pubmed数据库操作

检索字段及标识符
AD(Address): 第一作者所属单位和地址 ALL(All Fields): 全部字段 AU(Author): 作者姓名 DP(Publication Date): 出版时间 EDAT(Entrez Date): 录入时间 1AU(First Author Name): 第一作者姓名 FAU(Full Author Name): 作者姓名全称(02年以后） LASTAU(Last Author) 最后一个作者（通讯作者） IP(Issue): 期号、部分号、增刊号 IS(ISSN): 国际标准刊号 LA(Language): 原文语种
1. 直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写 及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名 字段进行检索。 2. 使用PubMed资源的“Journals Database” 查询特定期刊上的文章。
基本检索
如果刊名是Mesh词（如：Gene Therapy、Science、Cell)，或刊名是单 个单词（Scanning)，如只想将其作为刊 名检索，需加刊名字段标识[ta]。
推荐使用刊名全称或缩写查找，因为 有些过早的文献没有ISSN。
science
Science[ta]
基本检索
1. 直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写 及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名 字段进行检索。 2. 使用PubMed资源的“Journals Database” 查询特定期刊上的文章。
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
截词检索： 可通过在词干后加“*”检索以 该词干开头的所有词的文献。
需要注意的是：截词检索将关闭PubMed的 自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩展检索功 能 。如：输入heart attack*，不会启动自动匹配 功能检索与之匹配的Mesh主题词“Myocardial Infarction”及其下位更专指的主题词的相关文献。
wk.baidu.com
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
nature
Searching by a specific field
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
基本检索
基本检索
截词功能最多可使用600个词形变化。超过 600个会显示如下图的提示信息。
基本检索
PubMed在检索时忽略一些常用的英语词汇， 下表为禁用词列表
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
对于输入PubMed的多词词组， PubMed会 查询词组索引，如果查到相应词组则将其作为一 个检索词来检索。如果未查到相应词组，则将其 拆分成单个词，分别进行检索并以逻辑和 （AND）进行组配，如：single cell相当于检索 single AND cell。可通过如下方式强制将其作 为一个词组进行检索：
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
基本检索
Mesh转换表 期刊名转换表 Keyword(s) 作者索引表 作者姓名转换表 经过转换后的 检索式
Pubmed系统 进行检索 Details分析
11
基本检索
1、Mesh转换表 由Mesh词、款目词、Mesh副主题词、 文献类型词、药理作用词、一体化医学语言系统词及 化学物质名称等组成。
概况
收录从1948年至今80多个国家和 地区37种文字的5000多种生物医学期 刊上的文献2400多万条。每日更新 （周二到周六），每天增加2000－ 4000条完整记录。PUBMED引文90% 为英文文献，79%有英文摘要。
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名， PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。
可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识 [au] 关闭该功能，如：“Smith J”[au]
基本检索
以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名， PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。
Heart attack
自动匹配检索
"myocardial infarction"[MeSH Terms] OR ("myocardial"[All Fields] AND "infarction"[All "myocardial infarction"[MeSH Terms] OR Fields]) OR "myocardial infarction"[All ("myocardial"[All Fields] AND "infarction"[All Fields]) OR Fields] OR ("heart"[All Fields] Fields] OR AND "myocardial infarction"[All "attack"[All Fields]) "heart attack"[All ("heart"[All Fields] ANDOR "attack"[All Fields]) OR Fields] "heart attack"[All Fields]
PubMed数据库检索介绍
河北医科大学图书馆
于伟
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
概况
PubMed（http://www.pubmed.gov) 是由美国国立医学图书馆（ National Library of Medicine，NLM) 的国家生 物技术信息中心（National Center for Biotech-nology Information ， NCBI) 开 发的一个以网络为基础的医学文献检 索系统 , 是 NCBI 庞大的检索体系 Entrez 的一部分。
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
基本检索
1. 直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写 及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名 字段进行检索。 2. 使用PubMed资源的“Journals Database” 查询特定期刊上的文章。
基本检索
2、期刊转换表 由Pubmed收录期刊的刊名全称、 MEDLINE格式刊名缩写和ISSN三种形式组成。
3、作者全名转换表 由2002年以来发表文章作者的姓名 全称组成。检索时，按自然顺序或姓前名后的形式输 入均可。 4、作者索引 Pubmed将姓全称，后边带名首字母缩写 的短语自动识别为作者姓名。 如果在上述转换表中找不到相同匹配的词， Pubmed会将短语拆开，按单个词重复以上顺序分别查 找，直到找到相匹配的词。
高级检索
作者检索：
通过Advanced Search页面中的“Search Builder ”下拉列表选择“Author”字段，在字段 后的检索框中输入作者姓名，姓名的输入具有自 动完成属性。
高级检索
期刊检索： 通过Advanced Search页面中的“Search Builder ”下拉列表选择“Journal”字段，在字 段后的检索框中输入刊名全称、Medline缩写及 ISSN
高级检索
通过高级检索页面的“ Search Builder ” 可以进行特定字段的限定检索。 首先在下拉列表中选择要检索的字段，然 后在检索框中输入检索词。 再选择“AND”、“OR”、“NOT”三种逻 辑关系之一，即可将输入的检索词在所选字段 中检索的策略以相应的逻辑关系加入到检索框 中。
高级检索
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms): 主题词 MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词 PG(Pagination): 页码（起页） PT(Publication Type): 出版类型 SB(Subset): 文献子集 SH(Mesh Subheadings): 副主题词 TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写 TI(Title): 文章题名 TIAB(Title/Abstract): 题名摘要 TW(Text Words): 文本词 VI(Volume): 卷号
1. 加双引号，如：“single cell”
2.加标段标识[tw]: single cell[tw]
3.使用短横线“-”将两词连接起来：single-cell
4.使用截词符*：single cell*
基本检索
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 截词检索 词组检索
布尔逻辑检索
概况 基本检索 高级检索 主题词途径检索 临床查询检索 单引文匹配检索 检索结果处理
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 词组检索 截词检索
布尔逻辑检索
基本检索
自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 词组检索 截词检索
布尔逻辑检索
基本检索
对于输入检索框中未加标识的检索词， PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容：
1.MeSH translation table 2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index
• Searching by a specific field • Browsing the index of terms • Combining searches using history • Displaying the search details
高级检索
检索史按检索式运行的顺序列出各检索式，包括 检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条 数。 检索史最多保存100条检索式，检索史将在离开 PubMed或其他Entrez数据库8小时后消失。 单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检 索结果。 可通过检索策式的序号对检索策略进行组配，如： #2 AND #6， #3 AND (drug therapy OR diet therapy) 单击检索史窗口下方的Clear History按钮可将所 有检索式删除。
高级检索
通过“Search Builder”检索框下面的 “Show Index”选项可查询在所有字段或某一特 定字段中的索引，可以从索引中选择一个或几个 词来完善检索策略。
chronic proctitis
高级检索
PUBMED的Advanced Search页面整合了 多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：
可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识 [au] 关闭该功能，如：“Smith J”[au]。
基本检索
如果只输入作者的姓，则PubMed会 在所有字段中对其进行检索，如只想将其 作为作者检索，需加作者字段标识[au]。 2002年以后的论文，如果提供作者 全名，可使用作者全名进行检索。作者姓 名可正序或倒序。如：juila s wong或 wong julia s。为了区分姓名全称与首字 缩写，需加标全名字段标识[fau]，如： peterson do[fau]