一个内含子长度多态性标记与栽培稻F_1花粉育性基因座连锁

分子植物育种，２００６年，第４卷，第３期，第３２３－３２８页

ＭｏｌｅｃｕｌａｒＰｌａｎｔＢｒｅｅｄｉｎｇ，２００６，Ｖｏｌ．４，Ｎｏ．３，３２３－３２８

研究报告

ＲｅｓｅａｒｃｈＲｅｐｏｒｔ

一个内含子长度多态性标记与栽培稻Ｆ

１

花粉育性基因座连锁

吴海滨１，２朱汝财１李迪１赵德刚２＊白羊年１＊

１海南省热带农业资源开发利用研究所，三亚，５７２０２５；２贵州省农业生物工程重点实验室，贵州大学，贵阳，５５００２５

＊共同通讯作者，ｄｅｇａｎｇｚｈａｏ＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ；ｂａｉｙａｎｇｎｉａｎ＠ｈｉｔａｒ．ｏｒｇ

摘要本研究利用两份栽培稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．）种质ＨＩＴＡＲ００５和ＩＲＧＣ２０５０９杂交建立了含有５００个单

株的Ｆ

２群体，采用内含子长度多态性标记对Ｆ

２

群体中的１１７株进行了标记基因型分析。研究发现一个内含

子长度多态性标记，ＲＩ０１５９４，其标记座位上与父本（ＩＲＧＣ２０５０９）相同基因型的纯合植株完全消失，且母本纯合基因型植株与杂合基因型植株的比率符合１：１（!２

Ｃ

＝０．９０，"２Ｃ＜Ｘ２０．０５），表现出一种明显的偏分离现象。分析该分子标记所在的目的序列，ＲＩ０１９５４标记所位于的基因含有３个内含子是一个功能未知的转录因子，粳稻Ｎｉｐｐｏｎｂａｒｅ（日本晴）在该基因的第３个内含子序列与籼稻９３１１的序列相比有２４个碱基的缺失。进一步分析ＲＩ０１９５４标记的ＰＣＲ产物表明，发现消失的纯合植株基因型偏向于粳稻Ｎｉｐｐｏｎｂａｒｅ（日本晴）。结合供试

的Ｆ

２群体的花粉育性检测结果，初步表明ＲＩ０１５９４标记与栽培稻Ｆ

１

花粉育性基因座连锁，与Ｆ

１

花粉不育基

因座连锁的遗传距离小于０．５ｃＭ，推测与ＲＩ０１９５４标记连锁的栽培稻的Ｆ

１

花粉不育性基因座是一个新的杂种不育位点。

关键词栽培稻，内含子长度多态性，Ｆ１花粉育性，偏分离

ＡｎＩＬＰＭａｒｋｅｒＣｌｏｓｅＬｉｎｋｉｎｇｗｉｔｈｔｈｅＴｅｎｔａｔｉｖｅＮｏｖｅｌＦ１ＰｏｌｌｅｎＳｔｅｒｉｌｅＬｏｃｕｓｉｎＣｕｌｔｉｖａｔｅｄＲｉｃｅ

ＷｕＨａｉｂｉｎ１，２ＺｈｕＲｕｃａｉ１ＬｉＤｉ１ＺｈａｏＤｅｇａｎｇ２＊ＢａｉＹａｎｇｎｉａｎ１＊

１ＨａｉｎａｎＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＴｒｏｐｉｃａｌＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＲｅｓｏｕｒｃｅｓ，Ｓａｎｙａ，５７２０２５；２ＧｕｉｚｈｏｕＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＢｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＧｕｉｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕｉｙａｎｇ，５５００２５

＊Ｃｏ－ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，ｄｅｇａｎｇｚｈａｏ＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ；ｂａｉｙａｎｇｎｉａｎ＠ｈｉｔａｒ．ｏｒｇ

ＡｂｓｔｒａｃｔＴｈｅＦ２ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ５００ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓｗａｓｄｅｖｅｌｏｐｅｄｕｓｉｎｇｔｗｏｃｕｌｔｉｖａｔｅｄｒｉｃｅｇｅｒｍｐｌａｓｍｓ（Ｏ－ｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．），ＨＩＴＡＲ００５ａｓｆｅｍａｌｅｐａｒｅｎｔｆｒｏｍＨＩＴＡＲａｎｄＩＲＧＣ２０５０９ａｓｍａｌｅｐａｒｅｎｔｆｒｏｍＩＲＲＩ，ａｎｄｔｈｅＩＬＰ（ｉｎｔｒｏｎｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）ｍａｒｋｅｒｓｗｅｒｅｅｍｐｌｏｙｅｄｔｏｇｅｎｏｔｙｐｅｔｈｅ１１７ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓｏｆｔｈｅＦ２ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ．ＲＩ０１９５４，ａｎＩＬＰｍａｒｋｅｒｍａｐｐｅｄｉｎｔｈｅ３ｒｄｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ，ｗａｓｆｏｕｎｄｔｈａｔｉｔｓｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓｌｏｃｕｓｆｏｒｍａｌｅｐａｒｅｎｔｗｅｒｅｃｏｍｐｌｅｔｅｌｙａｂｓｅｎｔｉｎｔｈｅ１１７ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓａｎｄｔｈｅｒａｔｉｏｏｆＲＩ０１９５４ｌｏｃｕｓｂｅｔｗｅｅｎｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓｏｆｆｅｍａｌｅｐａｒｅｎｔａｎｄｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｕｓｗａｓ１：１（#２Ｃ＝０．９０，$２Ｃ＜Ｘ２０．０５），ｗｈｉｃｈｓｈｏｗｅｄｏｂｖｉｏｕｓｌｙｄｉｓｔｏｒｔｅｄｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎｉｎｔｈｅＦ２ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ．ＴｈｅｓｅｑｕｅｎｃｅｃｏｎｆｅｒｒｉｎｇＲＩ０１９５４ｗａｓｄｅｅｐｌｙａｎａｌｙｚｅｄｔｈａｔｉｔｉｓｕｎｋｎｏｗｎｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｆａｃｔｏｒｃｏｎｔａｉｎｉｎｇｔｈｒｅｅｉｎｔｒｏｎｓ．Ｔｈｅｒｅｉｓ２４ｂｐｄｅｌｅｔｉｏｎｏｆｔｈｅ３ｒｄｉｎｔｒｏｎｉｎＪａｐｏｎｉｃａＮｉｐｐｏｎｂａｒｅｃｏｍｐａｒｉｎｇｗｉｔｈＩｎｄｉｃａ９３１１．ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＰＣＲｐｒｏｄｕｃｔｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｂｙｐｒｉｍｅｒｓｏｆＲＩ０１９５４ｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｂａｎｄｓｆｏｒｍａｌｅｐａｒｅｎｔｄｉｓａｐｐｅａｒｅｄｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｃａｌｔｏＪａｐｏｎｉｃａＮｉｐｐｏｎｂａｒｅ．ＣｏｍｂｉｎｉｎｇｔｈｅｒｅｓｕｌｔｏｆｐｏｌｌｅｎｆｅｒｔｉｌｉｔｙａｎａｌｙｓｉｓｉｎｔｈｅＦ２ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ，ｉｔｗａｓｐｒｉｍａｒｙｃｏｎ－ｃｌｕｄｅｄｔｈａｔＲＩ０１９５４ｍａｒｋｅｒｃｌｏｓｅｌｙｌｉｎｋｅｄｔｏｔｈｅｐｈｅｎｏｔｙｐｅｏｆｔｈｅＦ１ｐｏｌｌｅｎｓｔｅｒｉｌｉｔｙｌｏｃｕｓａｎｄｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｄｉｓｔａｎｃｅｓｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｍｗａｓｅｓｔｉｍａｔｅｄｌｅｓｓｔｈａｎ０．５ｃＭ．ＡｎｄａｌｓｏｉｔｓｕｇｇｅｓｔｅｄｔｈａｔｔｈｅｌｏｃｕｓｌｉｎｋｅｄｗｉｔｈＲＩ０１９５４ｗａｓａｎｏｖ－ｅｌＦ１ｐｏｌｌｅｎｓｔｅｒｉｌｅｌｏｃｕｓｉｎｔｈｅｃｕｌｔｉｖａｔｅｄｒｉｃｅ．

ＫｅｙｗｏｒｄｓＣｕｌｔｉｖａｔｅｄｒｉｃｅ（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．），Ｉｎｔｒｏｎｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ（ＩＬＰ），Ｈｙｂｒｉｄｓｔｅｒｉｌｉｔｙ，Ｄｉｓｔｏｒｔｅｄｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ