CLOPE-快速有效的聚类算法

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大规模单细胞转录组数据高效聚类算法

大规模单细胞转录组数据高效聚类算法

大规模单细胞转录组数据高效聚类算法大规模单细胞转录组数据高效聚类算法随着生物学和医学领域的不断发展,研究者们越来越意识到单细胞水平的研究对于深入了解生物系统和人类疾病的重要性。

单细胞转录组数据是目前最常用的单细胞研究方式之一,它可以提供单个细胞的转录水平信息,帮助我们识别细胞类型、揭示时空动态以及发现相关疾病的潜在机制。

然而,由于技术限制和数据冗余性,处理大规模的单细胞转录组数据仍然面临挑战。

对于单细胞转录组数据,其中一个重要的任务是将细胞聚类成具有相似特征的群体,以便于后续的进一步分析。

在大规模数据集中进行高效聚类是一个关键问题,因为数据集往往包含数以千计的细胞,并且具有高度的噪声和稀疏性。

为了解决这个问题,研究者们提出了一种大规模单细胞转录组数据高效聚类算法。

该算法的核心思想是结合数据降维和聚类技术,以提高聚类的效率和准确性。

在数据降维方面,研究者们通常采用主成分分析(Principal Component Analysis,简称PCA)或 t-SNE 算法,将原始高维数据降低到较低维度,以便于后续的聚类分析。

在通过降维得到的低维数据上,研究者们可以更好地发现数据中的结构和模式,提高聚类的准确性。

在降维后的数据上进行聚类时,研究者们通常使用基于密度的聚类算法,如DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)或HDBSCAN (Hierarchical Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)算法,以识别具有相似特征的细胞。

与传统的基于距离的聚类算法相比,基于密度的聚类算法能够更好地处理噪声和稀疏性问题,提高聚类的稳定性和可靠性。

为了进一步提高聚类的效率,研究者们还结合了并行计算和大规模数据处理技术。

通过将数据划分成多个小块,并在多个计算节点上并行处理这些小块,研究者们可以显著提高聚类算法的运行速度。

机器学习中的聚类算法详解

机器学习中的聚类算法详解

机器学习中的聚类算法详解机器学习中最基本的任务是分类和聚类。

分类是将数据样本分成不同的类别,而聚类则是将数据样本分成不同的簇。

我们在研究聚类算法时,主要关注的是无监督学习方法。

因为我们不知道需要将数据分成什么类别,需要学习算法自己分出不同的簇。

1. 聚类算法的基本思想聚类算法通过寻找数据样本内部的共性,将样本数据进行聚类并最终产生不同的簇。

先前我们在研究分类算法时,需要标记每个数据样本的类别标签,产生训练数据。

而聚类算法不需要这些标记,可以根据数据样本的特征直接对数据样本进行分组。

聚类算法要解决的问题有:1. 如何衡量样本之间的相似度2. 如何判断簇对最终聚类结果的影响3. 如何选择聚类算法的参数和初始簇聚类算法的基本流程:1. 初始化:选择聚类算法的初始参数和初始簇2. 计算相似度:使用相似度计算方法,计算每个数据样本之间的相似度3. 确定簇的数量:根据聚类算法的参数确定簇的数量4. 分配簇:将样本中的每个数据分配到对应的簇中5. 重新计算簇心:重新计算每个簇的簇心6. 重新分配簇:根据新的簇心重新将样本数据分配到簇中,直到簇之间的间隔不再变化7. 输出聚类结果2. 常用的聚类算法常用的聚类算法有层次聚类、K均值聚类和密度聚类,这里分别进行介绍。

2.1 层次聚类层次聚类(Hierarchical Clustering)是将数据样本分层次的聚类方法。

根据聚类层次不同,分成两类:分层聚类和聚合聚类。

分层聚类的算法流程:从每个数据样本作为一个簇出发,然后合并最相近的两个簇。

重复这个过程,直到最后只剩下一个簇。

聚合聚类的算法流程:将所有的数据样本看作一个簇,重复将距离最近的两个簇合并的过程,直到合并到指定的簇数。

2.2 K均值聚类K均值聚类(K-means)算法是聚类算法的经典算法之一,是一种基于距离度量的贪心聚类算法。

K-means算法主要分为以下三个步骤:1. 初始化:选择K个点作为初始的聚类中心2. 分配数据:将每个数据分配该距离最近的聚类中心所在簇3. 计算新的簇中心:将数据分配到各个簇中之后,重新计算各簇的中心点,即为新的聚类中心2.3 密度聚类密度聚类是一种基于密度的聚类方法,它假设聚类的区域比非聚类区域的密度高,通过寻找具有高密度的区域,来实现聚类。

高维数据聚类算法比较与优化研究

高维数据聚类算法比较与优化研究

高维数据聚类算法比较与优化研究近年来,随着数据科学和机器学习的快速发展,高维数据聚类算法变得越来越重要。

高维数据聚类是一项挑战性的任务,因为在高维空间中,数据点之间的距离往往变得稀疏,这导致了传统的聚类算法在处理高维数据时效果不佳。

本文将介绍并比较几种常见的高维数据聚类算法,并讨论其优化方法。

首先,我们将介绍两种常见的高维数据聚类算法:K-means和DBSCAN。

K-means算法是一种基于距离的聚类算法。

算法首先随机选择K个聚类中心点,然后迭代地将数据点分配给最近的聚类中心,再更新聚类中心的位置。

这个过程将重复进行,直到聚类中心不再发生变化为止。

K-means算法简单、直观,并且在低维数据集上表现良好。

然而,在处理高维数据时,K-means算法存在“维数灾难”的问题,即随着维度的增加,数据点之间的距离变得日益稀疏,导致聚类效果下降。

DBSCAN算法是一种基于密度的聚类算法。

该算法将数据点分为核心点、边界点和噪声点三类。

算法先选取一个核心点,然后找出以该核心点为中心,以给定半径ε内的所有数据点,将这些点作为一个聚类。

然后,递归地处理每个核心点的邻域,直到所有的核心点都被处理完。

DBSCAN算法相比于K-means算法更适用于处理高维数据,因为它不依赖于距离的定义,而是通过密度的概念实现聚类。

然而,虽然DBSCAN算法相对于K-means算法在高维数据上具有一定优势,但仍然存在一些问题。

其中一个问题是参数选择问题,包括ε和最小样本数min_samples的选择。

这些参数的选择直接影响着聚类结果的质量,而且在高维空间中很难确定合适的参数值。

另一个问题是算法的性能问题,由于DBSCAN算法需要计算数据点之间的距离和密度,对于大规模高维数据集来说,计算复杂度会急剧增加,导致算法运行效率低下。

为了解决上述问题,研究者们提出了一些优化方法。

其中一个方法是使用降维技术。

降维技术可以将高维数据映射到低维空间,从而减少维数灾难导致的距离稀疏问题。

聚类算法使用教程(Ⅰ)

聚类算法使用教程(Ⅰ)

聚类算法使用教程一、引言聚类算法是数据挖掘领域中的重要工具,它能够将数据集中的样本按照相似性分成若干类别,为之后的数据分析和决策提供支持。

聚类算法在多个领域都有着广泛的应用,比如市场分析、社交网络分析、医学影像处理等。

本文将介绍几种常见的聚类算法的使用方法,并结合实例进行详细说明。

二、K均值聚类算法K均值聚类算法是最为经典的聚类算法之一,它通过迭代的方式将数据集中的样本划分成K个类别。

算法的步骤如下:1. 初始化K个聚类中心点,可以随机选择数据集中的K个样本作为初始中心。

2. 将每个样本分配到距离最近的聚类中心点所在的类别中。

3. 根据每个类别中的样本重新计算聚类中心。

4. 重复执行第2和第3步,直到聚类中心点不再发生变化或者达到设定的迭代次数。

下面以一个简单的二维数据集为例,来演示K均值聚类算法的使用方法。

假设有如下的数据集:x = [1, 2, 2, 3, 6, 7, 8, 9]y = [1, 1, 2, 2, 8, 6, 7, 6]首先,我们随机选择K=2个样本作为初始聚类中心,比如选择(2, 1)和(7,6)。

然后按照上述算法步骤进行迭代,最终得到数据集中的样本被分成了两个类别。

三、层次聚类算法层次聚类算法是一种自底向上或自顶向下的聚类方法,它不需要预先指定聚类的个数,而是通过计算样本之间的相似性来构建聚类树。

层次聚类算法的步骤如下:1. 计算每对样本之间的相似性或者距离。

2. 将每个样本看作一个单独的类别。

3. 根据相似性或者距离的大小,将最相似的两个类别合并成一个新的类别。

4. 重复执行第3步,直到所有的样本被合并成一个类别。

层次聚类算法的优点在于它能够产生聚类层次结构,并且不需要预先指定聚类的个数。

下面以一个简单的二维数据集为例,来演示层次聚类算法的使用方法。

假设有如下的数据集:x = [1, 2, 2, 3, 6, 7, 8, 9]y = [1, 1, 2, 2, 8, 6, 7, 6]我们可以通过计算欧氏距离来构建样本之间的相似性矩阵,然后根据相似性矩阵使用层次聚类算法来得到聚类结果。

聚类算法介绍

聚类算法介绍

聚类算法介绍聚类算法是一种常见的机器学习算法,它可以将数据集中的数据按照相似度进行分组,从而实现对数据的分类和分析。

聚类算法在数据挖掘、图像处理、自然语言处理等领域都有广泛的应用。

聚类算法的基本思想是将数据集中的数据按照相似度进行分组,使得同一组内的数据相似度较高,不同组之间的数据相似度较低。

聚类算法的核心是相似度度量和聚类方法。

相似度度量是指对数据之间的相似程度进行度量的方法。

常用的相似度度量方法有欧氏距离、曼哈顿距离、余弦相似度等。

不同的相似度度量方法适用于不同的数据类型和应用场景。

聚类方法是指将数据集中的数据按照相似度进行分组的具体方法。

常用的聚类方法有层次聚类、K均值聚类、密度聚类等。

不同的聚类方法适用于不同的数据类型和应用场景。

层次聚类是一种自下而上的聚类方法,它从每个数据点开始,逐步将相似的数据点合并成一个聚类,直到所有数据点都被合并为一个聚类。

层次聚类的优点是可以得到聚类的层次结构,缺点是计算复杂度较高。

K均值聚类是一种基于距离的聚类方法,它将数据集中的数据分为K个聚类,每个聚类的中心点是该聚类中所有数据点的平均值。

K均值聚类的优点是计算复杂度较低,缺点是对初始聚类中心的选择比较敏感。

密度聚类是一种基于密度的聚类方法,它将数据集中的数据分为若干个密度相连的区域,每个区域对应一个聚类。

密度聚类的优点是可以处理不规则形状的聚类,缺点是对参数的选择比较敏感。

聚类算法是一种常见的机器学习算法,它可以将数据集中的数据按照相似度进行分组,从而实现对数据的分类和分析。

不同的相似度度量方法和聚类方法适用于不同的数据类型和应用场景,需要根据具体情况进行选择。

聚类CLIQUE算法 的基本思路

聚类CLIQUE算法 的基本思路
CLIQUE算法的基本思路


采用基于密度的算法 聚类( cluster)就是一个区域,满足该区域中 的点的密度大于与之相邻的区域。 把数据空间分割成网格单元(unit),将落到某个 单元中的点的个数当成这个单元的密度 (density)。可以指定一个数值,当某个单元 中的点的个数大于该数值时,我们就说这个单 元格是稠密( dense)的。聚类也就定义为连 通的所有的稠密单元格的集合。


Start with some unit u in D, assign it the first cluster number,and find all the units it is connected to If there still are units in D that have not yet been visited,find one and repeat the procedure.
1.Covering with maximal regions

Input:
a set C of connected dense units in the same k-dimensional space S

Output:
a set W of maximal region such that W is a cover of C

A bottom-up algorithm to find dense units


Determines 1-dimensional dense units by making a pass over the data Having determined (k-1)-dimensional dense units, the candidate k-dimensional units are determined using candidate generation procedure. To decide which subspaces(and the corresponding dense units) are interesting. MDL------Minimal Description Length

clique聚类算法 -回复

clique聚类算法 -回复

clique聚类算法-回复关于clique聚类算法引言:在数据挖掘和机器学习领域,聚类是一种常用的技术,它将数据对象分组成具有相似特征的簇或群体。

其中一种聚类算法是clique聚类算法,它能够找到具有相似特征的数据对象的集合,并将它们归为一类。

本文将深入分析clique聚类算法,并逐步解释其原理和实施步骤。

第一部分:聚类算法概述聚类算法是一种无监督学习方法,它在没有已知类别或标签的情况下将数据对象分组到不同的簇中。

这些簇由具有相似特征的数据对象组成,这些特征可能是数值、离散值或二进制值。

聚类算法可以用于数据分析、图像处理、社交网络分析等领域。

第二部分:介绍clique聚类算法2.1 原理clique聚类算法是一种基于网络的聚类方法,它通过寻找图中的完全子图来识别簇。

一个完全子图是指其中的每对节点之间都有边连接。

clique算法根据完全子图中的节点密度来确定簇的边界。

密度是指节点与其邻居节点之间的边的数量。

2.2 步骤2.2.1 构建网络首先,将数据转化为图的形式。

每个数据对象对应图中的一个节点,而数据对象之间的相似度则决定了节点之间是否有边连接。

可以使用距离度量来计算相似度。

2.2.2 寻找完全子图在构建好网络之后,需要找出具有完全子图的节点集合。

一个完全子图是指其中的每对节点之间都有边连接。

clique算法通过搜索网络中的完全子图来确定簇的候选对象。

2.2.3 簇划分完成完全子图的搜索之后,需要将节点分配给不同的簇。

这可以通过计算每个节点在候选对象中的密度来实现。

密度高的节点将被归入某个簇中。

2.2.4 簇扩展为了进一步提高聚类的准确性,可以进行簇的扩展。

在簇划分之后,算法会尝试将邻近的节点加入已有的簇中,以进一步增加簇的密度。

这样做可以使得簇更加完整,并减少错误分类。

第三部分:clique聚类算法的优势和应用3.1 优势clique聚类算法能够处理高维数据和非球形簇,相比于其他聚类算法具有较好的鲁棒性。

聚类算法及其在数据分析中的应用

聚类算法及其在数据分析中的应用

聚类算法及其在数据分析中的应用近年来,随着技术的不断进步,数据分析的应用越来越广泛。

在大数据时代下,人们面对的不仅仅是海量数据,更是数据的“概括”。

如何在数据中获取有用的信息,这是必须掌握的一项技能。

而聚类算法就是其中的一种。

什么是聚类算法?聚类算法是一种用于将数据对象分为相似组或类的机器学习方法,其目的是将彼此相似的数据对象集合在一起,彼此不相似的数据对象则分开。

聚类算法的本质是通过学习和计算相似性来完成数据的自动分类,这种分类能够帮助我们更高效地理解和分析数据。

聚类算法的分类聚类算法的分类很重要,因为不同的聚类算法方法适用于不同的数据情况。

根据聚类算法的方法和特点,我们可以将聚类算法分为以下几种:1. 层次聚类算法:是一种自下而上的方法,可以找到数据的层次结构,在数据对象之间建立完全二叉树结构。

2. 划分聚类算法:是一种自上而下的方法,将母集合分为若干个不相交的子集合,因此也称之为“分类”。

3. 密度聚类算法:基于数据集的局部密度来对数据对象进行聚类。

4. 分布密度聚类算法:基于数据的概率分布来进行聚类。

5. 原型聚类算法:需要定义一个具有代表性的样本来描述一个组的特点,例如 k 均值算法。

聚类算法的应用聚类算法的应用非常广泛,以下是聚类算法在数据分析中具体应用的几个方面。

1. 客户细分:利用聚类算法,可以将客户分为不同的群体,从而更好地进行营销工作。

例如,我们可以通过分析客户的购买记录、行为偏好、地理位置等来划分客户群体,以便测定不同营销策略。

2. 图像分析:利用聚类算法,可以将关闭的区域放在一起形成边,从而理解和分析图像中的边缘。

图像分析是聚类算法的重要应用之一。

3. 生物分类:利用聚类算法,可以对生物类群进行分类,例如将动物、树木和真菌分别归为不同的物种。

聚类算法还可以帮助生物学家更好地理解物种之间的关系和共同点。

4. 垃圾邮件过滤:利用聚类算法,可以将垃圾邮件与正常邮件分离开来。

通过聚类算法将相似的邮件归为同一类别,然后进行分类。

clique聚类算法 -回复

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clique聚类算法-回复什么是clique聚类算法?Clique聚类算法是一种在图论中应用的聚类算法。

聚类算法是一种将数据分组成具有相似特征的集合的方法。

而Clique算法则基于图中的团(clique)的概念,通过找到图中的最大团来实现聚类。

在聚类算法中,一个团是指图中的一组节点,其中每个节点都与其他节点相连接。

Clique 聚类算法利用这个性质将相似节点分为一组。

Clique聚类算法的步骤是怎样的?Clique聚类算法的步骤包括以下几个:1. 构建图:首先,将待聚类的数据表示为一个图。

每个数据点可以看作是图中的一个节点,而数据之间的相似性则由边来表示。

边的权重可以根据数据点之间的相似性来确定,例如,可以使用欧氏距离或其他相似性度量方法。

2. 确定团:在构建好的图中,团是由一组相互连接的节点组成的。

Clique 算法通过找到图中的最大团来实现聚类。

团的大小取决于所定义的相似性阈值,表示在此阈值下两个节点被认为是相似的。

3. 找到最大团:Clique聚类算法的目标是找到图中的最大团,即节点数最多的团。

为了达到这个目标,算法会从图中的一个节点开始,然后通过递归地添加与已有节点相连的新节点来扩展这个团。

如果新添加的节点与团中的所有节点相连,那么这个节点会被添加到团中。

算法会重复这个过程,直到不能再添加新节点为止。

4. 划分数据点:当找到了最大团后,Clique算法会将团中的节点视为一个聚类。

这些聚类可以通过标记每个节点所属的团来获得。

Clique聚类算法的优缺点是什么?Clique聚类算法具有以下优点:1. 高效性:Clique算法通过找到图中的最大团来实现聚类,因此可以在时间复杂度较低的情况下完成聚类任务。

2. 鲁棒性:Clique算法对噪声数据具有一定的鲁棒性。

由于聚类是基于团的,如果某个节点由于噪声而被放入一个错误的团中,它也可能与其它正确的团相关联,从而在后续的扩展过程中被正确地重新划分。

然而,Clique聚类算法也存在一些缺点:1. 依赖于相似性阈值:聚类的结果取决于所定义的相似性阈值。

列举常用聚类算法

列举常用聚类算法

列举常用聚类算法聚类算法是一种将数据集中的相似数据分组的方法。

它是无监督学习的一种应用,可以在没有标签或类别信息的情况下对数据进行分类。

在机器学习和数据挖掘中,聚类算法被广泛应用于数据分析、图像处理、模式识别等领域。

本文将列举常用的聚类算法。

一、K均值聚类算法(K-means Clustering)K均值聚类算法是一种基于距离度量的聚类方法,它将数据集划分为K 个簇,每个簇包含距离其它簇最近的点。

该算法首先随机选择K个点作为初始质心,然后将每个点分配到与其距离最近的质心所在的簇中,并计算每个簇内所有点的平均值作为新的质心。

重复以上过程直到质心不再改变或达到预定迭代次数。

二、层次聚类算法(Hierarchical Clustering)层次聚类算法是一种自下而上或自上而下逐步合并或拆分簇来建立层次结构的方法。

该算法有两种实现方式:凝聚层次聚类和分裂层次聚类。

凝聚层次聚类从每个数据点开始,将它们逐步合并成越来越大的簇,直到所有点都被合并为一个簇。

分裂层次聚类从整个数据集开始,将其逐步拆分成越来越小的簇,直到每个簇只包含一个点。

三、DBSCAN聚类算法(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)DBSCAN聚类算法是一种基于密度的聚类方法,它可以识别任意形状的簇,并能够自动排除离群值。

该算法首先选择一个未访问的核心点作为起始点,并找到其可达范围内的所有点,并将它们加入同一簇中。

然后继续寻找未访问的核心点,并重复以上过程直到所有核心点都被访问完毕。

四、谱聚类算法(Spectral Clustering)谱聚类算法是一种基于图论和线性代数的聚类方法,它将数据集看作是一个图,在图上进行划分。

该算法首先构建一个相似度矩阵或邻接矩阵,并通过特征值分解或奇异值分解来获取特征向量和特征值。

然后将特征向量作为新的数据集,使用K均值或层次聚类等方法对其进行聚类。

(完整版)聚类算法总结

(完整版)聚类算法总结

1.聚类定义“聚类是把相似的对象通过静态分类的方法分成不同的组别或者更多的子集(subset),这样让在同一个子集中的成员对象都有一些相似的属性” ——wikipedia“聚类分析指将物理或抽象对象的集合分组成为由类似的对象组成的多个类的分析过程。

它是一种重要的人类行为。

聚类是将数据分类到不同的类或者簇这样的一个过程,所以同一个簇中的对象有很大的相似性,而不同簇间的对象有很大的相异性。

”——百度百科说白了,聚类(clustering)是完全可以按字面意思来理解的——将相同、相似、相近、相关的对象实例聚成一类的过程。

简单理解,如果一个数据集合包含N 个实例,根据某种准则可以将这N 个实例划分为 m 个类别,每个类别中的实例都是相关的,而不同类别之间是区别的也就是不相关的,这个过程就叫聚类了。

2.聚类过程:1) 数据准备:包括特征标准化和降维.2) 特征选择:从最初的特征中选择最有效的特征,并将其存储于向量中.3) 特征提取:通过对所选择的特征进行转换形成新的突出特征.4) 聚类(或分组):首先选择合适特征类型的某种距离函数(或构造新的距离函数)进行接近程度的度量;而后执行聚类或分组.5) 聚类结果评估:是指对聚类结果进行评估.评估主要有 3 种:外部有效性评估、内部有效性评估和相关性测试评估.3 聚类算法的类别没有任何一种聚类技术(聚类算法)可以普遍适用于揭示各种多维数据集所呈现出来的多种多样的结构,根据数据在聚类中的积聚规则以及应用这些规则的方法,有多种聚类算法.聚类算法有多种分类方法将聚类算法大致分成层次化聚类算法、划分式聚类算法、基于密度和网格的聚类算法和其他聚类算法,如图 1 所示的4 个类别.3.聚类算法基于层次聚类算法:采用抽样技术先对数据集 D 随机抽取样本,再CURE:采用分区技术对样本进行分区,然后对每个分区局部聚类,最后对局部聚类进行全局聚类也采用了随机抽样技术,该算法在计算两个对ROCK:象的相似度时,同时考虑了周围对象的影响首先由数据集构造成一个 K-最近邻图Gk ,再通过一个图的划分算法将图 Gk 划分成大量CHEMALOEN(变色龙的子图,每个子图代表一个初始子簇,最后用算法):一个凝聚的层次聚类算法反复合并子簇,找到真正的结果簇SBAC:BIRCH:BUBBLE:BUBBLE-FM:SBAC 算法则在计算对象间相似度时,考虑了属性特征对于体现对象本质的重要程度,对于更能体现对象本质的属性赋予较高的权值BIRCH 算法利用树结构对数据集进行处理,叶结点存储一个聚类,用中心和半径表示,顺序处理每一个对象,并把它划分到距离最近的结点,该算法也可以作为其他聚类算法的预处理过程BUBBLE 算法则把 BIRCH 算法的中心和半径概念推广到普通的距离空间BUBBLE-FM 算法通过减少距离的计算次数,提高了BUBBLE 算法的效率基于划分聚类算法(partition clustering)是一种典型的划分聚类算法,它用一个聚类的中心来代表一个簇,即在迭代过程中选择的聚k-means:点不一定是聚类中的一个点,该算法只能处理数值型数据K-Means 算法的扩展,采用简单匹配方法来度量k-modes:分类型数据的相似度结合了 K-Means 和 K-Modes 两种算法,能够处k-prototypes:理混合型数据在迭代过程中选择簇中的某点作为聚点,PAM k-medoids:是典型的k-medoids 算法CLARA 算法在PAM 的基础上采用了抽样技术,能CLARA:够处理大规模数据CLARANS 算法融合了PAM 和CLARA 两者的优点,CLARANS:是第一个用于空间数据库的聚类算法采用了空间索引技术提高了 CLARANS 算法的效Focused CLARAN:率模糊集合理论引入聚类分析中并提出了 PCM 模PCM:糊聚类算法基于密度聚类算法:DBSCAN 算法是一种典型的基于密度的聚类算法,该算法采用空间索引技术来搜索对象的邻域,引入DBSCAN:了“核心对象”和“密度可达”等概念,从核心对象出发,把所有密度可达的对象组成一个簇算法通过泛化 DBSCAN 算法中邻域的概念,以适应GDBSCAN:空间对象的特点DBLASD:OPTICS 算法结合了聚类的自动性和交互性,先生OPTICS:成聚类的次序,可以对不同的聚类设置不同的参数,来得到用户满意的结果FDC 算法通过构造 k-d tree 把整个数据空间划分FDC:成若干个矩形空间,当空间维数较少时可以大大提高DBSCAN 的效率基于网格的聚类算法:利用网格单元保存数据统计信STING:息,从而实现多分辨率的聚类在聚类分析中引入了小波变换的原理,主要应用于信号处理领域。

快速聚类分析的基本步骤

快速聚类分析的基本步骤

快速聚类分析的基本步骤聚类分析的概念和实际应用非常广泛,用于帮助管理者更好地理解和分析数据。

它可以帮助组织更有效地推广分析,并从中获得可操作的信息。

聚类分析非常有用,它可以帮助用户更加深入地了解自己的数据,了解其中隐藏的潜在趋势,并将其转换为可操作的信息,以帮助决策者做出正确的决定。

尽管聚类分析的方法有很多,但是它们的基本步骤几乎是相同的。

下面介绍快速聚类分析的基本步骤:首先,确定聚类的目的,并确定用于分析的数据集。

聚类算法的种类有很多,根据目标不同,可以选择适当的聚类算法。

例如,如果聚类算法是为了帮助用户探索和发现数据中的联系,那么可以考虑使用层次聚类、K-means聚类或DBSCAN算法。

第二步,确定聚类分析的属性,并选择最合适的度量准则。

聚类分析的属性可以是字符型或数值型。

根据属性类型和数据类型,可以有多种距离准则,如欧氏距离、曼哈顿距离、切比雪夫距离和余弦距离。

第三步,计算数据点间的距离。

可以使用选定的度量准则,根据数据类型和属性计算数据点之间的距离。

第四步,定义聚类中心点。

层次聚类没有特定的聚类中心,而K-means和DBSCAN算法则根据数据点的特征来定义聚类中心,其中K-means算法使用平均值作为聚类中心,而DBSCAN算法则使用指定的距离作为聚类中心。

第五步,将数据点分配到各聚类中心,这一步的方法取决于使用的聚类算法。

例如,层次聚类算法使用单链法将数据点分配到聚类中心,而K-means算法和DBSCAN算法则使用最近邻法将数据点分配到聚类中心。

最后,可以根据结果解释结果,以便分析其意义,并执行后续决策。

以上就是快速聚类分析的基本步骤,其基本原理就是将相似的数据点分配到相同的组中,从而发现数据中的联系。

聚类分析也可以用于预测和分类,包括客户分析、市场分析和关系分析等,有效地提取信息,做出正确的决策。

聚类算法步骤

聚类算法步骤

聚类算法步骤聚类算法是一种常用的机器学习算法,它能够将数据集中的样本分成若干个类别或簇。

聚类算法的目标是在每个簇内部保持样本之间的相似性,并在不同簇之间保持样本的差异性。

本文将介绍聚类算法的步骤,包括数据预处理、选择聚类算法、确定聚类数目、计算相似度、聚类分配和评估聚类结果。

一、数据预处理在进行聚类算法之前,需要对数据进行预处理。

预处理的目的是将原始数据转换为适合聚类算法处理的形式。

常见的预处理方法包括数据清洗、数据变换和数据规范化。

数据清洗是指对数据进行去噪、缺失值处理和异常值处理。

数据变换是指对数据进行特征选择和特征变换,以减少数据维度和提高数据的可分性。

数据规范化是指将数据按照一定的规则进行缩放,使得不同特征的取值范围一致。

二、选择聚类算法选择合适的聚类算法是进行聚类分析的关键步骤。

常用的聚类算法包括K-means算法、层次聚类算法和DBSCAN算法等。

K-means 算法是一种划分聚类算法,它将数据集划分成K个簇,每个簇包含离其质心最近的样本。

层次聚类算法是一种自底向上或自顶向下的聚类方法,它将数据集划分成一棵树状结构,每个节点表示一个簇。

DBSCAN算法是一种基于密度的聚类算法,它将数据集划分成高密度区域和低密度区域。

三、确定聚类数目确定聚类数目是聚类算法的一个重要问题。

聚类数目的选择对聚类结果有很大影响。

常用的确定聚类数目的方法包括肘部法则、轮廓系数和评估指标等。

肘部法则是通过绘制不同聚类数目下的聚类误差平方和曲线,选择拐点作为聚类数目。

轮廓系数是通过计算样本与同簇样本的相似度和与其他簇样本的相似度,选择轮廓系数最大的聚类数目。

评估指标是通过计算聚类结果与真实标签的一致性度量,选择评估指标最大的聚类数目。

四、计算相似度在聚类算法中,相似度是衡量样本之间距离的度量。

常用的相似度度量方法包括欧氏距离、曼哈顿距离和余弦相似度等。

欧氏距离是指样本之间的直线距离,曼哈顿距离是指样本之间的曼哈顿距离,余弦相似度是指样本之间的夹角余弦值。

聚类算法分类算法 大数据

聚类算法分类算法 大数据

聚类算法分类算法大数据
随着大数据时代的到来,数据量的增长和多样性的增加给数据处理和分析带来了巨大的挑战。

为了有效地处理和分析大量数据,聚类算法和分类算法成为了大数据处理的重要工具。

聚类算法是一种将相似数据点分组的方法。

它通过将数据点分为具有相似属性的簇来发现数据之间的结构和关系。

常见的聚类算法包括K均值聚类、层次聚类和密度聚类等。

分类算法是一种将数据分为不同类别的方法。

它通过分析数据的属性和特征来确定数据属于哪个类别。

常见的分类算法包括决策树、支持向量机和朴素贝叶斯等。

在大数据处理中,聚类算法和分类算法可以互相结合使用。

通过聚类算法对数据进行分组,可以使分类算法更加准确地对不同组数据进行分类。

同时,分类算法可以帮助聚类算法更好地识别簇的特征和属性。

总之,聚类算法和分类算法是大数据处理和分析中的重要工具,它们可以帮助我们更好地理解和挖掘数据之间的关系和结构。

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快速聚类法

快速聚类法

快速聚类法快速聚类法(Fast clustering Algorithm)是一种常用的数据挖掘技术,能够帮助用户快速地从大量的数据中提取出重要信息。

本文将从以下几个方面来介绍快速聚类法:聚类原理、聚类算法、应用领域及优缺点等。

一、聚类原理聚类是一种无监督学习方法,它的目标是将一组样本划分为若干个同类别的簇,使簇内的样本相互间距离尽可能小,而不同簇之间的样本则尽可能远离。

在聚类过程中,采用的距离度量方法及聚类算法都会对聚类结果产生影响。

二、聚类算法快速聚类法是一种基于密度的聚类算法,它通过计算样本点周围的点的密度大小,将样本点分为密集区域和稀疏区域。

该算法的基本思想是,将样本点按照密度从高到低排序,从密度最大的样本点开始向外扩散,直到达到某个密度阈值停止扩散,形成一个簇。

然后重复上述过程直到所有的样本点都被聚类到某一个簇中。

快速聚类法的优点是可以处理任意形状的聚类,对于噪声和离群点有一定的鲁棒性。

但由于该算法的计算复杂度较高,其时间复杂度为O(n²logn),处理大规模数据时效率较低。

三、应用领域快速聚类法广泛应用于数据分析、图像处理、自然语言处理等领域。

例如,在文本分类中,可以使用快速聚类法将相似的文本聚成一类,以便更好地进行分类和挖掘。

在图像处理领域中,快速聚类法可以将相似的图像聚类到一起,以实现图像分类或图像检索。

另外,快速聚类法还被广泛应用于社交网络分析、金融风险评估等领域。

例如,在社交网络分析中,可以使用快速聚类法来识别社群或社区,以便更好地理解和分析社交网络的结构和演化。

四、优缺点优点:1. 快速聚类法可以处理任意形状的聚类,对于噪声和离群点有一定的鲁棒性。

2. 该算法使用密度来描述聚类,对密度的定义不依赖于任何假设,具有较强的鲁棒性。

3. 快速聚类法不需要假定数据分布的任何参数,不具有前提条件的偏见。

缺点:1. 该算法的计算复杂度较高,处理大规模数据时效率较低。

2. 算法的结果易受初始参数影响,需要采用合适的参数设置和聚类结果评估方法。

数据分析中的聚类算法原理及实现

数据分析中的聚类算法原理及实现

数据分析中的聚类算法原理及实现随着互联网和人工智能技术的发展,大量的数据被不断产生和存储。

如何从这些数据中提取有用的信息和技巧是数据分析的目标之一。

而聚类作为数据分析的一种重要方法,可以将大量的无标签数据划分为不同的类别,为数据挖掘和信息检索提供有力支持。

一、聚类算法的基本原理聚类算法的主要任务是根据给定的数据集,将其中的样本划分为若干个不同的簇(cluster),使得同一个簇中的样本之间具有较高的相似度,而不同簇之间的样本相似度较低。

因此,簇内的相似度越高,簇间的相似度越低,聚类的效果越好。

聚类算法的基本流程:1.初始化簇的个数和中心;2.计算每个样本与每个簇的距离(相似度);3.根据计算得到的距离将样本分配到对应的簇中;4.重新计算簇中心;5.重复步骤2-4,直到满足停止条件。

聚类算法的停止条件:1.簇的数量已经达到指定的值;2.迭代次数超过了设定的最大值;3.簇中心的变化量小于设定的阈值。

聚类算法的评价指标:当出现多个簇时,可以使用SSE(sum of squares for error)来评价聚类的效果,SSE越小,聚类效果越好。

二、常见的聚类算法1.KMeans算法K-Means算法是经典的聚类算法之一,也是使用最广泛的算法之一。

K-Means算法的基本思想是:先随机选取k个初始的簇中心,将每个样本点与这些簇中心进行计算,将该样本点分配到距离该样本点最近的簇中心的簇中,然后通过重新计算簇中心的方法,重新计算簇的中心,不断重复上述过程,直到满足一定的停止条件。

2.层次聚类算法层次聚类是一种自下而上的聚类算法,旨在纵向建立一棵树形的聚类关系。

层次聚类算法的基本思想是:将每个样本点视为一棵单独的树,不断将距离最近的两个树的合并起来,直到所有的树都被合并到一棵树中,该树的末端就是簇的集合。

3.DBSCAN算法DBSCAN算法是基于密度的聚类算法,能够发现任意形状、任意大小的簇。

DBSCAN算法的基本思想是:首先将所有样本点标记为未访问,然后随机选取一个样本点,将其标记为已访问,将该点的密度直达距离内的所有样本点标记为已访问,如果该密度直达距离内的样本点数量达到设定的阈值,则生成一个簇,否则标记为噪声点,继续寻找下一个密度直达点。

快速聚类分析的基本步骤

快速聚类分析的基本步骤

快速聚类分析的基本步骤聚类分析是一种新兴的数据挖掘技术,它可以将数据分成几个具有类似特征的簇,从而更好地提取模式以及显示数据之间的关系。

聚类分析主要是对数据进行分组,以便更好地理解和描述数据,尤其是面对大规模和复杂的数据集时。

目前,聚类分析的主要应用领域有市场营销、金融风险管理、医疗与健康等许多领域。

快速聚类分析(Fast Clustering)是一种更先进的聚类分析方法,它可以有效地处理大规模的数据集,而不会影响最终结果的质量。

快速聚类分析的核心思想是使用块算法来高效地将数据集分块,然后分析每一块的特征,进而建立相互之间的联系。

快速聚类分析的基本步骤包括:第一步:数据预处理数据预处理是快速聚类分析中最重要的步骤之一,主要是对数据进行清洗和转换,以确保数据的完整性和质量。

经过数据预处理,可以有效地减少数据的噪声,使后续分析准确性更高、结果更可靠。

第二步:块算法分块块算法是一种高效的分块方法,它可以将数据集快速分割成多个小块,每个小块只包含一些简单的特征,这样可以大大减少后续操作需要处理的数据量,从而提高运行效率。

第三步:局部匹配局部匹配是一种比较有效的聚类方法,主要是通过比较每个数据块与其他数据块之间的相似性,将其分组,形成一个聚类。

第四步:聚类诊断完成聚类分析后,为了检验和评估结果的可靠性和准确性,还需要做聚类诊断,主要是采用聚类得分来测量聚类效果,从而验证最终结果的质量。

综上所述,快速聚类分析的基本步骤是:数据预处理、块算法分块、局部匹配和聚类诊断。

这些步骤可以有效地帮助我们提取、诊断和检验大规模数据集的模式,也为进一步的数据挖掘提供了基础。

因此,快速聚类分析可以说是一种非常有效的数据挖掘技术,在市场营销、金融风险管理、医疗与健康等领域具有很大的应用价值。

pcl点云聚类方法

pcl点云聚类方法

pcl点云聚类方法(原创实用版2篇)目录(篇1)1.介绍 PCL 点云聚类方法2.PCL 点云聚类方法的算法原理3.PCL 点云聚类方法的具体步骤4.PCL 点云聚类方法的优缺点5.PCL 点云聚类方法的应用案例正文(篇1)PCL(Point Cloud Library)点云聚类方法是一种基于点云数据的聚类算法。

点云数据是由大量三维坐标点组成的数据集,它在计算机视觉、图形学、机器人学等领域有着广泛的应用。

通过对点云数据进行聚类分析,可以提取出点云数据中的重要特征,为后续的数据处理和分析提供有效的依据。

PCL 点云聚类方法基于 RANSAC(Random Sample Consensus)算法,通过随机抽样并计算点云数据中各点的共识度来完成聚类任务。

具体来说,PCL 点云聚类方法分为以下三个主要步骤:1.构建点云数据的 k-d 树结构。

k-d 树是一种基于轴向分割的数据结构,可以高效地搜索和处理点云数据。

通过构建 k-d 树,可以快速找到点云数据中的近邻点,为后续的聚类计算提供便利。

2.计算点云数据的共识度。

共识度是衡量点云数据中各点之间相似性的一个指标。

在 PCL 点云聚类方法中,通过随机抽样并计算点对之间的距离来估计共识度。

随机抽样的次数越多,估计的共识度越精确,但计算量也越大。

3.根据共识度进行聚类。

根据计算得到的共识度,可以将点云数据划分为不同的簇。

通常,可以根据预设的聚类数量,将共识度最高的点对划分为同一个簇。

在划分过程中,可以使用一些启发式方法,如基于图的聚类方法,以提高聚类的准确性和效率。

PCL 点云聚类方法具有以下优缺点:优点:1.聚类效果较好,能够较好地挖掘点云数据中的特征信息。

2.算法原理成熟,有广泛的应用基础。

3.支持多种聚类算法,可根据实际需求灵活选择。

缺点:1.计算量较大,对计算资源有一定要求。

2.对于大规模点云数据,聚类效率较低。

PCL 点云聚类方法在许多领域都有应用,例如:1.三维场景重建:通过对点云数据进行聚类分析,可以提取出点云数据中的重要特征,用于三维场景的重建和可视化。

CLOPE-快速有效的聚类算法.

CLOPE-快速有效的聚类算法.

CLOPE :针对交易的数据快速有效聚类算法摘要本文研究分类数据的聚类问题,特别针对多维和大型的交易数据。

从增加聚簇直方图的高宽比的方法得到启发,我们开发了一种新的算法 ---CLOPE,这是一种非常快速、可伸缩,同时又非常有效的算法。

我们展示了算法对两个现实数据集聚类的性能,并将 CLOPE与现有的聚类算法进行了比较。

关键词数据挖掘,聚类,分类数据,可伸缩性1.简介[12,14, 4, 1]聚类是一种非常重要的数据挖掘技术,它的目的是将相似的交易分组在一起。

最近,越来越多的注意力已经放到了分类数据[10,8,6,5,7,13]的聚类上,分类数据是由非数值项构成的数据。

交易数据,例如购物篮数据和网络日志数据,可以被认为是一种特殊的拥有布尔型值的分类数据,它们将所有可能的项作为项。

快速而精确地对交易数据进行聚类的技术在零售行业,电子商务智能化等方面有着很大的应用潜力。

但是,快速而有效聚类交易数据是非常困难的,因为这类的数据通常有着高维,稀疏和大容量的特征。

基于距离的算法例如[11][12]k-means和 CLARANS 都是对低维的数值型数据有效。

但是对于高维分类数据的处理效果却通常不那么令人满意[7]。

像 ROCK这类的分层聚类算法在分类数据聚类中表现的非常有效,但是他们在处理大型数据库时表现出先天的无效。

LargeItem [13]算法通过迭代优化一个全局评估函数对分类数据进行聚类。

这个评估函数是基于大项概念的,大项是在一个聚簇内出现概率比一个用户自定义的参数——最小支持度大的项。

计算全局评估函数要远比计算局部评估函数快得多,局部评估函数是根据成对相似性定义的。

这种全局方法使得LargeItem 算法非常适合于聚类大型的分类数据库。

在这篇文章中,我们提出了一种新的全局评估函数,它试图通过增加聚簇直方图的高度与宽度之比来增加交易项在聚簇内的重叠性。

此外,我们通过引用一个参数来控制聚簇紧密性的方法来泛化我们的想法,通过修改这个参数可以得到不同的聚簇划分个数。

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CLOPE:针对交易的数据快速有效聚类算法摘要本文研究分类数据的聚类问题,特别针对多维和大型的交易数据。

从增加聚簇直方图的高宽比的方法得到启发,我们开发了一种新的算法---CLOPE,这是一种非常快速、可伸缩,同时又非常有效的算法。

我们展示了算法对两个现实数据集聚类的性能,并将CLOPE与现有的聚类算法进行了比较。

关键词数据挖掘,聚类,分类数据,可伸缩性1.简介聚类是一种非常重要的数据挖掘技术,它的目的是将相似的交易[12, 14, 4, 1]分组在一起。

最近,越来越多的注意力已经放到了分类数据[10,8,6,5,7,13]的聚类上,分类数据是由非数值项构成的数据。

交易数据,例如购物篮数据和网络日志数据,可以被认为是一种特殊的拥有布尔型值的分类数据,它们将所有可能的项作为项。

快速而精确地对交易数据进行聚类的技术在零售行业,电子商务智能化等方面有着很大的应用潜力。

但是,快速而有效聚类交易数据是非常困难的,因为这类的数据通常有着高维,稀疏和大容量的特征。

基于距离的算法例如k-means[11]和CLARANS[12]都是对低维的数值型数据有效。

但是对于高维分类数据的处理效果却通常不那么令人满意[7]。

像ROCK这类的分层聚类算法在分类数据聚类中表现的非常有效,但是他们在处理大型数据库时表现出先天的无效。

LargeItem[13]算法通过迭代优化一个全局评估函数对分类数据进行聚类。

这个评估函数是基于大项概念的,大项是在一个聚簇内出现概率比一个用户自定义的参数——最小支持度大的项。

计算全局评估函数要远比计算局部评估函数快得多,局部评估函数是根据成对相似性定义的。

这种全局方法使得LargeItem算法非常适合于聚类大型的分类数据库。

在这篇文章中,我们提出了一种新的全局评估函数,它试图通过增加聚簇直方图的高度与宽度之比来增加交易项在聚簇内的重叠性。

此外,我们通过引用一个参数来控制聚簇紧密性的方法来泛化我们的想法,通过修改这个参数可以得到不同的聚簇划分个数。

实验表明,我们的算法运行速度比Largeltem快得多,聚类的质量与ROCK算法[7]相当接近。

为了解释算法的一些基本思想,我们采用一个非常小的交易数据库,其中包含5条交易数据{(苹果,香蕉),(苹果,香蕉,蛋糕),(苹果,蛋糕,盘子),(盘子,鸡蛋),(盘子,鸡蛋,鱼)}。

为简单起见,交易(苹果,香蕉)被简称为ab,以此类推。

对于这个小型数据库,比较下面两个聚类划分(1){{ab,abc,acd},{de,def}};(2){{ab,abc},{acd,de,def}}。

对于每一个聚簇,我们计算每一个不同项的出现次数,然后得到聚簇的高度(H)和宽度(W)。

例如,聚簇{ab,abc,acd}中a:3,b:2,c:2,d:1,H=2.0,W=4,图1将这些结果显示为几何上的直方图,按项出现频率降序排列,这样做只是为了更容易直观展示。

图1 两个聚簇的直方图我们通过分析聚簇的高度和宽度,从几何学上来评判这两个聚类的质量。

不算{de,def}和{ab,abc}这两个拥有相同直方图的聚簇,另两个直方图的质量不同。

聚簇{ab,abc,acd}的直方图8块区域(H=2.0, H/W=0.5)只有4个不同项,但是聚簇{acd,de,def}对于相同的块数却有5个不同的项(H =1.6,H/W=0.32)。

很明显,聚类(1)比较好,因为我们更希望同一个聚簇中的交易有更多的重叠。

从上面的例子中,我们可以看到,拥有更大高宽比的直方图具有更好的簇内相似性。

我们应用这一简单的直觉作为聚类算法的基础,用簇的直方图的几何性质定义全局评估函数。

我们把这种新的算法叫做CLOPE——带有倾斜的聚类。

CLOPE算法不仅非常有效,在聚类形如市场交易数据和网络服务器日志这类高维的大型交易数据时也非常之快而且具有较好的可拓展性。

本文的其它部分安排如下。

第2节将更加正式地分析分类数据聚类问题,并提出我们的评估函数。

第3节详细介绍CLOPE算法以及其实现问题。

在第4节,将CLOPE与Largeltem对现实数据集聚类的实验结果进行比较。

第5节介绍相关工作后,第6节对文章进行总结。

2.CLUSTERING WITH SLOPE(具有倾斜的聚类)符号:在整篇文章中,我们使用以下符号。

交易数据集D是一组交易{t1, ...,t n}的集合。

每条交易是一些项{i1, ..., im}的集合。

一个聚簇{C1, ... Ck}是{t1, ...,t n }的一个划分,也就是说,C1∪…∪ Ck={t1, ..., tn}而且对任意1 ≤i, j ≤k,满足C i≠φ∧ C i∩C j = φ。

每一个C i叫做一个簇。

除非其它说明,n,m,k分别表示交易的个数、项的个数和聚簇的个数。

一次好的聚类应该将相似的交易分到同一组。

大部分聚类算法定义一些评估函数并且优化它们,最大化簇内的相似度和簇间相异。

评估函数可以定义为局部的的或者全局的两种类型。

在定义为局部的方式中,评估函数建立在交易对相似性基础上。

这种方式已经被广泛地应用于数值数据的聚类中,使用对相似性例如L p((Σ|xi-yi|p)1/p)作为两点之间的相似度量。

常见的分类数据的相似度量有Jaccard系数(|t1∩t2|/|t1∪t2|),Dice系数(2×|t1∩t2|/(|T1|+|T2|))或者简单地为两个交易的公共项数[10]。

然而,对于大型的数据,相比于全局方法,这些局部方法在计算上的成本是非常巨大的。

在Wang等在他们的LargeItem算法[13]中首创的全局相似测度也可以用于分类数据的聚类。

在全局方法中,不需要个别交易之间的两两相似度量。

聚类质量在簇级测定,它利用了聚簇中大项集和小项集这样的信息。

既然这些全局度量的计算要比两两相似度的计算要快得多,所以全局方法对大型分类数据库的聚类处理中是非常有效的。

与LargeItem相比,CLOPE使用一个更简单而有效的全局测度来聚类交易数据集。

更高的高宽比的生动形象地反映了更好的聚类结果。

给一个聚簇C,我们可以找到其中所有不同的项以及每个项对应的出现次数,即包含了项的交易数。

我们用D(C)表示不同项的集合,Occ(i,C)表示项i 在聚簇C中的出现次数。

然后我们可以画出聚簇C的直方图,项作为X轴,以它们出现次数的降序排列,项出现的次数作为Y轴。

我们定义聚簇C的大小S(C)和宽度W(C),如下:聚簇的高度定义为H(C)=S(C)/W(C)。

当聚簇C不重要或者能从上下文推出时,我们将H(C),S(C),W(C)简写为S,W和H。

为了阐明,我们下面详细解释图1中最后一个聚簇的直方图。

请注意,几何图2中,直方图与具有高度H和宽度W的虚线矩形具有相同的大小S.图2 聚簇 {acd, de, def }的直方图详解很明显,一个更大的高度表示在聚簇中项之间有更多的重叠,这样聚簇中的交易就有更多的相似性。

在我们运行的例子中,{ab,abc,acd}的高度是2,而{acd,de,def }的高度是1.6。

既然两个聚类的所有其它的特征是相同的,我们认为聚类(1)更好。

然而,为了定义我们的评估函数,单独定义高度是不够的。

取一个非常简单的数据库{ abc,def },两个交易中没有重叠,但是聚簇{{abc,def}}和聚簇{{abc},{def}}有相同的高度1。

另一个做法对这个例子更合适。

我们可以用梯度G(C)= H(C)/ W(C)= S(C)/ W(C)2代替H(C)作为聚簇C的质量测度。

.现在,聚簇{ { abc },{ def } }更好,因为其中两个聚簇的梯度都是1/3,大于聚簇{ abc def }的梯度1/6。

为了定义聚类评估函数,,我们需要考虑每个聚簇的形状以及其中的交易数。

对于聚类C = { C1,……,Ck},我们使用以下公式作为一个评估函数的直观定义。

事实上,这个评估函数可以用一个幂参数r而不是2进行泛化,如下所示。

上式中,r是一个正实数1,称为排斥因子,用来控制聚簇内的相似度等级。

当r很大时,同一个聚簇内的交易必须共享大部分共同的项。

否则,将这些交易分到不同的聚簇中会得到更大的收益值。

例如,比较数据库{ abc,abcd,bcde,cde }的两个聚类:(1) {{abcd,abcd,bcde,cde } },(2) { { abc,abcd },{ bcde,cde } }。

为了聚类(2)得到更大聚类收益值,它的收益值必须大于聚簇(1)的聚类收益值这意味着必须使用一个大于ln(14/7)/ln(5/4) ≈ 3.106的排斥因子。

相反,可以使用小的排斥因子来分组稀疏数据。

共享少量公共项的交易可能被放到相同的聚簇中。

对于数据库{abc,cde,fhg,hij,},想要聚类{{abc,cde},{fgh,hij,}}的聚类收益值大于聚类{{abc},{cde},{fgh},{hij}}的聚类收益值,需要一个小于ln(6/3)/ln(5/3) ≈ 1.357的排斥因子。

现在,我们表述聚类交易数据的问题如下。

问题定义:给定D和r,找到一个聚类C使Profitr(C)最大。

图3. CLOPE算法的概要描述3、实现像绝大多数基于划分的聚类方法一样,我们通过迭代扫描数据库来趋近最佳的方案。

然而,由于我们的评估函数是定义为全局的,函数中只有一些轻松可计算的测度,比如大小和宽度,方法的执行速度比局部方法快得多。

我们的实现方案需要一个初次扫描数据库以构建初始聚类,由评估函数驱动。

然后,需要通过多次扫描来完善聚类、优化评估函数。

如果相比Profitr上一次扫描,聚类划分没有发生改变,算法将停止,最终聚类划分作为输出。

输出是只是简单地为每条交易形成的整数标签,指明交易所属的聚簇id。

算法的示意图如图3所示。

内存数据结构:在有限的内存空间里,我们对每一个聚簇仅仅保留当前交易和少量的信息。

这些信息,称为聚簇特性,包括交易数量N,不同项的项数(或宽度)W ,<项,出现次数>的哈希值occ ,和一个预先计算好的整数S 来快速访问聚簇的大小。

我们记C.occ[i]为聚簇C 中项i 出现的次数,以此类推。

备注:事实上,CLOPE 相当节约内存,甚至对于大多数交易数据库以数组形式表示出现的数据都是可行的。

如果使用4字节的数组,项出现次数所需的总内存大约是M*K*4字节,M 是维数,K 是聚簇数。

有着10K 不同项、1K 个聚簇的数据库可以装到40M 的RAM 。

聚类收益值计算:在添加或删除一条交易时更新簇特征很简单,通过簇特征,使用每一个聚簇的S ,W 和N 计算聚类收益值也很简单。

算法中最花时间的部分(图3中的步骤3和步骤10)是比较添加交易到所有聚簇(包括空的聚簇)的不同收益。

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