白菜品种测评展示报告2017
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报告5：
白菜品种测评展示报告（2017）
白菜属十字花科芸薹属，叶用蔬菜，原产于中国，又名 结球白菜、包心白菜、胶菜等，是我国种植面积最大的蔬菜 作物之一，生态类型多样，分布广，产量高，耐贮运，供应 期长，营养全面，食用方法多样，且种植简易、省工、成本 低，其丰欠关系到蔬菜的市场价格，直接影响市场供应，在 我国菜篮子中居不可替代的重要地位。
一、白菜产业发展现状 （一）栽培面积大，分布区域广 据农业部 2012 年统计，全国大白菜播种面积为 255.8 万 hm2，占蔬菜总播种面积的 13%，栽培面积和产量为各种蔬 菜作物之首，大白菜生产在蔬菜业中占有主导地位。 大白菜在全国普遍栽培，其中山东、河北、河南等省种 植面积较大，西藏、青海种植面积较小。由于历史、生态、 生产和消费习惯差异的原因，我国山东、河北、河南等北方 地区是大白菜的主产区，广东、云南等南方省份由于具备多 茬排开播种的优势，因此复种指数高，栽培面积也很大。另 外，长江以南地区近年来面积增长较快，可能是作为苗菜食 用增多的原因所致。 （二）实现了周年栽培、周年供应 由于市场的需求、品种的进步、栽培技术的不断完善和
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提高，目前我国大白菜栽培季节由过去主要是秋季一季栽 培，发展为春、夏、秋多季栽培，加之南菜北运、北菜南运 对市场的调节我国大白菜已基本达到了周年供应的要求。并 且随着产业的发展，逐渐在全国形成了大白菜新的优势产业 区，如黑龙江、吉林的加工大白菜产区，河北坝上地区、鄂 西山区、秦岭山区、甘肃的春夏季大白菜产区，云南、贵州 的越冬大白菜产区等，这些优势产区的形成，极大地促进了 大白菜产业的发展。
（三）栽培模式和消费模式不断发生变化 近些年来，大白菜的栽培和消费模式发生了重大变化。 由过去种植大株品种、以大型白菜球消费为主，发展为大球、 苗用大白菜（快菜）、娃娃菜和小型大白菜等多种栽培和消 费模式并存。 苗用菜、娃娃菜和小型大白菜由于具有品质好、生长周 期短、生产效益高、适合目前我国家庭人口少的消费需求等 优势，很受生产和消费者的青睐，市场前景看好。 苗用大白菜是以 30-35 天生长左右的大白菜苗作为上市 产品。由于其不耐长途运输，一般在城市近郊进行生产，就 近供应市场。苗用大白菜茬口安排灵活，北方秋冬在保护地、 夏秋在露地生产。 娃娃菜是利用早熟、小型化的大白菜品种通过高度密植
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的栽培形式生产的。娃娃菜因为个体小，一般单球重 150-200g，便于包装，适合目前我国三口之家消费的需要， 口感品质好，愈来愈受到城市消费者的欢迎，已成为全国各 大超市和农贸市场的畅销蔬菜产品。目前，我国娃娃菜的主 产区在云南、甘肃、河北张家口坝上地区等，近年来栽培区 域有继续扩大之势。北京市郊区春季在日光温室、大棚，秋 季在露地栽培的面积不断扩大。但娃娃菜是通过把高密度种 植获得的小型大白菜进行加工，把外叶和球外部的多层能食 用的叶片去掉而成，加工过程造成的浪费较大。
小型大白菜是应该提倡和大力发展的栽培和消费模式， 该类型就是利用娃娃菜的种植品种和种植模式，生产商品球 重 500-1000g 的小型白菜球作为商品上市，这样即可避免加 工娃娃菜过程中的浪费，也可满足目前家庭对小型大白菜消 费的需求。据了解，日本现在小型大白菜的消费需求也不断 增长，但娃娃菜的消费并不多，日本的做法是值得我们思考 和借鉴的。
二、大白菜品种需求分析 （一）大白菜品种主要类型 大白菜起源于我国，栽培历史悠久，品种类型丰富。大 白菜按栽培季节可分为春白菜、夏白菜、早秋白菜贩白菜和 秋白菜按熟性可分为极早熟、早熟、中熟和晚熟按球形分为
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近球形、头球形锥形、炮弹形和直筒形按抱合类型又分为叠 抱、合抱、拧抱等。
（二）品种的需求“专用化”和“多样化” 蔬菜出口是许多国家农业创汇的重要渠道，荷兰、西班 牙、意大利、美国等均是蔬菜出口的重要国家。我国蔬菜出 口逐年稳步增长，发展势头良好，但与世界蔬菜贸易水平尚 有很大差距。我国蔬菜总产量占世界蔬菜总产量的 40%左 右，而蔬菜出口量只占国内蔬菜总量的 0.7%，远远低于全球 蔬菜的国际贸易量占世界蔬菜产量 6%的平均水平，有很大 的发展空间。造成我国蔬菜出口与发达国家差距较大的因素 有很多，除了产品农药残留超标、栽培方式落后等诸多因素 之外，缺乏优质、专用的品种也是重要原因之一。蔬菜出口 形式主要有新鲜蔬菜和加工蔬菜两大类，大白菜同样有新鲜 蔬菜和加工蔬菜（主要是朝鲜辣菜）出口两大类型，不同出 口目的和出口地区所需要的品种类型有所不同，因此需要选 育满足出口目的的专用品种。 随着信息和运输产业的发展，我国蔬菜专业化反季节蔬 菜生产基地在各地相继建立，生产、收购、调运、贩卖或出 口一条龙的新型产业正在悄然兴起，以全国调运为主的生产 基地对品种提出了“耐贮运”的新要求，推广品种除要求高产、 抗病、优质、商品性好等优良性状外，还要求品种具有“耐贮
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运”和基地规模化生产所需要的特殊优良性状。因此，近年来 形成了北方秋季北菜南运的大白菜生产基地和高海拔地区 夏季大白菜生产基地等，需要易包装、耐贮运的专用大白菜 品种。选育和推广高水平商品菜生产基地专用品种可大大促 进我国大白菜产业进一步向规模化、专业化方向发展。
加强大白菜育种新技术与材料的创新研究，可为快速、 高效选育出具有市场竞争力的换代新品种提供技术支撑，选 育生产上急需的春播晚抽薹类型、秋播出口类型、商品菜基 地专用的抗干烧心、耐贮运品种及娃娃菜、小型大白菜、苗 用大白菜品种等，以满足当前大白菜产业发展和多样化消费 的需要。
三、品种对比试验 为了进一步了解当前白菜品种现状，中国蔬菜协会在济 南开展叶菜品种测评展示，旨在筛选适时适地的高产优质大 白菜品种，为白菜生产提供参考。 （一）材料和方法 1.试验品种 供试白菜品种及其来源具体见表 1，选取当地常规栽培 品种北京新 3 号作为对照品种。 2.试验方法 试验在济南现代农业示范园进行，土质粘壤土，肥力中
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等。8 月 23 日直播，采取点播的方式，每穴 10 粒种子左右，
由于播种后预报有阵雨，又加入些许萝卜种子以利于拱土，
行株距根据品种熟性不同而有所不同，早熟品种 60×40cm，
晚熟品种 60×50cm。试验采用随机区组排列，2 次重复，每 处理 1 畦，畦宽 1.5 m，长 17 m，每畦 2 行，每小区 25.5 m2 ， 共计 94 个处理，占地 2397 m2 。田间管理采用常规方法。
白菜生长期调查品种农艺性状，病虫害发生情况，利用分子
标记进行品种差异性分析。济南市农业局与济南现代农业示
范园专业技术人员负责田间管理。
（二）结果分析
1.不同白菜品种农艺性状比较
一共征集了 46 个大白菜品种，其中 21 个为晚熟品种，
其中有 2 个为极晚熟品种，生长期 120 天左右；25 个为早熟
品种，个别品种熟期较早，只有 50 天左右，应属于娃娃菜
类型。大部分品种都是合抱类型，只有 11 个品种为叠抱、
半叠抱、翻心类型。绝大数品种为黄心，只有 2 个品种为桔
红心。
公司
华盛农业 华盛农业 华盛农业 春奥种苗 春奥种苗
表 1 品种性状统计表
品种名称
品种 行间距 熟性
编号 （cm）
锦宝 2 号 锦宝 3 号 5542 秋田 秋香
050101 50 050102 50 050103 50 090101 40 090102 40
早熟 早熟 早熟 早熟 早熟
6
球型
半叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱
内部 颜色
黄心 黄心 黄心 黄心 黄心
春奥种苗 金帆
090103 50
春奥种苗 CR 开拓 16 号 090104 40
捷利亚
CR 迷你黄 110101 40
捷利亚
三口美
110102 40
捷利亚
三口福
110103 40
捷利亚
CR 金胜
110104 40
华耐农业 冬雅 85
120101 50
华耐农业 冬雅 86
120102 50
华耐农业 萌黄 321
120103 40
华耐农业 萌黄 325
120104 40
华耐农业 华耐 B1102 120105 40
华耐农业 羞月 155
120106 50
华耐农业 羞月 156
120107 50
安峰种苗 艳秋
150101 50
安峰种苗 锦秋
150102 50
安峰种苗 CR 金达
150103 50
安峰种苗 CR 春辉
150104 50
种都种业 白菜 1701 170101 50
种都种业 白菜 1702 170102 50
种都种业 白菜 1703 170103 50
种都种业 白菜 1704 170104 50
中蔬种业 中白 61
190105 40
中蔬种业 绿笋 70
190106 50
中蔬种业 吉红 308
190107 50
中蔬种业 1540050
190108 50
科润
珍绿 60
200101 40
科润
珍绿 6 号 200102 50
科润
津桔 65
200103 40
科润
津秀 2 号 200104 50
山东农科院 16-M2
210101 50
山东农科院 17-M1
210102 50
山东农科院 17-M2
210103 50
山东农科院 17-F4
210104 40
大一种苗 DB53
220101 50
大一种苗 DB56
220102 50
大一种苗 BT7005
220103 50
大一种苗 小黄蜂
220104 40
德高
青华 76
230101 50
德高
德高 157
230103 50
德高
德高 CR117 230104 40
德高
德高 18 号 230105 50
7
早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 极晚熟 极晚熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟
合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 叠抱 叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 翻心 合抱 叠抱 叠抱 叠抱 合抱 合抱 叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 翻心 翻心 合抱 叠抱
黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 桔红 黄心 黄心 黄心 桔红 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心
2.不同白菜品种主要病害发生情况 由于实验地块第一年种白菜，而且防控得力，病虫害发 生很轻，基本未发现霜霉病、病毒病、软腐病病株，仅有部 分品种因为受涝或者药害导致死棵或者长势不旺，因而误差 可以忽略不计，这也从某种程度说明我国白菜育种在抗病性 方面取得了很大进步， 四、品种差异性分析 （一）样品准备 实验室用 CTAB 法提取大白菜幼嫩叶片组织，合格 DNA 样品送给公司建库测序。 （二）测序与聚类分析 1.材料重测序 样品基因组 DNA 检测合格后，用机械打断的方法（超声 波）将 DNA 片段化，然后对片段化的 DNA 进行片段纯化、末 端修复、3′端加 A、连接测序接头，再用琼脂糖凝胶电泳进 行片段大小选择，进行 PCR 扩增形成测序文库，建好的文库 先进行文库质检，质检合格的文库用 Xten 进行测序。 2.低质量数据过滤 数据过滤的主要步骤如下：(1) 去除带接头（adapter） 的 reads;(2) 过滤 N 含量超过 10%的 reads;(3) 去除质量值 低于 10 的碱基超过 50%的 reads。具体统计信息见文后附件：
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46 份白菜重测序数据量大小统计。 3.全基因组 SNP 位点检测 过滤掉低质量的重测序 reads 后，用 BWA 将 46 份白菜
的重测序 reads 比对到白菜 V1.5 版本参考基因组（http:// brassicadb.org/brad/datasets/pub/Genomes/Brassica_r apa/V1.0/V1.5/Brapa_sequence_v1.5.fa.gz）上，利用 19 9 份白菜的变异库信息(F, R et al. 2016)，获得了这些 46 份材料 SNP 位点信息。
4.根据每个样本的全基因组 SNP 位点信息构建进化树 对最后的样本群体的 SNP 位点进行过滤（缺失率小于 40%），提取过滤后的位点分型结果（缺失用 N 表示）进行比 对，最后使用 phylip-3.69 获得白菜群体的进化树。 说明： Normal 和 Unrooted 是两种聚类树的展示方式， 使用的为相同的文件。
白菜品种测评展示报告（2017）
白菜属十字花科芸薹属，叶用蔬菜，原产于中国，又名 结球白菜、包心白菜、胶菜等，是我国种植面积最大的蔬菜 作物之一，生态类型多样，分布广，产量高，耐贮运，供应 期长，营养全面，食用方法多样，且种植简易、省工、成本 低，其丰欠关系到蔬菜的市场价格，直接影响市场供应，在 我国菜篮子中居不可替代的重要地位。
一、白菜产业发展现状 （一）栽培面积大，分布区域广 据农业部 2012 年统计，全国大白菜播种面积为 255.8 万 hm2，占蔬菜总播种面积的 13%，栽培面积和产量为各种蔬 菜作物之首，大白菜生产在蔬菜业中占有主导地位。 大白菜在全国普遍栽培，其中山东、河北、河南等省种 植面积较大，西藏、青海种植面积较小。由于历史、生态、 生产和消费习惯差异的原因，我国山东、河北、河南等北方 地区是大白菜的主产区，广东、云南等南方省份由于具备多 茬排开播种的优势，因此复种指数高，栽培面积也很大。另 外，长江以南地区近年来面积增长较快，可能是作为苗菜食 用增多的原因所致。 （二）实现了周年栽培、周年供应 由于市场的需求、品种的进步、栽培技术的不断完善和
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提高，目前我国大白菜栽培季节由过去主要是秋季一季栽 培，发展为春、夏、秋多季栽培，加之南菜北运、北菜南运 对市场的调节我国大白菜已基本达到了周年供应的要求。并 且随着产业的发展，逐渐在全国形成了大白菜新的优势产业 区，如黑龙江、吉林的加工大白菜产区，河北坝上地区、鄂 西山区、秦岭山区、甘肃的春夏季大白菜产区，云南、贵州 的越冬大白菜产区等，这些优势产区的形成，极大地促进了 大白菜产业的发展。
（三）栽培模式和消费模式不断发生变化 近些年来，大白菜的栽培和消费模式发生了重大变化。 由过去种植大株品种、以大型白菜球消费为主，发展为大球、 苗用大白菜（快菜）、娃娃菜和小型大白菜等多种栽培和消 费模式并存。 苗用菜、娃娃菜和小型大白菜由于具有品质好、生长周 期短、生产效益高、适合目前我国家庭人口少的消费需求等 优势，很受生产和消费者的青睐，市场前景看好。 苗用大白菜是以 30-35 天生长左右的大白菜苗作为上市 产品。由于其不耐长途运输，一般在城市近郊进行生产，就 近供应市场。苗用大白菜茬口安排灵活，北方秋冬在保护地、 夏秋在露地生产。 娃娃菜是利用早熟、小型化的大白菜品种通过高度密植
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的栽培形式生产的。娃娃菜因为个体小，一般单球重 150-200g，便于包装，适合目前我国三口之家消费的需要， 口感品质好，愈来愈受到城市消费者的欢迎，已成为全国各 大超市和农贸市场的畅销蔬菜产品。目前，我国娃娃菜的主 产区在云南、甘肃、河北张家口坝上地区等，近年来栽培区 域有继续扩大之势。北京市郊区春季在日光温室、大棚，秋 季在露地栽培的面积不断扩大。但娃娃菜是通过把高密度种 植获得的小型大白菜进行加工，把外叶和球外部的多层能食 用的叶片去掉而成，加工过程造成的浪费较大。
小型大白菜是应该提倡和大力发展的栽培和消费模式， 该类型就是利用娃娃菜的种植品种和种植模式，生产商品球 重 500-1000g 的小型白菜球作为商品上市，这样即可避免加 工娃娃菜过程中的浪费，也可满足目前家庭对小型大白菜消 费的需求。据了解，日本现在小型大白菜的消费需求也不断 增长，但娃娃菜的消费并不多，日本的做法是值得我们思考 和借鉴的。
二、大白菜品种需求分析 （一）大白菜品种主要类型 大白菜起源于我国，栽培历史悠久，品种类型丰富。大 白菜按栽培季节可分为春白菜、夏白菜、早秋白菜贩白菜和 秋白菜按熟性可分为极早熟、早熟、中熟和晚熟按球形分为
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近球形、头球形锥形、炮弹形和直筒形按抱合类型又分为叠 抱、合抱、拧抱等。
（二）品种的需求“专用化”和“多样化” 蔬菜出口是许多国家农业创汇的重要渠道，荷兰、西班 牙、意大利、美国等均是蔬菜出口的重要国家。我国蔬菜出 口逐年稳步增长，发展势头良好，但与世界蔬菜贸易水平尚 有很大差距。我国蔬菜总产量占世界蔬菜总产量的 40%左 右，而蔬菜出口量只占国内蔬菜总量的 0.7%，远远低于全球 蔬菜的国际贸易量占世界蔬菜产量 6%的平均水平，有很大 的发展空间。造成我国蔬菜出口与发达国家差距较大的因素 有很多，除了产品农药残留超标、栽培方式落后等诸多因素 之外，缺乏优质、专用的品种也是重要原因之一。蔬菜出口 形式主要有新鲜蔬菜和加工蔬菜两大类，大白菜同样有新鲜 蔬菜和加工蔬菜（主要是朝鲜辣菜）出口两大类型，不同出 口目的和出口地区所需要的品种类型有所不同，因此需要选 育满足出口目的的专用品种。 随着信息和运输产业的发展，我国蔬菜专业化反季节蔬 菜生产基地在各地相继建立，生产、收购、调运、贩卖或出 口一条龙的新型产业正在悄然兴起，以全国调运为主的生产 基地对品种提出了“耐贮运”的新要求，推广品种除要求高产、 抗病、优质、商品性好等优良性状外，还要求品种具有“耐贮
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运”和基地规模化生产所需要的特殊优良性状。因此，近年来 形成了北方秋季北菜南运的大白菜生产基地和高海拔地区 夏季大白菜生产基地等，需要易包装、耐贮运的专用大白菜 品种。选育和推广高水平商品菜生产基地专用品种可大大促 进我国大白菜产业进一步向规模化、专业化方向发展。
加强大白菜育种新技术与材料的创新研究，可为快速、 高效选育出具有市场竞争力的换代新品种提供技术支撑，选 育生产上急需的春播晚抽薹类型、秋播出口类型、商品菜基 地专用的抗干烧心、耐贮运品种及娃娃菜、小型大白菜、苗 用大白菜品种等，以满足当前大白菜产业发展和多样化消费 的需要。
三、品种对比试验 为了进一步了解当前白菜品种现状，中国蔬菜协会在济 南开展叶菜品种测评展示，旨在筛选适时适地的高产优质大 白菜品种，为白菜生产提供参考。 （一）材料和方法 1.试验品种 供试白菜品种及其来源具体见表 1，选取当地常规栽培 品种北京新 3 号作为对照品种。 2.试验方法 试验在济南现代农业示范园进行，土质粘壤土，肥力中
5
等。8 月 23 日直播，采取点播的方式，每穴 10 粒种子左右，
由于播种后预报有阵雨，又加入些许萝卜种子以利于拱土，
行株距根据品种熟性不同而有所不同，早熟品种 60×40cm，
晚熟品种 60×50cm。试验采用随机区组排列，2 次重复，每 处理 1 畦，畦宽 1.5 m，长 17 m，每畦 2 行，每小区 25.5 m2 ， 共计 94 个处理，占地 2397 m2 。田间管理采用常规方法。
白菜生长期调查品种农艺性状，病虫害发生情况，利用分子
标记进行品种差异性分析。济南市农业局与济南现代农业示
范园专业技术人员负责田间管理。
（二）结果分析
1.不同白菜品种农艺性状比较
一共征集了 46 个大白菜品种，其中 21 个为晚熟品种，
其中有 2 个为极晚熟品种，生长期 120 天左右；25 个为早熟
品种，个别品种熟期较早，只有 50 天左右，应属于娃娃菜
类型。大部分品种都是合抱类型，只有 11 个品种为叠抱、
半叠抱、翻心类型。绝大数品种为黄心，只有 2 个品种为桔
红心。
公司
华盛农业 华盛农业 华盛农业 春奥种苗 春奥种苗
表 1 品种性状统计表
品种名称
品种 行间距 熟性
编号 （cm）
锦宝 2 号 锦宝 3 号 5542 秋田 秋香
050101 50 050102 50 050103 50 090101 40 090102 40
早熟 早熟 早熟 早熟 早熟
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球型
半叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱
内部 颜色
黄心 黄心 黄心 黄心 黄心
春奥种苗 金帆
090103 50
春奥种苗 CR 开拓 16 号 090104 40
捷利亚
CR 迷你黄 110101 40
捷利亚
三口美
110102 40
捷利亚
三口福
110103 40
捷利亚
CR 金胜
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华耐农业 冬雅 85
120101 50
华耐农业 冬雅 86
120102 50
华耐农业 萌黄 321
120103 40
华耐农业 萌黄 325
120104 40
华耐农业 华耐 B1102 120105 40
华耐农业 羞月 155
120106 50
华耐农业 羞月 156
120107 50
安峰种苗 艳秋
150101 50
安峰种苗 锦秋
150102 50
安峰种苗 CR 金达
150103 50
安峰种苗 CR 春辉
150104 50
种都种业 白菜 1701 170101 50
种都种业 白菜 1702 170102 50
种都种业 白菜 1703 170103 50
种都种业 白菜 1704 170104 50
中蔬种业 中白 61
190105 40
中蔬种业 绿笋 70
190106 50
中蔬种业 吉红 308
190107 50
中蔬种业 1540050
190108 50
科润
珍绿 60
200101 40
科润
珍绿 6 号 200102 50
科润
津桔 65
200103 40
科润
津秀 2 号 200104 50
山东农科院 16-M2
210101 50
山东农科院 17-M1
210102 50
山东农科院 17-M2
210103 50
山东农科院 17-F4
210104 40
大一种苗 DB53
220101 50
大一种苗 DB56
220102 50
大一种苗 BT7005
220103 50
大一种苗 小黄蜂
220104 40
德高
青华 76
230101 50
德高
德高 157
230103 50
德高
德高 CR117 230104 40
德高
德高 18 号 230105 50
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早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 极晚熟 极晚熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟 早熟 晚熟 晚熟 晚熟 晚熟 早熟 早熟 早熟 早熟 早熟 晚熟 晚熟 早熟 晚熟
合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 叠抱 叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 翻心 合抱 叠抱 叠抱 叠抱 合抱 合抱 叠抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 合抱 翻心 翻心 合抱 叠抱
黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 桔红 黄心 黄心 黄心 桔红 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心 黄心
2.不同白菜品种主要病害发生情况 由于实验地块第一年种白菜，而且防控得力，病虫害发 生很轻，基本未发现霜霉病、病毒病、软腐病病株，仅有部 分品种因为受涝或者药害导致死棵或者长势不旺，因而误差 可以忽略不计，这也从某种程度说明我国白菜育种在抗病性 方面取得了很大进步， 四、品种差异性分析 （一）样品准备 实验室用 CTAB 法提取大白菜幼嫩叶片组织，合格 DNA 样品送给公司建库测序。 （二）测序与聚类分析 1.材料重测序 样品基因组 DNA 检测合格后，用机械打断的方法（超声 波）将 DNA 片段化，然后对片段化的 DNA 进行片段纯化、末 端修复、3′端加 A、连接测序接头，再用琼脂糖凝胶电泳进 行片段大小选择，进行 PCR 扩增形成测序文库，建好的文库 先进行文库质检，质检合格的文库用 Xten 进行测序。 2.低质量数据过滤 数据过滤的主要步骤如下：(1) 去除带接头（adapter） 的 reads;(2) 过滤 N 含量超过 10%的 reads;(3) 去除质量值 低于 10 的碱基超过 50%的 reads。具体统计信息见文后附件：
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46 份白菜重测序数据量大小统计。 3.全基因组 SNP 位点检测 过滤掉低质量的重测序 reads 后，用 BWA 将 46 份白菜
的重测序 reads 比对到白菜 V1.5 版本参考基因组（http:// brassicadb.org/brad/datasets/pub/Genomes/Brassica_r apa/V1.0/V1.5/Brapa_sequence_v1.5.fa.gz）上，利用 19 9 份白菜的变异库信息(F, R et al. 2016)，获得了这些 46 份材料 SNP 位点信息。
4.根据每个样本的全基因组 SNP 位点信息构建进化树 对最后的样本群体的 SNP 位点进行过滤（缺失率小于 40%），提取过滤后的位点分型结果（缺失用 N 表示）进行比 对，最后使用 phylip-3.69 获得白菜群体的进化树。 说明： Normal 和 Unrooted 是两种聚类树的展示方式， 使用的为相同的文件。