用该院的OID进行标识。以确保该文档对象的唯一性,也为跨院语义层面的数据交换做准备。
该院目前已经使用了使用了52类电子病历共享文档,收集临床105类电子病历文档。目前临床数据中心已经收集和存储了2千余万电子病历文档。
2.3 数据采集和标准化
该院信息化在建设之初就已经搭建了总线性的集成平台(ESB),以面向事件的方式集成和整合异构的医院业务系统。根据该院的实际临床业务开展,梳理128个业务场景,使用了59类的HL7消息。临床数据中心接入集成平台。对临床数据进行实时地收集和存储。
通过中心字典(Central Dictionary)对医院业务领域的基础字典、人员科室、以及医院术语库等主数据进行管理。中心字典属于医院系统架构的核心部件,为集成平台的一部分。集成平台根据业务的需求,通过访问中心字典,对交互的数据内容进行必要的数据标准化和数据转义。从而达到按需进行数据标准化和转义,以兼容异构的系统和多类型的数据字典。见图2。
3 临床应用
3.1 临床信息集成视图
基于临床数据中心,将临床信息进行统一的展示。方便医生对患者的历次就诊信息进行查询。临床信息集成视图可以从5个角度进行浏览,就诊索引视图、门诊视图、住院视图和时间轴视图以及临床信息分类视图。医生可以从任何一个视图切入了解患者信息。由于整合了各个系统的临床数据。
根据该院的实际业务流程,集成视图可以展示业务闭环过程和状态。得益于临床数据中心的实时性,可以方便医生了解业务实时进展。集成视图整合了医院的历史临床数据,医生可以看到单个患者历次检验结果的对比和趋势图。方便医生了解患者个性化的诊疗情况。3.2 对外数据服务的建设
对外数据服务为有需要的应用系统提供全生命周期的临床数据服务,对数据服务的接口进行统一的配置和管理,一方面提供数据访问的灵活性[3],另一方面,确保数据访问的安全性。对外数据服务提供视图和Webservice等接口,提供通配符SQL语句配置方式,方便数据接口的配置,可以兼容异构的系统和访问需求。对外数据服务有基于角色的权限管理(Role Bases Access Control),有对访问IP的白名单限制,具备一定的安全保护机制。
由于临床数据中心的支持,使得应用系统更方便地获取到跨业务部门的临床数据。应用系统的实施交付周期变短。目前该院已经实现了基于临床数据中心的应用系统有5个,达到了良好的效果。
4 问题和讨论
4.1 数据质量的改进
临床数据质量决定临床数据中心的应用价值。数据质量不单单和数据在收集、传输、转义、存储方面的正确处理有关系,还有源系统的数据质量有密切的关系。另一方面,录入的数据不规范,不完整也是影响临床数据中心的主要原因。因此,除了把控源系统的数据质量之外,临床用户主动推动数据质量建设也十分重要。
4.2 数据安全
虽然CDR向医护人员提供统一视图展示方便医生的查询,对应用系统提供数据服务的访问支持方便应用系统的交付,但这同时也带来临床数据安全性的风险。希望以后有基于医生操作行业和敏感数据内容的智能权限防护预警。
4.3 数据利用