pubmed数据库操作

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PubMed生物医学数据库检索方法与技巧

PubMed生物医学数据库检索方法与技巧





MH - Adrenergic beta-1 Receptor Antagonists/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Biological Availability MH - *Bisoprolol/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Comorbidity MH - *Coronary Disease/complications/drug therapy/physiopathology MH - *Drugs, Generic/economics/pharmacokinetics MH - *Heart Failure/complications/drug therapy/physiopathology MH - Humans MH - *Hypertension/complications/drug therapy/physiopathology MH - Perioperative Care/methods MH - Therapeutic Equivalency MH - Treatment Outcome

1997年6月开始向全球开放

特色:具有收录范围广、内容全、检索途径 多、检索体系完备等特点,部分文献还可在 网上直接免费获得全文。
2. PubMed数据来源



MEDLINE: [pubmed-indexed for medline] In Process Citations:每天收录,尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process] Publisher-Supplied Citations:由出 版商提供的电子文献,每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。

它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。

二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。

基本检索的结果会按照相关性排序。

2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。

高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。

3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。

例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。

三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。

检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。

四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。

可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。

2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。

例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。

3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。

五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。

Pubmed-数据库文献推送-----My-NCBI定制方法

Pubmed-数据库文献推送-----My-NCBI定制方法
准备注册信息:
用户名、密码、邮箱 (username、password、email)
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱtep1:
2.点击进入My NCBI
Step1:
3.点击注册
Step1:
4.注册信息:
1)用户名 2)密码:至少8位字母+数字 3)Email:用于推送符合条件的文献
Step1:
5.点击注册成功
注册成功
Step2:
1.点击进入定制过程
Step2:
4.点击保存
Step2:
2.输入检索式
Step2:
3.点击开始检索
Step2:
5.命名、保存
已定制完成的 信息内容
Step3:
2. 保存
Step3:
1.选择自动推送 频率、时间、 格式、数量
Step3:
3.设置成功,回到 检索界面后退出
Step4:
图书馆/信息中心
2014-12-25
1、 My NCBI 是PUBMED数据库中的一项自助式
信息推送服务; 2、用户需要注册; 3、用户自行定制检索式,My NCBI自动文献检索
和更新推送; 4、用户可定制多个课题;
确定课题内容: 如:糖尿病神经损伤的光疗法
确定检索式:
phototherapy and diabetic neuropathy
进入注册邮箱 激活链接
太复杂了! 找我们吧:
我们替您完成:
第1-3步
您只需做:
第4步(进入自己的邮箱---激活链接)
2019SUCCESS
POWERPOINT
2019/6/11
2019SUCCESS
THANK YOU
2019/6/11

pubmed的使用

pubmed的使用

第3章 PubMed检索PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库,是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)提供的,其网址为:/PubMed/。

该系统于1997年开始使用,与以往的Medline 光盘数据库相比,它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点,并且由于NCBI与多家出版商达成协议,出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时,将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站,从而获取相应期刊的全文。

3.1 PubMed的收录范围PubMed的数据主要有4个部分,即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。

Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。

OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。

In Process Citations:是一个临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations库中删除。

In Process Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。

Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送,加入到In Process Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。

PubMed 数据库使用介绍

PubMed 数据库使用介绍

Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
Copyright ©2006
二、PubMed收录范围(1)
(一)MEDLINE
——全世界70多个国家和地区的4800余种生物医学期刊 ——自1966年至今数据1400万余条 ——内容每周更新一次,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、 卫生保健和前临床科学等。 ——标识[PubMed - indexed for MEDLINE] ——1950 年到1965年全世界生物医学期刊 ——目前数据大约200多万条 ——标识[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966] ——1996年8月开始增加该数据库,只提供基本的引文信息和文摘, ——每天更新,经过标引以后进入MEDLINE,并从PreMEDLINE 中删除这些记录。 ——标识[MEDLINE in process]
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University
Copyright ©2006
2、主题检索(MeSH Database)
Evidence Based Medicine Center,Lanzhou University

pubmed数据库及获取文献小技巧

pubmed数据库及获取文献小技巧

Pubmed数据库概况
收录5642种期刊,NLM于1988 年成立文献选择技术审查委员会 (Literature Selection Techni cal Review Committee, LSTRC) , 专门从事审核期刊、评价 其内容、增选新刊,同时剔除不符合要 求的已收录期刊。
Pubmed数据库概况
投药与剂量
按摩疗法
副作用
血液
激动剂
并发症
拮抗剂与抑制剂
诊断
分析
药物疗法
生物合成
生物合成
血液
血液
化学 。。。。。。
病因学 。。。。。。
青霉素/副作用
类风湿/病因学
加权检索
加权检索减少了检出量, 实际上是提高了检准率, 因为加权检索是将文献重点讨论的内容检索出来特 别是当文献检出量较多时, 加权检索是一种缩小检索 范围的有效方法。
Gastric Neoplasms Gastric Cancer Stomach Cancer Stomach Neoplasms
Stomach Neoplasms
款目词
主题词
Mesh Database
high blood pressure
✓ 副主题词
✓ 副主题词
青霉素可组配的副主题词: 类风湿可组配的副主题词:
LASTAU(Last Author) 最后一个作者(通讯作者)
IP(Issue):
期号、部分号、增刊号
IS(ISSN):
国际标准刊号
LA(Language):
原文语种
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms):
主题词
MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词

pubmed使用方法

pubmed使用方法
内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学 等专业。
MEDLINE的数据均进行过主题词标引,其可以使检索结果更加 准确和全面。 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
简介
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它 每天都在不断地接受新数据,并进行加工(主 题标引等),加工完成后每周向Medline数据库 进行添加。
PubMed检索2000年以来有关65岁以上老人阿尔 茨海默病(Alzheimer Disease)死亡率(mortality) 的多元分析 (meta analysis)文献
65 meta analysis 2000 Alzheimer Disease mortality
检索结果处理
检索结果显示、保存 检索结果的过滤 全文获取 My ncbi个性化服务
检索结果的处理
在文献管理软件中对结果进行分析、标准化处理等
过滤器(filter)的使用演示
全文的获取
全文的链接:提供电子全文的链接 免费的全文链接: Open Access、 PMC 无电子全文的,提供馆藏链接
Entrez平台 (/Entrez/)
Entrez资源整合系统可 检索NCBI提供的30余 个数据库,且系统内数 据库间广泛多项联系, 这种联系可通过检索结 果中Link连接实现。
Entrez平台
Entrez所包含的数据库类型多样,基因序列、结构、文献、基 因组等有机结合。
sensitive search,查全率较高)与特异性(narrow,specific search,
查准率较高)
Finding Systematic Reviews
提供systematic reviews、meta analysis、reviews of clinical trials、

pubmed数据库使用方法

pubmed数据库使用方法

pubmed数据库的使用方法本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。

在pubmed中检索到该篇文章后,网址是 /pubmed/23389453在页面左侧稍微靠上的地方,显示有该文章所属的期刊名字,如下图所示:上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字(是缩写),鼠标移动到该缩写的期刊名字上后,会弹出提示框显示该期刊的全名。

棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。

双击棕色横线标注处的链接,将可以查看该期刊的更多详细信息。

页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接,如下图所示:在上图的棕色横线标注处,有时可以看到一个矩形的图标,那就是该篇文献的全文下载链接。

点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面,例如该篇文献的网络下载页面如下图所示:上图红色链接标注处出现了一个登陆框,要求进行登陆,这表明你没有下载该篇文献的权限。

上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时,点击下载文献全文的位置。

没有该篇文献全文下载权限的话,是无法下载到此文献的,如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面,则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限,如下图所示:上图是通过seek68提供的pubmed入口下载文献有该篇文献下载权限时出现的页面,大家可以比较与上一图的不同之处,即没有出现登陆框,并且绿色横线标注处也有所不同,提示您点击绿色横线标注处的链接即可以下载到此文章。

不过pubmed并不是对所有文章都给出全文下载链接,此时就需要根据pubmed所揭示的该文章被收录于什么期刊或者什么数据库等信息,来到相应的期刊或数据库网址中下载文章。

Pubmed数据库检索与利用

Pubmed数据库检索与利用
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
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数据库检索与利用
从图书馆网站下载NoteExpress
66
数据库检索与利用
检索结果保存为Medline格式文件
67
数据库检索与利用
从NoteExpress导入题录及在文章中引用
数据库检索与利用
输入检索词
作者姓名[字段标识] Woods[au]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
刊名[字段标识] Science[ta]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
数据库检索与利用
检索结果
数据库检索与利用
题录检索
数据库检索与利用
数据库检索与利用
输入检索信息
点击“Search”
例:检索《病毒杂志》(archives of virology)2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》(genetic stability and linkage analysis)这篇文献
68
数据库检索与利用
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
69
数据库检索与利用
结果存为XML文件
70
数据库检索与利用
将XML文件数据d检索PubMed数据库

PubMed中文使用手册

PubMed中文使用手册

PubMed中文使用手册(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。

PubMed是NCBI Entrez数个数据库查询系统下中的一个。

PubMed是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。

PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。

PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。

(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。

如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

Old PubMed(使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法,后面将会有详细介绍。

Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。

Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。

Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤-回复Pubmed检索步骤:从主题到有效结果在进行学术研究时,一个重要的步骤是通过PubMed进行文献检索。

PubMed是一个免费的、由美国国家医学图书馆维护的生物医学文献数据库,在该数据库中,你可以搜索并访问数百万篇医学、生物医学和健康科学方面的期刊文章。

本文将详细介绍如何使用PubMed进行检索,以及一些技巧和注意事项,以确保你找到的结果是有效且有价值的。

第一步:明确主题和目的在开始之前,我们应当明确自己的研究主题和目的。

对于这个示例,我们将以“运动对健康的影响”作为主题进行检索。

这个主题非常广泛,我们可能需要进一步缩小范围或明确研究的特定方面。

第二步:使用关键词进行初始化搜索关键词是你最常用的工具,以确保找到的文章与你的研究主题相关。

将你的关键词输入到PubMed的搜索栏中,点击搜索按钮,将会得到一系列与关键词相关的文章列表。

在这个例子中,我们可以输入“exercise and health”作为初始搜索关键词。

注意,关键词应当简明扼要,并尽可能涵盖你研究主题的不同方面。

第三步:筛选和缩小范围初始搜索结果往往会产生大量的文章,但并不是每篇文章都与你的主题有关。

这时,你需要筛选和缩小范围,以找到最相关的文章。

你可以使用多种方法来缩小搜索结果的范围,其中一种常用的方法是使用筛选器。

筛选器可以根据文章的出版日期、文章类型、作者、研究范围等标准进行筛选。

你可以根据自己的需要,使用这些筛选器来优化搜索结果。

此外,你还可以添加其他关键词、使用逻辑操作符(如“AND”、“OR”、“NOT”)来进一步缩小范围,甚至可以利用高级搜索功能来更精确地找到相关文章。

在这个例子中,我们可以使用筛选器将文章的出版日期限定在过去5年内,将文章类型限定为研究论文,以缩小搜索结果的范围。

第四步:评估和筛选文章在筛选和缩小搜索结果范围后,我们需要对找到的文章进行评估,以确定哪些文章是与我们的研究主题相关且有效的。

PubMed数据库

PubMed数据库

(2)选择检索途径,选择主题途径或自由词途径。
#1 Transforming Growth Factor bet
#2 Receptors,Transforming Growth Factor beta
#3 Colorectal Neoplasms
#4 Signal Transduction (3)综合检索式 (#1 OR #2)AND #3
图30 Pubmed数据库FREE fulltext PDF格式界面(9)
图31 Pubmed数据库检索史逻辑组配界面(1)
图32 Pubmed数据库检索结果显示界面(2)
图33 Pubmed数据库检索史逻辑组配界面(3)
图34 PubmBiblioteka d数据库检索结果显示界面(4)图35 Pubmed数据库Limits检索界面(1)
PubMed数据库
一、概述
PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)的下属 的美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建 立 的 生 物 医 学 文 献 检 索 系 统 , 于 1997 年 5 月 在 Internet 上 向 用 户 提 供 的 免 费 检 索 服 务 , 网 址 是 /pubmed 。 该系统具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索 体系完备等特点,并与多家生物医学期刊出版商联合, 通过链接可获取全文或部分全文。PubMed的主界 面见图1。
文链接
五、PubMed数据库检索实例分析
例1.检索有关“转化生长因子β信号传导抵抗在结直肠 癌的作用”这一课题研究方面的国外文献。
检索要求: (1)查找近3年的文献,语种为英文。 (2)期刊检索:从检索结果中选中的期刊,进一步了解

pubmed的主要检索规则

pubmed的主要检索规则

pubmed的主要检索规则
PubMed是一个免费的生物医学文献数据库,主要包含了生物
医学、生命科学和相关领域的学术文章。

以下是PubMed的主
要检索规则:
1. 使用关键词检索:用户可以在PubMed的搜索框中输入与所
需信息相关的关键词,例如特定疾病、研究领域、药物名称等。

可以使用布尔运算符(AND、OR、NOT)来组合关键词,以
便更精确地进行检索。

2. 使用限制条件:用户可以使用限制条件来缩小检索结果的范围。

例如,可以通过选择特定时间范围、特定语言、特定研究类型(如临床试验、回顾性研究等)来限制检索结果。

3. 使用注册号检索:用户可以使用PubMed的搜索框来搜索特
定文献的注册号,如PubMed唯一的标识号(PMID)或国际
标准序列号(ISBN)等。

4. 使用高级搜索:PubMed还提供了高级搜索选项,用户可以
使用更多的搜索条件和筛选器来进行更精确的检索。

例如,用户可以在高级搜索中指定作者、期刊、出版日期等限制条件。

5. 使用Mesh词检索:PubMed还使用了医学主题词(Medical Subject Headings,简称Mesh)的术语系统来标注和分类文章。

用户可以使用Mesh词来更精确地检索文章并获得相关的研究
结果。

需要注意的是,PubMed的检索规则可能会根据平台的更新而有所变化。

因此,用户在使用PubMed检索时应根据具体的要求和搜索介面的提示进行操作。

PubMed数据库

PubMed数据库

PubMed数据库一.检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。

要求写出:①第一篇文章的原文出处,②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。

操作步骤:1.在地址栏中输入/pubmed,进入PubMed2.在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o,点击Go3.点击题录中作者姓名如: Genbacev O,得到文摘,点击出处下方免费获取全文(free textarticle)红色按钮。

4.在原文最后找到Reference(参考文献),得到第一篇作者姓名。

二.用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。

要求:第一作者Rao M的工作单位及E-mail地址。

操作步骤:1.进入PubMed主页,点击主页左侧中MeSH Database,进入MeSH Database网页2.在检索栏中输入renal failure, 点击Go3.在主题词注释页中,点击kidney failure。

4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法),选择send to下的Search Boxwith AND。

5.在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M,点击PubMedSearch。

三.查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文,并写出其他合著者。

操作步骤:1. 进入PubMed主页,在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。

2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息,点击search 按钮。

基因序列获取与同源性对比一.用NCBI查找人类抗癌基因(human antioncogene)的核酸序列报告,要求:写出序列号和碱基数,并拷贝原序列(Origen)。

2024年pubmed数据库使用指南

2024年pubmed数据库使用指南

概述:
PubMed是一个生命科学领域的文献数据库,是生物医学文献检索的重要工具。

本文对PubMed数据库的使用做一个简要介绍,以帮助读者更好地利用这个数据库进行文献检索。

1. PubMed数据库的结构和特点:
PubMed数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发维护的。

它是一个免费的公共数据库,收录了生物医学和生命科学领域的大量学术文献,包括期刊文章、会议论文、学位论文等。

2.检索策略:
(1)关键词检索:根据文献的关键词进行检索。

关键词可以是疾病名、药物名、基因名等。

使用AND、OR、NOT等逻辑符号来组合关键词,以缩小或扩大范围。

(2)高级检索:在PubMed的高级界面中,可以通过使用多个字段、设置日期范围、对检索结果进行限定等方式,更精确地进行文献检索。

3.结果筛选和排序:
(1)限制结果:通过在界面的左侧面板中选择相关选项,可以限制结果的类型、语言、年份等。

(2)排序方式:结果默认按相关性排序,但也可以按出版日期、被引用次数等进行排序。

4.期刊和发表者信息:
5.数据库更新与同步:
(1)PubMed数据库每周更新,保持最新的文献信息。

(2)可以通过RSS订阅或设置自动更新来获取最新的文献信息。

6.其他功能和工具:。

PubMed生物医学数据库检索方法与技巧

PubMed生物医学数据库检索方法与技巧

输入:ma dl
Peking university
高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献
5.3 主题检索

点击MeSH Database打开主 题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性,利用主题词进行的研 究,对提高查全率、查准率会 有相当的帮助。
基本检索
高级检索 主题检索

基本检索举例:肝癌和酒精的关系

分析该检索课题,包含两个方面: 肝癌:liver cancer; 酒精:alcohol

两个主题之间的逻辑关系是AND,即

liver cancer AND alcohol
基本检索举例:肝癌和酒精的关系
输入:liver cancer AND alcohol



限制检索字段:如liver cancer[ti]
作者:Smith J 、
仅知道作者姓,则必须加上字段标识,如: Smith[au] 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索

如:Joshua Lederberg
5.1 基本检索

期刊刊名: ⑴可用期刊全称:GENE THERAPY[TA]; ⑵ 可 用 期 刊 简 称 : JAMA[TA] ; (The Journal of the American Medical Association) 复杂表达式:liver cancer AND aflatoxin 带有摘要文献的检索 :liver cancer AND hasabstract
“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果
高级检索
5.2 高级检索
5.2 高级检索
高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献

Pubmed教程

Pubmed教程

pubmed 教程--pubmed使用全攻略(1)第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

这是PubMed的核心部分。

大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。

在主界面的左侧框(如左图),有:• Journal Browser 期刊浏览• MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表• Single Citation Matcher(单引文匹配)输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

• Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

• Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4 个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

• Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)3) Related Resources• Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。

• Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。

Grateful Med也提供MEDLI NE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

• Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

• Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

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基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
截词检索: 可通过在词干后加“*”检索以 该词干开头的所有词的文献。
需要注意的是:截词检索将关闭PubMed的 自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩展检索功 能 。如:输入heart attack*,不会启动自动匹配 功能检索与之匹配的Mesh主题词“Myocardial Infarction”及其下位更专指的主题词的相关文献。
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能,可实现如下操作:
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
nature
Searching by a specific field
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能,可实现如下操作:
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名, PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。
可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识 [au] 关闭该功能,如:“Smith J”[au]
基本检索
以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名, PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。
高级检索
通过“Search Builder”检索框下面的 “Show Index”选项可查询在所有字段或某一特 定字段中的索引,可以从索引中选择一个或几个 词来完善检索策略。
chronic proctitis
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能,可实现如下操作:
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 词组检索 截词检索
布尔逻辑检索
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 词组检索 截词检索
布尔逻辑检索
基本检索
对于输入检索框中未加标识的检索词, PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容:
1.MeSH translation table 2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index
概况
收录从1948年至今80多个国家和 地区37种文字的5000多种生物医学期 刊上的文献2400多万条。每日更新 (周二到周六),每天增加2000- 4000条完整记录。PUBMED引文90% 为英文文献,79%有英文摘要。
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
Heart attack
自动匹配检索
"myocardial infarction"[MeSH Terms] OR ("myocardial"[All Fields] AND "infarction"[All "myocardial infarction"[MeSH Terms] OR Fields]) OR "myocardial infarction"[All ("myocardial"[All Fields] AND "infarction"[All Fields]) OR Fields] OR ("heart"[All Fields] Fields] OR AND "myocardial infarction"[All "attack"[All Fields]) "heart attack"[All ("heart"[All Fields] ANDOR "attack"[All Fields]) OR Fields] "heart attack"[All Fields]
1. 加双引号,如:“single cell”
2.加标段标识[tw]: single cell[tw]
3.使用短横线“-”将两词连接起来:single-cell
4.使用截词符*:single cell*
基本检索
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
1. 直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写 及ISSN,PubMed通过自动匹配自动在刊名 字段进行检索。 2. 使用PubMed资源的“Journals Database” 查询特定期刊上的文章。
基本检索
高级检索
作者检索:
通过Advanced Search页面中的“Search Builder ”下拉列表选择“Author”字段,在字段 后的检索框中输入作者姓名,姓名的输入具有自 动完成属性。
高级检索
期刊检索: 通过Advanced Search页面中的“Search Builder ”下拉列表选择“Journal”字段,在字 段后的检索框中输入刊名全称、Medline缩写及 ISSN
检索字段及标识符
AD(Address): 第一作者所属单位和地址 ALL(All Fields): 全部字段 AU(Author): 作者姓名 DP(Publication Date): 出版时间 EDAT(Entrez Date): 录入时间 1AU(First Author Name): 第一作者姓名 FAU(Full Author Name): 作者姓名全称(02年以后) LASTAU(Last Author) 最后一个作者(通讯作者) IP(Issue): 期号、部分号、增刊号 IS(ISSN): 国际标准刊号 LA(Language): 原文语种
基本检索
Mesh转换表 期刊名转换表 Keyword(s) 作者索引表 作者姓名转换表 经过转换后的 检索式
Pubmed系统 进行检索 Details分析
11
基本检索
1、Mesh转换表 由Mesh词、款目词、Mesh副主题词、 文献类型词、药理作用词、一体化医学语言系统词及 化学物质名称等组成。
可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识 [au] 关闭该功能,如:“Smith J”[au]。
基本检索
如果只输入作者的姓,则PubMed会 在所有字段中对其进行检索,如只想将其 作为作者检索,需加作者字段标识[au]。 2002年以后的论文,如果提供作者 全名,可使用作者全名进行检索。作者姓 名可正序或倒序。如:juila s wong或 wong julia s。为了区分姓名全称与首字 缩写,需加标全名字段标识[fau],如: peterson do[fau]
推荐使用刊名全称或缩写查找,因为 有些过早的文献没有ISSN。
science
Science[ta]
基本检索
1. 直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写 及ISSN,PubMed通过自动匹配自动在刊名 字段进行检索。 2. 使用PubMed资源的“Journals Database” 查询特定期刊上的文章。
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
高级检索
检索史按检索式运行的顺序列出各检索式,包括 检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条 数。 检索史最多保存100条检索式,检索史将在离开 PubMed或其他Entrez数据库8小时后消失。 单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检 索结果。 可通过检索策式的序号对检索策略进行组配,如: #2 AND #6, #3 AND (drug therapy OR diet therapy) 单击检索史窗口下方的Clear History按钮可将所 有检索式删除。
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms): 主题词 MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词 PG(Pagination): 页码(起页) PT(Publication Type): 出版类型 SB(Subset): 文献子集 SH(Mesh Subheadings): 副主题词 TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写 TI(Title): 文章题名 TIAB(Title/Abstract): 题名摘要 TW(Text Words): 文本词 VI(Volume): 卷号
PubMed数据库检索介绍
河北医科大学图书馆
于伟
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
概况
PubMed() 是由美国国立医学图书馆( National Library of Medicine,NLM) 的国家生 物技术信息中心(National Center for Biotech-nology Information , NCBI) 开 发的一个以网络为基础的医学文献检 索系统 , 是 NCBI 庞大的检索体系 Entrez 的一部分。
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