氨基酸缩写简写及密码子及其氨基酸应用
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氨基酸
体内20 种氨基酸按理化性质可分为4 组:
①非极性、疏水性氨基酸:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙
氨酸和脯氨酸。
②极性、中性氨基酸:色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、
谷氨酰胺和苏氨酸。
③酸性的氨基酸:天冬氨酸和谷氨酸。
④碱性氨基酸:赖氨酸、精氨酸和组氨酸。
中文名称英文名称缩写符号分子量类型
丙氨酸Alanine Ala A 89.079 脂肪族类
精氨酸Arginine Arg R 174.188 碱性氨基酸类天冬酰胺Asparagine Asn N 132.104 酰胺类
天冬氨酸Aspartic acid Asp D 133.089 酸性氨基酸类半胱氨酸Cysteine Cys C 121.145 含硫类
谷氨酰胺Glutamine Gln Q 146.131 酰胺类
谷氨酸Glutamic acid Glu E 147.116 酸性氨基酸类甘氨酸Glycine Gly] G 75.052 脂肪族类
组氨酸Histidine His H 155.141 碱性氨基酸类异亮氨酸Isoleucine Ile I 131.16 脂肪族类
亮氨酸Leucine Leu L 131.16 脂肪族类
赖氨酸Lysine Lys K 146.17 碱性氨基酸类蛋氨酸Methionine Met M 149.199 含硫类
苯丙氨酸Phenylalanine Phe F 165.177 芳香族类
脯氨酸Proline Pro P 115.117 亚氨基酸
丝氨酸Serine Ser S 105.078 羟基类
苏氨酸Threonine Thr T 119.105 羟基类
色氨酸Tryptophan Trp W 204.213 芳香族类
酪氨酸Tyrosine Tyr Y 181.176 芳香族类
缬氨酸Valine Val V 117.133 脂肪族类
起始密码子、终止密码子及其密码子列表
起始密码子
mRNA:原核生物的起始密码子AUG翻译对应的是甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物的起始密码子AUG翻译
对应的是甲硫氨酸(Met)。少数细菌(属于原核生物)以GUG(缬氨酸)或UUG为起始密码。线粒体和叶绿
体以AUG、AUU、AUA为起始密码子。
DNA:相应的DNA上的起始密码子序列是ATG、ATT、ATA
终止密码子
mRNA:UAA、UAG、UGA
三个终止密码子UAA叫赭石(ochre)密码子(相应于赭石突变);UAG叫琥珀密码子(相应于琥珀突变);UGA叫蛋白石(opal)密码子(相应于蛋白石突变)。
线粒体和叶绿体的终止子有四个,是UAA,UAG,AGA,AGG
DNA:相应的DNA上的终止密码子序列是TGG、TGA、TAG;GAG、GAA
密码子列表
第一个核苷酸
第二个核苷酸第三个
核苷酸U C A G
U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸C 亮氨酸丝氨酸终止终止A 亮氨酸丝氨酸终止色氨酸G
C 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸U 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸C 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸A 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸G
A 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸U 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸C 异亮氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸A 蛋氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸G
G 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸U 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸C 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸A 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸G
二、氨基酸各种分类
1.根据氨基酸分子中所含氨基和羧基数目的不同,将氨基酸分为中性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸:
类别氨基酸特点
中性氨基酸甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、
缬氨酸、胱氨酸、半胱氨酸、甲硫氨酸、
苏氨酸丝氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、
色氨酸、脯氨
这类氨基酸分子中只含
有一个氨基和一个羧基
酸性氨基酸谷氨酸、天门冬氨酸这类氨基酸分子中含有一个氨基和二个羧基
碱性氨基酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸这类氨基酸的分子中含二氨基一羧基;组氨酸具氮环,呈弱碱性,也属碱性氨基酸。
2.根据氨基酸的极性分类:
类别氨基酸
非极性氨基酸甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸
极性氨基酸极性中性氨基酸
色氨酸、酪氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、
蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸酸性氨基酸天冬氨酸、谷氨酸
碱性氨基酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸
其中,属于芳香族氨基酸的是:色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸
属于亚氨基酸的是:脯氨酸
含硫氨基酸包括:半胱氨酸、蛋氨酸
3.按其亲水性、疏水性可分为:
类别氨基酸
亲水性氨基酸D, E, H, K, Q, R, S, T, 羟脯氨酸, 焦谷氨酸疏水性氨基酸A, F, I, L, M, P, V, W, Y, α-氨基丁酸,
β-氨基丙氨酸,正亮氨酸
未定类 C 和G
4.其它的分类方法
类别氨基酸
在温和条件下氧化的氨基酸C, M
脱氨或脱羧基的氨基酸N, Q
蛋白制备中易降解的氨基酸M, W
带正电荷的氨基酸K, R, H
带负电荷的氨基酸D, E
天然的氨基酸现已经发现的有 300 多种,其中人体所需的氨基酸约有 22 种,分非必需氨基
酸和必需氨基酸(人体无法自身合成)。另有酸性、碱性、中性、杂环分类,是根据其
化学性质分类的。
1、必需氨基酸(essential amino acid):指人体(或其它脊椎动物)不能合成或合成速度远不适应机体的需要,必需由食物蛋白供给,这些氨基酸称为必需氨基酸。共有 8 种其作用分别是:
①赖氨酸(Lysine ):促进大脑发育,是肝及胆的组成成分,能促进脂肪代谢,调节松果腺、乳腺、黄体及卵巢,防止细胞退化;
②色氨酸(Tryptophane):促进胃液及胰液的产生;
③苯丙氨酸(Phenylalanine):参与消除肾及膀胱功能的损耗;
④蛋氨酸(又叫甲硫氨酸)(Methionine);参与组成血红蛋白、组织与血清,有促进脾脏、胰脏及淋巴的功能;
⑤苏氨酸(Threonine):有转变某些氨基酸达到平衡的功能;
⑥异亮氨酸(Isoleucine ):参与胸腺、脾脏及脑下腺的调节以及代谢;脑下腺属总司令部作用于甲状腺、性腺;
⑦亮氨酸(Leucine ):作用平衡异亮氨酸;
⑧缬氨酸(Viline):作用于黄体、乳腺及卵巢。
其理化特性大致有:
1)都是无色结晶。熔点约在 230°C 以上,大多没有确切的熔点,熔融时分解并放出CO2;都能溶于强酸和强碱溶液中,除胱氨酸、酪氨酸、二碘甲状腺素外,均溶于水;除脯氨酸和羟脯氨酸外,均难溶于乙醇和乙醚。
2)有碱性[二元氨基一元羧酸,例如赖氨酸(lysine)];酸性[一元氨基二元羧酸,例如谷氨酸(Glutamic acid)];中性[一元氨基一元羧酸,例如丙氨酸(Alanine)]三种类型。大多数氨基酸都呈显不同程度的酸性或碱性,呈显中性的较少。所以既能与酸结合成盐,也能与碱结合成盐。
3)由于有不对称的碳原子,呈旋光性。同时由于空间的排列位置不同,又有两种构型: D 型和 L 型,组成蛋白质的氨基酸,都属 L 型。由于以前氨基酸来源于蛋白质水解(现在大多为人工合成),而蛋白质水解所得的氨基酸均为α-氨基酸,所以在生化研究方面氨基酸通常指α-氨基酸。至于β、γ、δ……ω等的氨基酸在生化研究中用途较小,大都用于有机合成、石油化工、医疗等方面。氨基酸及其衍生物品种很多,大多性质稳定,要避光、干燥贮存。
2、非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成,不需要从食物中获得的氨基酸。例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。