第三章 细胞分化的分子机制——转录后的调控

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UAG UAA UGA
2. mRNA寿命的不同对蛋白质合成的调控 —— 寿命的不同对蛋白质合成的调控
通过mRNA的选择性降解和 的选择性降解和mRNA稳定性不同调控蛋白质的合成 通过 的选择性降解和 稳定性不同调控蛋白质的合成 不同基因的mRNA的半衰期不同,主要受其3`UTR控制。短寿命 的半衰期不同,主要受其 控制。 不同基因的 的半衰期不同 控制 短寿命mRNA 通常含有一个或多个AU富集区 降解。 的3’UTR通常含有一个或多个 富集区,其作用是促进 通常含有一个或多个 富集区,其作用是促进Poly(A)降解。 降解
C-fos mRNA
5’UTR
coding sequence
3’UTR
成纤维细胞
AU富集区Байду номын сангаас富集区
肿瘤细胞
c-fos基因编码正常成纤维细胞分裂必需的一种蛋白质
3. 激素对特定 激素对特定mRNA稳定性的影响 稳定性的影响
如Prolactin(泌乳刺激素)仅提高牛的 (泌乳刺激素)仅提高牛的casein(酪蛋白)基 (酪蛋白) 因转录水平2倍 提高其mRNA寿命 倍,使mRNA更多次 寿命25倍 因转录水平 倍,提高其 寿命 更多次 的翻译。 的翻译。
rabbit 3’ 中含有3个 富集区 稳定,半衰期17h 富集区, β-珠蛋白RNA的3’UTR中含有 个C富集区,稳定,半衰期 珠蛋白 的 中含有 一种生长因子mRNA的半寿期不超过 的半寿期不超过30min 一种生长因子 的半寿期不超过
mRNA降解性能的差异可以影响细胞的功能 降解性能的差异可以影响细胞的功能
(二)、前体mRNA的加工对 早期发育的调控
海胆:
• 囊胚期与长腕幼虫期细胞nRNA相同; 囊胚期与长腕幼虫期细胞nRNA相同; nRNA相同 • 囊胚期处于转录激活状态的DNA序列与长腕幼虫期 囊胚期处于转录激活状态的DNA序列与长腕幼虫期 DNA 完全一致; 完全一致; • 随着发育进程由基因组DNA的转录所产生的细胞质 随着发育进程由基因组DNA的转录所产生的细胞质 DNA mRNA的复杂性逐渐减小 的复杂性逐渐减小; mRNA的复杂性逐渐减小; • 早期胚胎发育的调控机制:存在加工水平的差异 早期胚胎发育的调控机制:
二、RNA加工水平的调控
(一)、同一基因的初始转录物(nRNA) )、同一基因的初始转录物(nRNA) 同一基因的初始转录物 经选择性拼接可产生不同的成熟RNA 经选择性拼接可产生不同的成熟RNA
原肌球蛋白基因
α-原肌球蛋白基因
重链可变区(抗原结合区)在淋巴细胞形成过程中,发生基因重 排(DNA水平) 重链恒定区发生分子转换,该模式通过RNA加工完成
(二)、RNA 3’末端的决定
绝大多数真核生物nRNA在剪接之前,先进行3’末端断裂和多聚腺苷 酸化加工,这种加工由顺式和反式作用元件调控。 1、顺式作用元件 • AAUAAA序列:位于3’末端,对其下游10-30bp位点发生的裂解是必 需的; • GU或U富积序列:位于3’末端AAUAAA区域下游,调控mRNA 3’末端 裂解的效率。 2、反式作用元件 (人癌细胞) • 特异性核蛋白因子:可识别发生裂解和进行多聚腺苷酸化的顺式 因子; • poly(A)聚合酶:用于合成多聚腺苷酸尾; • 裂解因子I和II:mRNA前体的裂解酶; • 裂解刺激因子:可显著提高裂解反应的效率
(三)、mRNA向核外的运输
• 推测:RNA在核基质内完成转录和加工,然后将 mRNA运输到核膜孔,由此运出核外,但机制尚不 十分清楚。 • 然而,已知细胞分化中基因选择性表达调控的另 一种方式是细胞核以何种方式处理mRNA前体,通 过调控,有的mRNA运出核外,有的不能运出; • 已发现:一种特殊的病毒蛋白对于mRNA运输是必 需的。
2. 秀丽隐杆线虫发育的翻译调控
—— mRNA 3’UTR调控配子的决定 调控配子的决定
3’ UTR对发育的时空调控作用: 调控配子的决定; 调控许多卵母细胞贮存mRNA的翻 译活动; 调控一些mRNA在卵母细胞中的定 位; 参与某些组织分化的维持
TRATRA-2是卵子发育所必需的一种 蛋白质,如果tra-2 mRNA翻译活 性被抑制,生殖细胞→精子;
二、早期发育 中母体效应因 子的影响
1、卵母细胞中合成并贮藏 大量的发育信息(mRNA和 蛋白质),这些信息在排 卵以前至早期发育过程中 逐渐被利用; 2、每个卵母细胞中贮藏 20 000 – 50 000种不同的 mRNA,每种mRNA大约1 600个拷贝; 3、贮藏的信息在卵细胞中 梯度分布或者均匀分布
前体RNA IgM µ区
生殖细 胞的 DNA B淋巴细胞的DNA,发生重排
IgD δ区
nRNA
mRNA
相同基因在不同发育时期或不同组 织细胞中拼接不同,合成不同的蛋白质
降钙素/神经多肽CGRP mRNA前体
选择性RNA加工与性别决定
果蝇性别表型的决定事件,通过3 果蝇性别表型的决定事件,通过3个主要性别决定基 RNA的不同拼接模式 的不同拼接模式, 因RNA的不同拼接模式,引起差异基因表达
RNA加工前三个胚层中的 加工前三个胚层中的 RNA量无差异。 量无差异 加工后的RNA主要存在于 主要存在于 加工后的 外胚层中。 外胚层中。
nRNA
核酸run-on(在膜上固定 在膜上固定intron序列与放射性 核酸 在膜上固定 序列与放射性 RNA探针杂交 实验表明:Spec1基因在原肠胚 探针杂交)实验表明 探针杂交 实验表明: 基因在原肠胚 的内、 外胚层细胞核中都表达, 的内、中、外胚层细胞核中都表达,但成熟的 Spec1 mRNA只存在于外胚层中。 只存在于外胚层中。 只存在于外胚层中
第三章 细胞分化的分子机制 —— 转录后的调控
第一节 RNA加工水平的调控 RNA加工水平的调控
大多数编码细胞特异性蛋白质的基因选择性表达的调控主要发 生在转录水平,但转录后调控对决定蛋白质结构和功能重要 真核生物: DNA → nRNA(核)→ mRNA (质)
一、mRNA前体和mRNA
(一)、异质性核RNA(hnRNA) )、异质性核RNA(hnRNA) 异质性核RNA 由于转录模板不同, 由于转录模板不同,nRNA的长度和性质差别较大 的长度和性质差别较大 分子量: nRNA﹥mRNA; 半寿期: nRNA﹤ mRNA; 复杂性: hnRNA﹥mRNA,核苷酸序列多样性
Poly(A)对翻译的调控: 对翻译的调控: 对翻译的调控 在小鼠的未成熟卵母 细胞质中可以翻译的 mRNA具有较长的 具有较长的poly(A), 具有较长的 减数成熟分裂后poly(A)降 减数成熟分裂后 降 翻译终止。 解,翻译终止。 在减数成熟分裂前不 表达的mRNA的poly(A)较 表达的 的 较 但其3`UTR具 短(15-90A), 但其 具 有胞质多聚腺苷酸化信号 序列(CPEs)(UUUUAU in 序列 mice and frogs)。减数成 。 熟分裂后这些 mRNA迅速 迅速 加上一个长的polyA,开始 加上一个长的 开始 翻译。 翻译。
4. RNA编辑 编辑
RNA编辑是指在已有的RNA 分子上改变(缺失、插入 或置换)一个特定的碱基 以改变遗传信息,使翻译 生成的蛋白质氨基酸组成, 不同于基因序列中原有的 编码信息
血清脂质携带蛋白
翻译后水平上的调控 5、翻译后水平上的调控
一条长链被剪切并除去部分而激活, 胰岛素; 一条长链被剪切并除去部分而激活 胰岛素 除去某些保护/抑制性片段而激活, 除去某些保护 抑制性片段而激活,Dorsal; 抑制性片段而激活 特定的亚细胞定位,膜蛋白、核蛋白等 特定的亚细胞定位,膜蛋白、核蛋白等; 与其它蛋白质一起装配成为功能单位,血红蛋白; 与其它蛋白质一起装配成为功能单位,血红蛋白; 与某些离子结合而激活,钙调蛋白 与某些离子结合而激活,钙调蛋白; 通过蛋白质修饰(磷酸化、乙酰化)而激活,鱼精蛋白、 通过蛋白质修饰(磷酸化、乙酰化)而激活,鱼精蛋白、 晶体蛋白。 晶体蛋白。
FEM-3是精子发育所必需的一种蛋白质,如果 fem-3 mRNA翻译活性被抑制,生殖细胞→卵子; 在幼虫四龄时, fem-3 mRNA 3’UTR区结合翻译 抑制因子(TRA-2),
tra-2 mRNA的3’UTR区含有2个区
域,它们可能结合在幼虫精子发 生时合成的抑制蛋白;如果这两 个区域突变,精子不能形成
三、翻译和翻译后调控的机制
1、卵母细胞中翻译调控机制的假说 卵母细胞中翻译调控机制的假说
masking(掩蔽) mRNA与其它蛋白结合成 与其它蛋白结合成ribonucleoprotein mRNA masking(掩蔽): mRNA与其它蛋白结合成ribonucleoprotein complex,阻止与核糖体结合 卵成熟或受精后, 阻止与核糖体结合; (RNP) complex,阻止与核糖体结合;卵成熟或受精后,离子强度改变或 蛋白磷酸化等导致RNP不稳定/解体,翻译得以进行。 RNP不稳定 蛋白磷酸化等导致RNP不稳定/解体,翻译得以进行。 Cap( 甲基鸟苷酸)的调控:如某些种类( 其卵中的部分mRNA 5’ Cap(7-甲基鸟苷酸)的调控:如某些种类(蛾),其卵中的部分mRNA 5`-鸟苷酸在受精后才甲基化,然后开始翻译。 的5`-鸟苷酸在受精后才甲基化,然后开始翻译。 sequester(隐蔽) mRNA被阻隔于蛋白合成装置 被阻隔于蛋白合成装置。 mRNA sequester(隐蔽): 指mRNA被阻隔于蛋白合成装置。如海胆未受 精卵的组蛋白 mRNA定位于原核中 受精后原核破裂,mRNA才能进入胞质 定位于原核中, 精卵的组蛋白 mRNA定位于原核中,受精后原核破裂,mRNA才能进入胞质 开始翻译。 开始翻译。 Poly(A)对翻译的调控 卵母细胞减数分裂成熟前后, 对翻译的调控: polyA的长度 Poly(A)对翻译的调控:卵母细胞减数分裂成熟前后,mRNA polyA的长度 发生变化( UTR调控)。带长polyA的 发生变化(由3’UTR调控)。带长polyA的mRNA具翻译活性 UTR调控)。带长polyA mRNA具翻译活性 翻译效率的调控:如将海胆卵母细胞裂解液的pH从自然状态下的pH6.9 pH从自然状态下的pH6.9提 翻译效率的调控:如将海胆卵母细胞裂解液的pH从自然状态下的pH6.9提 高到pH7.4 受精后自然状态下的pH 蛋白质合成量急剧增加。 pH7.4( pH) 高到pH7.4(受精后自然状态下的pH),蛋白质合成量急剧增加。受精后 pH升高的作用可能包括去除mRNA的封闭蛋白和激活翻译起始因子。 升高的作用可能包括去除mRNA的封闭蛋白和激活翻译起始因子 pH升高的作用可能包括去除mRNA的封闭蛋白和激活翻译起始因子。
3. 血红蛋白翻译水平的调控 • 成体血红蛋白

2n中 2n中,4α和2β珠蛋白基因→4肽链2α/2β 珠蛋白基因→ 肽链2α/2β
α- mRNA:β- mRNA = 1.4:1 mRNA: 珠蛋白: α珠蛋白:β珠蛋白 = 1:1
• 平衡调节机制: 平衡调节机制:
两者竞争翻译起始因子 珠蛋白mRNA mRNA具有更强的与 β珠蛋白mRNA具有更强的与 翻译起始因子结合的能力
翻译和翻译后的调控 第二节 翻译和翻译后的调控
一、翻译水平的调控
1. 翻译过程(mRNA → 特异多肽链的合成) 翻译过程( )
3个阶段
AUG
氨基酰-tRNA与核糖体结合; 与核糖体结合; 氨基酰 与核糖体结合 aa离开 离开tRNA,aa之间肽键、 之间肽键、 离开 , 之间肽键 缩合;核糖体沿mRNA移动; 移动; 缩合;核糖体沿 移动
早期发育对RNA信息的选择——不同类型细胞 对nRNA的选择不同
Ect En/mes
核酸保护实验(放射性 核酸保护实验 放射性intron或 放射性 或 exon探针与总 探针与总RNA杂交后再 探针与总 杂交后再 RNase消化 表明:海胆钙结合 消化)表明 消化 表明: 蛋白基因CyIIIa在原肠胚的外 蛋白基因 在原肠胚的外 胚层中表达
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